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Genética Evolutiva

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Genética evolutiva

Los genomas y el origen de la variación genética


 Primera Ley de Mendel: También llamada ley de la uniformidad, indica que, si se cruzan dos razas puras
para un determinado carácter, se obtendrá una F1 igual entre sí, tanto fenotípica como
genotípicamente.
 Segunda Ley de Mendel: También llamada principio de segregación. Se refiere a que, cuando dos
individuos F1 se cruzan (con genotipo Aa), darán lugar a F2, donde se recupera el fenotipo del individuo
recesivo parental (con genotipo aa), dando como resultado la aparición del genotipo parental recesivo
en una proporción de 1:4. En otras palabras, indica que cada individuo lleva un par de alelos para cada
característica o fenotipo; y cada alelo se separa o segrega, durante la formación de los gametos.
 Tercera Ley de Mendel: También llamada ley de distribución independiente, establece que los alelos de
dos o más genes diferentes, se reparten en los gametos de forma independiente el uno del otro, es
decir, el alelo de un gen que recibe un gameto, no influye en el alelo que recibe de otro gen. Esta ley no
se cumple universalmente, pues dependen de qué tan cercanos se encuentra un par de genes en el
mismo cromosoma.
 Hugo de Vries desarrolló la teoría mutacional de la evolución.
 La integración de la genética mendeliana con la teoría evolutiva, ocurrió con el trabajo de genéticos
poblacionales como R. Fisher, S. Wright, y J.B.S. Haldane. El trabajo de Fisher, demostró que la variación
continua (que describe caracteres que cambian gradualmente y tienen un rango de posibles valores)
puede ocurrir si la variación en diferentes genes, contribuye al fenotipo. Este trabajo, a su vez, sentó las
bases para la genética cuantitativa, que busca entender cómo afectan los genes la expresión y evolución
de caracteres complejos (es decir influenciados por muchos genes, a diferencia de los caracteres
Mendelianos, determinados por un solo gen).
 R. Fisher contribuyó a la genética evolutiva, la estadística, y el diseño experimental. Su libro The
Genetical Theory of Natural Selection, explica la teoría matemática de cómo la selección natural actúa en
los genes en poblaciones grandes.
 S. Wright también contribuyó a la genética evolutiva, por ejemplo, con su metáfora de los paisajes
adaptativos, y desarrolló la teoría de la deriva genética.
 J.S.B. Haldane, es conocido por investigar cómo la selección natural, flujo genético, y mutaciones,
afectan la frecuencia genética e interactúan entre si (en su libro The Causes of Evolution).
 Estos tres científicos fueron los principales artífices de la creación de la teoría sintética de la evolución,
que se resume en cuatro puntos:
o La evolución es un proceso gradual.
o Entender los procesos evolutivos requiere un pensamiento a nivel poblacional. La variación
genética existe dentro de una población, generada por mutaciones, recombinación, y flujo
genético. La evolución ocurre debido a cambios en la frecuencia alélica causados por la selección
natural y deriva genética, que actúan en las poblaciones.
o La selección natural es la fuerza dominante en la evolución. Esta actúa en el fenotipo de
individuos en poblaciones, de acuerdo a las condiciones reinantes, y causa cambios en la
frecuencia alélica en los genes que afectan a esos fenotipos.
o La macroevolución, es compatible con la microevolución.
 Desde la síntesis modera, la noción de que la selección natural es la fuerza dominante en la evolución,
era ampliamente aceptada. Pero M. Kimura (en 1968 y 1983), presentó una teoría alternativa, la teoría
neutra de la evolución molecular, que postula lo siguiente:
o La mayoría de los cambios evolutivos a nivel molecular son causados por la acción de la deriva
genética actuando en alelos que son selectivamente neutrales, y no causados por la selección
direccional.
o La mayoría de variación molecular presente en una especie en un tiempo dado, es
selectivamente neutral, y no es mantenida por selección de equilibrio.
o La mayoría de mutaciones son dañinas, y son removidas rápidamente por selección purificadora.
 En lugar de utilizar al gen como unidad evolutiva, se utiliza el termino locus, para señalar regiones
genómicas de interés para los biólogos evolutivos. Un locus simplemente se refiere a una locación
genómica específica. Puede significar un gen que codifica una proteína, un sitio de mutación no génico
que puede o no afectar al fenotipo o la aptitud, un marcador genético, o cualquier otro sitio de interés.
 Los factores ambientales pueden inducir cambios en la expresión génica, por medio de la metilación del
ADN, un proceso en el cual, un grupo metilo (CH3), es añadido a los nucleótidos de citosina o adenina,
causando que el gen pierda efectividad, o sea inactivado. Pero hay que tener en cuenta que estos
cambios epigenéticos no involucran cambios en el ADN, aunque estos pueden heredarse hasta dos
generaciones. No obstante, el cambio epigenético no es cambio evolutivo.
 Para estudiar empíricamente genética evolutiva, necesitamos generar información molecular de los
organismos bajo estudio, y utilizar herramientas analíticas (estadísticas) para interpretar la información.
Junto a la información de expresión fenotípica y genética, la variación en las secuencias de ADN, y
marcadores genéticos, constituyen las principales fuentes de información en el estudio empírico de la
genética evolutiva.
 La electroforesis es una técnica estándar y multipropósito en el estudio de evolución. Se utiliza
principalmente para separar (genotipificar) marcadores genéticos que exhiben polimorfismos de
longitud, como los microsatélites.
 La genotipificación es el proceso para determinar las diferencias en el genotipo de un individuo,
examinando la secuencia de su ADN, y comparándola con secuencias de referencia, o de otros
individuos.
 En años recientes, los marcadores asociados a sitios de restricción (RAD tags), se han vuelto populares
como método para generar y genotipificar, de manera rápida y barata, marcadores genéticos de todo el
genoma (genome-wide genetic markers). Utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento, las
secuencias que flanquean estos sitios de restricción se pueden determinar. Mapeando esta secuencia
obtenida con un genoma de referencia, se puede obtener el genotipo, un gran número de SNPs, y su
locación en el genoma.
 En la actualidad, debido a su elevado coste por corrida, y relativa baja velocidad, la secuenciación Sanger
no es el método principal a utilizarse para generar información de secuenciación. Sin embargo, la
precisión es todavía su mayor activo, y es ocasionalmente utilizada para verificar hallazgos de secuencias
que han sido identificadas utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento.
 La aplicación de lenguajes de programación, estadística, y visualización de datos para la información
genética, es referida como bioinformática. En pocas palabras, es el uso de la computación para investigar
adecuadamente la HTS.
 Una parte crucial de la revolución HTS ha sido una tendencia hacia la ciencia reproducible y abierta al
público. El grueso de esta información se encuentra almacenada en bases de datos online, como por
ejemplo: NCBI (National Center for Biotechnology Information), ENA (European Nucleotide Archive),
GOLD (Genomes Online Database).
 La transposición replicativa tiene efectos de gran escala en la evolución de los genomas. Un elemento
transponible activo puede producir múltiples copias de si mismo a una tasa acelerada, y si no es
destruido por mutaciones, las copias pueden replicarse después de ser integradas al genoma del
hospedador.
 La transposición es el principal mecanismo de mutación que causa repeticiones intercaladas en el
genoma, y es uno de los factores más potentes para el crecimiento en tamaño del genoma. Una gran
proporción de la variación del tamaño del genoma entre eucariotas, puede atribuirse fluctuaciones
pasadas y presentes en la actividad de transposición. Los pseudogenes inactivados de elementos
transponibles, pueden ser clasificados como ADN no funcional.
 Los efectos de estos ETs pueden, ocasionalmente, ser positivos. Por ejemplo, los retrovirus pueden
funcionar como vectores para transferir horizontalmente un gen de una especie a otra, donde el gen
transferido adopta una nueva función en su nuevo huésped.
 Una mutación es un cambio permanente en la secuencia nucleotídica en el genoma de una célula de un
organismo, aunque también se utiliza para describir el efecto fenotípico que una alteración de ADN
podría tener. En biología evolutiva, estamos interesados en la variación genética que es transmitida a
través de generaciones, y por lo tanto, las mutaciones de la línea germinal, aquellas que ocurren durante
la meiosis cuando los gametos se forman, son de primordial interés.
 Las mutaciones puntuales son sustituciones de un nucleótido por otro, en un sitio específico en el
genoma. Es más común que una purina (A, G), sea reemplazada por otra purina, a que una purina sea
reemplazada por una pirimidina (C, T), o viceversa. El reemplazo de una purina por otra purina, se llama
transición, mientras que el reemplazo de una purina (o pirimidina) por una pirimidina (o purina), se
llama transversión.
 Las mutaciones que no alteran la secuencia de aminoácidos, se llaman silenciosas o sinónimas. Las
mutaciones que causan que un aminoácido sea reemplazado por otro, se llaman “con cambio de
sentido” (missense). El segundo tipo de mutación no sinónima, se llama “sin sentido” (nonsense), porque
el codón que especificaba para un aminoácido, muta en un codón de terminación, provocando que la
proteína no sea sintetizada al completo, y que pierda su función. Las mutaciones no sinónimas son
blancos de la selección natural.
 El deslizamiento de replicación (replication slippage), es una forma de mutación que causa inserciones o
deleciones cortas y en tándem (e.g. CACACA) en el genoma durante la replicación, y es el principal
mecanismo mutacional para los microsatélites. Estas secuencias repetitivas en tándem, son muy
inestables, y forman un tallo-bucle, que puede causar un desajuste entre la cadena molde y la cadena
que se está sintetizando una vez que se vuelvan a realinear. Esto resulta en una o más unidades
repetidas extra añadidas, o incluso en menos unidades sintetizadas.
 Debido a su inestabilidad y susceptibilidad al deslizamiento de replicación, estas repeticiones cortas en
tándem (conocidas como microsatélites), son marcadores genéticos útiles, pues su alta tasa de
mutación, significa un alto número de alelos segregados en la población. Y cabe señalar que, dos
individuos no relacionados genéticamente, difícilmente tendrán exactamente el mismo genotipo en un
número de diferentes loci de microsatélites. Los genotipos de microsatélites multi locus, son como
huellas digitales moleculares: únicas para cada individuo.
 El deslizamiento de replicación, es uno de los mecanismos de mutación que explica las indels
(inserciones y deleciones) en el genoma. Estos indels pueden tener serias consecuencias si ocurren
dentro de las secuencias codificadoras. Una mutación por desplazamiento del marco de lectura (frame-
shift) distorsiona el marco de lectura de un gen, lo que da lugar a una proteína completamente
diferente. Esta proteína, seguramente será nociva para el organismo, lo que resultará en la selección
actuando en contra de esta.
 Durante la profase I del ciclo meiótico, los cromosomas homólogos se empatan, y es aquí donde ocurren
los eventos de recombinación, como el entrecruzamiento (crossing over). Uno de estos eventos de
recombinación, se llama conversión genética, donde un alelo ubicado en uno de los cromosomas
homólogos, dicta la secuencia del alelo ubicado en el otro cromosoma homólogo. Es decir, el segundo
alelo (por medio de enzimas de reparación del ADN), mutará, de modo que los gametos resultantes
llevarán el mismo alelo.
 Si existe un fallo en la alineación entre cromosomas homólogos durante la profase I, puede ocurrir un
entrecruzamiento desigual (unequal crossing over). Esto hace que uno de los cromosomas resultantes
obtenga una inserción, y el otro, una deleción (además de un deslizamiento de replicación). Este fallo en
la alineación puede ocurrir cuando los cromosomas tienen secuencias repetidas no homólogas (e.g.,
transposones). Debido a que estas secuencias repetidas son comunes, el entrecruzamiento desigual es
un fenómeno frecuente.
 Estas repeticiones de elementos transponibles pueden estar repartidas por todo el genoma, con la
consecuencia de que pueden ocurrir estos fallos en la alineación inclusive entre cromosomas no
homólogos. A este fenómeno se denomina translocación.
 Otras mutaciones genómicas de gran escala, como las inversiones, suponen una rotación de 180º de un
segmento de cromosoma.
 Los genomas de muchas especies, difieren en maneras que solo pueden ser explicadas por
entrecruzamiento desigual en algún momento de su evolución. Dicho esto, las mutaciones derivadas del
entrecruzamiento desigual pueden, ocasionalmente, ser beneficiosas, y fijarse por selección natural, o
deriva genética.
 El entrecruzamiento desigual puede llevar a una duplicación genética. Pero cabe señalar que un gen
duplicado no siempre resulta en la exaptación de nuevos genes con diferentes funciones. A veces, una
de las copias muta de manera que pierde su funcionalidad (pseudogen). Por ejemplo, una mutación en la
región promotora puede prevenir que una ARN polimerasa se acople, previniendo que el gen sea
transcrito.
 Mientras el deslizamiento de replicación es el mecanismo de mutación principal para secuencias cortas,
repetidas en tándem, como los microsatélites, el entrecruzamiento desigual explica la aparición de
repeticiones en tándem más largas.
 Algunos mecanismos aparentemente son los causantes de que los parálogos (genes originados por
duplicación) dentro de cada especie no evolucionen independientemente, sino que se mantengan
similares. Este fenómeno se llama evolución concertada. Los dos mecanismos que pueden explicar la
evolución concertada, son: 1) conversión genética, y 2) entrecruzamiento desigual.
 Es posible que algunos genes hayan aparecido por acción de diversas mutaciones en secuencias de ADN
no codificadores, pero es más probable que nuevos genes hayan aparecido por eventos de duplicación, y
divergencia subsiguiente.
 Nuevas funciones genéticas pueden originarse por medio del barajado de exones (exon shuffling). Aquí,
uno o más exones de un gen, se insertan en un gen diferente. También ocurre cuando los exones dentro
de un gen, se duplican. El número de genes que han evolucionado por el barajado de exones, es mucho
mayor en animales que en otros eucariotas.
 Entre las fuentes de variación genética externa, tenemos a la introgresión, que ocurre cuando uno o más
genes de una especie, pueden transferirse a otra, por medio de hibridación. Cabe señalar que la mayoría
de las veces, el híbrido será estéril, o inviable, pero en casos particulares, el híbrido puede ser capaz de
reproducirse.
 Una de las diferencias entre la variación genética que se origina por mutación, y por introgresión, es que
las mutaciones son cambios aleatorios, mientras que las variantes por introgresión han sido modeladas
por selección natural. Por lo tanto, los alelos obtenidos por introgresión podrían tener una mayor
probabilidad de ser beneficiosos, y contribuir a la adaptación, que una mutación aleatoria. Por ejemplo,
muchos casos de mimetismo mulleriano, han sido posibles gracias a la introgresión, donde determinados
genes involucrados en el mimetismo, han sido transferidos entre especies relacionadas por medio de la
hibridación introgresiva.
 La transferencia horizontal de genes, es otro ejemplo donde se pueden compartir genes entre
organismos distantemente relacionados, sin necesidad de que estos se reproduzcan entre sí. Este
mecanismo es más común en bacterias y arqueas, pero se sabe de casos donde también ha ocurrido en
eucariotas. Por ejemplo, en casos donde la relación entre bacterias y sus hospedadores es tan intima,
que ha resultado en los últimos incorporando ADN bacteriano. Los virus son otro ejemplo, donde
funcionan como vectores para la transferencia horizontal genética.

