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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA

DE HONDURAS

Facultad de microbiología

Dr. Miguel Ángel Zúñiga

Asignatura: Biotecnología 2

Sección: 1300

Nombre del trabajo: Cuestionarios del Manual

Estudiantes:
Edmon Luis Matamoros Montoya – 20132302074
José Ariel Sánchez Barahona 20131001928

Fecha: 02 de Marzo del 2023


Cuestionario # 1

1. ¿Qué riesgos se pueden presentar al desarrollar un


procedimiento en el laboratorio?

R// Riesgos que pueden provocar accidentes (caídas, cortes, quemaduras


térmicas o químicas, intoxicaciones, incendios, etc.) y enfermedades profesionales
(derivadas de la exposición continuada a contaminantes químicos, físicos o
biológicos). (1)

 Riesgos químicos:

Los productos químicos pueden provocar dos tipos de efectos:

- Efectos agudos (accidentes): se producen por una única


exposición súbita y severa (quemadura química, intoxicación, incendio,
etc.).

- Efectos crónicos (enfermedades): se producen por la exposición


repetida y prolongada a un contaminante químico. Los síntomas aparecen
después de años y a menudo son irreversibles (enfermedades hepáticas,
pulmonares, cáncer, etc.). (1)

 Riesgo físico:

Los riesgos físicos más habituales en los laboratorios: las radiaciones


(ionizantes y no ionizantes) y el ruido. (1)

 Riesgos biológicos

El riesgo biológico es la posibilidad de contraer una enfermedad infecciosa


provocada por bacterias, virus, hongos o parásitos durante el trabajo. La
manipulación de microrganismos, cultivos celulares y muestras biológicas (sangre,
tejidos, aguas de depuradora, etc.) puede provocar diversas enfermedades
infecciosas. (1)

2. ¿Cuál son las sustancias químicas de interés relacionadas con


la generación de residuos o desechos peligrosos en Honduras?

R: Quimicos que generan desechos peligros (1):


- Corrosivos

- Reactivos

- Explosivos

- Tóxicos

- Citótoxicos

- Inflamables

- Genotóxicos

3. ¿Cuál es el aprovechamiento o valorización de residuos


peligrosos en Honduras?

R: hay residuos peligros que pasan por un proceso de valoración y


reclasificaión como por ejemplo las Lámparas Fluorescentes que pasa por
tratamientos como la trituración y captura de vapores de Mercurio y con una
disposición final de encapsulación de barril/ depósito en relleno sanitario y el vidrio
sobrante pasa a ser Vidrio al relleno municipal. (1)

También existen residuos que pasa por procesos de recuperación energética


y de minerales; eso residuos peligros que se pueden incinerar según su hoja de
seguridad, son susceptibles de incineración se utilizan como fuente de combustibles
para hornos o materiales alternativos. (1)

4. ¿Cuál es el procedimiento que realiza tu institución para la


disposición final de los residuos obtenidos de los diferentes procedimientos
de laboratorio?

R: la siguiente informacion es un protocolo establecido por la UNAH para el


uso de residuos peligros por el el covid pero que tambien son aplicables a todo
residuo peligrosos.

El manejo interno adecuado de los residuos incluye un proceso de


segregación, etiquetado, almacenamiento intermedio, recolección y transporte
interno, almacenamiento temporal y capacitación del personal. (1)
Para el manejo externo de los desechos debe cumplirse lo siguiente:
recolección y transporte externo, tratamiento y disposición final. (1)

5. ¿consulta cuales empresas de recolección de residuos existen


en tu ciudad y en el país y que tipo de residuos recolectan?

R: RECYCLE S. DE R.L. empresa localizada en puerto cortés y maneja


residuos peligros como no peligros. (1)

Empresas encargadas de recoger los residuos sólidos en Tegucigalpa, capital


de Honduras. Esas empresas son Ama Honduras, (Amahsa) y Compañía
Constructora y Servicios Múltiples S.A. (Cosemsa). (1)

Cuestionario # 2

1. ¿Cuál es la diferencia entre ADN genómico y ADN


cromosómico?

