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Clase 1 21/01/21
Notas adicionales antes de la clase:
Darwin. Se basa en cuatro postulados acerca de las poblaciones, es decir, todos los individuos de una
especie en un área particular.
Postulado 1 Los individuos varían en una población. Cada uno de los integrantes de una población
difiere de los demás en muchos aspectos.
Postulado 2 Los caracteres se heredan de padres a descendientes. Al menos algunas de las
diferencias entre los miembros de una población se deben a características que pueden
transmitirse de los progenitores a la descendencia.
Postulado 3 Algunos individuos no logran sobrevivir y reproducirse. En cada generación, algunos
individuos de una población sobreviven y se reproducen con éxito, pero otros no.
Postulado 4 La supervivencia y la reproducción no están determinadas por el azar. El destino de
los individuos no está determinado completamente por el azar o la suerte. En vez de ello, la
probabilidad de supervivencia y reproducción de un individuo depende de sus características.
Los individuos con caracteres que les confieren ventajas sobreviven más tiempo y dejan mayor número
de descendientes, un proceso conocido como selección natural.
NOTAS DE CLASE
Ciencia: Herramientas para contestar esas preguntas.
Teoría: Conjunto de ideas coherentes que tratan de responder una pregunta. Una teoría se vuelve
realidad cuando haya mas datos que la apoyen.
Darwin propone que venimos de un ancestro en común y que de el se diversifican las especies.
Lamark decía que si un organismo tiene un rasgo favorecido los descendientes lo heredan.
Que algo sea cierto no quiere decir que sea una verdad absoluta.
Evolución biológica: es el conjunto de transformaciones a través del tiempo.
La teoría de la evolución de Darwin se basa en cinco ideas particulares.
1. La evolución ocurre. La evolución biológica es el cambio en las propiedades de un grupo de
organismos (Poblaciones) durante el curso de sus generaciones, el cambio ocurre genéticamente.
El DNA de la población no es estático. Las formas de vida no son estáticas si no que evolucionan;
las especies cambian continuamente, unas se originan y otros se extinguen.
2. El cambio usualmente ocurre en forma gradual. Las poblaciones cambian en cientos, miles o
millones de años. El proceso de evolución es gradual, lento y continuo, sin saltos discontinuos o
cambios súbitos.
3. La especiación ocurre: una especie se divide en dos o más especies. Especie: es un conjunto de
individuos que proceden de antecesores comunes y que son capaces de reproducirse entre si y
de dar lugar a una descendencia fértil. Las poblaciones que se derivan de una población ancestral.
Si diferentes cambios se vuelven obvios en varias poblaciones, entonces esas poblaciones
divergen. Durante la evolución las poblaciones tienen descendientes con modificaciones.
Los transgénicos no son parte de la evolución, si no más con una evolución artificial.
4. Todas las especies comparten un ancestro común.
Los organismos parecidos se hallan emparentados
y descienden de un antepasado común. Todos los
organismos vivientes pueden remontarse a un
origen único de la vida.
Si se toma un parte de especies, sin importar que tan
cercanas o lejanas estén relacionadas
filogenéticamente, y se empieza a analizar su
evolución, tarde o temprano vamos a encontrar entre
ambas un ancestro común.
Esto debido a la aparición de linajes a partir de una forma ancestral. Si esto no ocurriera, no habría
los 10 millones de especies que hay. Todo sería una línea de especies humanas.
5. Mucho del cambio evolutivo fue causado por selección natural, el cual es el único proceso que
produce adaptación. La forma clásica de la selección natural establece que las condiciones de un
medio ambiente favorecen o dificultan, es decir, seleccionaban la reproducción de los
organismos vivos según sean sus peculiaridades.
La selección natural es la clave, que, en dos fases, que explica todo el sistema.
Primera fase: Producción de variables = generación de modificaciones espontaneas en los
individuos.
Segunda fase: selección a través de la supervivencia en la lucha por la vida: los individuos
mejor dotados, los que han nacido con modificaciones espontáneos favorables para hacer
frente al medio ambiente van a tener mas posibilidades de sobrevivir, de reproducirse y de
dejar descendencia con estas ventajas.
EJEMPLO
Los pinzones de Darwin, residentes de las islas Galápagos
Darwin estudió un grupo de especies estrechamente
relacionadas de pinzones en las Islas Galápagos. Cada especie
se especializa en comer un tipo distinto de alimento y tiene un
pico con tamaño y forma característicos, porque la selección
natural favoreció a los individuos más aptos para explotar
eficientemente cada fuente de alimento local.
