La energa se define como capacidad para hacer un trabajo, que es
cualquier cambio de estado o de movimiento de la materia. En general, los bilogos expresan la energa en unidades de trabajo, kilojoules (kJ). Tambin se pueden expresar en unidades de energa calorfica (ca), kilocaloras (kcal), la energa trmica que fluye de un objeto con mayor temperatura a un objeto con menor temperatura. Una kilocalora es igual a 4.184 kJ. Cuando un arquero tensa un arco y dispara, la energa cintica, energa de movimiento es utilizada para efectuar este trabajo. La tensin resultante en el arco y en la cuerda representa la energa almacenada o potencial. La energa potencial es la capacidad para realizar trabajo como consecuencia de la posicin o del estado. Cuando la cuerda es liberada, esta energa potencial se convierte en energa cintica en el movimiento del arco, que a su vez impulsa la flecha. La energa qumica, que es la energa potencial almacenada en los enlaces qumicos, es de particular importancia para los organismos. En este ejemplo, la energa qumica de las molculas alimenticias se convierte en energa cintica en las clulas musculares del arquero. La contraccin de sus msculos, al igual que muchas de las actividades efectuadas por un organismo, es un ejemplo de energa mecnica, que realiza trabajo al mover la materia. La termodinmica, el estudio de la energa y sus transformaciones. En el contexto de la termodinmica, los cientficos utilizan el trmino sistema para referirse al objeto bajo estudio, sea una clula, un organismo, o el planeta Tierra. Un sistema cerrado no intercambia energa con sus alrededores, mientras que un sistema abierto s puede hacerlo. Los sistemas biolgicos son sistemas abiertos. De acuerdo con la primera ley de la termodinmica, la energa no se puede crear o destruir, aunque se puede transferir o convertir de una forma a otra, incluyendo las conversiones entre materia y energa. Como se especifica con la primera ley de la termodinmica, los organismos no pueden crear la energa que requieren para vivir. Entonces, stos deben capturar energa del ambiente y convertirla a una forma que se pueda utilizar para trabajo biolgico. La segunda ley de la termodinmica establece que cuando la energa se convierte de una forma a otra, alguna energa utilizable, es decir, energa disponible para efectuar trabajo, se convierte en calor que se dispersa en los alrededores. (el calor es la energa cintica de partculas en movimiento aleatorio). A diferencia de la energa calorfica, que fluye de un objeto de mayor temperatura a otro con menor temperatura, este movimiento aleatorio no puede realizar trabajo. Como resultado, en el universo disminuye la cantidad de energa utilizable para efectuar trabajo.
La energa en forma menos utilizable es ms difusa, o desorganizada. La
entropa (S) es una medida de este desorden, o aleatoriedad; la energa utilizable tiene baja entropa, est organizada, mientras que la energa desorganizada, como el calor, tiene alta entropa. El metabolismo es la suma de todas las actividades qumicas que ocurren en un organismo. El metabolismo de un organismo consiste en muchas series de reacciones qumicas, o rutas metablicas que se cruzan. El anabolismo y el catabolismo son las dos principales rutas del metabolismo. El anabolismo incluye las diversas rutas en las que se sintetizan molculas complejas a partir de sustancias ms simples, como la unin de aminocidos para formar protenas. El catabolismo incluye las rutas en las que grandes molculas se dividen en molculas ms pequeas, como en la degradacin de almidn para formar monosacridos. L os enlaces qumicos se rompen y entonces se pueden formar nuevos y diferentes enlaces. Cada tipo especfico de enlace qumico tiene una cierta cantidad de energa de enlace, definida como la energa requerida para romper dicho enlace. La energa de enlace total, equivale en esencia a la energa potencial total del sistema, cantidad conocida como entalpa (H). La entropa y la entalpa estn relacionadas con un tercer tipo de energa, llamada energa libre (G), que es la cantidad de energa disponible para efectuar trabajo bajo las condiciones de una reaccin qumica. La energa libre, el nico tipo de energa que puede realizar trabajo celular. Una reaccin exergnica libera energa y se dice que es una reaccin espontnea o una reaccin cuesta abajo, de alta energa libre a ms baja. Una reaccin endergnica es una reaccin en la que existe ganancia de energa libre. Un gradiente de concentracin, con una regin de alta concentracin y otra regin de ms baja concentracin, es un estado ordenado. Una clula debe gastar energa para producir un gradiente de concentracin. Como el trabajo es realizado para producir este orden, entonces un gradiente de concentracin es una forma de energa potencial. Conforme las partculas se mueven aleatoriamente, el gradiente se degrada. As, la energa libre disminuye al aumentar la entropa. En la respiracin celular y en la fotosntesis, la energa potencial almacenada en un gradiente de concentracin de iones de hidrgeno (H+) es transformada en energa qumica en trifosfato de adenosina (ATP) conforme los iones de hidrgeno atraviesan la membrana disminuyendo su gradiente de concentracin. Muchas reacciones metablicas, como la sntesis de protena, son anablicas y endergnicas. Ya que una reaccin endergnica no puede ocurrir sin el ingreso de energa, entonces las reacciones endergnicas estn acopladas a reacciones exergnicas. En las reacciones acopladas, la reaccin exergnica termodinmicamente favorable proporciona la energa requerida para manejar la reaccin endergnica, termodinmicamente desfavorable. La reaccin endergnica slo procede si
absorbe la energa libre cedida por la reaccin exergnica a la que est
acoplada. En todas las clulas vivas, la energa est temporalmente almacenada dentro de un conocido compuesto qumico llamado trifosfato de adenosina (ATP), que conserva la energa disponible durante muy cortos perodos. La energa que la clula requiere para uso inmediato est temporalmente guardada en el ATP, como si fuera dinero en efectivo. Cuando usted gana dinero extra, una parte de ste la puede depositar en el banco; de manera similar, una clula puede depositar energa en los enlaces qumicos de lpidos, almidones, o glucgeno. Adems, al igual que usted no gasta ms dinero que el que gana, as la clula debe evitar la quiebra energtica, que significara su muerte. Por ltimo, al igual que usted, el dinero que obtiene no lo guarda por mucho tiempo, la clula gasta continuamente su ATP, que debe reemplazarse de inmediato. El ATP es un nucletido que consiste en tres partes principales: adenina, una base orgnica que contiene nitrgeno; ribosa, un azcar de cinco carbonos; y tres grupos fosfato, identificables como tomos de fsforo rodeados por tomos de oxgeno. Cuando el fosfato terminal se elimina del ATP, la molcula restante es difosfato de adenosina (ADP). Si el grupo fosfato no se transfiere a otra molcula, se libera como fosfato inorgnico (Pi). sta es una reaccin exergnica con un valor negativo de G relativamente grande. (5) ATP + H2O ADP + Pi G = 32 kJ/mol (o 7.6 kcal/mol). La reaccin 5 se puede acoplar a reacciones endergnicas en las clulas. Considere la siguiente reaccin endergnica, en la cual dos monosacridos, glucosa y fructosa, forman la sacarosa disacrida. Una reaccin de fosforilacin es una en la que un grupo fosfato se transfiere a algn otro compuesto. El ATP acopla reacciones exergnicas y endergnicas. Las reacciones exergnicas en las rutas catablicas (parte superior) proporcionan energa para dirigir la formacin endergnica de ATP a partir del ADP. Inversamente, la hidrlisis exergnica del ATP aporta energa a las reacciones endergnicas en rutas anablicas (parte inferior). La clula mantiene una proporcin de ATP a ADP que est lejos del punto de equilibrio. El ATP se forma constantemente a partir del ADP y de fosfato inorgnico conforme los