Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
TESIS
Dirigida por:
Por:
Los usuarios de la información no deben reproducir el contenido textual, gráficas o datos del
trabajo sin el permiso expreso del autor y/o director del trabajo. Este puede ser obtenido
escribiendo a la siguiente dirección __jaranda@acei.ip.mx o gao@servidor.unam.mx___. Si
el permiso se otorga, el usuario deberá dar el agradecimiento correspondiente y citar la fuente
del mismo.
El final de este camino ha marcado lo que soy. Dedico este trabajo a las siete personas
más importantes de mi vida:
A mis padres, Juan José y María Aurora, por ser el pilar de mi vida. Su ejemplo, apoyo
y cariño incondicional me han dado las armas para sobrevivir en esta vida. Por no
dejarme caer ni permitirme rendirme en los peores momentos. ¡¡¡Misión cumplida!!!.
Los amo con todo mi corazón.
A Quique, porque me regalaste los nueve mejores años de mi vida. Tu paso por ella
dejó una gran enseñanza y tu partida me mostró la importancia de vivir. Flaco esto se
quedó incompleto, pero aún me sostiene la esperanza de encontrarte en la eternidad.
A Petrita, porque su cariño se ha impuesto aún por encima de ella misma. Por ser el
pilar de una gran familia y por olvidarte de todos pero tener presentes a tus niños. ¡¡Te
quiero abu!!
A todos ustedes les debo aquellas pequeñas cosas que me hacen lo que hoy soy. Los
amo!!!
AGRADECIMIENTOS
A Rosario, por el cariño sincero y constante. Me has mostrado el verdadero sentido de
la amistad. ¡¡Gracias por formar parte de mi vida!!
A Ubaldo, Gloria, Marlene, Paty, Fátima, Selene, Elizabeth y Ada Luz, sin cuyo apoyo
en el laboratorio las carreras de cada día hubieran sido prácticamente imposibles. Su
ayuda fue invaluable. Gracias por su cariño y preocupación para hacer las cosas lo
mejor posibles.
A Mayra, Damaris, Bety, Maribel, Fernando, Rafa, Lety, Laura, Janeth, Félix, Erick y
David, por permitirme poner un granito de arena en su formación y seguirme el paso
con confianza y admiración.
A Angie, Jesús, Elizabeth, Ana y Estela, por su cariño sincero. A Pamela, además por
mostrarme la luz en el camino. Por ustedes vale la pena el trabajo.
A Lupita, Gaby, Yola, Alex, Odi y la Dra. Ponce, por su amistad constante. Son el
mejor premio de mi paso por CINVESTAV.
A Oli e Inti por las porras y el abrazo sincero. Agradezco a Tere el compartirlos
conmigo.
A Nadia, por la disposición y apoyo. Gracias por ayudar en mis carreras, y todas las
horas dedicadas a los trámites.
A Blanca Aguilar Trejo, por la enseñanza de la técnica, pero sobre todo por la
enseñanza de vida. Siempre agradeceré la disposición para aligerar mi camino. Gracias
por la confianza, aprendí mucho de ti.
A los revisores de este trabajo, Dr. Enrique Durán, Dr. Edgar Salgado y Dra. Carmen
Oliver, por los acertados comentarios para mejorar este documento y el tiempo dedicado
a la revisión del mismo.
RESUMEN 1
ABSTRACT 2
1. INTRODUCCIÓN GENERAL 3
2. OBJETIVOS 5
2.1 Objetivo general 5
2.2 Objetivos específicos 5
3. MARCO TEÓRICO 6
3.1 Los polisacáridos de la pared celular de las plantas. 6
3.1.1 Estructura y función de la pectina. 6
3.2 El sistema pectinolítico 7
3.2.1 Regulación de la actividad pectinolítica 11
3.2.1.1 Regulación por la fuente de carbono. 12
3.2.1.2 Regulación por pH. 12
3.3 Los sistemas de producción de polisacarasas 13
3.3.1 Los microorganismos productores de pectinasas 14
3.3.1.1 Las características de género Aspergillus 14
3.3.1.2 Aspergillus flavipes FP-500 15
3.3.2 Sistemas de producción en cultivo en medio líquido 16
3.3.2.1 El cultivo en lote 16
3.3.2.2 El cultivo alimentado 16
3.4 Los balances de materia para los cultivos 17
3.5 Modelos cinéticos utilizados para describir el comportamiento de un cultivo
microbiano 19
3.5.1 Estimación de los parámetros cinéticos a partir de datos
experimentales. 20
4. MATERIALES Y MÉTODOS. 23
4.1 Microorganismo. 23
4.2 Composición del medio. 23
4.3 Inóculo 23
4.4 Condiciones de cultivo 23
4.4.1 Cultivos en matraz. 23
4.4.2 Experimentos de transferencia 24
4.4.3 Cultivo por lote en fermentador. 25
4.4.4 Cultivo alimentado en fermentador 26
4.5 Técnicas de analíticas 28
4.5.1 Cuantificación de la concentración de biomasa. 28
4.5.2 Cuantificación de la actividad de exopectinasas. 28
4.5.3 Cuantificación de la actividad de endopectinasas. 29
4.5.4 Cuantificación de la actividad de pectinliasas. 29
4.5.5 Cuantificación de la concentración de azúcares reductores. 29
4.5.6 Cuantificación de la concentración de ácido poligalacturónico y pectina en
los cultivos. 30
matraz 50
Estudio cinético de la producción secuenciada de pectinasas por Aspergillus flavipes FP-500 iii
Figura 12. Evolución del pH, la producción de exopectinasas, endopectinasas y pectin
sobre pectina 88
Resumen
producidas por Aspergillus flavipes FP-500. Para lo anterior, se utilizaron diferentes tipos
carbono, cada una en tres valores de pH inicial; a nivel biorreactor se desarrollaron cultivos
de dos tipos, lotes desarrollados sobre pectina y ácido galacturónico y cultivos alimentados,
en los que se emplearon glucosa y pectina. Para todos los experimentos desarrollados, se
pectin liasas, así como la naturaleza inducible de las exo y endopectinasas y pectin liasas
producidas por esta cepa. Con el uso de los cultivos alimentados, además de confirmar la
ante los diferentes valores de pH observados. Se observó que las exo y endopectinasas se
Abstract
Aspergillus flavipes FP-500 was studied. For this, the microorganism was cultivated in
batch or fed-batch systems with different carbon sources and at different initial pH in the
culture media. For all the experiments, biomass, substrate concentration and exopectinases,
Through the analysis of experimental enzymatic activities and from a kinetic interpretation
of the pectinases production, we propose constitutive isoforms for the exopectinase and
pectin lyases produced by this strain. Inducible pectinases were found to be subject to
catabolic repression, although this phenomena is only transient. Besides, it was observed
that the exo and endopectinases are produced mainly on acidic pH values, meanwhile
2. Objetivos
500.
¾ Analizar el efecto del pH del medio sobre la producción de las pectinasas de A. flavipes
FP-500
1. Introducción general
La pectina es uno de los polisacáridos más complejos encontrados en la naturaleza. Su
microorganismos deben secretar al medio las enzimas necesarias para degradar a esos
existe alguna relación o dependencia entre la producción de estas enzimas. Sin embargo, es
bien sabido que este es un proceso complejo, regulado por diversos factores, de los que
cultivo.
carbono, estas enzimas pueden ser de dos tipos. Aquellas que se expresan ante cualquier
fuente de carbono se conocen como constitutivas, mientras que las que lo hacen solamente
consideran de naturaleza inducible. Estas últimas, además, pueden verse afectadas por la
Por otra parte, el pH del medio determina la cantidad y tipo de pectinasas obtenidas en cada
con valores de pH ácidos, de entre 2 y 4, mientras que las pectin liasas se producen
3. Marco Teórico
Los polisacáridos de la pared celular de las plantas son los compuestos orgánicos más
mayoría por tres polisacáridos: celulosa, hemicelulosa y pectina (de Vries y Visser, 2001).
a la pared celular. Las hemicelulosas, son polisacáridos heterogéneos que forman poros en
estabilizar a las microfibrillas de celulosa, así como a otros polímeros y proteínas (Annis y
unidos a los componentes de la misma (Naidu y Panda, 1998). Las sustancias pécticas
comprenden del 0.5 al 4.0 % del peso seco de la planta (Singh Jayani et al, 2005).
La pectina es uno de los heteropolisacáridos más complejos de los que conforman a la pared
celular de las plantas. La estructura de la pectina está constituida por dos grandes regiones:
estructura más sencilla. Su cadena lineal está constituida por unidades de ácido D-
galacturónico, unidas entre sí por enlaces α,1-4. A lo largo de dicha cadena se encuentran
grupos acetilo (en los grupos hidroxilo de los carbonos 2 y 3) o metilo (en el carbono 6), así
En la región del ramnogalacturonano, las unidades de ácido galacturónico se intercalan con las
principal, esta región se caracteriza por ramificaciones de azúcares de diversos tipos, que van
ramificaciones más pequeñas, conformadas por xilosa, ácido ferúlico, apiosa y fucosa, entre
industriales que emplean como materia prima elementos ricos en este polisacárido (Kashyap,
et al, 2001; Hoondal et al, 2002; Jayani et al, 2005; Hadj-Taieb et al, 2006). Por otro lado, en
la naturaleza este tipo de materiales son los sustratos de los microorganismos saprófitos,
debido a la capacidad de estos para producir pectinasas. Así, las enzimas pectinolíticas
producidas de manera natural por los microorganismos saprófitos se han utilizado para
de jugos y alimentos de diversos tipos (Ortega et al, 2004; Rodríguez-Nogales et al, 2008); la
de azúcar y almidón (Kashyap et al, 2001; Mathew y Abraham, 2005) y los procesos de
fabricación del papel (Kashyap et al, 2001, Hoondal et al, 2002; Chand y Mishra, 2003).
esta manera, la primera gran clasificación de las pectinasas se da con base en la parte de la
estructura sobre la que actúan, teniéndose dos grupos: el de las enzimas que actúan sobre la
Las actividades enzimáticas que actúan sobre la cadena principal de la pectina, tienen la
función de degradarla hasta sus unidades monoméricas básicas. Así, de acuerdo al mecanismo
de acción que desarrollan, este grupo se divide en dos subgrupos: las enzimas desesterificantes
y las despolimerizantes. Las enzimas desesterificantes se encargan de liberar los grupos acetilo
reacción que catalizan, en tres grupos: las polimetilgalacturonasas, las poligalacturonasas y las
Las polimetilgalacturonasas incorporan una molécula de agua durante la ruptura de los enlaces
ácida. Dependiendo del mecanismo mediante el cual lleven a cabo esa ruptura, estas enzimas
se subclasifican en dos grupos: las del tipo endo y las del tipo exo. En el primer grupo se
encuentran las enzimas encargadas de hidrolizar de manera aleatoria los enlaces α-1,4-
A la vez, las enzimas del tipo exo causan una ruptura secuencial de los enlaces α-1,4-
glicosídicos de la pectina, a partir de los finales no-reductores de la cadena principal. Con esto,
poligalacturónico. Estas enzimas también pueden ser del tipo endo (que catalizan la hidrólisis
aleatoria de los enlaces α-1,4-glicosídicos del ácido péctico) o con mecanismo exo (catalizan
da como resultado un enlace insaturado entre los carbonos C-4 y C-5 de la unidad de sacáridos
conocen como pectin liasas, mientras que si lo hacen sobre la región parcialmente esterificada
de éste, se conocen como pectato liasas. De igual manera, dentro de las liasas se encuentran
Por último, las enzimas accesorias se encargan de liberar de las ramificaciones laterales a la
α-L-arabinofuranosidasas
Endo- y exoarabinasas
α-D-xilosidasas
Enzimas accesorias
α- y β-D-galactosidasas
Endo- y exogalactanasas
Feruloil y p-cumaroil esterasas
Las poligalacturonasas pueden tener distintas funciones, en dependencia del organismo que las
produce. Así, mientras que en los hongos saprófitos, como A. niger, estas enzimas son
de estos para ingresar a las células. Así, se ha sugerido que los oligosacáridos liberados de
estos polímeros y/o sus respectivos derivados, son los encargados de desencadenar la
establece con base en la frecuente observación de que el compuesto que induce la producción
de una cierta enzima, resulta ser precisamente el producto de esa reacción enzimática, o el
Se ha demostrado que los hongos saprófitos producen de manera constitutiva una serie de
diversos grupos reductores, de los que destaca el ácido galacturónico, con lo que a su vez se
activan los miembros de la familia de genes inducibles que codifican para pectinasas.
Adicionalmente, la expresión de estos genes puede verse afectada por los fenómenos de
pectinasas aún no son claros, debido a la complejidad y diversidad del sustrato. Sin embargo,
se ha observado que la síntesis del complejo pecinolítico pareciera estar controlada, al nivel de
transcripción, por al menos tres mecanismos diferentes: la inducción específica por pectina o
et al, 2002).
codifican para enzimas pectinolíticas (de Vries, 2003), mientras que fuentes como la L-
estas enzimas, dependiendo del sistema biológico que las produzca, pueden sufrir represión
catabólica por carbono. Los principales represores de los sistemas pectinolíticos son las
El pH del medio de cultivo evoluciona a medida que sucede la producción de metabolitos por
influenciar la ruptura de los sustratos como el transporte a través de la pared celular de los
la capacidad de estos para secretar una serie de enzimas, en dependencia del pH del medio
metabolitos de diversos tipos, en dependencia del pH del cultivo, por los organismos
tales procesos regulatorios en los microorganismos saprófitos. Existen reportes en los que se
los cuales se encuentran aquellos que codifican para las enzimas secretadas por el hongo. De
esta manera, las poligalacturonasas se secretan a bajos pH, mientras que las pectato liasas lo
hacen cuando el pH del medio se incrementa, lo que sugiere que los patógenos son capaces de
modular el pH del huésped como un mecanismo para incrementar su virulencia (Eshel et al,
fenómenos naturales, que consideran la generación de estas enzimas por parte de los
donde destacan los cultivos líquidos y la fermentación sólida. Dentro de los cultivos líquidos,
los cultivos en lote, así como los lotes alimentados son los más utilizados.
Las enzimas pectinolíticas son producidas por una extensa variedad de organismos, tales como
entre todos ellos destacan los hongos filamentosos, debido a su fácil cultivo, y su alta
diversidad de las enzimas producidas por estos microorganismos, así como su elevada
crecer sobre diversos sustratos bajo una gran variedad de condiciones en el ambiente
(MacCabe et al, 2002). Los géneros más utilizads para la producción de las diversas
clasificados generalmente como seguros para la salud humana (GRAS, por sus siglas en
Los microorganismos del género Aspergillus son hongos filamentosos que crecen en materia
por un conidiósporo, el cual tiene un tallo y una cabeza conidial de más de 700 µm de
diámetro, que surge desde la delgada pared micelial, llamada célula pie, como se muestra en la
Figura 2.
Los hongos del género Aspergillus crecen en un rango de temperaturas de 6- 47ºC, con una
temperatura óptima entre 35-37ºC y un intervalo de valores de pH de entre 1.4 y 9.8 (Schuster
et al, 2002). Tienen la capacidad para crecer en fuentes de carbono de diversos tipos. Se
caracterizan por su propiedad para producir una variedad de enzimas de importancia a nivel
El grupo de los Aspergillus flavipes está conformado por una sola especie, sin variedades.
capacidad para producir flavipina (Raistrick y Rudman, 1956) y lovastatina (Valera et al,
2005). Dentro de las enzimas degradadoras de polisacáridos que producen las cepas de esta
destacando las poligalaturonasas del tipo endo y exo, y las pectin liasas (Solís et al, 1997).
La cepa Aspergillus flavipes FP-500 fue aislada por el Grupo de Fisiología de Hongos
demostrado que esta cepa produce xilanasas y α- y β- galactosidasas (Álvarez Arriaga, 2005),
características que la hacen competitiva con las obtenidas de otras especies del género
Aspergillus.