Las primeras trazas detectables de vida en la tierra deben ser formas simples y solo después deben
aparecer formas más complejas.
Diferencias entre arquea y bacteria: Principal diferencia es la
membrana.
En los humanos aparece el lanugo, está presente en los fetos. Provenimos de animales peludos, que aun
lo conservan porque lo necesitan.
Clase 2 25/01
La biogeografía es la ciencia que estudia la distribución de los seres vivos sobre la tierra, así como los
procesos que la han originado, que la modifican y que la pueden hacer desaparecer.
En alguna isla las especies no son endémicas todas migraron.
Si la evolución es el resultado principal de la selección natural, es posible ver los cambios hay mas de 300
casos.
El ejemplo más común es la del pico de los pinzones.
Las cosas que podrían decir que la evolución es falsa
Encontrar fósiles en lugares muy antiguos
Adaptaciones que solo sean buenas para una especie y no para las que siguen.
Desarrollo de un comportamiento altruista entre especies no relacionadas
Que haya discordancia entre la morfología y el ADN
Pero ya que no se han encontrado estas la teoría es científicamente cierta
-SOBRE EL ARTICULO-
En el cual afirmaba que todas las pruebas que se conocían eran coherentes con la idea de que el hombre
había evolucionado a partir de un antecesor compartido con los monos. Especuló que el lugar de este
origen era África y que los antepasados humanos habían tomado gradualmente su forma actual desde
entonces. Sugirió que la selección natural no era la única presión evolutiva que actuaba. Las mujeres
podrían haber preferido caracteres diferentes en los hombres, lo que Darwin llamó selección sexual, y
esto pudo haber dado lugar a diferencias entre las razas. Las ideas de Darwin no convencieron a su viejo
corresponsal, Alfred Russel Wallace, quien decidió que nuestros cerebros demasiado grandes eran mucho
más potentes de lo necesario, ya que podríamos sobrevivir fácilmente con unas mentes sólo ligeramente
más avanzadas que las de los monos. Concluyó, por tanto, que la creación del hombre debía ser obra de
la intervención divina.
El descubrimiento de los primeros fósiles humanos
Incluso cuando, en 1857, salió a la luz la primera parte de un ser humano fósil, a los naturalistas les costó
mucho reconocer lo que era en realidad. Unos mineros alemanes que trabajaban en el Feldhofer Grotto,
en el valle de Neander, desenterraron un cráneo que tenía un aspecto un tanto humano, pero era
notablemente grueso y lucía un toro supraorbital muy desarrollado. ¿Pertenecía a un individuo antiguo
de una especie humanoide extinta en la actualidad? ¿O era el hombre de Neanderthal simplemente un
individuo extremo de Homo sapiens? Uno de los naturalistas alemanes que describió el cráneo por
primera vez, Herman Schaaffhausen, estaba convencido de esto último. Ignoró las pruebas de que el
cráneo se había encontrado junto a mamuts y osos de las cavernas extintos, y afirmó que era algún
bárbaro reciente, quizás perteneciente a una de las tribus salvajes que mencionaban los historiadores
romanos.
https://www.sesbe.org/evosite/history/humans_evolv.shtml.html
https://www.sesbe.org/evosite/history/humans_evolv3.shtml.html
Neodarwinismo
Este mapa del libro de Wallace muestra su región biogeográfica oriental, dividida en cuatro subregiones
(trazadas en rojo). La flecha indica la «línea de Wallace». Haz clic para aumentar de tamaño.
https://www.sesbe.org/evosite/history/biogeography.shtml.html
en 1915 el geólogo alemán alfred weinberg observo que se habían descubierto las mismas plantas y
animales fósiles en lados opuestos del atlántico. Dado que el océano era una distancia demasiado grande.