nutrientes se descomponen en la respiracin celular o conforme la fotosntesis atrapa la energa radiante de la luz solar. En cualquier momento, una clula comn contiene ms de 10 molculas de ATP por cada molcula de ADP. El hecho de que la clula mantenga la concentracin de ATP a tan alto nivel (respecto a la concentracin de ADP) hace que su reaccin de hidrlisis sea ms fuertemente exergnica y ms capaz de impulsar las reacciones endergnicas con las que se acopla. La energa tambin se transporta por transferencia de electrones. La oxidacin es el proceso qumico durante el que una sustancia pierde electrones, mientras que la reduccin es el proceso complementario en donde una sustancia gana electrones. Ya que, en las clulas vivas, los
electrones liberados durante la reaccin de oxidacin no pueden existir en
estado libre, entonces cada reaccin de oxidacin debe ser acompaada por una reaccin de reduccin en la cual los electrones son aceptados por otro tomo, ion, o molcula. Con frecuencia, las reacciones de oxidacin y de reduccin se conocen como reacciones redox porque ocurren simultneamente. La sustancia que se oxida da energa liberando electrones, y la sustancia reducida recibe energa al ganar electrones. Con frecuencia, las reacciones redox ocurren en una serie, conforme los electrones son transferidos de una molcula a otra. Esos electrones que se transfieren, son equivalentes a transferir energa, siendo una parte esencial de la respiracin celular, de la fotosntesis, y de muchos otros procesos qumicos. Las reacciones redox, por ejemplo, liberan la energa almacenada en las molculas alimenticias de manera que pueda sintetizarse el ATP utilizando esa energa. Las clulas regulan la rapidez de las reacciones qumicas mediante enzimas, que son catalizadores biolgicos que aumentan la rapidez de una reaccin qumica sin ser consumidas en la reaccin. Aunque la mayora de las enzimas son protenas, los cientficos han aprendido que algunos tipos de molculas de ARN tambin tienen actividad cataltica. (La catlisis es el proceso por el cual se aumenta la velocidad de una reaccin qumica, debido a la participacin de una sustancia llamada catalizador. Un catalizador es una sustancia qumica, simple o compuesta, que modifica la velocidad de una reaccin qumica) Todas las reacciones, sean exergnicas o endergnicas, tienen una barrera de energa conocida como la energa de activacin (EA), que es la energa requerida para romper los enlaces existentes e iniciar la reaccin. En una poblacin de molculas de cualquier tipo, algunas tienen energa cintica relativamente alta, mientras que otras tienen un menor contenido energtico. Slo las molculas con una energa cintica relativamente alta tienen posibilidad de reaccionar para formar el producto. Por ejemplo, el hidrgeno molecular y el oxgeno molecular pueden reaccionar violentamente para formar agua: 2 H2 + O2 2 H2O.Esta reaccin es espontnea, aunque el hidrgeno y el oxgeno pueden mezclarse de manera segura teniendo cuidado con las chispas porque la energa de activacin requerida es relativamente alta para esta reaccin particular. Una minscula chispa proporciona la energa de activacin que permite que unas cuantas molculas reaccionen. Estas reacciones liberan tanto calor que el resto de las molculas reacciona, produciendo una explosin. Al igual que todos los catalizadores, las enzimas afectan la rapidez de una reaccin disminuyendo la energa de activacin (EA) necesaria para iniciar una reaccin qumica. Si las molculas necesitan menos energa para reaccionar porque ha descendido la barrera de activacin, entonces en un tiempo dado reacciona una mayor proporcin de molculas del reactivo. Como resultado, la reaccin ocurre ms rpidamente. Si la reaccin tiende al equilibrio, entonces ningn catalizador puede hacerla ir en una direccin termodinmica desfavorable o influir en las concentraciones finales de reactivos y productos. Las enzimas simplemente aumentan la rapidez de la reaccin.
