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AcidosNucleicos Veronica
AcidosNucleicos Veronica
PROPIEDADES
DE LOS CIDOS
NUCLICOS
Vernica Burriel Coll
Qumica Aplicada a la Ingeniera Biomdica
Master en Ingeniera Biomdica
INTRODUCCIN
Definicin
Los cidos Nucleicos son las biomolculas portadoras de la informacin
gentica. Son biopolmeros, de elevado peso molecular, formados por otras
subunidades estructurales o monmeros, denominados Nucletidos.
Desde el punto de vista qumico, los cidos nucleicos son macromolculas
formadas por polmeros lineales de nucletidos, unidos por enlaces ster de
fosfato, sin periodicidad aparente.
De acuerdo a la composicin qumica, los cidos nucleicos se clasifican en
cidos Desoxirribonucleicos (ADN) que se encuentran residiendo en el ncleo
celular y algunos organelos, y en cidos Ribonucleicos (ARN) que actan en el
citoplasma.
Los cidos nucleicos estn formados por largas
cadenas de nucletidos, enlazados entre s
por el grupo fosfato. El grado de
polimerizacin puede llegar a ser
altsimo, siendo las molculas
ms grandes que se conocen,
con molculas constitudas por
centenares de millones de nucletidos
en una sola estructura covalente. De la
misma manera que las protenas son
polmeros lineales aperidicos de aminocidos,
los cidos nucleicos lo son de nucletidos. La
aperiodicidad de la secuencia de nucletidos
implica la existencia de informacin. De hecho,
sabemos que los cidos nucleicos constituyen
el depsito de informacin de todas las
secuencias de aminocidos de todas las
protenas de la clula. Existe una
correlacin entre ambas secuencias, lo que
se expresa diciendo que cidos nucleicos y
protenas son colineares; la descripcin de
esta correlacin es lo que llamamos Cdigo
Gentico, establecido de forma que a una
secuencia de tres nucletidos en un cido
nucleico corresponde un aminocido en
una protena.
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Son las molculas que tienen la informacin gentica de los organismos y son
las responsables de su transmisin hereditaria. El conocimiento de la estructura
de los cidos nucleicos permiti la elucidacin del cdigo gentico, la
determinacin del mecanismo y control de la sntesis de las protenas y el
mecanismo de transmisin de la informacin gentica de la clula madre a las
clulas hijas.
Existen dos tipos de cidos nucleicos, ADN y ARN, que se diferencian por el
azcar (Pentosa) que llevan: desoxirribosa y ribosa, respectivamente. Adems
se diferencian por las bases nitrogenadas que contienen, Adenina, Guanina,
Citosina y Timina, en el ADN; y Adenina, Guanina, Citosina y Uracilo en el
ARN. Una ltima diferencia est en la estructura de las cadenas, en el ADN
ser una cadena doble y en el ARN es una cadena sencilla
Un poco de historia
El descubrimiento de los cidos nucleicos se debe a Meischer (1869), el cual
trabajando con leucocitos y espermatozoides de salmn, obtuvo una sustancia
rica en carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno y un porcentaje elevado de
fsforo. A esta sustancia se le llam en un principio Nuclena, por encontrarse
en el ncleo.
Aos ms tarde, se fragment
esta nuclena, y se separ un
componente proteico y un grupo
prosttico, este ltimo, por ser
cido, se le llam cido Nucleico.
En los aos 30, Kossel comprob
que tenan una estructura
bastante compleja.
En 1953, James Watson y Francis
Crick, descubrieron la estructura
tridimensional de uno de estos
cidos, concretamente del cido
Desoxirribonucleico (ADN).
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BASES PRICAS
Y PIRIMIDNICAS
Definicin
Las Bases Nitrogenadas son las que contienen la informacin gentica. En el
caso del ADN las bases son dos Purinas y dos Pirimidinas. Las purinas son A
(Adenina) y G (Guanina). Las pirimidinas son T (Timina) y C (Citosina). En el
caso del ARN tambin son cuatro bases, dos purinas y dos pirimidinas. Las
purinas son A y G y las pirimidinas son C y U (Uracilo).
