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Este documento presenta información sobre la extracción y purificación de ácidos nucleicos. Incluye afirmaciones sobre la integridad de los ácidos nucleicos después de la purificación y análisis de la pureza de tres muestras de ADN y ARN mediante absorbancia. Explica cómo la electroforesis en gel de agarosa puede usarse para verificar la integridad y cómo los cocientes de absorbancia pueden indicar contaminación con proteínas, fenol u otros compuestos.
Este documento presenta información sobre la extracción y purificación de ácidos nucleicos. Incluye afirmaciones sobre la integridad de los ácidos nucleicos después de la purificación y análisis de la pureza de tres muestras de ADN y ARN mediante absorbancia. Explica cómo la electroforesis en gel de agarosa puede usarse para verificar la integridad y cómo los cocientes de absorbancia pueden indicar contaminación con proteínas, fenol u otros compuestos.
Este documento presenta información sobre la extracción y purificación de ácidos nucleicos. Incluye afirmaciones sobre la integridad de los ácidos nucleicos después de la purificación y análisis de la pureza de tres muestras de ADN y ARN mediante absorbancia. Explica cómo la electroforesis en gel de agarosa puede usarse para verificar la integridad y cómo los cocientes de absorbancia pueden indicar contaminación con proteínas, fenol u otros compuestos.
NEREA LAGUNA SERRANO BIOLOGÍA MOLECULAR Y CITOGENÉTICA EJERCICIOS
Tema 3. Extracción Y Purificación De Ácidos Nucleicos
10. Escribe en tu cuaderno si son verdaderas o falsas las siguientes afirmaciones relativas a la integridad de los ácidos nucleicos tras la purificación y justifica la respuesta: a) La electroforesis en gel de agarosa es la técnica de elección para comprobar la integridad de los ácidos nucleicos. Verdadero. b) En la electroforesis de una muestra de ARN total no degradado de un organismo eucariote se observan dos bandas nítidas correspondientes a los ARNr 28S Y 18S, junto con un ligero smear por el ARNm. Verdadero. c) La mejor muestra para purificar ADN es el tejido fijado en formal e incluido en parafina, porque la fijación con formal conserva perfectamente la integridad de los ácidos nucleicos. Falso. d) Cuando el ADN se degrada, en la electroforesis se observa un smear, cuya amplitud e intensidad depende del grado de fragmentación y degradación del ADN. Verdadero. e) En la electroforesis de ADN plasmídico íntegro se observan múltiples bandas por la formación de dímelos, trímeros, tetrámeros… Falso. 11. Analiza la pureza de las siguientes muestras: En las muestras en las que consideres que hay contaminación, explica cuáles pueden ser los posibles contaminantes y propón soluciones para eliminarlos. Muestra 1: ADNds. A230 = 0’182 / A260 = 0’352 / A280 = 0’265 / A320 = 0’025 A260 / A280 = (0’352 - 0’025) / (0’265 - 0’025) = 1’36 A260 / A230 = (0’352 - 0’025) / (0’182 - 0’025) = 2’08 El cociente A260 / A280 es inferior a 1’6, por lo que es razonable pensar que el ADN está contaminado con proteínas o derivados fenólicos. Si la purificación no se hizo con solventes orgánicos, lo lógico es que la contaminación sea por proteínas y se pude solucionar mediante un tratamiento con proteínas a K, seguido de precipitación, lavado y resuspensión del ADN. Si la purificación se hizo con solventes orgánicos, lo más probable es que la contaminación sea producida por restos del fenol utilizado. En este caso conviene tratar con cloroformo / alcohol isoamílico para crear una fase orgánica, agitar y centrifugar para separar las dos fases (los restos de fenol habrán pasado a la fase orgánica). A partir de la fase acuosa se vuelve a precipitar, lavar y re suspender el ADN. Muestra 2: ADNds. A230 = 0’235 / A260 = 0’436 / A280 = 0’248 / A320 = 0’020 A260 / A280 = (0’436 - 0’020) / (0248 - 0’020) = 1’82 A260 / A230 = (0’436 - 0’020) / (0’235 - 0’020) = 1’93 Se considera ADN puro sin contaminantes. Muestra 3: ARN. A230 = 0’229 / A260 = 0’312 / A280 = 0’166 / A320 = 0’029 A260 / A280 = (0’312 - 0’029) / (0’166 - 0’029) = 2’07 A260 / A230 = (0’312 - 0’029) / (0’229 - 0’029) = 1’41 El cociente A / A es inferior a 1’5 por lo que es razonable pensar que el ARN está contaminado por polisacáridos o sales. Para solucionarlo se precipita nuevamente el ARN, se lava y se resuspende.