Cambios en la frecuencia alélica y genotípica

 La evolución es el cambio en caracteres heredables de las poblaciones a lo largo de generaciones


sucesivas. Es decir, cambios en su composición genética.
 La genética de poblaciones se encarga de responder cómo los diferentes procesos demográficos y
evolutivos, afectan la variación genética dentro y entre poblaciones, para así poder reconstruir su
historia evolutiva.
 La genética de poblaciones se basa en modelos teóricos abstractos, y son una aproximación de la
realidad. De esta manera, es una herramienta para desarrollar una expectativa de los patrones que
podríamos observar con datos empíricos.
 Vamos a empezar con el caso más simple, investigando un único locus con dos alelos que se segregan.
 En un locus dado, podemos denotar la frecuencia de un alelo A1, como p, y la frecuencia de un alelo
alternativo A2, como q. Por otra parte, la frecuencia de los genotipos se denota como g, con subíndices
que indican los alelos que conforman el genotipo. Por ejemplo:
o A1A1 sería g11.
o A1A2 sería g12.
o A2A2 sería g22.
 En una población, la frecuencia fenotípica y/o alélica en un locus, puede cambiar si:
1. Ocurre apareamiento no aleatorio (non-random mating). Por ejemplo, si hay endogamia o
exogamia.
2. Los alelos están sujetos a deriva genética.
3. Ciertos genotipos podrían tener efectos fenotípicos que potencian la probabilidad del individuo
de sobrevivir o reproducirse, en relación a individuos con otros genotipos. En este caso, habrá
selección natural que puede afectar tanto a la frecuencia de alelos, como a la genotípica.
4. Un alelo puede mutar en otro diferente debido a errores durante la meiosis, que puede ser
heredado a la siguiente generación.
5. Existe un influjo de alelos de una población diferente, que puede terminar cambiando la
composición genética de una población.
 Para investigar cómo estos cinco procesos afectan la composición genética de una población en términos
cuantitativos, hay que tener un modelo nulo, es decir, la relación esperada entre las frecuencias alélicas
y fenotípicas si no estuvieran operando ninguno de estos cinco procesos.
 A este modelo nulo para el caso de un solo locus, se le conoce como modelo de Hardy-Weinberg. Este es
un modelo simple, que da cuenta de la relación entre las frecuencias alélicas y las frecuencias
genotípicas en una población ideal, es decir, una que no esté sujeta a procesos evolutivos. En pocas
palabras, una población cumple con el modelo de Hardy-Weinberg si:
1. Los individuos se aparean de manera aleatoria.
2. La población tiene un tamaño infinito (no hay deriva genética).
3. No ocurre selección.
4. No ocurre mutación.
5. No ocurre flujo genético.
 Volviendo al ejemplo con dos alelos que se segregan, A1 y A2, La frecuencia de A1 es p, y la frecuencia de
A2 es q. Entonces, la probabilidad de formar un individuo homocigoto A1A1, es la probabilidad de
combinar un espermatozoide A1 con un ovulo A1, es decir:
2
p × p= p
 La probabilidad de formar un individuo homocigoto A2A2, es:

