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Las enzimas

Prof. Yndra Cordero de Rojas


Las enzimas

Sitio activo
Son moléculas de naturaleza
proteica que catalizan reacciones
químicas, siempre que sean
termodinámicamente posibles
Enzima

Son especificas: una enzima puede catalizar solo un tipo de


reacción.

Son eficientes: una misma enzima puede catalizar miles de


reacciones químicas del mismo tipo, una tras otra.

Su actividad depende de la temperatura y de su acidez: Las


enzimas tienen una temperatura y un pH óptimos que responden a
los valores de estas variables en las que estás biomoléculas
“trabajan” mas rápido.
Las enzimas

Generalidades de enzimas

Potentes catalizadores: aceleran las reacciones hasta 10 20 veces.


Hidrofílicas (la mayoría).
Termolábiles.
Fácilmente desnaturalizables, perdiendo actividad.
Regulables.
Altamente específicas sobre su(s) sustrato(s):
a.- Absoluta b.- Relativa
Algunas se encuentran como PRO-ENZIMA o ZIMÓGENO
(precursor inactivo de la enzima).
Las formas múltiples de una enzima que catalizan la misma reacción
reciben el nombre de ISOENZIMAS.
Las enzimas
Tipos de enzimas

Enzimas simples Enzimas conjugadas

La acción catalítica depende La acción catalítica depende tanto


sólo de la parte proteica de la porción proteica como del
componente no proteico

La parte proteica recibe el


Formadas sólo por proteínas
nombre de apoenzima y es
responsable de la especificidad de
la enzima.
La parte prostética recibe el
nombre de coenzima
Las enzimas

Las enzimas pueden ser

Enzimas metabólicas
Se producen de manera natural en el interior de las células.
Actúan en todas las funciones corporales y vitales.

Enzimas digestivas
Las genera el cuerpo, especialmente el aparato digestivo, y
sirven para que este aproveche al máximo los nutrientes,
debido a que descompone los alimentos.

Enzimas dietéticas
Proceden de los alimentos y su función catalizadora actúa
cuando éstos se consumen crudos, ya que las enzimas suelen
destruirse o perder propiedades con el calor de la cocción
Las enzimas

Diferencias entre catalizadores biológicos y químicos


Las enzimas

Nomenclatura de las enzimas

Hay varias formas mediante las cuales se asigna un nombre a una


enzima:
1.- nombres particulares
2.-nombre sistemático de la comisión enzimática (enzyme
commission) (EC) de la IUBMB (International Union of Biochemistry
and Molecular Biology)

El nombre sistemático de un enzima consta actualmente de 3


partes:
del sustrato
el tipo de reacción realizada
terminación "asa"
Las enzimas

la Unión Internacional de Bioquímica creó, en 1956, su Enzyme Commission o


Comisión Internacional de Enzimas, precursora del vigente Nomenclature
Committee o Comité de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y
Biología Molecular.

1.- código numérico, encabezado por las letras EC (enzyme commission),


2.- seguidas de cuatro números separados por puntos.
El primer número indica a cual de las seis clases pertenece el enzima,
el segundo se refiere a distintas subclases dentro de cada grupo,
el tercero y el cuarto se refieren a los grupos químicos específicos que
intervienen en la reacción.
Las enzimas

glucosa ATP fosfotransferasa (glucoquinasa) EC 2.7.1.2.

2= indica que es una transferasa,


7 = que es una fosfotransferasa,
1 = indica que el aceptor es un grupo OH,
2= indica que es un OH de la D-glucosa el que acepta el grupo fosfato.

glucosa oxidasa es: EC 1.1.3.4


1. Tipo de reacción (oxido reducción)
1. Donador de electrones (OH)
3. Aceptor de electrones (O2)
4. Orden de la enzima dentro de la clasificación Internacional.
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas

Fijar específicamente al sustrato


Transformarlo catalíticamente
Las enzimas

Aminoácidos de fijación:
encargados de la unión débil de
L la enzima al sustrato; se
localizan en el centro activo.
a
s
Aminoácidos catalizadores:
e constan de tres tipos Se unen al sustrato de forma
de aminoácidos covalente, lo que favorece su
n acción catalítica, también se
z encuentran en el sitio activo.
i
m Aminoácidos estructurales:
a Sirven de estructura
s tridimensional, no tienen
función dinámica
Las enzimas

