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Informe de práctica de campo o laboratorio
Actividad N° 1
Laura Valentina Garzón Benavides 1.
Estudiante del curso de Bioquímica. Programa de
Licenciatura en Ciencias Naturales y Educación
Ambiental. Universidad Surcolombiana. Neiva, Huila,
Colombia.
1
Correo electrónico: u20181166287@universidad.edu.co
Cuestionario
1. Describir las propiedades del agua que explique su tensión de
superficie, viscosidad, estado líquido a temperatura ambiente y poder
solvente.
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Título del informe de la práctica
Respuesta:
Respuesta: ***************
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Nombre de los autores del informe la práctica
Respuesta:
Nombre Símbolo Nombre Símbolo
Con cadenas laterales alfalíticas Con cadenas laterales que
contienen grupos ácidos o sus
amidas
Glicina Gli [G] Acido aspártico Asp [D]
Alanina Ala [A] Asparagina Ans [N]
Valina Val [V] Acido Glu [E]
glutámico
Leucina Leu [L] Glutamina Gln [Q]
Isoleucina Ile [I] Con cadenas que contengan
grupos básicos
Con cadenas laterales que Arginina Arg [R]
contiene grupos hidoxilicos (OH)
Serina Ser [S] Lisina Lis [K]
Treonina Tre [T] Histidina His [H]
Tyrosina Tir [Y] Que contienen anillos
aromáticos
Con cadenas laterales que Histidina His [H]
contiene átomos de azufre
Cisteína Cis [C] Fenilalanina Fen [F]
Metionina Met [M] Tirosina Tir [Y]
Iminoácido Triptófano Trp [W]
Prolina Pro [P]
10.
Describir la contribución de cada tipo de grupo R de los aminoácidos de
proteínas a sus propiedades químicas.
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Título del informe de la práctica
11.
Listar funciones claves adicionales de los aminoácidos y explicar cómo
ciertos aminoácidos en semillas de plantas pueden tener
repercusiones graves sobre la salud humana.
12.
Nombra los grupos ionizables de los aminoácidos de proteínas y listar los
valores de pKа aproximados como aminoácidos libres en solución
acuosa.
Respuesta:
Aminoácido pK
x-carboxilo 3.5 a
4.0
COOH no α de Asp o 4.0 a
Glu 4.8
Imidazol de His 6.5 a
7.4
SH de Cis 8.5 a
9.0
OH de Tir 9.5
10.5
α- amino 8.0 a
9.0
ε- amino de Lis 9.8 a
10.4
Guanidino de Arg ~12.0
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Nombre de los autores del informe la práctica
13.
Calcular el pH de una solución acuosa no amortiguadora de un
aminoácido polifuncional y el cambio de pH que ocurre después de la
adición de una cantidad de ácido o álcali fuerte.
Respuesta:
14.
Definir el pI y explicar su relación con la carga neta en un electrolito
polifuncional.
15.
Explicar cómo el pH, la pK y el pI pueden usarse para predecir la
movilidad polielectrolito, como un aminoácido en un campo eléctrico
de corriente continua.
16.
Describir la direccionalidad, nomenclatura y escritura primaria de los
péptidos
17.
Describir las consecuencias conformaciones del carácter de doble enlace
peptídico e identificar los enlaces en el esqueleto peptídico que están
libes para rotar.
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Título del informe de la práctica
18.
Describir múltiples métodos de cromatografía empleados para el
aislamiento de proteínas a partir de materiales biológicos.
19.
Explicar cómo los científicos analizan la secuencia de una proteína o la
estructura de la misma para extraer información acerca de su posible
función fisiológica.
20.
Listar varias de las alteraciones protraduccionales por las que pasan las
proteínas durante su lapso de vida y la influencia de estas
modificaciones sobre la función.
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Nombre de los autores del informe la práctica
21.
Describir la base química del método de Edman para determinar la
estructura primaria.
22.
Dar razones por las cuales la espectrometría de masas ha suplantado en
su mayor parte a los métodos químicos.
23.
Explicar por qué la MS permite detectar modificaciones
postraduccionales que no se detectan mediante la secuenciación de
Edman o secuenciación de DNA.
24.
Describir cómo la clonación de DNA y la biología molecular hicieron
mucho más rápida y eficiente la determinación de las estructuras
primarias de las proteínas.
25.
Explicar qué significa “el proteoma” y citar ejemplos de su importancia
potencial final.
