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PRESENTACIÓN
INTRODUCCIÓN
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QUÍMICA BIOORGÁNICA
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Propiedades de la vida
Molécula Organelo
Macromolécula Célula
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La naturaleza química de una partícula
compleja está determinada por la naturaleza
de su partes constituyentes elementales, su
número y estructura química.
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LOGROS
• Dibujar una estructura química de compuestos orgánicos simples.
moléculas que reciben un nombre químico común u oficial. moléculas
polifuncionales mas complejas, podremos identificar grupos funcionales
(nombre genérico) dada la estructura química.
• Se podrá predecir la solubilidad de una sustancia química en
1. ácido acuoso
2. agua
3. base acuosa
• Serán capaz de predecir y mostrar, con estructuras químicas, las
inestabilidades químicas de cada grupo funcional orgánico en condiciones
apropiadas a una sustancia “medio de reacción", por lo que se entiende las
condiciones como aire, luz, ácido o base acuosa y calor.
• También podremos predecir y mostrar, con estructuras químicas, el
metabolismo de cada grupo funcional orgánico.
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Grupos funcionales
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MÉTODOS SINTÉTICOS DE ALQUENOS Y ALQUINOS
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Los diterpenos se obtienen a partir de dos unidades de terpeno, por lo
que especialmente. La vitamina A (retinol) es de gran importancia. Se
forma por oxidación de estos, la retina, un componente del "pigmento
visual" rodopsina, un factor decisivo que juega un papel en el proceso
visual. Esto conduce a una isomerización cis / trans de un doble enlace.
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Síntesis de alquenos (olefinas) por
eliminación de alcoholes o haluros.
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Mec. E 1
ET 1
E
Alcohol 1º > alcohol 2º > alcohol 3º ET 2
Facilidad de deshidratación I
R
P
Av. Rxn17
E2 DESHIDRATACIÓN DE ALCOHOLES EN MEDIO BÁSICO
E2
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Olefinación de Julia.
También conocida como olefinación de Julia-Lythgoe, esta reacción elimina un bencenosulfonil (PhSO2)
y un benzoato (PhCO2) o acetato (CH3CO2) para generar un alqueno.
Regioselectiva
La eliminación es promovida por un agente reductor, usualmente amalgama de sodio (sodio metálico
disuelto en mercurio):
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La olefinación de Julia es altamente estereoselectiva para el isómero E
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Se puede emplear benzotiazol o tetrazol (Julia-Kociensky) en
lugar de fenil-sulfonas para obtener el doble enlace
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REACCIÓN DE WITTIG
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Estereocontrol en la reacción de Wittig
Estas reacciones son estereoselectivas ya que dan lugar a la formación
mayoritaria de la olefina E o de la olefina Z en función del grado de
estabilidad del iluro empleado en el proceso
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Una ves formado el iluro, hay la posibilidad de
resonancia con el fosforo o con el carbonilo adyacente
produciendo un iluro estabilizado que genera olefinas de
configuración E
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En la reacción de Horner-Wadsworth-Emmons (o
Horner-Emmons o Wadsworth-Emmons o Horner-Wittig)
se emplea esteres de fosfonato en lugar de trifenilfosfina
(PPh3), la razón radica en que los iluros de fosfonato son
más reactivos y pueden reaccionar con cetonas también.
Los esteres de fosfonato se obtienen a partir de la
trietilfosfita con el respectivo haluro de alquilo,
mediante la reacción de Arbuzov:
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reacción de Arbuzov
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los grupos funcionales alquenos de varios metabolitos corporales sirven
como centros de reacción (Fig.). Los ácidos grasos insaturados agregan
agua para dar alcoholes. Un citocromo P450 oxidasa ataca el grupo
funcional alqueno en el escualeno para dar un epóxido durante la
biosíntesis de esteroides. Se forma un intermedio de peróxido de
eicosatrienoato, un trieno, durante la biosíntesis de prostaglandinas y
durante la síntesis de ácidos grasos saturados, los alquenos se reducen
in vivo.
