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1. REGULACIÓN EN BACTERIAS
Hay distintos niveles de regulación en bacterias:
1. Inicio de la transcripción
2. Terminación de transcripción
3. Una vez que tenemos la molécula de ARN también se
regula la estabilidad de este
4. Traducción
5. Una vez que tenemos el péptido se pueden dar
mutaciones postraduccionales o que influyen en la
expresión del péptido
ADAPTACIÓN AL AMBIENTE
Las bacterias se adaptan al ambiente produciendo de terminadas enzimas solo cuando están presentes
sustratos específicos. Estas enzimas se denominaron enzimas adaptativas. Por el contrario, las enzimas que
se producen continuamente, sea cual sea la composición química del ambiente, se denominaron enzimas
constitutivas. Desde entonces, el término adaptativo se ha reemplazado por otro más preciso, inducible.
• Sistema inducible: la transcripción ocurre en respuesta a la aparición de una molécula pequeña que
modula la actividad de la proteína reguladora. La molécula pequeña moduladora es un inductor.
Tanto si la regulación es inducible como reprimible, puede estar bajo control positivo o negativo.
• Control positivo: la unión de la proteína reguladora a un elemento de actuación en cis es necesaria
para la transcripción. La proteína reguladora es un activador
• Control negativo: la proteína reguladora impide la transcripción cuando se une a un elemento de
actuación en cis (operador). La proteína reguladora es un represor
La unión de un elemento de actuación en trans a un sitio de actuación en cis puede regular el grupo de genes
tanto de forma negativa (desactivando la transcripción) como positiva (activando la transcripción de los
genes del grupo).
• Secuencias cuyos productos actúan en trans. Ej: secuencia que codifica una proteína reguladora
• Secuencia de actuación en cis: secuencia de ADN que afecta la expresión de las secuencias que está
físicamente ligada. Ejemplo: promotor o sitio al que se une una proteína reguladora (operador)
GENES ESTRUCTURALES
Los genes que codifican la estructura primaria de las enzimas se denominan genes estructurales. El operón
lac tiene tres genes estructurales. El gen Z codifica la β-galactosidasa, una enzima cuya función principal es
convertir el disacárido lactosa en los monosacáridos glucosa y galactosa.
Esta conversión es esencial para que la lactosa pueda servir de fuente de energía primaria en la glucólisis. El
segundo gen, lacY, codifica la estructura primaria de la permeasa, una enzima que facilita la entrada de
lactosa en la célula bacteriana. El tercer gen, lacA, codifica la enzima transacetilasa.
Para estudiar los genes que codifican estas 3 enzimas, los investigadores aislaron muchas mutaciones que
eliminan la función de una a otra de estas enzimas. Joshua Lederberg fue el primero en aislar y estudiar estos
mutantes lac-.
Las células mutantes que no pueden producir β-galactosidasa (lacZ - ) o permeasa (lacY - ) activas son
incapaces de utilizar la lactosa como fuente de energía. También se encontraron mutaciones en el gen de la
transacetilasa. Estudios cartográficos realizados por Lederberg establecieron que los tres genes están
estrechamente ligados o son contiguos dentro del cromosoma bacteriano, siguiendo el orden Z-Y-A
El conocimiento de su estrecho ligamiento condujo a otro descubrimiento relevante acerca de lo que
posteriormente sería conocido con regulación de los genes estructurales: los tres genes se transcriben como
una sola unidad, lo que resulta en lo que se denomina ARNm policistrónico. En consecuencia, los tres genes
se regulan coordinadamente, ya que un mismo ARN mensajero sirve de base para la traducción simultánea
de los tres productos génicos.
MUTACIONES DE REGULACIÓN
Lactosa: inductor
metabolizable
En las células que tienen mutaciones constitutivas, las enzimas se producen independientemente de la
presencia o ausencia de lactosa. Estudios de la mutación constitutiva lacF permitieron cartografiar la
mutación y localizarla en un sitio del cromosoma bacteriano cercano a los genes estructurales lacZ, lacY y
lacA, pero no exactamente coincidente con ellos. Esta mutación llevó a los investigadores a descubrir el gen
lacl, que acertadamente se denomina gen represor.
La mutación lac OC se encuentra en la región operadora del operón. Puesto que en ambos tipos de mutantes
constitutivos las enzimas se producen continuamente, se ha eliminado la capacidad de inducción y se ha
perdido la regulación genética.