R: El ADN genómico o nuclear: Nos referimos al ADN que está dentro del
núcleo de cada célula de nuestro organismo (excepto las células rojas de la sangre
que no tienen núcleo). (1)

Cromosomas: El ADN del núcleo de las células no está constituido por un


único filamento sino por varios distribuidos entre un número variable de
cromosomas. Cada cromosoma contiene una única molécula de ADN fuertemente
empaquetada. (1)

2. ¿Qué elementos contienen los medios LB y medio HBI?

R: El medio Luria-Bertani (LB), es uno de los más usados para el cultivo


de Escherichia coli y de otras especies bacterianas, debido a que es rico en
nutrientes, de fácil elaboración y permite el crecimiento de una gran variedad de
cepas. Está constituido por tres componentes, de los cuales uno es mineral, el NaCl,
y dos son orgánicos: la triptona (o peptona) y el extracto de levadura. (1)

BD Brain Heart Infusion (BHI) Agar es un medio de uso general adecuado


para el cultivo de una amplia variedad de tipos de organismos, incluidos las
bacterias, levaduras y hongos filamentosos, a partir de muestras clínicas. Obtiene
los nutrientes de la infusión de cerebro y corazón, la peptona y la glucosa. Las
peptonas y la infusión son fuentes de nitrógeno orgánico, carbono, azufre, vitaminas
y sustancias de traza. La glucosa es la fuente de carbohidratos que los
microorganismos utilizan mediante fermentación. Se utiliza fosfato disódico como
tampón en el medio.

3. ¿Qué son las nucleasas?

R: La función de las nucleasas (ADNasas y ARNasas) consiste en la rotura


enzimática del ADN y el ARN y son necesarias para numerosas aplicaciones
experimentales. Por ejemplo, la purificación de proteínas y ácidos nucleicos
específicos a menudo requiere la digestión del ADN, el ARN o ambos. Los
problemas de viscosidad resultantes de concentraciones elevadas de ADN y de los
métodos enzimáticos de disociación celular a menudo mejoran cuando se utiliza una
ADNasa.  (1)

4. ¿Qué son las lisozimas y la mutanolisima?

R: La lisozima, también llamada muramidasa, es una  de 14,4 kilodalton que


daña las células bacterianas catalizando la hidrólisis de las uniones beta 1,4 entre
los residuos de ácido N-acetilmurámico y N-acetil-D-glucosamina en
un peptidoglicano. La lisozima es abundante en numerosas secreciones como la
saliva, las lágrimas y el moco. Está presente también presente en los gránulos
citoplasmáticos de los neutrófilos polimorfonucleares PMN. Una gran cantidad de
esta enzima puede hallarse en las claras de huevo. (1)

La mutanolisina es una enzima específica grampositiva que hidroliza


componentes de la pared celular. (1)

5. ¿Qué papel juega cada uno de los reactivos utilizados en el


proceso de extracción y purificación?

R:

- Los medios LB Y HBI tienen la funcion de reconstituir a los


microorganismos

- El agua libre de nucleasas ayuda obtener resultados fiables


debiado a que protege el material genético y es viene libre de
contaminantes.
Cuestionario #3

1. ¿Qué indica la presencia de florescencia cercana al punto de


origen dé la corrida?

La presencia de fluorescencia cercana al punto de origen de la corrida puede


indicar que se ha producido una contaminación en la muestra inicial o en los
reactivos utilizados durante la corrida.

La fluorescencia es un fenómeno que puede ser causado por diferentes tipos


de moléculas, incluyendo compuestos orgánicos, inorgánicos y biomoléculas, como
proteínas o ácidos nucleicos. En el contexto de una corrida, la fluorescencia se
puede utilizar para detectar la presencia de la secuencia de interés en la muestra.

