MEDICINA

MODALIDAD SEMIPRESENCIAL

GUÍA DE CONTENIDOS Y ACTIVIDADES

Bioquímica - Inmunología y
Asignatura
Nutrición Normal

Subasignatura Bioquímica - Nutrición Normal

Unidad didáctica 2. Biocatálisis

Tema Enzimas

Autor Gustavo Bertot

 Medicina

Índice
Introducción 3
Objetivos 4
1. Aspectos básicos de la catálisis y los catalizadores. Las enzimas como
catalizadores biológicos 5
2. Cinética enzimática 7
3. Inhibición enzimática 10
4. Regulación de la actividad enzimática 13
Ideas clave 15

2 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

 Medicina

Introducción
Los alquimistas medievales descubrieron que la presencia de algunos elementos extraños en
una mezcla hacía posible la obtención de productos diferentes a los iniciales. Desconociendo
la naturaleza del fenómeno, imaginaron la existencia de una sustancia que transformara los
metales como el plomo y el hierro en oro, y consagraron sus esfuerzos a encontrarla, en vano.
Siglos después, la acumulación de experiencias y observaciones llevó, en 1836, a Berzelius a
conjuntar todos estos fenómenos en una sola definición, y acuñó las voces “fuerza catalítica”
y “catálisis”.
En una forma imaginaria, los catalizadores pueden compararse con la piedra filosofal de los
alquimistas, ya que permiten transformar sustancias no en oro, sino en una serie de materia-
les valiosos de uso cotidiano. Si una reacción química se lleva a cabo lentamente puede ser
acelerada utilizando un catalizador.

RECORDÁ:
Las reacciones químicas que ocurren en los sistemas vivientes son tan variadas
como complejas. La mayoría de las reacciones que ocurren en los sistemas vivos
son catalizadas por proteínas conocidas con el nombre de enzimas. Se puede
afirmar, con fundamento, que sin la catálisis enzimática no sería posible la vida.

Es suficiente decir que el proceso base de la actividad vital, la asimilación del CO2 por la clo-
rofila de las plantas, es un proceso fotoquímico y catalítico. La transformación por las células
de albúminas, grasas, carbohidratos, así como la síntesis de otras moléculas son catalíticas.
La formación de las cadenas de ADN, que es la base del código genético, depende de la pre-
sencia de ciertas enzimas.
Este documento es una guía que te orientará acerca de los contenidos que estudiaremos en
la unidad 2.
En esta guía encontrarás distintas actividades para trabajar dichos contenidos.

3 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

 Medicina

Objetivos
Al finalizar el trabajo con esta unidad, serás capaz de:
• Reconocer las características generales del proceso catalítico y las propiedades de los
catalizadores.
• Reconocer las propiedades diferenciales de los catalizadores biológicos, las enzimas,
respecto de los demás catalizadores.
• Definir qué es un cofactor y su participación en los procesos catalíticos. Diferenciar
entre coenzimas y grupos prostéticos.
• Relacionar las vitaminas del complejo B con los cofactores enzimáticos.
• Definir qué es el centro activo de una enzima así como otros sitios que puedan estar
presentes. Relacionar la estructura espacial de la enzima con el reconocimiento de su
sustrato.
• Analizar la temperatura y el pH como factores que modifican la actividad enzimática.
• Definir qué son los parámetros Km y Vmáx. Reconocerlos en los gráficos de Michaelis-
Menten y dobles recíprocos (Linerweaver-Burke).
• Interpretar el concepto de Km y Vmáx a nivel biológico.
• Diferenciar la inhibición reversible de la irreversible.
• Contrastar las características que definen una inhibición reversible competitiva versus
una inhibición reversible no-competitiva.
• Analizar cómo se modifican los parámetros cinéticos de una enzima en presencia de un
inhibidor competitivo o no-competitivo.
• Comparar los mecanismos de regulación de la actividad enzimática: alostérica,
covalente y génica.
• Definir qué es una isoenzima e interpretar su papel a nivel biológico.
• Definir qué es un zimógeno e interpretar su papel a nivel biológico.
• Interpretar el papel de la compartimentación en la regulación de la actividad enzimática.

