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PROBLEMAS DE BIOQUÍMICA

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PROBLEMAS DE BIOQUÍMICA, 1º BIOLOGÍA -2do PARCIALIV. ENZIMOLOGÍA 49.

Un enzima con Km=3x10-4 M se ensayó con una concentración inicial de sustrato de 10 -6 M. En un minuto, el 5% del sustrato había reaccionado. a) ¿Qué porcentaje de sustrato habrá reaccionado en 5min?. b) Si la concentración inicial de sustrato fuese de 8x10 -7 M, ¿qué porcentaje de sustrato habrá reaccionado en 5min?. c) Calcular Vmax. d) A concentración 9x10-7 M, ¿cuánto tardará en reaccionar el 50% del sustrato?. e) A concentración 10-6 M, ¿cuánto tardará en reaccionar el 75% del sustrato?. Sol: a) 23%. b) 23%. c) 1,5x10-5 mol/lxmin. d) 13,58 min. e) 27,15 min. 50. Una enzima se ensayó con una concentración inicial de sustrato de 10 -5M. La Km para el sustrato era de 2x10-3 M. Después de transcurrido 1min, el 2% del sustrato se había convertido en producto. a) ¿Qué porcentaje del sustrato se habrá convertido en producto después de 3min?. ¿Cuáles serán las concentraciones de producto y sustrato en ese momento?. b) Si la concentración inicial de sustrato fuese de 10 -6 M, ¿qué porcentaje de sustrato se habrá convertido en producto tras 3min de reacción?. c) ¿Cuál es la Vmax alcanzable con la concentración de enzima dada?. d) ¿Con qué concentración de sustrato, aproximadamente se observará Vmax?. e) Con esta concentración de sustrato, ¿qué porcentaje de sutrato se convertirá en producto en 3min?. Sol: a) 6%, 0,6x10-6 M, 9,4x10-6 M. b) 6%. c) 40 µmoles/lxmin. d) 0,2 M. e) 0,0603%. 51. Una enzima con una Km para el sustrato de 1,2x10 -4 M se ensayó con una concentración inicial de sustrato de 0,02 M. En 30seg se obtuvo una cantidad de producto de 2,7µmol x l-1. ¿Qué cantidad se obtendrá en: a) 1min, b) 95seg y c) 5,3min?. d) ¿Cuál es el porcentaje del sustrato original que habrá reaccionado a esos tiempos?. Sol: a) 5,4x10-6 M. b) 8,55x10-6 M. c) 28,62x10-6 M. d) 2,7x10-2 %, 4,27x10-2%, 14,31x10-2%. 52. Un volumen de 0,1ml de una preparación homogénea de nitrato reductasa (pm=500.000 mg/mmol), que contiene 0,5mg de proteínas ml -1, cataliza la producción de 20µmoles de NO2- en 5 min, utilizando una mezcla de reacción cuyo volumen final es de 1ml. Calcular: a) la actividad de la preparación enzimática en U/ml, b) la actividad específica c) la actividad total en katales, de 100 ml de preparación enzimática,;d) la actividad molar de la preparación; e) la actividad por centro activo, sabiendo que la nitrato reductasa tiene dos sitios para la reducción del nitrato; y f) el tiempo requerido para que se transforme una molécula de sustrato en producto. Sol: a) 40U/ml. b) 80U/mg. c) 66,6x10-6 katales. d) 40.000 min-1. e) 20.000 min-1. f) 3 mseg. 53. a) ¿Qué concentración de inhibidor competitivo se requiere para dar un 75% de inhibición, cuando la concentración de sustrato es de 1,5 x 10 -3 M, sabiendo que la Km de la enzima por dicho sustrato vale 2,9 x 10-4 M, y que la Ki para el inhibidor es de 2 x 10-5 M?. b) ¿Hasta que concentración debe elevarse el sustrato para restablecer el valor de velocidad obtenido en ausencia del inhibidor?. Sol: a) 3,7x10-4 M. b) 2,93x10-2 M. 54. La actividad de una aminoácido descarboxilasa puede ensayarse manométricamente siguiendo el desprendimiento de CO2. En un experimento realizado con esta enzima en presencia o ausencia de un hidroxiácido (0,05 M) se obtuvieron los siguientes resultados:

) -Hidroxiácido +Hidroxiácido 12. b) el tipo de inhibición ejercida y el valor de Ki correspondiente.5 0.23 22. Vmax.4 50 33. Ki 0.11 2.8 100 40 20. 82%. una Km para su sustrato de 6.06 µM.48 3. c) estimar la concentración del inhibidor necesaria para inhibir un 50% la reacción.66 1.7 x 10 -4 M. y su Vmax es de 300 µmol/min. Una glutaminasa de hepatocito hidroliza distintas concentraciones de glutamina.5 M.14 19. b) Km 1mM. V=60 unidades arbitrarias y Ki=13. d) 72 %.15 3.5 13.03 35.5mM.25 0.2 0.73 Se pide: a) determinar el tipo de inhibición.83 2. e) la cantidad de sustrato desaparecido en 3 min.3 11. 50. obteniéndose los siguientes resultados: [S] (mM) 0.5 mM [Ib]= 1. 58.33 0. b) Km=39µM. b) Inhibición competitiva.2 6.16 3. Km’=179 µM.33 0.00 4. en 1ml de mezcla de reacción.50 1.91 5.86 1.2 [I]=0 V (mmol x min-1) [Ia]= 1.62 5.000 mg/mmol) contiene 10mg prot por ml.[aa] (M) V (u.00 2.0 Se pide: a) indicar el tipo de inhibición que ejerce el hidroxiácido en la reacción enzimática.00 1. 50 µl de la preparación enzimática en presencia de [S]= 0.71 11. Km=1mM. Sol: a) V=V’=10mmoles/min.5 mM 1.81 . Al ensayar una fumarasa de levadura frente a un sustrato específico en presencia o ausencia de un inhibidor. Sol: 2. se obtiene una velocidad inicial de 1. Calcúlese la Ki y el porcentaje de inhibición para un inhibidor competitivo. se obtienen los siguientes resultados: [S] (mM) 0.00 V(mmol x min-1) [I]=0 [I]= 0. y Ki.000 µmoles.00 V (mmol x min-1) [I]= 0 [I]= 2mM 2.00 57.47 2.2 4. 56. Una preparación de glutamato deshidrogenasa (PM= 60.67 0.43 4.3 - 16. en ausencia de inhibidor.90 14. en presencia o ausencia de dos inhibidores diferentes. e) 75.a. Sol: a) inhibición competitva. se obtienen los siguientes resultados: [S] (mM) 0. así como el número de recambio.4 0.00 0. cuando se ensayan. c) 0. c) la actividad enzimática en U/ml y U/mg. 55.22 6. d) el grado de inhibición cuando [S]= 0.4 10.63 0.5 µmol/min. Si 20µl de esta preparación se ensaya a concentración saturante de piridín nucleótido.02x 10-6M.67 17.6 3. Km’=5mM.67 A partir de estos datos calcular: a) los valores de Vmax y Km en presencia y ausencia de inhibidor. 57.08 7. Una isomerasa tiene.00 30. y b) calcular los valores de Km.5 mM.1µM 24. Sol: a) Inhibición no competitiva.92mM. b) calcular los valores de Km para el sustrato y de Ki para el inhibidor. variando las concentraciones de glutamato.62 3. y en presencia o ausencia de un inhibidor.6 25 22.81 50. 3x10-6 min-1.000 U/ml. c) 500.18 1.44 2.8 1. Ki 6´6x 10 -2M. cuando la concentración de sustrato es 3 mM. sabiendo que con [S]= 2 x 10 -5 M y [I]= 10-5 M.000 U/mg.48 0.