Sin embargo, si hay fluorescencia cerca del punto de origen de la corrida,


esto puede significar que se ha producido una contaminación que ha afectado a las
muestras o reactivos utilizados. Es importante investigar y solucionar la fuente de la
contaminación antes de continuar con la corrida, ya que, de lo contrario, puede
haber un riesgo de resultados imprecisos o incorrectos. (1)

2. ¿Qué indica la no visualización de florescencia?

La falta de visualización de fluorescencia puede tener diferentes significados


según el contexto en el que se está llevando a cabo la corrida o la técnica de
detección utilizada. En general, la ausencia de fluorescencia puede indicar una falta
de amplificación de la secuencia objetivo o una falta de sensibilidad del método de
detección.

Si se está llevando a cabo una PCR, la falta de fluorescencia puede indicar


que no se ha producido amplificación de la secuencia de interés debido a una serie
de posibles problemas, como la falta de especificidad de los cebadores, una baja
concentración de la muestra ADN, una temperatura incorrecta durante la PCR, o la
presencia de inhibidores en la muestra. En estos casos, se pueden realizar ajustes
en los protocolos o repetir la corrida para intentar solucionar el problema.

Si se está utilizando una técnica de detección de fluorescencia, como la


citometría de flujo, la falta de fluorescencia puede indicar una falta de sensibilidad
del método de detección, una baja concentración de la muestra, o una falta de
especificidad de los ensayos o sondas fluorescentes utilizadas. En estos casos, se
pueden realizar ajustes en los protocolos o utilizar técnicas de amplificación de
señal para mejorar la sensibilidad del método de detección. (1)

3. ¿Qué nos indica la presencia de un barrido en el carril


correspondiente a una muestra?

La presencia de un barrido en el carril correspondiente a una muestra puede


indicar varias cosas, dependiendo del contexto en el que se esté realizando la
muestra. Algunas posibles interpretaciones:

 Contaminación: un barrido puede indicar la presencia de


contaminantes en la muestra que están siendo arrastrados por la corriente
eléctrica de la electroforesis. Esta contaminación puede deberse a varios
factores, como impurezas en los reactivos o en el material de la muestra, o
una carga demasiada alta de la muestra en el gel.

 Degradación: si el barrido se observa en las bandas de ADN o


ARN, puede indicar que la muestra ha sufrido algún tipo de degradación
durante la extracción o el almacenamiento. La presencia de fragmentos de
menor tamaño que el esperado también puede ser un indicativo de
degradación.

 Sobrecarga: un barrido puede aparecer si se carga excesiva


muestra en el pozo correspondiente, lo que hace que se solapen las bandas
y se produzca una imagen borrosa. En este caso, reducir la cantidad de
muestra o cargarla en varios pozos puede solucionar el problema.

 Errores técnicos: un barrido también puede tener errores


técnicos durante el proceso de electroforesis, como una corriente eléctrica
demasiado alta o una desnaturalización de la muestra debido a una
temperatura demasiado elevada.

En cualquier caso, es importante analizar el contexto en el que se está


realizando la muestra y considerar todas las posibles explicaciones antes de llegar a
una conclusión definitiva. (1)

4.
¿Cuál es la absorbancia máxima del bromuro de etidio?

La absorbancia máxima del bromuro de etidio (también conocido como etidio


bromuro o EtBr) es de aproximadamente 590 nanómetros (nm) cuando se encuentra
unido al ADN o ARN.

5) ¿Cuál es la sensibilidad máxima del bromuro de etidio?

En general, se considera que el EtBr puede detectar tan poco como 10 ng/de
ADN en un gel de agarosa, lo que se traduce en una sensibilidad de 10 ng/ml de
EtBr en la muestra. Sin embargo, es importante tener en cuenta que la sensibilidad
puede variar según las condiciones experimentales y las características de la
muestra. (1)

Cuestionario #4

1) Esquematice el proceso de amplificación por la técnica de PCR


indicando los cambios de temperatura programados en el termociclador.

