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Venecia
Bioquímica Bloque 1
Hecho por:
Enrique Santos Díaz
Frida Monroy Castillo
1. AGUA Y ELECTROLITOS:
2. EQUILIBRIO ACIDO-BASE:
2.1. Generalidades
2.2. Sistema amortiguador
3. AMINOACIDOS Y PROTEINAS:
4. ENZIMAS Y COENZIMAS:
4.1. Fisicoquímica
4.2. Sistema enzimático
4.3. Cinética enzimática
4.4. Enzimología médica
NOTA:
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1. Agua y electrolitos.
Densidad electrónica:
Es la ALTA CAPACIDAD DE LOS HIDRÓGENOS CON SU CARGA POSITIVA Y LA DEL OXÍGENO
CON SU ALTA ELECTRONEGATIVIDAD, ES PARA SU UNIÓN Y FORMAR MOLÉCULAS DE AGUA,
MEDIANTE UN ENLACE DE TIPO COVALENTE POLAR.
Dipolo:
La POLARIDAD DEL AGUA LE PERMITE TENER PROPIEDADES SOLVENCIA Y FORMAR PUENTES DE
HIDRÓGENO, Y TAMBIÉN ESTÁN ESTRECHAMENTE ASOCIADAS A LAS PROPIEDADES
FISICOQUÍMICAS DEL AGUA. Los PUENTES DE HIDRÓGENO SON LA ASOCIACIÓN ENTRE 2
MOLÉCULAS, MEDIADA POR EL ÁTOMO DE HIDRÓGENO, que requiere de direccionalidad y
acercamientos muy precisos; la energía de este tipo de enlace es 20 veces menor que la de
un enlace covalente.
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Calor de evaporación:
Representa la CANTIDAD DE ENERGÍA QUE REQUIEREN LAS MOLÉCULAS EN EL ESTADO LÍQUIDO
PARA VENCER SU MUTUA ATRACCIÓN Y ALEJARSE UNAS DE OTRAS PARA CONVERTIRSE EN
ESTADO GASEOSO. El calor de evaporación del agua también ES ALTO (539 CAL/G),
NECESARIA PARA MINIMIZAR LAS PÉRDIDAS DE AGUA que pudieran ocurrir en los seres vivos
debido a la evaporación, de manera que PROTEGE CONTRA LA DESHIDRATACIÓN AL
EXPONERSE AL SOL (TERMORREGULADOR).
Calor específico:
Se define como la CANTIDAD DE ENERGÍA CALORÍFICA NECESARIA PARA AUMENTAR LA
TEMPERATURA DE 1 GRAMO DE UNA SUSTANCIA, A 1°C. En los mamíferos, el elevado calor
específico del agua ayuda a MANTENER LA TEMPERATURA HOMOGÉNEA O CONSTANTE EN EL
CUERPO, MEDIANTE EL BOMBEO CONSTANTE DE SANGRE.
Tensión superficial:
SE MANIFIESTA EN LA SUPERFICIE DE UN LÍQUIDO Y CORRESPONDE A LA CANTIDAD DE ENERGÍA
NECESARIA PARA AUMENTAR SU SUPERFICIE POR UNIDAD DE AREA, esta propiedad DEPENDE
DE LA ATRACCIÓN QUE SUFREN LAS MOLÉCULAS DE LA SUPERFICIE HACIA EL SENO DEL LIQUIDO
FORMANDO UNA MEMBRANA. ESTA PROPIEDAD PROVOCA EL COLAPSO DE LOS ALVÉOLOS, TAL
COLAPSO EVITADO POR EL FACTOR SURFACTANTE, AGENTE TENSO-ACTIVO producido por los
Neumocitos tipo II y compuesto principalmente por dipalmitoilfosfatidilcolina, su principal
función es abrir los alvéolos para poder respirar.
Calor de fusión:
Representa la ENERGÍA CINÉTICA QUE DEBEN ADQUIRIR LAS MOLÉCULAS DEL SÓLIDO PARA
PASAR DE UN ORDEN CONTINUO, IMPUESTO POR LAS FUERZAS DE ATRACCIÓN EN EL SÓLIDO,
HACIA UN ORDEN DISCONTINUO CARACTERÍSTICO DEL LÍQUIDO. En los seres vivos, el alto calor
de FUSIÓN DEL AGUA (80 cal/g) OFRECE UN SISTEMA EFICIENTE DE PROTECCIÓN CONTRA EL
CONGELAMIENTO.
Constante dieléctrica:
Es la PROPIEDAD DE LOS SOLVENTES DE SEPARAR IONES DE CARGAS OPUESTAS, UN EJEMPLO
SON LOS FÁRMACOS a una temperatura de 20°- 80°C.
Hidratación:
ES LA CAPACIDAD DE RODEAR LOS IONES CON MOLÉCULAS DE AGUA QUE SE ORIENTAN SEGÚN
LA CARGA DE LOS IONES y se disponen en capas concéntricas de moléculas alrededor del
ion. Cuando el solvente es distinto del agua, esta propiedad recibe el nombre de solvatación.
Hidrólisis:
ÉSTA ES LA REACCIÓN QUÍMICA EN LA QUE INTERVIENE UNA MOLÉCULA DE AGUA que
reacciona con otra molécula diferente. En la reacción se fragmentan ambas moléculas.