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El atracurio también se degrada en el cuerpo por eliminación no enzimática.
Normalmente, esta eliminación requeriría condiciones de una fuerte alcalinidad y una
temperatura alta, pero la presencia del grupo carbonilo aumenta la acidez del protón y, por
tanto, facilita su eliminación. La eliminación puede proceder fácilmente en condiciones
fisiológicas, dando al atracurio una vida media de unos 20 minutos
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El mecanismo de reacción empieza con la adición del
carbeno (catalizador de Grubb) a uno de los alquenos
(cicloadición [2+2]) para generar un anillo de cuatro
miembros conocido como metal ciclobutano:
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El segundo paso implica el rompimiento de dos de los
enlaces del metal ciclobutano formado, que en caso de ser
los mismos que se acaban de crear, dará los reactivos de
partida (en principio todos las cicloadiciones son
reversibles) si no es el caso, entonces se generara un
nuevo complejo de rutenio y estireno:
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Una vez formado este complejo, presenta una nueva
cicloadición [2+2] intramolecular con el otro doble enlace
(en rojo) para dar un anillo de cinco miembros y un
segundo metal ciclobutano, el cual se descompone de la
misma forma que se acaba de explicar:
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El nuevo carbeno formado reacciona con otra molécula del
material de partida, repitiendo el mismo ciclo, excepto que
se genera etileno en lugar de estireno:
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Veamos unos ejemplos del enorme potencial
de la reacción de metátesis
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REACCIONES DE ELIMINACIÓN
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ALQUINOS
ESTRUCTURA
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• El enlace 𝛔 se forma por la superposición de los dos orbitales
híbridos sp.
• Cada enlace p está formado por la superposición lado a lado de
dos orbitales 2p.
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Como los trans cicloalquenos, los cicloalquinos con anillos pequeños son inestables. La
cadena de carbono debe ser lo suficientemente largo para conectar los dos extremos del
triple enlace sin introducir demasiada tensión. El ciclooctino es el cicloalquino aislado más
pequeño, aunque se descompone al pararse en la habitación temperatura después de un
corto tiempo. Para acomodar el triple enlace en el anillo, se produce la flexión alrededor de
los C híbridos sp, desestabilizando ciclooctino.
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Dos hormonas sintéticas RU 486 y levonorgestrel. RU 486 bloquea los efectos de la progesterona y, debido
a esto, evita la implantación de un óvulo fertilizado.
El levonorgestrel interfiere con la ovulación, por lo que previene el embarazo.
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Histrionicotoxin es un diyne aislado en pequeñas cantidades de la piel de Dendrobates
histrionicus, una colorida rana sudamericana. Esta toxina, secretada por la rana como
mecanismo natural de defensa, fue utilizado como veneno en las puntas de las flechas
por la tribu Choco de América del Sur.
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Problema: Nepheliosyne B es un nuevo ácido graso acetilénico aislado de una esponja marina de Nueva Caledonia.
(a) Rotula el átomo de H más ácido. (b) ¿Qué enlace σ carbono-carbono es el más corto? (c) Cuantos grados de
insaturación que contiene la nefeliosina B? (d) ¿Cuántos enlaces se forman a partir de Csp — Csp 3? (e) Rotule cada
enlace triple como interno o terminal.
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Los alquinos se preparan mediante reacciones de eliminación. Una
base fuerte elimina dos equivalentes de HX de un dihaluro vecinal o
geminal para producir un alquino en dos eliminaciones sucesivas de
E2.
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versiones estables, económicas y escalables
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1. Deshidrogenación de dialogenuros de alquilo
Un alcano dihalogenado, donde los átomos del halógeno
están en carbonos vecinos (dihalogenuro vecinal) o en el
mismo carbono (dihalogenuro geminal), puede lograr la
pérdida de átomos de halógeno e hidrógeno, generando un
alquino; ello es posible empleando KOH en medio alcohólico.