Cuando se desea estudiar tanto la fisiología, como los aspectos cinéticos y metabólicos que
sean de fácil medición y por ende, se puedan generar correlaciones a partir de estos (Teixeira
et al, 2000; Jacob y Prema, 2006; Oncu et al, 2006; Favela-Torres et al, 2006; Cavalitto y
Mignone, 2007; Gummadi y Kumar, 2008). Dos de las técnicas más utilizadas para tal fin son
El cultivo en lote es uno de los métodos más sencillos empleados para el desarrollo de cultivos
así como el estado fisiológico y metabólico celular, cambian conforme avanza el cultivo. De
represión por la concentración del sustrato, una alternativa es el empleo del cultivo
alimentado. En este, uno o varios de los nutrientes limitantes se suministran a lo largo del
cultivo y la alimentación de los sustratos puede hacerse por pulsos, o de manera continua; en
este último caso, el volumen se incrementa lineal o exponencialmente. A pesar del cambio en
el volumen de operación, el valor de ciertas variables clave, como las concentraciones del
dentro de los intervalos que favorezcan una función objetivo particular (Ramírez Reivich,
Para su diseño y análisis cinético, tanto el cultivo por lote como el cultivo alimentado parten
de los mismos balances de materia. Así, las ecuaciones que definen los balances para la masa
total del sistema de reacción (Vρ), generación de biomasa (X), consumo de sustrato (S) y la
d (Vρ )
= ρF Balance total de masa
dt
dXV
= qXV Para generación de biomasa
dt
dSV
= −q S V Para consumo de sustrato
dt
dPV
= q P XV Para generación de producto
dt
flujo de alimentación; mientras que las expresiones de velocidad (qX, qS y qP) se definen como:
q X = µX
qX
qS = −
Y XS
dP dS
qP = = −Y PS
dt dt
sólo se usa para la formación de biomasa (x) y producto (p). YXS y YPS representan el
como:
∆X Biomasa producida
Y XS = =
∆S Sustrato consumido
∆X Pr oducto generado
Y PS = =
∆S Sustrato consumido
Tabla 1. Balances de materia para el cultivo en lote y el cultivo en lote alimentado a partir de los
balances generales. Para el desarrollo de las ecuaciones específicas para cada cultivo, se expandieron
los términos diferenciales, calculando los productos de las dos derivadas.
Parámetro para balance Cultivo en lote Cultivo alimentado
Volumen constante, no hay Volumen variable, existe
flujo de entrada flujo de entrada
Volumen dV
=0
dV
dt
=F
dt
Flujo F =0 F ≠0
dX dX F
Generación de Biomasa = q X = µX = µX − X
dt dt V
dS 1 dS F 1
= −q S X = − µX = S 0 − µX
Consumo de sustrato dt YXS dt V Y XS
dP dP F
Generación del producto = qP X = qP X − P
dt dt V
La relación entre el flujo y el volumen (F/V), se conoce como Factor de dilución (D).
de producción, y dependiendo del tipo de cultivo que se esté desarrollando, las ecuaciones
toman formas específicas para describir el comportamiento del mismo, tal como se muestra en
la Tabla 1.
de un cultivo microbiano
Los resultados obtenidos de un experimento presentan tendencias que pueden dar una idea
general del comportamiento del cultivo ante ciertas condiciones de operación. A menudo es
necesario predecir eventos futuros con un alto grado de precisión, a partir de las tendencias
Nielsen, 2000).
El modelo propuesto por Monod es, por su sencillez y generalidad, uno de los más utilizados
S
µ = µ max
KS + S
En lo que respecta a la generación del producto durante el cultivo, esta puede darse
q P = αµX + β X
2004).
Además de los modelos aquí mencionados, existen otros más específicos o complejos
(Gombert y Nielsen, 2000; Thilakavathi et al, 2007), sin embargo, cualquiera que sea el
modelo empleado, este deberá acoplarse a las ecuaciones de balance listadas en la Tabla 1.
experimentales.
modelo, mayor será la dificultad para calcular los valores apropiados de los múltiples
Ingham, 1995).
Los diversos parámetros y constantes que se incorporan en los modelos cinéticos pueden ser
sin ningún significado físico, o bien representar magnitudes sobre algún proceso físico,
químico o biológico (Garcia-Ochoa y Casas, 1999). Así, por ejemplo, en un proceso por lotes,
las constantes µmax y KS no se puede determinar simultáneamente, por lo que solamente podrá
calcularse adecuadamente el valor de una de ellas con la metodología que se haya elegido para
la estimación de los parámetros del modelo (Nihtila y Virkkunen 1977, Chouakri et al, 1994).
Con frecuencia el valor de los parámetros del modelo se estima a partir de la idea de obtener el
mejor ajuste de los datos experimentales a la tendencia descrita por éste. Para lograr lo
anterior, los resultados experimentales se deberán comparar con los obtenidos a partir de la
aplicación del modelo, utilizando múltiples corridas para obtener el mejor ajuste de los
parámetros. El procedimiento para estimar los parámetros cinéticos que describen un sistema
parámetros del proceso, y modificando estos hasta encontrar el mejor ajuste con los datos
adecuadamente a la tendencia que presentan los datos experimentales, se deben especificar los
intervalos de confianza de los valores que tomaron los parámetros que definen a dicho
modelo. Uno de los métodos más sencillos para desarrollar calcular los intervalos de confianza
es la aplicación del estadístico t de Student, aunque existe una gran cantidad de metodologías,
cuya robustez determinará la confiabilidad de los valores que definen a los parámetros
mediante los cuales se modela el comportamiento del cultivo (Isermann, 1980; Almasy y Mah,
1984).
perspectivas. Destacan los avances que de ello se ha tenido con el empleo de la biología
molecular y la proteómica. Sin embargo, hay una escasa explotación del enfoque cinético y los
cultivos en lote y lote alimentado para el estudio del modo en que estas enzimas se producen
4. Materiales y Métodos.
4.1 Microorganismo.
Para este trabajo se utilizó la cepa Aspergillus flavipes FP-500, una cepa silvestre aislada a partir
de la UNAM. Esta cepa se mantuvo en refrigeración en cajas con agar papa-dextrosa mediante
resiembras periódicas.
Para todos los experimentos, A. flavipes FP-500 se hizo crecer en medio basal, que contenía en
g/l: K2HPO4, 2; KH2PO4, 2; y (NH4)2SO4, 5. El pH inicial del medio se ajustó con la ayuda de
soluciones de NaOH o H2SO4 2M, hasta lograr el valor deseado en cada caso. El medio se
esterilizó a 121°C y 1.5 psi durante 20 min. A esta solución basal se adicionó la fuente de
4.3 Inóculo
La suspensión de esporas que sirvió como inóculo se obtuvo a partir de cultivos desarrollados en
cajas petri con tres a cinco días de crecimiento, utilizando solución salina (NaCl al 0.9%). Cada
experimento se inoculó con el volumen adecuado de esta suspensión para tener 1X106
esporas/ml.
Para evaluar el efecto de la fuente de carbono y el pH inicial del medio sobre el crecimiento del
hongo y la producción de pectinasas, A. flavipes FP-500 se hizo crecer en medio basal, utilizando
arabinosa, ramnosa, xilosa, lactosa, glicerol y glucosa. Cuando se utilizaron monosacáridos como
fuente de carbono, el medio de cultivo fue adicionado con extracto de levadura al 0.1% (p/v).
Para cada una de las fuentes de carbono utilizadas se probaron tres valores iniciales de pH (3.5,
4.2 y 5.0), que se lograron mediante la adición de los volúmenes adecuados de soluciones de
NaOH o H2SO4 2M al medio de cultivo. En estos experimentos solo se registró el cambio del pH
a lo largo del cultivo. Todos los matraces se incubaron a 37ºC, en un agitador reciprocante a
200 rpm. Se tomaron muestras periódicas a cada matraz cada 24 h, las que después de registrarles
Para evaluar de manera preliminar el efecto inducible o represor del ácido galacturónico o
transferencia de micelio. Para esto, se inocularon los matraces con la cantidad adecuada de
como única fuente de carbono y extracto de levadura al 0.1%, como potenciador para la
germinación de las esporas. Al cabo de 16-18 horas, cuando el cultivo se encontraba en la fase de
ocasiones con solución salina (NaCl al 0.9%) estéril a 4°C. El último lavado se realizó con medio
basal estéril, y se obtuvo una suspensión de micelio, cuya concentración se determinó mediante la
técnica de peso seco. Con el volumen adecuado de dicha suspensión se inocularon 0.5 g L-1 de
micelio a matraces que contenían medio basal y pectina al 1% como fuente de carbono. Al cabo
glucosa o ácido galacturónico para alcanzar una concentración final de 1 g L-1. Se utilizó un
control sin adición, para comparar los resultados. Después de la adición, se tomaron muestras
por peso seco. El sobrenadante se mantuvo en refrigeración hasta su análisis. Todos los
del cultivo, registrando su valor en el momento de tomar las muestras. Los matraces se incubaron
Para observar la evolución de los parámetros de operación a lo largo del cultivo y conocer la
relación de este con la producción de las pectinasas, se utilizó un biorreactor BioFlo 110,
instalaron los bafles y dos impulsores, la distancia en la cual se colocaron los impulsores se
determinó con base en el diámetro del reactor. Así el primer impulsor se colocó a una distancia
igual a 1 diámetro y el segundo a 1.5 diámetros a partir de la base del reactor. Los cultivos en lote
desarrollados a nivel matraz utilizaron el medio basal descrito previamente. Y como única fuente
de carbono se empleó pectina, glucosa o ácido galacturónico, inoculando en cada caso con 1 X
106 esporas mL-1. En general, se emplearon para estos cultivos tres valores de pH inicial: 3.5, 4.2
y 5.0, empleando para ello una de dos modalidades. En la primera de ellas, el pH de los cultivos
se dejó evolucionar libremente, registrando de manera continua los cambios en este parámetro a
lo largo del experimento. Para la segunda, se mantuvo constante el valor del pH inicial, mediante
Para ambas modalidades, los cultivos operaron a 400 rpm, 37°C y 0.5 vvm de aire, registrando la
evolución del oxígeno disuelto (dO2) durante todo el cultivo. Se tomaron muestras periódicas
Para establecer el cultivo alimentado, fue necesario conocer los parámetros cinéticos del
un cultivo en lote desarrollado previamente. De esta manera, fue posible el establecimiento de las
concentración de sustrato (<1 g L-1). Para conocer el tiempo aproximado en que esto sucedía, se
et al, 2000), misma que se describe detalladamente más adelante dentro de este apartado.
Mediante este modelamiento, además de conocer el tiempo en que debía iniciar la alimentación,
se obtuvieron los valores de los parámetros cinéticos del microorganismo. Con estos datos fue
siguiente fórmula:
X
S0 =
Y XS
Donde
proceso de alimentación. Para ello, se utilizó un flujo de 0.042 L h-1, con el objetivo de
incrementar 1 L día-1 el volumen del reactor. El régimen de alimentación se dividió en tres etapas
de 24 h, durante las cuales se investigó si las condiciones específicas empleadas en cada caso
Durante el desarrollo de los cultivos en lote se utilizó un medio basal formulado con la
concentración de sales adecuada para un volumen final de 5 L. Así, en todo momento las sales
que componían al medio basal estuvieron en exceso. Por otra parte, la aireación se suplementó a
2.5 L min-1 a lo largo de todo el régimen de alimentación. Para descartar el efecto de la evolución
del pH sobre la producción de las pectinasas, el valor de este parámetro se mantuvo constante
mantuvieron a 37°C y una agitación de 400 rpm, tomando muestras periódicas cada 4 h. Las
Los regímenes de alimentación utilizados en esta etapa experimental fueron de dos tipos. En el
primero, se revisó el efecto de diferentes fuentes de carbono, mientras que con el segundo se
analizó el resultado de la variación del pH sobre la producción de las pectinasas por A. flavipes
FP-500.
Los valores de µ y D para los datos experimentales, se calcularon mediante el empleo de las
siguientes expresiones:
F Y XS S 0 µX
µ= y D=
V X Y XS S 0
Donde
YXS es el rendimiento, calculado a partir del experimento en lote utilizado como base.
alimentación
El crecimiento celular obtenido en cada muestra se determinó mediante la técnica de peso seco,
expresándose en g L-1.
100mM con la muestra, a 45 ºC durante 20 min. Las lecturas obtenidas se compararon contra una
definió como la cantidad de enzima que cataliza la formación de 1 µmol de ácido galaturónico
La actividad de endopectinasas se determinó con base en el cambio relativo que provocaban 0.5
la ayuda de un viscosímetro Canon Fenske # 200. Una unidad de actividad endo se definió como
absorbancia a 235 nm, provocado por la insaturación del enlace entre los carbonos 4 y 5 del ácido
reacción una alícuota de 0.2 mL, que se agregó a 1.8 mL de HCl 0.01 M, para detener la reacción.
Una unidad de actividad de pectin liasas se definió como la cantidad de enzima que provoca una
diferencia de 0.1 en la absorbancia de la solución de ácido clorhídrico a 235 nm, bajo las
El consumo de sustrato (en los experimentos con monosacáridos como fuentes de carbono) o la
aparición de grupos reductores (en el caso de las fermentaciones con polisacáridos como fuentes
un volumen final de 1 mL, considerando que la concentración máxima de muestra que detecta
reactivo DNS y se sometieron a ebullición por 5 min. Posteriormente, a cada tubo se le agregaron
agua en vez de muestra. La concentración obtenida en cada caso se calculó utilizando las curvas
El consumo de sustrato en los experimentos en los que se utilizaron polisacáridos como fuente de
carbono se estimó mediante la técnica descrita por Dubois et al (1956). Para ello, la cantidad
máxima de muestra que detecta esta técnica es de 0.1 mg mL-1. A la muestra diluida
de dejar reposar los tubos durante 20 min, los tubos se leyeron en el espectrofotómetro a 480 nm,
utilizando un blanco preparado con agua en vez de muestra. Las lecturas se compararon contra
El comportamiento del cultivo a lo largo del tiempo para los cultivos desarrollados en matraz se
dx s
= µ max x (Para crecimiento microbiano)
dt s + kS
ds µ s
= − max x (Para consumo de sustrato)
dt Yx / s s + k s
dp s
= αµ max x + βx (Para la producción de exopectinasas)
dt s + ks
donde
dx
Acumulación de biomasa en el medio de cultivo (gB L-1 h-1)
dt
ds
Consumo de sustrato en el medio de cultivo (gs L-1 h-1)
dt
dp
Acumulación de exopectinasas en el medio de cultivo (U L-1 h-1)
dt
pectinasas (U gb-1)
(U gb-1 h-1)
simultáneamente en un proceso por lotes (Nihtila and Virkkunen 1977, Chouakri et al. 1994), por
lo que la máxima velocidad específica de crecimiento (µmax) será, para este trabajo, el único
parámetro de utilidad.
como el más significativo en nuestra aproximación matemática, además de que en todos los casos
Con base en todas las condiciones anteriormente descritas, se especificó un vector de parámetros
P, definido como:
P = [µ max YX / S α ]
Las condiciones iniciales para modelar las ecuaciones (x0, s0 y p0) son las concentraciones
El rendimiento (YX/S) así como los parámetros identificables de los modelos de Monod (µmax) y
minimización:
F ([µmax Yx / s α β ]) = F ( P )
n n n
2 2 2
F ( P ) = ∑ xiexp − ximod ( P ) + ∑ siexp − simod ( P ) + ∑ piexp − pimod ( P )
[ ] [ ] [ ]
i =1 i =1 i =1
Donde los superíndices exp y mod indican los datos de los resultados experimentales y los
obtenidos a partir del modelo, respectivamente. Las diferencias entre los valores teóricos y los
F ( Pest ) = min
lo que significa que el valor de los parámetros estimados será aquel que produzca los menores
errores residuales entre los valores teóricos y los experimentales. La búsqueda del mínimo se hizo
cálculo.
Además, los valores de los parámetros obtenidos con el modelo se utilizaron para crear series de
datos sintéticos, adicionando ruido blanco a los resultados numéricos de x, S y p del modelo.
Cada serie de datos sintéticos produjo un vector de parámetros estimados de manera equivalente.