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El agua como solvente:
Al agua se le IDENTIFICA COMO EL SOLVENTE UNIVERSAL, DEBIDO A SU CAPACIDAD DE
DISOLVER MÁS SUSTANCIAS Y EN MAYOR CANTIDAD QUE CUALQUIER OTRO SOLVENTE, ESTO
GRACIAS A SUS PROPIEDADES COMO, POR EJEMPLO, LA CONSTANTE DIELÉCTRICA DEL AGUA,
SU CAPACIDAD DE HIDRATACIÓN Y DE FORMACIÓN DE PUENTES DE HIDRÓGENO, ASÍ COMO
LA POSIBILIDAD DE ROMPER LOS ENLACES IÓNICOS DE LAS MOLÉCULAS QUE DISUELVE,
EXPLICAN EL COMPORTAMIENTO DEL AGUA COMO SOLVENTE UNIVERSAL. La ATRACCIÓN
ELECTROSTÁTICA DE IONES CON CARGAS OPUESTAS DISMINUYE 80 VECES (CONSTANTE
DIELÉCTRICA DEL AGUA) AL COLOCARSE EN AGUA, POR LO TANTO, LOS SIGUIENTES EJEMPLOS
DESCRIBEN LO ANTERIOR:
A. Ion positivo: En este ION ATRAE LAS CARGAS NEGATIVAS DE LAS MOLÉCULAS DEL AGUA,
LAS CUALES SE DISPONEN EN CAPAS ALREDEDOR DEL ION.
B. Ion negativo: En este ION ATRAE LAS CARGAS POSITIVAS DE LAS MOLÉCULAS DE AGUA, LAS
CUALES SE DISPONEN EN CAPAS ALREDEDOR DEL ION.
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1.2. Cálculos de la concentración de solutos en una solución acuosa.
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A. Preparación de una solución diluida a partir de una solución concentrada:
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B. Solución Molar o Molaridad: NÚMERO DE MOLES DE SOLUTOS EN 1 LITRO DE SOLUCIÓN.
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D. Solución osmolar u Osmolaridad: MEDIDA QUE EXPRESA EL NIVEL DE CONCENTRACIONES DE
LOS COMPONENTES DE DIVERSAS DISOLUCIONES.
NOTA: Para que este ultimo tema se entienda mucho mejor, te dejamos el siguiente video:
https://www.youtube.com/watch?v=MliayqufMWQ&t=368s
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1.3. Presión osmótica
Propiedades de las soluciones:
SON LAS QUE MODIFICAN AL AÑADIR UN SOLUTO, SE DENOMINAN PROPIEDADES COLIGATIVAS
(LIGADAS EN CONJUNTO). La PRESION OSMOTICA CORRESPONDE A LA PRESION HIDROSTATICA
QUE SE APLICA A LA SOLUCIÓN CONCENTRADA PARA IMPEDIR EL FLUJO DE AGUA DESDE LA
SOLUCIÓN DILUIDA, CUANDO AMBAS ESTÁN SEPARADAS POR UNA MEMBRANA
SEMIPERMEABLE, QUE PERMITE EL FLUJO DE AGUA, PERO NO EL DE LOS SOLUTOS DISUELTOS.
• Anión: Es un ion con carga eléctrica NEGATIVA, QUE HA GANADO MÁS ELECTRONES.
• Electrolito: Sustancia que CONTIENE EN SU COMPOSICIÓN IONES LIBRES, que hacen que
se comporte como un conductor eléctrico.
• Anfolito (anfótera): Sustancia química que PUEDE REACCIONAR TANTO COMO UN ÁCIDO
QUE COMO UNA BASE. El agua es un ejemplo de anfótero.
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Solutos permeables: No electrolitos con la Solutos no permeables: Electrolitos con la capacidad
capacidad de pasar una membrana de pasar una membrana semipermeable con
semipermeable sin ningún problema. ayuda de algún transportador proteico.
HCO3-; anión
a) Solución hipotónica: AUMENTO DEL VOLUMEN CELULAR POR ENTRADA DE AGUA; se tiene
un VALOR MENOR DE 290 mosmol/L, QUE CAUSA HINCHAZÓN Y ROMPIMIENTO
(HEMÓLISIS) CELULAR.
b) Solución isotónica: El VOLUMEN DE LAS CÉLULAS NO CAMBIAN, se tiene un VALOR DE
ENTRE 290 y 310 mosmol/L, ENTRA Y SALE LA MISMA CANTIDAD DE AGUA.
c) Solución hipertónica: DISMINUCIÓN DEL VOLUMEN CELULAR POR SALIDA DE AGUA; se
tiene un VALOR MAYOR DE 310 mosmol/L, QUE CAUSA CRENACIÓN O ARRUGAMIENTO
CELULAR.
