Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
INSTITUTO DE BIOTECNOLOGIA
TABLA DE CONTENIDO
INTRODUCCION
1. Historia y Evolucin de las Tcnicas de Preservacin
2. Coleccin de Cultivos
2.1 Historia
2.2 Importancia
2.3 Funciones
2.3.1 Propsito de la Coleccin
2.3.2 Preservacin
2.3.3 Distribucin
2.3.4 Identificacin
2.3.5 Publicaciones
2.4 Tipos de Colecciones
2.4.1 Especializadas
2.4.2 Referencia
2.4.3 Nacionales
2.5 Principales Colecciones del Mundo
2.6 Formato Modelo del IBUN
3. Parmetros para la Seleccin de Mtodos de Preservacin
4. Mtodos de preservacin
4.1 Mtodos a Corto Plazo
4.1.1.Subcultivo
4.1.2. Congelacin Ordinaria
4.1.3. Baja Congelacin 70C
4.1.5 Secado
4.1.5.1 Suelo, Arena
4.1.5.2 Tiras Discos de Papel Filtro
4.1.5.3 Tapones Presecados
4.1.5.4 Discos de Gelatina
4.1.5.5 Silica Gel
4.1.5.6 Perlas de Vidrio Porcelana Porosas
4.2 Mtodos a Largo Plazo
4.2.1 Liofilizacin
4.2.1.1 Equipos
4.2.1.2 Etapas del proceso de Liofilizacin
4.2.1.3 Efectos de la Liofilizacin
4.2.2 Almacenamiento en Nitrgeno Lquido
4.2.2.1 Naturaleza del Criodao
4.2.2.2 Agentes Crioprotectores
5. Parmetros para la Evaluacin de los Mtodos de Preservacin
5.1 Caractersticas de los cultivos a ser evaluadas
___________________________________________________________ 2
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
INTRODUCCION
___________________________________________________________ 3
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Muchas sustancias han sido utilizadas como agentes crioprotectores que reducen
el dao celular durante la congelacin-descongelacin,entre los ms utilizados
___________________________________________________________ 4
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
tenemos: Glicerol (Polge et al., 1949), cido glutmico (Miller and Goodner, 1953),
dimetil sulfxido (lovelock and Bishop, 1959), glucosa, sacarosa y lactosa. Estos
aditivos son sustancias que controlan eficientemente la velocidad de congelacin
de las clulas y adicionalmente son permeables a la membrana celular, razn por
la cual su efecto protector se incrementa.
El trmino L-secado, fue utilizado por Annear (1958), este mtodo permite
reducir significativamente el tiempo de secado, economizar y disminuir labores,
en especial cuando se trabajo con un nmero significativo de muestras
simultneamente. Este mtodo fue investigado y puesto en prctica por Iijima and
Sakane (1970)y ampliamente utilizado para la conservacin de bacterias, hongos,
levaduras, actinomycetes y bacterifagos.
Hamada (1982) cubri la superficie del cultivo de actinomycetos con parafina y
congel a -20C.
___________________________________________________________ 5
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
2. COLECCIONES DE CULTIVOS
2. 1 Historia
* Cepa que sirve como base para describir el nombre de la especie subespecie.
___________________________________________________________ 6
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Los principales argumentos para constituir una coleccin de cultivos son: (Hunter
et al ., 1986)
En 1990 The World federation for Culture Collections (WFCC) public Guidelines
for the Establishment and Operation of Collections of Cultures of Microorganisms,
el cual proporciona la informacin de los principios de organizacin y operacin
de una coleccin y sugiere requerimientos mnimos en recursos y manejos.
Todas las colecciones representan una alta inversin de tiempo y dinero, por lo
tanto el establecimiento y mantenimiento de una coleccin de cultivos, no debe
ser algo trivial y por el contrario debe representar un adecuado planteamiento y
estimacin real de los recursos requeridos . Las principales funciones de las
colecciones de cultivos son: (Stevenson, R and Hatt, H 1992)
2.3.1Propsito de la Coleccin.
La coleccin de material biolgico depende del inters por el cual, esta va a ser
utilizada, por lo tanto las colecciones deben ser creadas con base en la seleccin
ordenada de criterios reconocidos de significancia cientfica.
