Universidad Abierta y a Distancia de México

Materia: Bioinformática

Unidad 3: Análisis de secuencias de aminoácidos

Actividad 2. BLASTP

Alumno: Jesús Antonio Bueno Rojas

Matrícula: ES1521204483

Docente: AMALIA MALDONADO MAGAÑA

Carrera: Ing. Biotecnología

Grupo: BI-BIIN-2001-B1-001

Fecha de entrega: 11/marzo/2020

1. Identificar a que proteína pertenece la secuencia utilizando el programa BLASTP.

> Secuencia 1

ASTVSNTSKLEKPVSLIWGCELNEQDKTFEFKVEDDEEKCEHQLALRTVCLGDKAKDEFNIVEIVT
QEEGAEKSVPIATLKPSILPMATMVGIELTPPVTFRLKAGSGPLYISGQHVAMEEDYSWAEEEDEG
EAEGEEEEEEEEDQESPPKAVKRPAATKKAGQAKKKKLDKEDESSEEDSPTKKGKGAGRGRKP
AAKK

Entrar al sitio web.

Seleccionar la opción de Protein BLAST.

Introducir la secuencia del archivo FASTA.

Realizar la búsqueda BLAST.

Los resultados muestran que la secuencia pertenece a la proteína Nucleoplasmina, con un
alineamiento de consulta del 100% y un error de 3e-139.

2. Encontrar dos proteínas con un grado de similitud mayor del 80% y dos proteínas con
aproximadamente un 50% de similitud.

Nombre Código Grado de similitud

Npm-A protein TR:Q6GQG6 99
nucleoplasmin-2 isoform X2 TR:A0A1U8DBM8 80.3
Nucleophosmin/nucleoplasmin, 2b TR:A0A3B4BT33 53.3
nucleoplasmin ATPase-like TR:A0A1S3QH32 51.1

Fuentes de Información:

NCBI. (2020). BLAST. Nucleotide Sequence. 2020, de NCBI Sitio web:

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_511369194

UnADM. (2020). Unidad 3. Análisis de secuencias de aminoácidos. 2020, de UnADM Sitio web:
https://csba.unadmexico.mx/pluginfile.php/2496/mod_label/intro/Unidad3.Analisisdesecuenciasdea
minoacidos.pdf

FASTA. (2020). Protein Similarity Search. 2020, de European Bioinformatics Institute. Sitio web:
https://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/fasta/