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Distribución del agua en el organismo:
Un hombre adulto normal de 70 kg de peso tiene 40L de agua, tiende a mantenerse
constante; cuya composición es constante: 70% de agua, 20% de proteínas y poco menos
de 10% de lípidos. El agua es el componente mayoritariamente del cuerpo humano, y puede
variar en cada género y edad:
A. Líquido extracelular: Es el más estudiado por la facilidad de obtener sus muestras a partir del
suero de la sangre o de los trasudados de las cavidades serosas. La CANTIDAD DE LÍQUIDO
CORPORAL PRESENTA ES EL 20% o 1⁄3 DEL 60% DEL TOTAL DE AGUA DEL CUERPO, SE DIVIDE
EN PLASMA SANGUÍNEO (5% DE AGUA) POR UN LADO y el LÍQUIDO INTERSTICIAL (15% DE
AGUA). LOS IONES QUE SE PRESENTAN MAYORITARIAMENTE EN ESTE COMPARTIMIENTO SON:
SODIO (Na+), CLORO (Cl-) y BICARBONATO(HCO3-).
B. Líquido intracelular: Se encuentran los datos representativos del líquido intracelular que
suelen obtenerse de los músculos o glóbulos rojos. La CANTIDAD DE LÍQUIDO CORPORAL
PRESENTA ES DE 40% O ⅔ DEL 60% TOTAL DEL AGUA DEL CUERPO. LOS IONES QUE SE
PRESENTAN MAYORITARIAMENTE EN ESTE COMPARTIMIENTO SON: POTASIO (K+) FOSFATOS
(HPO43-). La siguiente imagen representa estas cavidades:
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C. Concentraciones aproximadas de iones en los compartimientos:
Intracelular 12 150 4 12 40
Osmolaridad sérica:
Para DETERMINAR LA CONCENTRACIÓN OSMOLAR DE UNA SOLUCIÓN QUE CONTIENE UNA
MEZCLA DE ELECTROLITOS Y NO ELECTROLITOS HAY QUE TENER EN CUENTA LAS
CONCENTRACIONES INDIVIDUALES DE TODOS SUS COMPONENTES. Las siguientes ecuaciones
miden la cantidad de sustancias químicas disueltas en la parte líquida (suero) de la sangre.
Entre las sustancias químicas que afectan la osmolaridad sérica están el sodio, las proteínas
y glucosa.
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Caso de Cólera:
Infección intestinal aguda causada por el Vibrio cholerae O1 o por el Vibrio cholerae O139,
ambos toxigénicos, que se transmite al hombre por la ingesta de agua o alimentos
contaminados; LA ENFERMEDAD SE PRESENTA EN PERSONAS DE CUALQUIER EDAD, Y SE
CARACTERIZA POR DIARREA ABUNDANTE Y VÓMITO, QUE PUEDEN OCASIONAR CHOQUE
HIPOVOLÉMICO Y CAUSAR LA MUERTE. Los pasos que sigue la vibrión colérico:
1. Una vez que el VIBRIÓN COLÉRICO HA LOGRADO ADOSARSE AL BORDE EN CEPILLO DEL
ENTEROCITO, COMIENZA A REPLICARSE Y AL PRODUCIR LA TOXINA COLÉRICA, LA CUAL
ESTA CONSTITUIDA POR DOS FRACCIONES, LA SUBUNIDAD A Y LA SUBUNIDAD B.
4. También, después se formará la TOXINA ZOT (ZONA OCCLUDENS TOXIN) ROMPE LAS
UNIONES OCCLUDENS QUE MANTIENEN LA MUCOSA CELULAR UNIDA Y PRESERVAN LA
INTEGRIDAD DE LA MEMBRANA Y TAMBIÉN ALTERA EL EQUILIBRIO IÓNICO OCASIONANDO
DIARREA. Estas uniones actúan como una barrera que los iones no pueden atravesar por
lo que tienen que ser transportados a través de la membrana celular del enterocito por
bombas específicas; este mecanismo es el responsable de la habilidad del cuerpo para
retener agua.
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2. Equilibrio ácido-base.
A+B→C+D
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Constante de ionización del agua:
ES LA MEDIDA CUANTITATIVA DE LA FUERZA DE UN ÁCIDO EN UNA SOLUCION COMO EL AGUA,
DONDE LA MAYOR PARTE DE LAS MOLÉCULAS SE DISOCIAN O IONIZAN y forman los PROTONES
H+ Y LOS ANIONES A- (BASE CONJUGADA).
➢ Acido débil: En el caso de este, CUANDO SE DISUELVE EN AGUA, PROVOCA UNA GRAN
CANTIDAD DE MOLÉCULAS QUE PERMANECEN EN FORMA NEUTRA O NO DISOCIADA (HA)
SIN CARGA ELÉCTRICA, y una parte pequeña se disocia formando los protones H+, y las
bases conjugadas (A).
➢ Disociación de un ácido más que otro: DEPENDE DE UNA CUALIDAD INTRÍNSECA DE CADA
UNO, DE MANERA CUANTITATIVA, DENTRO DE SU CONSTANTE DE IONIZACIÓN O DE
DISOCIACIÓN.
➢ Mayor constante de ionización: TENDRA MENOS pKA (fuerza que tienen las moléculas
para disociarse).
➢ Menor constante de ionización: TENDRA MAYOR pKA (fuerza que tienen las moléculas
para disociarse).
A. Ácidos: SON SUSTANCIAS QUE LIBERAN IONES HIDRÓGENO (H+ O PROTONES) CUANDO
ESTÁN EN SOLUCIÓN.