2
q × q=q

 Y existen dos maneras de que se formen individuos con genotipos heterocigotos A1A2: un
espermatozoide A1 puede fertilizar un ovulo A2, o un espermatozoide A2 puede fertilizar un óvulo A1, en
ambos casos, la probabilidad es la misma pq, y la probabilidad combinada será 2 pq .
 Siendo así, las frecuencias genotípicas esperadas en el modelo Hardy-Weinberg son:

2
E ( g11 )= p
E ( g12 )=2 pq
2
E(g 22)=q

 Entonces, pongamos un ejemplo: se genotipan, de una población, 100 individuos diploides para un locus
determinado, y se encuentra que 9 individuos tienen el genotipo A1A1, 42 individuos tienen el genotipo
A1A2, y 49 individuos tienen el genotipo A2A2. La frecuencia de A1 es p, y la de A2 es q. El número total de
alelos es 200, porque los 100 individuos son diploides, y el número de alelos A1 y A2 es:

A1=2× 9+42=60
A2=2× 49+ 42=140
La frecuencia alélica es:
p=60/200=0 ,3
q=140 /200 o 1−0 , 3=0 , 7

Entonces, una vez obtenida la frecuencia alélica, calculemos la frecuencia observada de los genotipos
A1A1, A1A2, y A2A2:
g11 =9/100=0 , 09
g12=42/100=0 , 42
g22=49/100=0 , 49

Ahora, veamos si las frecuencias genotípicas observadas, que acabamos de calcular, cumplen con la
expectativa del modelo Hardy-Weinberg. Las frecuencias genotípicas esperadas son:

2 2
E ( g11 )= p =0 ,3 =0 , 09
E ( g12 )=2 pq=2× 0 ,3 × 0 ,7=0 , 42
2 2
E ( g22 )=q =0 ,7 =0 , 49

Si comparamos la frecuencia genotípica observada con la frecuencia genotípica esperada, vemos que
son prácticamente iguales, y no hay un desvío de lo que se espera según el modelo de Hardy-Weinberg.
 Cabe señalar que, para que nuestra muestra no cumpla con la hipótesis nula (modelo H-W), y sea
rechazada, debe tener una probabilidad bastante baja P ≤ 0 ,05 . Si la probabilidad es superior a este
límite de significancia, no se puede rechazar la hipótesis nula del equilibrio de H-W. La prueba estadística
a utilizar es la prueba de chi cuadrado X 2 .
2
2 (observada−esperada)
x =Σ
esperada

Mientras X2 se vuelve más grande, la probabilidad de que la diferencia entre observada y esperada se
deba solo a muestreo azaroso, se reduce. Otra manera de ponerlo, es que las frecuencias observadas y
as frecuencias esperadas empiezan a diferenciarse cada vez más, y esto vuelve improbable que la
hipótesis nula H-W sea explique el proceso que está determinando las frecuencias genotípicas.
Por poner un ejemplo, un valor X2 de 7,46 con 1 grado de libertad tiene una probabilidad de entre 0,01 y
0,001. Esto quiere decir que las frecuencias genotípicas observadas deberían observarse menos del 1%
de las veces en una población que verdaderamente presente las frecuencias genotípicas esperadas H-W.
Bajo la hipótesis nula, no esperamos mucha diferencia de las expectativas H-W. Por convención, como ya
mencionamos, rechazaremos el azar como explicación de las diferencias si X2 tienen una probabilidad de
0,05 o menos. En otras palabras, si el azar explica la diferencia en cinco pruebas de cien, o menos,
entonces rechazamos la hipótesis de que las frecuencias observadas y esperadas son la mismas.
 En poblaciones reales, las suposiciones del modelo de Hardy-Weinberg nunca se cumplen, pues no
existen poblaciones infinitas. Pero este modelo sigue siendo útil, no por que sea realista, sino porque las
violaciones a las suposiciones del modelo indican que la composición genética de las poblaciones ha sido
afectada.

Apareamiento no aleatorio

 Endogamia (Inbreeding) y exogamia (Outbreeding)


 Claramente, si los alelos no fuesen combinados de manera aleatoria durante la fertilización, las
frecuencias genotípicas de la siguiente generación se desviarían de la expectativa Hardy-Weinberg.
 La endogamia es una forma de apareamiento no aleatorio, donde los individuos son mas propensos a
aparearse con otros individuos genéticamente relacionados. El ejemplo de endogamia más extremo es la
auto fertilización, común en muchas plantas, y algunos animales.
 Consideremos el siguiente ejemplo, tenemos una población en equilibrio H-W en un locus con dos
alelos, A1 y A2. Pero ¿qué ocurre si empieza a producirse endogamia? Si los heterocigotos A1A2 se auto
fertilizan, producirán descendencia que, en promedio, 25% serán A1A1, 50% serán A1A2, y 25% serán A2A2.
Es decir, solo la mitad de la descendencia de heterocigotos que se auto fertilizan, serán heterocigotos. Y
de esto, se deduce que, por cada generación que salga de una población que se auto fertiliza, la
frecuencia de los heterocigotos se reducirá en un 50%. Y si esta endogamia continua, la población
eventualmente terminará siendo homocigótica.
 Las formas menos extremas de endogamia, como el apareamiento entre individuos relacionados,
también produce a la larga el mismo resultado, pero de forma mucho más lenta.
 La exogamia, es lo opuesto a la endogamia, donde es menos propenso que los individuos se apareen con
sus parientes, de lo que se esperaría en una población que se aparea aleatoriamente.
 El apareamiento entre individuos no relacionados, resultará con mayor frecuencia en descendencia
heterocigótica, justamente porque, al no descender de un antepasado muy inmediato, tienden a poseer
alelos diferentes. Entonces, la exogamia producirá más heterocigotos de lo que se espera de una
población en equilibrio H-W.
 Una de las consecuencias de la endogamia es que, alelos raros, recesivos y dañinos se pueden combinar
en genotipos homocigotos. Esto produce baja viabilidad y/o fertilidad de los individuos, lo que reduce la
aptitud promedio de la población, fenómeno que se denomina depresión endogámica.
 La selección natural, siendo el caso, tenderá a favorecer características que reduzcan la probabilidad de
endogamia. Y esto, a su vez, va a resultar en un exceso de heterocigotos (exogamia).

 Apareamiento selectivo (Assortative Mating) y apareamiento disasortativo (Disassortative Mating)


 El apareamiento no aleatorio no se restringe a la endogamia y exogamia. El apareamiento selectivo es el
apareamiento preferencial entre individuos que tienen en mismo fenotipo y/o genotipo.
 El apareamiento disasortativo, es el apareamiento preferencial entre individuos con diferentes
genotipos y/o fenotipos.
 La endogamia y el apareamiento selectivo tienen el mismo efecto en las frecuencias genotípicas, ambos
reducen la proporción de heterocigotos en relación a la expectativa Hardy-Weinberg (HWE). Por otra
parte, la exogamia y el apareamiento disasortativo incrementan el número de individuos heterocigotos
en relación a la expectativa Hardy-Weinberg.
 La diferencia entre estos pares de factores, es que la endogamia y la exogamia tienen efectos en todos
los loci polimórficos del genoma, afectando la heterocigosis en todos estos; mientras que el
apareamiento selectivo y disasortativo, solo tienen efectos locales en la heterocigosis de un solo locus (o
loci) que determinan la preferencia de apareamiento en los individuos.

 Coeficiente FIS
 El apareamiento no selectivo es un factor muy importante que causa desviaciones del HWE en las
poblaciones.
 El coeficiente FIS, llamado también coeficiente de endogamia, mide la diferencia entre la heterocigosis
esperada (HWE) y la heterocigosis observada:

H S−H I
F IS =
HS

Donde HS es la frecuencia esperada de los heterocigotos en HWE, y HI es la frecuencia observada de


heterocigotos. Cabe destacar que FIS será 0 en HWE. Será positivo cuando HS>HI, es decir, que haya
déficit de heterocigotos; y será negativo cuando HS<HI, es decir, que haya exceso de heterocigotos. FIS
será 1 cuando no existan heterocigotos en la población, incluso si existe la presencia de múltiples alelos,
como sería el caso de una población completamente endogámica.
Entonces, por ejemplo, si un valor hipotético de FIS es de 0,333, querrá decir que la frecuencia de
heterocigotos es 33.33% mayor de lo esperado por el modelo de Hardy-Weinberg.
 En otras palabras, este coeficiente es definido como la probabilidad que tiene un individuo, seleccionado
de manera aleatoria, de tener dos alelos en un locus, que sean idénticos por descendencia (heredados
de un mismo ancestro sin que exista recombinación) en relación con la población base, de la cual se
asume que todos los alelos tienen su origen. Y este coeficiente refleja el grado de endogamia en una
población.

