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UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA

NOMBRE: BIOLOGÍA MOLECULAR


CÓDIGO: 3006817
Profesora Claudia Ximena Moreno Herrera.

TALLER PARA EL PRIMER TEMA

1. Que tipo de macromoléculas es capaz de dirigir su propia replicación?


2. Identifique diez aminoácidos no polares y describa donde ellos tienden a localizarse en una típica enzima
monomerica soluble en agua.
3. ¿Cúal de los siguientes compuestos no es un aminoácido:

(A) (B) (C) (D) (E)

4. Defina que es el punto isoeléctrico de un aminoácido como afecta esto la proteína


5. El esqueleto central de una cadena de aminoácidos unidos mediante enlaces peptídicos tendrá la secuencia de
átomos siguiente:

a. N-R1-C-N-R2-C-N-R3-C-N-R4-C
b. N-C-N-C-N-C-N-C-N-C-N-C
c. C-N-C-C-N-C-C-N-C-C-N-C
d. N-C-C-N-C-C-N-C-C-N-C-C
e. Las opciones anteriores no corresponden al esqueleto de un péptido.
6. ¿Cuál de los siguientes aminoácidos puede formar enlaces laterales en las proteínas y por que?

a. Cys
b. Gln
c. Asp
d. Leu
e. no existe ninguno.
7. Para conocer la estructura primaria de una proteína particular es necesario determinar:

a. la secuencia de los residuos de aminoácido en la cadena de la proteína.


b. la orientación global de todos los enlaces peptídicos en la proteína.
c. los enlaces débiles que se forman entre los grupos R de los residuos de aminoácido
d. el contenido de cada aminoácido en la proteína.
e. nada, porque en la estructura de las proteínas no se presenta tal cosa.
8. En que consiste la estructura secundaria de las proteínas:
9. Las hojas o plegamientos  se caracterizan por:
10. En la estructura de proteínas con frecuencia se encuentran segmentos de la cadena que siguen la arquitectura
segmento de hoja , giro , segmento de hoja , giro , etc., este conjunto de segmentos se conocen como
estructura de "greca". Usted clasificaría esta arquitectura como:

a. Dominio
b. Estructura terciaria
c. Estructura secundaria
d. Estructura Primaria
e. Motivo de estructura supersecundaria
11. Una proteína posee estructura cuaternaria si y sólo si:

a. Si presenta puentes disulfuro.


b. Si se desnaturaliza por acción de los detergentes y/o de los agentes reductores como el DTT.
c. Presenta varios polipéptidos distintos.
d. Si su estructura funcional requiere de la interacción entre dos o más cadenas de aminoácidos iguales o
diferentes.
e. Si su secuencia de aminoácidos incluye los 20 diferentes amonoácidos de las proteínas.
12. Defina y de un ejemplo de Motivo y de dominio en una proteína.
13. Cuales son las fuerzas que mantienen unidas las estructuras secundarias y terciaria? Que es la estructura
cuaternaria cuales son las interacciones que la estabilizan?
14. Consulte que son las enzimas:
15. Para estar en posibilidades de catalizar una reacción química una enzima debe primero:

a. alterar la polaridad de la solución.


b. alterar su conformación para alcanzar una estructura tridimensional super-energizada.
c. alcanzar un estado iónico de carga neta igual a cero.
d. reconocer específicamente a sus sustratos formando un complejo con ellos.
e. hacer nada de lo anterior.

16. La velocidad de una reacción catalizada por una enzima varía con todos los factores siguientes:
a. pI, temperatura y concentraciones de proteína, sal y sustratos.
b. pH, temperatura y energía libre de formación de los sustratos.
c. pH, temperatura, concentración de sustratos y concentración de enzima.
d. pI de la enzima, pI del sustrato y pI del producto.
e. en todos los encisos hay al menos un factor incorrecto.
17. Cuando un sitio de la hemoglobina se ocupa con oxígeno:
a. La proteína pasa de un estado tetramérico a un estado dimérico.
b. La afinidad de los tres sitios restantes por el oxígeno se incrementa debido al efecto alostérico del sitio
ocupado sobre los otros sitios.
c. La afinidad de los tres sitios restantes por el oxígeno se incrementa debido al que hay menos sitios que
compitan por el O2.
d. La afinidad de los tras sitios restantes se reduce debido a la repulsión electrostática entre los oxígenos.
e. ninguno de los encisos es correcto.
18. Que es el colágeno y por que se caracteriza?.
19. El plegado correcto de las proteínas es esencial para la actividad biológica. Describa el papel de las chaperonas y
de las chaperoninas moleculares en el plegado de las proteínas.
20. Que problemas se pueden presentar por un defecto en el plegamiento de las proteínas explique?
21. Prediga la secuencia con que la eluirían las siguientes proteínas de una columna de filtración en gel con un rango
de exclusión de 5,000 a 400,000 daltones: Mioglobina, catalasa, citocromo c, miosina, quimotripsinógeno y
seroalbúmina. (Ver Tabla 1)

Tabla 1. Propiedades fisicoquímicas de algunas proteínas.