B. Bases: SON SUSTANCIAS QUE PUEDEN CAPTAR H+.
4. Sí este EJEMPLO FUERA EL AGUA, ES POSIBLE CONSIDERAR QUE ES UNA SUSTANCIA QUE
PUEDE REACCIONAR COMO ÁCIDO, ES DECIR, LIBERAR H+:
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Curva de titulación:
Esta PERMITE ESTABLECER LA FUERZA DE UN ÁCIDO AL DETERMINAR EL CAMBIO DE PH SI SE LE
AGREGA UNA SOLUCIÓN ALCALINA. Imaginemos que tenemos un recipiente con ácido y le
agregamos una base:
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Cálculos para valores de pH:
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2.2. Sistema amortiguador.
Son las SOLUCIONES QUE CONSERVAN SU pH CON TENACIDAD, AUNQUE SE LES AÑADEN
GRANDES CANTIDADES DE ÁCIDOS O BASES, SE CONOCEN COMO SOLUCIONES
AMORTIGUADORAS, TAMPON O BUFFERS QUE FUNCIONAN EN SEGUNDOS, TIENEN LA
CAPACIDAD DE OPONERSE A CAMBIOS DE pH.
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D. Ecuación de Henderson-Hasselbalch: ECUACIÓN QUE EXPLICA LAS PROPORCIONES DE UNA BASE
CONJUGADA CON RESPECTO AL ÁCIDO, ESTO PARA DETERMINAR EL PH DE UNA SOLUCIÓN
AMORTIGUADORA. La siguiente imagen es la ecuación de Henderson-Hasselbalch:
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Mecanismo de regulación del ácido-base:
A. pH intracelular: Buffers
1. Amortiguador de fosfato:
2. Amortiguador de proteínas:
B. pH extracelular
1. Bicarbonato:
2. Hemoglobina:
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Sistema respiratorio:
SI LOS AMORTIGUADORES NO REGULAN, EL SISTEMA RESPIRATORIO ES EL SEGUNDO EN ACTUAR
(EN MINUTOS). PARTICIPAN CAMBIOS DE LOS VOLÚMENES RESPIRATORIOS Y LA FRECUENCIA
DEL NÚMERO DE RESPIRACIONES (FC), PUES AFECTAN EL TRANSPORTE DE OXÍGENO A LA
SANGRE, EL EFECTO AMORTIGUADOR DE LA HEMOGLOBINA Y LA ELIMINACIÓN DEL ÁCIDO
CARBÓNICO (EN FORMA DE CO2) A TRAVÉS DE LOS PULMONES. Los siguientes ejemplos son
como actua este sistema en el pH:
Sistema renal:
SI EL SISTEMA RESPIRATORIO NO FUNCIONA, EL SISTEMA RENAL ES EL TERCERO EN ACTUAR
(HORAS). LOS RIÑONES SON REGULADORES EFICACES DEL EQUILIBRIO ÁCIDO-BASE POR SU
CAPACIDAD DE ELIMINAR LOS ÁCIDOS FIJOS (IONES H+), pues cuando éstos se producen, al
principio se combinan con HCO3-, impidiendo así cambios importantes en el pH, pero esto
disminuye la reserva alcalina del plasma. El sistema amortiguador de la orina está
conformado por: NH4+ y NH3+, siendo el pH de la orina varía de 4 a 8. Los siguientes ejemplos
son como actua este sistema en el pH:
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Alteraciones del equilibrio Ácido - Base:
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3. Aminoácidos y proteínas.
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B. Aminoácidos esenciales y no esenciales:
Los 20 aminoácidos de las proteínas presentan una variedad de tamaños, formas y
propiedades químicas. La conformación que adoptan las cadenas polipeptídicas en el
espacio es determinada por el volumen y la solubilidad de las cadenas laterales.
ESENCIALES NO ESENCIALES
(Se adquieren de la dieta) (El cuerpo puede producirlos a través del
metabolismo)
● Cadena R Aromática: Contienen estructuras cíclicas que los constituyen en una clase de
hidrocarburos insaturados con nubes electrónicas conjugadas. El benceno es uno de los
hidrocarburos aromáticos más simples y las alifáticas:
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● Cadena R Alifática: Se refiere a hidrocarburos NO aromáticos, como el metano y el
ciclohexano. La glicina, la alanina, la valina, la leucina, la isoleucina y la prolina poseen
grupos R alifáticos.
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2. Aminoácidos Polares: Poseen GRUPOS FUNCIONALES CAPACES DE FORMAR ENLACES POR
PUENTES DE HIDRÓGENO QUE INTERACTÚAN DE FORMA SENCILLA CON EL AGUA
(HIDRÓFILOS). Poseen grupos funcionales. También se une con metales (p. ej., iones hierro
y cobre) en las proteínas; se dividen:
● Aminoácidos Neutros
● Aminoácidos ácidos: Son estándares que poseen cadenas laterales con grupos carboxilo.
Los ácidos glutámico y aspártico tienen pKa cercano a 4, por lo que, en el intervalo
fisiológico de pH, el carboxilo (COOH) se encuentra como carboxilato (COO–), dando
lugar a las bases conjugadas glutamato y aspartato.
