CURSO DE INTRODUCCIÓN AL DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN PEDIATRÍA

CONCEPTOS BÁSICOS: PARTE 1

Dr. Veneruzzo Gabriel

Laboratorio de Genómica
labgenomicagarrahan@gmail.com
gabrielveneruzzo@gmail.com
 Los Ácidos Nucleicos: Nucleótidos, ADN y ARN.
 Organización de la información: Genoma, Cromosoma y Gen.
 Replicación del ADN: In vivo e In vitro (PCR)
 El flujo de la información dentro de la célula.
 Un Gen Eucariota en Detalle.
 El código Genético y sus Características.
 Definición de Términos
 Clasificación de variantes I: Alteraciones Cromosómicas
 Almacenamiento de la información Genética: Los Ácidos Nucleicos

Nucleótidos: La unidad ADN: Doble, sentido y ARN: Cadena Simple

fundamental antisentido
 Organizando la Información
Genoma
Es el material genético completo
(ácido nucleico). En Eucariotas: ADN
Cromosómico Nuclear + ADN
Mitocondrial.
Humanos: 3.100.000.000 bases
nucleares (Set haploide) + ADN
mitocondrial (17.000b – 37 genes)
Cromosomas Gen Eucariota:
Son estructuras discretas de Porción genómica discreta,
ácidos nucleicos y proteínas cuya transcripción es regulada
asociadas en las que se por uno o varios promotores y
organiza el genoma. elementos distales y/o
proximales y que contiene las
Humanos: instrucciones para generar
23 pares de Cromosomas una proteína funcional o un
(22 pares de autosomas + par ARN no codificante.
sexual): 46XX; 46XY 20.000-30.000 genes
Replicación del ADN: In vivo
Replicación del ADN: In vivo
 Replicación del ADN In vitro: la Reacción
en Cadena de la Polimerasa (PCR)

ADN molde

´Cebadores/
Primers

Medio
de
reacción
Nucleótidos
Polimerasa
Replicación del ADN In vitro: la Reacción
en Cadena de la Polimerasa (PCR)
 Replicación del ADN In vitro: la Reacción en
Cadena de la Polimerasa (PCR)

Kary B. Mullis
1 CICLO 2 CICLOS 3 CICLOS
Premio Nobel de
Química 1993
1 copia  después de 30 ciclos  1.073.741.824 copias
 Flujo de la información dentro de la célula

Francis Crick (1916 – 2004)

Pierce, Benjamin A. Genetics: A Conceptual Approach. New York: W.H. Freeman, 2012
SPLICING ALTERNATIVO
 Traducción: el Código Genético
 Organizado en Tripletes (Codones)
 64 codones posibles – 61 con sentido para 20 AA posibles. 3 codones sin sentido.
 Degenerado pero no ambiguo
 Sin Superposiciones
 Universal
 El marco de lectura

Para una secuencia determinada hay 3 marcos de lectura

posibles. 6, si consideramos la hebra antisentido.
 Definición de Términos I

Locus: Región genómica definida, que contiene

un elemento de interés (Ej.: un gen) dentro del
genoma.

Loci: Plural de locus.

Ploidía (n): Número de sets cromosómicos

completos. Las células somáticas poseen dos
sets de cromosomas, por lo que la ploidía es 2.
Definición de Términos II

Variante de Secuencia: toda diferencia entre la

secuencia genética bajo análisis y la secuencia
de referencia que la representa.

Alelo: Una de las posibles versiones de un gen

o marcador genético en un locus o sitio
particular dentro del genoma.
 Definición de Términos III

Genotipo: Configuración alélica.

 Homocigota: mismo  Heterocigota: Alelos  Heterocigota compuesto: Alelo

alelo materno y paterno diferentes en un materno y paterno se diferencian por
en un locus. mismo locus. poseer variantes de secuencia en sitios
diferentes dentro del mismo locus.
Cromosoma
Paterno

Cromosoma
Materno

 Hemicigota: Un solo alelo para un locus, ya sea porque el alelo está

ausente naturalmente (X e Y en masculinos) o por deleción.
 Definición de Términos III: Continuación

Fase: relación entre marcadores genéticos.

 Cis: cuando los dos elementos o  Trans: Cuando los dos elementos o
marcadores genéticos comparten marcadores genéticos se encuentran
una misma molécula de ADN. en moléculas de ADN diferentes.

Cromosoma
Paterno

Cromosoma
Materno
 Definición de Términos IV

Fenotipo: Es una característica observable

(Estructural y/o funcional) de una entidad
biológica, producto de la interacción entre
su información genética y el ambiente.

Alelo Dominante: La presencia Alelo recesivo: El rasgo se Codominancia entre alelos:

de al menos una copia del presenta cuando el alelo Relación entre alelos en la
alelo es suficiente para asociado se encuentra en cual ambos se expresan por
imponer el fenotipo asociado. homocigosis. igual en el fenotipo.
 Definición de Términos IV: Continuación
Penetrancia: Frecuencia de individuos que portan un genotipo
determinado y presentan el fenotipo asociado. En el caso de una condición
autosómica dominante, representaría el porcentaje de individuos que
poseen el alelo potencialmente deletéreo y expresan la patología.

