Metabolismo Microbiano

El metabolismo se refiere a la suma de

reacciones bioqumicas requeridas para
la generacin de energa y el uso de la
energa para sintetizar material celular a
partir de molculas del medio ambiente.
El metabolismo se divide en:

Catabolismo. Reacciones de
generacin de energa.

Anabolismo. Reacciones de sntesis que
requieren de energa.

Las reacciones catablicas producen

energa como ATP, el cual es utilizado en
las reacciones anablicas para sintetizar
el material celular a partir de nutrientes.
Metabolismo
Catabolismo Anabolismo
Generacin de energa Reacciones biosintticas

Fuente de Nutrientes
energa

Precursores intracelulares
ATP

Intermediarios biosintticos

ADP Biopolmeros

Productos
metablicos Estructuras
Enzimas
Sustrato Productos

Enzima Complejo Enzima

Enzima-Sustrato

Catalizadores biolgicos de
naturaleza proteca. Reducen
la energa de activacin de
una reaccin qumica. Son
especficos para un sustrato.
Grupo prosttico

Son molculas no proteicas (orgnicas o inorgnicas), que se

encuentran unidos a la protena y a diferencia de las
coenzimas no se disocian despus de que se cataliza la
reaccin. Ejemplo: el grupo prosttico con ncleo de Fe de
los citocromos.
Cofactores y coenzimas

Apoenzima Cofactor o Holoenzima

(porcin proteica) coenzima (toda la enzima)

Molculas no protecas que pueden ser orgnicas o

inorgnicas, se unen a la enzima y dan afinidad al sustrato
con la enzima para catalizar la reaccin.
Cofactores
Sustrato

Cofactor

Enzima

Algunas enzimas requieren cofactores:

Alcohol deshidrogenasa -Zn2+

Ureasa -Ni2+

Nitrogenasa -Mo

Purivato cinasa -K+ y Mg2+
Coenzimas
Las coenzimas tienen una unin dbil con la enzima.

Coenzimas de oxido-reduccin: NAD, NADP, FAD, FMN.

Otras coenzimas: CoA, Vitaminas.

Sustrato
oxidado Sustrato
reducido
Coenzima Coenzima
reducida oxidada

Enzima
NAD NADH

Nicotinamida Adenina Di-nucletido (NAD), es la principal

coenzima de xido-reduccin.
Enzimas
Clase Tipo de reaccin que Ejemplos
cataliza
Oxidoreductasa Oxido-reduccin, donde oxgeno Citocromo oxidasa.
e hidrgeno son ganados o Lactato deshidrogenasa.
perdidos.
Transferasa Transferencia de grupos Acetato cinasa.
funcionales (amino, acetilo, Alanina desaminasa.
fosfato)
Hidrolasa Hidrlisis (adicin de agua) Lipasa.
Sucrasa.
Liasa Remocin de grupos de tomos Oxalato descarboxilasa.
sin hidrlisis. Isocitrato liasa.
Isomerasa Rearreglo de tomos dentro de Glucosa fosfato
una molcula. isomerasa.
Alanina racemasa.
Ligasa Unin de dos molculas Acetil Co A sintetasa
(empleando energa Ligasa.
usualmente derivada del
rompimiento de ATP.
Actividad enzimtica
Una enzima, por s misma,
no puede llevar a cabo
E + S ES E + P una reaccin, su funcin
es modificar la velocidad
de la reaccin. La
actividad enzimtica es la
cantidad de producto
formado por unidad de
tiempo.
La actividad de una
enzima es modificada por
factores que afectan a las
protenas, por ejemplo: la
temperatura.
Modificacin de Actividad de la
enzima

la actividad
enzimtica pH

El pH que al influir sobre las cargas Actividad de la

enzima
elctricas, podr alterar la estructura
del centro activo y, por lo tanto,
tambin influir sobre la actividad
enzimtica. Temperatura

La temperatura elevada

desnaturaliza las molculas
Actividad de la
proteicas por lo que los sitios activos enzima
se ven modificados.

