Estructura y expresión

de genes eucariotas
 Alberts MBOC5 2008

Table 6-1 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)

 LOS GENES NO SÓLO CODIFICAN PROTEÍNAS

GENES

RNA
RNAs micro RNAs
RNAs RNAs DE RIBOZIMAS
siRNAs RNAs
TRANSFERENCIA NUCLEARES
RIBOSOMALES PEQUEÑOS MENSAJEROS
sncRNA

PROTEÍNA
PROTEÍNA
 Cromosoma de 1,5 x 108 pares de bases, conteniendo aproximadamente 3000 genes

0,5% del cromosoma, conteniendo 15 genes

Un gen de 105 pares de bases de longitud

Promotor y regions regulatorias intrón exón

TRANSCRIPCIÓN

Transcripto primario o pre-mRNA

intrón

exón
mRNA
 GEN (ADN)
PROMOTOR
EXÓN EXÓN EXÓN
"enhancer" INTRÓN INTRÓN

pol II

TRANSCRIPCIÓN
factores de
SPLICEOSOMA
transcripción

Precursor del ARN mensajero

SPLICING
CAPPING CORTE Y
POLIADENILACIÓN

CAP AAAAAAA

ARN mensajero maduro

núcleo

citoplasma
traducción en los ribosomas
 Capping
(agregado de Cap,
caperuza o capuchón)
Figure 6-22b Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Corte y poliadenilación
 señal de
poliadenilación
pre-mRNA UAG AAUAAA Pol II

AG
último intrón
último exón

sitio de corte y
poliadenilación

señal --------15 a 17 nt---------sitio

Splicing = corte y empalme = ayuste
 GEN (ADN)
PROMOTOR
EXÓN EXÓN EXÓN
"enhancer" INTRÓN INTRÓN

pol II

TRANSCRIPCIÓN
factores de
SPLICEOSOMA
transcripción

Precursor del ARN mensajero CAP

SPLICING

CAP AAAAAAA

ARN mensajero maduro

núcleo

citoplasma
traducción en los ribosomas
 exón intrón exón

5'...AGGU A AGU.........//.....C X C U A AC ..... C XAGG...3'

G U U G U U
12-17
consenso "dador" o consenso de
sitio 5' de splicing ramificación consenso "aceptor
" o sitio 3' de
splicing

30-50 nucleótidos
pre-mRNA
consenso de
"dador" "aceptor"
ramificación

PASO 1

pre-mRNA

PASO 2 intrón en forma

de lazo
covalente
("lariat")

mRNA maduro desramificación

(procesado, "spliceado")

degradación
Figure 6-26a Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Spliceosoma = empalmosoma
Spliceosoma
tri-snurp
El splicing ocurre co-transcripcionalmente

Beyer and Osheim, Genes Dev. 1988

 Post-transcriptional Co-transcriptional
pre-mRNA processing pre-mRNA processing

Pol II Pol II
Transcription
Transcription Capping
Splicing
Primary transcript Polyadenylation

Capping CAP
Splicing
Polyadenylation

CAP An CAP An
Terminación de la
transcripción en
eucariotas
 Torpedo model

Poly(A) Poly(A)
signal site Pol II
DNA
Termination
Pol II Pol II Pol II Pol II Pol II
Capping
Xrn2
Splicing

‘Torpedo’
p
Ca 5’®3’ degradation
Cleavage Xrn2
p
Ca +
polyadenylation

RNA P
5’
Cap (A)n OH 3’ Xrn2
Mature mRNA

Proudfoot, Buratowski, Manley

 Regiones 5' y 3' UTR
5' and 3' untranslated regions = 5' y 3' no traducidas = 5' y 3' no codificantes
Gen

+1

AUG UAA
mRNA
maduro
 240 pb (3' UTR)
70 pb (5' UTR)

pA

1098 pb 2300 pb 1640 pb 1545 pb

250 pb 150 pb 270 pb 180 pb 300 pb

+1

5'UTR: región 5' no traducida o 5' no codificante (5' untranslated region). Del +1 al ATG
3'UTR: región 3' no traducida o 3' no codificante (3' untranslate region). Del codón stop de la traducción al sitio
de corte poliadenilación (pA).

Longitud del gen (desde el +1 hasta el pA): E1+I1+E2+I2+E3+I3+E4+I4+E5

o sea
250 pb + 1098 pb + 150 pb + 2300 pb + 270 pb + 1640 pb + 180 pb + 1545 pb + 300 pb = 7733 pb

Longitud del mRNA: E1+E2+E3+E4+E5 [medido en nucleótidos (nt) porque es simple cadena]
o sea
250 nt + 150 nt + 270 nt + 180 nt + 300 nt = 1150 nt
 240 pb (3' UTR)
70 pb (5' UTR)

pA

1098 pb 2300 pb 1640 pb 1545 pb

250 pb 150 pb 270 pb 180 pb 300 pb

+1

5'UTR: región 5' no traducida o 5' no codificante (5' untranslated region). Del +1 al ATG
3'UTR: región 3' no traducida o 3' no codificante (3' untranslate region). Del codón stop de la traducción al sitio
de corte poliadenilación (pA).

Longitud del gen (desde el +1 hasta el pA): E1+I1+E2+I2+E3+I3+E4+I4+E5

o sea
250 pb + 1098 pb + 150 pb + 2300 pb + 270 pb + 1640 pb + 180 pb + 1545 pb + 300 pb = 7733 pb

Longitud del mRNA: E1+E2+E3+E4+E5 [medido en nucleótidos (nt) porque es simple cadena]
o sea
250 nt + 150 nt + 270 nt + 180 nt + 300 nt = 1150 nt

Nº de aminoácidos (aa) de la proteína codificada: (longitud del mRNA - 5'UTR – 3'UTR) / 3

o sea
(1150 nt – 70 nt – 240 nt) / 3 nt/aa = 840 nt / 3 nt/aa = 280 aa

PM relativo de la proteína codificada: Nº de aminoácidos x PM promedio ponderado de un aa

o sea
280 aa x 110 Da/aa = 30.800 Da = 30,8 kDa