National Human Genome Research Institute

 Variantes: Clasificación

De acuerdo a la frecuencia poblacional (No recomendada):

 Mutación: Variante que presenta una frecuencia

poblacional menor al 1%, asociada a patología.

 Polimorfismo: Variante que presenta una frecuencia

poblacional mayor al 1%, no asociada a patología.

HGVS no recomienda usar términos los términos polimorfismo y

mutación. En su lugar aconseja usar términos neutros como Variante
de secuencia, Variante Génica, o simplemente Variante o Cambio.
 Variantes: Clasificación
De acuerdo a la extensión del
material genético involucrado

Cromosómicas Génicas Transversión o

(decenas o cientos de miles a (de una a miles de bases)
miles de millones de bases) Transición

Con cambio de sentido

(Missense)

Numéricas Sustituciones
Sin sentido
(Nonsense)

Inserciones
Sinónima
Estructurales

Deleciones
CITOGENETICA BIOLOGIA MOLECULAR

• PCR
– CUALITATIVA
– CUANTITATIVA
• CNV
– MLPA
– ARRAY-CGH

• SECUENCIACION
▫ SANGER
▫ NGS
 Anomalías Cromosómicas: Numéricas
HETEROPLOIDIAS

EUPLOIDIAS (xn) ANEUPLOIDIAS: (2n +/- x)

Hipodiploides
- Monosomías: 2n-1
- Nulisomías: 2n-2

Poliploidías Hiperdiploides
- Trisomías: 2n+1
- Triploide 3n
- Tetraploide 4n - Tetrasomías:2n+2

- Doble Trisomía: 2n+1+1

Anomalías Cromosómicas: Numéricas

EUPLOIDIAS (xn)
 Anomalías Cromosómicas: Numéricas

ANEUPLOIDIAS: (2n +/- x)

Autosomas
Alteración Síndrome
Trisomía del Cromosoma 13 Patau
Trisomía del Cromosoma 18 Edwards
Trisomía del Cromosoma 21 Down
Cromosomas Sexuales
Alteración Síndrome
Monosomía del X Turner
XXX Triple X
XXY Klinefelter
Sdme. Del XYY o mal llamado
XYY
“del super hombre”
Anomalías Cromosómicas: Estructurales
 Anomalías Cromosómicas: Síndrome de Cri Du Chat

Principales Características Fenotípicas:

- Microcefalia
- Facie redondeada
- Hipertelorismo
- Puente nasal alto
- Orejas rotadas de implantación baja
- Hipotonía neonatal
- Discapacidad intelectual
 RESUMEN

Ácidos Nucleicos: En el ser humano el ADN doble cadena almacena la

información genética. 23 pares de cromosomas.

Flujo de la información: La información génica contenida en el ADN se

TRANSCRIBE en una molécula de mRNA móvil que abandona el núcleo para
TRADUCIRSE a proteína en el citosol.

Código Genético: 4 letras posibles (ATGC) – Cada mensaje codificado tiene un

punto de inicio y se lee en tripletes consecutivos (Marco de lectura). El código
es degenerado, universal y no solapado

Locus – Alelo – Genotipo - Fenotipo

Variantes: Cromosómicas
 Agenda de la 2da parte

 Variantes Génicas
Definición de Variante “de novo”,
Caso familiar, caso esporádico,
Mosaicos y más.
Patrones de herencia Mendelianos en
enfermedades Monogénicas.
Nomenclatura de variantes génicas
 Bibliografía
• Biología Celular y Molecular, septima edición. Harvey Lodish. Panamericana, 2016.
• Cri du chat syndrome: a critical review. Rodríguez-Caballero et al. Med Oral Patol Oral Cir Bucal. 2010 May
01;15(3):e473-8 – PMID: 20038906
• Genética: Un enfoque conceptual. Quinta edición. Pierce, Benjamin A. Panamericana, 2016.
• Genetic terminology. Elston RC, et al. Methods Mol Biol. 2012;850:1-9 – PMID: 22307690
• Help Me Understand Genetics - Lister Hill, National Center for Biomedical Communications, U.S. National
Library of Medicine , National Institutes of Health, Department of Health & Human Services - Published on July
7, 2020 (https://ghr.nlm.nih.gov/primer).
• Open questions: How many genes do we have? - Salzberg BMC Biology (2018) – PMID: 30124169.
• Talking Glossary of Genetic Terms - NIH (https://www.genome.gov/genetics-glossary).
• The Human Genome: Book of Essential Knowledge. John Quackenbush. Imagine, 2011.
• The Human Genome Project: big science transforms biology and medicine. Leroy Hood et al. Genome Med.
2013; 5(9): 79. PMID: 24040834
• What is a gene? An updated operational definition. Pesole G - Gene. 2008 Jul 1;417(1-2):1-4 – PMID:
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