La técnica de PCR (reacción en cadena de la polimerasa) es una técnica de


amplificación de ADN que se utiliza para replicar una región específica de ADN. El
proceso consta de tres pasos principales: desnaturalización, apariencia y extensión.
El termociclador es un equipo que controla la temperatura para que se produzcan
estos tres pasos de forma repetida, permitiendo la amplificación de ADN de forma
exponencial. A continuación, se esquematiza el proceso de amplificación por la
técnica de PCR, indicando los cambios de temperatura programados en el
termociclador:

1. Desnaturalización: El ADN se calienta a una temperatura alta


(95°C) durante 30 segundos a 1 minuto para romper los enlaces de
hidrógeno entre las dos hebras complementarias y separarlas. Este paso se
realiza para generar dos hebras simples de ADN.

2. Apareamiento: El ADN se enfría a una temperatura de


aproximadamente 50-60°C durante 30 segundos a 1 minuto para que los
cebadores (oligonucleótidos sintéticos diseñados para hibridarse con una
secuencia específica del ADN) se unan a las hebras simples de ADN.

3. Extensión: La temperatura se aumenta a 72°C durante

(2)

1) A qué se debe el nombre de Taq de la ADN polimerasa utilizando en


una PCR.

El nombre de Taq de la ADN polimerasa utilizada en la PCR se debe a


que esta enzima fue aislada por primera vez de la bacteria Thermus aquaticus,
también conocida como T. aquaticus. Esta bacteria es un microorganismo
extremófilo que habita en fuentes termales y otros ambientes de alta
temperatura, y es capaz de sobrevivir y reproducirse en condiciones extremas
de temperatura y pH. (1)

2) ¿Cuáles son los aspectos críticos a considerar en el diseño de los


primers?

El diseño de los primers es uno de los aspectos críticos en la


amplificación de una región específica del ADN por la técnica de PCR. Algunos
de los aspectos críticos a considerar en el diseño de los primers son los
siguientes:
Especificidad: Los cebadores deben ser específicos para la región de
ADN que se desea amplificar, es decir, no deben unirse a otras secuencias de
ADN que puedan estar presentes en la muestra. Para lograr la especificidad, es
importante evitar la complementariedad de los cebadores con secuencias no
deseadas y utilizar herramientas de bioinformática para buscar regiones únicas
en el genoma de interés.

Tamaño: Los cebadores deben tener una longitud adecuada,


generalmente entre 18 y 24 nucleótidos, para permitir una unión estable y
específica con el ADN molde.

Temperatura de fusión: Los primers deben tener una temperatura de


fusión similar (Tm) para permitir una hibridación específica con el ADN mol. (3)

4) ¿Qué son los dímeros de primers y como minimizarlos?

Los dímeros de primers son estructuras formadas por la unión de dos


cebadores (primers) durante el proceso de PCR, en lugar de unirse a la
secuencia de ADN objetivo que se desea amplificar. Los dímeros de cebadores
pueden competir con los cebadores para unirse al ADN, reducir la eficiencia de
la amplificación y descubrir productos no específicos que pueden interferir en la
interpretación de los resultados.
Para minimizar la formación de dímeros de primers, es importante
optimizar el diseño de los cebadores y las condiciones de la reacción de PCR.
Algunas estrategias útiles para evitar la formación de dímeros de primers son:
 Diseñar cebadores con secuencias específicas y evitar la
formación de cebadores complementarios en las regiones de unión.
 Ajustar la concentración de los cebadores para que sean
necesarios para permitir la amplificación específica, pero no tanto que
favorezcan la formación de dímeros.
 Optimizar la temperatura de recocido para que sea específica
para los cebadores y evitar la formación de dímeros.
 Usar aditivos especiales en la mezcla de reacción que reduzcan
la formación de dímeros, como DMSO, BSA o betaina.
 Realizar una optimización de los cuidados a los parámetros de
la PCR, incluyendo la temperatura de recocido, la cantidad de ADN, la
concentración de cebadores y la cantidad de enzima de PCR. (4)

5) ¿Qué efecto tendría un exceso de dNTPs en la mezcla de reacción PCR?