Es importante que toda coleccin establezca un sistema de registro de datos, con
relacin a la historia, informacin de la fuente de aislamiento, publicaciones,
condiciones de almacenamiento y manipulacin.
2.3.2 Preservacin
___________________________________________________________ 7
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Cultivo Inicial
Stock Semilla
2.3.3 Distribucin
___________________________________________________________ 8
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
que los recipientes cumplan con los requisitos y recomendaciones, que aseguren
la ausencia de riesgo para la salud, con la manipulacin y el uso de agentes
infecciosos. En la Tabla 1, se clasifican los microorganismos con relacin al tipo
de riesgo y recomendaciones en cuanto al envo.
___________________________________________________________ 9
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 10
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
2.3.4 Identificacin
Los catlogos deben consistir en una lista de los nombres de los cultivos que
estn preservados, tambin incluye informacin: fecha, lugar y detalles del origen
del material, bibliografa bsica de citacin y una historia de posesin y
procedencia del cultivo.
Otros catlogos incluyen la lista de los cultivos organizadas en relacin a sus
aplicaciones, propiedades similares tales como: thermofilicos, enzimas de
restriccin etc.
The World Data Center for Microorganisms, publica una combinacin de catlogos
y directorios donde se encuentra una lista de los microorganismos y lneas
celulares que son preservadas y las colecciones donde estn disponibles.
(Stevenson, R and Hatt, H 1992)
En 1949 The United States Patent and Trademark Office , estipul que los cultivos
a ser patentables ,deben ser depositados en conjunto con las aplicaciones de la
patente, concerniente a la invencin microbiolgica. Las leyes en los E.U, con
relacin a los cultivos a ser patentables, establecen que estos deben ser
almacenados en una coleccin, por lo menos el tiempo de vida de la patente 17
aos, lo cual provee de un deposito neutral, seguridad en el mantenimiento y
distribucin de cultivos involucrados en los procesos de patentes y evita ilcitas
experimentaciones. (Kurtzman , C.P 1992).
2.4 Tipos de Colecciones de Cultivos
___________________________________________________________ 11
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Bacterial Plant Phathogen Collection of the Late Mortimer Starr at the University of
California at Davis.
Collection of Microorganisms
National Center for Agricultural Utilization Research
1815N. University St., Peoria, Il61604-3999
___________________________________________________________ 12
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 13
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 14
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
IDENTIFICACIN: Cdigo
ORIGEN:
CARACTERISTICAS:
Macroscpicas:
Microscpicas:
Bioqumicas:
Fisiolgicas:
Genticas:
___________________________________________________________ 15
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
VIABILIDAD:
___________________________________________________________ 16
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 17
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
4. METODOS DE PRESERVACION
1. Subcultivo
2. Inmersin en Aceite
3. Congelacin Ordinaria -20C
4. Baja Congelacin -70C
5. Secado
Suelo O Arena
Papel De Filtro
Tapones Presecados
Gelatina
Silica Gel
Perlas De Vidrio Y Porcelana
1. LIOFILIZACION
2. ULTRACONGELACION
___________________________________________________________ 18
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Gentica
Material Labor
Transferencia Peridica
Almacenamiento a Baja Alto 1-6 meses Variable
temperatura ambiente Media Alto 6 -12 variable
Baja Bajo/Medio meses Pobre
Almacenamiento en el
Baja Bajo/Medio 1 -40 aos Moderada
refrigerador Media Bajo/Medio 1- 5 aos Moderada
Almacenamiento en aceite 4 - 5 aos
Almacenamiento en agua
Almacenamiento en
congelacin
Secado
Suelo Baja Medio 5 - 25 aos Moderada a baja
Silica gel Baja medio 5 - 19 aos Buena
Liofilizacin Alta Inicialmente 4 - 40 aos Buena
Media
Congelacin
Nitrgeno Lquido Alto Baja Infinita Buena: 23 aos
___________________________________________________________ 19
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Esta lista son aproximaciones y existe variacin entre las especies de un mismo gnero
___________________________________________________________ 20
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 21
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Ventajas Desventajas
Poco costo en trminos de equipo Costo en cuanto al personal necesario
para realizar los subcultivos
Fcilmente recuperables, cuando son Alto riesgo de contaminacin por
cultivos que se requieren con alta subcultivo
frecuencia
Alto riesgo de mutacin
Alto riesgo de seleccin en la
poblacin y prdida de caractersticas
Aplicable a un amplio rango de Se requiere de un espacio amplio para
microorganismos el almacenamiento.