La enzima se satura a cierta
Concentracin
concentracin del sustrato. del sustrato
 A

Sitio
activo
Sustrato
Inhibidores
Enzima
enzimticos
Sitio
alostrico
A) El sustrato se une a la enzima
B Sustrato en el sitio activo.
Sustrato B) Un inhibidor competitivo se
2
une a la enzima en el sitio
Inhibidor
Enzima competitivo activo, impidiendo la
entrada y unin del sustrato.
C) Un inhibidor alostrico
C
modifica la afinidad de la
Sustrato enzima por el sustrato, al
unirse en un sitio distinto (sitio
Efector alostrico)al sitio activo.
alostrico Enzima
Regulacin
Sustrato
de vas Enzima 1 Producto final

metablicas
Intermediario 1

Enzima 2
Inhibicin por
Regulacin de una retro-
alimentacin
va metablica Intermediario 2
mediante inhibicin
enzimtica por Enzima 3

producto final.
Intermediario 3

Enzima 4

Producto final
Regulacin de la expresin y
sntesis de las enzimas
Nivel transcripcional

Procesos de induccin y
represin.

Atenuacin y procesamiento
del ARNm.

Nivel traduccional

Regulacin de la sntesis de las

protenas ribosmicas.

Inhibicin de la sntesis de
protenas.
ATP

Compuesto de alta
energa, se produce
por fosforilacin a
nivel de sustrato,
cadena respiratoria y
fotofosforilacin.
 Oxidacin-reduccin
Par redox
oxidado/reducido

Donador de electrones
H2 2e- + 2H+
Aceptor de electrones
O2 + 2e- O2-
Formacin de agua
2H+ + O2- H2O
Reaccin total
H2 + O2 H2O
 Microorganismos

Fuente de energa
Clasificacin
Oxido-reduccin Luz
Quimitrofas Fottrofas

Compuestos orgnicos
Fuente de carbono
Quimiohetertrofos

Compuestos orgnicos
Fuente de carbono
Fotohetertrofos

Compuestos orgnicos CO2

Quimiohetertrofos Fotoauttrofos

CO2

Compuestos inorgnicos
Quimiolittrofos

Fuente de carbono

Compuestos Orgnicos
Mixtrofos

CO2
Litoauttrofos
Quimiohetertrofos
La clula oxida molculas
orgnicas para producir la
energa (catabolismo) y
luego usa la energa de
sintetizar el material celular
de estas molculas
orgnicas (anabolismo).
Todos los hongos y los
protozoarios son
hetertrofos, muchas
bacterias, pero solo algunas
aqueobacterias. El
metabolismo heterotrfico
conduce a dos procesos:
fermentacin y respiracin.
 Metabolismo central
Las vas del
ATP ATP metabolismo central:
NADPH
Glucosa Glucosa 6P Gluconato 6P Gluconato Gluclisis (Embden-
Meyerhof-Parnas
Fructosa 6P Pentosas P CO2, EMP), de las Pentosas
NADPH
ATP
ATP fosfato y Entner-
Fructosa 1,6 biP Doudoroff proveen de
Gluclisis Pentosa
precursores
Entner
Gliceraldehdo P Doudoroff metablicos para
ATP, NADH
otras vas, son las vas
Fosfoenolpiruvato para el metabolismo
ATP de carbohidratos y
Piruvato
cidos carboxlicos.
NADPH, CO2 Las tres vas convierten por diferentes rutas
Acetil CoA la glucosa en gliceraldehdo, que es
oxidado por la misma reaccin para
formar piruvato.
 Gluclisis
La va de la gluclisis
(Embden-Meyerhof-
Parnas EMP), se encuentra
en todos los eucariotes y
en muchas especies de
bacterias.

En la primera etapa hay

gasto de 2 molculas de
ATP por molcula de
glucosa.

En la segunda parte se
forman 4 molculas de
ATP por fosforilacin a
nivel de sustrato y 2 de
NADH.
 Ciclo de las
pentosas
fosfato
Importancia:
Produce los precursores de la
ribosa, desoxirribosa en los
cidos nucleicos y provee de
eritrosa fosfato como
precursor de aminocidos
aromticos.
Se produce en est va,
NADPH, la mayor fuente de
electrones de la biosntesis y
varias de sus reacciones las
comparte con el ciclo de
Calvn.
Va Entner-Doudoroff
Muchos tipos de bacterias no
poseen la enzima
fosfofructocinasa-1 y no pueden
convertir la glucosa-6P a
Fructosa 1,6-bifosfato.