Un exceso de dNTPs (nucleótidos de desoxirribonucleótido tri-fosfato) en la


mezcla de reacción de PCR puede tener varios efectos negativos en la amplificación
del ADN:

1. Inhibición de la actividad de la ADN polimerasa: La presencia de


un exceso de dNTPs puede reducir la actividad de la ADN polimerasa, ya que
la enzima tiene dificultades para seleccionar los nucleótidos adecuados
necesarios para la síntesis del ADN.

2. Aumento de la cantidad de productos no específicos: Una


cantidad excesiva de dNTPs puede aumentar la tasa de incorporación no
específica de nucleótidos, lo que conduce a la síntesis de productos de PCR
no específicos y la amplificación no deseada de productos contaminantes.

3. Disminución de la especificidad de la PCR: La presencia de un


exceso de dNTPs puede aumentar la tasa de incorporación no específica de
nucleótidos, lo que puede disminuir la especificidad de la PCR y aumentar la
probabilidad de amplificar productos de PCR no deseados.

4. Inhibición de la detección de la PCR: El exceso de dNTPs puede


inhibir la detección de la PCR, ya que la cantidad de productos de PCR
puede ser demasiado baja para su detección por técnicas de análisis
posteriores.

En general, es importante agregar la cantidad correcta de dNTP a la


mezcla de reacción de PCR para garantizar una amplificación eficiente y
específica del ADN. Un exceso de dNTPs puede tener efectos negativos en
la amplificación del ADN y en la detección de la PCR. (4)

6) ¿Qué efecto tendría un déficit de MGCl2 en una reacción de PCR?


El MgCl2 es un cofactor importante en la reacción de PCR, ya que es
necesario para la actividad de la enzima Taq polimerasa. La Taq polimerasa
utiliza el Mg2+ para estabilizar los enlaces fosfodiéster durante la síntesis de la
cadena de ADN, lo que permite que la polimerasa pueda extender los
cebadores y amplificar la secuencia de ADN objetivo.
Un déficit de MgCl2 en la reacción de PCR puede tener efectos negativos
en la amplificación del ADN, ya que la enzima Taq polimerasa no será capaz de
unirse al ADN y extender los cebadores adecuadamente. En general, una
concentración óptima de MgCl2 en la reacción de PCR es esencial para obtener
una amplificación eficiente y específica de la secuencia de ADN objetivo.
Si hay un déficit de MgCl2 en la reacción de PCR, es posible que se
produzcan los siguientes efectos:

Reducción de la eficiencia de la amplificación del ADN, lo que puede


resultar en cantidad de productos de PCR.

 Aumento de la formación de productos no, ya que la Taq


polimerasa puede unirse a regiones no específicas del ADN si no hay
suficiente MgCl2 disponible para estabilizar los enlaces fosfodiéster durante
la síntesis de la cadena.
 Reducción de la especificidad de la reacción de PCR, ya que la
Taq polimerasa puede unirse a los cebadores y generar productos no
específicos si no hay suficiente Mg2+ disponible para estabilizar los enlaces
fosfodiéster durante la síntesis de la cadena.
En resumen, es importante asegurarse de que haya una concentración
adecuada de MgCl2 en la reacción de PCR para obtener una amplificación
eficiente y específica de la secuencia de ADN objetivo. (2)

7) Realice una tabla comparativa entre PCR punto final PCR en tiempo real
PCR digital.

PCR Punto PCR en Tiempo


Parámetros Final Real PCR digitales
principio Amplificación de Amplificación de la Amplificación de la
la cadena de cadena de ADN en cadena de ADN en
ADN por ciclo de tiempo real mediante tiempo real
PCR Punto PCR en Tiempo
Parámetros Final Real PCR digitales
mediante la
separación y
cuantificación de
la monitorización de moléculas
calor la fluorescencia individuales
Detecta
cuantificación
de ADN Si Si Si
rango de
cuantificacion limitado Amplio Amplio
sensibilidad Baja Alta muy alto
Resolucion Baja Alta muy alto
especificidad limitada Alta muy alto
tiempo de
analisis Largo Corto Medio-largo
Termociclador y equipo
equipo de deteccion de Dispositivo de PCR
necesario Termociclador fluorescencia digital
Análisis cuantitativo de Análisis cuantitativo de
Analisis de ADN en tiempo real, ADN, detección de
presencia o diagnóstico molecular, seleccionados,
ausencia de detección de parásitos, diagnóstico molecular,
ADN en análisis de expresión análisis de variantes
Aplicaciones muestras génica genómicas
(2)

