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El capítulo concluye con una breve discusión de los conceptos de la bioquímica experimental
moderna y una introducción a la biología de sistemas, una estrategia de investigación utilizada
para mejorar nuestra comprensión de los organismos vivos como sistemas integrados en lugar
de colecciones de componentes aisladas y reacciones químicas.
¿QUÉ ES LA VIDA?
Gran parte de la dificultad para delinear la naturaleza precisa de los organismos vivos reside
en la abrumadora diversidad del mundo vivo y la aparente superposición en varias
propiedades de la materia viva y no viva. En consecuencia, la vida ha sido vista como una
propiedad carbono, nitrógeno, oxígeno, y fósforo.
All Rightsvibrantes
Los ejemplos incluyen los ácidos nucleicos, las proteínas y los polisacáridos, que se forman a
partir de los nucleótidos, aminoácidos y azúcares, respectivamente. La capacidad de los
organismos vivos para regular los procesos metabólicos a pesar de la variabilidad en sus
entornos internos y externos se denomina homeostasis. En organismos multicelulares, otros
niveles de organización incluyen tejidos, órganos y sistemas de órganos. La vida es celular.
Los hidrocarburos son moléculas que contienen carbono e hidrógeno que son hidrófobas o
insolubles en agua. Todas las demás moléculas orgánicas se forman uniendo otros átomos o
grupos de átomos a la cadena principal de carbono del hidrocarburo. Las propiedades
químicas de estas moléculas derivadas están determinadas por la disposición específica de
los átomos llamados grupos funcionales . Primero, se usan en la síntesis de moléculas más
grandes, muchas de las cuales son polímeros.
Los ácidos grasos son componentes de las moléculas de lípidos de varios tipos .
En los aminoácidos , es el tipo más común, el grupo amino está unido al átomo de carbono
inmediatamente adyacente al grupo carboxilo . En los aminoácidos β y, el grupo amino está
unido al segundo y tercer carbono, respectivamente, del grupo carboxilo. Varios ejemplos de
aminoácidos se presentan en la figura 1.4. Fórmulas estructurales para varios aminoácidos .
Las proteínas también contienen aminoácidos no estándar que son versiones modificadas de
los aminoácidos estándar. La estructura y la función de las moléculas de proteína a menudo
se alteran mediante la conversión de ciertos residuos de aminoácidos en derivados mediante
fosforilación, hidroxilación y otras modificaciones químicas. Muchos aminoácidos naturales no
son aminoácidos . Las moléculas de aminoácidos se usan principalmente en la síntesis de
polímeros largos y complejos conocidos como polipéptidos.
Aunque el grupo carboxilo cargado tiene afinidad por el agua, las largas cadenas de
hidrocarburos no polares hacen que la mayoría de los ácidos grasos sean insolubles en
agua. Los nucleótidos también tienen un papel importante como moléculas de subunidades
estructurales de los ácidos nucleicos.
DEsíPUEBLA
Providedcuatro formar una doble hélice dextrógira Una vista ampliada de dos pares de
bases. Las bases en las cadenas opuestas forman pares debido a los enlaces de
hidrógeno. Las secuencias de codificación, llamadas genes, especifican la estructura de los
productos genéticos funcionales como los polipéptidos y las moléculas de ARN. El ácido
ribonucleico es un polinucleótido que difiere del ADN en que contiene la ribosa de azúcar en
lugar de desoxirribosa y el uracilo como base en lugar de timina.
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Reacciones bioquímicas
Por ejemplo, los enlaces amida de las proteínas se hidrolizan en el estómago en una reacción
catalizada por los ácidos que produce aminoácidos. La hidrólisis de ATP para producir ADP y
fosfato inorgánico y la reacción de glucosa con ATP proporcionan dos ejemplos de sustitución
nucleófila que implica la transferencia de un grupo fosforilo. El ataque por parte del OH del
agua al fosfato terminal de ATP rompe el enlace del fosfoanhídrido, liberando así energía que
se utiliza para impulsar muchos procesos celulares. La reacción de la glucosa con el
ATP, produciendo glucosa6fosfato y ADP, es el primer paso en la utilización de la glucosa
como fuente de energía.