Una va alterna es Entner-

Duodoroff, en la cual la glucosa
6P es convertida a piruvato y
Gliceraldehdo-3-fosfato por la
desidratacin poco usual del
6-fosfogluconato para formar
2-ceto-3-desoxi-6-fosfogluconato
(KDPG).
 Fosforilacin a Compuesto orgnico
(reducido)

nivel de sustrato Intermediario A

NAD+
El sustrato orgnico (donador de Pi

e-) pasa por una ruta catablica NADH

(ej., la gluclisis), y uno de los Intermediario B P

intermediarios de esa ruta es

Acarreador
oxidado por un coenzima, se electrnico
origina un intermediario no Intermediario C P

fosforilado con una gran energa ADP

de hidrlisis. El intermediario ATP

experimenta enseguida una

Intermediario D
sustitucin con un fosfato, para dar (oxidado)
la correspondiente forma acil- NADH

fosfato (enlace de alta energa). NAD+

Este acil-fosfato dona su fosfato de Producto final
alta energa al ADP, que pasa a (reducido)

ATP.
 + cido
Acido lctico +2H cido pirvico pirvico Acido
-acetolctico
Fermentacin Streptococcus ATP
-CO2
-CO2
Lactobacillus
Staphylococcus H2

Se realiza en ADP
Acetoina

condiciones +CO2
CO2 +2H
anaerbicas. Acido oxaloactico
2,3-butanediol

Emplea como +2H
Shigella Klebsiella
aceptor de Acido mlico
cido frmico
Acetil-S-CoA Enterobacter
Bacillus
electrones a una -H2O +4H
+2H -CoA-SH
molcula -CoA-SH
Acido succinico Etanol
orgnica. CO2 H2
-CO2 Acido
+Acetil S-CoA

Utiliza el NADH E. coli Actico
-CoA-SH
Acido propionico Salmonella
producido en la Clostridium

gluclisis. Bifidobacterium Acetoacetil-S-CoA

Propionibacterium

Se conserva la Acetona -CO2 +4H Butiril-S-CoA
-CoA-SH
energa de la +4H
+2H -CoA-SH
fosforilacin a nivel
de sustrato (FNS). Isopropanol cido Butirico Butanol
 Etanol
Malta Ceveza (Saccharomyces cerevisiae)
Frutas Vino (Saccharomyces ellipsoideus)
Desechos de la agricultura combustible (S. cerevisiae)
Fermentaciones tradicionales
indgenas de Mxico
Las fermentaciones tradicionales indgenas de Mxico ms
conocidas son: pozol, tesgino, tejuino, tepache, tibicos, pulque,
tuba, colonche, entre otras.

Tepache Pozol Colonche

Pulque Tejuino
Acido actico
Etanol Acido actico (Acetobacter aceti)

Madre de vinagre: consorcio

formado por una levadura y una
bacteria.
 Acido lctico
Leche Yogurt y queso (Lactobacillus, Streptococcus)
Granos Pan de centeno (Lactobacillus bulgaricus)
Col Chucrut o Sauerkraut (Lactobacillus plantarum)
Carne Salchichas (Pediococcus)
 Otras fermentaciones

cido propinico y CO2.
Leche Queso suizo (Propionibacterium freudenreichii)

Acetona y butanol (Clostridium acetobutylicum)

Glicerol (Saccharomyces cerevisiae)

cido ctrico melazas (Aspergillus niger)