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2. Alquilación de acetiluros de sodio
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3. Deshalogenación de tetrahalogenuros
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Los alquinos tienen unas propiedades físicas similares a los alcanos y
alquenos. Son poco solubles en agua, tienen una baja densidad y
presentan bajos puntos de ebullición. Sin embargo, los alquinos son más
polares debido a la mayor atracción que ejerce un carbono sp sobre los
electrones, comparado con un carbono sp3 o sp2.
El enlace carbono - hidrógeno de alquinos terminales
está polarizado y muestra una ligera tendencia a
ionizarse.
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El Hidrógeno del propino es débilmente ácido, con un
pKa = 25. Utilizando bases fuertes (NaH, LDA, NH2-) se
puede desprotonar, obteniéndose su base conjugada
-propinil sodio- una especie muy básica y nucleófila.
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aplicaciones en sistemas biológicos
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Adición a los enlaces múltiples
carbono-carbono
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• Toda reacción de los alquenos implica una
adición: el enlace siempre se rompe.
• Debido a que los alquenos son ricos en
electrones, los alquenos simples no
reaccionan con nucleófilos o bases, reactivos
que son ellos mismos ricos en electrones. Los
alquenos reaccionan con los electrófilos.
• La región roja rica en electrones del enlace π
se encuentra por encima y por debajo del
plano de la molécula. Debido a que el plano
del alqueno representado en esta gráfica de
potencial electrostático está inclinado, solo el
rojo. La región por encima de la molécula es
visible.
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Los alquinos son ricos en electrones, como se muestra en el mapa de potencial
electrostático del acetileno en la figura.
• La región roja rica en electrones se encuentra entre los dos átomos de carbono,
formando un cilindro de densidad de electrones.
Los dos enlaces π forman un cilindro de densidad electrónica entre los dos
átomos de carbono hibridados sp, y esta densidad electrónica expuesta hace un
triple enlace nucleofílico. Como resultado, los alquinos reaccionan con
electrófilos.
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REACCIONES DE LOS ALQUENOS
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Los alquinos se hidrogenan con dos equivalentes de
hidrógeno, en presencia de un catalizador metálico
finamente dividido, para formar alcanos. Los
catalizadores más utilizados son: platino, paladio, rodio
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La hidrogenación de los alquinos a alcanos transcurre a través de un
intermedio que es el alqueno. Es posible parar la hidrogenación en el
alqueno empleando un catalizador de paladio envenenado, llamado
catalizador de Lindlar. Los venenos disminuyen la actividad del
catalizador y permiten parar la hidrogenación en el alqueno.
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Una alternativa a la hidrogenación con el catalizador de Lindlar es la reducción de
alquinos con sodio o litio en amoniaco líquido, la diferencia radica en el alqueno
obtenido. Así, la hidrogenación con el catalizador de Lindlar produce alquenos cis,
mientras la hidrogenación con sodio en amoniaco líquido genera alquenos trans.
La reducción monoelectrónica transcurre a través de un intermedio llamado anión-
radical. La protonación del anión con el amoniaco produce la hidrogenación del
alqueno.
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Adición de Haluros de Hidrógeno a Alquinos
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Halogenación de Alquinos
Los alquinos reaccionan con cloro y bromo para formar
tetrahaloalcanos. El triple enlace adiciona dos moléculas de
halógeno, aunque es posible parar la reacción en el alqueno
añadiendo un sólo equivalente del halógeno
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La razón para esta regioselectividad puede ser vista de la estructura del ion
bromonio en esta estructura, aproximadamente 90% de la carga positiva
reside sobre el carbono terciario, y el enlace entre este carbono y el bromino
es mas largo y débil de tal forma que esta especie es esencialmente un
carbocatión conteniendo una interacción débil carbono-bromino.