GLUTAMATO: PRECURSOR DEL 𝜶- ASPARTATO: PRECURSOR DEL OXALACETATO
CETOGLUTARATO Y GABA (PAPEL Y PARTICIPA COMO RECEPTOR POTENCIAL
IMPORTANTE EN EPILEPSIA) Y PARTICIPA DE PUENTES DE HIDRÓGENO.
COMO RECEPTOR POTENCIAL DE PUENTES
DE HIDRÓGENO.
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● Aminoácidos Básicos: Poseen carga positiva a pH fisiológico, pueden formar enlaces
iónicos con los aminoácidos ácidos. GRUPO AMINO EXTRA.
LISINA: TIENE UN GRUPO ARGININA: PRECURSOR HISTIDINA: Es una BASE DÉBIL PORQUE
AMINO EN LA CADENA DEL ÓXIDO NÍTRICO SÓLO SE IONIZA DE MANERA PARCIAL
LATERAL, ACEPTA UN PARA EN UN pH DE 7, YA QUE SU PKA ES
PROTÓN DEL AGUA VASODILATACIÓN DEL CERCANO A 6. ÚNICO AMINOÁCIDO
PARA FORMAR EL MÚSCULO LISO Y QUE FUNCIONA COMO
ÁCIDO CONJUGADO. TAMBIÉN SE AMORTIGUADOR EN LA SANGRE.
Al unirse con la arginina ENCUENTRA EN EL Precursor de HISTAMINA
forma las histonas. CICLO DE LA UREA. (INFLAMACIÓN Y
BRONCOCONSTRICCIÓN).
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D. Actividad óptica de los aminoácidos: Los 19 DE 20 AMINOÁCIDOS TIENEN 4 GRUPOS DIFERENTES
UNIDOS A SU CARBONO α, TAMBIÉN SON LLAMADOS CARBONOS ASIMÉTRICOS O QUIRALES.
LA GLICINA ES EL ÚNICO AMINOÁCIDO SIMÉTRICO PUESTO QUE SU CARBONO ESTÁ UNIDO
A DOS HIDRÓGENOS. Las moléculas con carbonos quirales pueden existir como
ESTEREOISÓMEROS, QUE SON MOLÉCULAS QUE SÓLO SE DIFERENCIAN EN LA DISPOSICIÓN
ESPACIAL DE SUS ÁTOMOS y como ENANTIÓMEROS, QUE NO PUEDEN SUPERPONERSE UNA
SOBRE OTRA.
E. Punto isoeléctrico: Los grupos amino y carboxilo de los aminoácidos se comportan como
ácidos o bases débiles (moléculas anfotéricas) en soluciones acuosas, es decir, que
presentan un comportamiento dual, como donadores o aceptores de protones. En
algunos aminoácidos, ESTA SITUACIÓN COINCIDE CUANDO EL AMINOÁCIDO SE
COMPARTAN COMO UNA MOLÉCULA NEUTRA QUE LLEVA UN NÚMERO IGUAL DE CARGAS
POSITIVAS Y NEGATIVAS (CARGA NETA DE CERO), CONOCIDA COMO ZWITTERION.
𝑝𝐾1 +𝑝𝐾𝑟
AMINOÁCIDOS ÁCIDOS 𝑝𝐼 = 2
𝑝𝐾2 +𝑝𝐾𝑟
AMINOÁCIDOS BÁSICOS 𝑝𝐼 = 2
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3.2. Estructura y función de proteínas.
Enlace peptídico:
Los L-AMINOÁCIDOS SE ENCUENTRAN UNIDOS EN LAS PROTEÍNAS MEDIANTE ESTE ENLACE
COVALENTE, POR EL GRUPO CARBOXILO DE UN AMINOÁCIDO CON EL GRUPO AMINO DE OTRO.
EN ESTA REACCIÓN DE CONDENSACIÓN SE FORMA UNA AMIDA, que une los dos aminoácidos
para formar el enlace peptídico un enlace estable, rígido y planar. ESTE ENLACE SE FORMA
POR BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS A TRAVÉS DE LOS RIBOSOMAS (TRADUCCIÓN).
Puentes de hidrógeno:
Son las INTERACCIONES NO COVALENTES QUE SE ESTABLECEN ENTRE UN ÁTOMO DE
HIDRÓGENO Y UN ÁTOMO ELECTRONEGATIVOS. UNO DE LOS ÁTOMOS ELECTRONEGATIVOS
ESTÁ UNIDO DE MANERA COVALENTE AL HIDRÓGENO, LO QUE LO VUELVE UN ÁCIDO (A-H) O
DONADOR; el HIDRÓGENO QUE FORMA PARTE DEL PUENTE DE HIDRÓGENO PRESENTA CIERTA
AFINIDAD POR LA BASE (B) O ACEPTOR. Esto se observa en las proteínas participan los grupos
amino y carbonilo del esqueleto polipeptídico, las cadenas laterales y las moléculas de agua.
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Fuerzas electrostáticas:
La CARGA NETA DE LAS PROTEÍNAS, DEPENDEN DEL PH DEL MEDIO, YA QUE ALGUNAS CADENAS
LATERALES, ASÍ COMO LOS GRUPOS AMINO Y CARBOXILO TERMINALES, PRESENTAN GRUPOS
IONIZABLES.