Así, se generó cierto número de parámetros equivalentes para estimar la media y la desviación
σi
∆Pi = ± t0.975
mN − q
donde:
1
V (u ) =
mN − q
∑ (uexp − umod ) 2
donde
u → x, S o p
Los efectos provocados por cada tratamiento experimental se compararon mediante la prueba
estadística de Diferencia Mínima Significativa (LSD, por sus siglas en inglés) (Montgomery,
2001). En todos los casos, la diferencia significativa entre medias se presenta como un diseño
factorial completamente aleatorizado mediante el parámetro (p), con el uso del programa
Los polisacáridos son macromoléculas de elevado peso molecular y algunos, como la celulosa,
son insolubles, por lo que las células microbianas no los pueden transportar a su interior. Debido
a esto, para metabolizarlos es muy probable que los monosacáridos y pequeños oligosacáridos
que conforman al polisacárido en cuestión, sean los inductores reales de los sistemas enzimáticos
sistema enzimático complejo, como el de las pectinasas, una estrategia adecuada consistiría en
estudiar el comportamiento del microorganismo al cultivarlo por separado en cada uno de los
azúcares que constituyen al polisacárido sujeto a la degradación (de Vries, 2003). Con base en lo
anterior, para el desarrollo de esta etapa experimental se hizo crecer al hongo en ácido
galacturónico, ramnosa, xilosa o arabinosa, por ser estos azúcares los principales constituyentes
de la pectina. Considerando además que, si el microorganismo produce una enzima ante cualquier
enzima es constitutiva (Mach y Zeillinger, 2003; Adriano-Anaya et al., 2005), el hongo se hizo
crecer también en glucosa y glicerol, por ser fuentes de carbono que no forman parte de la
complejo.
Por otro lado, a pesar de que hay pocos estudios referentes a la regulación por pH sobre la
actividades pectinolíticas específicas por hongos fitopatogénicos puede depender del pH del
medio de cultivo (Peñalva y Arst, 2000; Maccheroni et al, 2004). Debido a lo anterior, para los
utilizaron tres valores de pH inicial, 3.5, 4.2 y 5.0, cubriendo el intervalo ácido de crecimiento y
glicerol fue incluso mayor que la alcanzada con algunos de los monosacáridos relacionados
estructuralmente con la pectina, mientras que la generada en glucosa fue la producción más baja
de entre todas las encontradas (Tabla 2). Este comportamiento sugiere en primera instancia la
otros sistemas enzimáticos, como se reportó para la producción de lacasas con Botryosphaeria sp.
(Alves da Cunha et al, 2003). Además, existen reportes de exopectinasas constitutivas para otras
especies de Aspergillus (Aguilar y Huitrón, 1990; de Vries et al, 2002; Giese et al, 2008), que
con la pectina presentó diferencias significativas entre sí, destacando la producción obtenida en
ácido galacturónico (Tabla 2). De hecho, los títulos de actividad enzimática observados en esta
fuente de carbono, junto con las alcanzadas con ácido poligalacturónico y pectina son los más
altos de todas las fuentes de carbono probadas. Es probable que A. flavipes FP-500 produzca
isoformas con actividad exopectinolítica, por lo que las actividades de las pectinasas del tipo exo
obtenidas en mayor proporción con estas fuentes de carbono podrían tener una naturaleza
por otras especies de Aspergillus, en donde se determinó que la pectina y el ácido galacturónico
inducen algunos de los genes que codifican para la producción de poligalacturonasas (Herbert et
al, 2001; de Vries et al, 2002). Asimismo, mediante el desarrollo de cultivos de diversos tipos
como un excelente inductor de la actividad exopectinolítica (Pashova et al, 1999; Dartora et al,
2002; Shubakov y Elkina, 2002; Fawolea y Odunfab, 2003; Favela-Torres et al, 2006).
considerablemente mayor que la reportada para otras cepas de A. flavipes (Solis et al, 1997), y
Elkina, 2002).
Por otra parte, el pH inicial del medio pareció influenciar la actividad exopectinolítica obtenida
mayoría de los sustratos, la producción más alta de exopectinasas se obtuvo en los medios con pH
inicial de 3.5, lo que se observa con claridad en los cultivos de ácido galacturónico, xilosa,
glicerol y pectina, mientras que en arabinosa, glucosa y ácido poligalacturónico las mejores
esto sucedió en los medios con pH inicial de 5 (Tabla 2). En general, este comportamiento es
congruente con el de las poligalacturonasas producidas por hongos saprófitos, que se caracterizan
fuentes de carbono utilizadas (Tabla 3). Dentro del grupo de los azúcares simples, sólo se detectó
en ácido galacturónico en el cultivo con pH inicial de 3.5, con valores mayores que los obtenidos
mayor en todos los valores de pH inicial probados. La producción de las endopectinasas en las
anterior es congruente con lo reportado previamente para otras cepas del genero Aspergillus
En lo que se refiere al efecto del pH sobre la producción de endopectinasas por A. flavipes FP-
500, hubo una influencia clara de los valores más ácidos del pH sobre dicha producción. Así, la
actividad endopectinolítica fue mayor en los cultivos que iniciaron a pH de 3.5, mientras que su
valor disminuyó o fue prácticamente nulo en los medios con el pH inicial menos ácido (Tabla 3).
Lo anterior es congruente con lo reportado para las endopectinasas de otras cepas del género
cultivo con pH inicial de 4.0 (Malvessi y Moura, 2004). Este comportamiento indica que el pH
La actividad de pectin liasas producida por A. flavipes FP-500 se observó en todas las fuentes de
carbono probadas (Tabla 4). La producción obtenida en glicerol fue uno de los valores más bajos
(Tabla 4). Por su parte, la máxima producción de los medios con glucosa fue similar a las
xilosa, bajo cualquiera de las condiciones de pH probadas (Tabla 4). Esto es un hecho destacable,
trabajos que estudian la producción de pectinasas por diversos hongos. Para Penicillium
griseoroseum se reportó una buena producción de pectin liasas (∼ 60 U mL-1) al utilizar sacarosa
como fuente de carbono, aunque ante esta condición no se sugirió el carácter constitutivo de
dicha actividad enzimática, sino que sólo se destacó la capacidad del microorganismo para
producir pectin liasas en un sustrato que en general puede funcionar como un represor catabólico
para estas enzimas (Piccoli-Valle et al., 2001). En lo que respecta a las cepas del género de
Aspergillus, la producción de pectin liasas en un nivel constitutivo puede deducirse para A. niger,
al analizar que de una familia de seis genes que codifican para diversas pectin liasas, tres de ellos
(pelB, pelC y pelF) sintetizan enzimas que se expresan en una variedad de sustratos, que incluyen
a la glucosa (de Vries et al., 2002). Este es, entonces uno de los primeros reportes que señalan,
Bajo el mismo criterio con el que se señaló la naturaleza constitutiva de las exopectinasas
producidas por A. flavipes FP-500, se consideraron los valores obtenidos para la actividad de
pectin liasas en todas las fuentes de carbono probadas (Tabla 4). De esta manera, se observó una
serie de valores, desde unos muy pequeños hasta algunos cercanos a las 30 U mL-1, dependiendo
de la fuente de carbono usada. Esta variación en las producciones máximas de pectin liasas
sugiere que esta actividad también tiene isoformas de naturaleza inducible. Los sustratos en los
que se obtuvieron los mayores títulos de actividad de pectin liasas fueron el ácido galacturónico y
la pectina (Tabla 4), por lo que estos pueden considerarse como los principales inductores de esta
actividad.
A pesar de que fue posible observar la producción de pectin liasas por A. flavipes FP-500 en
todas las fuentes de carbono utilizadas, en general la producción de esta enzima fue baja en
comparación con los valores reportados para otros microorganismos. Así, con las cepas
pectin liasas, respectivamente, en cultivo sumergido al crecer sobre cáscara de limón como fuente
En lo que se refiere al efecto del pH inicial sobre la producción de pectin liasas, se observó una
diferencia entre monosacáridos y polisacáridos. Mientras que en los monosacáridos las mayores
producciones de pectin liasas se observaron en los medios más ácidos, lo que es evidente para
ácido galacturónico (Tabla 4), en los medios que utilizaron polisacáridos la máxima producción
relación con el pH inicial de cada cultivo, sugiere que el pH tiene un efecto significativo sobre la
producción de dicha actividad enzimática. Así, de acuerdo a las actividades alcanzadas en pectina
y ácido poligalacturónico, podría pensarse que estas enzimas se expresan sólo en los medios que
tienen un pH inicial menos ácido, como de hecho se ha reportado para otros hongos saprófitos
(Maccheroni et al, 2004). Sin embargo, los resultados de la producción obtenida en ácido
pectina.
En los experimentos descritos hasta el momento, sólo se ha considerado el efecto del pH inicial
sobre la producción de las pectinasas de A. flavipes FP-500. Sin embargo, debido a que no se ha
considerado la evolución del pH a lo largo del cultivo en las fuentes de carbono, no es posible
dilucidar el efecto de cada uno de estos factores sobre la producción de pectinasas, Para poder
discernir entre los verdaderos efectos de la fuente de carbono o el pH, fue necesario desarrollar
5.2 y 5.3.
Para reforzar las aseveraciones referentes a la naturaleza inducible o constitutiva de las pectinasas
producidas por A. flavipes FP-500, se desarrolló un análisis cinético de los datos de producción
volumétrica, basado en el modelo no estructurado descrito por Monod. Así, mediante el empleo
de la función de residuales para la aplicación del método Simplex (Aranda-Barradas et al, 2000),
se obtuvieron los valores numéricos de los parámetros cinéticos que describían cada uno de los
exopectinasas para cada una de las condiciones probadas. Dicha adecuación de los datos
A. flavipes FP-500 creciendo sobre glucosa y pectina, en los medios con pH inicial de 3.5 y 5.0.
En esta gráfica los intervalos de confianza de cada modelo se indican mediante líneas
discontinuas.
12 1,4 12 1,4
A B
10 1,2 10
Eopectinasas (U/mL)
1 1
Exopectinaas (U/mL)
8 8
0,8 0,8
6 6
0,6 0,6
4 4
0,4 0,4
2 2 0,2
0,2
0 0 0 0
0 20 40 60 80 0 20 40 60 80
12 90 12 45
C D
80 40
Pectina (g/L); Crecimiento (g/L)
Pectina (g/L); Crecimiento (g/L)
10 10
70 35
Exopectinasas (U/mL)
Exopectinasas (U/mL)
8 60 8 30
50 25
6 6
40 20
4 30 4 15
20 10
2 2
10 5
0 0 0 0
0 20 40 60 80 0 20 40 60 80
Tiempo (h) Tiempo (h)
Figura 3. Ajuste (línea continua) de los datos experimentales a un modelo cinético para el consumo de
sustrato (), crecimiento () y producción de exopectinasas (), a pH inicial de 3.5 (A & C) y 5.0 (B &
D), con glucosa (A & B) y pectina (C & D) como fuentes de carbono en cultivos en lote desarrollados a
nivel matraz. Las líneas punteadas representan los intervalos de confianza de las estimaciones del modelo
para S, x y p.
Debe considerarse que el modelo matemático muestra solamente las tendencias del
comportamiento observado en el experimento, y que por definición es sólo una representación del
crecimiento y producción de pectinasas como sistema físico. Así, no será extraño observar
tendencias que muestran una inflexión positiva o negativa en la curva que describen, aún donde
no existe ningún dato experimental que compruebe que es exactamente en ese punto sucede la
tendencia descrita por los datos experimentales, fue posible observar la variación de estos con
ácido poligalacturónico se obtuvieron los valores más bajos de este parámetro, mientras que en
acido galacturónico y en arabinosa las µmax presentaron valores más altos (Tabla 5). En todos
estos sustratos los resultados obtenidos para este parámetro fueron relativamente constantes en
cualquier condición de pH inicial utilizada, lo que parece indicar la dependencia del crecimiento
más por la fuente de carbono que por el pH inicial del cultivo. Sin embargo, en otro grupo de
sustratos (glucosa, ramnosa y pectina), los valores de µmax sí se vieron fuertemente afectados por
el pH inicial del cultivo. Así, los experimentos desarrollados sobre ramnosa mostraron un
incremento en µmax cuando el pH inicial era de 5.0, mientras que cuando el hongo se hizo crecer
en glucosa y pectina se observó una disminución significativa de µmax ante esa condición de pH
inicial (Tabla 5). Este comportamiento fue contrario al reportado para A. niger durante la
producción de glucoamilasas, ya que para esta cepa, los valores de las constantes de velocidad
específica de crecimiento obtenidos en glucosa a pH de 2.5 a 6.0, mostraron una ligera tendencia
a aumentar en los medios con los valores de pH más altos (Pedersen et al., 2000). Finalmente, los
valores más altos de µmax se obtuvieron para los cultivos desarrollados sobre pectina (Tabla 5).
Tabla 5. Parámetros cinéticos de crecimiento obtenidos con la modelación de los datos experimentales, mediante el empleo de la función de
residuales
µmax YX/S α
Parámetro cinético
(h-1) (g de biomasa g de sustrato-1) (U g de biomasa-1)
pH pH pH
Fuente de carbono
3.5 4.2 5.0 LSD* 3.5 4.2 5.0 LSD* 3.5 4.2 5.0 LSD*
Ácido 0.069 0.064 0.079 0.009 0.44 0.39 0.35 0.0596 37.89 4.14 14.53 3,9397
Galacturónico ± 0.008D,a ± 0.01C,b ± 0.005D,a ± 0.05 ± 0.04 ± ± 2.9A,a ± ± 2.5C,b
A,B,a B,C,a
0.03C,D,b 0.98 E,c
Arabinosa 0.15 0.05 0.12 0,022 0.36 0.44 0.37 0.0928 3.1 5.18 8.3 1,5704
± 0.021C,a ± 0.001 ± 0.03B,b ± 0.06C,D,a ± ± 0.03C,a ± 0.96D,c ± 0.68 ± 0.52D,a
C,D,c
0.02B,a E,b
Ramnosa 0.04 0.098 0.104 0,0153 0.44 0.31 0.39 0,0632 1.30 25.6 4.21 1,0959
± 0.01D.E,b ± 0.006 ± 0.01B,C,a ± 0.03B, ± 0.03 ± ± 0.2D,E,c ± ± 0.06E,b
B,a C,a D,E,b
0.017C,a 1.43A,a
Xilosa 0.029 0.029 0.026 0,0046 0.411 0.26 0.46 0.0238 0.013 0.73 0.84 0,1099
± 0.008E,a ± 0.003 ± 0.002E,a ± 0.05 ± 0.007 ± ± 0.003 ± ±
D,E,a A,B,b E,c
0.024B,a E,b
0.16F,a 0.087G,a
Glicerol 0.035 0.027 0.026 0,0081 0.48 0.26 0.26 0.0299 0.004 15.71 16.17 1.8473
± 0.003E,a ± 0.007 ± ± 0.02A,a ± 0.02 ± 0.06 E,b ±0.0024 ± 2.45 ±1.21B,a
E,b
0.005E,a,b E,b E,b C,a
Glucosa 0.17 0.07 0.08 0,082 0.49 0.52 0.41 0,0388 0.32 0.12 1.65 0.136
± 0.03B,a ± ± ± 0.04 ± ± ± 0.11 E ± 0.05 ±
0.01B,C,b 0.04C,D,a,b A,B,a
0.01A,a 0.036C,b F,c
0.15F,G,a
Ácido 0.034 0.032 0.027 0,0081 0.30 0.34 0.26 0.0383 11.97 19.99 27.88 2.5768
Poligalacturónico ± 0.005E,b ± 0.002 ± ± ± 0.03 ± 0.09 ± 1.53C,b ± ± 2.7A,a
D,E,b
0.0022A,a 0.014D,E,b C,D,a D,Eg,b
1.67B,b
Pectina 0.76 0.55 0.039 0,1104 0.34 0.34 0.68 0,0689 30.78 12.13 6.27 2.0281
± 0.06A,a ± 0.06A,b ± 0.007E,c ± 0.007E,b ± 0.03 ± 0.09A,a ± 0.95B,a ± ± 2.2E,c
D,b
0.33D,b
LSD** 0.0313 0.0254 0.016 0.0723 0.067 0.0763 1.9241 1.506 1.9426
Los resultados con cuyo análisis se elaboró este análisis estadístico se generaron en cultivos en lote desarrollados en matraz. Todos los cultivos se incubaron a
37°C durante 72 h, tomando muestras periódicas cada 24 h.