Como ocurre el mecanismo de unión de la enzima y su sustrato


Las enzimas
Las enzimas son moléculas de proteínas que tienen la capacidad de
facilitar y acelerar las reacciones químicas que tienen lugar en los
tejidos vivos, disminuyendo el nivel de la "energía de activación"
propia de la reacción.

se produce una transformación de sustancias iniciales llamadas reactantes


(R) o sustrato (S), en sustancias finales llamadas productos (P)
Las enzimas
Las enzimas

Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia


celular.
Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las
células no podrían existir.
Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y
en el tubo de ensayo.

E + S ESEP  E + P

E E E E
Las enzimas

Hay enzimas que necesitan un componente


no proteico para actuar:

Para actuar frente a su sustrato algunas enzimas requieren un


componente químico adicional que se llama cofactor.

Los cofactores pueden ser inorgánicos (Fe+2, Mn+2, Zn+2, etc.) o


moléculas orgánicas complejas llamadas coenzimas.

Las coenzimas derivan de vitaminas o son la vitamina misma.


Todos los cofactores tienen que ser ingeridos en la dieta por los
mamíferos y los principales síntomas de la falta de vitaminas son
consecuencia del mal funcionamiento de alguna enzima.
Las enzimas

CONSTITUYENTES ENZIMÁTICOS

La parte proteica de la enzima recibe el nombre de APOENZIMA.


El constituyente de naturaleza no proteica se denomina:

COFACTOR

INORGÁNICO ORGÁNICO

IONES METÁLICOS COENZIMAS


(tabla 1) (tabla 2)

Cuando la coenzima se encuentra fuertemente unida a la apoenzima por


enlaces covalentes, se denomina GRUPO PROSTÉTICO.
Las enzimas

Algunos elementos inorgánicos que actúan como cofactores


en las enzimas

Ion Enzima
Las enzimas
Las enzimas

Existen dos modelos que explican la forma de acción enzimática.

El modelo de unión enzima – sustrato de llave – cerradura.

Este modelo de unión enzima – sustrato de llave – cerradura


postula que las estructuras del sitio activo y del sustrato son
complementarias, por lo que este último se une al sitio activo de la enzima
como lo hace una llave de cerradura.
Las enzimas

El modelo de unión enzima – sustrato de ajuste inducido

Este modelo de unión


enzima –sustrato de ajuste
inducido plantea que el sitio
activo de la enzima es más
flexible y plástico,
permitiendo de esta manera
ajustarse a la estructura del
sustrato.
Las enzimas

Tipos de especificidad

• ESPECIFICIDAD ABSOLUTA La enzima actúa sobre un


solo sustrato: Glucoquinasa

• ESPECIFICIDAD RELATIVA La enzima actúa sobre


varios sustrato:
Hexoquinasa

Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo


Las enzimas

Factores que afectan la velocidad de una reacción enzimática

1. Concentración de Enzima
2. Concentración de sustrato
3. pH
4. Temperatura
5. Presencia de Inhibidores
Las enzimas
Efecto del pH en la enzima
Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad
El pH afecta las interacciones iónicas

La intensidad máxima de la actividad de la enzima, ocurre en el pH


óptimo, con rápida disminución de la actividad a cada lado de este valor
de pH. La actividad óptima generalmente se observa entre los valores de
5y9
Las enzimas
Efecto de la temperatura en la enzima
Cada enzima tiene una temperatura óptima

Aumento de la Desnaturación
velocidad por calor

15º 40º 75º


Temperatura

Los limites de actividad para la mayor parte de las enzimas tiene lugar
entre los 10°C y 50°C; la temperatura optima para las enzimas en el
cuerpo se halla alrededor de 37°C.
Las enzimas

CINETICA QUIMICA: Velocidad de una reacción química se puede


medir como:
a) Velocidad de formación de sus productos
b) Velocidad de consumo de sus reactivos
Las enzimas
Cinética Enzimática

 La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de


cada uno de los factores que intervienen en la actividad
enzimática, que se evalúa a través de la velocidad de la
reacción catalizada.

