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Biotransfromation of Dibenzothiophene - En.es - Traducido
Biotransfromation of Dibenzothiophene - En.es - Traducido
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DOI: 10.4172 / 2155-6199.1000439
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ISSN: 2155-6199
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2 Laboratorio de Fisiología Molecular Vegetal, Centro de Biotecnología de Borj Cedria (CBBC), Ecoparque Borj-Cedria, Soliman, Túnez
3 Centro de Investigación de la Biosfera Tropical, Centro de Biociencias Moleculares (COMB), Universidad de Ryukyus, 1 Sembaru, Nishihara-cho, Okinawa, Japón
*Autor correspondiente: Leila El-Bassi, Laboratorio de Aguas Residuales y Medio Ambiente, Centro de Investigación y Tecnologías del Agua, Ecoparque Borj-Cedria, Soliman, Túnez, Tel:
Fecha de grabación: 23 de marzo de 2018; Fecha acc: 30 de abril de 2018; Fecha de publicación: 02 de mayo de 2018
Derechos de autor: © 2018 El-Bassi L, et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la Licencia de Atribución Creative Commons, que permite el uso, distribución y
reproducción sin restricciones en cualquier medio, siempre que se acredite el autor y la fuente originales.
Resumen
Se seleccionaron cinco aislamientos capaces de utilizar dibenzotiofeno (DBT) como única fuente de azufre con altas tasas para investigar sus potencialidades como
biocatalizadores de reacciones de biodesulfuración. Se investigaron las actividades desulfurantes de las cepas seleccionadas en el estado celular en crecimiento y en reposo.
Los rendimientos de biodegradación fueron considerablemente más altos en la reacción celular en reposo, especialmente para dos cepas denominadas provisionalmente S1
(98,8%) y S27 (97,5%). Estos resultados insinuaron que la actividad de biodegradación estaba relacionada principalmente con el metabolismo secundario de estas cepas.
También se evaluaron sus potencialidades de biotransformación bajo diversas condiciones con el fin de evaluar su estabilidad tanto en medios acuosos como orgánicos; y su
sensibilidad a la presencia de escualeno, utilizado en este estudio como representante de los hidrocarburos en el petróleo. Los resultados mostraron que las 5 cepas
seleccionadas todavía estaban activas en presencia de 95% de escualeno pero no se observó transformación en 99% de escualeno. La selectividad del sustrato de azufre se
estudió en presencia de otros compuestos orgánicos de azufre como dimetilsulfóxido DMSO y benzotiazol BTH. La presencia de estos sustratos inhibió la absorción de DBT por
las bacterias y, en consecuencia, disminuyó su tasa de degradación. Además, el análisis convencional de la secuenciación del ADN ribosómico 16S mostró que la cepa, con las
tasas de bioconversión más altas, pertenecía a La presencia de estos sustratos inhibió la absorción de DBT por las bacterias y, en consecuencia, disminuyó su tasa de
degradación. Además, el análisis convencional de la secuenciación del ADN ribosómico 16S mostró que la cepa, con las tasas de bioconversión más altas, pertenecía a La
presencia de estos sustratos inhibió la absorción de DBT por las bacterias y, en consecuencia, disminuyó su tasa de degradación. Además, el análisis convencional de la
secuenciación del ADN ribosómico 16S mostró que la cepa, con las tasas de bioconversión más altas, pertenecía a Serratia marcescens especies. Hasta donde sabemos, Serratia
sp. rara vez se informó como cepa degrder DBT. Por lo tanto, la velocidad y el alcance de la reacción de biodesulfuración, exhibida por la cepa Serratia marcescens S27, sugirió
que podría usarse en una escala práctica.
Palabras clave: Dibenzotiofeno; Biodesulfuración; Organosulfur vía [22,23]. Rhodococcus y Gordonia tienen la especificidad de oxidar
compuestos; Xenobióticos; Biodegradación; Serratia sp. azufre en DBT sin dividir el esqueleto carbónico en hidrocarburos con
bajo número de carbonos. Esta propiedad tiene una gran ventaja cuando
Introducción se aplica a procesos industriales.
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Identificación de ARNr. También se destacó la detección de genes 121 ° C durante 5 min en caso de células inactivadas por calor para examinar la
desulfurantes con el fin de caracterizar la vía metabólica utilizada por la posibilidad de adsorción de sustratos a las células en reposo. La reacción se inició
cepa con alto potencial de degradación. añadiendo el DBT utilizado aquí como sustrato. Se añadió DBT a una concentración
final de 1 g / L. Los experimentos de bioconversión se llevaron a cabo en matraces
Materiales y métodos de 250 mL a 30 ° C y 200 rpm. Las muestras se recogieron cada 2 horas de
intervalos para el ensayo de DBT por HPLC. La actividad de las células en reposo se
determinó mediante la tasa de consumo de DBT durante las 24 h del experimento.