Metano cido actico (Methanosarcina)

cido ascrbico Sorbitol (Acetobacter)
Ciclo del cido ctrico
Ciclo de los cidos
tricarboxlicos (TCA)
Ciclo de Krebs (CK).
El acetil-CoA se forma
a partir del piruvato
por la piruvato
deshidrogenasa y es
oxidado a CO2 en el
CK.
Por Acetil-CoA se
forman 2 molculas
de NADH, una de
NADPH y una de
FADH2, adems de un
ATP por FNS.
 Fosforilacin oxidativa.
Respiraciones.
Respiracin es la obtencin de energa por
NADH
oxidacin de sustratos reducidos DH2
(orgnicos en quimiorgantrofas, e
e-
inorgnicos en quimiolittrofas), pero las
coenzimas reducidas (como el NADH)
Respiracin transfieren los electrones a un aceptor final
H+ aerobia
O2 H2O
oxidado, no directamente (como en la
H+ fermentacin), sino a travs de una
Respiracin
anaerobia
cadena transportadora de electrones al
e- NO3- NO2- final de la cual existe un aceptor exgeno
ADP + Pi oxidado, que se reduce.
H+
ATP
Respiracin aerobia: el aceptor final es el
O2.

Respiracin anaerobia: el aceptor final es
distinto del O2 (nitrato, sulfato, etc.).
Transporte de electrones
La transferencia de electrones se da en
la direccin de mayor potencial redox
positivo, con la liberacin de energa
libre. La energa libre se va a traducir en
un potencial electroqumico de protones,
cuya disipacin a travs de ATP-asas de
membrana origina ATP, conocindose
este proceso como fosforilacin
oxidativa.
Transportadores de electrones
Protenas

NADH deshidrogenasas.
Transfieren los e- y los H+.

Flavoprotenas. Transfieren
los e- y los H+.

Protenas de hierro y azufre.
Acarreador de electrones.

Citocromos. Acarreador de
electrones.

No protenas

Quinonas. Transfieren los e- y
los H+.
ATPasa La ATP sintasa es una
protena con una de sus
fracciones embebida en la
membrana y la otra en la
cara citoplasmtica:

Complejo cataltico F1
(subunidades 33),
responsable de la
interconversin de ADP+ Pi y
ATP.

Complejo F0 (subunidades
ab2c12), responsable de la
transferencia de protones a
travs de la membrana.
Formacin de ATP

El movimiento de protones a travs de F0 dirige la rotacin de las

protenas c generando la rotacin, la energa es transmitido a F1
por la rotacin de las subunidades , esto causa una cambio
conformacional en que permite la formacin de ATP en cada
subunidad. De igual modo la ATPasa es reversible generando
fuerza protn motriz.
Respiracin Fuera Citoplasma

2 H+ Fp NADH + H+

aerobia 2e-

Fe-S

Q 2 H+

2e-
2 H+

Cyt b556
Cyt b562
3 H+ + O2

Cyt o

2 H+ H2O

ADP + Pi

H+ ATPasa H+

ATP
Respiracin Fuera Citoplasma

2 H+ Fp NADH + H+
anaerobia 2e-

Fe-S

Q 2 H+

2e-
2 H+

Cyt b556

NO3- + 2 H+

Nitrato reductasa
NO2- + H2O

ADP + Pi

H+ ATPasa H+

ATP
Quimiolittrofos
Microorganismos que usan
compuestos inorgnicos
como fuente de energa, la
mayora son aerobios y
producen la energa
removiendo los electrones de
un sustrato y produciendo ATP
por fosforilacin oxidativa,
algunos son littrofos
facultativos y pueden emplear
los compuestos orgnicos
como fuente de energa.

Muchos de los littrofos son autotrofos (litoauttrofos), algunos

utilizan el CO2 como nica fuente de carbono, como las
bacterias metanognicas, las nitrificantes y algunas otras.
Quimiolittrofos
Fuente de Producto
Grupo energa final Organismo
(reducido) (oxidado)
Bacterias del Alcaligenes,
H2 H2O
hidrgeno Pseudomonas
Bacterias del
NH3 NO2- Nitrosomonas
nitrgeno*
Bacterias del
NO2- NO3- Nitrobacter
nitrgeno*
Bacterias del Thiobacillus,
H2S o S SO4=
azufre Sulfolobus
Bacterias del Gallionella,
Fe 2+ Fe3+
hierro Thiobacillus

*El proceso de nitrificacin requiere de un consorcio de bacterias para convertir el NH3 a NO3.
 Auttrofos
Organismos que utilizan el CO2 como fuente de carbono. El CO2
puede ser incorporado por diversas vas:

Ciclo de Krebs reverso. Bacterias verdes del azufre (Chlorobium)