 Las variables más importantes son:

• Concentración de enzima, sustratos y productos


(incluyendo inhibidores y/o activadores)
• Temperatura
• pH Esto ha permitido
Distinguir las enzimas.
Distinguir entre isoenzimas.
Reconocer las diferencias entre las
actividades de un tejido y otro.
Permite conocer la afinidad con los
sustratos.
Las unidades se miden en pH óptimo.
Las enzimas

La Cinética de Michaelis Menten

En 1903 se propuso la idea de que las enzimas cambian con su sustrato


para formar un complejo, esta idea fue desarrollada por Michaelis y
Maunt Menten y se convirtió en la teoría general de las enzimas.
Las reacciones enzimáticas se caracterizan porque aunque se aumente la
concentración de sustrato la velocidad no aumenta linealmente, aparece
un efecto de saturación.
La saturación se debe a que todos los centros activos están ocupados. La
velocidad depende de la cantidad de enzima con sustrato suficiente.
Las enzimas

La velocidad de la reacción va aumentando a medida que


aumente la concentración de sustrato hasta que la enzima se
satura. En ese momento se habrá alcanzado el punto de
saturación de la enzima
Las enzimas

La Cinética de Michaelis Menten

Consideraremos sólo la velocidad inicial de las reacciones para cada


concentración de sustrato cuando se construya una gráfica, evitando el
error introducido por el deterioro del enzima. Como en el primer
momento no hay producto no consideraremos la reacción contraria.

Se rige por la siguiente relación matemática:


V1: velocidad de reacción.
Vmax: velocidad máxima
Km: constante de Michaelis Menten
S:concentración de sustrato.
Las enzimas

Ecuación de Michaelis Menten

Para conocer la velocidad de una determinada reacción enzimática es


necesario conocer cómo varía la concentración del complejo E-S.

a) Los procesos que aumenta la concentración de ES:


K1
E +S E–S

v1 = k1 [E] [S]
b) Los procesos que disminuyen la concentración de ES:
K2 K3
E–S E+S E–S E+P

v2 = k2 [ES] v3 = k3 [ES]
Las enzimas

Ecuación de Michaelis Menten


1ra deducción)
Las enzimas

Ecuación de Michaelis Menten


(2da deducción)
Las enzimas

Ecuación de Michaelis Menten


(3ra deducción)
Las enzimas
Las enzimas

Representación de Lineweaver-Burk

Vmax [S] 1 Km + [S]


Vo = =
Km + [S] Vo Vmax [S]

1 Km [S]
= +
Vo Vmax [S] Vmax [S]

1 Km 1 1
= . +
Vo Vmax [S] Vmax

y = m . x + b

Ecuación de la línea recta. Pendiente


Las enzimas
Las enzimas

Inhibidor:

Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de


interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).

Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la


enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática, de
esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:

I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo

II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la


molécula, causando un cambio conformacional con
repercusión negativa en la actividad enzimática.
Las enzimas

Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:

1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,


con el complejo enzima-substrato o con ambos:

E+I EI

ES + I ESI

2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:

E+I E’
Las enzimas

Inhibición reversible

(a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,


impidiendo la fijación del sustrato: Inhibición Competitiva

(b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo


haga o no el sustrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación
del sustrato a la enzima, pero sí impide la acción catalítica:
Inhibición No Competitiva

(c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-sustrato una


vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se conoce
como Inhibición Anticompetitiva o Acompetitiva
Las enzimas

Ejemplos de algunos medicamentos y su mecanismo de acción

Medicamento Enzima inhibida Enfermedad tratada


Amburicin® Topoisomerasa 2 Cáncer (quimioterapia)
Antabuse® Aldehído deshidrogenasa Alcoholismo
Captopril® Enzima de la síntesis de Hipertensión
angiotensina
Celebrex® Ciclo-oxigenasa 2 Artritis
Digoxin® ATPasa de la bomba K+ Na+ Problemas cardíacos
Hycamtin® Topoisomerasa 1 Cáncer (quimioterapia)
Lipitor® 3-hidroxi-3-metil-glutaril CoA Exceso de colesterol
Viagra® Fosfodiesterasa 5 Disfunción eréctil y la
hipertensión pulmonar
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas
Las enzimas

