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¿Mencione
ventajas y desventajas de cada una? ¿Utilidad?
Ventajas Desventajas
Este método es fácil de utilizar. Limitación en el tamaño de moléculas
de ADN a separar.
El gel tiene la capacidad de recuperar la Es de bajo rendimiento (no procesa los
muestra de ADN. dato rápidamente).
Ventajas Desventajas
Es de alto rendimiento (rapidez en los Se necesita de alguien profesional para
resultados). ser utilizado ese método.
Obtención de información detallada. Es más costoso que otros métodos.
3.En la práctica anterior, usted extrajo ADN a partir de una muestra biológica (sangre,
células o tejido). Consulte cual es el tamaño del ADN, y compare su peso frente al marcador
molecular. ¿Qué puede concluir? ¿Esperaría más de una banda en el caso del material
extraído? Explique su respuesta.
Teniendo en cuenta que 1 kilobase es igual a 1000 pares de bases y que una molécula
de ADN consta de 3000 kilobases (kb), el tamaño total de nuestro ADN sería 3’000.000 de
pares de bases (pb)
El marcador de peso que se utilizó en el laboratorio es el GeneRuler 100 pb.
Podemos concluir que la diferencia de tamaños en muy evidente, el ADN es mucho
más “grande” o extenso que el marcador de peso.
No se esperaría más de una banda en el caso del ADN, ya que las moléculas de ADN
al será más grandes no pasarían más allá de la primera banda.
En el caso de que se hallen más bandas en la molécula podríamos concluir que no es
una molécula de ADN pura, es decir, que esta se encuentra fragmentada. Esto se puede dar
por fallas en la extracción de la muestra y no es lo más apropiado para la electroforesis.
Si se tomara la muestra del segundo lavado de la sílica gel, tendríamos un ADN con
probabilidades de que esté menos contaminado que el anterior por ende esté se podría
apreciar en el gel de agarosa ubicado más arriba que el de la muestra 1, podría presentar
también un barrido en el gel queriendo decir que es un ADN fragmentado.
Si se tomara la muestra del tercer lavado, se esperaría que el ADN en esta estuviera
más puro; ya que los contaminantes quedaron en las muestras anteriores, puesto que entre
más lavados se haga a la muestra el ADN que se obtendría estaría más puro e ideal, por lo
cual en el análisis de electroforesis este se podría observar en la parte superior del gel lo que
quiere decir que este es ADN íntegro y no presenta fragmentaciones.
Para que la práctica sea efectiva y con las expectativas deseadas se debe tener en
cuenta algunos factores que influyen en esto:
5.En esta práctica se usó como Buffer electroforético TAE 5X solución madre y TAE
0.5X como Buffer de trabajo, realice los cálculos respectivos si se quisiera trabajar a partir de
una solución madre TAE 10X y la respectiva dilución para una solución de trabajo TAE 1X.
100ML 10X
X 1X
100 ML∗1 X
x= = 10 ML – En 10ML hay 1X.
10 X
1 ML∗10 X
x= = 0,1 ML – En 1ML hay 0,1X.
100 ML
Por tanto, en una dilución de 100ML hay una concentración de 10X, donde por
ML encontramos 0,1X; por lo cual una concentración de 1X está presente en 10
ML
6.Explique qué beneficios trae usar Buffer, Tris acetato y EDTA (TAE), Tris-borato
(TBE), o Tris-fosfato (TPE) como buffers electroforéticos y cuáles son las diferencias en
utilidad de estos Buffers.
El buffer de carga es un amortiguador que tiene como fin brindar peso, densidad y
color a la muestra, lo que facilita su depósito en el pocillo y evita su salida del gel; permite,
además, monitorear el corrimiento de la muestra en el gel.
El buffer de carga de ácidos nucleicos se compone de Tris; el cual mantiene el pH en
el gel, azul de bromo fenol; se utiliza como un marcador ya que su color es una ayuda visual
durante la carga de muestra en los pocillos, azul de xileno; se compone de color y carga, se
utiliza para comprobar el progreso de la electroforesis, permite detener la electroforesis con la
confianza de que las moléculas grandes de DNA no se hayan salido del gel y glicerol; este
aporta densidad y facilita la aplicación a los pocillos a la muestra.
