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GENOMAS MODELO

• Dado el avance en el proyecto del genoma humano


se logró secuenciar diversos organismos que
actualmente se usan como modelos.
• C. elegans
• Drosophila melanogaster
• Arabidopsis thaliana
• Plasmodium faciparum
• E. Coli
• Los organismos los podemos dividir
• Eucariontes→ Endomembranas, mitocondrias y
cloroplastos. Se incluyen animales, plantas, hongos y
protozoarios.
• Procariontes→ no presentan compartimentos internos.
• Bacterias- Gram (+/-), cianobacterias
• Arqueas- Condiciones extremas. Hipoxia, Temperaturas
altas, etc.
GENOMAS EUCARIONTES
Organización genómica eucarionte
• El tamaño del genoma varía del organismo
• Pequeño- > Mb
• Mayor <100,000 Mb

• Se espera que el tamaño del genoma este asociado al nivel


de complejidad del organismo. Sin embargo, no se
encuentra una asociación directa.
• La paradoja del valor C( C-value paradox)- No existe
correlación entre el tamaño del genoma y el número de
genes entre eucariontes
Comparación del
genoma eucarionte
• Segmento de 50 kb del
segmento que codifica para el
receptor de células T-B.
• Si comparamos a la levadura.
• *El genoma de la levadura
muestra más genes que el
humano
• * Pocas regiones
Comparación del
genoma eucarionte
• *El genoma de la levadura
muestra más genes que el
humano
• El cromosoma III codifica para
RNAt y proteínas
• * Pocas regiones discontinuas
• El genoma de la levadura solo
presenta 239 intrones
• El humano presenta 300,000
• *Se presentan pocas regiones de
repetidos
• LTR- Ty2
• El total del repetidos del genoma
es 3.4%
• Humano 44%
C-Value Paradox
No existe un incremento del
tamaño del genoma con respecto a
la complejidad del organismo.
GENOMAS
PROCARIONTES
• EL genoma procarionte carece en su
mayoría de espacios entre los genes
• -thrA,thrB,thrC
• Operon – Serie de genes adyacentes
en el genoma bacteriano que son
transcritos al mismo tiempo bajo el
mismo promotor y regulación
• No hay presencia de intrones – Todo
el genoma bacteriano es continuo.
• No existe un semejante a las
estructuras de repetidos en tándem
como en los eucariontes.
• * Posen secuencia de Inserción (IS1)
• Son regiones transposables que
permiten la inserción o transferencia
de genoma entre organismos.
Secuencias de Inserción (IS1)
• Son regiones o elementos transposables en la bacteria
• Esta región codifica genes para transposasas que permiten la movilización e
inserción
• Tamaño 768 bp hasta 5 kb
• La primera se encuentro en el operan galactosa de E.Coli
Genoma procarionte
• DNA circular
• Presenta 1 solo cromosoma
• DNA extracromosomico
• Lineal e independiente
• Circular

• El genoma de Borrelia burgdorferi B31 es un


cromosoma lineal de 9112 kb→ 853 genes
• + 17/18 genes lineares y circulares que agregan
430 gees
GENOMA EUCARIONTE
Empaquetamiento de
ADN
• Cada especie tiene su propio
numero de cromosomas
• Los genes se encuentran
segmentados
• Se encuentra Ploidismo
• Haploide (1n)
• Diploide (2n)
• Poliproide (>3n)
Empaquetamiento de
ADN
• Cada especie tiene su propio
numero de cromosomas
• Los genes se encuentran
segmentados
• Se encuentra Ploidismo
• Haploide (1n)
• Diploide (2n)
• Poliproide (>3n)

• Humano presenta células


somáticas 2n= 46 cromosomas
• Se encuentran diversa
disposición de los centrómeros
• Telocentric
• Acrocentric
• Metacentric

• Telomero: Region final del


corosomoma
• Histonas

• DNA da 1.6 vueltas al complejo (~147 pb)


• Formación de Nucleosoma

• Región entre dos nucleosomas “espaciador” (~200) Región no protegida por las histonas

• Histona H1 estabiliza el complejo


Cromosomas
Tinción
Giemsa
Clasificación por
dominios

• La identificación de
secuencias de
aminoácidos permite
identificar regiones
conservadas entre
proteínas, intuyendo la
funcionalidad de la
misma.
Grb7 SH2 domain structure and interactions with a cyclic
10.1186/1472-6807-7-58 peptide inhibitor of cancer cell migration and proliferation
Comparación del catalogo genético entre
diversos organismos

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