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El agua reacciona con el ion bromonio en el carbono terciario, y el
enlace débil al grupo saliente se rompe, para dar la regioselectividad
observada.
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CONVERSIÓN DE ALQUENOS EN ALCOHOLES
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Hidratación de Alquinos
Los alquinos reaccionan con ácido sulfúrico acuoso en presencia
de un catalizador de mercurio para formar enoles. El enol
isomeriza (tautomeriza) rápidamente en las condiciones de
reacción para dar aldehídos o cetonas.
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OXIMERCURACIÓN-REDUCCIÓN
DE ALQUENOS
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Un ion mercuronio
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La adición se completa por la transferencia de un protón al ion acetato
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conversión de los aductos provenientes
de la oximercuración en alcoholes
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HIDROBORACIÓN-OXIDACIÓN
DE ALQUENOS
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Mec.
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Mecanismo concertado
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CONVERSIÓN DE ORGANOBORANOS EN ALCOHOLES
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OZONOLISIS DE ALQUENOS
Formación de ozonidos
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Ozonólisis de Alquinos
Los alquinos reaccionan con ozono para formar ácidos carboxílicos.
En esta reacción se produce la ruptura del triple enlace,
transformándose cada carbono del alquino en el grupo carboxílico.
Artemisia annua,
fuente del agente
antimalarial artemisinina
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El etileno como madurador de frutas
111
Hidroboración de Alquinos
La hidroboración es la hidratación antiMarkovnikov de un alquino. Como reactivo
se emplea un borano impedido (diciclohexilborano o diisoamilborano)
obteniéndose un enol que tautomeriza a aldehído o cetona. Los alquinos
terminales dan lugar a aldehídos los internos a cetonas.
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Porque los enlaces C-H con hibridación sp son más ácidos que los enlaces C-H sp 2 y
sp3 hibridados, en los alquinos terminales se desprotonan fácilmente con una base
fuerte en una reacción ácido-base de Brønsted-Lowry. El anión resultante se llama anión
acetiluro.
¿Por qué es útil esta reacción? Los aniones acetiluro formados por desprotonación de
alquinos terminales son nucleófilos fuertes que pueden reaccionar con una variedad de
electrófilos
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RADICALES LIBRES
ADICIÓN DE BROMURO DE HIDROGENO A ALQUENOS
A. El efecto peróxido
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B. radicales libres y la notación "anzuelo"
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C. radicales libres reacciones en cadena
1, etapa de iniciación
1, etapa de iniciación 2, etapa de propagación
3, etapa de terminación
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2, etapa de propagación
En los pasos de propagación de una reacción de radicales libres, los radicales
reaccionan con materiales de partida para dar otros radicales; se consumen las
materias primas y los productos están formados. Los pasos de propagación ocurren
repetidamente
119
3, etapa de terminación
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EXPLICACIÓN DEL EFECTO PEROXIDO
El mecanismo de radicales libres es la base para
comprender el efecto del peróxido en la adición de HBr. a
alquenos, es decir, por qué la presencia de peróxidos
invierte la regioselectividad normal de HBr
121
Cuando el átomo de bromo se suma al enlace p de un
alqueno, dos reacciones compiten: el átomo de bromo
puede reaccionar en cualquiera de los dos carbonos
del doble enlace para dar diferentes intermedios de
radicales libres.
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¿Cuál es la diferencia entre estos dos radicales libres?
Los radicales libres, como los carbocationes, pueden
clasificarse como primaria, secundaria o terciaria.
123
El radical libre terciario se forma más rápidamente por dos razones. La primera
razón es que cuando el átomo de bromo bastante grande reacciona con el
carbono más ramificado del doble enlace, experimenta repulsiones de van der
Waals con los hidrógenos en las ramas (Fig. a)
Cuando
reacciona el
Estas átomo de
repulsiones bromo
aumentan la en el carbono
energía de este menos
estado de ramificado del
transición. doble enlace,
estas
repulsiones
de van der
Waals están
ausentes
(b).