Efecto hidrófobo:
Es la CAPACIDAD DEL AGUA DE EXPULSAR DE SU SENO AQUELLAS MOLÉCULAS QUE NO SON
IÓNICAS O QUE NO TIENEN UN GRAN NÚMERO DE DONADORES O ACEPTORES DE PUENTES DE
HIDRÓGENO; este FENÓMENO, GUIADO POR EL CAMBIO FAVORABLE EN LA ENTROPÍA DEL
SOLVENTE, SE CONOCE COMO EFECTO HIDRÓFOBO Y ES FUNDAMENTAL EN LA FORMACIÓN DE
LAS MEMBRANAS CELULARES Y DEL NÚCLEO NO POLAR EN EL INTERIOR DE LAS PROTEÍNAS.
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● Alfa Hélice: Está DEFINIDA POR UN PATRÓN DE PUENTES DE HIDRÓGENO. Se da
PRINCIPALMENTE EL GIRO HACIA LA DERECHA Y SE HACE UN PUENTE DE HIDRÓGENO
CADA 3.6 AMINOÁCIDOS. ALANINA ES ABUNDANTE.
● Lámina Beta plegada: Se CONFORMA POR DOS HOJAS BETA Y TIENE UNA FORMA
EXTENDIDA, LOS PUENTES DE HIDRÓGENOS ENTRE LOS ÁTOMOS QUE FORMAN EL
ENLACE PEPTÍDICO ESTABILIZAN LA PROTEÍNA, pueden ser PARALELAS O
ANTIPARALELAS. PROLINA ABUNDANTE.
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Plegamiento de proteínas:
ESTO SE HACE PARA QUE LAS PROTEÍNAS LLEVEN A CABO SU FUNCIÓN SE REQUIERE QUE
TENGAN UNA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL PRECISA. El ribosoma sintetiza las proteínas de
manera lineal, forma cadenas de aminoácidos mediante la síntesis de los enlaces peptídicos
(traducción). En el INTERIOR DE LA CÉLULA, CIERTOS PASOS DEL PLEGAMIENTO SON
CATALIZADOS POR ENZIMAS COMO LA PEPTIDIL-PROLIL-CIS-TRANS-ISOMERASA, QUE COMO SU
NOMBRE INDICA, CAMBIA LA CONFORMACIÓN DE LAS PROLINAS DE CIS A TRANS, y la proteína
isomerasa de disulfuros que rompe enlaces disulfuro, permitiendo que éstos se vuelvan a
formar entre cisteínas diferentes.
Desnaturalización de proteínas:
ES LA PÉRDIDA DE LAS ESTRUCTURAS DE ORDEN SUPERIOR (SECUNDARIA, TERCIARIA Y
CUATERNARIA), QUEDANDO LA CADENA POLIPEPTÍDICA REDUCIDA A UN POLÍMERO
ESTADÍSTICO SIN NINGUNA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL FIJA. La ESTRUCTURA NATIVA Y LA
DESNATURALIZADA TAN SÓLO TIENEN EN COMÚN LA ESTRUCTURA PRIMARIA.
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Plegamiento incorrecto de las proteínas o plegopatías:
EN CIERTAS CONDICIONES EL PLEGAMIENTO SE DA DE MANERA INCORRECTA, DANDO LUGAR
A OTRAS CONFORMACIONES ESTABLES (NO FUNCIONALES) QUE PUEDEN O NO SER
INTERMEDIARIOS DEL ESTADO NATIVO. Por ello, la célula cuenta con mecanismos para evitar
y revertir el plegamiento incorrecto de las proteínas; a pesar de esto, en los últimos años se
ha descubierto un gran número de “enfermedades del plegamiento anómalo de las
proteínas”:
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Proteínas de importancia biológica:
Proteína Función
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4. ENZIMAS Y COENZIMAS
4.1. Fisicoquímica
La termodinámica es la parte de la física que estudia los cambios asociados con el paso de
un sistema desde un estado inicial a otro final. Un sistema ES UN CONJUNTO DE MATERIA Y
ENERGÍA QUE, PARA FINES DE ESTUDIO SE AÍSLA DEL RESTO DEL UNIVERSO. Los sistemas se
clasifican con base en las fronteras o límites que los separan de los alrededores:
A. Entalpía (ΔH): ES UNA MEDIDA DEL CONTENIDO DEL SISTEMA (ELEMENTO), ES UNA FUNCIÓN
DE ESTADO. El CAMBIO DE ENTALPÍA (ΔH) REPRESENTA LA CANTIDAD DE CALOR QUE SE
LIBERA O SE ABSORBE EN UNA REACCIÓN A PRESIÓN CONSTANTE, es decir, el calor liberado
o absorbido por el sistema equivale al cambio en la entalpía de este. Si la reacción se
realiza en condiciones estándar, se obtiene el cambio de entalpía estándar (ΔH).
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➢ Reacción exotérmica: El SISTEMA LIBERA CALOR A LOS ALREDEDORES Y EL CAMBIO DE
ENTALPÍA ES NEGATIVO (ΔH NEGATIVO).
Segunda Ley de la Termodinámica: “El universo tiende al máximo desorden” Establece que
cuando un sistema sufre un cambio de estado irreversible, hacia una variación positiva de la
misma magnitud.