Una reaccin no catalizada depende de las colisiones aleatorias entre los
reactivos. Debido a su estructura ordenada, una enzima reduce esta dependencia sobre eventos aleatorios y por lo tanto controla la reaccin. La enzima logra esto formando un complejo intermedio inestable con el sustrato, la sustancia sobre la que acta. Cuando el complejo enzimasustrato, o complejo ES, se descompone, el producto se libera; la molcula de la enzima original se regenera y queda libre para formar un nuevo complejo ES. Cada enzima contiene uno o ms sitios activos, regiones en las cuales se une el sustrato, para formar el complejo ES. La forma de la enzima no parece exactamente complementaria a la del sustrato. El enlace del sustrato a la molcula de la enzima causa un cambio, conocido como ajuste inducido, en la forma de la enzima. Normalmente, la forma del sustrato tambin cambia un poco, de manera que se puedan distorsionar sus enlaces qumicos Las enzimas catalizan a prcticamente todas las reacciones que ocurren en un organismo. Debido a que la forma del sitio activo est ntimamente relacionada a la forma del sustrato, la mayora de las enzimas estn altamente especializadas y slo catalizan a unas pocas reacciones qumicas cercanamente relacionadas, o en muchos casos, slo a una reaccin particular. La enzima ureasa, que descompone urea a dixido de carbono y amoniaco, no ataca a otros sustratos. La enzima sacarasa slo divide sacarosa; no acta sobre otras disacridas, tales como la maltosa o la lactosa. Unas pocas enzimas son especficas slo en cuanto a que requieren que el sustrato tenga un cierto tipo de enlace qumico. Por ejemplo, la lipasa, secretada por el pncreas, divide los enlaces ster conectando el glicerol y cidos grasos de una amplia variedad de grasas. Los cientficos normalmente nombran a las enzimas agregando el sufijo asa al nombre del sustrato. La enzima sacarasa, por ejemplo, descompone sacarosa en glucosa y fructosa.
Clases importantes de enzimas
Oxidorreductasas: Catalizan reacciones redox.
Transferasas: Catalizan la transferencia de un grupo funcional de una molcula donadora a una molcula aceptadora. Hidrolasas: Catalizan reacciones de hidrlisis Isomerasas: Catalizan la conversin de una molcula de una forma isomrica a otra. Ligasas: Catalizan ciertas reacciones en las cuales dos molculas se unen en un proceso acoplado al hidrlisis del ATP Liasas: Catalizan ciertas reacciones en las cuales se forman o se rompen enlaces doble
Algunas enzimas slo consisten de una protena. La enzima pepsina, que se
secreta por el estmago animal y digiere protena del alimento rompiendo ciertos enlaces pptidos, es exclusivamente una molcula de protena. Otras enzimas tienen dos componentes: una protena llamada apoenzima y un componente qumico adicional llamado cofactor. Ni la apoenzima ni el cofactor solos tienen actividad cataltica; solamente cuando ambos se combinan permiten que la enzima funcione. Un cofactor puede ser inorgnico, o puede ser una molcula orgnica. Algunas enzimas requieren un ion metlico especfico como un cofactor. Dos cofactores inorgnicos muy comunes son los iones de magnesio y los iones de calcio. La mayora de los elementos traza, como el hierro, cobre, zinc y manganeso, que todos los organismos requieren en muy pequeas cantidades, funcionan como cofactores. Un compuesto orgnico, no polipptido que se une a la apoenzima y sirve como un cofactor, es una coenzima. La mayora de las coenzimas transportan molculas que transfieren electrones o parte de un sustrato de una molcula a otra. En este captulo ya se introdujeron algunos ejemplos de coenzimas. NADH, NADPH y FADH2 son coenzimas; stas transfieren electrones. El ATP funciona como una coenzima; es responsable de transferir grupos fosfato. Otra coenzima, la coenzima A, est implicada en la transferencia de grupos derivados de cidos orgnicos. La mayora de las vitaminas, que son compuestos orgnicos que un organismo requiere en pequeas cantidades pero que no puede sintetizarlas por s mismo, son coenzimas o componentes de coenzimas. Las enzimas trabajan mejor en condiciones especficas de temperatura y de pH. Una clula puede regular la actividad enzimtica controlando la cantidad de enzima producida y regulando las condiciones metablicas que infl uyen en la confi guracin de la enzima. Algunas enzimas tienen sitios alostricos, sitios no catalticos a los que se une un regulador alostrico, cambiando la actividad de la enzima. Algunas enzimas alostricas estn sujetas a la inhibicin por retroalimentacin, en la que la formacin de un producto fi nal inhibe una reaccin inicial en la ruta metablica. La inhibicin reversible ocurre cuando un inhibidor forma enlaces qumicos dbiles con la enzima. La inhibicin reversible puede ser competitiva, en la que el inhibidor compite con el sustrato por el sitio activo, o no competitiva, en la que el inhibidor se une a la enzima en un sitio distinto al activo. La inhibicin irreversible ocurre cuando un inhibidor se combina con una enzima para activarla permanentemente