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Título del informe de la práctica
26.
Comentar las contribuciones de la genómica, los algoritmos de
computadora y las bases de datos a la identificación de los marcos de
lectura abierta (oRF) que codifican para una proteína dada.
27.
Indicar las ventajas y desventajas de varios métodos para clasificar las
proteínas.
28.
Explicar las estructuras primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria de
proteínas, e ilustrarlas.
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Nombre de los autores del informe la práctica
29.
Identificar los principales tipos reconocidos de estructura secundaria, y
explicar los motivos supersecundarios.
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Título del informe de la práctica
30.
Describir la clase y las potencias relativas de las fuerzas que estabilizan
cada orden de estructura de proteína
31.
Describir la información resumida por medio de un gráfico de
Ramachandran
Respuesta:
32.
Indicar el estado actual del conocimiento respecto al proceso por pasos
mediante el cual se cree que las proteínas alcanzan su conformación
natural.
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Nombre de los autores del informe la práctica
33.
Identificar los papeles fisiológicos en la maduración de proteína de los
chaperones, la proteína disulfuro isomerasa, y la peptidilprolina cis-
trans-isomerasa.
Respuesta: las proteínas que ayudan al plegado comprenden la
proteína disulfuro isomerasa, prolina-cis, trans-isomerasa y los
chaperones que participan en el plegado de más de la mitad de las
proteínas de mamífero. Los chaperones protegen contra solvente a los
polipéptidos recién sintetizados, además de que proporcionan un
ambiente para que elementos de la estructura secundaria surjan y
muestren coalescencia para formar glóbulos fundidos.
La disulfuro isomerasa de proteína, facilita la formación de enlaces
disulfuro y estabiliza la conformación natural de una proteína.
34.
Describir las principales técnicas biofísicas que se usan para estudiar las
estructuras terciaria y cuaternaria de proteínas.
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Título del informe de la práctica
35.
Explicar cómo los trastornos genéticos y nutricionales de la maduración
del colágeno ilustran el enlace estrecho entre la estructura de
proteína y la función de la misma.
36.
Para las enfermedades por prion, esbozar los eventos generales en su
patología molecular, y nombrar las formas de vida que afecta cada
una.
37.
Describir las similitudes y diferencias estructurales más importantes
entre la mioglobina y la hemoglobina.
Respuesta: la mioglobina es monomérica; la hemoglobina es un
tetrámero de dos tipos de subunidad (α2 β2 en la HbA). Pese a tener
estructuras primarias diferentes, la mioglobina y las subunidades de
la hemoglobina tienen estructuras secundaria y terciaria casi
idénticas
38.
Dibujar curvas de unión para la oxigenación de mioglobina y
hemoglobina.
Respuesta:
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Nombre de los autores del informe la práctica
39.
Identificar los enlaces covalentes y otras asociaciones estrechas entre el
hem y la globina en la oximioglobina y la oxihemoglobina.
40.
Explicar por qué la función fisiológica de la hemoglobina requiere que su
curva de unión a O2 sea sigmoidea más que hiperbólica.
41.
Explicar el papel de un ambiente obstaculizado sobre la capacidad de la
hemoglobina para unirse a monóxido de carbono.
Respuesta: *****************
42.
Definir la P50 e indicar su importancia en el transporte de oxígeno y el
aporte del mismo.
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Título del informe de la práctica
43.
Describir los cambios estructurales y conformacionales en la
hemoglobina que acompañan su oxigenación y su desoxigenación
subsiguiente.
44.
Explicar la función del 2,3-difosfoglicerato (BPG) en la unión a oxígeno y
el aporte de este último.
45.
Esbozar la implicación de la hemoglobina en el transporte de CO2 y
protón, y describir los cambios acompañantes de la pKa del grupo
imidazolio importante.
46.
Describir las consecuencias estructurales para la HbS de la disminución
de la pO2.
47.
Identificar el defecto metabólico que ocurre como consecuencia de
talasemias α y β.
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Nombre de los autores del informe la práctica
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Título del informe de la práctica
Mapa conceptual
Diagrama Cap 3
Diagrama Cap 4 y 5
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Nombre de los autores del informe la práctica
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Título del informe de la práctica
Referencias
Rodwell, V. W., Bender, D. A., Botham, K. M., Kennelly, P. J., & Weil, A.
(2015). Harper Bioquimica Ilustrada 30a Edicion. China: McGraw-Hill
Global Education Holdings, LLC.
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