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Extracción y Purificación de La Enzima Monóxido de Carbono Deshidrogenasa A Partir de La Bacteria Carboxidótrofa Oligotropha Carboxidovorans
Extracción y Purificación de La Enzima Monóxido de Carbono Deshidrogenasa A Partir de La Bacteria Carboxidótrofa Oligotropha Carboxidovorans
Raúl A. Cuervo
Bióloga. Profesor Tiempo Completo de la USB
Clara Hurtado Enrique Bravo
Química, magíster en Química, Bioquímico, magíster en Ciencias,
Universidad del Valle. Universidad del Valle.
Neyla Benítez Walter Torres
Bióloga, magíster en Microbiologia, Químico, doctorado en Química,
Universidad del Cauca. Universidad del Valle.
Fernando Larmat
Químico, doctorado en Química, Universidad del Valle.
Resumen
En este trabajo se reporta la extracción y purificación de la enzima monóxido de carbono deshidrogenasa a
partir de la bacteria Oligotropha carboxidovorans, cepa OM 5. La bacteria creció de manera autótrofa en un
medio mineral, en una atmósfera saturada con monóxido de carbono, a 30 °C con agitación constante. Para
la obtención de los extractos enzimáticos crudos, los cultivos se sometieron a ruptura por sonicación,
solubilización con detergente no iónico y centrifugación con el fin de eliminar los restos celulares. En el
proceso de purificación, los extractos enzimáticos crudos se pasaron a través de una columna de exclusión
molecular y otra de intercambio iónico.
Abstract
This paper reports the extraction and purification of the carbon monoxide dehydrogenase enzyme from
the Oligotropha carboxidovorans bacteria, OM 5 strain. The bacteria grew autotrophically in a mineral
medium, in carbon monoxide saturated atmosphere, at 30°C with constant agitation. In order to obtain the
crude enzymatic extracts, the crops underwent a breakdown by sonication, solvolysis with non-ionic
detergent and centrifugation to eliminate the cellular debris. During the purification process, the crude
enzymatic extracts were passed through a molecular exclusion column as well as through an ion-exchange
one.
* Este informe hace parte de las investigaciones adelantadas en el grupo Biotecnología vegetal, registrado por Colciencias e
inscrito en el Centro de Investigaciones Bonaventuriana de la Universidad de San Buenaventura Cali.
Fecha de recepción: Septiembre de 2005.
Aceptación para su publicación: Noviembre de 2005.
Revista científica Guillermo de Ockham. Vol. 3, No. 2. Julio-Diciembre de 2005 • ISSN: 1794-192X 107
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(200 mg), CuCl2. 2 H2O (10 mg), NiCl2. 6 Un volumen final de 5 ml de la suspensión
H2O (20 mg), Na2MoO4. 2 H2O (900 mg), celular tratada con lisozima fue sometida a so-
Na2 SeO3 (20 mg). nicación con las indicaciones mencionadas
El crecimiento autotrófico fue realizado me- anteriormente. La muestra fue colocada en hie-
carbono disponible para la bacteria provenía dos de sonicación fueron de dos minutos con
cida a partir del liofilizado original en 1 ml del Este procedimiento se repitió cinco veces con
medio de cultivo descrito anteriormente. A par- cada una de las muestras, completando un
tir de esta muestra se realizaron cultivos su- tiempo total de sonicación de 10 minutos por
cesivos hasta obtener 200 ml de cultivo. El muestra.
recipiente con el medio de cultivo inoculado
Determinación de la concentración de
fue colocado en un desecador saturado con proteínas de los extractos celulares
monóxido de carbono, con agitación cons- La cuantificación de proteínas presentes en
tante a 30 ºC, durante 96 horas, tiempo nece- el extracto crudo obtenido a partir de la so-
sario para que las células alcanzaran la fase nicación fue realizado por el método espectro-
de crecimiento exponencial fotométrico de Schleif y Wensink (1981).
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das para evitar el escape del gas y el contac- El gel utilizado fue el Sephadex G-100, capaz
to de los reactantes con el oxígeno del aire y de separar proteínas que posean tamaños
posteriormente, burbujeadas durante 10 mi- entre 4.000 y 150.000. Un gramo de Sephadex
nutos con monóxido de carbono. Los ensa- G-100, fue solubilizado en 10 ml de alcohol
yos se realizaron en un tiempo total de 1.800 etílico al 10% y, posteriormente, colocado en
segundos, suficiente para que la reacción se una pipeta, obteniendo una columna de 1.3x
efectuara completamente. 10 cm de alto.
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Figura 1
lulas antes y después de la sonicación varia-
ba, lográndose concentraciones proteicas M 1 2 3 4 5
270
desde 1.21 mg/ml hasta 23.4 mg/ml.