La tectónica de placas
Las regiones biogeográficas del mundo que identificó Wallace coinciden aproximadamente con los
continentes. Pero en el siglo XX, los científicos reconocieron que la biogeografía ha sido mucho más
dinámica durante el transcurso de la historia de la vida. En 1915, el geólogo alemán Alfred Wegener
(izquierda) se sorprendió por el hecho de se hubieran descubierto las mismas plantas y animales fósiles
en lados opuestos del Atlántico. Dado que el océano era una distancia demasiado grande para que la
hubieran atravesado por sí mismos, Wegener propuso que los continentes habían estado unidos. No fue
hasta la década de 1960, cuando los científicos cartografiaron detalladamente el suelo oceánico, que
fueron capaces de demostrar cuál era el mecanismo que hacía posible la deriva continental: la tectónica
de placas.
https://www.sesbe.org/evosite/history/biogeography2.shtml.html
La radioactividad también proporcionó un calendario absoluto de la
historia de la vida. Los físicos eran capaces de estimar la edad de las
rocas (derecha) midiendo los átomos producidos por las
desintegraciones en su interior. Además, comparando la proporción de
esos átomos con los átomos de los meteoritos, podían estimar cuanto
tiempo hacía que se había formado la Tierra, junto con el resto del
sistema solar. En 1956, el geólogo estadounidense Clair Patterson
(arriba) anunció que la Tierra tenía 4 500 millones de años. Por fin,
Darwin había conseguido el lujo del tiempo que ansiaba.
https://www.sesbe.org/evosite/history/radiometric2.shtml.html#:~:text=Los%20cient%C3%ADficos%20
miden%20la%20edad,Tierra%20mediante%20la%20dataci%C3%B3n%20radiom%C3%A9trica.&text=Los
%20f%C3%ADsicos%20eran%20capaces%20de,las%20desintegraciones%20en%20su%20interior.
arwin mostró que los misteriosos parecidos entre embriones tenían todo el sentido si la vida
evolucionaba por selección natural. Tras la publicación del Origen de las especies, muchos científicos
hicieron la siguiente pregunta lógica: ¿era el desarrollo embrionario un registro de la auténtica historia
evolutiva de su especie?
https://www.sesbe.org/evosite/history/early_evodevo.shtml.html
La evolución (evo) se reencuentra con el desarrollo (devo)
El paleontólogo de
Harvard Stephen Jay
Gould (izquierda), más
que nadie, llamó de
nuevo la atención hacia
los embriones como
cápsulas del tiempo. En
su emblemático libro de
1977 Ontogenia y
filogenia, GGould
documentó la historia de
la investigación científica
que había conducido a
tanta confusión, pero
además demostró que la gran riqueza de ejemplos podía organizarse según ciertos principios sencillos.
Imagina que el ritmo del desarrollo está controlado por dos ruedas de ajuste como las de la radio. Una de
ellas controla la velocidad a la que crece un organismo y la otra regula la velocidad a la que cambia de
forma con el paso del tiempo. Las mutaciones aleatorias pueden tener como consecuencia un cambio en
el ajuste de cada una de las ruedas, acelerando o frenando la velocidad a la que se desarrollan los
embriones de una especie. Estos tipos de ajustes pueden alterar completamente el cuerpo de un
organismo o los órganos individuales.
https://www.sesbe.org/evosite/history/modevdev.shtml.html
https://www.sesbe.org/evosite/history/randommuts.shtml.html
Ronald Fisher y sus colegas dieron una nueva base genética al concepto de la selección natural de Darwin Sin embarg
dejaron un proyecto igualmente importante para los biólogos que los sucedieran: explicar, en el lenguaje de los gene
son las especies y cómo se originan. Las respuestas no comenzarían a aparecer hasta la década de 1930, gracias en p
trabajo de un genético soviético llamado Theodosius Dobzhansky (derecha).
Dobzhansy emigró a los Estados Unidos en 1928 y trabajó en la habitación de las moscas («Fly Room») de Thomas H
Morgan, donde se estaban estudiando de cerca las mutaciones por primera vez. También estudió cuidadosamente el t
de los genéticos de poblaciones como Sewall Wright, quienes estaban demostrando cómo afecta el tamaño de una po
la velocidad a la que puede extenderse una mutación. A Dobzhansky le interesaba descubrir la genética que determin
diferencias entre las poblaciones de una especie.