Cada valor es un promedio de 3 mediciones ± la desviación estándar entre las réplicas.
Para la interpretación del análisis estadístico de los datos, ver las notas de la Tabla 1.
Lo anterior sugiere que este hongo está más adaptado a crecer en polisacáridos que en
monosacáridos.
Los rendimientos calculados después del empleo de los métodos numéricos, fueron semejantes a
los obtenidos a partir de los datos volumétricos experimentales, con lo que se confirma la validez
y significancia de los datos generados a partir del modelo matemático. En general, los
rendimientos observados estuvieron entre 0.2 y 0.6 g de biomasa g de sustrato-1. Los valores más
altos para el rendimiento se observaron en pectina (Tabla 5), lo que refuerza la idea de mayor
Los rendimientos obtenidos por A. flavipes FP-500 sobre glucosa fueron semejantes al reportado
para A. nidulans (0.48 g de biomasa g de sustrato-1) en esa misma fuente de carbono (David et al,
2005). Los valores de este parámetro dependieron en mayor medida del pH inicial del cultivo.
Así, los rendimientos más altos se obtuvieron, en los medios con pH inicial de 3.5, para ácido
galacturónico, ramnosa y glicerol, mientras que con el pH inicial de 4.2 fue con arabinosa,
glucosa y ácido poligalacturónico donde se alcanzaron los mayores valores para este parámetro,
en tanto que con xilosa y pectina esto sucedió en los medios con el pH inicial de 5.0 (Tabla 5).
como su constitutividad o inducibilidad, de manera tal que se considera que una producción
presenta dicha asociación siempre que α ≠ 0. Como el microorganismo produce las pectinasas
para poder crecer sobre un sustrato complejo como la pectina, entonces dicha producción está
reportó valores de cero o negativos, carentes de toda significación física, para el parámetro β en
Piret, los valores estimados para α mostraron una dependencia de este parámetro tanto por el
sustrato como por el pH inicial utilizados (Tabla 5). El análisis independiente del efecto del pH o
la fuente de carbono sobre los parámetros α y µmax, si bien permite establecer tendencias y
comportamientos, podría no ofrecer una certeza definitiva a las hipótesis planteadas previamente.
Sin embargo, mostrar mediante una gráfica la relación µmax–α generada a partir de los datos
obtenidos en las fuentes de carbono más representativas permitió verificar, bajo otro criterio, la
cambios en los valores de µmax, es porque en estos casos la enzima producida es constitutiva,
comportamiento de inducibilidad. Con lo anterior como base, al trazar una gráfica que relaciona
i. En los datos del cultivo desarrollado con glucosa, los valores de µmax dependían
fuertemente del pH del medio, pero no así los de α (Figura 4a). Pareciera que aunque la µmax se
sugiere la producción basal de esta actividad enzimática ante dichas condiciones. De acuerdo al
ii. En sustratos como ácido galacturónico o ácido poligalacturónico, los valores de µmax
fueron iguales en los tres valores de pH inicial probados, pero las α variaron dependiendo del pH
inicial utilizado para cada medio. La representación gráfica de la relación de estos parámetros
muestra una clara tendencia lineal, mediante una línea casi vertical (Figura 4b). Esto sugiere que
hay una inducción de las exopectinasas, pero con una fuerte dependencia en el pH inicial, como
iii. En los cultivos que utilizaron pectina como fuente de carbono, se observó una relación
proporcional positiva entre los valores de los parámetros µmax y α (Figura 4c). Si bien este
comportamiento señala claramente la naturaleza inducible de las enzimas, en este caso no fue
altos comparados con los calculados para los otros sustratos, destacando los valores observados
en los medios con pH inicial de 3.5. Con lo anterior, se refuerza la idea de la inducción de las
Este es uno de los primeros trabajos en los que se sugiere la naturaleza constitutiva o inducible de
las exopectinasas con base en el análisis cinético de los datos de un cultivo, lo que significaría
45
40 A
35
30
25
20
α (U/g) 15
10
5 4.2 5.0 3.5
0
0 0.05 0.1 0.15 0.2 0.25
-1
µmax (h )
45
40 B
3.5
35
30 5.0
25
α (U/g)
4.2
20
15 3.5 5.0
10
5 4.2
0
0 0.05 0.1 0.15 0.2 0.25 0.3 0.35
-1
µ m ax (h )
45
40 C
35
30
3.5
α (U/g)
25
20
15
10 5.0
4.2
5
0
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
-1
µ m ax (h )
Figura 4. Correlación µmax - α , a diferentes valores de pH inicial en (a) glucosa (), (b) ácido
galacturónico, () y ácido poligalacturónico () y (c) pectina (•). Los números asociados a los
marcadores indican el pH inicial del medio de cultivo. Los parámetros cinéticos aquí reportados se
obtuvieron a partir de los datos de producción de exopectinasas en cinéticas desarrolladas a nivel matraz.
Constitutividad e inducibilidad en pectinasas de Aspergillus flavipes FP-500: análisis de 50
producción volumétrica y estudio cinético
Constitutividad e inducibilidad en pectinasas de Aspergillus flavipes FP-500: análisis de producción volumétrica y
estudio cinético
5.1.5 Conclusion
Aspergillus flavipes FP-500 creció mejor en pectina que en las otras fuentes de carbono probadas,
lo que sugiere que esta cepa está mejor adaptada a polisacáridos complejos que a cualquiera de
los monosacáridos que constituyen a estos polisacáridos. Los niveles de producción de las
acido galacturónico como los principales inductores de las mismas. Por su parte, la comparación
volumétrica y cinética sugirió la naturaleza constitutiva de las exopectinasas producidas por esta
cepa, así como las características que señalan a las endopectinasas como enzimas inducibles.
resultados parecen indicar cierto efecto del pH inicial sobre la producción de las pectinasas
producidas por A. flavipes FP-500. Sin embargo, con estos experimentos no fue posible dilucidar
con claridad cómo es ese efecto y si sucede sobre la producción o la actividad de las pectinasas
cuantificadas.
Dentro de las principales aportaciones de esta etapa experimental se cuentan la propuesta de las
pectin liasas como una actividad enzimática constitutiva, así como la identificación de la
naturaleza constitutiva o inducible de las pectinasas con base en criterios cinéticos, empleando
demostrado la sinergia entre las pectinasas producidas por cepas de Aspergillus, se ha reportado
sustratos de diversos tipos (Shuvakov y Elkina, 2002; Malvessi y Moura, 2004; Favela- Torres et
al, 2006), lo que sugiere alguna forma de acción concertada de estas enzimas.
Con base en lo anterior, el objetivo principal de los experimentos descritos en este apartado fue
Para determinar, de manera general, cómo sucede la producción de las pectinasas de A. flavipes
FP-500 a lo largo del cultivo desarrollado en pectina, se llevaron a cabo cultivos en lote a nivel
Mediante estos experimentos fue posible monitorear los parámetros de operación a lo largo del
desarrollo del cultivo, así como un muestreo frecuente del mismo. La metodología empleada para
Ante la presencia de un polisacárido, el hongo tiene que producir las enzimas que necesita para
obtener de éste sus azúcares constitutivos y poder metabolizarlo. Considerando que los hongos
dependencia con la fuente de carbono sobre la que se les haga crecer (Teixeira et al, 2000;
Carlsen y Nielsen, 2001; Lenartovicz et al, 2003), en el estudio del cultivo de un hongo con un
producidas.
Al analizar los resultados obtenidos mediante el desarrollo del cultivo, se observó que al inicio
del mismo la concentración de azúcares reductores fue baja, pero se incrementó hasta 2 g L-1 al
cabo de las primeras 24 h (indicado por la línea punteada en la Figura 5). Posteriormente, se
menores de los 0.5 g L-1, comportamiento que se mantuvo aproximadamente estable desde las 40
h hasta el final del cultivo (Figura 5A). En lo que respecta a la pectina existente en el medio, su
que indicó que este sustrato polimérico se estaba degradando a sus azúcares constitutivos
evidente entre las 16 y las 40 h, donde de hecho se desarrolló la fase de crecimiento exponencial
mantuvo aproximadamente constante hasta el final del cultivo, al mismo tiempo que sucedió la
pectinolíticas. Para facilitar la comparación de los resultados y verificar las posibles correlaciones
calculó la producción específica de las enzimas, es decir, la relación resultante entre la actividad
específica máxima durante las primeras 24 h de cultivo (Figura 5B). Lo anterior sugiere la
producción de las isoformas constitutivas de las exopectinasas producidas por A. flavipes FP-500
liberan al medio por la acción de las exopectinasas constitutivas, producidas en los tiempos
iniciales dentro del cultivo. Cuando la concentración de azúcares reductores disminuyó, también
incrementarse al cabo de las 40 h, hasta alcanzar su máximo hacia el final del cultivo. El segundo
cultivo. Aunque no fue posible caracterizar la cantidad y tipo de grupos reductores liberados en
anteriormente como un inductor de esta actividad enzimática. Esto, desde luego, deberá
verificarse experimentalmente.
Por otra parte, la actividad de endopectinasas comenzó a observarse hasta después de las
su máximo hacia el final del cultivo. Los resultados obtenidos para las actividades exo y
azúcares reductores producidos por la acción de las isoformas constitutivas de las exopectinasas,
9 3.5
8 A 3
Pectina (g L )
-1 5 2
4 1.5
3
1
2
1 0.5
0 0
20 2
Endopectinasas (U g de biomasa-1)
B
Exopectinasas (U g de biomasa-1)
18 1.8
16 1.6
14 1.4
12 1.2
10 1
8 0.8
6 0.6
4 0.4
2 0.2
0 0
7
C
Pectin liasas (U g de biomasa-1)
0
0 20 40 60 80
Tiempo (h)
Figura 5. Evolución del cultivo en lote desarrollado a nivel biorreactor, utilizando pectina como fuente de
carbono. Se partió de un pH inicial de 3.5, mismo que se dejó evolucionar libremente a lo largo del
cultivo. A. Consumo de pectina (), liberación de azúcares reductores () y Biomasa total (∗); B.
Producción específica de exopectinasas () y endopectinasas (); y C. Producción específica de pectin
liasas () y pH (X).
estas enzimas. En principio, las exopectinasas producidas de manera constitutiva actúan sobre los
pectinasas por parte del microorganismo. Una vez en el medio, las pectinasas inducidas
largo de la cadena principal, y generan con ello más extremos no reductores, que quedan
disponibles para el ataque masivo por parte de las exopectinasas recientemente inducidas. Un
modelo semejante permitió explicar la acción concertada de las celulasas (Prade, 1995), lo que
La producción específica de pectin liasas observada durante las primeras 24 h del cultivo parece
las pectin liasas pareciera ser independiente de la acción de las endopectinasas, y estar
relacionada con la liberación de los inductores debido a la acción de las exopectinasas sobre la
pectina. Sin embargo, hay reportes que indican que esta actividad enzimática se regula
principalmente por el pH del medio (Yakobi et al, 2000). Como se puede observar, la
disminución en la actividad específica de pectin liasas fue concordante con la disminución del
pH, mientras que el aumento de esta actividad coincidió con el incremento en el pH (Figura 5C).
En la sección 5.3 se discutirán con detalle experimentos planteados para revisar el efecto del pH
medio a las 24 h (Figura 5A). Lo anterior sugeriría la posibilidad de que algunas de las isoformas
inducibles de las exopectinasas y las endopectinasas estén sujetas a represión catabólica, como en
general sucede para muchas pectinasas (de Vries, 2003; Flipphi et al, 2003). Además, a partir del
análisis de estos resultados podría decirse que esa represión sucede cuando la concentración de
medio había concentraciones de glucosa de 7 g L-1 (Panda et al, 2004), mientras que la expresión
de las endopectinasas de A. citri se vio fuertemente reprimida con concentraciones de glucosa del
A pesar de que para la producción de pectin liasas sucedió también una disminución al cabo de
las 24 h de cultivo, no es posible sugerir que en este caso el efecto de una represión catabólica, si
se consideran los resultados obtenidos en el cultivo en lote desarrollado sobre pectina con un pH
inicial de 5.0 (no mostrados). En ese caso se observó, durante las primeras horas, una producción
de pectin liasas mayor que la reportada para este experimento, aún cuando la concentración
encontrado que las pectin liasas actúan sobre todo en la cáscara de los frutos cítricos para macerar
los tejidos, durante la invasión de estos por microorganismos patógenos (Deising et al, 1995;
Maccheroni et al, 2004). Debido a que en dichos materiales difícilmente se encuentran azúcares
reductores libres, no sería extraño que estos grupos no ejercieran un efecto importante en la
Para verificar las suposiciones establecidas respecto a la inducción de las exo y endopectinasas
por el ácido galacturónico liberado de la estructura principal de la pectina, así como lo referente a
precrecido en glucosa a diversos matraces con medio mineral fresco en el que la pectina era la
única fuente de carbono. Cuando comenzó la producción de las pectinasas (12 h después de la
el comportamiento del cultivo con cada azúcar adicionado, comparando contra un experimento
control (sin adición). La metodología empleada para esta serie experimental se describe
El crecimiento obtenido en las tres condiciones experimentales fue semejante durante las
primeras 8 h de cultivo después de la adición, sin embargo pareció verse favorecido por la
adición de azúcares reductores al medio (Figura 6A). Así, la concentración de biomasa fue mayor
en los experimentos a los que se les adicionó ácido galacturónico o glucosa (Figura 6A). El
reportado previamente para otras cepas, como A. oryzae durante la producción de α-amilasas
Durante las primeras horas después de la adición de los sustratos, el ácido galacturónico provocó
experimento control. Esta diferencia fue más notable hacia el final del cultivo, donde hubo una
ácido galacturónico, apoya el papel de inductor de esta fuente de carbono sobre la actividad
exopectinolítica.
exopectinasas en las primeras 4 h después de la adición, que reafirma la idea del efecto represor
de este azúcar sobre dicha actividad. Sin embargo, después de ese decremento se observó un
adición tanto de glucosa como del ácido galacturónico (Figura 6 C). Así, mientras que la
producción de estas enzimas durante las primeras 10 h después de la adición fue semejante a la
del experimento control, durante las siguientes 12 h esta se mantuvo prácticamente constante en
los cultivos a los que se adicionaron los azúcares reductores. A pesar de que la producción de esta
actividad enzimática se recuperó alrededor de las 40 h del cultivo, en ningún caso se alcanzaron
los niveles del control (Figura 6C). Este comportamiento pudo deberse a que, con la adición de la
se incrementó, y fue sólo hasta que esta disminuyó, alrededor de las 40 h (datos no mostrados),
micelio. En los cultivos en los que sucedió la adición de glucosa o ácido galacturónico, la
cultivo, en una proporción pequeña con respecto a la del experimento control (Figura 6D).
Para probar algunas de las hipótesis generadas, referidas al posible efecto represor que ejerce la
glucosa sobre las pectinasas, así como la probable reversibilidad de dicho efecto represor, se
propuso el diseño de un cultivo alimentado. El objetivo principal de este era mantener una
disponibles en el medio, para verificar las respuestas del hongo ante tales condiciones de
operación.