4 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

 Medicina

1. Aspectos básicos de la catálisis y los cataliza-

dores. Las enzimas como catalizadores biológicos
Los contenidos mínimos que debés estudiar sobre este tema son:
• Propiedades de los catalizadores. Características diferenciales de las enzimas como
catalizadores biológicos.
• Nomenclatura y criterios de clasificación de las enzimas.
• Cofactores enzimáticos.
• Centro activo y otros sitios de unión a moléculas.
• Modelos de interacción enzimas sustrato.

Verificá tu aprendizaje

Actividad 1

Resolvé las siguientes consignas. Tené en cuenta que

el profesor abrirá un espacio de foro destinado a ellas. Esta actividad será retomada
en el espacio sincrónico.

1. Definí los siguientes términos:

a. Catalizador d. Centro activo g. Coenzima j. Apoenzima

b. Enzima e. Sitio alostérico h. Grupo prostético k. Inhibidor
c. Susutrato y f. Cofactor i. Holoenzima
producto

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5 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

 Medicina

2. Respondé: ¿qué propiedades diferentes y distintivas presentan las enzimas como ca-
talizadores biológicos respecto de otro tipo de catalizadores no biológicos? ¿Por qué
estas propiedades permiten adecuar el proceso catalítico de las enzimas en el ámbito
biológico?
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3. Explicá a través de qué mecanismo una enzima cataliza una reacción química.
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4. Mencioná algunos ejemplos de vitaminas, coenzimas y metales que sean importantes

en las reacciones enzimáticas y justificá por qué lo son.
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5. Observá y analizá las siguientes reacciones. En cada una indicá qué clase de enzima la
catalizaría.

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2. Cinética enzimática
Los contenidos mínimos que debés estudiar sobre el tema son:
• Velocidad de reacción. Factores que influyen sobre la velocidad de una reacción: pH,
temperatura, sustrato, enzima, inhibidores. Concepto de pH y temperatura óptimos.
• Cinética de Michaelis-Menten. Conceptos de velocidad máxima (Vmáx), constante de
Michaelis-Menten (Km) y constante catalítica (Kcat). Gráficos. Transformaciones de Li-
neweaver-Burke. Cinética no-micaeliana alostérica.
• Inhibición enzimática. Características diferenciales entre inhibidores irreversibles ver-
sus reversibles. Inhibición competitiva y no-competitiva, modificaciones de los paráme-
tros cinéticos en cada caso.

Verificá tu aprendizaje

Actividad 2

Resolvé las siguientes consignas. Tené en cuenta que

el profesor abrirá un espacio de foro destinado a ellas. Esta actividad será retomada
en el espacio sincrónico.

1. Observá con detenimiento el gráfico.

7 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

 Medicina

De acuerdo con él:

a. Explicá qué información proporciona.
b. ¿Cuáles son los parámetros cinéticos de una enzima con una cinética de Michaelis-
Menten?
c. Señalá Km y Vmáx.
d. ¿Cómo harías para realizar un gráfico de Lineweaver-Burke y dónde ubicarías Km y
Vmáx?

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2. En el siguiente gráfico se muestra la variación en la actividad de una enzima en función

de los cambios de temperatura. Interpretalo y respondé: ¿a qué se debe el comporta-
miento diferente a bajas temperaturas frente a las altas temperaturas?

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3. En el siguiente gráfico se muestran los pH óptimos de tres enzimas. Reflexioná y debatí

sobre la relación entre el pH óptimo de estas enzimas, su localización y los procesos
que catalizan.

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 Medicina

3. Inhibición enzimática
Los contenidos que debés estudiar sobre este tema son los siguientes:
• Inhibición enzimática. Características diferenciales entre inhibidores irreversibles ver-
sus reversibles.
• Inhibición competitiva y no-competitiva, modificaciones de los parámetros cinéticos en
cada caso.

Verificá tu aprendizaje

Actividad 3

Resolvé las siguientes consignas. Tené en cuenta que

el profesor abrirá un espacio de foro destinado a ellas. Esta actividad será retomada
en el espacio sincrónico.

1. Distinguí entre inhibición e inactivación enzimática.

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2. Definí el concepto de inhibición enzimática y explicá en qué se basa cada tipo de inhi-
bición.

a. Irreversible.
b. Reversible: competitiva y no-competitiva.
c. Sustrato suicida.

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10 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

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3. Se determinaron los parámetros cinéticos de una enzima con cinética de Michaelis-

Menten, en ausencia y en presencia de un inhibidor enzimático. Se obtuvo el siguiente
gráfico.