Operón
inducible con
control negativo
El operón lac está formado por los genes estructurales Z, Y y A , y por las secuencias adyacentes de ADN
conocidas como región operadora. Estos científicos argumentaron que el gen lacl regula la transcripción de
los genes estructurales produciendo una molécula represora, y que el represor es alostérico, lo que significa
que es una molécula que puede interactuar con otra molécula de manera reversible, sufriendo tanto un
cambio conformacional de su forma tridimensional como un cambio en su actividad química
En resumen, el modelo del operón utiliza una serie de interacciones entre proteínas, inductores y ADN para
explicar la regulación eficiente de la expresión de los genes estructurales. En ausencia de lactosa, no se
necesitan las enzimas codificadas por estos genes, y la expresión de dichos genes se reprime. Cuando hay
lactosa, esta induce indirectamente la activación de los genes uniéndose al represor*. Si toda la lactosa se
metaboliza, no queda lactosa para unirse al represor, el cual puede unirse otra vez al ADN operador para
reprimir la transcripción.
Las mutaciones constitutivas I- y OC interfieren con estas interacciones moleculares, lo que permite la
transcripción continua de los genes estructurales. En los mutantes I, la proteína represora está alterada o
ausente y no puede unirse a la región operadora, por lo que los genes estructurales están siempre activados.
En el caso del mutante OC, la secuencia nucleotídica del ADN del operador está alterada y no puede unirse
con una molécula represora normal. El resultado es el mismo: los genes estructurales se transcriben siempre.
El modelo del operón es especialmente bueno porque conduce a tres predicciones importantes que pueden
comprobarse para determinar su validez. Estas predicciones son:
(1) el gen I produce un producto celular difusible (es decir, un producto de actuación en trans);
(2) la región O está implicada en la regulación, pero no genera ningún producto; y
(3) la región O tiene que ser adyacente a los genes estructurales para poder regular su transcripción.
La creación de bacterias parcialmente diploides permite evaluar estas suposiciones, especialmente las que
predicen la presencia de elementos reguladores de actuación en trans.
Mutaciones en el operador
Por ejemplo, el plásmido F puede contener genes cromosómicos, en cuyo caso se denomina F’. Cuando una
célula F- adquiere uno de estos plásmidos, contiene su propio cromosoma y uno o más genes adicionales
presentes en el plásmido. Esta célula huésped es por tanto un merocigoto, una célula que es diploide para
determinados genes añadidos (pero no para el resto del cromosoma). El uso de estos plásmidos hace que
sea posible, por ejemplo, introducir un gen I+ en una célula huésped cuyo genotipo sea I-, o introducir una
región 0+ en una célula huésped de genotipo OC.
3. MUTACIONES POLARES
Cuando hay bajos niveles de glucosa no se produce la inhibición de la adenilato ciclasa por lo que se forma
AMPc. Pueden ocurrir 2 situaciones:
1) Los niveles de AMPc son bajos, y por tanto es menos probable que este se una a la CAP
2) Si esta unión no se produce la ARN pol no se une al ADN de forma tan eficiente
3) Los resultados son bajas tasas de transcripción
La conclusión de esto es que la presencia de glucosa reprime la expresión del operón de lactosa
El operón del Trp tiene una particularidad, una secuencia denominada líder, muy larga que se encuentra
antes de los genes estructurales. También posee un atenuador el cual es un 2º nivel de regulación
La concentración del Trp es alta, por lo que el represor trp normalmente es inactivo, por lo que la proteína
reguladora inactiva (represor) no puede unirse al operador y tiene lugar la transcripción de los genes
estructurales.
Si la concentración de Trp es baja, este se une al represor y lo activa, por lo que el represor trp se une al
operador inactivando la transcripción
CONTROL DE ATENUACIÓN
Con una alta concentración de Trp la traducción en ARNt que sintetiza Trp y el ribosoma, siguen avanzando.
En cambio, si hay baja concentración de Trp en el medio no habrá ARNt que lo sinteticen y el ribosoma se
queda retenido o reprimido. También si sigue avanzando por la presencia de Trp llega un codón de fin de
mensaje (STOP) y el ribosoma se desensambla provocando el final de la transcripción prematura.
El operón del Trp está regulado tanto por atenuación como por represión, aunque la mayoría de los operones
están regulados solo por uno de estos mecanismos.
