Merlo Ortega Aimee Aketzalli. Práctica " Aislamiento y electroforesis de DNA plasmídico".
Ramírez García Ruth Marbella Sección 2
INTRODUCCIÓN La electroforesis es una técnica que se utiliza de forma generalizada en la que, fundamentalmente, se aplica corriente eléctrica a moléculas biológicas, ya RESULTADOS sean ADN, proteínas o ARN y se separan en función de si son más grandes o pequeñas. Por lo que debemos saber que los plásmidos son pequeños fragmentos de ADN que se pueden unir a los elementos apropiados, circularizar, y luego introducirse en bacterias, donde pueden ser propagados unto con el cromosoma bacteriano. Estos pequeños círculos que contienen el ADN clonado son llamados plásmidos. Cada célula bacteriana suele producir muchas copias de un plásmido, a diferencia de Imagen 1. Gel con muestras su propio cromosoma del cual hace una DISCUSIÓN copia única. El hecho de que los Como podemos observar en la figura 1, plásmidos son más pequeños y en mayor tenemos un gel en el que se colocaron 8 número que el cromosoma del huésped muestras, teóricamente sabemos que hace que sea más fácil aislarlos en forma las isoformas observadas corren de pura. OBJETIVO diferente manera en el gel, • Realizar un aislamiento de DNA dependiendo del tamaño de la plasmídico bacteriano molécula. • Obtener el DNA del plásmido El circular relajado queda al inicio, no puc18, mediante el método de avanza mucho; el lineal queda en MINI-PREP medio y el enrollado avanza más. • Realizar una electroforesis en gel Gracias a esto y a la forma que tienen, de agarosa del plásmido podemos identificarlos en la figura 1. obtenido y discutir sobre las En la muestra 2 podemos apreciar el formas moleculares obtenidas. circular relajado al inicio, en medio el lineal y al final el superenrollado; al igual que en la muestra 4 y 7. Sin embargo, en la muestra 8 solo se logra apreciar 1 isoforma que es la lineal. La estructura relajada, viaja de una manera más lenta debido a que Merlo Ortega Aimee Aketzalli. Práctica " Aislamiento y electroforesis de DNA plasmídico". Ramírez García Ruth Marbella Sección 2 corresponde a un DNA que quedó muy que su recorrido sea más lento que el dañado, y se fragmenta. anterior mencionado y por último la La estructura lineal se debe a que una estructura relajada corresponde a que hebra se rompió, provocando que su el DNA se quedó muy dañado y se corrimiento sea menor que el enrollado, fragmenta ocasionando que su pero mayor que el relajado. recorrido sea más lento que las otras dos Por último, el superenrollado viaja de estructuras. una manera más rápida, ya que su CONCLUSIÓN estructura se mantuvo intacta. ✓ Es posible aislar DNA plasmídico y La utilización de bromuro de etidio es ponerlo de manifiesto con fundamental para poder colorear y bromuro de etidio y luz UV en una observar el recorrido de DNA a través del placa de agarosa con azul de soporte de agarosa, se pone de bromofenol, mediante el empleo manifiesto con luz UV. Se trata de un de la electroforesis. compuesto intercalante, es decir, que ✓ El DNA plasmídico, de acuerdo tiene afinidad para unirse al DNA, pues con sus diferentes se introduce entre sus bases apiladas. conformaciones puede correr a Esto se debe a su geometría plana y su diferentes velocidades en un gel estructura aromática, que interacciona durante la electroforesis. favorablemente con el interior hidrófobo ✓ Se puede observar la calidad de de la doble hélice. En menor medida, aislamiento de DNA, debido a la interacciona también con DNA mono observación de las zonas catenario. Su utilidad deriva así mismo recorrido, este dependerá de la de su fluorescencia, exaltada al estructura de este, que puede se encontrarse en un entorno hidrófobo, es super enrollada, lineal y relajada. decir, al estar unido al DNA. Se excita ✓ Finalmente, del plásmido con luz ultravioleta de onda corta, a obtenido, la Isoforma que se ciertos nm y emite su fluorescencia obtuvo en mayor proporción Tue como luz visible, de color rosado DNA lineal, por lo que se concluye anaranjado. En la electroforesis, se utiliza que el aislamiento fue de buena para teñir el DNA, para revelar su calidad. posición en el gel. El recorrido de DNA BIBLIOGRAFÍA puede ser de diferentes maneras, esto o Lehninger, A. Bioquímica, 2ª ed. dependerá de la calidad con que se Omega, Barcelona, 1978 realizó el procedimiento de aislamiento o Bioquímica 3ª Ed. (2002) C. de DNA plasmídico. La estructura Mathews, K. van Holde, K. Ahern. superenrollada viaja más rápido a través Pearson Educación S. del soporte de agarosa ya que se o Principios de Bioquímica 3ª/4ª mantiene intacta su estructura. La edición. (2000/2005) David L. estructura lineal de DNA se debe a que Nelson y M. M. Cox. Editorial una hebra del DNA se rompió haciendo Omega Merlo Ortega Aimee Aketzalli. Práctica " Aislamiento y electroforesis de DNA plasmídico". Ramírez García Ruth Marbella Sección 2 o Laguna José; "BIOQUÍMICA"; Editorial FOURNIER S.A México D.F Pág. 315-320 o Ingeniería Genética; consultado 07/06/2023https://www.agro.uba .arigori.pdf Sambrook J, Russell DW (2001) "Clonaje Molecular": Manual de laboratorio, edición. Cold Spring Harbor Laboratory Precc