B. Entropía (ΔS): MEDIDA DEL GRADO DE DESORDEN DE UN SISTEMA. El cambio puede ser:
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C. Energía libre de Gibbs: RELACIÓN QUE EXISTE ENTRE LA ENTROPÍA Y LA ENTALPÍA DA ORIGEN
A UNA NUEVA FUNCIÓN DE ESTADO DENOMINADA ENERGÍA LIBRE DE GIBBS (PRINCIPAL
RITERIO DE ESPONTANEIDAD): Energía libre (ΔGo) = ΔHo – TΔS
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4.2. Sistema Enzimático.
Las ENZIMAS SON PROTEÍNAS CATALIZADORAS QUE INCREMENTAN LA VELOCIDAD DE UNA
REACCIÓN Y QUE NO SE CONSUMEN DURANTE ÉSTA. La siguiente tabla explica las clases de
enzimas:
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A. Características de las enzimas: La enzima tiene segmentos; HOLOENZIMA CORRESPONDE AL
COMPLEJO DE LA ENZIMA CON EL COFACTOR QUE ESTÁ EN FORMA ACTIVA DE LA ENZIMA.
La APOENZIMA SE REFIERE A LA ENZIMA LIBRE DEL COFACTOR Y ESTÁ EN FORMA INACTIVA.
ALGUNAS ENZIMAS REQUIEREN LA PRESENCIA DE UN COFACTOR Y EN LA AUSENCIA DE ÉSTE,
LA ENZIMA NO CATALIZA LA REACCIÓN. El cofactor puede ser:
E Antioxidante
(tocoferol)
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Vitaminas hidrosolubles: No pueden almacenarse en ningún tejido; PRECURSORAS DE
COENZIMAS:
Vitamina Coenzima Transferencia Deficiencia
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Especificidad, sitio activo y grupos catalíticos de las enzimas:
● Unión de sustratos y enzimas: LAS ENZIMAS SE UNEN A LOS SUSTRATOS POR MEDIO DE
INTERACCIONES HIDROFÓBICAS Y ELECTROSTÁTICAS, PUENTES DE HIDRÓGENO Y FUERZAS
DE VAN DER WAALS.
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4.3. Cinética enzimática.
Complejo enzima-sustrato:
La unión del sustrato a la enzima puede explicarse por medio de dos mecanismos:
A. Modelo de llave y cerradura: El cual considera que el SITIO ACTIVO DE LA ENZIMA ESTÁ
PREFORMADO, DE TAL MANERA QUE LOS RESIDUOS MANTIENEN UNA POSICIÓN FIJA Y
COMPLEMENTARIA A LOS GRUPOS DEL SUSTRATO. EN ESTA COMPLEMENTARIEDAD SE BASA
LA ESPECIFICIDAD DE LA INTERACCIÓN DEL SUSTRATO CON LA ENZIMA.
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B. Modelo del ajuste: Propone que al INTERACTUAR EL SUSTRATO CON LA ENZIMA SE INDUCEN
CAMBIOS CONFORMACIONALES EN ÉSTA, QUE DAN LUGAR A LA FORMACIÓN DEL SITIO
ACTIVO. Se ha dicho que la enzima semeja un guante vacío, y la presencia del sustrato
equivale a introducir la mano en el guante, con lo que se le da forma precisa al sitio activo.
EL MODELO DEL AJUSTE INDUCIDO ES EL QUE SE OBSERVA A MENUDO EN LA NATURALEZA.
Orden de la reacción:
La VELOCIDAD INICIAL EN UNA REACCIÓN QUÍMICA EN LA QUE PARTICIPAN DOS REACTANTES
DEPENDE DE LA CONCENTRACIÓN DE CADA UNO de ellos y de su tendencia inherente a
reaccionar. Si se mantienen constantes las condiciones de la reacción, pero se duplica la
concentración de uno de los reactantes, se registra una duplicación de la velocidad de la
reacción. Para una REACCIÓN CATALIZADA POR UNA ENZIMA, SE TIENEN DIFERENTES ÓRDENES
DE REACCIÓN, DEPENDIENDO DE LA CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO:
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Ecuación de Michaelis-Menten:
Describe cómo VARÍA LA VELOCIDAD DE LA REACCIÓN EN FUNCIÓN DE LA CONCENTRACIÓN
DE SUSTRATO A UN PH Y T° ESTÁNDAR. Se aplica a UNA REACCIÓN SIMPLE EN LA CUAL, LA
ENZIMA Y EL SUSTRATO FORMAN UN COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO (ES) QUE PUEDE VOLVER A
DISOCIARSE HACIA LA ENZIMA LIBRE Y EL SUSTRATO, LA VELOCIDAD INICIAL DE LA FORMACIÓN
DE PRODUCTO ES PROPORCIONAL A LA CONCENTRACIÓN DE COMPLEJO ES. ESTA ECUACION
DEPENDE DE TRES FACTORES: CANTIDAD DE SUSTRATO, SATURACIÓN DE LA ENZIMA Y AFINIDAD.
Las siguientes imágenes muestran cómo funcionan las enzimas y la ecuación que se utiliza:
• ↓Km = REFLEJA UNA AFINIDAD ELEVADA DE LA ENZIMA POR EL SUSTRATO (se necesita
una baja concentración de sustrato para saturar la mitad de la enzima, es decir, para
alcanzar una velocidad que sea 1/2 Vmax).