Cuestionario 5

1) ¿Qué carga tiene el ADN y por tanto en un proceso de electroforesis hacía


que polo migra?
El ADN tiene una carga negativa debido a la presencia de grupos fosfato en
su estructura, por lo que migrará hacia el polo positivo durante un proceso de
electroforesis. En una electroforesis en gel de agarosa, el ADN se coloca en un
pozo en la parte superior del gel y se somete a un campo eléctrico. Debido a la
carga negativa del ADN, este migrará hacia el polo positivo, es decir, hacia la parte
inferior del gel. La velocidad de migración apareció del tamaño y la forma del ADN,
así como de la intensidad del campo eléctrico y la concentración de la matriz del gel.
(1)

2) ¿Qué es el bromuro de etidio y que función tiene en la electroforesis?

Durante la electroforesis, el ADN se separa según su tamaño y carga


eléctrica. Sin embargo, el ADN está incoloro y no se puede ver directamente. Por lo
tanto, se utiliza el bromuro de etidio, que intercala entre los pares de bases del ADN
y emite fluorescencia al ser expuesto a luz ultravioleta (UV).

El gel de agarosa se colorea con bromuro de etidio antes o después de la


electroforesis, y el ADN se visualiza como bandas brillantes bajo luz UV. La
intensidad de la fluorescencia es proporcional a la cantidad de ADN presente en la
banda, lo que permite la cuantificación del ADN en la muestra.

Es importante tener en cuenta que el bromuro de etidio es altamente tóxico y


debe ser manipulado con precaución. Además, su eliminación debe realizarse de
manera segura para evitar la contaminación del medio ambiente. Alternativas más
seguras como SYBR Green, GelRed y otros colorantes fluorescentes están siendo
cada vez más utilizados en la actualidad. (1)

3) ¿Cuáles son los principales polímeros usados para hacer una


electroforesis?

La agarosa es un polisacárido extraído de algas que se utiliza normalmente


en la electroforesis en gel para separar fragmentos de ADN de tamaño grande,
como fragmentos de PCR y plásmidos. La agarosa se disuelve en agua caliente y
luego se solidifica en una matriz por enfriamiento. La concentración de agarosa se
ajusta para obtener diferentes resoluciones de separación de fragmentos de ADN.

El poliacrilamida, por otro lado, es un polímero sintético que se utiliza para


separar fragmentos de ADN de tamaño pequeño y proteínas. La poliacrilamida se
polimeriza para formar una matriz en la que los fragmentos se separan según su
tamaño y carga eléctrica. La concentración de la poliacrilamida se ajusta para
obtener diferentes resoluciones de separación de fragmentos.

Tanto la agarosa como la poliacrilamida tienen diferentes propiedades que las


hacen adecuadas para diferentes tipos de electroforesis. Por ejemplo, la agarosa se
utiliza para la separación de fragmentos de ADN grandes, mientras que la
poliacrilamida se utiliza para la separación de fragmentos de ADN pequeños y
proteínas. (4)

4) ¿Cómo el bromuro de etidio tiñe el ADN y como es fundamento con otros


colorantes existen ya en el mercado?

El bromuro de etidio es un colorante intercalante que se une al ADN mediante


la inserción entre los pares de bases. Al hacerlo, su estructura se modifica y se
vuelve fluorescente cuando se ilumina con luz UV. Debido a que el ADN es incoloro
y el bromuro de etidio se une específicamente a él, el ADN se tiñe de color naranja-
rojo cuando se visualiza bajo luz UV después de la electroforesis.

