Equipo 6

Jimena Sigala Garcia

Fernando Ortiz Velazquez

Cuestionario

1. El ORF ¿a qué proteína corresponde?

Tirosinasa humana

2. ¿Cuáles son los dominios estructurales que contienen nuestra secuencia problema (ORF)?
PROSITE

DominioEGF-like y dominio EFG_LAM_1 de tipo laminasa.

3. ¿Cuál fue la proteína más parecida y que sirvió de “molde” para el modelado por homología?

5, 6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase

4. ¿Que identidad de secuencia tenían, que PDB ID tenía el molde y a que especie corresponde?

Es el 43.32% de identidad secuencial

ID: 5m8l 1.A
Especie: humana

5. ¿Qué significa los valores de GMQE y de QMEAN4?

QMEAN es una función de puntuación compuesta que puede derivar estimaciones de calidad
absoluta tanto globales (es decir, para toda la estructura) como locales (es decir, por residuo) sobre la
base de un único modelo. QMEAN4 es una combinación lineal de cuatro términos potenciales
estadísticos. Por otra parte, GMQE es la estimación global de calidad del modelo. Indica estabilidad
de la estructura proteica hipotética, por tanto calidad del modelo.
En resumen la GMQE y QMEAN4 miden la calidad del modelo en valores de entre 0 y 1, mientras
más altos lo valores mejor es la calidad.

6. De acuerdo con la proteína que hayas identificado como a la correspondiente al ORF ¿De qué
fuente?

Es codificada por el gen TYR, encontrado en el cromosoma 11 de los seres humanos.

7. Tendría alguna relevancia especial a nivel industrial y/o médico si la sobreexpresaramos y/o
modificaremos mediantes ingeniería de proteínas?

Si, a nivel industrial la sobreexpresión de tirosina aumenta la producción de proteínas y péptidos que
contienen el aminoácido, lo que resulta útil en la producción industrial de proteínas específicas con
aplicaciones terapéuticas, enzimas o productos químicos. Además, su modificación en proteínas
puede influir en las propiedades físicas y químicas de los biomateriales; lo que resultaría relevante
para el desarrollo de materiales con propiedades específicas, como biomateriales para implantes
médicos o productos de ingeniería tisular.

Por otro lado, el ámbito médico si se modifica la tirosina por ejemplo en la terapia génica, puede tener
aplicaciones en el tratamiento de enfermedades genéticas relacionadas con defectos en la síntesis
de proteínas o en la función de neurotransmisores. La sobreexpresión de tirosina también puede
usarse para generar proteínas terapéuticas, como anticuerpos monoclonales o proteínas
recombinantes. Al ser una proteína precursora de neurotransmisores, su modificación podría tener
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Fernando Ortiz Velazquez
implicaciones en la investigación de enfermedades neurológicas y en el desarrollo de nuevas
terapias.

Evidencias

Bibliografía

Camus-Parada, V. A. (2015). Análisis bioinformático comparativo del gen que codifica para el
receptor de lipoproteínas de baja densidad oxidadas LOX1 en rata, ratón y humano.
https://repositorio.uchile.cl/bitstream/handle/2250/187499/Analisis-bioinformatico-comparativo-del-gen
-que-codifica-para-el-receptor-de-lipoproteinas.pdf?sequence=1