 Coeficiente FST
 Los efectos del apareamiento no aleatorio en las frecuencias genotípicas, puede medirse al comparar la
frecuencia genotípica HW esperada de heterocigotos, que asume apareamiento aleatorio, con las
frecuencias heterocigóticas observadas en una población. Esta comparación recibe el nombre de
coeficiente de fijación, y es comúnmente utilizado para comparar cuánta heterocigosis está presente en
una población, en relación a los niveles de heterocigosis esperados bajo apareamiento aleatorio.
 Es estructuralmente idéntico a FIS, pero incluye otros estimados de heterocigosis:

H T −H S
F ST =
HT

Donde HT es la heterocigosis esperada de acuerdo al modelo HW, asumiendo apareamiento aleatorio en


toda la metapoblación (poblaciones más o menos aisladas genéticamente, lo que afecta su composición
genética), y HS es el promedio de heterocigosis esperada, asumiendo apareamiento aleatorio solo dentro
de las poblaciones.
Un valor de 0 entre dos poblaciones, significa que no existe diferencia en la heterocigois esperada a nivel
de metapoblacion o de subpoblación. Un valor de 1 significa que las subpoblaciones que componen la
metapoblación, tienen alelos diferentes.
 En otras palabras, este coeficiente se utiliza como una medida de las diferencias genéticas entre
poblaciones (y especies). Por ejemplo, si se obtiene un FST de 0.048 entre dos subpoblaciones que
componen una metapoblación, quiere decir que difieren genéticamente entre sí en un 4.8%.

Deriva genética – evolución en poblaciones finitas


 Las poblaciones en la naturaleza nunca son infinitas, y por tal razón, tienen efectos en la frecuencia de
alelos y a la larga, consecuencias evolutivas.
 Mientras más pequeña a población, más fuerte será el impacto. Este cambio evolutivo, que se produce
por eventos aleatorios, se denomina deriva genética. Una fuente importante de deriva genética es la
selección aleatoria de alelos que toma lugar en la fertilización. Y puede ocurrir que algunos padres
produzcan un exceso de cierto genotipo. Consideremos la selección aleatoria (Random Sampling) en una
población muy pequeña:
Un par de padres heterocigotos A1A2 X A1A2 puede producir descendientes que todos sean A1A1. Lo
primero a considerar, es que debemos asumir que todas las suposiciones H-W se cumplen, excepto el
tamaño de la población, que sería finito y pequeño. Asumiremos que el número de individuos es N=8,
y consideraremos un locus con dos alelos. Para simplificar, asumiremos que ambos alelos son igual de
frecuentes, es decir p=q=0.5, y que la población está en equilibro H-W (que los individuos se aparean
aleatoriamente, no hay selección, ni mutación, ni flujo genético). Entonces, de los 8 individuos, hay 2 con
cada genotipo homocigótico A1A1, A2A2, y 4 individuos con genotipos heterocigóticos A1A2.
Ahora, dejamos que estos individuos se apareen aleatoriamente para producir la siguiente generación.
Hacen esto para reemplazarse, es decir, 8 nuevos individuos.
Debido a que las probabilidades de los dos alelos presentes, son las mismas, podemos obtener las
siguientes combinaciones, como si se tratase de lanzar una moneda 16 veces. En este ejemplo,
supongamos que se obtienen 0 A1A1, 6 A1A2, 2 A2A2. Entonces, la frecuencia de A1 es p ’=6/16=0.375, y
la de A2 es q ’=0.625.
Si nos fijamos, una generación de selección aleatoria ha llevado a un cambio dramático en la frecuencia
alélica: de p=0.5 a p ’=0.375. Pero si calculamos la frecuencia genotípica y X2 nos da una P=0.237.
Es decir, la desviación de HWE no es significativa en la nueva generación.
 Del ejemplo anterior, podemos concluir que la selección aleatoria de alelos en una población finita lleva
a cambios en la frecuencia alélica. Sin embargo, mientras el apareamiento sea aleatorio, ningún cambio
en la frecuencia genotípica relativa a HWE ocurre.
 La selección aleatoria de alelos podrá variar, a veces, p’ será mayor que p inicial, a veces será menor, y
otras, exactamente igual. Es decir, siempre habrá una variación, y a esta variación se la puede definir
como:
p(1−p)
V=
2N

Esta varianza constituye la fuente de evolución por deriva genética. Mientras menor sea el tamaño
poblacional N, mayor será la varianza, y por lo tanto, mayor será el cambio promedio en la frecuencia
alélica de una generación a otra. Por el contrario, mientras mayor sea el tamaño poblacional, la varianza
V se aproximará a cero, y no se producirá deriva genética.
 A lo largo del tiempo, en cada generación, la selección aleatoria de alelos ocurrirá. A veces, el alelo A1
aumentará de frecuencia por puro azar de una generación a la siguiente, otras veces, decrecerá. Y la
única manera en la que este vaivén por deriva genética se detenga, es que algo ocurra que lleve al alelo
A1 a la fijación, o que lo elimine de la población. En el caso de que se fije, no ocurre más la evolución por
deriva genética, porque ya no hay variación en ese locus. La deriva genética solo puede continuar si
ocurre una nueva mutación, o si aparece una nueva variante genética por medio de flujo genético.
 La probabilidad de que un alelo dado se fije o desaparezca, depende de la frecuencia inicial de ese alelo.
Por ejemplo, si A1 y A2 son igual de frecuentes, cualquiera de los dos puede fijarse o ser eliminado. Y la
probabilidad de que un alelo se fije en el futuro, depende de su frecuencia actual. Si ocurre una
mutación, la probabilidad de que esta se fije en la población por deriva sería 1/2 N , que es mucho más
probable en una población pequeña.
 En otras palabras, la deriva genética ocurre cuando una muestra aleatoria y no representativa de una
población, produce la siguiente generación. Por tal razón, mientras más pequeña es una población, la
frecuencia de los alelos fluctuará de manera más dramática, y relativamente pronto, uno de los alelos en
cuestión se fijará, o se perderá. Es decir, la deriva genética aumenta a medida que el tamaño de la
muestra utilizada para producir la siguiente generación, se reduce. Lo contrario ocurre con poblaciones
grandes, es decir, la frecuencia de alelos no cambia mucho por causa de la deriva genética, y la pérdida
de alelos por este mecanismo, tomará mucho más tiempo.
 El modelo Wright-Fisher de deriva genética utiliza suposiciones idénticas al modelo H-W, con la
excepción de que en el primero, se supone una población finita. Otras suposiciones del modelo W-F son:
o Los adultos se reproducen de manera sincronizada, y una sola vez en su vida (para evitar que las
generaciones se solapen).
o El número de machos y hembras es parejo.
o El tamaño de la población (N), se mantiene constante en el tiempo.
o Todos los individuos producen gametos, y todos los gametos son viables. Es decir, no hay
selección natural.
 Con estas cuatro suposiciones simplificadas, es posible aproximarse al efecto real que tiene la deriva
genética en poblaciones biológicas.
 La deriva genética es comúnmente modelada y demostrada desde la perspectiva de la frecuencia alélica,
porque es más sencillo condensar un locus dialélico en una población como dos frecuencias alélicas,
antes que tres frecuencias genotípicas. Sin embargo, recordar que las frecuencias genotípicas también
resultan afectadas por la deriva genética, pues los cambios en las frecuencias genotípicas, son
consecuencia de los cambios en las frecuencias alélicas debido a la deriva genética.
 Mientras más baja sea la frecuencia inicial de un alelo en una población, más frecuente será la pérdida
de este alelo. Por el contrario, mientras más alta sea la frecuencia inicial del alelo, mayor es la
probabilidad de que sea fijado.

probabilidad de fijación de alelo=frecuencia alélicainicial

probabilidad de pérdida de alelo=1−frecuencia alélicainicial

 Bajo el modelo W-F, se puede llegar a las siguientes conclusiones respecto a la acción de la deriva
genética en poblaciones finitas:
o La dirección del cambio en la frecuencia alélica es aleatoria.
o La magnitud de las fluctuaciones aleatorias en las frecuencias alélicas, de generación en
generación, incrementa a medida que el tamaño de la población decrece,
o La pérdida o la fijación representan el estado de equilibrio si no existe otro proceso que
contraponga a la deriva genética (por ejemplo, reintroducción de variación genética).
o La deriva genética cambia la frecuencia alélica, y por consiguiente, la frecuencia genotípica.
o La probabilidad de una fijación eventual de un alelo, es igual a su frecuencia inicial; mientras que
la probabilidad de que un alelo se pierda es igual a 1 menos su frecuencia inicial.
 Para la deriva genética considerada bajo el modelo W-F, los alelos que sean igual de frecuentes, es decir
p=q=0.5, presentarán la máxima variabilidad en cuanto a fluctuaciones en su frecuencia, en una
muestra de tamaño determinado. A esta fluctuación se denomina error estándar, que es la desviación
estándar de la media, es decir, la desviación del valor que se esperaría de la frecuencia alélica p y q.
Siendo así, el error estándar de la frecuencia alélica decrece a medida que la frecuencia alélica alcanza la
fijación, o la pérdida: la desviación estándar es 0 cuando las frecuencias alélicas son 0 o 1, porque no
existe variación genética, y cualquier tamaño de muestra va a reproducir fielmente la frecuencia alélica
de la población de la que es tomada.