8.Dibuje un gel con su respectivo marcador de peso molecular, luego de que hiciera la
digestión de una muestra con la enzima EcoRI. El amplificado digerido tenía una longitud de
738 pares de base, con punto de corte en la posición 100 y 200.
10. Cuál es la secuencia de reconocimiento de la enzima EcoRI. ¿Corta una sola de las
cadenas? ¿Cuál es el enlace que digiere? ¿Qué tipo de reacción química efectúa? ¿Qué
diferencia hay entre endonucleasa y exonucleasa?
La enzima Ecori corta las dos cadenas de ADN, pero 5’ siempre queda con una
Guanina.
El enlace que digiere se realiza por medio del ADN ligasa la cual se encarga de
unir por enlaces covalentes.
Las endonucleasas son comúnmente conocidas como enzimas de restricción. Estas
producen fragmentos de ADN a la hora del “rompimiento” o “corte” el cual se lleva a
cabo por una reacción química de hidrólisis entre dos enlaces fosfodiéster.
12. A cuál grupo químico pertenece la Agarosa y cuál es el enlace que permite
su polimerización.
Otra diferencia importante es que los geles de agarosa se encuentran planos sobre la
mesa con un recorrido horizontal, mientras que los geles de poliacrilamida se colocan sobre
la mesa con un recorrido vertical.
Los ácidos nucleicos (ADN y ARN) solo tienen carga negativa por su esqueleto de
fosfatos, de esta manera, estos de desplazarán hacia el polo positivo (ánodo).
En cambio, las proteínas pueden tener carga positiva o negativa, lo cual no permite
una buena realización de la electroforesis. Por esta razón, previamente a ser sometidas a la
electroforesis, las proteínas deben ser tratadas con detergentes que les brinden una carga
negativa. De esta manera las proteínas se homogenizarán y se desplazarán al polo positivo
(ánodo) y se dividirán por tamaño.
17. ¿Cuáles son los sistemas de marcaje utilizados para la detección del analito en el
Westernblot?
Estos tres son métodos de transferencia o también llamada blotting, los cuales nos
permiten identificar la presencia de una banda específica en un gel de electroforesis, sea de
una proteína o de ácidos nucleicos.
Pero cada uno de estos métodos es utilizado dependiendo de lo que se vaya a
examinar: ácidos nucleicos o proteínas.
20. ¿Si deseara detectar una molécula específica de ADN después de un corrido
electroforético como lo haría? Menciones los pasos que realizaría, el tipo de marcaje y la
interpretación del resultado.
https://www.textoscientificos.com/quimica/cromatografia/capa-fina.
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https://conogasi.org/articulos/metodo-gel-de-electroforesis-agarosa/
https://www.e-allscience.com/blogs/articulos/introduccion-a-western-blot
https://www.uco.es/dptos/bioquimica-biol-mol/pdfs/17%20ELECTROFORESIS%20ACS
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https://www.aefa.es/wp-content/uploads/2014/04/Electroforesis-capilar.pdf
https://es.khanacademy.org/science/ap-biology/gene-expression-and-regulation/biotechnology/a/gel-
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https://www.redalyc.org/pdf/651/65114270008.pdf
https://www.researchgate.net/figure/Figura-6-Tecnica-PCR-RFLP-Polimorfismo-de-
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https://diferenciario.com/endonucleasa-y-exonucleasa/
https://es.khanacademy.org/science/biology/biotech-dna-technology/dna-cloning-tutorial/a/
restriction-enzymes-dna-ligase#:~:text=Cuando%20EcoRI%20reconoce%20y
%20corta,de%20ADN%20de%20cadena%20sencilla%3A&text=De%20esta
%20manera%20se%20produce,cada%20extremo%20del%20ADN%20cortado.