La atenuación se descubrió por Charles Yanofki, aislando una serie de mutantes que presentaban altos niveles
de transcripción, aunque el control en el sitio del operador no estaba afectado, lo que sugirió que algún
mecanismo distinto a la represión en el sitio del operador controlaba la transcripción
También observaron que se transcribían 2 ARNm de diferente tamaño a partir del operón del trp:
- Uno largo que contenía la secuencia para los genes estructurales
- Otro mucho más corto que contenía solo 140 nucleótidos
Estas observaciones le llevaron a postular que un mecanismo que causaba la terminación prematura de la
transcripción que también regula la transcripción en el operón trp
Entre las causas de la producción de estas moléculas se encuentra la falta de metabolitos como glucosa, la
falta de aminoácidos y la presencia de productos metabólicos tóxicos (alcohol, por ejemplo)
La alarmona arquetípica es ppGpp (3’-difosfato, 5’-difosfato Guanosina), que se une a las subunidades β y β’
de la ARNpol, modificando la afinidad por promotores. Otro ejemplo que también se une a la ARN pol es la
pppGpp
9. REGULACIÓN POSTRADUCCIONAL
REGULACIÓN ALOSTÉRICA: es un modo de regulación de las enzimas por el que la unión de una molécula en
una ubicación (sitio alostérico) modifica las condiciones de unión de otra molécula, en otra ubicación (sitio
catalítico) de la enzima, distante de la primera. Como por ejemplo:
La principal diferencia de las células eucariotas con respecto a las procariotas es el núcleo, además de la
presencia de cromatina en las primeras
La relajación de la cromatina en estos sitios permite el acceso de las proteínas reguladoras a sitios de unión
del ADN
Por lo menos 3 procesos diferentes afectan la regulación génica por modificación de la estructura de la
cromatina:
Las histonas del octámero del nucleosoma tienen 2 dominios, las colas de las histonas a menudo son
modificadas por la adicción o la eliminación de grupos fosfatos, metilo o acetilo.
Todas estas modificaciones se han denominado código de histonas, porque codifican la información que
afecta a la manera de expresión de los genes, por modificación directa de la estructura de la cromatina, o,
en algunos casos por servir como sitio de reconocimiento para las proteínas que se unen al ADN y que
después regulan la transcripción
La relación entre la metilación del ADN y la desacetilación de las histonas es que ambas se inactiva el
cromosoma X de las hembras de mamíferos
Las “islas” de CpG suelen acumularse corriente arriba del inicio de la transcripción
Las señales epigenéticas por ejemplo, son modificaciones en la ADN que no tienen nada que ver con la
secuencia primaria de nucleótidos que además se mantienen en el tiempo
En la misma secuencia puede haber citosinas metiladas y no metiladas, lo que provocará que cuando se
produzca la replicación la citosina no metilada no sea reconocida por la metilasa de mantenimiento y lo que
está metilada si lo hará
ACETILACIÓN Y METILACIÓN
La acetilación de histonas provoca la activación de la cromatina, sin embargo, la metilación del ADN y de
sitios específicos en las histonas inactiva la cromatina
ENSAMBLAJE DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN
Un ejemplo de proteína activadora de la transcripción es la GAL4, que regula la transcripción de varios genes
de levaduras cuyos productos metabolizan galactosa, estos genes que controlan el metabolismo de la
galactosa son inducibles
En ausencia de galactosa estos genes no se transcriben y no se producen las proteínas que degradan a la
galactosa. En presencia de galactosa, se transcriben los genes y se sintetizan las enzimas
Los genes estructurales de GAL4 se activan con la presencia de galactosa y se inactivan con la presencia de
glucosa. En eucariotas cada gen estructural, posee su propio promotor que se regulan de manera conjunta
En la imagen las franjas azules son UAS, el sitio de unión de GAL4 al gen
Los genes reguladores, se encuentran en
distintos cromosomas, o en cualquier parte
del genoma. El dominio de unión al ADN se
da por secuencias que se encuentran en el
promotor
Cuando hay Gal presente, esto se une a otra proteína denominada GAL3, que interactúa con GAL80, lo que
causa un cambio de conformación que le hace tener más afinidad por GAL80, de manera que esta ya on
puede unirse a GAL4. Entonces GAL4 puede activar la transcripción de los genes, cuyos productos
metabolizan la galactosa