De acuerdo con él:

a. ¿Cómo calcularías los parámetros cinéticos? ¿Qué valor calculás para Km y Vmáx de
cada situación?
b. Indicá cuál recta corresponde a la reacción en ausencia o presencia de dos concen-
traciones diferentes de un inhibidor I (I1, I2). Considerá [I2] > [I1].
c. ¿A qué tipo de inhibición corresponde?
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11 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

 Medicina

4. Se determinaron los parámetros cinéticos de otra enzima michaeliana, en ausencia y

en presencia de un inhibidor enzimático. Se obtuvo el siguiente gráfico.

De acuerdo con él:

a. ¿Cómo calcularías los parámetros cinéticos? ¿Qué valor calculás para Km y Vmáx de
cada situación?
b. Indicá cuál recta corresponde a la reacción en ausencia o presencia de dos concen-
traciones diferentes de un inhibidor I (I1, I2). Considerá [I2] > [I1].
c. ¿A qué tipo de inhibición corresponde?
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12 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

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4. Regulación de la actividad enzimática

Los contenidos que debés estudiar sobre este tema son los siguientes:
• Características principales y mecanismos implicados de los siguientes sistemas de re-
gulación de la actividad enzimática: alosterismo, modificación covalente, génica, zimó-
genos, isoenzimas, compartimentación subcelular.

Verificá tu aprendizaje

Actividad 4

Resolvé las siguientes consignas. Tené en cuenta que

el profesor abrirá un espacio de foro destinado a ellas. Esta actividad será retomada
en el espacio sincrónico.

1. Explicá el fundamento de los siguientes mecanismos de regulación de la actividad

enzimática:

a. Alostérico d. Zimógenos

b. Modificación covalente e. Isoenzimas

c. Génico f. Compartimentación celular

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 Medicina

2. Leé el siguiente párrafo y luego repondé a la pregunta relacionada con él.

“La velocidad del ciclo de Krebs se controla continuamente para cumplir con las nece-
sidades energéticas exactas de la célula. La isocitrato deshidrogenasa, que cataliza la
descarboxilación oxidativa del isocitrato:

Isocitrato + NAD+ alfa-cetoglutarato + CO2 + NADH + H+

(…) es la enzima clave de la vía, siendo estimulada por la presencia de ADP, que aumen-
ta la afinidad de la enzima por el sustrato e inhibida por NADH como consecuencia del
desplazamiento directo de NAD+.”
¿Qué tipos de mecanismos de regulación se definen sobre la isocitrato deshidrogena-
sa? Justificá tu respuesta.

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3. Indicá las afirmaciones correctas y reescribí de manera adecuada aquellas que consi-
deres falsas:
a. Una enzima presenta regulación alostérica cuando distintas sustancias compiten
con el sustrato a nivel del centro activo.
b. Se dice que una enzima se regula covalentemente cuando su actividad es modifica-
da por la unión de ciertos grupos químicos a residuos de aminoácidos.
c. Hablamos de zimógenos cuando una enzima presenta distintas estructuras molecu-
lares que catalizan la misma reacción.
d. La inducción o represión genética permite modificar la actividad de una enzima ha-
ciéndola más o menos activa, respectivamente.
e. Las isoenzimas son enzimas que catalizan distintas reacciones y presentan estruc-
tura molecular idéntica.
f. La presencia de isoenzimas junto con la compartimentación celular es una estrategia
biológica que permite establecer un mecanismo eficiente de regulación enzimática.

14 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

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g. Los mecanismos de regulación por retroalimentación negativa permiten el control de

una vía metabólica por su producto final.
h. Todas las enzimas se regulan a través de mecanismos alostéricos, covalentes y ge-
néticos.

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15 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

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Ideas clave

• Los catalizadores aceleran la velocidad de una reacción porque disminuyen la energía

de activación. Entre otras propiedades, permanecen inalterados al final de la reacción,
pueden ser reutilizados y no modifican la Keq de la reacción.

• Las enzimas son catalizadores orgánicos muy eficaces, específicos y dada su natura-
leza proteica o de ácido ribonucleico, termolábiles.