No es un mtodo recomendable para
el suministro, por que las condiciones
de envo pueden resultar adversas.
___________________________________________________________ 22
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 23
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Ventajas Desventajas
Utilizado para una amplia variedad de Costo de equipo
bacterias
Metodologa rpida y fcil, no requiere No es utilizado cuando las muestras
subsecuente manipulacin, durante el se requieren con mucha frecuencia
almacenamiento
Espacio mnimo
Utilizado para la preservacin de
microorganismos por periodos
prolongados de tiempo
___________________________________________________________ 24
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Varios materiales como almidn, peptona y dextran han sido utilizados para hacer
tapones presecados, ???sobre los cuales son goteadas suspensin de
organismos antes de ser secados y almacenados en condiciones de vaco. Este
mtodo ha sido exitosamente utilizado para bacterias que difcilmente pueden ser
almacenadas por liofilizacin tales como Neisseria gonorrheae y Vibrio cholerae
(Annear 1956, Malik Cap 4,10)
Ventajas Desventajas
Riesgo de contaminacin menor si se La estabilidad depende del tipo de
___________________________________________________________ 25
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
4.2.1 Liofilizacin:
___________________________________________________________ 26
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
4.2.1.1 Equipo
___________________________________________________________ 27
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
proceso. Para este fin dividiremos en 5 las etapas que trataremos con particular
atencin en nuestro trabajo.
Cada una de estas etapas conlleva estrs para la bacteria, por lo que es
necesario desarrollar una metodologa que disminuya el riesgo de prdida del
cultivo
Soporte de liofilizacin. Una vez listos los viales, preparamos el soporte sobre
el cual dispensaremos nuestra suspensin celular se recomienda adicionar a los
viales 1 mL de leche descremada estril al 20%, Luego se congelan a 70C y
se liofilizan por un lapso no superior a 3-4 horas. Al final de este proceso ya
tendremos listo nuestro soporte de leche, sobre el cual se va a adicionar la
suspensin celular. La preparacin de este soporte de leche es recomendada
___________________________________________________________ 28
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 29
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Azotobacter 72 Nocardia 96 o ms
Azomonas 72 Pediococcus 24
Bacillus 96 Propionibacterium 24-72
Bacteroides 48 Proteus 24
Bifidobacterium 24 Pseudomonas 24
Brevibacterium 72 Serratia 24
Cellulomonas 24-48 Sporosarcina 24
Chromobacterium 24 Staphylococcus 18
___________________________________________________________ 30
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 31
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Durante esta fase, el agua es removida del producto congelado por sublimacin,
por lo tanto es necesario un medio ambiente que permita que las molculas de
agua migren desde el producto congelado, esto se acompaa por evacuacin del
rea alrededor del producto, para remover molculas competitivas y dar libre
flujo al vapor de agua, de ah que, la bomba de vaco es un componente esencial
del sistema de liofilizacin. Una trampa de humedad o condensador, colecta las
molculas de agua antes de que estas entren al sistema de la bomba de vaco,
este condensador, es una superficie de metal congelado, sobre la cual las
molculas de agua pueden colectarse. La temperatura de este condensador debe
ser ms baja que la temperatura del producto, para permitir la migracin de las
molculas de agua desde el producto. La tasa de sublimacin depende de la
diferencia en la presin de vapor entre el producto y el condensador (Gherna,R.
1991)
___________________________________________________________ 32
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
cromatografa de gases, cabe aclarar que los anlisis de humedad residual son
destructivos para el producto(Gherna,R 1991).