Aunque el bromuro de etidio ha sido el colorante más utilizado para la


electroforesis durante décadas, su toxicidad y manejo seguro son preocupantes.
Además, el bromuro de etidio puede dañar el ADN y afectar la precisión de las
mediciones cuantitativas.

Hay varios colorantes alternativos disponibles en el mercado que se están


volviendo cada vez más populares. Estos colorantes son menos tóxicos y menos
dañinos para el ADN. El SYBR Green, por ejemplo, es un colorante intercalante
similar al bromuro de etidio, pero es menos tóxico y más sensible. Otro ejemplo es
el GelRed, que se une al ADN de manera no covalente, lo que lo hace menos tóxico
y más seguro de usar.

También hay colorantes que no son intercalantes como el SYPRO Orange y


SYPRO Ruby, que se unen a proteínas específicas y permiten la visualización y
cuantificación de proteínas separadas por electroforesis.

Existen varios colorantes en el mercado que son menos tóxicos y menos


dañinos para el ADN que el bromuro de etidio, pero cada colorante tiene sus propias
propiedades y aplicaciones específicas. (3)
¿Qué sucedería si?:

5) ¿Si la cámara de electroforesis tuviera agua en el lugar del tampón TAE?

La electroforesis no se llevaría a cabo adecuadamente. El tampón TAE es un


tampón de electroforesis utilizado que proporciona las condiciones adecuadas para
la separación de fragmentos de ácidos nucleicos. Contiene iones que ayudan a
mantener un pH constante ya estabilizar las cargas eléctricas. Además, el tampón
TAE también proporciona iones para que la corriente eléctrica fluya a través de la
solución y permita la migración de los fragmentos de ácidos nucleicos a través del
gel.

En cambio, si la cámara de electroforesis tuviera solo agua, no se


proporcionaría la conductividad eléctrica necesaria para que los fragmentos de
ácidos nucleicos se separen adecuadamente en el gel. En otras palabras, la
corriente eléctrica no fluiría correctamente a través del agua, y no se generaría un
campo eléctrico para permitir la separación de los fragmentos suficientes de ADN o
ARN. (1)

6) Si se utiliza agua en lugar en lugar de tampón TAE en la preparación del


gel de agarosa.

Si se utiliza agua en lugar del tampón TAE para preparar el gel de agarosa, el
pH del gel podría ser incorrecto y las cargas eléctricas no se estabilizarían
adecuadamente. Además, la ausencia de iones en el agua podría afectar la
conductividad eléctrica del gel, lo que podría afectar la calidad de la electroforesis y
hacer que los fragmentos de ácidos nucleicos no migren adecuadamente a través
del gel.(4)

7) Si los electrodos se ponen invertidos

Si los electrodos se ponen invertidos en una electroforesis, se invertiría la


dirección del campo eléctrico en el gel de agarosa. Esto afectaría la dirección de la
migración de los fragmentos de ácidos nucleicos a través del gel y alteraría el patrón
de bandas resultantes en la electroforesis. (3)
8) ¿Qué representa una banda en un gel de agarosa?

En la electroforesis en gel de agarosa, una banda representa una agrupación


de fragmentos de ácidos nucleicos que se han separado y se han concentrado en
un área específica del gel. Cada banda en un gel de agarosa representa un
fragmento de ácido nucleico de tamaño específico.

(1)

9) Examine la foto de su gel y describa la calidad de cada uno de los ADN


procesados en la electroforesis.

Se puede observar que se encuentra la cantidad de ADN esperado que es


aproximadamente 1.8 kbp para el gen gyrA y 540 para el gen 16s rRNA para cada
muestra correspondiente, tambien se encuentra material genético degradado y una
gran concetración de dímeros de primers. La mayoría de muestra obtuvo buena
calidad de ADN a excecpión de la muestra número 10 que se creo intefercia al
agregar un paso extra al proceso de extración.

Bibliografía
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