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Sistemas de secreción

Trends in Microbiology, 25 (7): 532-545, 2017


Transporte de moléculas al
exterior de la célula
¤  Translocación. Transporte de
proteínas intra o a través de la
membrana.
¤  Exportación. Cuando la proteína
es translocada al periplasma.
¤  Secreción. Cuando la proteína
es transportada al medio
extracelular, dentro de otra
célula o a la superficie celular.
¤  Excreción. Transporte
extracelular de moléculas que
nos son de origen proteico (por
ejemplo productos de la
fermentación).
Nature Reviews Molecular Cell Biology 4, 738-744, 2003
Transporte de ¤  Ocurre en las células de los tres
dominios de la vida.
proteínas ¤  La tercera parte de las proteínas
de las células es secretada a
través o insertada en las
membranas.
¤  Bacterias Gram positivas solo en la
membrana citoplasmática.
¤  Bacterias Gram negativos también
ocurre en la membrana externa.
¤  Bacterias fotótrofas además en las
membranas fotosintéticas.
¤  Células eucariotas en las
membranas de los orgánulos.
¤  Bacterias patógenas en la
membrana citoplasmática de las
células hospederas y las toxinas en
http://www.proteinatlas.org/images_learn/
proteome/secretome3.png su sitio blanco.
Secreción de
proteínas
¤  Enzimas hidrolíticas.
¤  Lipoproteínas
periplásmicas.
¤  Toxinas.
¤  Apéndices de superficie.
¤  Proteínas integrales de
membrana:
•  Transporte.
•  Producción de energía.
•  División celular.
•  Receptores de señales
extracelulares.
•  Biogénesis.
Nature Reviews Microbiology 13, 343–359, 2015
Sistemas generales de secreción
¤  Sistema Sec (General Secretory Pathway “GSP”). Sistema de
translocación y exportación de proteínas no plegadas.
¤  Sistema Tat (Twin arginine translocation). Sistema de
translocación y exportación de proteínas plegadas.
¤  Translocasa YidC. Sistema de translocación de proteínas de
Membrana Interna.

ME

Periplasma Sec-dependiente Sec-independiente

MC Tat SEC SEC Yid Yid


C C
Citoplasma

Translocación a través Inserción en la membrana


de la membrana
Sistema Sec
General Secretory Pathway (GSP). Sistema de translocación y
exportación de proteínas no plegadas.

¤  Componentes:

1.  Péptido líder


2.  Proteína chaperona (SecB)
3.  Complejo de proteínas de unión (SecYEG)
4.  ATPasa citoplasmática (SecA)
Sistema Sec
¤  SecYEG + Sec A= translocasa. Es la responsable del
movimiento de la proteína a través de la membrana
citoplasmática.
¤  El complejo SecYE forma un canal conocido como translocón
o canal conductor de proteínas (CCP).
¤  SecG, estimula el transporte y SecD, SecF y yajC son
regulatorias.
¤  Péptido líder (secuencia líder o secuencia señal).
¤  La proteína que será translocada es sintetizada con este
péptido y es removido durante la translocación.
¤  Peptidasa del péptido señal (SPaseI). Libera la proteína
translocada del translocón.
Exportación de proteínas a través
de la vía bacteriana Sec

Nature Reviews Microbiology 15, 21–36, 2017


Exportación de proteínas
a través de la vía
bacteriana Sec

Nature Reviews Microbiology 15, 21–36, 2017


Etapas de la exportación
1.  Clasificación y selección: las proteínas no plegadas (naranja) que
contienen péptidos señal (verde) y las proteínas de la membrana
plasmática se clasifican de forma co-traduccional y se dirigen al canal
SecYEG transmembranal (amarillo) por la partícula de reconocimiento
de señal (SRP; púrpura) y su receptor de membrana FtsY (rosa) o,
postraduccionalmente, por SecA (azul). Las chaperonas ayudan a la
orientación postraduccional: el factor desencadenante (verde oscuro)
y el motor ATPasa SecA se unen a preproteínas en el ribosoma o en el
citoplasma; la chaperona SecB (roja) se une a ellos en el citoplasma.
Las preproteínas pueden dirigirse al translocasa SecYEG-SecA de
forma independiente de la chaperona.
2.  Translocación: las preproteínas se translocan a través de SecYEG hacia
el periplasma o hacia la membrana plasmática, cuyo proceso es
impulsado por ciclos repetidos de unión a ATP e hidrólisis por SecA y la
fuerza motriz de protones (PMF) 16. Los componentes auxiliares SecDF –
YajC6 (marrón) y YidC11 (naranja claro) mejoran la eficiencia de la
translocación.
3.  Maduración y liberación: las peptidasas señal (SPasas; rosa pálido)
cortan los péptidos señal y el dominio maduro se libera en el
periplasma.
Translocación de la pre-
proteína dependiente de SecA
¤  SecA y SecY se muestran como monómeros y el extremo
carboxilo de SecA, donde se cree que SecB se une (etapas
1-4 y 12).
¤  Contornos irregulares indican cambios conformacionales.
¤  La línea gruesa de color naranja
representa a la pre-secreción de proteínas y el rectángulo
naranja representa el N-terminal del péptido de señal.
¤  D: ADP
¤  T: ATP.