REACCIONES
La eliminación del H2O desde las biomoléculas que contienen grupos funcionales de alcohol
es una reacción frecuente. Un ejemplo destacado es la deshidratación del 2fosfoglicerato, una
reacción de la glucólisis, que es una vía bioquímica en el metabolismo de los
carbohidratos . Como se ilustra en las Introducción, esta reacción ocurre a través de un
mecanismo E1cB. Una reacción de eliminación.
Por ejemplo, los ácidos grasos contienen proporcionalmente más átomos de hidrógeno que
los azúcares y, por tanto, producen más energía tras la oxidación. Cada vez que se transfiere
un electrón, se pierde energía. Las células tienen mecanismos complejos para explotar este
fenómeno de una manera que permite capturar parte de la energía liberada para el trabajo
celular. La característica más destacada de la generación de energía en la mayoría de las
células es la vía de transporte de electrones, una serie de moléculas transportadoras de
electrones incorporadas en la membrana.
Durante un proceso regulado, se libera energía a medida que los electrones se transfieren de
una molécula transportadora de electrones a otra. Durante varias de estas reacciones
redox, la energía liberada es suficiente para impulsar la síntesis de ATP, la molécula
transportadora de energía que suministra directamente la energía utilizada para mantener
estructuras y funciones celulares altamente organizadas. A pesar de sus muchas
similitudes, los grupos de organismos vivos difieren en las estrategias precisas que utilizan
para adquirir energía de su entorno. Los heterótrofos obtienen energía al degradar moléculas
de alimentos preformados obtenidos al consumir otros organismos.
Por ejemplo, la glucólisis, la vía generadora de energía que degrada el azúcar de seis
carbonos, la glucosa, se compone de 10 reacciones. Todos los procesos metabólicos de un
organismo individual consisten en un vasto patrón similar a una red de reacciones bioquímicas
interconectadas que se regulan de tal manera que se conservan los recursos y se optimiza el
uso de energía. Debido a que la biosíntesis aumenta el orden y la complejidad, las vías
anabólicas requieren un aporte de energía. Algunas vías catabólicas liberan energía.
Una fracción de esta energía es capturada y utilizada para impulsar las reacciones anabólicas.
TRANSFERENCIA
Las vías de transducción de las señales permiten que las células reciban y respondan a las
señales de su entorno. Por ejemplo, la glucosa se une a su receptor en las células
pancreáticas secretoras de insulina, por lo que la insulina se libera en la sangre. Más
comúnmente, tales respuestas son un aumento o una disminución en la actividad de las
enzimas ya existentes o la síntesis de nuevas moléculas enzimáticas. Los componentes
celulares se sintetizan en una amplia gama de reacciones químicas, muchas de las cuales
requieren energía, suministrada directa o indirectamente por las moléculas de ATP.
Provided
Sin embargo, otras moléculas son tan tóxicas que han evolucionado procesos específicos
para proporcionar su eliminación. Las células vivas también contienen una amplia variedad de
moléculas potencialmente tóxicas que deben eliminarse. Las células vegetales resuelven este
problema transportando dichas moléculas a una vacuola, donde se descomponen o
almacenan. Las sustancias hidrófobas como las hormonas esteroideas, que no se pueden
descomponer en moléculas más simples, se convierten durante una serie de reacciones en
derivados solubles en agua.
BIOLOGÍA DE SISTEMAS
La información del panorama de los procesos bioquímicos sobre los que acaba de leer se
descubrió utilizando un método de investigación basado en el reduccionismo. Cada parte
individual se desglosa aún más para que se puedan determinar las propiedades químicas y
físicas de sus moléculas y las conexiones entre ellas. En las últimas décadas, se ha utilizado
un nuevo enfoque llamado biología de sistemas para lograr una comprensión más profunda de
los organismos vivos. Basado en los principios de la ingeniería desarrollados originalmente
para construir aviones a reacción, la biología de sistemas considera a los organismos vivos
como sistemas integrados.