Actividad enzimática 250
La muestra anteriormente mencionada se pa- el extracto crudo, mientras que en los pozos
só por una columna de Sephadex g-100, em- cuatro y cinco se observa una sola banda
pleándose para ello 120 ml del buffer de elu- correspondiente a la enzima purificada.
ción, los cuales fueron recolectados en 12
Los resultados muestran que utilizando suce-
fracciones de 1 ml cada una, después de la
sivamente las columnas de Sephadex G-100
fracción número 12 no se observaba activi-
y Ecteolla celulosa, se lograron grados de
dad enzimática, ni proteína.
purificación que oscilaron entre 2 a 100 veces
Se agruparon las fracciones que contenían con Sephadex y 6,7 a 200 veces con Ecteolla
actividad enzimática y concentración de pro- celulosa, para el caso específico de M2, se
teínas en una sola fracción y se tomaron 300 lograron grados de purificación tres veces con
ml colocándola en el extremo superior de sen- Sephadex y 25 veces con Ecteolla celulosa
da columna de Ecteolla celulosa. Al final de la (Figura 2).
cromatografía se obtuvieron seis fracciones de De otro lado, se determinó si el proceso de
1 ml. La depuración de proteínas a través de solubilización proteica por medio del Tritón X-
los pasos de purificación se puede observar 100 estaba influyendo sobre la purificación de
en la Figura 1. la proteína, de ahí que para M2 se obtuvo una
Se puede observar como va disminuyendo el actividad enzimática específica de 30 microU/
número de bandas a medida que aumentan mg antes de Tritón X-100 y 110 microU/mg
los pasos de purificación. En el pozo uno se después del Tritón X-100.
observan cinco bandas definidas correspon- Es importante indicar que si cambiaba la se-
dientes a las diversas proteínas presentes en cuencia de purificación, pasando el extracto
Figura 2
M2
Comparación entre la concentración de proteínas y la actividad enzimática
específica de la muestra M2 a través de los pasos de purificación.
enzimático primero por la columna de Ecteolla corriente anódica sobre la voltametría del azul
celulosa y luego por la de Sephadex G-100, de metileno, mientras la corriente catódica
la actividad enzimática del extracto se perdía. permanece estable. La Figura 3 muestra la
diferencia entre el voltamograma para el azul
Estudios electroquímicos de metileno (¾) y con la adición del sustrato
Voltametría cíclica CO al sistema en la presencia del mediador y
Los experimentos de voltametría cíclica no CODH, dando como resultado un aumento
mostraron indicios de electroactividad directa en la corriente anódica (—).
del monóxido de carbono deshidrogenasa.
El CO tiene un efecto en la disminución de la
Figura 3
100
80
Discusión de resultados
60
40
Extracción y purificación enzimática
CORRIENTE (nA)
20
El grado de ruptura celular fue aproximada-
0
-20
mente del 85%, determinado por medio de
-40 conteos celulares antes y después de la
-60 sonicación. El método de ruptura recomen-
-80
-0,26 -0,24 -0,22 -0,20 -0,18 -0,16 -0,14 -0,12 dado es la prensa francesa, usado por Meyer
POTENCIAL (V) vs Ag/AgCl
& Schlegel (1979), el cual tiene la ventaja de
Voltamograma cíclico de azul de metileno (2.5
mM) en buffer fosfato 50 mM, pH 7, saturado con hacer estallar las células de forma uniforme,
nitrógeno, saturado con CO: (¾) solo; (—) con la
adición de 0.36 ml de extracto enzimático. logrando mayor efectividad en la ruptura.
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El decrecimiento de la absorbencia del azul centrifugación a 5.000 rpm, con el único ob-
de metileno es una medida indirecta de la oxi- jetivo de precipitar los restos celulares. Ade-
dación del monóxido de carbono. La absor- más, fue necesario el tratamiento de las mues-
bancia disminuye a medida que transcurre el tras con Tritón X-100 para separar la enzima
tiempo de reacción y el color de la mezcla de de los restos celulares. Meyer y Schlegel par-
reacción cambia desde un color azul (estado tieron de un cultivo de 10 litros en un fermen-
oxidado del azul de metileno) hasta incoloro tador, mientras que en nuestro trabajo se par-
(estado reducido del azul de metileno). La te de un cultivo de sólo 200 ml, debido a la
actividad de oxidación del monóxido de car- imposibilidad de utilizar tales cantidades de
bono del extracto crudo fue baja en compa- medio de cultivo.
ración a las reportadas por Meyer & Schlegel
La actividad inicial de la enzima medida en
(1979); sin embargo, se logró un aumento
los extractos crudos, tuvo una amplia varia-
importante en la actividad enzimática especí-
ción, esto puede deberse al método de soni-
fica de los extractos después de los procedi-
cación empleado para el rompimiento celular.
mientos de purificación proteica.