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Debido a que la reacción con el estado de transición de menor energía es la reacción
más rápida, la reacción del átomo de bromo en el carbono del alqueno con menos
sustituyentes alquilo para dar los radicales libres más sustituidos con alquilo es más
rápido. Reacción posterior de este radical libre con HBr conduce a los productos
observados.
125
Calores de formación de algunos radicales libres (25 ºC)
126
La geometría
del radical
Metilo. El
carbono esta
hibridizado sp2
con geometría
trigonal plana,
y el electrón
incompartido
ocupa un
orbital 2p.
Otros radicales
carbono son
ligeramente
piramidales
127
La reacción nucleofílica del ion bromuro a este carbono completa la adición.
En presencia de peróxidos, el mecanismo por radicales libres se lleva a cabo
de la siguiente forma; primero se adiciona un átomo de bromo, colocando así
el electrón desapareado en el carbono con el mayor numero de sustituyentes.
Un átomo de hidrogeno es subsecuentemente transferido a este carbono.
128
EPOXIDACIÓN
El método tradicional de epoxidación de alquenos
utiliza como oxidante ácidos percarboxílicos, cuyo
mecanismo pasa a través de la formación de un
complejo de transición bicíclico
129
El mecanismo de la epoxidación de alquenos es
concertado, transcurriendo en una única etapa.
130
Otro método empleado en este tipo de reacciones
se basa en la utilización de halohidrinas,
formadas por el ataque electrófilo de HOCl a un
alqueno, que en condiciones básicas fuertes
131
Un importante ejemplo de epoxidación catalítica en medio
homogéneo es la utilización de alquilhidroperóxidos como t-
butil hidroperóxido (TBHP) o etilbenceno hidroperóxido
(EBHP) como oxidantes y metales de transición de valencia
elevada como catalizadores (MoVI, WVI, VV y TiIV), siendo
los de molibdeno particularmente efectivos.
132
Adición de carbenos:
Adición de carbenos: reacciones de ciclopropanación, los carbenos son intermedios de reacción sin carga que
contienen un átomo de carbono divalente. El carbeno más sencillo es el :CH2 y se denomina metileno, como al
grupo –CH2- en un molécula. La estructura electrónica de un carbeno se explica admitiendo una hibridación sp2
en el carbono, la geometría del carbeno es trigonal. El orbital p está vacío y el par electrónico libre se encuentra
en uno de los orbitales híbridos sp2. Como el carbeno tiene un par electrónico libre y un orbital p vacío puede
reaccionar como electrófilo y como nucleófilo. Cuando el carbeno reacciona con el doble enlace , rico en
electrones, exhibe su comportamiento electrofílico. La reacción del carbeno con alquenos genera ciclopropanos:
133
Como el carbeno tiene un par electrónico
libre y un orbital p vacío puede reaccionar
como electrófilo y como nucleófilo.
134
REACCIONES DE CICLOPROPANACIÓN
135
Un método mejor para la ciclopronación es mediante la
reacción de Simmons-Smith. El reactivo se prepara
agregando Yoduro de metileno al par zinc-cobre,
generando ICH2ZnI el cual se asemeja a un carbeno, por
eso con frecuencia se le denomina carbenoide.
136
A partir de compuestos halogenados también es posible la formación
de especies carbenoides. Por ejemplo, cuando el bromoformo CHBr3
se trata con una disolución acuosa de KOH al 50% se genera un
carbeno denominado dibromocarbeno.
