Bancos de datos y sus

aplicaciones en la taxonomía
integrativa: Barcode of Data Life
Systems

Lic. en Manejo de Recursos Naturales Sarahi Jaime

Estudiante de la Maestría en Ciencias Marinas y Costeras
 La descripción taxonómica de los organismos lo realizamos
¿Por qué incluir análisis moleculares al estudio taxonómico?
con medios tradicionales desde hace más de 250 años:
Las identificaciones y descripciones se han sofisticado
Análisis genéticos en la taxonomía, revolución para los investigadores

Si se supone que cada individuo tienen genes que los diferencian con otros individuos, entonces…
¿por qué no aplicarlo a la taxonomía?

El gen mitocondrial COI no es el único gen que se

pueden usar, otros como el 16S y 18S entre otros
también son utilizables.
 La combinación de las herramientas morfológicas y
moleculares han enriquecido el inventario de la biodiversidad También nos ha permitido contestar a
en el mundo, ayudando en la clarificación y reorganización de preguntas y problemas como estos:
las especies

(Kotov y Gololobova, 2016; Schlick-Steiner et al., 2010)

Empleando tecnologías como esta
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Estos bancos de
datos se
fundamentan en
secuencias
obtenidas del
ADN
 ± 650 pares de bases (PB)

Cada par de bases está conformado por una purina y una pirimidina
Adenina - Timina
Citocina - Guanina
 Ventajas del Gen COI
Análisis de identificación de los organismos
(complejo de especies, especies crípticas)
Obtener secuencias genéticas en un corto
periodo de tiempo
Comprender patrones de distribución de las
especies
Analizar las divergencias genéticas entre y
dentro de las poblaciones y compararlas con
el estudio morfológico
Ayuda para reforzar y proponer la
conservación de áreas naturales
Limitantes del Gen COI
Solo se utiliza un marcador genético, el
gen mitocondrial y plastidico en plantas
No se puede realizar análisis de
filogenia de los individuos (ancestría
descendencia)
No es tan efectivo el análisis de
identificación en plantas y hongos
(ausencia de variación a nivel de la
secuencia entre especies del mismo
género)
(Paz et al 2011)
 Para lograr esto existe una serie de pasos a considerar:

• Colecta en campo
1

• Separación e identificación de los organismos

2

• Preparación y aislamiento de AND

3

• Ampliación y secuenciación del ADN

4

• Procesamiento y análisis de secuencias genéticas

5
1. Colecta en campo

IMPORTANTE:
Para asegurar la mejor calidad de las
muestras, fijarlas con alcohol al 96% y
refrigerarlas
2. Separación e identificación de los IMPORTANTE:
Realizar todo este procedimiento
organismos usando únicamente alcohol
En esta etapa se recomienda tomar fotografías
y medidas de los organismos que se
secuenciarán
 El primer paso es agregar material biológico de los
3. Preparación y aislamiento de AND especímenes a los que se desea obtener secuencias
genéticas la caja Eppendorf

La Caja Eppendof se prepara con 0.2 µl de alcohol

Este espacio se deja vacío

El segundo paso es la Extracción o Aislamiento del ADN

Existen laboratorios como el de Código de

Barras de la Vida de El Colegio de la
Frontera Sur, Chetumal
 la caja de Eppendorf se envía a Canadá (Universidad de
4. Ampliación y secuenciación del ADN Guelph), para la ampliación y replicación con PCR de la
información genética
 ± 650 pares de bases (PB)
La amplificación del ADN se traduce
en secuencias genéticas

Estas secuencias se
representan en un
cromatograma

Electroforesis de la amplificación de ADN

(Recuperado de Monroy-Vaca et al., 2014)

Y en código de barras
 4. Procesamiento y
análisis de secuencias
genéticas

Gutiérrez-Aguirre et al., 2020

 Brachionus plicatilis -
Recuperado de Mills et al., 2017

Moina micrura - Recuperado de

Montoniu-Elena et al., 2019

Mastigodiaptomus suarezmoralesi – Recuperado de

Gutiérrez-Aguirre y Cervantes-Martínez, 2013
En pocas palabras, es como distinguir entre distintos tipos de refrescos
 Rotifera

Cladocera

Copepoda
Desde el 2003, los estudios empleando ambas
herramientas han incrementado
Los estudios de metagenómica han
empezado a tomar lugar para el trabajo
de identificación de las especies

(valentin, et al., 2019)

Mejor combinar todas las
herramientas que tenemos
disponibles para definir a las
especies

No olvidar que las herramientas

moleculares son SOLO una
herramienta de identificación
 Imaginen un futuro utópico en donde
podamos realizar un análisis
taxonómico integrativo de los seres
vivos de manera remota

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