BIOQUIMICA 1

Repaso y Generalidades
Temario: Termodinámica de procesos biológicos. Fuerzas que participan en la estabilización de
la estructura de macromoléculas. Uniones covalentes. Interacciones no covalentes:
Electrostáticas, de Van der Waals, puentes de hidrogeno, hidrofóbicas. Energías y alcances.
Entornos acuosos y no polares. Propiedades fisicoquímicas de macromoléculas. Carga,
hidrofobicidad, tamaño, forma.
Bibliografía
-Biochemistry, Stryer, Fifth ed. Cap. 1.2, 1.3.
-Biochemestry, Zubay, segunda y tercera edición.
-Bioquímica . Voet, Donald, Voet, Judith G Second Edition.. 3° edición-Buenos Aires.
Panamericana, 2006. Capítulos 1 al 14.
-Principios de Bioquímica. Lenhinger. Quinta edición. Nelson & Cox. Ed. Omega Barcelona
(2009). Primera parte: Estructura y catálisis. Capítulos 1 al 11.
- Molecular Biology of the Cell, Alberts et al., Third Edition, 1994

Problema 1. Mencione que representa cada uno de los términos de la siguiente ecuación. ¿Qué
predicciones termodinámicas podría realizar conociendo los valores de dicha ecuación?

Problema 2. ¿Por qué es más conveniente predecir la dirección de una reacción en términos de
ΔGsist que en términos de ΔSuniv? ¿En qué condiciones se utiliza ΔGsist para predecir la
espontaneidad de una reacción?
Problema 3. ¿Cómo cambia la entropía de un sistema para cada uno de los siguientes
procesos?:
a. Un sólido se funde
b. Un líquido se congela
c. Un líquido hierve
d. Un vapor se solidifica
e. Un vapor se condensa
f. Un sólido sublima
g. La urea se disuelve en agua
Problema 4. El siguiente gráfico representa la concentración del producto Y en función del
tiempo durante el avance de una reacción.
a. ¿En qué intervalo de tiempo la velocidad de aparición de Y es máxima? ¿Qué relación
tendrá esta velocidad con la de desaparición de reactivos?
b. ¿En qué intervalo de tiempo la velocidad de aparición de Y es constante?
c. ¿Qué representa químicamente la asíntota horizontal en el gráfico?
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Problema 5. Mencione los grupos funcionales en cada molécula

a) b) c) d) e)

Problema 6. Describa la molécula del agua y mencione sus principales propiedades

fisicoquímicas. ¿Qué ventajas biológicas le confiere lo antes mencionado?
Problema 7. i) Demuestre que Ka x Kb = Kw, utilizando como ejemplo el ácido fluorhídrico.
ii) Calcule el pH de las soluciones que poseen las siguientes concentraciones iónicas
a 25ºC:
a. [H3O+] = 0,001 M
b. [H3O+] = 1,40 x 10-11 M
c. [HO-] = 1,0 x 10-3 M
d. [HO-] = 7,80 x 10-4 M
Problema 8. ¿Cuáles de los siguientes derivados del ciclohexano son quirales? Esquematice en
caso de ser quiral el/los isómero/os existentes.

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Problema 9. La bilirrubina es el principal producto de degradación del grupo hemo proveniente
de la hemoglobina y de distintos citocromos según la serie de reacciones que se muestran a
continuación:
a. ¿Puede esta molécula formar puentes de hidrógeno intramoleculares? Si es así,
mencione entre qué grupos.
b. ¿Cómo espera que sea la solubilidad de la bilirrubina en agua? ¿Por qué?
c. ¿Cómo espera que sea la solubilidad de la bilirrubina en lípidos? ¿Por qué?

Bilirubin. Solubility and Interaction with albumin and phospholipid. Brodersen, R. J. Biol. Chem.
254:2364-2369 (1979).

Problema 10. Ahora que ha analizado algunos de los factores que participan en la
estabilización/perturbación de las interacciones entre moléculas y entre sus propios grupos
¿Cree que la alta densidad de solutos dentro de la célula (crowding) afecta esas interacciones y
la estabilidad de las macromoléculas? ¿de qué modo? Justifique su respuesta.

Problema 11. En el crecimiento anaeróbico de Escherichia coli se reprime la síntesis de piruvato

deshidrogenasa, isocitrato deshidrogenasa y succinato deshidrogenasa, se activa la lactato
deshidrogenasa ya presente, y se induce la síntesis de piruvato formato liasa, fosfotransacetilasa
y acetato quinasa. Estas tres últimas enzimas catalizan las siguientes reacciones:
piruvato + CoA ↔ acetil CoA + formato ∆Go' = -3,9 kcal
piruvato formato liasa

acetilCoA + Pi ↔ acetil fosfato + CoA ∆Go' = +2,2 kcal

fosfotransacetilasa

acetato + ATP ↔ acetil fosfato + ADP ∆Go' = +3,1 kcal

acetato quinasa

a) Clasifique en términos termodinámicos como son cada una de las reacciones.

b) Considera que E. coli con las tres reacciones que se expone en el enunciado podría producir
energía (ATP) a partir de piruvato. Justifique.
c) En caso de poder obtener energía a partir de piruvato, explique si se cumple o contradice
alguna ley de termodinámica.-