PROFESOR: Dr.

CARLOS ENRIQUE ESCÁRCEGA GONZÁLEZ

FCQ, UANL INGENIERÍA QUÍMICA

 INTRODUCTION

Differences in microbial metabolism can be attributed partly

to genetic differences and/or to differences in their
responses to changes in their environment. Even the same
species may produce different products when grown under
different nutritional and environmental conditions.

Example: The Crabtree effect.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 INTRODUCTION

CATABOLISM is the intracellular process of degrading a

compound into smaller and simpler products (e.g., glucose
to CO2 and H2O).

ANABOLISM is involved in the synthesis of more complex

compounds (e.g., glucose to glycogen) and requires energy.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 INTRODUCTION

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

The energy for living cells is obtained from the catabolism of

carbon compounds, mainly carbohydrates. They are
synthesized from CO2 and H2O in the presence of light by
PHOTOSYNTHESIS. The sun is the ultimate energy source for
the life processes on earth.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

Energy in biological systems is primarily stored and

transferred via adenosine triphosphate (ATP), which
contains high-energy phosphate bonds.

Also GTP, UTP and CTP store and transfer high-energy

phosphate bonds.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 REACCIONES IMPLICADAS EN EL
METABOLISMO

OXIDO REDUCCIÓN (REDOX)

Oxidación.
• Pérdida de electrones en una molécula.
• Pérdida de átomos de H o ganancia de átomos de O.
• Disminuye la energía potencial de la molécula.

Reducción.
• Ganancia de electrones en una molécula.
• Ganancia de átomos de H.
• Aumenta la energía potencial de la molécula.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
REACCIONES IMPLICADAS EN EL
METABOLISMO

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 REACCIONES IMPLICADAS EN EL
METABOLISMO

MOLECULAS TRANSPORTADORAS DE ELECTRONES DURANTE

LAS REACCIONES REDOX:

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

Hydrogen atoms released in biological oxidation–reduction

reactions are carried by nicotinamide adenine dinucleotide
(NAD+) and nicotinamide adenine dinucleotide phosphate
(NADP+). NADH has two major functions in biological
systems:

Reducing power:

ATP formation in respiratory metabolism: The electrons (or

H atoms) carried by NADH are transferred to oxygen
(respiratory chain) to produce up to three ATP molecules.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

ATP can be formed from the

reducing power in NADH in the
absence of oxygen if an
alternative electron acceptor is
available (e.g., NO3).

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 BIOENERGETICS

El FADH2 también
transporta electrons
para producir ATP en la
cadena respiratoria.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 GLUCOSE METABOLISM

RESPIRATION may be aerobic or anaerobic, depending on

the final electron acceptor.

If oxygen is used as final electron acceptor, the respiration is

called AEROBIC RESPIRATION.

When other electron acceptors, such as NO3, SO4 , Fe+3,

Cu+2, and S, are used, the respiration is termed ANAEROBIC
RESPIRATION.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 GLUCOSE METABOLISM

El metabolismo de la glucosa se pude dividir en 4 procesos:

GLUCÓLISIS (se realizan en el citosol). La realizan células procariotas y

eucariotas

FORMACIÓN DE ACETIL-COA (se realiza en la matriz mitocondrial)

CICLO DE KREBS (se realiza en la matriz mitoncondrial)

CADENA RESPIRATORIA O CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES

(en este proceso se lleva a cabo la FOSFORILACIÓN OXIDATIVA en la
cual se produce el ATP (se realiza en la membrana interna
mitocondrial).

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 GLUCOSE METABOLISM

GLYCOLYSIS takes place in cytoplasm, whereas the site for the

Krebs cycle is the matrix of mitochondria in eucaryotes. In
procaryotes, these reactions are associated with membrane-
bound enzymes.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
GLUCOSE METABOLISM

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 GLUCOSE METABOLISM

Under anaerobic conditions, pyruvate may be converted to

lactic acid, ethanol, or other products, such as acetone,
butanol, and acetic acid.

Anaerobic conversion of glucose to the aforementioned

compounds used to be known as FERMENTATION.

Under aerobic conditions, pyruvate is converted to CO2 and

NADH through the TCA CYCLE (tricarboxylic acid cycle).

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 GLUCOSE METABOLISM

FORMACIÓN DE ACETIL-COA
(Descarboxilación oxidativa del piruvato)

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 GLUCOSE METABOLISM

CICLO DE KREBS O CICLO DEL ÁCIDO CÍTRICO

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
CICLO DE KREBS O DEL ÁCIDO CÍCLICO

“DISEÑO DE BIOPROCESOS, 1° PARTE: FUNDAMENTOS DE BIOPROCESOS.

M EN C. PROCESOS SUSTENTABLES"
 KREBS CYCLE

The major roles of the TCA cycle are:

(1) To provide electrons (NADH) for the electron transport

chain and biosynthesis
(2) To supply C skeletons for amino acid synthesis
(3) To generate energy.

The overall reactions is:

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 RESPIRATION
ELECTRON TRANSPORT CHAIN

The process of forming

ATP from the electron
transport chain is
known as OXIDATIVE
PHOSPHORYLATION.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 RESPIRATION
ELECTRON TRANSPORT CHAIN

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
METABOLISMO DE LA GLUCOSA

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
GLUCOSE METABOLISM

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
METABOLISMO DE LA GLUCOSA

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 FERMENTATION

The generation of energy without the electron

transport chain is called FERMENTATION
(anaerobic).

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 FERMENTATION

Other partially oxidized by-

products are acetone, butanol
fermentation, propionic acid,
acetic acid (for vinegar), 2,3-
butanediol, isopropanol, and
glycerol.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
FERMENTATION
 FERMENTATION

No one organism makes all the products.

Thus, it is important to screen a wide variety of organisms to select

one that will maximize the yield of a desired product, while
minimizing the formation of other by-products.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 FIJACIÓN DE NITRÓGENO

Mcroorganisms like Azotobacter, Azotomonas, Azotococcus, and

Biejerinckia fix atmospheric nitrogen to form ammonia.

These microorganisms provide ammonium for plants.

Rhizobium and Azospirillum are widely used for agricultural

purposes and are bioprocess products.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
FIJACIÓN DE NITRÓGENO

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 METABOLISM OF HYDROCARBONS

Pseudomonas, Mycobacteria, certain yeasts and molds can

metabolize hydrocarbons.

Hydrocarbon molecules are converted to an alcohol by

incorporation of oxygen, then oxidized to aldehyde and finally to an
organic acid which is further converted to acetyl-CoA, which is
metabolized by the TCA cycle.

Anaerobic metabolism of hydrocarbons is more difficult. Few

microorganisms cleave the C-C bonds and saturate with hydrogen to
yield methane.
“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO
INGENIERIA QUÍMICA"
 METABOLISMO ANAÉROBICO

The same pathways can be used; the primary difference is the use
of an alternative electron acceptor such as NO3- and N2O- to
produce N2 (denitrification).

Many advanced biological waste-treatment systems are operated to

promote denitrification.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
 AUTOTROPHIC METABOLISM

Autotrophs (either photoautotrophs or chemoautotrophs) obtain

nearly all their carbon from CO2.

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
METABOLIC PATHWAYS IN E.coli

“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO

INGENIERIA QUÍMICA"
GRACIAS POR SU ATENCIÓN
“MICROBIOLOGÍA, 2° PARTE: METABOLISMO Y CRECIMIENTO
INGENIERIA QUÍMICA"