Nature Reviews Microbiology 5, 839-851 (Nov 2007)


Translocación de la pre-proteína
dependiente de SecA

Nature Reviews Microbiology 15, 21–36, 2017


Translocación de la pre-proteína
dependiente de SecA
Translocación co-traduccional.
Signal Recognition Particle (SRP)
La translocación de
proteínas es
mediada por una
ribonucleoproteína
(SRP), su receptor
(FtsY) en la
membrana y el
complejo SecYEG.
Requiere la hidrólisis
de GTP en la SRP y
FtsY para liberar la
proteína naciente a
través de SecYEG.
Nature Reviews Microbiology 4, 537-547 (July 2006)
Sec en diferentes organismos

Nature Reviews Microbiology 4, 537-547 (July 2006)


Composición de la translocasa
Sec en los dominios de la vida

Nature Reviews Microbiology 4, 537-547 (July 2006)


Sistema Tat
Twin arginine translocation (Tat). Sistema de translocación y
exportación de proteínas plegadas.
Se ha encontrado en
algunos organismos:
¤  La membrana
citoplasmática en
bacterias y
arqueas.
¤  Membranas
tilakoides de los
cloroplastos en
plantas.
¤  Posiblemente en la
membrana interna
Nature Reviews Microbiology 10, 483-496 (July 2012)
de la mitocondria.
Componentes twin-arginine
translocase (Tat)
Peptido señal (SRRxFLK) en el extremo amino terminal.

3 Dominios
Amino terminal, cargada positivamente.
Hidrofóbico
Carboxilo terminal

Corte de la
Annu. Rev. Microbiol. 2006. 60:373–95 peptidasa
Péptido señal en Tat

Nature Reviews Microbiology 10, 483-496 (July 2012)


Aminoácido Código de tres letras Código de una letra
Alanina Ala A
Arginina Arg R
de aminoácidos Asparagina Asn N
Ácido aspártico Asp D
Nomenclatura

Cisteína Cys C
Glutamina Gln Q
Ácido glutámico Glu E
Glicina Gly G
Histidina His H
Isoleucina Ile I
Leucina Leu L
Lisina Lys K
Metionina Met M
Fenilalanina Phe F
Prolina Pro P
Serina Ser S
Treonina Thr T
Triptófano Trp W
Tirosina Tyr Y
Valina Val V
Proteínas TatABC

Tat translocasa: Proteínas membranales (TatA, TatB y TatC).


¤  TatA forma el poro por medio de subunidades .
¤  TatB tiene función semejante a TatC sin embrago no se
encuentra presente en todos los microorganismos.
¤  TatC funciona en el reconocimiento de las proteínas.

Annu. Rev. Microbiol. 2006. 60:373–95


Presencia de
Tat B

TatA (verde)
TatB (amarillo)
TatC (púrpura)

A) E. coli K-12
B) Bacillus subtilis
C) Halobacterium sp.
D) Tilakoides de maíz

Tat B pudiera servir como


mediador entre Tat A y C.
Modelo de translocación de Tat
en E. coli y cloroplastos

Nature Reviews Microbiology 10, 483-496 (July 2012)


Modelo Tat

Annu. Rev. Microbiol. 2006. 60:373–95


Trasporte de proteínas plegadas

Nature Reviews Microbiology 10, 483-496 (July 2012)


Translocasa YidC
Translocación e inserción de
proteínas de Membrana
Interna.

Las proteínas de membrana


interna (IMP) pueden
translocarse e insertarse a
través de tres formas
propuestas:

A. Ruta de YidC.
B. Ruta YidC-SRP ?
C. Ruta translocasa Sec-YidC
o SecSRP-YidC

EMBO reports 4, 10, 939–943 (2003)


Proteínas en las membranas
Hay dos tipos de proteínas integrales
de membrana en las membranas
celulares:

¤  Las que contienen regiones


transmembranales (TM) α-hélices
ampliamente distribuidas.
¤  Las que poseen múltiples
plegamientos β, que se
encuentran predominantemente
en la membrana externa de las
bacterias Gram negativas
y de la membrana externa
mitocondrial y de cloroplastos de
las eucariotas.
Topologías de proteínas de
membrana interna
(secuencias topogénicas)
YidC insertasa dependiente e
independiente de Sec

La insertasa YidC tienen la


función de promover la
inserción de proteínas de
membrana en conjunción
con la translocasa Sec (o
Sec-SRP) o independiente
de ella.
Nature Reviews Microbiology 6, 234-244 (March 2008)
Durante la inserción en la
membrana los segmentos Inserción por las
translocasas
transmembranales de la proteína
recién sintetizada se unen a
YidC, la cual facilita el
desplazamiento lateral de los
segmentos hidrofóbicos dentro
Sec y YidC en la MI
de la bicapa y/o asiste en el
plegamiento y ensamblaje. YidC
también actúa como proteína
insertasa de membrana
independiente de Sec de ciertas
pequeñas proteínas de
membrana. Estas proteínas se
unen directamente a YidC o
posiblemente utilizan el sistema
SPR y FtsY para la unión. Aún se
desconoce que determina que
las proteínas recién sintetizadas
empleen un sistema Sec-
dependiente o Sec-
independiente. PMF: fuerza
protón motriz.
Microbial Cell Factories 2008 7:10
YidC interactúa con los
segmentos TM de dos maneras

Nature Reviews Microbiology 6, 234-244 (March 2008)

En el modelo secuencial, el primer segmento TM es liberado de


YidC para entrar en la fase lipídica antes de unirse a la siguiente
hélice TM (a).
YidC interactúa con los
segmentos TM de dos maneras

Nature Reviews Microbiology 6, 234-244 (March 2008)

En el modelo de ensamblaje de sitio, YidC tiene un papel


importante en el acomodo de las regiones TM en un paquete (b).
El conjunto de los segmentos TM se libera de YidC y entran en la
bicapa lipídica al mismo tiempo.
En ambos casos, los segmentos TM pasan el canal SecYEG uno a
la vez mientras que YidC actúa como un acompañante
transfiriendo los dominios TM en la bicapa lipídica.

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