44 Calcular la KM y la Vmáx en ambos casos y la KI para el inhibidor.500 0.5x10-5M de substrato.252 [Cetoácido](M) 2.62 16 V(µmol/min). b) Km 1mM. Sol: Vmáx 0. expresada en función de la K M nos dará una velocidad de reacción igual al 60% de la Vmáx.8x10-4 M. Ki(b) 1. 62. 59. Ib inhibidor no competitivo. Sol: 1. b) 2. La descarboxilación enzimática de un cetoácido muestra las siguientes velocidades para las concentraciones que se citan: V0 (µmoles CO2/2min) 0.250x10-3 A partir de estos datos calcular gráficamente la Vmáx y la KM de esta reacción enzimática. Calcular la relación entre la concentración de substrato necesaria para una velocidad 90% de la Vmáx y la requerida para una velocidad 10% de la V máx para una enzima cuya cinética sigue la ecuación de Michaelis-Menten. 66%.05 0. Calcular qué concentración de substrato. 64.370 0. Sol: a) 9.02 0. Vmáx). v=v’(a)=10 mmol/min.5 0. 0.Inhibidor 8. km’(b) 1mM. ¿Qué clase de inhibición se produce?.33mM. Km’(a) 3. v’(b) 5 mmol/min. en ausencia y presencia de un inhibidor ([I]=1mM).25 10 12.588 0. Calcular la velocidad y el grado de inhibición de una reacción enzimática en presencia de 3.6x10-4M cuando la [S]=0.50 15. 65. (KM=2x10-4M) y 4x10-5M de inhibidor no competitivo (KI=2x10-5M).09 µmol/min.03M de substrato en ausencia de inhibidor es de 295 µmoles /min.8 V (µmol/min)+ Inhibidor 6. Sol: 14.5 KM. KM 5. Una enzima se ensayó para distintas concentraciones de su substrato específico.81. b)Km/3.526x10-3 0.67 25 41.64mM. Ki(a) 0. Calcular la velocidad inicial que se obtendrá en una reacción enzimática si la velocidad máxima es de 10 µmol/min y la concentración de sustrato es a) 10Km. 63.11KM. 81.000x10-3 0.Calcular: a) en cada caso el tipo de inhibición existente.6 µmoles /min. Sol: 9x10-7M.5 µmol/min.67 44. 60. sabiendo que la velocidad observada a 0.5mM.33 16. . Calcular la concentración de un inhibidor competitivo (K I= 10-7M) necesaria para que la velocidad sea un 20% de la Vmáx de una reacción enzimática (KM=1. 61.714x10-3 0. Sol: a) Ia inhibidor competitivo.77µmoles /min .417 0.4 mM).obteniéndose los siguientes resultados: [S] mM 0.10 0.500x10-3 1. Sol: 9KM. b) el valor de los correspondientes parámetros cinéticos (Km. Ki.

57%. Sol: a) 13. La mutación de la cepa 3 formó la cepa 4 que contenía Pro en dicha posición 26.23 µmol/min.6x10-3 mol/lxmin. 73. Jones y Nüremberg obtuvieron las siguientes frecuencias de aminoácidos que habían sido incorporados en proteínas: 10.Sol: Vmáx 50 µmol/min. b) 6. derivada de la 1 por mutación. El genetista molecular expresó su sorpresa y realizó un examen minucioso del problema propuesto. es el Met-Pro-Ser-Tyr-Gly. 63%.1mM. contenía Leu en la posición 26. c) 7. ¿qué velocidad y qué grado de inhibición (i%) se observará en el caso de que el inhibidor sea un: a) inhibidor competitivo (KI= 3x10-4M). KI 5. KM 0.15x10-4M. La mutación de la cepa 2 produjo la cepa 3. Inhibición acompetitiva o incompetitiva. c) inhibidor acompetitivo (KI= 3x10-4M). Para una [S] de 2x10-4M y [I] de 5x10-4M. La proteína A de la cepa 2. El nuevo péptido.5x10-3 mol/lxmin. 66. b) la secuencia de bases del ARNm transcrito por la segunda hebra de ADN. y muestra una Vmáx de 22x10-3 moles/lxmin. Suponiendo que todas las mutaciones eran sustituciones de bases.3% de Thr y 32. 