Va del Hidroxipropionato. Bacterias verdes (Chloroflexus)

Va Acetil CoA reductiva. Bacterias acetognicas (Clostridium
thermoaceticum, Acetobacterium woodii), metanognicas
(Methanobacterium thermoautotrophicum) y auttrofas sulfato
reductoras (Defulfobacterium autotrophicum)

Ciclo de Calvn. Bacterias prpura,

cianobacterias, algas, plantas verdes, muchas
bacterias quimiolittrofas y algunas
arqueobacterias halfilas e hipertermfilas. La
fijacin es realizada por la enzima Ribulosa
bifosfato carboxilasa (RubisCO) que forma
acmulos llamado carboxisomas. Carboxisomas en
Prochlorococcus marinus
Ciclo de
Calvin-Benson
Consta de tres fases:

Fijacin por la enzima
Rubisco.

Reduccin a
Gliceraldehdo 3-
fosfato (formacin de
compuestos
orgnicos).

Regeneracin de
Ribulosa bifosfato,
sustrato para la
fijacin.
 Fottrofos
Los organismos fottrofos convierten la energa luminosa en
energa qumica para formar ATP.

Fotosntesis oxignica. Cianobacterias, algas y plantas

Fotosntesis anoxignica. Bacterias prpura, verdes y
heliobacterias.

Fotofosforilacin no fotosntetica (mediada por el pigmento
bacteriorodopsina). Halobacterias (arquea haloflica)

Chloroflexus (bacteria verde no del azufre, Chloroflexaceae), Rhodospirillum (bacteria prpura,

Rhodospirillaceae), Chlorobium (bacteria verde del azufre, Chlorobiaceae), Heliobacterium
(Gram-positiva, Heliobacteriaceae), y Nostoc (cianobacteria, Nostocaceae).
 Fotosntesis
Es la conversin de energa
luminosa en energa qumica que
puede ser usada para la
formacin de material celular a
partir de CO2.

Es un metabolismo separado en
dos componentes metablicos:

Catablico (fase luminosa), la

energa solar es transformada en
energa qumica.

Anablico (fase oscura),

involucra la fijacin de CO2
como fuente de carbono para el
crecimiento celular.
Pigmentos de la fotosntesis

Clorofila (fotosntesis oxignica)

Bacterioclorofila (fotosntesis anoxignica)
Pigmentos de la fotosntesis
Ficoeritrobilina y la ficocianobilina como
pigmentos capturadores de la luz. Las
ficobilinas estn unidas covalentemente
a protenas de unin especficas,
formando las ficobiliprotenas, que se
asocian en complejos ordenados
llamados ficobilisomas. Estas son las
principales estructuras de captacin de
luz en los microorganismos.

En estos ensamblajes los pigmentos de ficobilina se unen a

protenas especficas que forman pigmentos llamados ficoeritrina
(PE), ficocianina (PC) y aloficocianina (AP). La energa de los
fotones absorbidos por PE o PC es transmitida por AP a la clorofila
a del centro de reaccin mediante un proceso conocido como
transferencia de excitones.
Pigmentos de la fotosntesis
Pigmentos accesorios. Carotenoides: carotenos y xantofilas.
Fotofosforilacin acclica

Ocurre en la fotosntesis oxignica. El donador de electrones

es el agua y el aceptor final es una coenzima oxidada. Hay
produccin de oxgeno.
Fotofosforilacin cclica

Ocurre en la fotosntesis anoxignica. Los donadores de

electrones son principalmente: H2S, S, S2O32-. Los electrones
son devueltos a la clorofila por medio de transportadores
(cadena reversa).
Fotofosforilacin no fotosntetica
La bacteriorrodopsina tiene
siete hlices a que
comprenden toda la
seccin de la
membrana. El cromforo
retinal todo-trans (prpura)
esta unido covalentemente
mediante una base de
Schiff al grupo -amino de
una Lys. Una serie de
residuos Asp y Glu, y
molculas de agua
asociadas aportan la va
transmembranal para los
protones (flechas rojas).
Reacciones biosintticas

Los intermediarios de las

vas del metabolismo
central son tambin
intermediarios de las
vas de degradacin y
biosntesis de protenas
y lpidos.