Universidad Abierta y a Distancia de México

Materia: Bioinformática

Unidad 2: Análisis computacional de secuencias de ADN

Actividad 2. BLAST

Alumno: Jesús Antonio Bueno Rojas

Matrícula: ES1521204483

Docente: AMALIA MALDONADO MAGAÑA

Carrera: Ing. Biotecnología

Grupo: BI-BIIN-2001-B1-001

Fecha de entrega: 21/febrero/2020

En México es común encontrar prácticas fraudulentas en la venta de bacalao, pues esta
especie es sustituida por otras especies. En un supermercado se tomó una muestra de
bacalao, se extrajo el ADN de sus mitocondrias y por PCR se obtuvo un fragmento de
aproximadamente 200 pb que fue secuenciado. La secuencia del fragmento muestreado es
la siguiente:

>secuencia desconocida:
ATTGCCCTCTACGTAACATGATCAATTTTAGAATTTGCTTCATGATATATACACTCCGACCCAT
ATCTAAACCGATTCTTCAAATATCTTCTACTATTTCTAGTAGCTATAATTATTCTAGTAACCGCC
AACAACCTATTTCAACTATTTATCGGCTGAGAAGGAGTCGGCATTATATCATTCCTACTAATTG
GGT

Impresiones de pantalla del proceso para hacer el BLAST.

Entrar al sitio web.

Seleccionar la opción de nucleotide BLAST.

Introducir la secuencia del archivo FASTA.

Utilizar los valores que se utilizan por defecto.

Realizar la búsqueda BLAST.

Los resultados muestran que la secuencia pertenece a Pangasianodon hypophthalmus

mitochondrion, complete genome, con un alineamiento de consulta del 100% y un error de 2e -96,
por lo cual se considera que es esta especie de pez la que se vende en el supermercado.
¿Qué es lo que en realidad se vende en el supermercado?
Pangasianodon hypophthalmus (panga), una especie de pez de agua dulce —de color gris y
carne blanca, puede medir hasta 1,5 metros y pesar 40 kilos.

Panga

Bacalao

Fuentes de Información:

NCBI. (2020). BLAST. Nucleotide Sequence. 2020, de NCBI Sitio web:

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_511369194

UnADM. (2020). Unidad 2. Análisis computacional de secuencias ADN. 2020, de UnADM Sitio
web:https://csba.unadmexico.mx/pluginfile.php/2492/mod_label/intro/Unidad2.Analisiscomputacion
aldesecuenciasADN.pdf