6 40
A B
35
5
30
Crecimiento (mg mL-1 )
Exopectinasas (U mL )
-1
4
25
3 20
15
2
10
1
5
0 0
3.5 2.5
C D
3
2
Endopectinasas (U mL-1)
2.5
1.5
2
1.5
1
1
0.5
0.5
0 0
0 10 20 30 40 50 60 0 10 20 30 40 50 60
Tiempo (h) Tiempo (h)
Figura 6. Experimento de transferencia de micelio, desarrollado a nivel matraz con pectina al 1% (p/v) como fuente
de carbono. Crecimiento (A), producción de exopectinasas (B), endopectinasas (C) y pectin liasas (D), del
experimento control (sin adición ), con adición (indicada por la flecha) de ácido galacturónico () o glucosa ()
al cabo de las 12 h después de la transferencia.
efecto de la glucosa.
constante es posible generar una condición fisiológica estable, mediante la cual se logre la
condición de que µ→ D. La metodología utilizada para generar dicha condición, así como para el
Para el desarrollo de este cultivo alimentado, se partió del establecimiento de un cultivo en lote,
con pectina como única fuente de carbono, en una concentración de 10 g L-1. Cuando existió una
concentración menor de 1 g L-1 de pectina en el reactor, este comenzó a alimentarse con una
solución de pectina, en una concentración inicial de 6.92 g L-1 (ver fórmula para cálculo de la
muestras periódicas del reactor cada 4 h. Al cabo de las primeras 24 h de alimentación, se cambió
concentración de 6.92 g L-1, misma que se alimentó durante las siguientes 24 h. De igual manera,
se realizaron muestreos periódicos durante esta fase de alimentación. Por último, el sustrato
alimentado se sustituyó nuevamente por pectina, en una concentración de 6.92 g L-1. Después de
que se concluyó la alimentación (lo que se indica con la flecha en la Figura 7), se permitió que el
cultivo continuara desarrollándose durante 6 h más, y se tomaron dos muestras ante esas
3,5
2,5
1,5
0,5
0
0 20 40 60 80
Tiempo (h)
Figura 7. Evolución del crecimiento (), concentración de pectina () y concentración de azúcares reductores ()
en el cultivo alimentado desarrollado sobre pectina, sometido a alimentación con pectina (Etapa I), glucosa (Etapa II)
y pectina (Etapa III) en un pH constante de 3.5. La flecha indica el momento en que cesó la alimentación.
las etapas I y II, en un valor entre 1.5 y 2 g L-1, y se incrementó en la Etapa III, donde se
alcanzaron valores de casi 3 g L-1. Sin embargo al final de esta etapa la concentración de biomasa
volvió a decrecer, llegando a los valores encontrados en un inicio (Figura 7). En lo que respecta a
un valor cercano a los 0.5 g L-1, mientras que la concentración de azúcares reductores fue
Otra manera de demostrar que mediante esta metodología se establece una condición en la que
mostrando los resultados en una gráfica donde se pueda observar la variación del valor de ambos
parámetros en el tiempo (Figura 8). En este caso, hacia el final del régimen de alimentación, se
0.06
0.05
I II III
µ (h ), D (h )
-1 0.04
0.03
-1
0.02
0.01
0
0 20 40 60 80
Tiempo (h)
Figura 8. Velocidad específica de crecimiento µ () y factor de dilución D (), calculadas a partir de los datos
experimentales de biomasa obtenidos durante el régimen de alimentación en el cultivo alimentado. Las líneas
constantes muestran los valores de µ y D, calculados a partir de los datos de biomasa predichos por el modelo
descrito con los parámetros cinéticos del cultivo en lote que sirvió como base para el establecimiento del cultivo
alimentado. La flecha indica el momento en que cesó la alimentación.
alimentación esta actividad pectinolítica se mantuvo prácticamente constante, alrededor del valor
obtenido con el cultivo en lote, con una actividad específica de ∼ 15 U g de biomasa-1 (Figura 9
A). Así, esta primera etapa de alimentación sirvió para establecer las condiciones fisiológicas
requeridas para estudiar el efecto de las fuentes de carbono sobre la producción de las pectinasas
de A. flavipes FP-500. En lo que se refiere a la etapa II, en la que se alimentó glucosa, durante las
aunque después de ese tiempo y hasta finalizar esa etapa de alimentación, dicha actividad
continuó observándose durante las primeras 8 horas de la Etapa III, cuando se volvió a alimentar
pectina. Sin embargo, pasando ese tiempo, la actividad se recuperó, y al finalizar el cultivo, esta
biomasa-1 durante la etapa I y la mitad de la etapa II (Figura 9B). En ese punto se observó un
biomasa-1, comportamiento que se observó durante las primeras 8 h de la etapa III. Al cabo de ese
Si se considera que existe un momento en el que hay una mezcla de las dos fuentes de carbono
que han sido alimentadas al reactor, es muy probable que ambas sean utilizables por el
que se alimentó primero seguirá consumiéndose o bien comenzará a diluirse por efecto de la
carbono será considerablemente mayor, y ejercerá el mayor efecto sobre el microorganismo. Los
resultados obtenidos en estos experimentos sugieren que este fenómeno sucede alrededor de las
durante las primeras 12 h de la etapa III, correspondería al efecto de la glucosa sobre estas
actividades pectinolíticas. Con lo anterior, se refuerza la idea del efecto represor de la glucosa
sobre ambas pectinasas, mismo que ya se sugirió a partir de los datos obtenidos en el experimento
endopectinasas, observado hacia finales de la etapa III, demostró la inducción de estas por la
pectina y reforzó la sugerencia de que la represión catabólica causada por la glucosa sobre la
25
A
Exopectinasas (U ge de biomasa-1)
I II III
20
15
10
3.5 I III
B
II
Endopectinasas ( g de biomasa-1)
2.5
1.5
0.5
14
I III
C
12 II
Pectin liasas (U g de biomasa-1)
10
0
0 20 40 60 80
Tiempo (h)
Figura 9. Producción específica de exopectinasas (A), endopectinasas (B) y pectin liasas (C) producidas por A.
flavipes FP-500 en un cultivo en lote alimentado. Se muestran las producciones obtenidas a partir del comienzo del
régimen de alimentación, para el cual se utilizó pectina (Etapa I), glucosa (Etapa II) y pectina (Etapa III) en una
concentración de 6.92 g L-1, las cuales se alimentaron en un flujo de 0.042 L h-1 durante 24 h cada una. La flecha
indica el momento en que cesó la alimentación.
En este caso fue más sencillo observar esa reversibilidad en la represión de las endopectinasas, lo
permitió obtener conclusiones con certeza. Sin embargo, pareciera no haber influencia de los
han reportado producciones de pectin liasas que no están sujetas a represión catabólica para
hongos patógenos de plantas y frutos cítricos, como Uromyces viciae (Deising et al, 1995), que
Para redondear los resultados obtenidos referentes a la represión provocada por la glucosa, la
reversibilidad de la misma y el efecto inductor de la pectina sobre las pectinasas producidas por
A. flavipes FP-500, se desarrolló un último cultivo en lote alimentado. En este se utilizaron los
mismos criterios que para el experimento descrito anteriormente, pero modificando la alternancia
en los sustratos de alimentación. Así, las condiciones óptimas para comenzar la alimentación se
la Etapa I se utilizó glucosa, luego se cambió a pectina para la Etapa II, y por último se volvió a
alimentar glucosa, en la Etapa III. Los parámetros cinéticos calculados a partir del cultivo en lote
tomado como base, permitieron conocer el tiempo en el que se alcanzarían las condiciones
todo el régimen de alimentación, por lo que la producción de las pectinasas se reporta con base en
Como se puede observar, la producción de exopectinasas fue baja en el cultivo en lote, ya que al
comenzar la alimentación esta actividad era como máximo de 1.5 U g de biomasa-1. Este valor se
Etapa II (Figura 10A). La respuesta observada durante la fase de alimentación con glucosa podría
el final del cultivo, aún cuando el último sustrato alimentado fue la glucosa (Figura 10A). Lo
anterior podría indicar la inducción de las isoformas inducibles de las exopectinasas por acción
de la pectina adicionada. Por otra parte, el que no se observe una disminución en la actividad
exopectinolítica debido a la adición de glucosa en la Etapa III, podría deberse a que en este caso,
observado para las poligalacturonasas de A. terreus, que no parecieron estar sujetas a represión
20
18 I II III A
Exopectinasas (U g de biomasa-1)
16
14
12
10
8
6
4
2
0
0.9
I II III B
Endopectinasas (U g de biomasa-1)
0.8
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
7
I II III C
Pectin liasas (U g de biomasa-1)
0
0 20 40 60 80 100
Tiempo (h)
Figura 10. Producción específica de exopectinasas (A), endopectinasas (B) y pectin liasas (C) producidas por A.
flavipes FP-500 en un cultivo en lote alimentado. Se muestran las producciones obtenidas a partir del inicio del
régimen de alimentación, para el cual se utilizó pectina (Etapa I), glucosa (Etapa II) y pectina (Etapa III) en una
concentración de 6.92 g L-1, las cuales se alimentaron en un flujo de 0.042 L h-1 durante 24 h cada una. La flecha
indica el momento en que cesó la alimentación.
indica que esta actividad no se produjo en el cultivo en lote desarrollado en glucosa. Tampoco se
observó la producción de esta actividad durante toda la Etapa I y hasta la mitad de la Etapa II,
que muestran el efecto de la alimentación de glucosa. Lo anterior, fortalece la hipótesis del efecto
casi 1 U g de biomasa-1 hacia el final de la etapa II, lo que comprueba el efecto inductor de esta
se volvió a alimentar glucosa, esta actividad disminuyó ligeramente hasta ∼ 0.5 U g de biomasa-1,
Por último, en este experimento la producción de las pectin liasas nuevamente fue muy variable,
5.2.4 Conclusiones
Las exopectinasas constitutivas de Aspergillus flavipes FP-500 son las primeras pectinasas
producción de ambas enzimas está influenciada negativamente por concentraciones elevadas (> 2
g L-1) de azúcares reductores, como el ácido galacturónico y la glucosa. Los resultados indican
que las pectinasas de A. flavipes FP-500 están sujetas a represión catabólica, aunque esta es
transitoria.
Por otra parte, la producción de pectin liasas no tiene una influencia importante de un grupo
etapa experimental indicaron que es el pH del medio el factor que determina la producción de
esta actividad pectinolítica, así como su aparición en el cultivo durante la degradación de pectina.
mediante las cuales fue posible obtener conclusiones específicas respecto a la regulación de las
pectinasas de A. flavipes FP-500 por la fuente de carbono; así como la propuesta de la relación
Los microorganismos saprófitos colonizan las plantas y los frutos cítricos debido a su
para crecer en medios con una amplia variedad de valores de pH, ya que al parecer poseen un
sistema regulatorio que asegura que las enzimas y otros productos sólo se generen a niveles de
pH en los cuales sus funciones serán eficientes (Prusky y Yakobi, 2003). Así, el pH del medio es
un parámetro de suma importancia dentro del estudio de la producción de pectinasas, dado que
este puede regular la expresión de dichas enzimas. Poco se sabe respecto a la regulación por el
pH de las poligalacturonasas producidas por los microorganismos del género Aspergillus (de
Vries y Visser, 2001). Sin embargo, se ha reportado que A. nidulans puede crecer en una amplia
variedad de valores de pH, que van desde 2.5 hasta 9.0, lo que a su vez requiere de la secreción
en el medio, de manera tal que el pH óptimo de éstas coincida con el de su ambiente (Manteau et
al, 2003).
En los resultados discutidos hasta este momento, algunas vertientes han conducido al hecho de
El objetivo de este apartado es revisar el efecto que ejerce el pH del medio sobre la producción y
Para verificar el posible efecto del pH sobre la producción de las pectinasas de A. flavipes FP-
500, se consideraron, en primera instancia, los cultivos en lote desarrollados a nivel matraz, en
los que se utilizaron diferentes valores de pH inicial. Para determinar dichos valores, se tomó en
cuenta el pH de muchos de los tejidos que pueden servir como huéspedes para este hongo, y que
se extienden desde un nivel ácido (pH 3.32) hasta alguno cercano a la neutralidad (pH 6.30)
(Manteau et al, 2003). Uno de los objetivos de esta etapa experimental era observar el
valores de pH, y obtener una correlación de dicha producción con las condiciones de pH inicial
probadas.
Los resultados obtenidos a partir de los cultivos desarrollados sobre diferentes fuentes de
carbono, para los que se utilizaron 3 valores diferentes de pH inicial, mostraron que la mayor
valores más ácidos (Tablas 2 y 3), mientras que la generación de pectin liasas no presentó un
patrón específico respecto al pH inicial del medio. Para esta actividad pectinolítica, las mayores
de A. flavipes FP-500 en los distintos valores de pH inicial, sugiere que existe un efecto de este
Para estudiar el efecto del pH sobre la producción de pectinasas, se llevaron a cabo cultivos en
lote a nivel biorreactor, utilizando diferentes condiciones de pH. Para establecer estos cultivos, se
tomaron como base los resultados obtenidos en los cultivos en lote desarrollados a nivel matraz,
mismos que se describieron en la sección 5.1, y considerando que los mejores inductores de la
producción de pectinasas por A. flavipes FP-500 fueron la pectina y el ácido galacturónico, estos
cultivos se desarrollaron con estas fuentes de carbono a dos condiciones de pH inicial: 3.5 y 5.0.
En estos cultivos, se permitió la libre evolución del pH, y se registró el valor de este parámetro a
lo largo de los mismos. Cuando se utilizó como fuente de carbono pectina, para ambos valores de
pH inicial del medio (3.5 y 5.0), el microorganismo creció con diferentes velocidades específicas
(µ = 0.1367 ± 0.01 y 0.1703 ± 0.008 h-1, respectivamente). Debido a lo anterior, para eliminar
cualquier efecto que las diferencias observadas en los valores de µ pudieran provocar en la
interpretación de los resultados, los resultados presentados en esta sección se reportan como las
luego disminuyó hasta alcanzar su valor más bajo y finalmente se incrementó hacia las últimas
cualquiera de los valores de pH inicial utilizados se presentaron dos etapas donde se obtuvo un
máximo de actividad específica. La primera de ellas se observó entre las 0 y las 36 h de cultivo,
inicial de 3.5, y a las ∼ 10 h cuando el cultivo inició en un pH de 5.0 (Figura 11 B). Al cabo de
las 36 h, después de la disminución que marcó el fin de la primera etapa, la producción específica
de las exopectinasas se volvió a incrementar, hasta alcanzar un nuevo máximo al final del cultivo.
del pH en el medio, ya que la disminución en el pH coincidió con la actividad más baja de esta
etapa, mientras que el incremento del mismo hacia el final del cultivo fue coincidente con en
aumento de la actividad exopectinolítica que determinó la segunda etapa de este cultivo (Figura
11 B).
menos dos grupos de pectinasas del tipo exo, cuya producción pudiera estar modulada por
poligalacturonasas de otros hongos patógenos de plantas, como Botrytis cinerea, que produjo tres
isoformas (pI de 4.9, 7.6 y 7.8) en el medio de pH 3, y cuatro (pI de 7.1, 7.4, 7.6 y 7.8) en los
medios con pH de 7.0. En ambos casos el pH del medio evolucionó libremente a lo largo del
cultivo (Manteu et al, 2003). Por su parte, para diferentes especies de Aspergillus, se ha reportado
sugieren la expresión de isoformas con esta actividad en dependencia con el pH del medio (de
La acidificación del medio podría deberse a la producción de ácidos orgánicos, como resultado
del metabolismo básico del hongo. El ácido oxálico se ha reportado como uno de los principales
mediante la quelación de los iones de calcio presentes en la estructura de la pectina (Manteu et al,
2003; Favaron et al, 2004). En el hongo Sclerotinia sclerotirum, la secreción de ácido oxálico es
paralela a la expresión de las isoformas ácidas de las poligalacturonasas, y una de las funciones
de éste es disminuir el pH del medio hasta el valor óptimo para la actividad de las
poligalacturonasas del tipo exo (Favaron et al, 2004). En Aspergillus, la función de la producción
de ácido oxálico aún no es del todo clara, aunque se ha correlacionado con la movilización de los
sustratos a partir de los polisacáridos de la pared celular de las plantas, debido a su capacidad
inició en pH de 3.5, donde el inicio de la producción coincidió con el valor más bajo de pH en el
6
A
5
pH
3
25
B
Exopectinasas (U g de biomasa-1)
20
15
10
1.4
Endopectinasas (U g de biomasa-1)
1.2
C
1
0.8
0.6
0.4
0.2
25
D
Pectin liasas (U g de biomasa-1)
20
15
10
0
0 20 40 60 80
Tiempo (h)
Figura 11. Evolución del pH (A, figuras sin relleno), la producción de exopectinasas (B), endopectinasas (C) y
pectin liasas (D) en cultivos en lote de A. flavipes FP-550 desarrollados a nivel biorreactor con pectina al 1% (p/v)
como única fuente de carbono, con valores de pH inicial de 3.5 () y 5.0 ().
por los productos de la acción previa de las exopectinasas. Sin embargo, a pesar de que la
producción de exopectinasas en los dos valores de pH inicial fue muy semejante (Figura 11B), la
las pectinasas del tipo endo pudiera deberse a la concentración máxima de azúcares reductores
producidos en cada caso (1.9 y 2.7 g L-1, respectivamente). Por un lado, una concentración
elevada de estos (mayor que 2.5 g L-1) podría tener un efecto sobre la producción de la actividad
endopectinolítica, como se reportó para las pectinasas de A. niger (Panda et al, 2004). Como la
producción de exopectinasas en ambos cultivos fue semejante, es probable que existan en cada
caso diferentes isoformas con esta actividad pectinolítica, que sean las que determinan la cantidad
y tipo de azúcares reductores producidos. A su vez, esto tendría un efecto sobre la producción de
endopectinasas, como ya se había propuesto. Por otro lado, es posible también que la producción
de endopectinasas esté influenciada únicamente por el pH inicial del medio. Para discernir entre
el efecto ejercido por cada uno de estos dos factores, fue necesario el desarrollo de experimentos
La producción de pectin liasas mostró diferencias respecto al pH inicial del cultivo, siendo
considerablemente mayor la obtenida en los medios que iniciaron en un pH de 5.0 (Figura 11 D).