Reconstitucin de los viales. Los viales son desinfectados con alcohol al 70%,
se flamean los bordes con cuidado y se recomienda manejar los viales en cabina
de flujo laminar. Escoger un buen medio de reconstitucin para los
microorganismos, es tambin un paso fundamental, para garantizar el xito de la
tcnica, puede usarse un caldo enriquecido como el BHI, o una solucin al 24%
de un carbohidrato de eleccin, con el fin de brindar a la clula las condiciones
necesarias para el crecimiento. Khyrsheed A. Malik 1987 resaltan la importancia
de que no transcurra ms de un minuto entre la apertura del vial y la adicin de la
solucin de rehidratacin, as como el permitir que dicho proceso se lleve a cabo
en incubacin por lo menos por media hora, antes de realizar la siembra en placa
o caldo para que la clula realice su proceso de adaptacin al medio. El liofilizado
se rehidrata adicionando el caldo o la solucin elegida, con una jeringa estril,
puede adicionarse 0.3-.04 mL en cada vial, mezclar bien para disolver el pellet
completamente, volver a usar la jeringa para transferir .02 mL del cultivo
rehidratado a una placa de agar o un medio semislido de la misma composicin.
Si se trata de bacterias patgenas, los viales deben abrirse nicamente en cabina
de seguridad. Los cultivos liofilizados frecuentemente exhiben un prolongado
periodo de adaptacin y debe incubarse por periodos extendidos antes de
considerar no viable el cultivo.
___________________________________________________________ 33
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 34
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
vial implica nuevos factores incidentes sobre la viabilidad celular, por lo tanto es
importante realizar este paso rpidamente en un caldo de enriquecimiento o
solucin adecuada.
Ventajas de la Liofilizacin
Este mtodo es ampliamente utilizado para la conservacin de bacterias, hongos,
levaduras y algunos virus, con menos eficiencia aplicable para la conservacin de
algas, protozoos, clulas animales y de plantas.
La liofilizacin se constituye en uno de los ms econmicos y efectivos mtodos
de preservacin a largo plazo para bacterias y otros microorganismos. Muchas
especies bacterianas diversas fisiolgicamente y algunos bacterifagos, han sido
exitosamente preservados por esta tcnica, y permanecen viables por cerca de
50 aos. El mtodo facilita la elaboracin de un gran nmero de viales
simultneamente, y el pequeo tamao de los viales facilita el almacenamiento
(Gherna,R 1992).
Adems, este mtodo minimiza los problemas de riesgo de contaminacin y
seleccin de poblacin obtenidos con otros mtodos de preservacin. Aunque el
equipo, en principio es costoso, posteriormente vemos que gracias a los largos
periodos de preservacin que no ofrece, los gastos de manipulacin en cuanto a
medios de cultivo, mantenimiento y personal disminuyen en un gran porcentaje el
costo total del procedimiento.
Ventajas Desventajas
Utilizado para el suministro de cultivos Elevado costo de equipos
Mantenimiento de la viabilidad por El proceso es laborioso
periodos prolongados de tiempo(> 50
aos)
Baja periodicidad en relacin al En general la estabilidad de las
___________________________________________________________ 35
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Ventajas Desventajas
Longevilidad y Estabilidad de los Seleccin en la poblacin
cultivos son mayor que con el de
liofilizacin.
Durante el almacenamiento se El nitrgeno lquido se evapora y
considera que no hay prdida de puede haber disminucin
material biolgico interrupcin de este, lo cual ocasiona
la prdida de colecciones enteras
El proceso es poco laborioso y una Costo del equipo es alto
vez conservada la cepa la
manipulacin es poca.
Estabilidad y viabilidad por periodos Riesgo de explosin del vial
prolongados >23 aos
No es recomendable para la
distribucin de cultivos
___________________________________________________________ 36
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
75
descongelacin rpida
%
Supervivencia
___________________________________________________________ 37
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
50
descongelacin lenta
25
___________________________________________________________ 38
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 39
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 40
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Caractersticas Recombinantes:
Plasmidos: Determinar la presencia ausencia del plasmido, la forma ms
segura de establecer la estabilidad del plsmido, es por secuenciacin, sin
embargo esta tcnica dado el costo no se realiza de rutina, sin embargo
tcnicas como aislamiento del plasmido, digestin con enzimas de restriccin,
puede ser realizada de rutina, utilizando una muestra del plasmido como
control. La evaluacin de la presencia ausencia de plasmido debe realizarse
en forma peridica de manera que se pueda determinar si el plasmido est o
no integrado al cromosoma y que esta en la localizacin correcta. Tambin
pueden ser utilizadas en combinacin pruebas de resistencia a antibiticos y
la capacidad de fermentar algunos carbohidratos como la glucosa.