• ↑Km = REFLEJA UNA AFINIDAD BAJA DE LA ENZIMA POR EL SUSTRATO (se necesita una
concentración elevada de sustrato para saturar la mitad de la enzima).
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A. Hexocinasa: La isoenzima de los eritrocitos (glóbulos rojos), tiene una KM BAJA PARA LA
GLUCOSA DE APROXIMADAMENTE 0.05 MM, ES TOTALMENTE DEPENDIENTE DEL
METABOLISMO DE LA GLUCOSA PARA CUBRIR SUS NECESIDADES DE ATP, Y AUN ASÍ EL
GLÓBULO ROJO PUEDE FOSFORILAR GLUCOSA A VELOCIDADES CERCANAS A LA VMAX.
Inhibición reversible:
LOS INHIBIDORES SON MOLÉCULAS O IONES QUE INTERACTÚAN CON LA ENZIMA Y DISMINUYEN
SU ACTIVIDAD CATALÍTICA. TIENEN GRAN IMPORTANCIA DESDE EL PUNTO DE VISTA MÉDICO,
DEBIDO A QUE UN BUEN PORCENTAJE DE LOS FÁRMACOS TRABAJAN COMO INHIBIDORES DE
ALGUNA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA, por ejemplo, inhibir el mecanismo de reacción de una
enzima reguladora de una vía metabólica. Los siguientes son ejemplos de inhibiciones:
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• ESTE TIPO INHIBIDOR AFECTA A LA KM DE LA ENZIMA AUMENTANDO, PERO NO AFECTA A
LA VMAX. La intersección con el eje vertical (1/Vmáx) es la misma en presencia o
ausencia del inhibidor, pero la intersección con el eje horizontal (-1/Km aparente)
disminuye al aumentar la concentración del inhibidor. Por lo tanto, se obtiene una
familia de rectas que se interceptan en el eje vertical. Esquema del tipo de la inhibición:
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B. Inhibición mixta (no competitiva): Se FORMAN LOS COMPLEJOS BINARIOS; entre la ENZIMA Y EL
INHIBIDOR (EI) Y LA ENZIMA Y EL SUSTRATO (ES), SE PUEDE FORMAR EL COMPLEJO TERNARIO
ENTRE LA ENZIMA, EL INHIBIDOR Y EL SUSTRATO (EIS). El INHIBIDOR MIXTO TIENE UNA
ESTRUCTURA DIFERENTE A LA DEL SUSTRATO Y LAS CONCENTRACIONES SATURANTES DE ESTE
ÚLTIMO NO SE PUEDE REVERTIR LA INHIBICIÓN:
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• ESTE INHIBIDOR AFECTA LAS 2; LA KM DE LA ENZIMA AUMENTANDOLA Y LA VMAX. Estos
cambios se reflejan en la doble recíproca. Tanto la intersección con el eje vertical (1/
Vmax) como la intersección con el eje horizontal (-1/Km) aumentan en presencia del
inhibidor, por lo que se obtiene una familia de rectas paralelas.
Fármacos inhibidores:
Fármaco Tipo de inhibición Enzima que inhibe Efecto
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4. Inducción enzimática: Es el INCREMENTO DE LA SÍNTESIS DE UNA ENZIMA, POR EL AUMENTO DE
LA CONCENTRACIÓN DE SU SUSTRATO. Un FÁRMACO PUEDE INDUCIR SU PROPIO
METABOLISMO O INFLUENCIAR EL DE OTRO FÁRMACO METABOLIZADO POR LAS MISMAS
ENZIMAS, este incrementa el metabolismo farmacológico, reduce así la concentración de
los fármacos sustrato en la sangre.
6. Degradación enzimática: Se DEGRADAN LAS PROTEÍNAS DE LAS ENZIMAS, YA QUE ESTAS TIENEN
UNA VIDA MEDIA Y EL ORGANISMO PUEDE HACER UN RECAMBIO DE PROTEÍNAS. Unos
ejemplos pueden ser el RECAMBIO LISOSOMAL O POR VÍA UBIQUITINA-PROTEOSOMA.
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4.4. Enzimología médica.
Enzimas de escape:
Cuando las CÉLULAS DE UN TEJIDO MUEREN DEBIDO A LA INTERRUPCIÓN DEL RIEGO
SANGUÍNEO, por ejemplo, en infarto de miocardio, enfermedades degenerativas o
crecimiento de células cancerosas, SE LIBERAN ENZIMAS CITOSÓLICAS A LA SANGRE. A ÉSTAS
SE LES LLAMA ENZIMAS DE ESCAPE, Y LA ENZIMA QUE SE LIBERA A LA CIRCULACIÓN SANGUÍNEA
DEPENDE DEL PADECIMIENTO:
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Bibliografía principal:
Martínez, F. Pardo, J. Riveros, H. (2018). Bioquímica de Laguna y Piña. México. Editorial el manual
moderno/UNAM. octava edición.
● Fuentes de apoyo:
McKee, T. McKee, J. (2004). Bioquímica las bases moleculares de la vida. Reino Unido. Editorial mc graw hill
education. Quinta edición.
http://187.191.75.115/gobmx/salud/documentos/manuales/06_Manual_Colera.pdf
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