Como sucedió con las exopectinasas, durante las primeras 24 h de cultivo se observó una primera
etapa de producción de esta actividad pectinolítica, cuyo valor máximo se obtuvo alrededor de las
20 h en ambos casos (Figura 11 D), durante las que sucedió una disminución en el pH del medio
donde se observó también un incremento en la producción de pectin liasas, que fue más evidente
hipótesis que sugiere la regulación en la expresión de pectin liasas por valores de pH tendientes a
liasas por hongos filamentosos (Peñalva y Arst, 2002). Los dos máximos de actividad observados
en cada caso sugieren además la posibilidad de que el hongo produzca isoformas de pectin liasas
con distintos valores de pI, que se estarían expresando en el medio en dependencia con el pH del
mismo. Esto no sería extraño, si se considera que para A. niger se han reportado al menos cuatro
pectin liasas diferentes, cuyos puntos isoeléctricos van de 3.65 hasta 7.7 (de Vries y Visser,
2001).
Con base en los resultados descritos anteriormente, referentes a la relación de la evolución de los
corrida experimental se llevó a cabo utilizando ácido galacturónico como única fuente de
carbono. De esta manera, se podría determinar el efecto real de uno de los principales productos
Para los cultivos en lote desarrollados con ácido galacturónico se utilizaron también dos valores
de pH inicial (3.5 y 5.0). En este caso, se observó un incremento del pH a medida que el cultivo
avanzaba (Figura 12 A). En cualquiera de los dos valores de pH inicial utilizado, el valor final del
mismo fue ∼ 6.5. La alcalinización del medio en cultivos con ácido galacturónico es un hecho
pocas veces reportado durante la producción de pectinasas por hongos del género Aspergillus,
aunque sí se ha observado en otros hongos patógenos de plantas como Botrytis cinerea (Wuben et
al, 2003) y Sclerotinia sclerotiorum (Cotton et al, 2003). A pesar de que el ácido galaturónico es
considerarse una fuente de carbono represora (Runco et al, 2001; Panda et al, 2004). Por lo
que conforman a las proteínas producidas en las primeras horas de cultivo, con la subsecuente
liberación de amonio al medio, lo que provocaría la alcalinización del mismo (Peñalva y Arst,
2002). Adicionalmente, el consumo del ácido galacturónico a lo largo del cultivo podría también
ser la causa de la alcalinización del medio observada en estos casos. Como el ácido galacturónico
comportamiento distinto al observado para cualquiera de las otras fuentes de carbono utilizadas.
Como sucedió con la pectina, aunque el hongo creció a una velocidad semejante en estos cultivos
cultivos que iniciaron en un pH de 3.5, la primera fase de producción se observó entre las 0 y las
38 h de cultivo, mientras que en los de pH inicial de 5.0 ésta sucedió en las primeras 36 h (Figura
12 B). En ambos casos, el valor máximo de esta primera etapa se obtuvo antes de que el pH del
durante el incremento del pH en el medio. En los medios que iniciaron en un pH de 3.5 pareció
suceder una tercera etapa de producción máxima entre las 36 y las 54 h (Figura 12 B). Estos
resultados refuerzan la sugerencia de que A. flavipes FP-500 produce varias isoformas con
actividad exopectinolítica y sugiere además que la expresión de cada una está regulada por
7 A
6
pH
3
0
70
B
Exopectinasas (U g de biomasa-1)
60
50
40
30
20
10
1
Endopectinasas (U g de biomasa-1)
0.9 C
0.8
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0
25
D
Pectin liasas (U g de biomasa-1)
20
15
10
0
0 20 40 60 80 100
Tiempo (h)
Figura 12. Evolución del pH (A), la producción de exopectinasas (B), endopectinasas (C) y pectin liasas (D) en
cultivos en lote de A. flavipes FP-500 desarrollados a nivel biorreactor con ácido galacturónico al 1% (p/v) como
única fuente de carbono, con valores de pH inicial: 3.5 () y 5.0 ().
Por otro lado, la elevada producción específica de exopectinasas alcanzada con esta fuente de
carbono, en comparación con la obtenida en pectina (Figura 11 B), confirmó el papel de esta
(Figura 12 C), cuando la concentración de ácido galacturónico había disminuido casi a la mitad
inició en pH de 3.5 fue menor que la alcanzada en pectina en el mismo valor de pH inicial en un
se había incrementado hasta ser mayor a 5.0 (Figura 12 A). Por otra parte, en los medios que
ellas sucedió cuando el pH aún estaba por debajo de 6.0, mientras que la segunda fase se observó
hacia el final del cultivo, cuando el pH en el medio era cercano a la neutralidad (Figura 12 C).
Los resultados obtenidos sugieren que la actividad de endopectinasas está regulada tanto por el
ácido galacturónico como por el pH ácido en el medio, y que como sucede con otros hongos
saprófitos, como Botrytis cinerea (Wubben et al, 2003), A. flavipes FP-500 codifica para
obtenidas ante distintas condiciones de producción han reportado diferencias que apoyarían esta
hipótesis. Sin embargo, sería necesario hacer un análisis electroforético y zimográfico muy
La producción de pectin liasas no se observó en los medios que iniciaron en el pH de 3.5 durante
las primeras 60 h, y después esta fue muy baja (Figura 12 D). Sin embargo, la producción
obtenida en los medios con pH inicial de 5.0 fue semejante a la observada en pectina en las
mismas condiciones de cultivo (Figura 12 D). En este caso hubo también dos etapas de
pH en el medio era mayor que 5.0, es decir, durante la segunda fase del cultivo (Figura 12 D).
Este comportamiento confirma que la producción de pectin liasas sucede preferentemente en los
medios con valores de pH mayores a 5.0, y que este parámetro tiene la mayor influencia sobre la
flavipes FP-500
En primera instancia, se destacó la acidificación del medio en los cultivos desarrollados sobre
pectina. En este caso, se mencionó la posible producción de ácidos orgánicos, como el ácido
actividad por la fuente de carbono, y se sugirió que el pH también podía ejercer cierta regulación
al respecto.
Por otro lado, a pesar de que la producción de pectin liasas pareció estar más influenciada por
Con base en lo anterior, en esta etapa experimental se llevaron a cabo cultivos en lote utilizando
mantuvo constante en un valor de 3.5 para las dos fuentes de carbono. La segunda condición fue
evolucionar libremente, hasta que alcanzó su valor más bajo (∼36 h). A partir de entonces, el pH
se mantuvo constante en ese valor hasta el final del cultivo. Para el ácido galacturónico, la
evolución del pH se controló de manera tal que semejara las condiciones observadas en pectina.
se retrasó, comenzando a observarse hasta las 24 h del mismo en ambas fuentes de carbono
(Figura 13). En pectina, la máxima producción obtenida fue como máximo de 4 U g de biomasa-1
biomasa-1 (Figura 13 B). En este último caso, la producción de exopectinasas fue semejante a la
observada hacia el final del cultivo en lote desarrollado sobre ácido galacturónico con pH inicial
20 10
18 A B 9
Exopectinasas (U g de biomasa-1)
14 7
12 6
10 5
8 4
6 3
4 2
2 1
0 0
0 20 40 60 80 0 20 40 60 80 100
Tiempo (h) Tiempo (h)
Figura 13. Evolución de la producción de exopectinasas producidas en cultivos en lote desarrollados sobre pectina
(A) o ácido galacturónico (B). En la primera condición probada para estas fuentes de carbono, el pH se mantuvo
constante a lo largo de todo el cultivo en un valor de 3.5 (). Para la segunda condición, en pectina el pH se dejó
evolucionar libremente, y cuando este llegó a su valor más bajo (indicado por la flecha), se mantuvo constante hasta
el final del cultivo (), mientras que en ácido galacturónico el valor del pH se hizo variar de modo que su
comportamiento fuera semejante a la evolución observada en la pectina con pH inicial de 3.5 ().
13 A) refuerza la idea de que la acidificación del medio es provocada por la generación de ácidos
orgánicos, que propiciarían las condiciones necesarias para la producción de estas pectinasas,
actuando ya sea sobre la estructura de la pectina para dejarla más accesible al ataque enzimático,
o bien estabilizando el sitio activo de las enzimas, para mejorar la afinidad de éstas por su
sustrato (Favaron et al, 2004). Por otra parte, a pesar de que el pH del medio se controló en
no fue tan alta como la observada en los cultivos en los que se permitió la libre evolución del pH
(Figura 13A), probablemente porque en este caso no se expresaron las exopectinasas inducidas
por los valores de pH menos ácidos. En ácido galacturónico, cuando la evolución del pH se
asemejó a la observada en pectina, la producción exopectinolítica obtenida fue muy baja, y sólo
se observó hacia las 70 h de cultivo (Figura 13 B). Lo anterior sugiere que con la asimilación del
ácido galacturónico se generan compuestos que provocan el incremento del pH del cultivo.
constante en valores de 3.5, en pectina la producción endopectinolítica obtenida fue muy baja
(Figura 14 A), mientras que en ácido galacturónico ésta fue incluso mayor a la obtenida en este
mismo sustrato en los cultivos con pH inicial de 3.5 y libre evolución del mismo (Figura 14 B).
de exopectinasas obtenida en este caso. Por otro lado, cuando el pH se mantuvo en valores
ácidos, a partir de una evolución del pH inicial, la actividad de endopectinasas se incrementó casi
en valores ácidos induce una mayor proporción de estas pectinasas. En ácido galacturónico,
actividad endopectinolítica al cabo de las 70 h de producción (Figura 14 B), que pareciera ser una
endopectinasa inducida por valores ácidos de pH, y cuya expresión pudiera ser independiente de
2.5 1.2
A B
Endopectinasas (U g de biomasa -1)
Endopectinasas (U g de biomasa-1)
1
2
0.8
1.5
0.6
1
0.4
0.5 0.2
0 0
0 20 40 60 80 0 20 40 60 80 100
Tiempo (h) Tiempo (h)
Figura 14. Evolución de la producción de endopectinasas producidas en cultivos en lote desarrollados sobre pectina
(A) o ácido galacturónico (B). En la primera condición probada para estas fuentes de carbono, el pH se mantuvo
constante a lo largo de todo el cultivo en un valor de 3.5 (). Para la segunda condición, en pectina el pH se dejó
evolucionar libremente, y cuando este llegó a su valor más bajo (indicado por la flecha), se mantuvo constante hasta
el final del cultivo (), mientras que en ácido galacturónico el valor del pH se hizo variar de modo que su
comportamiento fuera semejante a la evolución observada en la pectina con pH inicial de 3.5 ().
La producción de pectin liasas se afectó severamente afectada por niveles ácidos de pH. Así, en
observarse hasta casi las 30 de producción en pectina (Figura 15 A), mientras que en ácido
galacturónico esta producción se observó hasta las 40 h de cultivo (Figura 15 B). En ambos casos
la producción de pectin liasas fue muy baja en comparación con la obtenida en los cultivos en
lote con libre evolución del pH. Lo mismo sucedió cuando en pectina el pH se mantuvo en su
valor mínimo hasta el final del cultivo (Figura 15 A), o cuando el pH del cultivo desarrollado
sobre ácido galacturónico se asemejó al de la pectina (Figura 15 B). Al parecer, las bajas
producciones de pectin liasas alcanzadas en las condiciones más ácidas son expresadas por genes
regulados por valores de pH ácidos. Aunque no se sabe si A flavipes FP-500 produce diferentes
isoformas de pectin liasas reguladas a distintos valores de pH, hay reportes de pectin liasas con
diversos puntos isoeléctricos para otras especies de Aspergillus, como A. niger (de Vries y Visser,
7 1.8
A B 1.6
6
1.4
5
1.2
4 1
3 0.8
0.6
2
0.4
1 0.2
0 0
0 20 40 60 80 0 20 40 60 80 100
Tiempo (h) Tiempo (h)
Figura 15. Evolución de la producción de endopectinasas producidas en cultivos en lote desarrollados sobre pectina
(A) o ácido galacturónico (B). En la primera condición probada para estas fuentes de carbono, el pH se mantuvo
constante a lo largo de todo el cultivo en un valor de 3.5 (). Para la segunda condición, en pectina el pH se dejó
evolucionar libremente, y cuando este llegó a su valor más bajo (indicado por la flecha), se mantuvo constante hasta
el final del cultivo (), mientras que en ácido galacturónico el valor del pH se hizo variar de modo que su
comportamiento fuera semejante a la evolución observada en la pectina con pH inicial de 3.5 ().
También, pudiera suceder que la producción de las pectin liasas observadas en la segunda etapa
del cultivo sea independiente del efecto del pH del medio, y estar más bien reguladas por otras
condiciones encontradas en estos cultivos, o bien ser expresadas a etapas tardías de los mismos.
Si cualquiera de estas suposiciones fuera cierta, entonces tal vez haya una mayor producción de
pectin liasas en el medio ante estas condiciones, pero probablemente el pH ácido generado para el
valores de pH
las pectin liasas en condiciones ácidas de pH, se produjo un extracto pectinolítico a partir de un
inicial de 3.5, mismo que se dejó evolucionar libremente a lo largo del cultivo. Después de
recuperar el filtrado enzimático con actividad de pectin liasas, este se incubó a diferentes valores
de pH utilizando para ello soluciones reguladoras de acetatos (para los valores de pH de 2 a 6), y
de Tris-HCl (para el pH de 8), durante 24 h, retirando muestras cada 8 h, para verificar dicha
estabilidad. A la muestras así obtenidas se les cuantificó la actividad de pectin liasas, mediante la
Después de la incubación del filtrado enzimático con soluciones reguladoras de distinto pH, se
cuantificaron diferentes valores para la actividad de pectin liasas del filtrado enzimático, respecto
estabilidad en la actividad de pectin liasas durante las 24 h de incubación, aunque entre las 8 y las
16 h, esta actividad disminuyó ligeramente para volverse a incrementar a su valor inicial hacia el
final del tiempo de incubación. Sin embargo, cuando el filtrado se incubó con soluciones
reguladoras de pH igual a 6 y 8, la actividad se incrementó a partir del valor inicial (Figura 16).
Así, en los valores de pH de 6.0, la actividad se incrementó en un 50%, mientras que en los que
Los resultados obtenidos mediante el desarrollo de estos experimentos permitieron demostrar que
la actividad de pectin liasas es sensible a valores ácidos de pH, y al parecer se activa en valores
mayores de 5.0.
250
200
Pectin liasas (%)
150
100
50
0
0 5 10 15 20 25 30
Tiempo de incubación (h)
Figura 16. Estabilidad de las pectin liasas en los valores de pH de 2 (), 4 (), 6 () y 8 (X) durante 24 h de
incubación de una alícuota del filtrado enzimático con los reguladores preparados a los distintos valores de pH.