___________________________________________________________ 41
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
BIBLIOGRAFIA
___________________________________________________________ 42
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
H.J.Phaff. (1981) Scientific American 245, 52-65 . In H.C Jennie and B. Angela.
Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1 de.Acedemic Press, San
Diego, California ,1996, p 22-23.
Hammer, B.W. (1911). J. Med. Res. 24, 527-530. In H.C Jennie and B. Angela.
Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1 de.Acedemic Press, San
Diego, California ,1996, p 17.
___________________________________________________________ 43
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Fry , R.M., and Greaves, R. I. N. (1951). J. Hyg. 49, 220-246. In H.C Jennie and
B. Angela. Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1 de.Acedemic
Press, San Diego, California ,1996, p 24.
Polge et al., (1949). Nature (London) 164.666. In H.C Jennie and B. Angela.
Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1 de.Acedemic Press, San
Diego, California ,1996, p 24.
Miller, R., Jr., and Goodner, K. (1953). Yale J. Biol.Med. 25, 262. In H.C Jennie
and B. Angela. Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1
de.Acedemic Press, San Diego, California ,1996, p 24.
Lovelock, L. E., and Bishop, M.W.H. (1959). Nature (London) 183, 1394-1395. In
H.C Jennie and B. Angela. Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry.
1 de.Acedemic Press, San Diego, California ,1996, p 24.
Annear, D.I.(1958). Aust. J. Exp. Biol. 36, 211-222. In H.C Jennie and B. Angela.
Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1 de.Acedemic Press, San
Diego, California ,1996, p 24.
Iijima, T., and Sakane, K.(1970). Jnp J. Freezing Drying 16, 87-91. In H.C Jennie
and B. Angela. Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1
de.Acedemic Press, San Diego, California ,1996, p 24.
Hamada, M. (1982). Jnp J. Freezing Drying 28, 63-67. In H.C Jennie and B.
Angela. Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1 de.Acedemic
Press, San Diego, California ,1996, p 24.
Hunter, J.C., Belt, A., and Halluin, A.P. (1986). Guidelines for Establishing a
Culture Collection within a Biotechnology Company. Trends Biotechnol. 4, 5-6. In
H.C Jennie and B. Angela. Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry.
1 de.Acedemic Press, San Diego, California ,1996, p 2.
___________________________________________________________ 44
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Altlkinson, R. G. (1954). Can. J. Bot. 32, 673 - 678. In Kirsop and Doyle A.
Maintenance of Microorganisms and Cultred Cells. A Manual of Laboratory
Methods. 2de. Academic Press. London. p.24
Coe, A. W. and Clark, S.P. (1966) . Mon.Bull. Minist. Hlth. 25, 97 -100. In Kirsop
and Doyle A. Maintenance of Microorganisms and Cultred Cells. A Manual of
Laboratory Methods. 2de. Academic Press. London. p 24.
Annear, D. I. (1956) . J. Hyg., Camb. 54, 487 - 508. In Kirsop and Doyle A.
Maintenance of Microorganisms and Cultred Cells. A Manual of Laboratory
Methods. 2de. Academic Press. London. 24
___________________________________________________________ 45
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
Clark, W. A., Horneland, W., and Klein, A. G. (1962) attempts to Freeze some
Bacteriophages at Ultralow Temperatures. App. Microbiol. 10, 463-465. In H.C
Jennie and B. Angela. 1996Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry.
1 de.Acedemic Press, San Diego, California .p256.
Clark , W. A., and Klein, A. (1966) The Stability of Bacteriophages in Long Term
Storage at Liquid Nitrogen Temperatures. Crybiology 3, 68-75. In H.C Jennie
and B. Angela. 1996Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry. 1
de.Acedemic Press, San Diego, California .p 256.
ANDREW, J and RUSSEL, H. The survival of Injured Microbes. The Society for
Applies Bacteriology Symposium seeries No 12. Academic Press London. Pg 45-
69
CASTRO, H. Evidence of Membrane Damage in Lactobacillus bulgaricus
Following Freeze Drying. Journal Applied of Microbiology. 1997. Vol 28 pg 87
94
___________________________________________________________ 46
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 47
.
Instituto de Biotecnologia. Universidad Nacional de Colombia
___________________________________________________________ 48
.