 Cuando los alelos son igual de frecuentes, el error de muestreo es igual de propenso a incrementar o
reducir la frecuencia alélica, y producir un mayor rango de resultados posibles, equivalente a un mayor
efecto de deriva genética.
 En pocas palabras, una población es más propensa a experimentar mayores cambios en su frecuencia
alélica, hacia la fijación o pérdida, debido a la deriva genética, cuando ambos alelos tienen frecuencias
similares. Por otra parte, una población con una frecuencia alélica muy desigual, es menos propensa a
experimentar deriva genética de la misma magnitud.

Basándonos en la figura de arriba, podemos comprobar que los alelos cercanos a la fijación o a la pérdida, no
necesitan demasiado tiempo para fijarse o perderse. Y un alelo inicialmente muy cercano a la fijación (o
pérdida), necesitaría mucho más tiempo (si el tamaño de la población N es muy grande), para alcanzar la
condición opuesta (de perderse o fijarse, respectivamente). Cabe destacar también que, las curvas que
vemos para los tiempos de fijación, pérdida, y segregación, tienen la misma forma que la mostrada en la
figura, no importa el tamaño de la población. El tamaño de la población solo influye en el número
promedio de generaciones que transcurrirán antes de alcanzar una de las mencionadas condiciones.

 Hardy-Weinberg y poblaciones reales


 El apareamiento no aleatorio tiene un efecto inmediato en las frecuencias genotípicas en relación a
HWE; la deriva genética afecta las frecuencias alélicas, y causa que las poblaciones diverjan; la selección
natural puede tener un rango de efectos en las frecuencias genotípicas y alélicas dependiendo de su
naturaleza; mientras que las mutaciones y el flujo de genes, son fuentes de nueva variación sobre la que
tanto la selección natural, como la deriva genética pueden actuar, para producir cambio evolutivo.
 Sin embargo, en poblaciones reales, estos factores no operan aisladamente. En una población finita, un
locus afectado por la selección natural, simultáneamente se verá afectado por la deriva genética. Por
ejemplo, una mutación favorable puede perderse por deriva genética al tener una frecuencia muy baja
en la población, teniendo esta (deriva) más peso que la selección natural. Por otra parte, un alelo puede
fijarse por deriva incluso si la selección actúa en su contra. De esto se concluye que la selección es una
fuerza mucho más efectiva cuando el tamaño de la población es grande.

 Tamaño efectivo de la población


 Un acervo genético (gene pool), es el número de alelos en un número de genes diferentes que se
segregan a lo largo de las generaciones. Por lo tanto, el número total de individuos en una población, es
un mal predictor del tamaño del acervo genético, porque muchos individuos no se reproducen, y estos
alelos no contribuyen al acervo genético de la población.
 Adicionalmente, los alelos que se segregan en una población pueden variar entre loci. Por ejemplo,
muchos loci en el genoma no son diploides (cromosomas sexuales), lo que significa menos copias
segregándose en relación con los loci autosómicos. Y por tal razón, la deriva genética actuará con mayor
rapidez en estos loci.
 Un locus bajo selección direccional tenderá a tener, a lo largo de las generaciones, menos alelos
segregándose si comparamos con un locus no afectado por esta.
 El tamaño efectivo de una población (Ne), es un estimador importante del tamaño del acervo genético, y
se define como el tamaño de una población ideal que experimenta la misma cantidad de deriva genética
que una población real, sin importar su tamaño total N (census). En otras palabras, el tamaño efectivo es
el número de individuos que contribuyen gametos (y alelos) a la siguiente generación.
 La población ideal es aquella donde el apareamiento es aleatorio, y todos los individuos contribuyen de
igual manera a la reproducción, donde la ratio de sexos es igual, el tamaño de la población es constante,
no ocurre selección, y las generaciones no se solapan.
 El tamaño efectivo de la población varía entre loci (porque muchos no son diploides, son ligados al sexo,
o se encuentran en organelos que se heredan solo de la madre), y por tanto, Ne es una estadística que
mide cuantas copias de un locus se segregan en una población.

p(1− p)
N e=
2V actual

Donde Vactual es la varianza en la frecuencia alélica después de una generación de muestreo aleatorio en una
población real bajo consideración.

 Recuerda que, de manera general N e < N .

La teoría de la selección natural

 En genética de poblaciones, se asigna la adecuación (fitness) al efecto fenotípico que produce un


genotipo. Por ejemplo, individuos que posean el genotipo A1A1, tendrán una adecuación más elevada
que aquellos individuos con genotipo A2A2, si producen un mayor número de descendencia superviviente
en promedio.
 Por ejemplo, consideremos una planta con flor que tiene dos alelos que codifican diferentes pigmentos.
Los individuos A1A1 expresan flores con pigmentos más seductores, y atraen, en promedio, más
polinizadores que los individuos A2A2. Por tal razón, los individuos A1A1 producirán, en promedio, más
descendencia. Pero tener en cuenta que un individuo A1A1 escogido al azar, podría atraer menos
polinizadores que un individuo A2A2 escogido al azar.
 De lo anterior, se debe entender que la adecuación como la característica determinada por individuos
que exhiben una característica determinada que, en promedio, les permita engendran más
descendientes, debido a una relación causal entre la característica y la supervivencia/fecundidad del
individuo.
 La adecuación no se restringe a genotipos. En muchos casos, esta puede variar cuando existen
caracteres continuos. Por ejemplo, en muchos peces, existe una relación positiva entre el tamaño de la
hembra, y la fecundidad.
 Existen muchos tipos de selección, que se pueden clasificar de la siguiente manera:
o Selección estabilizadora: ocurre cuando los valores de un carácter, que se encuentren cercanos
a la media de la distribución, suelen ser preferidos a aquellos ubicados en los extremos de la
misma.
o Selección disruptiva: ocurre cuando los valores de un carácter, que presentan valores
intermedios en su distribución, no son preferidos en relación con aquellos valores ubicados en
los extremos de la distribución.
o Selección direccional: ocurre cuando los valores de un carácter, son preferidos cuando son
mayores, o menores en relación a la media.

 Hay que tener en consideración que los caracteres fenotípicos son determinados tanto por factores
genéticos, como por factores ambientales. Y adicionalmente, hay que entender que las diferencias en
adecuación de los fenotipos, resultarán en cambios evolutivos siempre y cuando sean heredables.
 Las diferencias de adecuación entre genotipos y/o fenotipos, pueden describirse en ocasiones como
diferencias en la supervivencia de sus portadores; y en otras como diferencias en la fecundidad.
 Es posible asignar adecuación a entidades diferentes que compartan propiedades fenotípicas. Estas
entidades pueden ser genes, individuos, grupos familiares, y poblaciones.
 En esencia, la selección natural es un proceso de crecimiento poblacional. Se puede entender con el
siguiente modelo:
N t +1=λ N t

Donde Nt+1 es el número de individuos una generación en el futuro, que es un producto del número de
individuos presentes actualmente en la población (Nt), y la tasa de incremento finita ʎ.
Esta ecuación representa un modelo de crecimiento poblacional sin límite, ʎ representa la diferencia
entre el número de individuos muertos, y el número de individuos nacidos cada generación. Si las
muertes se igualan a los nacimientos, ʎ=1, y la población no cambia de tamaño; si los nacimientos
superan las muertes, ʎ>1 y la población crece; finalmente, si las muertes superan los nacimientos, ʎ<1 y
la población decrece.
 La selección natural puede entenderse como un caso especial de este modelo de crecimiento, donde
cada genotipo tiene su propia tasa de crecimiento. Entonces, consideremos una población con un locus
con genotipo A y B, con sus propias tasas de crecimiento (también llamada adecuación absoluta),
tendríamos que la proporción de cada genotipo con respecto a la población total en cualquier
generación sería:
NA NB
p= q=
N A+ N B N A+ N B
Donde NA+NB es el tamaño total de la población.
Entonces, suponiendo que ambos genotipos inician con un mismo número de individuos, y por lo tanto,
igual proporción, y adicionalmente, suponiendo que el genotipo A crece un 3% por generación (ʎ=1.03),
y que el genotipo B crece solo 1% por generación (ʎ=1.01), tenemos los resultados mostrados en la
siguiente figura.

El gráfico a) nos muestra que ambos genotipos incrementan en número en el tiempo. Y el gráfico b) nos
muestra que los genotipos crecen a ritmos o tasas diferentes, logrando que sus respectivas proporciones
en la población cambien en el tiempo; lo que es equivalente a decir que el genotipo A es favorecido por
la selección natural, al poseer este un nivel superior de adecuación absoluta.