5.3.4 Uso del cultivo en lote alimentado para conocer la relación del
Para complementar los resultados obtenidos hasta el momento, se verificó el efecto de pH del
en la sección de materiales y métodos. El cultivo base sobre el que partió la fase de alimentación
continuo de pectina en una concentración de 6.92 g L-1. En este caso, las diferentes etapas del
régimen de alimentación se establecieron con base en el pH del cultivo. Así, durante la etapa I el
pH se mantuvo constante en 3.5, luego este se incrementó a 5.0 durante la etapa II, y por último
A
2.5
Biomasa (g L-1)
1.5
1
I II III
0.5
0
20
18 B
Exopectinasas (U ge de biomasa-1)
16
14
12
10
4 I II III
2
0
3
C
Endopectinasas (U g de biomasa-1)
2.5
1.5
0.5
I II III
0
9
8 D
Pectin liasas (U g de biomasa-1)
2
I II III
0
0 20 40 60 80 100
Tiempo (h)
Figura 17. Biomasa (A), producción específica de exopectinasas (B), endopectinasas (C) y pectin liasas (D)
producidas por A. flavipes FP-500 en un cultivo en lote alimentado desarrollado sobre pectina. Se muestran las
producciones obtenidas a partir del comienzo del régimen de alimentación, para el cual se utilizó pectina en una
concentración de 6.92 g L-1, en un flujo constante (0.042 L h-1). Durante la etapa I, se mantuvo el pH del medio
constante en un valor de 3.5, en la etapa II el pH del medio fue de 5.0, y en la etapa III se provocó una disminución
en el pH hasta 2.0.Se tomaron muestras periódicas cada 4 h durante el régimen de alimentación.
constante durante las primeras dos etapas, mientras que en la última fase dicha concentración
disminuyó notablemente. Lo anterior podría deberse al pH tan ácido en el que transcurrió esta
pH del medio se mantuvo constante (Figura 17 B, C y D). Al parecer, durante esta etapa se
observó el efecto inductor de la pectina sobre la producción de cada una de las actividades
pectinolíticas.
17 B). Además de la inducción por pectina, pareció observarse también el efecto inductor de los
valores de pH cercanos a la neutralidad sobre la expresión de las exopectinasas. Por otra parte, la
de alimentación (Figura 17 C). Al parecer, ante la condición de pH probada durante esta etapa no
misma (Figura 17 D), que comprueba la posible inducción de la fracción de pectin liasas que se
actividad de endopectinasas sufrió primero una disminución severa durante las primeras horas de
la etapa III, aunque después se incrementó hasta llegar al valor máximo obtenido durante la fase
de alimentación (Figura 17 C). Dado que la actividad endopectinolítica es muy estable en valores
segunda parte de la Etapa III sugiere que en esta fase se indujo la formación de endopectinasas
ácidas.
Por otra parte, la producción de pectin liasas se afectó severamente durante la etapa de
alimentación en la que el pH del medio se mantuvo ácido (Figura 17 D). Dicha disminución
podría deberse a la disminución en la estabilidad de la enzima en valores tan ácidos para el medio
5.3.5 Conclusión.
del medio sufre cierta evolución conforme sucede el desarrollo del mismo. En las primeras horas
exopectinolítica basal. Es muy probable que la acidificación del medio suceda por la producción
de ácidos orgánicos específicos, cuya función sea facilitar el ataque de estas enzimas al modificar
la estructura de la pectina, y/o estabilizar los sitios activos de las mismas para incrementar su
producción de la actividad endopectinolítica. Los resultados obtenidos parecieron indicar que las
pectinasas del tipo endo están reguladas tanto por la concentración y tipo de la fuente de carbono
presente en el medio, como por el pH del medio de cultivo. Finalmente, la producción de pectin
liasas pareció estar más relacionada con el pH del medio, produciéndose en mayor proporción a
Por otra parte, se sugirió que A. flavipes FP-500 produce varias isoformas de estas pectinasas, que
se expresan ante diferentes valores de pH. Así, los resultados obtenidos parecieron indicar que los
genes que codifican para las exopectinasas, endopectinasas y pectin liasas producidas por este
hongo pueden generar enzimas con valores óptimos de pH ácidos o básicos, lo que fue más
6. Conclusiones generales
Aspergillus flavipes FP-500 es una cepa adaptada al crecimiento sobre polisacáridos
sustratos, en comparación con los obtenidos en azúcares simples. Las endopectinasas, pectin
pectina y el ácido galacturónico son los principales inductores de las mismas. Por otra parte, la
exopectinasas constitutivas son las primeras que se observan en el medio de cultivo, mientras
constitutivas e inducibles. Además, ambas pectinasas están sujetas a represión catabólica por
carbono, aunque ésta es transitoria. Por otra parte, la producción de pectin liasas no tiene una
El pH inicial del medio de cultivo determina la producción máxima de las pectinasas obtenidas
mayoría de los medios con pH inicial de 3.5, mientras que la mayor producción de pectin
liasas se obtiene en los medios que iniciaron a pH de 5.0. La evolución del pH en el medio de
7. Ampliación de la investigación
Sin embargo, la investigación respecto al estudio de las pectinasas de esta cepa aún está
incompleta, por lo que haría falta analizar la producción de las otras enzimas que componen al
liasas, aún quedan algunos aspectos por resolver, que permitirán ampliar la investigación. A
pectina.
sustratos.
¾ Analizar la expresión de los diversos genes pectinolíticos al hacer crecer al hongo ante
8. Referencias bibliográficas
1. Adriano-Anaya, M., Salvador-Figueroa, M., Ocampo, J.A. y García-Romera, I. (2005).
3. Akimitsu, K., Isshiki, A., Ohtani, K., Yamamoto, H., Eshel, D. y Prusky, D. (2004)
Sugars and pH: A clue to the regulation of fungal cell wall-degrading enzymes in
4. Almasy. G.A., Mah, R.S.H. (1984). Estimation measurement error variances from
5. Alvarez Arriaga, M.E. (2005). Evaluación de los residuos de tamarindo como fuente de
6. Alves da Cunha, M.A., Barbosa, A.M., Giese, E.C. y Dekker, R.F.H. (2003). The effect
7. Annis S.L. y Goodwin, P. H., (1997). Recent advances in the molecular genetics of
8. Aranda-Barradas, J. S., Delia, M. L. y Riba, J.P. (2000). Kinetic study and modelling of
12. Casas López, J.L. (2004). Producción de lovastatina a partir de Aspergillus terreus en
13. Cavalitto, S.F. y Mignone, C.F. (2007). Application of factorial and Doehlert designs
14. Chand, S. y Mishra, P. (2003) Research and application of microbial enzymes – India’s
15. Chouakri, N., Fonteix, C., Marc, I. y Corriou, J. P. (1994). Parameter estimation of a
16. Cotton, P.; Kasza, Z., Bruel, C., Rascle, C. y Févre, M. (2003). Ambient pH controls the
17. Dartora, A.B., Bertoolin, T.E., Bilibio, D., Silveiira, M.M. y Costa, J.A.V. (2002)
18. David, H., Morkeberg, K., Roca, C., Akesson, M y Nielsen, J. (2005), CreA influences
the metabolic fluxes of Aspergillus nidulans during growth on glucose and xylose.
19. Deising, H., Frittrang, A. K., Kunz, S. y Mendgen, K. (1995). Regulation of pectin
20. de Vries, R. P., Jansen, J., Aguilar, G., Parenicova, L., Joosten, V., Wülfert, F., Benen,
21. de Vries, R.P. (2003). Regulation of Aspergillus genes encoding plant cell wall
22. de Vries, R.P. y Visser, J. (2001). Aspergillus enzymes involved in degradation of plant
23. Delgado, L., Trejo, A.B., Huitrón, C., Aguilar, G. (1993). Pectin lyase from Aspergillus
24. Dubois, M., Gilles, K. A.; Hamilton, J. K.; Rebers, P. A. y Smith, F. (1956)
25. Dunn, I.J. y Ingham, J. (1995). Dynamics of biological processes via modeling and PC
26. Eshel, D., Miyara, I., Ailing, T., Dinoor, A. y Prusky, D. (2002). pH regulates
27. Esquerré-Tugayé, M.T., Boudart, G., y Dumas, B. (2000). Cell wall degrading
dialogue between plants and pathogens. Plant Physiology Biochemistry. 38(1/2), 157-
163.
in the interaction between Sclerotinia sclerotiorum and soybean. MPMI. 17(12): 1402–
1409.
30. Fawolea, O.B., Odunfab, S.A. (2003). Some factors affecting production of pectic
223 – 227.
32. Garcia-Ochoa F, Casas J.A. (1999). Unstructured kinetic model for sophorolipid
33. Giese, E.C., Dekker, R.F.H. y Barbosa, A.M. (2008). Orange bagasse as substrate for
35. Gummadi, S.N. y Kumar, S. (2008). Batch and fed batch production of pectin lyase and
36. Guimares, L.H.S., Peixoto-Nogueira, S.C., Michelin, M., Rizzatti, A.C.S., Sandrim, V.,
Zanoelo, F.F., Aquino, A.C.M.M., Junior, A.B. y Polizeli, M.L.T.M. (2006) Screening
37. Hadj-Taieb, N., Ayadi, M., Khlif, M., Mrad, K., Hassari, I. y Gargouri, A. (2006).
Fermentor production of pectinases on gruel, a local by-product and their use in olive
38. Herbert, C., Bourdart, G., Borel, C., Jacquet, C, Esquerré-Tugayé, M.T. y Dumas, B.
(2001). Regulation and role of pectinases in pytopatogenic fungi en: Advances in pectin
39. Hoondal, G.S., Tiwari, R.P., Tewari, R., Dahiya, N. Y Beg, Q.K. (2002). Microbial
alkaline pectinases and their industrial applications: a review. Applied and Microbial
587.
44(2): 263–267.
42. Jayani, R.S., Saxena, S. Y Gupta, R. (2005). Microbial pectinolytic enzymes: a review.
44. Leathers, T.D. (2004). Enzymatic saccharification of defatted corn germ. Biotechnology
45. Lenartovicz, V., Marques de Souza, C. G., Guillen Moreira, F. y Peralta, R. M. (2003).
Temperature and carbon source affect the production and secretion of a thermostable β-
46. MacCabe, AS.P., Orejas, M., Tamayo, E.N., Villanueva, A. y Ramón, D. (2002).
47. Maccheroni, W., Luiz Araujo, W., Acevedo, L. J. (2004). Ambient pH-regulated
48. Mach, R.L., Zeilinger, S. (2003). Regulation of gene expression in industrial fungi:
49. Malvessi, E., Moura da Silveira, M. (2004). Influence of medium composition and pH
50. Manteau, S., Abouna, S., Lambert, B. y Legendre, L. (2003). Differential regulation by
51. Mathew, S. y Abraham, T.E. (2005) Studies on the production of feruloyl esterase from
cereal brans and sugar cane bagasse by microbial fermentation. Enzyme and Microbial
52. Miller, G.L. (1959). Use of dinitrosalisylic acid (DNS) for determination of reducing
53. Montgomery, D.C. (2001). Design and analysis of experiments. John Wiley & Sons,
New York.
55. Najafpour, G.D. (2007). Biochemical Engineering and Biotechnology. Primera Edición.
58. Oncu, S., Unluturk, S., Tari, C. y Gogus, N. (2006). Various factors affecting the pellet
59. Ortega, N., de Diego, S., Perez-Mateos, M. y Busto, M.D. (2004). Kinetic properties
61. Panda, T., Sushma, R. N., Prem, M.K. (2004). Regulation of synthesis of the pectolytic
203-2.
filamentous fungi and yeasts. Microbiol Mol Biol Rev. 66(3), 426–446.
66. Prade, R.A., Zhan, D., Ayoubi, P., Mort, A.J. (1999). Pectins, pectinases and plant-
395-406
70. Rodriguez-Nogales, J.M., Ortega, N., Perez-Mateos, M. y Busto, M.D. (2008). Pectin
hydrolysis in a free enzyme membrane reactor: an approach to the wine and juice
71. Ruijter, G.J.G., van de Vondervoort, P.J.I. y Visser, J. (1999). Oxalic acid production
72. Runco, R., Navarro, A.R., Maldonado, M.C. (2001). Regulation of the production of
73. Schuster, E., Dunn-Coleman, N., Frisvad, J.C. y van Dijck, P.W.M. (2002) On the
426-435.
filamentous fungi Aspergillus niger ACM D-119 and Penicillium dierckxii ACIM F-
75. Solís, S., Flores, M.E. y Huitrón, C. (1997). Improvement of pectinase production by
76. Talebnia, F., Pourbafrani, M., Lundin, M. y Taherzadeh, M.J. (2008). Optimization
3(1):108-122.
77. Teixeira, M.F.S., Lima-Filho, J.Ll., Durán, N. (2000). Carbon sources effect on
pectinase production from Aspergillus japonicus 586. Braz J Microbiol. 31, 286-290.
Aspergillus FP-180 and Aspergillus niger N402 growing under stress induced by the pH
80. Varela, H.R., Gomes, J., Lakshmi, S., Gururaja, R., Suryanarayan, S. y Kumar, D.
81. Ward, O.P., Qin, W.M., Dhanjoon, J., Ye, J. y Singh, A. (2006). Physiology and
82. Wubben, J.P., Have, A.T., van Kan, J.A.L., Visser, J. (2000). Regulation of
83. Yakoby, N., Kobiler, I. Dinoor, A. y Prusky, D. (2000). pH regulation of pectate lyase
Juan S. Aranda
Departmento de Bioingeniería
Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnología
Instituto Politécnico Nacional
Av. Acueducto s/n, Col. La Laguna Ticoman
D.F.CP 07340, México
Tel: 01 57 29 60 00. Anexo 56338
E-mail: jaranda@upibi.ipn.mx
Guillermo Aguilar-Osorio*
Departamento de Alimentos y Biotecnología
Facultad de Química
Universidad Nacional Autónoma de México
Ciudad Universitaria, Conj. E, Química
CP 04510, D.F., México
Tel: 01 55 56 22 53 05.
E-mail: gao@servidor.unam.mx
Financial support: This work was financially supported by the National Council for Science and Technology (Mexico), the Technologic Institute for
Higher Studies of Ecatepec (México), the Research Office of the National Polytechnique Institute (Mexico), and the National University of Mexico,
DGAPA projects IN207603 and IN219604.
Keywords: constitutive enzymes, inducible enzymes, initial pH, kinetic modeling, pectinases.
The aim of this work was to describe growth dynamics, barrier during microbial attack which involves the action of
substrate depletion and polygalacturonases production several enzymes (de Vries and Visser, 2001). Fungi of the
by Aspergillus flavipes FP-500 in batch cultures by genus Aspergillus are among the microbial species that can
means of unstructured models. The microorganism was degrade pectin, so producing a number of pectinases
cultivated on several mono- di- and poly- saccharides, (Texeira et al. 2000). The importance of pectin-degrading
and then the culture development modeled with Monod enzymes lies mainly in their actual and potential uses in a
and Leudeking-Piret equations. The kinetic parameters number of industries, like in food processing, textile
related to the models (µmax, γx/s, α and β) were obtained industry, paper and pulp industry, pectic wastewater
by minimizing the quadratic residuals function with a treatment and animal feed, among others (Jayani et al.
simplex algorithm. An accurate description of 2005; Niture, 2008). In addition, the understanding of the
experimental data was attained with the proposed regulation process of the production of polygalacturonases
models. Besides, modeling provided significant kinetic will contribute to get insights in the molecular dialogue
information on microbial degradation of complex between the host and the pathogen, during microbial
substrates, such as the correlation between specific invasion of plant cell wall (Esquerré-Tugayé et al. 2000;
growth rate µmax and production yield α, suggesting that Lang and Dörnenburg, 2000).
A. flavipes FP-500 polygalacturonases are actually
constitutive, but also that there is a certain degree of Although the specific signal molecule that triggers
induciblility in these enzymatic activities. pectinases synthesis remains unknown, the general
accepted idea is that fungal cells produce a low level of
Pectin is a complex polysaccharide found in middle constitutive pectinolytic enzymes, which release a few
lamellae of plant cell wall. It represents the first plant molecules of mono or oligosaccharides from a polymer in
*Corresponding author
Figure 1. Fitting (continuous line) of the experimental data to a kinetic model for substrate depletion ( ), growth ( ) and
polygalacturonases production ( ), at initial pH of 3.5 (a and c) and 5.0 (b and d) with glucose (a and b) and pectin (c and d)
as carbon source. Dotted lines represent confidence intervals for the model estimations of S, x and p. Solid markers ( ) are pH
evolution in the culture.
plant structure. These small molecules are transported into In this context, the present work aimed at describing the
the microorganism and start a massive expression of the dynamics of fungal growth, substrate depletion and
degrading pectinases (Mach and Zeilinger, 2003). This polygalacturonases production in batch cultures under
would mean that several pectinolytic activities are induced different conditions of carbon source and initial pH of the
by a number of substrates (Prade et al. 1999). Pectinases culture, using the Monod and Leudeking-Piret unstructured
production is regulated in different fungal species, models (Thilakavathi et al. 2007). After obtaining the
depending on the carbon source (Crotti et al. 1998; Wubben kinetic parameters, their numerical values were correlated
et al. 2000; Olsson et al. 2003) and the pH of the medium in order to point out the constitutive or inducible nature of
(de Vries and Visser, 2001; Peñalva and Arst, 2002). the produced polygalacturonases.