68. y que la cepa progenitora y la hija no diferían mas que en una sola base del codón del resto 26 de la proteína A.Thr-Phe-Ile-Trp. ¿Concuerdan estas frecuencias observadas con las que cabía esperar? 72. 9. Indicar la secuencia de aminoácidos es codificada por la siguiente secuencia de bases de una molécula de ARNm: 5’-UUGCCUAGUGAUUGGAUG-3’. Una proteína A de una bacteria tipo salvaje (cepa 1) tiene un resto de Trp en la posición 26. .4% de His. GENÉTICA MOLECULAR 67. 70. 71. Escribir: a) la secuencia de bases de la otra hebra del ADN. b) inhibidor no competitivo (KI= 3x10-4M). KM´0. ¿En qué codón tuvo lugar la supresión? ¿En qué posición del codón original estaba sustituida la base suprimida? ¿Qué secuencias de bases tendrán los ARNms salvaje y mutante? ¿Cuál sería la secuencia de aminoácidos resultante si una guanina se insertase después de las tres primeras bases en la secuencia del ARNm mutante?. leída de 5’ a 3’: TCGTCGACGATGGATCCCATCGGCTACTGCA. Una hebra de ADN contiene la siguiente secuencia.6x10-3 mol/lxmin. d) la secuencia aminoacídica codificada si la segunda T del extremo 3’ del ADN inicial está suprimida. Un químico de proteínas comunicó a un genetista molecular que había encontrado un nuevo mutante de la hemoglobina en el que Asp era reemplazado por Lys. 26. 69.6% de Asn. Vmáx´ 19.8% de Lys. c) la secuencia de aminoácidos codificada por el ARNm.7x10-5M.6% de Pro. 9. 24%. 11.034 mM. ¿Cuál es la secuencia del polipétido formado por la adición de poli (UUAC) a un sistema de síntesis de proteínas libres de células?. en la que no se detectó una nueva proteína A mutante. Un enzima tiene un K M de 4. ¿Por qué dudaba el genetista molecular de la referida sustitución del aminoácido? ¿Qué aminoácidos sustituidos habrían sido mucho más aceptados por el genetista molecular?.3% de Gln. Un segmento de ARNm codifica el siguiente polipéptido: Met. se pregunta si estas observaciones están de acuerdo con el código genético e indicar el curso de los cambios del codón durante esta serie de mutaciones. La proflavina induce la supresión de una sola base del gen codificador de este ARNm. fruto de la traducción del ARNm alterado. V. Utilizando un polirribonucleótido con un 47% de adenina y un 53% de citosina distribuidas al azar.

¿Cuáles son los posibles codones asignados para estos cuatro aminoácidos? ¿Cuál fue el efecto del mutágeno empleado? 76. 78. deducir la secuencia de nucleótidos del ARNm que corresponde a ese polipéptido en cada una de las cepas. que los mutantes obtenidos tuvieran Ser o Leu en el lugar de la Pro en una posición específica y que el tratamiento posterior de estos mutantes con el mismo mutágeno diera lugar a Phe en esa posición. sin molde. posición 54: Ile ó Ser. utilizándolo como mensajero en un sistema acelular.74. Pro ó Ile. Suponer que el ARN de cadena simple del virus del mosaico del tabaco fuera tratado con un mutágeno químico. se encuentran normalmente ocupadas por leucina. 