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Bases pricas
Estn basadas en el Anillo Purnico. Puede observarse que se trata de un
sistema plano de nueve tomos, cinco carbonos y cuatro nitrgenos.
En esta imagen puede
observarse como se forman
Adenina y Guanina a partir de
una Purina.
El anillo purnico puede
considerarse como la fusin de
un anillo pirimidnico con uno
imidazlico.
Nombre sistemtico
Adenina
Guanina
6-amino purina
2-amino 6-oxo purina
Bases pirimidnicas
Estn basadas en el Anillo Pirimidnico. Es un sistema plano de seis tomos,
cuatro carbonos y dos nitrgenos.
En esta imagen puede
observarse como derivan
Citosina, Timina y Uracilo de
Pirimidina.
Las distintas bases pirimidnicas
se obtienen por sustitucin de
este anillo con grupos oxo (=O),
grupos amino (-NH2) o grupos
metilo (-CH3).
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Nombre sistemtico
Citosina
Uracilo
Timina
Bases modificadas
Adems de las purinas y pirimidinas de las que hemos hablado anteriormente,
es frecuente encontrar Bases Modificadas.
Entre las ms abundantes encontramos:
la 5-metilcitosina, la 5-hidroximetilcitosina y la 6-Metiladenina que se
han relacionado con la regulacin de la expresin del DNA
la 7-metilguanina y el dihidrouracilo que forman parte de la estructura de
los RNA
Hipoxantina y Xantina como intermediarios metablicos y productos de
reaccin del DNA con sustancias mutagnicas.
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NUCLESIDOS Y
NUCLETIDOS
Nuclesidos
La unin de una base nitrogenada a una pentosa da lugar a los compuestos
llamados Nuclesidos.
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Los nuclesidos son ms solubles que las bases libres y los planos de la base
y el azcar son perpendiculares entre si.
Como el enlace glicosdico es sencillo, las bases pueden presentar dos
conformaciones diferentes:
Citosina
Uracilo
Timina
Adenina
Guanina
Nuclesido
Pirimidinas
Desoxicitidina
Desoxiuridina
Timidina
Purinas
Desoxiadenosina
Desoxiguanosina
Por su parte, los Desoxinuclesidos se denominan con el prefijo desoxidelante del nombre del nuclesido.
RIBONUCLESIDOS
Base
Nuclesido
Pirimidinas
Citosina
Citidina
Uracilo
Uridina
Timina
Ribotimidina
Purinas
Adenina
Adenosina
Guanina
Guanosina
Hipoxantina
Inosina
Se excepta el Desoxirribonuclesido de
Timina, que recibe el nombre de Timidina.
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Nuclesidos modificados
En los tRNA existen en forma caracterstica, nuclesidos modificados como la
Seudouridina, formada por Uracilo y Ribosa unidos a travs de un enlace (15). Tambin se encuentra un nuclesido de Timina y Ribosa, la Ribotimidina.
Otro nuclesido presente en el tRNA es la Dihidrouridina, formado por Ribosa y
Dihidrouracilo unidos por enlace (1-1).
En el metabolismo de las bases pricas se forma un nuclesido con
Hipoxantina y Ribosa llamado Inosina.
Nucletidos
Los nucletidos son los steres fosfricos de los nuclesidos. Estn formados
por la unin de un grupo fosfato al carbono 5 de una pentosa. A su vez la
pentosa lleva unida al carbono 1 una base nitrogenada.
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Abreviatura
Adenosina-5'-monofosfato
Adenosina-3'-monofosfato
Adenosina-2'-monofosfato
5'-AMP, AMP
3'-AMP
2'-AMP
Adenosina Polifosfatos
Nombre sistemtico
Abreviatura
Adenosina-5'-monofosfato
Adenosina-5'-difosfato
Adenosina-5'-trifosfato
AMP
ADP
ATP
Molcula de
ATP (adenosn
trifosfato): Es el
portador primario de
energa de la clula.