Aunque el número de células sometidas al
Los resultados mostraron que la actividad es- procedimiento fue aproximadamente el mis-
pecífica de la proteína aumentó con los pa- mo en cada caso y el protocolo usado fue el
sos de purificación, al mismo tiempo que se mismo, se observó que al final de la sonicación
notó una reducción en la concentración de el número de células rotas varió ampliamen-
proteínas. La mayor tasa de purificación logra- te. A partir de gel de poliacrilamida se puede
da fue de 200 veces. Estos resultados tienen comprobar que los pozos 4 y 5 (muestra des-
diferencias con los trabajos reportados por pués de pasar por Ecteolla) sólo presentan
Meyer y Schlegel (1980), donde se realizaron una banda visible, la cual tiene un peso
más pasos de purificación: ultracentrifugación molecular aproximado a 230.000, correspon-
del sobrenadante inmediatamente después diente al de la enzima monóxido de carbono
de rotas las células, seguido por una cromato- deshidrogenasa.
grafía en gradiente de densidad de sacarosa,
En el pozo 1 se presentan varias bandas, de
diálisis para eliminar los restos de sacarosa,
las cuales se observan dos grandes y visi-
concentración con Sephadex G-25, cromato-
bles, una a 270.000 y otra a 230.000. Este gel
grafía de Ecteolla celulosa, diálisis y, finalmen-
muestra cómo disminuye el número de ban-
te, gradiente de densidad de sacarosa. To-
das a medida que aumentan los pasos de
dos estos pasos les permitieron a estos
purificación, logrando una buena purificación
investigadores obtener una purificación de
enzimática.
35.5 veces con una actividad enzimática espe-
cífica de 1.9 mg/unidades. En nuestro traba- Aunque a partir del gel de poliacrilamida se
jo, el extracto enzimático obtenido de la puede decir que los pasos de purificación fue-
ultracentrifugación no tenía actividad enzimáti- ron eficientes para lograr la remoción de pro-
ca, por lo que este paso fue reemplazado por teínas diferentes a la enzima de interés, se re-
Figura 4
Oxidación electroquímica de monóxido de carbono con el uso de azul de metileno (AM+) como un
mediador electrónico, CODH (red.) y CODH (ox.).
comienda utilizar una columna de Sephadex La Figura 3 muestra la prueba realizada con el
G-120, de esta forma sería más eficiente el sistema completo, variando la cantidad de
proceso de purificación, debido a que el ta- extracto enzimático adicionado a la celda
maño de las partículas que conforman este electroquímica. La adición del sustrato al me-
gel es mayor, aumentando el rango de sepa- dio de reacción en presencia del extracto
ración. enzimático y el mediador mostró un aumento
Las pruebas electroquímicas se fundamen- en la corriente anódica, que comprueba el in-
tan en la oxidación de CO por la enzima tercambio de electrones entre el CO y el azul
CODH, el sustrato reducido, CO, dona un par de metileno, mediado por el extracto enzimá-
de electrones a la enzima; estos seguidamen- tico. La diferencia en el aumento de la corriente
te son aceptados por el sustrato oxidado azul anódica entre las dos pruebas es mínima (»15
de metileno (AMox), el cual es, por lo tanto, nA) lo que muestra que independiente de la
reducido, como lo indica la siguiente ecua- cantidad de extracto adicionado, se necesita
ción: tener suficiente cantidad de enzima activa pre-
sente en el mismo para que se lleve a cabo,
CODH
de manera efectiva, la catálisis enzimática que
CO + H2O + AMox CO2 + 2H+ + AMred
permita un notable aumento en la corriente
Y, finalmente, reoxidado sobre la superficie del
anódica del mediador electrónico una vez este
electrodo de platino. La Figura 4 muestra el
es reoxidado en la superficie electródica.
esquema de la reacción:
El acoplamiento de la enzima CODH con el
azul de metileno y la superficie electródica
permite explorar en el diseño de un biosensor
Conclusiones
para CO, en el cual el mediador participa fácil-
mente en la reacción redox con el componen- – Se logró la purificación de la enzima monó-
te biológico ayudando en la rápida transferen- xido de carbono deshidrogenasa a partir
cia electrónica y haciendo el sistema menos de extractos celulares procedentes de la
susceptible a sustancias interferentes debido bacteria Oligotropha carboxidovorans,
a los potenciales más bajos de electrodo. cepa OM 5.
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