77. Las secuencias de aminoácidos del extremo –NH2 de un polipéptido en cepas salvaje y mutantes de una especie bacteriana son: CEPA Salvaje Mutante 1 Mutante 2 Mutante 3 Mutante 1’ SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS Met-Ser-Gly-Leu-Val-Ser-His-Thr Met-Tyr-Trp-Ile-Ser-Val-Ser-His Met-Ser-Gly-Ser-Val-Ser-His-Thr Met-Ser-Gly-COOH Met-Tyr-Trp-Leu-Val-Ser-His-Thr Sabiendo que las cepas mutantes 1. En una cadena proteica de 100 aminoácidos. Utilizando un ARNm sintético en el que se repite la secuencia (CCAA) y un extracto celular de E. durante el estudio de diversos mutantes de esta proteína se han encontrado los siguientes aminoácidos en las posiciones indicadas anteriormente: posición 21: Val. Se obtuvo un polipéptido en el que sólo aparecían 4 aminoácidos en las siguientes proporciones: Phe (16%). ¿Cuáles son los de los otros tres aminoácidos?. 81. Ser. ¿A partir de la secuencia de aminoácidos del extremo de una proteína se puede predecir la secuencia de bases del ARNm que la codifica?. posición 97: His. Arg ó . teniendo en cuenta que el código genético es degenerado y que normalmente los tripletes de bases que codifican a un mismo aminoácido suelen tener las dos primeras bases iguales. Leu y Pro. b) Ile. polihistidina y poliisoleucina. Ser (24%). poli (UCA) con el que se obtuvo una mezcla de tres polipéptidos: poliserina. 54 y 97. tipo salvaje y de un mutante son respectivamente: -Thr-Lys-Ser-Pro-Ser-Leu-Asn-Ala-AlaLys.y –Thr-Lys-Val-His-His-Leu-Met-Ala-Ala-Lys. Utilizando los datos de los dos experimentos. ¿Cómo puede producirse este mutante? ¿Cuál es la secuencia de bases de los ARNm que codifican a los cinco aminoácidos diferenciales de las cepas salvaje y mutante?. ¿qué proporción de tripletes codificarían: a) Phe. c)Leu y d) Tyr?. se ha sintetizado un polipéptido en el que se repite la secuencia de aminoácidos (Thr-Asn-Gln-Pro)n. 80. y que cada una de ellas se originó por una mutación puntual. 79. Se sintetizó un polinucleótido. determinar qué codones especifican los aminoácidos Phe. Si el codón para Asn es AAC. Coli. a partir de una mezcla de ribonucleótidos difosfatos de uracilo (40%) y citosina (60%). las posiciones 21. Si un ARNm presentase la misma cantidad de bases adenina y uracilo situadas al azar.2 y 3 derivan de la salvaje y la 1’ de la mutante 1. En otro experimento se utilizó un ARNm de secuencia conocida. 75. Las secuencias de aminoácidos de una parte de la lisozima del bacteriófago T 4. Leu (24%) y Pro (36%).

calcular: a) K’eq e ΔG’º para la hidrólisis de la Glucosa6P y b) K’eq e ΔG’º para la síntesis de la Glucosa-6P.72. c) 2 x 10-4 M d) 10-5 M.005x 10-3 ΔG’º 3138cal/mol. Calcular los valores de ΔGº del estado estándar para la disociación del ácido acético a los siguientes valores de pH: a) pH 0 y b) pH 5. 10-4 y 10-2 M. Ka=1. VI: TERMODINÁMICA.99M y 0. las concentraciones de ATP. ¿Cuál sería el codón utilizado para la leucina en cada una de las tres posiciones. c) –10. El ΔGº’ de la hidrólisis del ATP a pH 7 y a 25°C es –7. En las condiciones de equilibrio (músculo en reposo). b) ΔG’º de la reacción. Sol: -3. b) K’eq 5.05% de la glucosa-6P permaneció como tal. ΔGº para la hidrólisis del ATP=–7.3 Kcal/mol. Sol: K’eq 18. respectivamente.Val. 0. b) 10-2 M.7 kcal/mol.0001M y 0. ΔG’º = 5. Calcular la K’eq total y el ΔG’º total a pH 7 y a 25°C para la conversión del ácido fumárico en ácido cítrico en presencia de los enzimas.0095M. ADP y Pi se mantienen igual a 10-3.14 kCal/mol. Sol: a) 160. 87. cosustratos y cofactores adecuados. Sol: A) K’eq 199.1 M y en el equilibrio el 0. Sol:a) 0. b) 0. 