Nombre de la proteína pI P.M. (kd)

Ovoalbúmina 4.5 45
Seroalbúmina (humana) 4.9 69
Ureasa (Canavalis enziformes) 5 483
ß-lactoalbúmina (cabra) 5.2 37
g-Globulina 6.6 120
Hemoglobina (Humana) 6.8 65
Mioglobina (corazón de equino) 7 17
Quimitripsinógeno (Bovino) 9.6 23
Citocromo c (corazón de Bovino) 10.65 13
Lisozima 11 nd
Virus del Mosaico del tabaco nd 40,590
Catalasa (rábano) nd 222
Aldolasa nd 149
Miosina (Bacalao) nd 525
Fibrinógeno (humano) nd 340

22. Calcule el peso molecular aproximado de la lisozima nativa a partir de los siguientes volumenes de elución
obtenidos en la columna del problema anterior (ver tabla 1):
a. Citocromo c, 118; b-lactoalbúmina, 58; Hemoglobina, 24; Lisozima, 83 ml.

Tenga en cuenta que el logaritmo del peso molecular varía linealmente (pero en forma negativa) con el volumen de
elusión

23. Usted es un investigador y esta tratando de purificar la acetilcolinesterasa de cerebro de rata, cual sería el
procedimiento que utilizaría, explique.

24. Los ácidos nucléicos presentan una estructura helicoidal porque:

a. las bases son regiones polares, formadoras de puentes de hidrógeno que "gustan" de interactuar con el
agua.
b. el balance hidrofílico/hidrofóbico de las bases es tal que el agua forza a estas regiones a formar
puentes de hidrógenos con otras bases y no con el agua
c. el esqueleto de azúcar fosfato se encuentra cargado negativamente y la repulsión electrostática de las
cargas se reduce cuando los fosfatos quedan menos expuestos al solvente.
d. la azúcar que forma parte del esqueleto forma una red intramolecular de puentes de hidrógeno.
e. los ácidos nucleícos nunca presentan estructura tridimensional de tipo helicoidal.

25. Los pares G.C, en el DNA de doble cadena, son más fuertes que los pares AT, explique como se relaciona la
temperatura de fusión (Tm) del DNA, con el contenido molar de G.C? Realice una grafica.
26. De las moléculas de DNA que se indican en la Tabla 2. Cual cabria prever que tuviera el valor máximo y el valor
mínimo de Tm

Origen Cadena Circular o N° de pares Masa Longitud % (G+C)


única (ss) lineal de bases (bp) molecular (Da)
doble(ds) o bases (b)
Virus 40 del ds C 5243 bp 3.293X106 1.78 um 40.80
mono
Bacterifago ss C 5386 b 1.6664X106 No 44.76
X174 determinado
Bacteriofago Ss C 6407 b 1.977X 106 Nd 40.75
M13
Virus del ds C 8031 pb 4.962 X106 2.73 um 40.19
mosaico de la
coliflor
Adenovirus ds L 35937 pb 2.221x107 12.2 um 55.20
Virus de ds C 172282 pb 1.065X108 58.6 um 59.94
Epstein-Barr
Mosca de la ds L 6.5X107 pb 4.3x1010 2 cm 40
fruta
Tabal 2. Propiedades de algunas moléculas de DNA existentes en la naturaleza

27. ¿Qué es un nucleósido? De un ejemplo dibujando la estructura. Cuales son los ribonucleótidos y
desoxirribonucleótidos
28. Que diferencia entre el RNA y el DNA ayuda a explicar la gran estabilidad del DNA? Qué implicaciones tiene
esto para la función del DNA?.
29. Describa los experimentos que llevaron a la conclusión de que el DNA es el genoma de los seres vivos.
30. Que funciones generales poseen los ácidos nucleicos y donde los podemos encontrar tanto en células procarióticas
y eucarióticas.
31. Un DNA circular cerrado superenrollado se relaja mediante el tratamiento con una topoisomerasa. Sea cual sea la
cantidad de enzima utilizada o el tiempo de realización del experimento, el investigador encuentra siempre un
patrón de electroforesis en gel que indica algo de DNA con una, dos o tres vueltas de superhélice, además del
circulo relajado (mellado) (véase la figura). Sugiera una explicación para esta observación.
-

___ Círculo Mellado

___

___

___

PARTE GENOMAS

1. Gran parte del genoma humano consiste de repeticiones del DNA. Describa que son minisatélites y LINES?

2. en que consiste el proceso conocido como exon shuffling? Porqué está involucrado con la evolución?

3. en que consiste el splicing?

4. El DNA en una célula se asocia con proteínas para formar la cromatina. Que es un nucleosoma? Que papel
tienen las histonas en los nucleosomas?

5. La Mitocondria contiene sus propias moléculas de DNA. Describa los tipos de genes codificados por el genoma
de la mitocondria?

6. Que es un operón?

7. En cuanto a los genomas de los organismos explique en que consiste la paradoja entre el tamaño y la
complejidad.

8. Cuales son las dos mayores funciones de los telomeros sobre los cromosomas?

9. Que caracteriza los genomas virales?