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Reacciones de adición a dienos conjugados
Reacción Cicloadición: de Diels-Alder
Hay algunas reacciones que no involucran iones. Estas reacciones generalmente se pueden
clasificar en una de dos categorías: reacciones radicales o reacciones pericíclicas. La siguiente
reacción, entre 1,3-butadieno y etileno, es una reacción de Diels-Alder: (una reacción pericíclica)
138
Observe que hay dos reactivos, pero solo un producto, porque los dos reactivos
se unen para formar un anillo de seis miembros. También note que los reactivos
tienen un total de tres enlaces π, mientras que el producto tiene solo un enlace
π:
139
La desaparición de dos enlaces π se acompaña
de la aparición de dos nuevos enlaces σ, que
forman el anillo de seis miembros:
140
El rendimiento de esta reacción es bastante pobre (~ 20%).
Sin embargo, el rendimiento aumenta drásticamente (lo que
hace que la reacción sea útil como técnica sintética) si
utilizamos un etileno sustituido, en el que el sustituyente es
un grupo captador de electrones (EWG):
141
El siguiente grupo resaltado es un ejemplo de un
grupo captador de electrones:
Para racionalizar por qué este grupo está retirando electrones, dibujamos las
estructuras de resonancia y nos enfocamos específicamente en la tercera
estructura resonancia. que se muestra a continuación:
142
Observe la posición de la carga positiva (resaltada) en la tercera
estructura de resonancia. La ubicación de este cargo indica que el
sustituyente retira la densidad de electrones del enlace π rico en
electrones. Cuando este compuesto reacciona con el 1,3-butadieno
en una reacción Diels-Alder, se observa que el rendimiento es muy
alto (∼100%):
143
A continuación se muestran otros ejemplos de grupos
aceptores de electrones (resaltados). Cada uno de
estos compuestos reaccionará con el 1,3-butadieno.
En una reacción de Diels-Alder para obtener un alto
rendimiento de producto
144
Para racionalizar por qué cada uno de estos grupos absorbe electrones, se
pueden dibujar estructuras de resonancia (tal como hicimos para el grupo
aldehído hace un momento).
Las reacciones de Diels-Alder proceden a través de un mecanismo que NO
involucra iones. Más bien, estas reacciones ocurren a través de un solo paso
concertado, en el que los electrones π se mueven en un anillo, como lo muestran
las siguientes flechas curvas:
145
Este proceso no involucra intermediarios, porque todo
sucede en un solo paso concertado. Se puede mostrar
que los electrones se mueven en un sentido horario,
como se muestra arriba, o en sentido antihorario, como
se muestra aquí:
146
Cuando se usa un etileno monosustituido en una reacción de
Diels-Alder, el producto contendrá un centro quiral (resaltado a
continuación):
147
Sin embargo, existen otros grupos funcionales que pueden
funcionar como dienophiles. El siguiente ejemplo muestra
un alquino que funciona como un dienófilo:
148
Ahora intentemos dibujar el producto que esperamos cuando se usa
ciclopentadieno como dieno en una reacción de Diels-Alder. Esperamos que el
átomo de carbono adicional (resaltado) permanezca en el producto.
149
Para dibujar este producto bicíclico, debemos considerar
donde los dos grupos aldehído estarán conectados en el
producto:
150
Cuando dibujamos el producto, debemos colocar los grupos aldehído en las
posiciones C5 y C6, como se muestra arriba. en el producto, recuerde que la
configuración del dienófilo debe conservarse en el producto. En este caso, el
dienófilo tiene un cis configuración, por lo que los dos grupos aldehído deben ser
cis entre sí en el producto, como se muestra en cada una de las dos estructuras
siguientes:
151
Estas son las dos estructuras que esperamos, sin embargo, la
reacción en realidad no produce ambas. De hecho, uno de estos
productos está muy favorecida: la estructura en la que ambos
grupos aldehído ocupan posiciones endo:
152
La posición endo se define como la posición que
está sincronizada con el puente más grande,
como se ilustra aqui:
153
Si el dienófilo esta trans substituido, entonces ambos
sustituyentes no pueden ocupar las posiciones endo en el
producto biciclico, porque la configuración trans del dienofilo
debe ser preservada. Entonces se obtienen dos productos
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