The mathematical modeling of microbial growth and MATERIALS AND METHODS
process performance has led to improved design and
operation of mycelial fermentations and has improved the Microorganism
ability of scientists to translate laboratory observations into
commercial practice. Unstructured modeling represents a Aspergillus flavipes FP-500, was isolated in Mexico from
particular and useful application of growth mathematical rotten tomatoes. The strain was maintained at 4ºC on PDA
analysis that could provide some important hints on agar plates.
constitutiveness and inducibility of metabolites production,
such as some enzymatic activities, on a kinetic, quantitative The strain was identified by conventional methods
basis. considering its morphological characteristics growing on
2
Polygalacturonases from Aspergillus flavipes
different media and by microscopic examination. A hydrolysis of polysaccharides containing samples with a
comparison with type strains was done resulting in the sulfuric acid and following color development of the phenol
identification of the strain as member of flavipes species. reagent (Dubois et al. 1956).
A. flavipes FP-500 was grown on basal medium, containing Culture behavior in time is described with the following
(g L-1): K2HPO4, 2; KH2PO4, 2; and (NH4)2SO4, 5. The equations:
medium was sterilized by autoclaving at 121ºC for 20 min.
The initial pH of the medium was adjusted with 2 M NaOH dx S
or H2SO4. To this basal salt solution, a suitable carbon = μ max x (microbial growth)
source was added to attain a final concentration of 10 g L-1. dt S + kS
Inoculum dS μ S
= − max x (substrate depletion)
Spores were collected from 3-day-old agar slants with dt Yx / s S + k s
Saline-Tween solution (NaCl, 0.9% and Tween 80, 0.01%).
A final concentration of 1 x 106 spores/mL was obtained by dp S
adjusting with sterile water. Monosaccharide based media = αμ max x + βx (polygalacturonases
(see below) were supplemented with 0.1% (w/v) of yeast dt S + ks
extract. production)
Microbial biomass. Cell growth was measured by dry Yx/s biomass on substrate yield coefficient (gb gs-1)
weight and expressed as g L-1.
α growth-associated coefficient for pectinases
Polygalacturonase activity. This was measured by production (U gb-1)
determination of the reducing sugars produced from 1%
(w/v) pectin solution after incubation at 45ºC for 20 min at β growth-independent coefficient for pectinases
pH 5.0. One unit of polygalacturonase activity was defined production (U gb-1 h-1)
as the amount of enzyme that catalyzes the formation of 1
µmol of galaturonic acid under assay conditions (Trejo- Monod constants µmax and ks are not simultaneously
Aguilar et al. 1996). identifiable in batch process (Nihtila and Virkkunen, 1977;
Chouakri et al. 1994), so the maximal specific growth rate
Substrate depletion. Monosaccharide substrates is the only useful obtained parameter.
consumption was measured through quantification of
reducing sugars using 3,5-dinitrosalicilic acid, with the Kinetic parameters in the Leudeking-Piret model, α and β,
corresponding sugar as the reference standard (Miller, indicate the relation between growth and pectinases
1959). Polymers consumption was estimated after acid production in a fungus culture. The parameter α expresses
3
Martínez-Trujillo, A. Et al.
F ([μ max Yx / s α β ]) = F ( P ) u x, S or p
RESULTS
[ ] [ ] [ ]
n n n
F ( P ) = ∑ xiexp − ximod ( P ) + ∑ siexp − simod ( P ) + ∑ piexp − pimod ( P )
2 2 2
i =1 i =1 i =1
Modeling of growth and pectinases production
Where superscripts exp and mod indicate experimental data
Kinetic parameters (µmax, γx/s, α) estimated by Nelder-Mead
and model results, respectively. The differences between
simplex algorithm (Table 1) showed to be accurate enough
experimental and theoretical values were calculated for the
to build a reliable model that describes the kinetics of
n sample points (n = 12). The estimated kinetic parameters
Aspergillus flavipes FP-500 on several carbon sources, as it
Pest are those that satisfy the condition
can be seen from the model fitting in Figure 1. A good fit to
F (Pest) = min experimental data was reached with this mathematical
treatment.
Meaning that the estimated parameters are chosen in order
to produce the minimum residual errors between the model Kinetic parameters as a function of pH and
theoretical values and the experimental data. The search of substrate
the minimum was carried out with a Nelder-Mead simplex
Kinetic parameters for the mathematical model were
method, given an arbitrary initial vector P0 to start up the
determined in each experimental condition described
algorithm.
before. Monod-type growth on substrates such as xylose,
The model can be coupled to estimated parameters Pest in glycerol and polygalacturonic acid resulted in maximal
order to create synthetic data sets, by adding white noise to specific growth rates around 0.03 h-1, while on galacturonic
numerical results on x, S and p from the model. Each acid µmax ≈ 0.07 h-1 and on lactose µmax was about 0.25 h-1.
synthetic data set produces a new vector of equivalent With all the forementioned substrates the maximal specific
estimated parameters. Therefore, calculating a number of growth rate was approximately constant regardless the
equivalent parameters allows the estimation of the mean initial pH in the culture. Thus, for these substrates,
and the standard deviation for every kinetic parameter estimated µmax values seem to indicate dependence of
(Table 1). growth on the carbon source, but not on the initial pH of the
culture. However, estimated µmax for other group of
Variance estimations in the model substrates (glucose, rhamnose, pectin) was strongly affected
by the initial pH. On the one hand, experiments with
Variance associated to parameters. Confidence intervals of rhamnose as a carbon source showed increasing µmax values
the best estimated parameters are given by as the initial pH was rised from 3.5 to 5.0. Growth on
glucose and pectin presented a significative drop of the
σi specific growth rate µmax when the initial pH in the culture
ΔPi = ± t0.975 was increased.
mN − q
4
Polygalacturonases from Aspergillus flavipes
Concerning polygalacturonases production represented by estimated µmax and α (Figure 2). Three major trends were
the Leudeking-Piret model, estimated β values were equal observed:
to zero for all the substrates and initial pH tested. In
contrast, α parameter estimations showed a dependence on i) For glucose, plotting µmax vs. α it could be observed that
both the substrates and the initial pH. The lowest α value the estimated µmax values strongly depended on the pH of
was obtained for glycerol (0.004 U/g, pH = 3.5), meanwhile the medium (Figure 2a). While α value at pH 3.5 and 4.2
high values were obtained for rhamnose (25.6 U/g, pH = was similar at 5.0 a higher value was obtained. However,
4.2), galacturonic acid (37.89 U/g, pH = 3.5), this latter value was relatively low as compared with other
polygalacturonic acid (27.88 U/g, pH = 5.0) and pectin substrates.
(30.78 U/g, pH = 3.5). Values obtained for pectin and
galacturonic acid were exceptionally high when compared ii) For substrates as lactose, galacturonic acid or
to other substrates in media with initial pH of 3.5. polygalacturonic acid, estimated µmax was the same on the
Similarily, for glycerol, the product yield α is relatively three initial pH tested. However, different α values were
high (15.71 U/g for pH = 4.2 and 16.17 U/g for pH = 5.0) obtained, depending on the initial pH used for each
although this substrate is not a structural component of medium. A graphical representation of µmax – α parameters
pectin. shows a linear, nearly vertical, relationship (Figure 2b).
Polygalacturonases constitutiveness and iii) With pectin as the carbon source, there is a positive
inducibility from kinetic proportional relationship between µmax and α (Figure 2c).
Table 1. Kinetic parameters for A. flavipes FP-500 on several carbon sources and different starting pH.
µmax YX/S α
Kinetic parameter -1
(h ) (g of biomass/g of substrate) (U/g of biomass)
pH pH pH
Carbon source
3.5 4.2 5.0 3.5 4.2 5.0 3.5 4.2 5.0
5
Martínez-Trujillo, A. Et al.
6
Polygalacturonases from Aspergillus flavipes
flavipes FP-500, which is expressed under any pH was significantly increased at low pH (3.5) for pectin, or at
condition. a slightly higher pH (5.0) for polygalacturonic acid.
With other substrates unrelated to pectin structure (glycerol Even though kinetic parameters are not definitive evidence
and lactose) α ranged from 0.004 to ~15 U/g. However, α of enzyme induction, an indirect inference from µmax - α
raised up to 25 U/g or more for cultures developed on relationship would indicate the conditions for an increase of
carbon sources related to pectin. Among them, the highest enzymatic activity, mainly due to substrate induction.
was attained on galacturonic acid, and it was comparable in
magnitude to those observed for polygalacturonic acid and ACKNOWLEDGMENTS
pectin. This seems to indicate a certain substrate-
inducibility degree in the enzymatic production. The authors acknowledge Dr. Edgar Salgado for the critical
reading of the manuscript.
When a graphical analysis between µmax and α was
performed for pectin-related substrates, different behaviors REFERENCES
were observed. On galacturonic acid, the fungus had the
same maximal specific growth rate (~0.07 h-1) but different ARANDA-BARRADAS, Juan S.; DELIA, Marie Line and
α values for every initial pH tested (Figure 2b). This RIBA, Jean-Pierre. Kinetic study and modeling of the
suggests that on galacturonic acid there is an induction in xylitol production using Candida parapsilosis in oxygen-
this strain of polygalacturonase activity depending on initial limited culture conditions. Bioprocess and Biosystems
pH, as it has been reported for other Aspergillus species (de Engineering, March 2000, vol. 22, no. 3, p. 219-225.
Vries et al. 2002). On polygalacturonic acid (Figure 2b) it
CHOUAKRI, N.; FONTEIX, C.; MARC, I. and
was clear that initial pH of the medium also conditioned the
CORRIOU, J.P. Parameter estimation of a Monod-type
polygalacturonases activity. It seems that for almost all the
model. Part I: Theoretical identifiability and sensitivity
substrates, the initial pH of 3.5 increases
analysis. Biotechnology Techniques, October 1994, vol. 8,
polygalacturonases activity. Thus, initial pH conditions
no. 10, p. 683-688.
regulate pectinases activity.
CROTTI, Luciana B.; TERENZI, Héctor F.; JORGE Joao
Some similar conclusions have been reached in induction
A. and POLIZELI, María de Lourdes. Regulation of pectic
and repression research on cellulases by A. niger (Hanif et
al. 2004). However, although our results on kinetic enzymes from the exo-1 mutant strain of Neurospora
modeling certainly give some insight on polygalacturonases crassa: effects of glucose, galactose and galacturonic acid.
production, constitutiveness and inducibility, there is still Journal of Basic Microbiology, July 1998, vol. 38, no. 3, p.
room for other confirmatory experiments. 181-188.
ii) Culture media containing monomeric substrates related ESQUERRÉ-TUGAYÉ, Marie-Thérese; BOUDART,
to pectin (xylose, rhamnose, arabinose) produced in general Georges and DUMAS, Bernard. Cell wall degrading
a low polygalacturonases yield (α), eventhough some enzymes, inhibitory proteins, and oligo-saccharides
important increases in enzymatic activity are attained by participate in the molecular dialogue between plants and
establishing the appropiate initial pH (3.5 for galacturonic pathogens. Plant Physiology and Biochemistry, January
acid and 4.2 for rhamnose) in the culture medium. 2000, vol. 38, no. 1-2, p. 157-63.
iii) Complex substrates such as pectin or polygalacturonic HANIF, A.; YASMEEN, A. and RAJOKA, M.I. Induction,
acid induced important polygalacturonase production that production, repression, and de-repression of exoglucanase
7
Martínez-Trujillo, A. Et al.
synthesis in Aspergillus niger. Bioresource Technology, SEIBOTH, Bernhard; PAKDAMAN, Babak S.; HARTL,
September 2004, vol. 94, no. 3, p. 311-319. Lukas and KUBICEK, Christian P. Lactose metabolism in
filamentous fungi: how to deal with an unknown substrate.
JAYANI, Ranveer Singh; SAXENA, Shivalika and Fungal Biology Reviews, February 2007, vol. 21, no. 1, p.
GUPTA, Reena. Microbial pectinolytic enzymes: A review. 42-48.
Process Biochemistry, September 2005, vol. 40, no. 9, p.
2931-2944. SHUBAKOV, Anatoly A. and ELKINA, Elena A.
Production of polygalacturonases by filamentous fungi
LANG, C. and DÖRNENBURG, H. Perspectives in the Aspergillus niger ACMF-1119 and Penicillium dierckxii
biological function and the technological application of ACIMF-152. Chemistry and Computational Simulation,
polygalacturonases. Applied Microbiology and 2002, vol. 2, no. 7, p. 65-68.
Biotechnology, April 2000, vol. 53, no. 4, p. 366-375.
TEIXEIRA, Maria F.S.; LIMA-FILHO, José L. and
MACH, R.L. and ZEILINGER, S. Regulation of gene DURÁN, Nelson. Carbon sources effect on pectinase
expression in industrial fungi: Trichoderma. Applied production from Aspergillus japonicus 586. Brazilian
Microbiology and Biotechnology, January 2003, vol. 60, Journal of Microbiology, October/December, 2000, vol. 31,
no. 5, p. 515-522. no. 4, p. 286-290.
MILLER, G.L. Use of dinitrosalisylic acid reagent for THILAKAVATHI, Mani; BASAK, Tanmay and PANDA,
determination of reducing sugars. Analytical Chemistry, Taprobata. Modeling of enzyme production kinetics.
March 1959, vol. 31, no. 3, p. 426-428. Applied Microbiology and Biotechnology, January 2007,
vol. 73, no. 5, p. 991-1007.
NIHTILA, M. and VIRKKUNEN, J. Practical
identifiability of growth and substrate consumption models. TREJO-AGUILAR, Blanca; VISSER, Jaap and
Biotechnology and Bioengineering, December 1977, vol. AGUILAR-OSORIO, Guillermo. Pectinase secretion by
19, p. 1831-1850. Aspergillus FP-180 and Aspergillus niger N402 growing
under stress induced by the pH of culture medium. In:
NITURE, Suryakant. K. Comparative biochemical and VISSER, J. and VORAGEN, A.G.J. eds. Pectins and
structural characterizations of fungal polygalacturonases. Pectinases: Proceedings of an International Symposium,
Biologia, February 2008, vol. 63, no. 1, p. 1-19. (December 3rd to 7th, 1995, Wageningen, The Netherland).
Progress in Biotechnology, 1996, vol. 14, p. 915-920.
OLSSON, Lisbeth; CHRISTENSEN, Tove M.I.E.;
HANSEN, Kim P. and PALMQVIST, Eva A. Influence of WUBBEN, Joss P.; HAVE, ArjenTen; VAN KAN, Jan
the carbon source on production of cellulases, A.L. and VISSER, Jaap. Regulation of
hemicellulases and pectinases by Trichoderma reesei Rut endopolygalacturonase gene expression in Botrytis cinerea
C-30. Enzyme & Microbial Technology, October 2003, vol. by galacturonic acid, ambient pH and carbon catabolite
33, no. 5, p. 612-619. repression. Current Genetics, February 2000, vol. 37, no. 2,
p. 152-157.
PAKULA, Tiina M.; SALONEN, Katri; UUSITALO, Jaana
and PENTTILÄ, Merja. The effect of specific growth rate
on protein synthesis and secretion in the filamentous fungus
Trichoderma reesei. Microbiology, January 2005, vol. 151,
no. 1, p. 135-143.
Note: Electronic Journal of Biotechnology is not responsible if on-line references cited on manuscripts are not available any more after the date of publication. 8
Supported by UNESCO / MIRCEN network.