Evidencia de aprendizaje

GENBANK

Nombre de la universidad: Universidad abierta y a

distancia de México
Carrera: Ingeniería en biotecnología
Nombre de la asignatura: Bioinformática
Grupo: BI_BIIN_2002_B1_001
Nombre de la unidad: Introducción a la bioinformática
Nombre de la actividad: Evidencia de aprendizaje
Nombre del alumno: Angelica Olguin Moreno
Nombre del docente: Amalia Maldonado Magaña
Matrícula: ES181001642
Fecha en que se entrega la actividad:30/07/2020

Imagen tomada del buscador Google.

  
Seleccionando el tipo
de bases de datos

Secuencia para buscar

Realizando la búsqueda
Datos de identificacion de la secuencia

Continuacion de la secuencia
Continuacion de la secuencia
Secuencia de
nucleotidos
Formato FASTA
 Create file
Coding sequences

FASTA Nucleotide
Descargando
 Guardado en carpeta

d). Una vez que has realizado y documentado la búsqueda de la secuencia de

nucleótidos es momento de analizar los resultados obtenidos, para lo cual deberás
completar la información de la siguiente tabla.

Nombre del campo Significado Resultado de nuestra búsqueda

LOCUS Es el espacio donde esta NM_001181369 2964 bp mRNA
el gen en el cromosoma, linear PLN 15-MAY-2020
es decir su dirección. O
puede ser nombre de la
secuencia.
DEFINITION Definición del concepto o Saccharomyces cerevisiae S288C 6-
descripción de la phosphofructokinase subunit alpha
secuencia. (PFK1), partial mRNA
ACCESION Identificador único de un NM_001181369
ADN o proteína que
registrar una secuencia,
lo que permite la
existencia de diferentes
versiones. También son
claves externas que
indica una secuencia.
VERSION Numero de versión de la NM_001181369.1
secuencia.
KEYWORDS Palabras clave que RefSeq.
describen la secuencia
SOURGE Nombre del organismo Saccharomyces cerevisiae S288C
ORGANISM Nombre científico del Saccharomyces cerevisiae S288C
organismo. Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota;
 Saccharomycotina; Saccharomycetes;
Saccharomycetales; Saccharomycetaceae;
Saccharomyces.
REFERENCE Notas relacionadas con 1 (bases 1 to 2964)
el tema.
COMMENT Si deseas aportar un REVIEWED REFSEQ: This record has been
comentario, sobre la curated by SGD. This record is
secuencia. derived from an annotated genomic sequence
(NC_001139).

e). En la sección FEATURES encontraras la descripción de las regiones del gen y

las propiedades biológicas que se han identificado en la secuencia de nucleótidos.
De acuerdo con los resultados de la búsqueda completa la siguiente tabla.
Campo Significado Resultado de la búsqueda
Source Nombre del organismo 1..2964
/organism="Saccharomyces cerevisiae
S288C"
/mol_ type="mRNA"
/strain="S288C"
/db_xref="taxon:559292"
/chromosome="VII"
Gene Región cubierta por un <1.>2964
gen /gene="PFK1"
/locus_tag="YGR240C"
/db_xref="GeneID:853155"
CDS Secuencia codificante. 1..2964
/gene="PFK1"
/locus_tag="YGR240C"
/EC_number="2.7.1.11"
/experiment="EXISTENCE: directassay: GO:0005737
cytoplasm
[PMID:11914276|PMID:22842922]"
/experiment="EXISTENCE: direct assay: GO:0005739
mitochondrion [PMID:16962558]"
/experiment="EXISTENCE: direct assay: GO:0005945
6-phosphofructokinase complex
[PMID:4271029|PMID:6231961|
PMID:21241708]"
/experiment="EXISTENCE: direct assay: GO:0006096
glycolytic

Referencia:
Autor desconocido. (Sin determinar). NCBI. 2020, de NCBI Sitio web:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Autor desconocido. (2019). Saccharomyces cerevisiae S288C 6-
phosphofructokinase subunit Alpha (PFK1), partial mRNA. 2020, de CNBI Sitio
web: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001181369.1
Autor desconocido. (Sin determinar). Bases de datos biológicas. 2020, de
Bioinformatics at COMAV Sitio web:
https://bioinf.comav.upv.es/courses/intro_bioinf/bases_datos.html#:~:text=Bases
%20de%20datos%20de%20secuencias,secuencias%20de%20ADN%20o
%20prote%C3%ADnas.&text=Las%20tres%20bases%20de%20datos,encuentra
%20depositada%20la%20misma%20informaci%C3%B3n .
También me ayudó mucho el tutorial que dejo en el foro de dudas docente.