La mayora de las
reacciones
metablicas
que requieren
energa estn
acopladas a la
hidrlisis de
ATP.
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Desoxinucletidos
Nombre sistemtico
Abreviatura
Desoxiadenosina-5'-monofosfato
Desoxiguanosina-5'-monofosfato
Desoxicitidina-5'-monofosfato
Timidina-5'-monofosfato
dAMP
dGMP
dCMP
TMP
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ESTRUCTURA
TRIDIMENSIONAL
DEL ADN
El ADN
cido Desoxirribonucleico (ADN), material gentico de todos los organismos
celulares y casi todos los virus. Es el tipo de molcula ms compleja que se
conoce. Su secuencia de nucletidos contiene la informacin necesaria para
poder controlar el metabolismo un ser vivo.
El ADN lleva la informacin necesaria para dirigir la
sntesis de protenas y la replicacin. En casi todos los
organismos celulares el ADN est organizado en forma
de cromosomas, situados en el ncleo de la clula.
Est formado por la unin de muchos
desoxirribonucletidos. La mayora de las molculas de
ADN poseen dos cadenas antiparalelas (una 5-3 y la
otra 3-5) unidas entre s mediante las bases
nitrogenadas, por medio de puentes de hidrgeno.
La adenina enlaza con la timina, mediante dos puentes
de hidrgeno, mientras que la citosina enlaza con la
guanina, mediante tres puentes de hidrgeno.
El estudio de su estructura se puede hacer a varios
niveles, apareciendo estructuras, primaria, secundaria,
terciaria, cuaternaria y niveles de empaquetamiento
superiores.
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Estructura Primaria
Se trata de la secuencia de
desoxirribonucletidos de una de las cadenas.
La informacin gentica est contenida en el
orden exacto de los nucletidos.
Las bases nitrogenadas que se hallan formando
los nucletidos de ADN son Adenina, Guanina,
Citosina y Timina. Los nucletidos se unen
entre s mediante el grupo fosfato del segundo
nucletido, que sirve de puente de unin entre
el carbono 5' del primer nucletido y el carbono
3' de siguiente nucletido.
Como el primer nucletido tiene libre el carbono
5' y el siguiente nucletido tiene libre el carbono
3', se dice que la secuencia de nucletidos se
ordena desde 5' a 3' (5' 3').
Estructura Secundaria
Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el almacenamiento de la
informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del ADN. Fue postulada
por James Watson y Francis Crick.
Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas
cadenas son complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la
otra, y la guanina de una a la citosina de la otra. Estas bases enfrentadas son
las que constituyen los Puentes de Hidrgeno.
Adenina forma dos puentes de hidrgeno con Timina. Guanina forma tres
puentes de hidrgeno con Citosina.
Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3 de una se enfrenta al
extremo 5 de la otra.
Las dos hebras estn enrolladas en torno a un eje imaginario, que gira en
contra del sentido de las agujas de un reloj. Las vueltas de estas hlices se
estabilizan mediante puentes de hidrgeno.
Esta estructura permite que las hebras que se formen por duplicacin de ADN
sean copia complementaria de cada una de las hebras existentes.
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Estructura terciaria
El ADN presenta una estructura terciaria, que consiste en que la fibra de 20
se halla retorcida sobre s misma, formando una especie de super-hlice. Esta
disposicin se denomina ADN Superenrollado, y se debe a la accin de
enzimas denominadas Topoisomerasas-II. Este enrollamiento da estabilidad a
la molcula y reduce su longitud.
Vara segn se trate de organismos procariontes o eucariontes:
a) En procariontes se pliega como una super-hlice en forma,
generalmente, circular y asociada a una pequea cantidad de protenas.
Lo mismo ocurre en la mitocondrias y en los plastos.
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Nucleosoma
Collar de perlas
Fibra cromatnica
Bucles radiales
Cromosoma.