Una enzima alostérica

es una enzima cuya actividad está regulada mediante un centro


alostérico, que es un sitio, distinto del centro activo de la enzima, al
que se une un regulador (llamado regulador alostérico) de manera
reversible y no covalente. La unión de este regulador modifica la
estructura tridimensional de la enzima y llega a afectar la
configuración del sitio activo, por lo que aumenta o disminuye su
actividad, según el caso.
Las enzimas

Usos de los inhibidores

Debido a que los inhibidores modulan la función de las enzimas, suelen ser
utilizados como fármacos.
Un típico ejemplo de un inhibidor que es utilizado como fármaco es:
la aspirina, la cual inhibe las enzimas COX-1 y COX-2 implicadas en la
síntesis de un intermediario inflamatorio, las prostaglandinas, con lo que
suprime así los efectos derivados, el dolor y la inflamación.

Sin embargo, otros inhibidores enzimáticos actúan como venenos. Por


ejemplo, el cianuro es un inhibidor irreversible que se une a los átomos de
hierro y cobre en el sitio activo de la citocromo c oxidasa de células
animales (las plantas son resistentes al cianuro), bloqueando así la
respiración celular.
Las enzimas

Inhibición mixta

El inhibidor se puede unir a la enzima al mismo tiempo que el sustrato.


Sin embargo, la unión del inhibidor afecta la unión del sustrato, y
viceversa.
Este tipo de inhibición se puede reducir, pero no superar al aumentar las
concentraciones del sustrato.
Aunque es posible que los inhibidores de tipo mixto se unan en el sitio
activo, este tipo de inhibición resulta generalmente de un efecto
alostérico donde el inhibidor se une a otro sitio que no es el sitio activo de
la enzima.
La unión del inhibidor con el sitio alostérico cambia la conformación (es
decir, la estructura terciaria) de la enzima de modo que la afinidad del
sustrato por el sitio activo se reduce.
Las enzimas

Inhibición

SUSTRATO CONCENTRACIÓN DEL PRODUCTO


(mM) (g/h)
Sin Inhibidor Con Inhibidor
1/[S] 1/Vo 1/Vo
1.0 1.0 12.5 0.08 6.2 0.161
2.0 0.5 21.2 0.047 10.5 0.095
4.0 0.25 32.2 0.031 16.1 0.062
10.0 0.1 47.4 0.021 23.8 0.042
14.4 0.069 52.5 0.019 26.3 0.038
22.2 0.045 58.5 0.017 28.5 0.035
33.0 0.030 62.5 0.016 30.0 0.033

Nota: trabaje el 1/[S] con 2 decimales y el 1/V con 3 decimales


Las enzimas

Inhibición no competitiva
No cambia KM
Disminuye Vmax
0,18

0,16

0,14

0,12

0,10
1/V sin I

0,08 1/V con I

0,06

0,04

0,02

0,00
-0,3 -0,2 -0,1 0,0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1,0 1,1
Las enzimas

Inhibición

SUSTRATO CONCENTRACIÓN DEL PRODUCTO


(mM) (g/h)
Sin Inhibidor Con Inhibidor
1/[S] 1/Vo 1/Vo
1.0 2.50 1.17
2.0 4.00 2.10
5.0 6.30 4.00
10.0 7.98 5.88
20 9.00 7.40

Nota: trabaje el 1/[S] con 2 decimales y el 1/V con 3 decimales


Las enzimas

Inhibición

SUSTRATO CONCENTRACIÓN DEL PRODUCTO


(mM) (g/h)
Sin Inhibidor Con Inhibidor
1/[S] 1/Vo 1/Vo
2.0 0.50 0.137 0.088
3.0 0.33 0.179 0.121
4.0 0.25 0.213 0.149
10.0 0.10 0.322 0.257
15.0 0.06 0.370 0.330

Nota: trabaje el 1/[S] con 2 decimales y el 1/V con 3 decimales

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