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Prácticamente todas las reacciones químicas que tienen lugar en los
seres vivos están catalizadas por enzimas. Los enzimas son
catalizadores específicos: cada enzima cataliza un solo tipo de
reacción, y casi siempre actúa sobre un único sustrato o sobre un
grupo muy reducido de ellos. En una reacción catalizada por un
enzima:
1. La sustancia sobre la que actúa el enzima se llama sustrato.
2. El sustrato se une a una región concreta del enzima, llamada centro
activo. El centro activo comprende (1) un sitio de unión formado por
los aminoácidos que están en contacto directo con el sustrato y (2) un
sitio catalítico, formado por los aminoácidos directamente implicados
en el mecanismo de la reacción.
3. Una vez formados los productos el enzima puede comenzar un nuevo
ciclo de reacción.
MODO DE ACCIÓN DE LAS ENZIMAS
En las reacciones espontáneas, los productos finales
tienen menos energía libre que los reactantes. Por tanto, en
las reacciones espontáneas se libera energía. Sin embargo, el
comienzo de la reacción requiere un aporte inicial de energía.
Esta energía inicial que hay que suministrar a los reactantes
para que la reacción transcurra se llama energía de
activación (Ea). Cuanto menor es la Ea más fácilmente
transcurre la reacción.
La acción de los catalizadores consiste,
precisamente, en disminuir la Ea
Las enzimas son catalizadores especialmente eficaces, ya que
disminuyen la Ea aún más que los catalizadores inorgánicos.
Por ejemplo, la descomposición del agua oxigenada (H2O2)
para dar H2O y O2 puede ocurrir sin catalizador, con un
catalizador inorgánico (platino), o con un enzima específico
(catalasa). Las respectivas Ea para cada proceso son 18, 12 y
6 Kcal./mol. Así, se puede calcular que el platino acelera la
reacción 20.000 veces, mientras que la catalasa la acelera
370.000 veces.
Para que una reacción química tenga lugar, las moléculas
de los reactantes deben chocar con una energía y una
orientación adecuadas. La actuación del enzima (1) permite
que los reactantes (sustratos) se unan a su centro activo con
una orientación óptima para que la reacción se produzca y (2)
modifica las propiedades químicas del sustrato unido a su
centro activo, debilitando los enlaces existentes y
facilitando la formación de otros nuevos.
E + S E-S E + P
•El sustrato se une al enzima a través de numerosas interacciones
débiles como son: puentes de hidrógeno, electrostáticas, hidrófobas,
etc., en un lugar específico , el centro activo. Este centro es una
pequeña porción del enzima, constituido por una serie de aminoácidos
que interaccionan con el sustrato.
Algunas enzimas actúan con la ayuda de estructuras no
proteicas. En función de su naturaleza se denominan:
1. Cofactor. Cuando se trata de iones o moléculas inorgánicas.
2. Coenzima. Cuando es una molécula orgánica. Aquí se puede
señalar, que muchas vitaminas funcionan como coenzimas y
realmente las deficiencias producidas por la falta de
vitaminas responden más bien a que no se puede catalizar una
reacción en la que la vitamina es la coenzima.
COFACTORES
Algunas enzimas dependen para su actividad
catalítica además de la estructura proteica, de
otras moléculas de naturaleza no proteica. Estas
estructuras reciben el nombre de cofactores.
Estos son resistentes al calor mientras que las
proteínas generalmente no lo son.
El complejo enzima – cofactor recibe el nombre de
holoenzima. A la fracción proteica aislada del
cofactor que es inactiva se la denomina apoenzima.
Los cofactores pueden ser simplemente iones
metálicos o en algunos casos moléculas orgánicas
complejas. Estas últimas el nombre de coenzimas.
Holoenzima = Apoenzima + Coenzima
VITAMINAS FUNCIONES Enfermedades carenciales
B1 (tiamina) Coenzima de las descarboxilasas y de las enzima que transfieren grupos aldehídos Beriberi
B3 (ácido
Constituyente de la CoA Fatiga y trastornos del sueño
pantotinico)
Vitamina D Calciferol
Vitamina E Tocoferol
Vitamina K Filoquinona
Dinucleótido de nicotinamida y adenina (NAD+)
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Coenzima A
Dinucleótido de flavina y adenina
(FAD)
Las primeras enzimas recibieron nombres
arbitrarios. Ejemplo: renina, papaína, tripsina,
protrombina, etc.
Algunas se designaron con nombres triviales, a
partir del sustrato sobre el que actuaban, seguido
de la terminación “ASA”. Ejemplo: Lipasas (lípidos),
proteasas (proteínas), amilasas (almidones) etc.
Otras enzimas recibieron su nombre a partir del
tipo de reacción que catalizaban. Ejemplo:
deshidrogenasas, isomerasas, etc.
La nomenclatura actual se basa en los lineamientos
fijados por la unión internacional de bioquímica
(IUB), utilizando un código de cuatro dígitos en el
cual:
El primer digito indica el grupo al que pertenece la
enzima: Oxidorreductasas, transferasas,
hidrolasas, liasas, isomerasas y ligasas.
El segundo digito indica la subclase: hidrolasa del
enlace ester reductasa descarboxilante, etc.
El tercer digito hace referencia a la clase de
reacción, con información respecto al sustrato
especifico, por ejemplo: establece la diferencia
entre un ester y un tioester.
El cuarto digito describe el sustrato especifico,
ejemplo: D-hexosa oxidasa, L-malato
deshidrogenasa.
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
Catalizan reacciones de oxidorreducción, es decir,
transferencia de hidrógeno (H) o electrones (e-) de un
sustrato a otro, según la reacción general:
AH2 + B A + BH2 Ared + Box Aox + Bred
Clase 2: TRANSFERASAS
Catalizan la transferencia de un grupo químico
(distinto del hidrógeno) de un sustrato a otro,
según la reacción:
A-B + C A + C-B
Un ejemplo es la glucoquinasa, que cataliza la
reacción representada en la Figura de la abajo:
glucosa + ATP ADP + glucosa-6-fosfato
Clase 3: HIDROLASAS