El ADN es una molcula muy larga en algunas especies y, sin embargo, en las
clulas eucariotas se encuentra alojado dentro del minsculo ncleo. Cuando el
ADN se une a protenas bsicas, la estructura se compacta mucho.
Las protenas bsicas son Histonas o Protamnas.
La unin con Histonas genera la estructura
denominada Nucleosoma. Cada nucleosoma est
compuesto por una estructura voluminosa,
denominada Core, seguida por un eslabn o
"Linker". El core est compuesto por un octmero de
protenas, Histonas, denominadas H2A, H2B, H3 y
H4. Cada tipo de histona se presenta en nmero
par. Esta estructura est rodeada por un tramo de
ADN que da una vuelta y 3/4 en torno al octmero.
El Linker est formado por un tramo de ADN que
une un nucleosoma con otro y una histona H1.
El conjunto de la estructura se denomina Fibra de Cromatina de 100. Tiene un
aspecto repetitivo en forma de collar de perlas, donde las perlas seran los
nucleosomas, unidos por los linker.
Estructura cuaternaria
La cromatina en el ncleo tiene un grosor de 300. La fibra de cromatina de
100 se empaqueta formando una fibra de cromatina de 300. El enrollamiento
que sufre el conjunto de nucleosomas recibe el nombre de Solenoide.
Los solenoides se enrollan formando la
cromatina del ncleo interfsico de la clula
eucariota. Cuando la clula entra en divisin, el
ADN se compacta ms, formando los
cromosomas.
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ESTRUCTURA
DEL A RN
El ARN
El cido Ribonucleico se forma por la polimerizacin de ribonucletidos, los
cuales se unen entre ellos mediante enlaces fosfodister en sentido 5-3 (igual
que en el ADN). Estos a su vez se forman por la unin de un grupo fosfato, una
ribosa (una aldopentosa cclica) y una base nitrogenada unida al carbono 1 de
la ribosa, que puede ser citosina, guanina, adenina y uracilo. Esta ltima es una
base similar a la timina.
En general los ribonucletidos se unen entre s, formando una cadena simple,
excepto en algunos virus, donde se encuentran formando cadenas dobles.
Un gen est compuesto, como hemos visto, por una secuencia lineal de
nucletidos en el ADN, dicha secuencia determina el orden de los aminocidos
en las protenas. Sin embargo el ADN no proporciona directamente de
inmediato la informacin para el ordenamiento de los aminocidos y su
polimerizacin, sino que lo hace a travs de otras molculas, los ARN.
Se conocen tres tipos principales de ARN y todos ellos participan de una u otra
manera en la sntesis de las protenas. Ellos son: El ARN mensajero (ARNm),
el ARN ribosomal (ARNr) y el ARN de transferencia (ARNt).
ARN mensajero (ARNm)
Consiste en una molcula lineal de nucletidos (monocatenaria), cuya
secuencia de bases es complementaria a una porcin de la secuencia de
bases del ADN. El ARNm dicta con exactitud la secuencia de aminocidos en
una cadena polipeptdica en particular. Las instrucciones residen en tripletes de
bases a las que llamamos Codones.
ARN ribosomal (ARNr)
Este tipo de ARN una vez trascrito, pasa al nucleolo donde se une a protenas.
De esta manera se forman las subunidades de los ribosomas.
ARN de transferencia (ARNt)
Este es el ms pequeo de todos, tiene aproximadamente 75 nucletidos en su
cadena, adems se pliega adquiriendo lo que se conoce con forma de hoja de
trbol plegada. El ARNt se encarga de transportar los aminocidos libres del
citoplasma al lugar de sntesis proteica. En su estructura presenta un triplete de
bases complementario de un codn determinado, lo que permitir al ARNt
reconocerlo con exactitud y dejar el aminocido en el sitio correcto. A este
triplete lo llamamos Anticodn.
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Estructura primaria
Estructura secundaria
Estructura terciaria
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