25 mM y 13 mM. Calcular las concentraciones de FDP. 88.3 Kcal/mol. 89. NAD+/NADH=1.75x10-5. calcular: a) K’eq de esta reacción en el músculo. b) –3Kcal/mol. Si la concentración inicial de Glucosa-6P fue de 0. 82. en la reacción: A ↔ B. El ΔG’º de la hidrólisis de la glucosa-6P a pH 7 y a 25°C es –3. Calcular ΔG’º y la K’eq para la reacción entre la glucosa y el ATP.000951M. La K’eq para la reacción de la Fructosa-1. ADP. ΔG’º a pH 7y 25°C= -7. 86.09cal/mol.56Kcal/mol. Calcular ΔG para la hidrólisis del ATP a pH 7 y a 25° C en condiciones de estado estacionario (análogas a las que pueden darse en una célula viva) en las que las concentraciones de ATP. 90.3Kcal/mol.013 mM. La glucosa-6P se hidroliza enzimáticamente a pH 7 y 25° C hasta glucosa y Pi. El ATP producido queda disponible para la contracción muscular. creatina-P y creatina son: 4mM. catalizada por la hexoquinasa. y c) ΔG’º de la hidrólisis: Creatina-P + H2O↔ Creatina + Pi. En el músculo la creatina-P es una reserva de energía: Creatina-P + ADP + H+ ↔ ATP + creatina. 83.7 kcal/mol. respectivamente. ΔGº= 4 kcal/mol. de dihidroxiacetona fosfato (DHAP) y de gliceraldehido 3 fosfato (GAP) en el equilibrio cuando la concentración inicial de FDP es: a) 1M. Sol: -11792 cal/mol. suponiendo que ha sido una mutación puntual la que ha dado origen al cambio de aminoácido?. c) 0.999M y 0.7cal/mol b) 13304 cal/mol. 85. ΔG’º -1735 cal/mol.6-difosfato aldolasa (FDP) a 25°C y pH 7 (escrita en la dirección de formación de triosa fosfato) es aproximadamente 10 -4. Sol: ΔG’º -4. Sol: a) 6485. 84.21x 103. Calcular el desplazamiento de la situación de equilibrio debido al acoplamiento de la hidrólisis de una molécula de ATP.456 kcal/mol. La enzima lactato deshidrogenasa cataliza la reacción: NADH + Piruvato  Lactato + NAD+ Calcular la reacción espontánea que se produce y su ΔG cuando a pH 7 se dan las siguientes relaciones entre concentraciones: a) Lactato/piruvato=1. ∆G’º-3136.999M y 9x 10-6M. K’eq 2. .0001M d) 0. Sabiendo que ΔG’º para la hidrólisis del ATP es de –7.8.3 Kcal/mol.

91. NAD+/NADH= 1000.b)Lactato/piruvato=1000. En una célula anaerobia esta conversión se acopla a la síntesis de dos moléculas de ATP por molécula de glucosa.6Kcal/mol.google. Calcular: a) ΔG’º de la reacción total acoplada. E’0 Lactato/piruvato=-0. La conversión de glucosa en ácido láctico a pH 7 y 25ºC tiene una ΔG’º total de –52. E’ 0 NADH/NAD+=-0. Sol: a) reacción espontánea. c) con esa eficiencia ¿cuántos moles de ATP por mol de glucosa podrán obtenerse en condiciones de metabolismo aerobio.0 kcal/mol). d) -482950cal/mol PROBLEMAS RESUELTOS http://books. Sol: a) –36.0 Kcal/mol. b) reacción espontánea. d) calcular el ΔG’º para la oxidación total acoplada a la síntesis de ATP.com/books?id=pF-A9vUEL8C&pg=PA324&lpg=PA324&dq=ecuacion+de+michaelis+menten+ejercicios+solucionados&sou rce=bl&ots=BZDzV6wOgn&sig=zPDA_EJrMi_Go93wX6UWk9etjO4&hl=es&ei=4hqrTd2OGabV0 QHttdTcAg&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=3&ved=0CCQQ6AEwAg#v=onepage&q& f=false .19V.32 V.6%. b) eficiencia de la conservación de energía en el proceso. b) 29. c) 26 moles. dónde la glucosa se oxida hasta CO2 y H 2O (ΔG’º = -686.

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