• Los cofactores, sean coenzimas o grupos prostéticos orgánicos e inorgánicos, desem-

peñan funciones importantes en la catálisis. Algunos cofactores son vitaminas (bioti-
na) o vitaminas activadas (por ejemplo, pirofosfato de tiamina), otros son derivados de
vitaminas del complejo B, o en algunos casos, parte de la estructura de una vitamina
que es utilizada como precursor para la síntesis del cofactor (por ejemplo, riboflavina
para FAD y FMN, niacina para NAD+).

• Cuando los sustratos se unen al sitio o centro activo de una enzima inducen cambios
conformacionales mutuos entre ambos, que facilitan el reconocimiento del sustrato y
del proceso catalítico.

• La temperatura, el pH, la concentración de enzima, la concentración de sustrato y los

inhibidores afectan la actividad de las enzimas.

• Para el modelo de Michaelis-Menten, Km —concentración de sustrato necesaria para

alcanzar la mitad de la Vmáx— y Vmáx —velocidad a la cual los sitios activos de la en-
zimas se encuentra saturados de sustrato— son los parámetros cinéticos que caracte-
rizan a la enzima.

• La Kcat, constante catalítica o número de recambio, es el número de reacciones

enzimáticas que puede catalizar una sola molécula de enzima saturada por unidad de
tiempo; es decir, el número máximo de moléculas de sustrato que se transforma en
producto.

• Las formas lineales de la ecuación de Michaelis-Menten (dobles recíprocos o

Lineweaver-Burke) simplifican la determinación de Km y Vmáx y permiten realizar
análisis comparativos entre enzimas y sustratos.

16 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

 Medicina

Ideas clave

• Los inhibidores pueden actuar de forma irreversible cuando se une a la enzima cova-
lentemente o con muy alta afinidad impidiendo que la enzima catalice la reacción; de
forma reversible sea al sitio activo (competitivos) modificando la Km (aumenta) pero
no la Vmáx; o no competitivos cuando se unen a un sitio diferente al sitio activo dismi-
nuyendo la Vmáx, pero sin afectar Km.

• La homeostasis incluye mantener un ambiente intracelular y dentro de rangos relativa-

mente constantes pese a las fluctuaciones en el ambiente externo. Esto se logra por
medio de cambios apropiados en las velocidades de las reacciones bioquímicas en
respuesta a la necesidad fisiológica.

• El control activo del flujo de metabolitos comprende cambios de la concentración y/o

la actividad catalítica de una enzima que cataliza una reacción limitante comprometida
o enzima clave.

• La unión de metabolitos y segundos mensajeros a sitios distintos del sitio catalítico de

enzimas (efectos alostéricos) desencadena cambios conformacionales que aumentan
o disminuyen su actividad, actuando como moduladores positivos o negativos de la
enzima.

• La fosforilación por proteína quinasas y la desfosforilación subsiguiente por proteína

fosfatasas regula la actividad de muchas enzimas. Las proteína quinasas y fosfatasas
que participan en cascadas de regulación que responden a señales hormonales o de
segundo mensajero, constituyen redes reguladoras que pueden procesar e integrar
información ambiental compleja para producir una respuesta celular apropiada e inte-
gral.

• El control sobre la expresión de una enzima permite aumentar o disminuir la concen-

tración de la enzima según las necesidades celulares.

• La proteólisis selectiva de pro-enzimas inactivas (zimógenos), desde el punto de vista

catalítico, inicia cambios conformacionales que forman el sitio activo. La secreción,
como una pro-enzima inactiva, facilita la movilización rápida de la enzima en respuesta
a la lesión o la necesidad fisiológica y puede proteger al tejido de origen.

17 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

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Ideas clave

• La existencia de isoenzimas -enzimas que catalizan la misma reacción pero que son
genéticamente independientes, es decir estructuralmente distintas- le brinda a cada
enzima propiedades únicas en cuanto a la expresión en tejidos específicos, comparti-
mentos subcelulares, mecanismos de control, pH óptimo, entre otros.

• La compartimentación celular permite que se puedan desarrollar reacciones químicas

de forma controlada dado que, por ejemplo, la presencia de membranas separa meta-
bolitos que pueden interferir entre reacciones o evitar la presencia de metabolitos que
alteren la reacción o que un sustrato que puede derivarse a distintas vías sea selectiva-
mente utilizado para aquella que se compartimentaliza.

18 Bioquímica - Inmunología y Nutrición Normal I Unidad didáctica: 2. Biocatálisis

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