En esa época, la mayoría de los biólogos asumían que todos los miembros de una
especie cualquiera tenían prácticamente los mismos genes; pero estas ideas se habían
originado en el laboratorio. Dobzhansky comenzó a analizar los genes de las moscas
de la fruta silvestres y viajó desde Canadá hasta México para atrapar moscas de la
especie Drosophila pseudoobscura. Averiguó que las diferentes poblaciones de D.
pseudoobscura no tenían unos conjuntos de genes idénticos. Cada población de
moscas de la fruta que estudió tenía marcadores distintivos que la distinguían de otras
poblaciones.
https://www.sesbe.org/evosite/history/modsynth.shtml.html
El libro de Dobzhansky la Genética y el origen de las especies cautivó a los biólogos mucho más allá de
los límites de la genética. En las montañas de Nueva Guinea, un ornitólogo llamado Ernst Mayr
(derecha) encontró en el libro una gran fuente de inspiración. Mayr se especializó en descubrir
nuevas especies de aves y cartografiar sus áreas de distribución. Determinar exactamente qué grupo
de aves merece el rango de especie no es tarea fácil. Una especie de ave del paraíso puede
reconocerse por el color de sus plumas, pero puede haber una gran cantidad de variación en otros
rasgos de un lugar a otro; por ejemplo, en una montaña podía tener una cola exageradamente larga
mientras que en otra la cola podría ser de corte recto (abajo a la derecha).
Las colas d
La variabilidad entre poblaciones
Los biólogos normalmente intentaban poner orden en este aves del pa
caos reconociendo subespecies, es decir, poblaciones locales que viven
de una especie lo bastante diferentes como para requerir una montañas d
etiqueta especial propia. Mayr observó que la etiqueta de de Nueva G
subespecie era una solución que distaba mucho de ser (A) son má
perfecta. En algunos casos, las subespecies no eran en que las de
realidad distintas entre sí, sino que había una gradación entre
que viven
ellas, como los colores de un arcoiris. En otros casos, era
posible que lo que parecía una subespecie, al examinarlo en
montañas m
mayor profundidad, resultara ser una especie por sí sola. centrales (
Como muchos otros naturalistas de su época, al
principio Mayr sospechaba que en la evolución
actuaba algún tipo de herencia lamarckiana, pero
cuando leyó a Dobzhansky y a otros artífices de la
síntesis moderna se dio cuenta de que el origen de
las especies podía explicarse mediante la genética.
Mayr también se dio cuenta de que el enigma de las
especies y las subespecies no debería considerarse
un rompecabezas: en realidad eran el testimonio vivo
del proceso evolutivo sobre el que había escrito
Dobzhansky. Las variaciones surgen en las diferentes
zonas del área de distribución de una especie, dando
lugar a diferencias entre las poblaciones (ejemplo de
la derecha). En una zona del área de distribución, las
aves tienen colas largas, en otras, colas cortas. Sin
embargo, debido a que las aves se aparean también
con sus vecinas, no se aíslan en una especie propia.
El tamaño y la forma de la cresta de Dicrurus paradiseus varía
considerablemente por todo el sureste asiático.
https://www.sesbe.org/evosite/history/speciation.shtml.html
Clase 11/02/2021
ADN, el lenguaje de la evolución: Francis Crick y James Watson
https://www.sesbe.org/evosite/history/dna.shtml.html
El árbol de la vida: Reconstrucción Filogenética
1. El proceso de evolución produce un patron ….
Los árboles filogenéticos son hipótesis sobre las relaciones que existen entre los organismos.
Las filogenias siguen la pista a los patrones de ascendencia compartidos por los linajes. Cada linaje
tiene una parte de historia que es única y otras partes que son compartidas con otros linajes.
Cada linaje tiene antepasados únicos de ese linaje.
Un clado es una agrupación que contiene un antepasado común y todos los descendientes de ese
antepasado. Los caldos están anidados unos dentro de otros, formando una jerarquía anidada. Un
clado puede estar formado por muchos miles de especies o solo por unas pocas.
Problemas en el árbol de los humanos.
1. Los humanos no evolucionaron a partir de los chimpancés. Son primos evolutivos.
Filogenia de vertebrados
Para construir un árbol filogenético, se recogen datos
sobre los caracteres de cada organismo que les interesa.
Carácter compartido: tiene en común 2 linajes
Derivado: a evolucionado en el linaje dando lugar a un
clado (apomorfico).
Ancestral: se encuentra en el ancestro común del grupo
(plesiomorfico).
HOMOLOGIAS
Caracteres homólogos: caracteres de diferentes organismos que fueron heredados de un antepasado
en común que también los tenía.
Las características similares debidas al parentesco se conocen como homologías.
Las homologías pueden descubrirse haciendo anatomía comparada.
Analogías: ejemplo la estructura de un ala de murciélago y un ave es homologa.
Evolución convergente: proceso en el cual 2 linajes distintos evolucionan de una característica similar
independientemente.