Los genes procarióticos suelen estar organizados en operones, y se generan ARNm policistrónicos (con varios
cistrones)
Sin embargo, las unidades transcripcionales eucarióticas suelen ser monocistrónicas, con secuencias no
traducidas y las que se pueden traducir dan lugar a una proteína
Si bien la mayoría de las células eucariontes no poseen operones, varios genes eucariontes pueden ser
activados por el mismo estímulo
Los genes que se expresan de forma coordinada en los procariontes se debe a que se encuentran físicamente
juntos, sin embargo, en los eucariontes se debe a que las células eucariontes pueden responder al mismo
estímulo, porque tienen secuencias reguladoras cortas en común en sus promotores o intensificadores
Estas secuencias reguladoras del ADN se denominan elementos de respuesta, estos, son sitios de unión para
activadores de la transcripción, y se disponen a lo largo de la región promotora. Puede haber 2 opciones:
1) Un único estímulo puede activar diferentes genes, ya que el mismo elemento de respuesta puede
estar presente en diferentes genes
2) Un solo gen puede ser activado por múltiples estímulos, como por ejemplo el gen de la
metalotioneína
A. GRE: elemento de respuesta a glucocorticoides
B. ARE: elemento de respuesta a antioxidantes
C. MRE: elemento de respuesta a metales
D. BLE: elementos de nivel basal
El procesamiento de los intrones, puede dar lugar a diferentes proteínas o variantes a partir de un mismo, es
decir, que se producen distintas proteínas a partir de un mismo gen. Las distintas formas de una proteínas
podrían ser generadas por genes relacionados, o podrían generarse por el mismo gen, se denominan
isoformas
En los eucariontes la transcripción y traducción no son simultáneas como en las procariotas, porque la
transcripción en eucariotas tiene lugar en el núcleo, y después los pre-ARNm son procesadas antes de
movilizarse al citoplasma para la traducción, lo que ofrece oportunidades para el control génico después de
la transcripción
Por ejemplo, la regulación génica mediada por corte y empalme, la cual posibilita que un pre-ARNm sea
cortado y empalmado de múltiples maneras, lo que genera diferentes proteínas en distintos tejidos o en
diversos momentos del desarrollo
En el ejemplo de la imagen, en ambos sexos la proteçina se traduce a través de un único gen, por llo que se
debería dar una única proteína, sin embargo, al eliminarse el exón B hace que se de un codón de STOP
prematuro que daría lugar a una proteína no funcional en el fenotipo de los machos
La cantidad de proteína que se sintetiza depende de la cantidad de ARNm correspondiente disponible para
la traducción. A su vez, la cantidad de ARNm disponible depende de la velocidad de síntesis del ARNm y de
la velocidad de degradación del mismo
Por lo general los ARNm eucariontes son más estables que los ARNm bacterianos, que suelen durar unos
pocos minutos antes de ser degradados
Aunque hay una gran variedad de estabilidad y vidas medias de los ARNm en eucariontes, lo que puede
provocar grandes diferencias en la cantidad de proteína sintetizada
La escasez de hierro provoca que la traducción del ARNm de la ferritina sea bloqueada, por lo que no se
produce la proteína de la ferritina. Sin embargo, en escasez de Fe si el ARNm tiene un receptor de la
transferrina este ARNm es estable y se traduce
Si tenemos un extremo 3’-UTR libre se produce la degradación del mensajero, aunque se encuentre presente
el Fe, haciendo que no se produzca tampoco el receptor de la transferrina
ARN INTERFERENTE Y SILENCIAMIENTO
A. Los ARN del interferencia pequeños (ARNsi) degradan el ARNm por escisión, la enzima Dicer escinde
el ARN bicatenario para producir ARN de interferencia pequeños. Estos se combinan con el complejo
proteico RISC y se aparean con secuencias complementarias del ARNm. El complejo escinde el ARNm
y después de la escisión, se degrada el ARN
B. Los micro-ARN (ARNmi) inducen inhibición de la traducción. Otras regiones bicatenarias de moléculas
de ARN son escindidas por la enzima Dicer para producir micro-ARN algunos de estos se combinan
con el complejo RISC y se aparean de manera imperfecta con un ARNm, lo que induce la inhibición
de la traducción
Otros ARNsi se unen a secuencias complementarias del ADN y atraen enzimas metiladoras, que
metilan el ADN o las histonas e inhiben la transcripción
Estos mecanismos son útiles para defensa frente a virus y transposones y regulación de genes dendógenos