 La adecuación absoluta (absolute fitness) es la tasa de crecimiento específica del genotipo que predice el
número absoluto de individuos de un genotipo dado en una población a lo largo del tiempo. En otras
palabras, indica el éxito reproductivo esperado de los individuos con un genotipo específico, y que
forman parte de una población.
 La ratio de las tasas de crecimiento específicas de los genotipos (ʎA y ʎB), se denomina adecuación
relativa (relative fitness), y se representa por el símbolo w en modelos de selección natural con
generaciones discretas, es decir, las que no existen simultáneamente, e.g., en ciertas plantas, todos los
adultos mueren antes de que la nueva generación germine. La adecuación relativa se expresa así:

λA
w A=
λB

λB
wB=
λA
 Cuando w=1.0, los dos genotipos tienen tasas de crecimiento idénticas, y la proporción de ambos se
mantiene constante en la población en el tiempo. Si w>1.0, entonces el genotipo en el numerador crece
más rápido que el del denominador. Por otra parte, si w<1.0, el genotipo en el numerador crece más
despacio que el del denominador, lo que representará una reducción en su proporción en la población
en el tiempo.
 En genética de poblaciones, es más común el uso de la adecuación relativa antes que la adecuación
absoluta, porque se busca entender el cambio evolutivo, y esto se logra comparando qué tan bien se
desempeña un genotipo en la población, en relación a la media poblacional.
 La adecuación relativa puede usarse para determinar el cambio en la frecuencia de un genotipo en el
tiempo. Este cambio es la diferencia de las frecuencias en dos generaciones:

Δ p= pt +1− pt

Esta expresión compara la frecuencia inicial pt del genotipo, con la frecuencia del mismo una generación
después pt+1, cuando la selección natural ha actuado por crecimiento diferencial. Si Δp es positiva, el
genotipo A incrementará en proporción, y si es negativa, se reducirá en proporción.
En la generación t+1, es decir, cuando se ha producido selección natural, la frecuencia esperada del
genotipo A sería:

pt w A
Δ p= −p t
p t w A + qt w B

Donde el denominador pt w A +q t w B , es la adecuación relativa promedio (average relative fitness) de la


población, y se la suele representar como w , y no es más que la suma ponderada de las frecuencias y
adecuación relativa de cada genotipo en la población. Por ejemplo, 70% de la población es A, y 30% es B;
y supongamos que sus respectivas adecuaciones relativas son 1 y 0.75.
Entonces w=0.7 × 1+ 0.3 ×0.75=0.925
 Ahora, veamos lo que ocurre con el modelo de selección natural cuando se incluye la reproducción
sexual. Para ello, se puede combinar el modelo H-W de frecuencias genotípicas con las tasas de
crecimiento específicas de los genotipos, y esto resultará en un modelo de selección natural que opera
en los tres genotipos producidos por un único locus dialélico. Las suposiciones para lograr tal modelo
son:
o Que los individios sean diploides.
o Que se trate de un locus con dos alelos.
o Que sea obligatoria la reproducción sexual.
o Que las generaciones no se solapen.
o Que el apareamiento sea aleatorio.
o Que el mecanismo de selección natural se deba a diferencias en supervivencia que sean
genotipo-específicas, y que esto lleve a tasas de crecimiento específicas de los genotipos que
sean variables, lo que se llama selección de viabilidad (viability selection).
o Los valores de aptitud son constantes que no varían en el tiempo, en el espacio, o en ambos
sexos.
o Que se trate de una población infinita, para descartar la deriva genética.
o Que no exista estructura de población.
o Que no exista flujo genético.
o Que no exista mutaciones.
 Entonces, supongamos una población con N individuos diploides, que se aparean aleatoriamente, y la
fusión aleatoria de sus gametos, produce cigotos. Cuando N número de cigotos se han formado, antes
de que actúe la selección natural, la frecuencia de los genotipos está en HWE. El tamaño total de la
población en este punto sería Nt, y el número de cigotos con cada genotipo sería:

2 2
AA= p N t Aa=2 pq N t aa=q N t

Después de que los cigotos con estos genotipos se hayan formado, la selección natural empezará a
actuar en estos, y se asume que cada genotipo experimentará una supervivencia y reproducción
específica y diferenciada, lo que dará como resultado una posible reducción en el número de nuevos
cigotos. En esta situación, los valores de adecuación de cada genotipo especifican la probabilidad de
supervivencia y reproducción, que se denomina viabilidad. Y a esta forma de selección natural, como ya
se mencionó, se llama selección de viabilidad.
 Como análogo de ʎ en la reproducción clonal de los ejemplos anteriores, tenemos a ɣ, que representará
la probabilidad de supervivencia hasta la edad reproductiva específica a cada genotipo. Entonces, el
número de individuos que poseen cada genotipo después de la selección de viabilidad es:

2 2
AA=γ AA p N t Aa=γ Aa 2 pq N t aa=γ aa q N t

Y este número de individuos de cada genotipo, se aparearán de manera aleatoria para formar la
siguiente generación. El tamaño total de la población después de la selección es:

2 2
γ AA p N t +γ Aa 2 pq N t + γ aa q N t

Y por ejemplo, la frecuencia del genotipo AA, sería:

2
γ AA p N t
2 2
γ AA p N t + γ Aa 2 pq N t + γ aa q N t

 Debido a que existen menos alelos que genotipos, los resultados de la selección natural se resumen en
términos de frecuencias alélicas en lugar de frecuencias genotípicas:

2
γ AA p +γ Aa pq
Frecuencia de alelos A en gametos= 2 2
γ AA p +γ Aa 2 pq+ γ aa q

2
γ aa q +γ Aa pq
Frecuencia de alelos a en gametos= 2 2
γ AA p + γ Aa 2 pq+ γ aa q

 Al igual que en el caso de la reproducción clonal, podemos utilizar los valores de adecuación relativa w ,
en lugar de los valores absolutos de supervivencia hasta la edad reproductiva. Siendo así, reemplazamos
los valores de γ AA , γ Aa, y γ aa por w AA, w Aa, y w aa. Y si recordamos, el denominador es la suma ponderada
de las frecuencias y adecuación relativa de cada genotipo en la población, denominada w . Entonces,
realizando estas sustituciones:
2
w AA p + w Aa pq
pt +1=
w
2
waa q + w Aa pq
q t +1=
w
 Los alelos pueden contribuir a la adecuación, y hay que tener en cuenta que el efecto que un alelo puede
tener en la adecuación, depende de en qué genotipo se encuentra. Puede que en heterocigosis, esté
asociado a una mayor adecuación que en homocigosis. Se utiliza el término de adecuación marginal
(marginal fitness) para un alelo, para denotar la adecuación relativa que este tiene en la población (el
numerador en las ecuaciones anteriores).
 La adecuación marginal de un alelo, depende tanto de la adecuación de los genotipos en los que se
encuentra, como en la frecuencia de estos genotipos.
 Al igual que en el caso de la reproducción clonal, el cambio en la frecuencia alélica después de una
generación, es:

∆ p= pt +1− p

Y para la reproducción sexual, sería:

pq [ p ( w AA −w Aa) + q( w Aa−waa ) ]
∆ p=
w

pq [ q ( waa−w Aa )− p (w AA −w Aa) ]
∆ q=
w

 Los límites de la selección natural


 Constreñimientos en la selección natural, pueden aparecer cuando muchos genes afectan a un fenotipo,
porque la selección en uno de estos genes, llevará a una respuesta correlacionada en los otros genes; lo
que impide que estos evolucionen como unidades independientes.
 La pleiotropía, es decir, cuando un gen afecta a más de una característica, y cualquier mutación que
puede resultar beneficiosa para una característica, puede resultar perjudicial para otra. Por ejemplo,
existe una proteína llamada ε-cristalina, una proteína estructural de los lentes en los ojos de aves y
cocodrilos, que a su vez, cumple una función como enzima digestiva en el intestino de estos animales.
Siendo así, una mutación que mejore las propiedades de la proteína como enzima digestiva, puede no
tener el mismo efecto beneficioso en el cristalino del ojo, lo que imposibilita la función óptica de ambos
fenotipos.
 Una población puede estar pobremente adaptada a su ambiente, porque carece de suficiente variación
genética sobre la que la selección natural pueda actuar. Y si esta población fracasa en adaptarse
rápidamente, puede extinguirse.
 La evolución por selección natural es un proceso contingente, que solo puede actuar con lo que está
disponible. Por ejemplo, formas y planes corporales ancestrales a menudo son el punto de partida para
futuras adaptaciones, y a su vez, es una limitante para el desarrollo de diseños que de otra manera,
podrían ser óptimos para su nicho. A esto se denomina constreñimiento ontogenético. En humanos,
podemos observar un claro ejemplo de constreñimiento ontogenético: en el proceso de dar a luz, se
requiere que el enorme cráneo del bebé pase a través de una cadera angosta, lo que es un proceso
doloroso y hasta peligroso. Esto se debe a que descendemos de ancestros cuadrúpedos con cráneos
mucho más pequeños en relación con su cuerpo.
 Desde 1972, existe una teoría llamada equilibrio
puntuado, planteada por Eldredge y Gould, la cual
postula que una especie se mantiene similar a lo
largo de períodos considerables de tiempo, hasta
que, súbitamente, experimenta un reemplazo por
otra especie diferente. Esta teoría se sostiene en la
evidencia fósil, donde muchos organismos parecen
ser inmutables en el tiempo (e.g., los cangrejos
bayoneta), e inclusive mantienen su forma en
ejemplares actuales, los llamados fósiles vivientes.
Pero estudios que ponen a prueba esta teoría, han
llegado a la conclusión de que, las especies que se
considera han mantenido una estasis evolutiva,
evolucionan tanto como aquellas especies que
experimentan evolución direccional. Como se
aprecia en la figura, la diferencia es que, en las
primeras, el cambio fluctúa alrededor de una media;
mientras que, en las segundas, el cambio va en una
dirección particular. Y cuando se compara el cambio
acumulado por unidad de tiempo, se descubrió que
el cambio es muy similar en ambos tipos de
especies.
 ¿En qué niveles actúa la selección natural? Se puede
decir que actúa en cualquier nivel en el que haya
discriminación. Algunos individuos logran sobrevivir
para reproducirse; algunas especies tienen tasas de
especiación altas, mientras otras raras veces sufren
especiación, o tienen altas tasas de extinción.
Además, la selección natural resulta en adaptación,
y por lo tanto, esta opera en cualquier nivel en el
que el proceso resulte en una adaptación. La
mayoría de adaptaciones suelen ocurrir a nivel de individuo, y a su vez, tales adaptaciones a nivel
individuo, también pueden tener influir en niveles más altos de organización. En otras palabras, la
discriminación a nivel de taxones es simplemente una consecuencia de adaptaciones previas a nivel
individuo.
También se puede discutir que la selección se da a nivel de genes, y pese a que es una aproximación muy
reduccionista, sirve para entender otros fenómenos como el conflicto genético, y la selección de
parentesco (kin selection).
 Un distorsionador de la segregación es un sistema genético que actúa a nivel gamético. Este no
evoluciona porque es beneficioso para la supervivencia del individuo, o para su fecundidad, sino porque
el esperma con el distorsionador gana una ventaja al momento de trasmitirse al eliminar a los demás
espermas con los que compite. Este distorsionador puede resultar en una reducción sustancial en la
fertilidad de los machos que lo poseen; y esto resulta en un conflicto genético entre el distorsionador y
otros genes, donde el resultado dependerá de la adecuación relativa observada a nivel gamético e
individual. Por ejemplo, si el costo de la adecuación a nivel de individuo es bajo, el distorsionador puede
fijarse; o si el costo de la adecuación a nivel individuo es alto, este distorsionador puede ser suprimido.
Pero por supuesto, a niveles intermedios de costo de la adecuación, las fuerzas de selección antagónicas
a nivel gamético o de individuo, se pueden balancear lo suficiente como para que el distorsionador
persista en la población por mayor tiempo.
 Es curioso notar que la primera ley de Mendel es el resultado de conflictos genómicos en el cual alelos
egoístas se mantienen a raya mediante la selección a nivel individual. Y bien se podría considerar a la
herencia mendeliana como una tregua entre alelos que compiten, y que a veces se puede romper.
 El conflicto genético demuestra que los genomas no siempre son entidades que funcionan en armonía y
al unísono para el bien del organismo, sino que son mejor representados como campos de batalla,
donde ciertos alelos compiten por transmitirse más que otros, muchas veces sin importar si resulta en
detrimento del éxito en supervivencia o reproducción de su portador.
 La selección de parentesco es una teoría que busca explicar el comportamiento altruista. Esto es muy
común en insectos eusociales, como las abejas y hormigas, donde muchas hembras no se reproducen, y
en su lugar, ayudan a que una de sus hermanas (la reina), se reproduzca. Un alelo altruista incrementará
en frecuencia por selección de parentesco si se cumple lo siguiente:

rB> C

Donde B es el recibidor, es decir, el/los individuos que se benefician del acto altruista; C es el actor, o
el/los individuos que se sacrifican (reproductivamente hablando); y r es el grado de parentesco entre el
actor y el recibidor (coeficiente de parentesco). Y quiere decir que el alelo C se esparcirá en la población
cuando el beneficio en términos de incremento de la adecuación de B, ponderado por el grado de
parentesco r, excede al costo promedio en términos de reducción en la adecuación de C.
 El coeficiente de parentesco r, es la probabilidad de que dos parientes genéticos compartan un alelo que
sea idéntico por descendencia, o que lo heredaran de un mismo ancestro.
 La selección de parentesco es un caso especial de selección individual, donde los individuos tienen una
adecuación inclusiva en lugar de una adecuación individual. La selección de parentesco involucra
selección en dos niveles: individual, y grupo familiar. Aquí existe una selección en contra de los altruistas
a nivel individual, pero a favor de grupos familiares con altruistas. Y vemos un claro paralelismo con el
conflicto genético: un alelo altruista puede incrementar su frecuencia en una población, si el efecto
negativo en la adecuación del individuo, es más que compensada por el efecto positivo en la
productividad del grupo familiar al que pertenece el individuo. En el ejemplo de las abejas y hormigas, la
colonia puede pensarse como un super-organismo sobre el que actúa la selección; y las abejas y
hormigas individuales, son el equivalente a las células que componen un organismo multicelular.

 Los fenotipos óptimos pueden diferir bajo condiciones fluctuantes, por tal razón, la selección natural
puede favorecer caracteres plásticos que pueden variar según señales ambientales. A esto se llama
plasticidad fenotípica. Más específicamente, es la habilidad de un genotipo de producir más de un
fenotipo alternativo en respuesta a condiciones ambientales.
 Las plantas, por ejemplo, muestran un amplio abanico de respuestas fenotípicas a la variación ambiental.
La plasticidad involucra sentir señales externas que inducen procesos de desarrollo, como
modificaciones epigenéticas.
 La habilidad de aprendizaje añade flexibilidad a la vida de un organismo, y la selección natural moldea
estas habilidades de maneras adaptativas. Pero estas habilidades cognitivas no solamente resultan como
producto de la selección natural. El aprendizaje también puede afectar el curso de la evolución. Por
ejemplo, un comportamiento aprendido puede afectar el éxito de supervivencia o reproductivo de un
organismo, y terminar afectando la composición genética de su especie por selección natural. A este
fenómeno se denomina el efecto Baldwin.
 Las consecuencias genéticas de la reproducción sexual, reducen la probabilidad de que los organismos
sexuales se extingan, e incrementa su tasa de diversificación (especiación). Puesto que el sexo combina
genes de dos individuos, se obtienen combinaciones ventajosas de manera mucho más rápida y sencilla
en comparación con individuos de poblaciones puramente asexuales. En otras palabras, la evolución
adaptativa ocurre más rápido en organismos sexuales, lo que les permite adaptarse mejor a cambios en
el ambiente, lo que reduce el riesgo de extinción.
 Los organismos sexuales también son más capaces de evitar la acumulación de mutaciones dañinas, en
comparación con los asexuales.

 Evolución en multilocus
 La mayoría de características fenotípicas son afectadas por una multitud de genes, que interactúan de
formas complejas.
 Al igual que con el modelo de un locus explicado al inicio de esta guía, es necesario comparar el modelo
multilocus (dos alelos en este caso), con un modelo nulo estilo Hardy-Weinberg. Las condiciones para
este modelo son las siguientes:
o Los individuos en la población se aparean aleatoriamente.
o La población tiene un tamaño infinito.
o No ocurre selección.
o No ocurren mutaciones.
o No ocurre flujo de genes.
o La recombinación destruye cualquier asociación entre los alelos en ambos loci.
 Si estas condiciones se cumplen, se dice que ambos loci se encuentran en equilibrio de ligamiento
(linkage equilibrium). Dicho de otra manera, dos loci se encuentran en EL cuando el genotipo en un locus
es independiente del genotipo en otro locus: los alelos en ambos loci se segregan independientemente
(2da ley de Mendel).
 Cualquier desviación de este equilibrio esperado, es de interés para entender los procesos evolutivos y
demográficos. Por esto, se utiliza más el concepto de desequilibrio de ligamiento (linkage disequilibrium)
o DL. Este ocurre cuando los genotipos en ambos loci, no son independientes uno de otro, y las
frecuencias alélicas, están correlacionadas.
 Cualquier violación a una o más de las condiciones descritas más arriba, puede significar que un par de
loci se encuentren en DL.
 Con dos loci, los genotipos incluyen un mínimo de cuatro alelos, repartidos así: A1A1B1B2. A partir de un
genotipo multilocus como este, se puede derivar un haplotipo, que es la combinación alélica de los
gametos parentales. Puesto que los alelos en
los dos loci no se segregan
independientemente, es más conveniente
seguir la pista del haplotipo que de los alelos.
 En dos loci: A y B, cada uno con dos alelos, se
darán cuatro haplotipos: A1B1, A1B2, A2B1, A2B2.
La frecuencia de un haplotipo se escribe como
x ij, donde los sufijos indican los alelos que este
contiene.
 En EL (bajo las condiciones indicadas arriba),
se espera que los alelos en ambos loci se
segreguen independientemente. Por tal razón,
la frecuencia esperada de los haplotipos en EL equivale al producto de las frecuencias alélicas incluidas
en esos haplotipos:

E ( x 11 ) =p A p B E ( x 12 )= p A q B
E ( x 21 )=q A p B E ( x 22 )=q A q B

Donde la frecuencia de A1 y A2 es pA y qA; mientras que la frecuencia de B1 y B2 es pB y qB.