Clase 25/02/2021
Es un programa para agrupar datos en árboles.
Paiwise Sequence Aligiament
Se secuencia por proteínas. Y se pueden hacer análisis de aminoácidos para clasificar dentro de las
proteínas, se agrupan dentro de la función que cumple su aminoácido.
Clase 1/3/2021
Maximun likehood: La máxima verosimilitud
Los métodos algorítmicos: Máxima parsimonia
Métodos de distancia = UPGMA
NJ: vecino mas cercano
Clase 8/03/21
Las mutaciones alteran rutas bioquímicas o de desarrollo preexistentes, así que no todos los cambios
mutacionales concebibles son posibles. Algunos cambios adaptativos pueden no ocurrir.
No todas las secciones de los genes van a ser mutadas. La mayoría de las mutaciones son no sinónimas.
Mutación sinónima: no producen cambio.
Mutación no sinónima: si producen cambio.
Mutaciones del cariotipo (complemento del cromosoma) incluyen.
Traslocación reciprocas entre dos cromosomas no homólogos da lugar a la traslocación heterocigota.
Una mutación es un cambio estable heredable en el material genético.
Alteran la secuencia del DNA por tanto introducen nuevas variantes.
Muchas de estas variantes suelen ser eliminadas, pero ocasionalmente algunas de estas variantes pueden
tener éxito e incorporarse en todos los individuos de la especie.
La mutación es un factor que aumenta la diversidad genética.
Marcadores genéticos
Marcador genético o marcador molecular: segmento de DNA con una ubicación física identificable en un
cromosoma y cuya herencia se puede rastrear.
Variación nucleotida del locus ADH de Drosophila melanogaster.
Se hace un diagrama de 4 exones separados por intrones.
Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción o RFLP: son secuencias específicas de nucleótidos
de DNA que son reconocidas y cortadas por las enzimas de restricción (también llamadas endonucleasas
de restricción) y que varían entre individuos. Las secuencias de restricción presentan usualmente patrones
de distancia, longitud y disposición diferentes en el DNA de diferentes individuos de una población es
polimórfica para estos fragmentos de restricción.
La técnica para RFLP se usa como marcador para identificar grupos particulares de personas con riesgo a
contraer ciertas enfermedades genéticas, en ciencia forense, en pruebas de paternidad y en otros campos.
Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados
Amplificación aleatoria de DNA polimórfico: esta basado en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
Los fragmentos de DNA obtenidos…
Fuerzas evolutivas
1. Mutación y recombinación
2. Selección natural
3. Deriva génica
4. Migración
5. Selección sexual
Selección natural: es la reproducción diferencial de unas variantes genéticas respecto de otros.
La gran idea de Darwin de la evolución por selección natural es relativamente sencilla, pero a menudo
se entiende mal. Ejemplos para entenderla bien:
Diversidad de caracteres: los escarabajos son verdes y otros marrones.
Definición axiomática….
Deriva génica
Es un sorteo de genes que ocurre durante la transmisión de gametos de los padres a los hijos de cada
generación.
- La mayoría de los organismos son diploides, es decir, tienen dos ejemplares de cada gen.
- Los gametos de estos organismos portan solo uno de los dos ejemplares (alelos) de cada gen.
- El que un gameto lleve un alelo u otro es una cuestión de azar. La formación de gametos y su
consiguiente unión para formar los huevos de la siguiente generación es un proceso
probabilístico.
Una población de una especie diploide de 50 individuos.
Un gen con dos alelos, A y si están en la misma frecuencia = 50 copias….
La migración
Es el intercambio de genes entre poblaciones debido a la migración de los individuos.
Selección sexual (caso especial de la selección natural)
Actúa sobre la capacidad que tiene un organismo para conseguir (por todos los medios necesarios),
copular con una pareja.
A menudo la selección sexual es lo bastante poderosa como para producir caracteres que deterioran
la capacidad de la supervivencia del individuo.
Una definición de población es su frecuencia genotípica. Esto da una indicación de los genotipos que
están mas o menos prevalentes en la población.
Propiedades de un experimento de Bernoulli
1. En cada experimento solo hay dos posibles resultados: éxito o fracaso.
2. El resultado obtenido en cada prueba es independiente de los resultados obtenidos en pruebas
anteriores.
3. La probabilidad de un suceso es constante, la representamos por p, y no varia de una prueba a
otra. La probabilidad del complemento es 1-p y la representamos como q.