Utilice Power Point para preparar tareas 2 y 3. Todas en un mismo archivo.

Tarea 2

Vaya al siguiente enlace:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001963.6
En esa página encontrará información acerca del factor de crecimiento humano.
Mire la secuencia de la proteína en la sección que dice /translation="MLLTLIILLP.

Note que la proteína empieza con una metionina, MLL. Los últimos tres aminoácidos
son LTQ. Luego viene el codón de terminación que no codifica para ningún
aminoácido.
Regrese al inicio de la página y haga click en el enlace FASTA.

Ahí encontrará la secuencia del ARN mensajero.

Copie toda la secuencia y péguela en la página de Expasy Translate
https://web.expasy.org/translate/ y haga click en Translate!
Recuerde cuando conversamos sobre este tema durante la segunda clase (esta en las
diapositivas). Recuerde que la pagina muestra todas las posibles traducciones a partir
de cada metionina que encuentra, y estas son mostradas en fondo rojo. Mire la
secuencia que empieza y termina con los aminoácidos de la proteína que está indicada
en la primera página que visitó (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001963.6).
a. De todas las secuencias que obtiene en Expasy Translate, copie la imagen de la
secuencia que corresponde exactamente a la secuencia de la proteína correcta.
b. Indique cuantos aminoácidos tiene la proteína. Puede, por ejemplo, pegar la
secuencia de la proteína en un archivo DOC y hacer conteo de letras.
c. Copie la secuencia de la proteína y péguela en la página de
Expasy Compute pI/Mw : https://web.expasy.org/compute_pi/ y seleccione
“Click here to compute pI/Mw” Obtendrá información acerca del punto
isoeléctrico de la proteína (pI) y del peso molecular (Mw). Indique los valores
que obtiene.
Siguiendo con el análisis del factor de crecimiento humano, vaya a la página del
Protein Data Bank https://www.rcsb.org/ y haga una búsqueda para:
“Crystal Structure of Human Epidermal Growth Factor”

Abra el enlace a la proteína (incluirá las siglas 1JL9), y finalmente, debajo de la imagen
de la proteína, haga click en 3D View: Structure

Juegue un poco con la imagen de la proteína, puede cambiar el ángulo sosteniendo la

imagen con el ratón de su computadora.
a. Capture tres imágenes de la proteína desde diferentes ángulos, y preséntelas en
una diapositiva en el mismo archivo Power Point.
b. Indique su opinión personal acerca de esta herramienta para analizar la
estructura 3D de las proteínas.
Tarea 3

Usted tiene un grupo de plantas transgénicas que producen el factor humano:

Granulocyte Macrophage Colony-Stimulating Factor (GM-CSF), factor utilizado en
terapias genéticas. La idea es producirlo en plantas, purificarlo y hacerlo accesible a la
comunidad médica. La secuencia de ADN de abajo es el gen que fue insertado en las
plantas (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_000758.4)
AGTACACAGAGAGAAAGGCTAAAGTTCTCTGGAGGATGTGGCTGCAGAGCCTGCTGCTCTTGGG
CACTGTGGCCTGCAGCATCTCTGCACCCGCCCGCTCGCCCAGCCCCAGCACGCAGCCCTGGGAG
CATGTGAATGCCATCCAGGAGGCCCGGCGTCTCCTGAACCTGAGTAGAGACACTGCTGCTGAGA
TGAATGAAACAGTAGAAGTCATCTCAGAAATGTTTGACCTCCAGGAGCCGACCTGCCTACAGAC
CCGCCTGGAGCTGTACAAGCAGGGCCTGCGGGGCAGCCTCACCAAGCTCAAGGGCCCCTTGACC
ATGATGGCCAGCCACTACAAGCAGCACTGCCCTCCAACCCCGGAAACTTCCTGTGCAACCCAGA
TTATCACCTTTGAAAGTTTCAAAGAGAACCTGAAGGACTTTCTGCTTGTCATCCCCTTTGACTGCT
GGGAGCCAGTCCAGGAGTGAGACCGGCCAGATGAGGCTGGCCAAGCCGGGGAGCTGCTCTCTC
ATGAAACAAGAGCTAGAAACTCAGGATGGTCATCTTGGAGGGACCAAGGGGTGGGCCACAGCC
ATGGTGGGAGTGGCCTGGACCTGCCCTGGGCCACACTGACCCTGATACAGGCATGGCAGAAGAA
TGGGAATATTTTATACTGACAGAAATCAGTAATATTTATATATTTATATTTTTAAAATATTTATTTA
TTTATTTATTTAAGTTCATATTCCATATTTATTCAAGATGTTTTACCGTAATAATTATTATTAAAAAT
ATGCTTCTACTTG

Para asegurar el producto a sus clientes productores, usted decide crear una prueba de
diagnostico usando PCR.
Copie la secuencia de ADN y péguela en la página del NCBI Primer-Blast:

Péguela en donde dice PCR Template y vaya al pie de la página y haga click en
“Get Primers”.
El proceso puede tardar un poco dependiendo de la velocidad de la Internet en su
ciudad.
a. Haga una captura de los resultados e indique el tamaño del producto. Recuerde que
para una PCR se requieren dos primers, uno llamado Forward y el otro Reverse.
b. Usando su imaginación, indique otros proyectos en los cuales usted crea que pueda
aplicar PCR para la producción.