3:23individuales
En contraste, los sistemas han evolucionado y error durante varios miles de millones de años.
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En contraste, los sistemas biológicos han evolucionado por ensayo y error durante varios
miles de millones de años. Los sistemas vivos se han vuelto cada vez más complejos, en
parte debido a la inevitabilidad de las interacciones entre los componentes del sistema
establecido y partes nuevas potencialmente útiles . El enfoque de sistemas es especialmente
útil porque la mente humana no puede analizar los cientos de reacciones bioquímicas que
tienen lugar a la vez en un organismo vivo.
Para abordar este problema, los biólogos de sistemas han inventado modelos matemáticos y
computacionales para derivar de las vías de reacción bioquímica una comprensión de cómo
operan estos procesos a lo largo del tiempo y bajo condiciones variables. Además, los
biólogos de sistemas organizan las vastas complejidades de las células vivas con conceptos
como sistemas, redes, módulos y motivos, que también se describen brevemente.
Robustez
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Los mecanismos de control a prueba de fallos, ya sea en sistemas hechos por el hombre o en
organismos vivos, son caros. Las restricciones como la disponibilidad de energía requieren
prioridades en la asignación de recursos. Como resultado, los sistemas por lo general están
protegidos de los cambios ambientales que se encuentran comúnmente, pero son vulnerables
a eventos inusuales o raros que causan daños. All y la proteómica la investigación de los
patrones de síntesis de las rutinaria para controlar la expresión génica de las células.
La biología de sistemas es un nuevo campo que intenta proporcionar una comprensión de las
propiedades funcionales de los organismos vivos mediante la aplicación de estrategias de
modelos matemáticos a los datos biológicos acumulados. Entre los primeros beneficios del
enfoque de sistemas se encuentran los conocimientos asociados con la emergencia, la
robustez y la modularidad.
Grupo hidroxilo e. Ácido graso d. Ácido graso saturado e. Ácido graso insaturado a.
Ácido nucleico b. Molécula señal d. La forma biológicamente activa de un ácido graso es el
tioéster de ____________. Nombra cuatro clases de biomoléculas pequeñas.
¿Por qué los ácidos grasos son la principal reserva de energía a largo plazo del
cuerpo?
Cuando la sal de sodio de un ácido graso se mezcla con agua, el grupo carboxilato de la
molécula se hidrata, pero la porción hidrofóbica de la molécula está pobremente hidratada, si
es que lo hace. Usando un círculo para representar el grupo carboxilato y una línea ondulada
adjunta para representar la cadena de hidrocarburos de un ácido graso, dibuje cómo
interactúan los ácidos grasos con el agua.
Por ejemplo, el ácido acético forma un tioéster con una molécula llamada coenzima A, que
tiene un grupo sulfhidrilo.
Preguntas de comprensión
Cuando esta molécula se acumula en las células cerebrales, un niño sano sufre un deterioro
motor y mental dentro de los meses posteriores al nacimiento y muere a la edad de tres
años. En términos generales, describa cómo un biólogo de sistema evalúa este
fenómeno. Las células cancerosas en un tumor proliferan sin control, y el tratamiento a
menudo implica el uso de drogas tóxicas en un intento de matarlas. Una o más células en el
tumor han expresado el gen de la glucoproteína P, una proteína de transporte de membrana
que bombea los medicamentos fuera de las células.
En ausencia de las moléculas de drogas tóxicas, estas células nuevamente crecen sin control
y eventualmente se convierten en las células dominantes en el tumor. ¿Qué características de
los organismos vivos ilustra este proceso?.
¿Cuáles son los posibles productos de una reacción de hidrólisis de una amida?
ácido acético d.
iv = ácido carboxílico a.