 Cualquier individuo que sea doble heterocigoto en estos dos loci (A1A2B1B2), puede haber heredado el
haplotipo A1B1 de un padre, y el haplotipo A2B2 del otro; o alternativamente, A1B2 de un padre, y A2B1 del
otro. Las dos posibilidades de genotipos se pueden denotar así: A1B1/A2B2 y A1B2/A2B1.
 En este ejemplo de dos loci con dos alelos, existen 10 diferentes combinaciones posibles de haplotipos.
 En la figura, podemos ver que las frecuencias genotípicas se muestran en negro, y son el equivalente a
las frecuencias genotípicas esperadas en HWE en el modelo de un locus:

2 2
E ( g11 )= p , E ( g 12) =2 pq , E ( g22 )=q

Tomando en cuenta que se considera que las frecuencias haplotípicas están en EL.
 La recombinación entre el locus A y el B durante la meiosis, reorganiza los alelos parentales, y produce
diferentes haplotipos en los gametos resultantes. Mientras más lejos se encuentre un loci de otro, más
probable es que ocurra recombinación entre estos. En otras palabras, el incremento en la distancia física
en el genoma, es un buen predictor de la tasa de recombinación (esta tasa no puede superar el 50%).
Entendamos el siguiente ejemplo:
Supongamos que hemos creado dos líneas endogámicas de gran tamaño de una especie hipotética de
mariposa, con el fin de remover la heterocigosis, y después, hacemos que ambas líneas se mezclen para
determinar cómo una población desbalanceada se aproximaría al EL.
El enfoque en este ejemplo va a ser dos loci fáciles de identificar, y con efecto fenotípico: el locus A
determina el color del ala delantera, y el locus B, el color del ala trasera. Entonces, tendríamos que
A1B1/A1B1 son mariposas totalmente azules, y A2B2/A2B2, son mariposas totalmente rojas. Los
heterocigotos en cualquier locus tendrán una coloración púrpura.
Al inicio de este experimento, tenemos una línea endogámica totalmente azul, y otra totalmente roja.
Otra suposición que haremos, es que la población es lo suficientemente grande como para ignorar
deriva genérica, selección, mutación, flujo de genes, y además considerar que los loci son libres de
recombinarse.
Los individuos de la línea azul, solo producirán gametos con el haplotipo A1B1, y los de la línea roja, solo
gametos con el haplotipo A2B2. Si existe la misma cantidad de mariposas azules y rojas en la población
conjunta, y el apareamiento es aleatorio, es igual de probable que una mariposa azul se aparee con otra
azul que con una roja, y viceversa para una mariposa roja. Por lo tanto, la mitad de la prole serán dobles
heterocigotos con A1B1 heredado de un padre, y A2B2, heredado de otro; y tendrán ambas alas color
púrpura A1B1/A2B2. Adicionalmente, un 25% serán azules A1B1/A1B1, y otro 25% serán rojas A2B2/A2B2.
Los haplotipos y genotipos de dos locus como estos, no se encuentran en EL. Esto porque los únicos
haplotipos presentes en la generación F1, son A1B1 y A2B2; y no hay rastro de los haplotipos
recombinantes A1B2 y A2B1.
Sin embargo, si las mariposas se continúan apareando por varias generaciones, la recombinación
empezará a romper el ligamiento entre A1 y B1, y entre A2 y B2. Por ejemplo, los dobles heterocigotos
producirán gametos recombinantes A1B2 y A2B1.
La proporción de los haplotipos recombinantes dependerá de la tasa de recombinación c.
Empecemos rastreando el cambio en la frecuencia del haplotipo A1B1. Ayudándonos con la tabla de
frecuencias anterior, vemos que hay cuatro genotipos que contienen el haplotipo A 1B1, y que podrían
producir gametos A1B1. Estos son A1B1/A1B1, A1B1/A1B2, A1B1/A2B1, A1B1/A2B2. Entonces, la frecuencia de
A1B1 en la siguiente generación será:

2
x ' 11=(x 11 ) + 0.5× 2 x 11 x 12+ 0.5× 2 x 11 x 21+ 0.5× 2 x 11 x 22 × ( 1−c ) +0.5 ×2 x 12 x 21 ×c

2
Donde el primer término (x 11 ) , representa la frecuencia de A1B1 en el genotipo A1B1/A1B1. Los siguientes
dos términos 0.5 ×2 x 11 x12 +0.5 ×2 x 11 x21 , representa la frecuencia de A1B1 en los genotipos A1B1/A1B2 y
A1B1/A2B1, donde solo la mitad de los gametos serían A1B1. En el tercer término 0.5 ×2 x 11 x22 × ( 1−c ),
representa a la frecuencia de A1B1 en el genotipo A1B1/A2B2 cuando los loci no se recombinan, donde la
mitad de gametos será A1B1, a una tasa de ( 1−c ). Pero si los loci se recombinan, tendremos haplotipos
A1B2/A2B1, y no se forma ningún gameto A1B1. El término 0.5 ×2 x 12 x 21 × c, indica la frecuencia de A1B1
en el genotipo A1B2/A2B1, cuando existe recombinación a una tasa c .
La ecuación anterior se puede simplificar, y queda así:

x ' 11=x 11 ( x 11 + x 12+ x 21 + x 22) −c (x 11 x22−x 12 x 21)

Y hay que señalar que el término ( x 11 + x 12+ x 21 + x 22) equivale a 1, porque es la suma de todas las
frecuencias de todos los haplotipos presentes. Y al término (x 11 x 22−x 12 x 21) , se representará como
parámetro D . Entonces, la ecuación anterior se reescribe:

x ' 11=x 11 −cD


Si realizamos todo el procedimiento de cálculo anterior para rastrear las frecuencias de todos los
posibles haplotipos A1B1, A1B2, A2B1, y A2B2, tenemos:

x ' 11=x 11 −cD


x ' 12=x 12+cD
x ' 21=x 21+cD
x ' 22=x 22−cD

El parámetro D , es una medida del DL. Habrá DL si D ≠ 0 , es decir, si existe un desbalance en la


frecuencia de haplotipos A1B1 y A2B2 con respecto a los haplotipos A1B2 y A2B1. En nuestro ejemplo de las
mariposas, vemos que de 8 haplotipos posibles en F1, la mitad son A1B1 ( x 11=0.5¿ , y la otra mitad son
A2B2 (x 22=0.5), mientras que no existen haplotipos A1B2 ( x 12=0 ¿ y A2B1 ( x 21=0 ¿. Por lo tanto:
D=( x11 x 22−x 12 x 21) =0.5 ×0.5−0 × 0=0.25

También es posible definir el desequilibrio de ligamiento D , como la diferencia entre la frecuencia


observada en un haplotipo x ij, y la frecuencia esperada de este haplotipo E(x ¿¿ ij)¿ en equilibrio de
ligamiento EL:
D=x 11 −E ( x 11 )=x 11 − p A pB
−D=x 1 2−E ( x 1 2 )=x 1 2− p A q B
−D=x 2 1−E ( x 2 1 )=x 2 1−q A p B
D=x 22−E ( x 22 )=x 22−q A q B

Donde, como recordaremos al inicio de la sección, p A y q A son las frecuencias de A1 y A2; mientras que
pB y q B son las frecuencias de B1 y B2.
 El apareamiento no aleatorio puede ocasionar DL. La endogamia, por ejemplo, reduce la frecuencia de
los heterocigotos en relación a lo que se esperaría de una población en HWE. Y puesto que los parientes
genéticos comparten alelos de un ancestro común, los haplotipos prolongados por la endogamia,
tenderán a acumularse, causando DL.
 La deriva genética puede causar un desbalance en las frecuencias de los haplotipos, y por consiguiente,
DL. Muchos estudios demuestran que el nivel de DL puede ser sustancial en el muestreo aleatorio de
alelos en poblaciones pequeñas.
 La selección natural puede ser muy compleja a nivel de multilocus. La selección aquí puede causar DL
cuando ciertos haplotipos en dos o más loci, se encuentren asociados con una mayor aptitud que otros
haplotipos en otros loci. Cuando la selección mantiene los mismos haplotipos en múltiples loci que
interactúan, el DL puede ser mantenido indefinidamente.
 Las mutaciones también pueden producir DL. Por ejemplo, si tenemos un locus monomórfico B, donde la
forma ancestral B1 muta a B2; y además, tenemos otro locus polimórfico A (con alelos A1 y A2) localizado
en el mismo cromosoma. El nuevo mutante B2 estará asociado completamente al locus A. Y si este alelo
B2 no es eliminado por deriva genética o selección, puede ser sometido a procesos eventuales de
recombinación, que romperá la asociación con A, lo que propiciaría a la aproximación hacia EL. No
obstante, cuando los loci están cercanamente ligados, el DL se mantendría por más tiempo, porque la
recombinación sería muy rara.
Ahora, pongamos por caso una inversión, que es una
mutación estructural muy relacionada al DL y a la
recombinación. Si se quiere producir recombinación entre
el segmento normal y el invertido, se reduciría
tremendamente la descendencia heterocigótica. Esto sería
así porque esta recombinación resultaría en gametos
aneuploides e inviables. Y en esta situación, los segmentos
ancestrales (normales), y los invertidos, se mantendrían
aislados entre sí.
El segmento invertido podría perderse por deriva genética,
o por selección; o también podría fijarse. Pero, en
ocasiones, tanto los segmentos normales como los
invertidos se mantendrán en la población por selección
balanceadora; y como estas variantes no logran
recombinarse, ambas divergirán genéticamente en el
tiempo, por medio de selección y deriva genética.
Es de destacar que estas reorganizaciones estructurales pueden tener profundos efectos en los
fenotipos y en su evolución (ver ejemplo de Calidris pugnax, en Kupper et al, 2016; Lamichhaney et al,
2016).

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