Productos quimicos
Condiciones de cultivo
Análisis de HPLC
Las cinco cepas seleccionadas cultivadas en 50 mL de medio de cultivo en
matraces de 250 mL se inocularon con 25 mg / L de DBT y se incubaron
Todas las concentraciones de compuestos se midieron mediante
durante 120 horas a 30 ° C en condiciones de agitación. Durante el tiempo de
cromatografía líquida de alta resolución (HPLC) (Tipo LC-10A, Shimadzu
cultivo, se tomaron muestras de alícuotas del cultivo para medir las
Co., Kyoto, Japón), equipada con un detector de red de diodos y un
concentraciones de DBT por HPLC y el crecimiento celular por ensayo
inyector automático.
turbimétrico a una densidad óptica de 660 nm (DO). Para analizar por HPLC se centrifugaron 1,5 mL de muestra a 13000 rpm
durante 5 min, en tubos Eppendhorf (muestras acuosas con acetonitrilo, en
El medio de cultivo se preparó según lo mencionado por Izumi et al.
diluciones ½). Cuando se separaron ambas fases, se midieron los compuestos
[30]. El medio estándar mínimo libre de sulfato (SMM) contenía: 5 g
en aceite una vez disueltos con una columna para análisis de fase inversa
fuente de carbono (glucosa o glicerol), 0,5 g de KH 2 correos 4, 4 mg de
(Tipo VP-ODS Shim-pack, 150 mm 4,6 mm, Shimadzu Co., Kyoto, Japón). En
K 2 HPO 4, 1 g de NH 4 Cl, 0,2 g de MgCl 2. 6H 2 O, 0,02 g de CaCl 2, 0.01 g de NaCl, 10
este caso, la elución isocrática se realizó con una fase móvil de acetonitrilo:
mL de solución de metal en 1000 mL de agua desionizada (pH 7,7).
La solución de metal contenía 0,5 g de FeCl 2. 4H 2 O, 0,5 g de ZnCl 2, 0,5 g de agua 55:45 (v / v) a 1 mL min. 1. Se detectó DBT a un valor de longitud de onda
de 280 nm.
MnCl 2. 4H 2 O, 0,1 g de Na 2 Mugir 4. 2H 2 O, 0.05 g de CuCl 2, 0,05 g de
N / A 2 WO 4. 2H 2 O y 120 mmol de HCl en 1000 ml de agua desionizada. La única fuente de azufre en este
experimento fue DBT (25 mg. L- 1 añadido en Identificación del ARNr 16S
solución en alcohol etílico).
El ADN genómico se preparó usando ISOPLANT (Nippon-gene Co., Tokio,
Japón) y se usó para PCR. El locus del gen 16S rRNA fue amplificado por PCR
Bioconversión de DBT por células en reposo como se describió anteriormente [31]. Se utilizó el programa blast
(http://ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/NCBI, MD, EE. UU.) Para la búsqueda de
Las células se cultivaron en 50 mL de SMM en matraces de 250 mL. Se
homología génica con el programa estándar por defecto. El árbol filogenético
recolectaron al final de la fase de crecimiento por centrifugación (20000 g durante
basado en la secuencia del gen de ARNr 16S se construyó mediante el método
15 min), se lavaron dos veces con agua desionizada esterilizada y una vez con
de unión de vecinos [32], con el modelo de dos parámetros de Kimura como
Tampón fosfato 0,1 M (pH 7,0) y suspendido en un volumen apropiado
corrector de distancia [33] después de la alineación de
del tampón fosfato para ajustar la concentración celular a una densidad
óptica a 660 nm de 10. La suspensión celular se calentó a
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Figura 1: Estructura química del dibenzotiofeno DBT. degradación en una tasa de tiempo más corta evaluada respectivamente como 98,8% y
97,5% como se ilustra en la Figura 4.
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95 30 20 11 18 28
99 0 0 0 0 0
90 40 33 26 39 58
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Propiedad de desulfuración de DBT de R. erythropolis Se ha demostrado La Figura 6 mostró la degradación de DBT por la cepa S27 en presencia de
que IGTS8, la primera bacteria que se informó por poseer la capacidad de varias fuentes de azufre en condiciones de crecimiento. DMSO es un
eliminar el azufre de la DBT [22], se debe a la presencia de genes de compuesto orgánico de azufre alifático. El DMSO es una fuente de azufre más
desulfuración, es decir, el operón ABC de dsz [36]. Por lo tanto, se llevó a cabo realista que el DBT para la producción de cantidades industriales de
una PCR para la evidencia molecular de la presencia de genes dsz en el biocatalizador debido a su costo y disponibilidad. La cepa creció
aislado S27. El análisis de las secuencias de los productos de PCR reveló una considerablemente mejor con dimetilsulfóxido y DBT que con DBT como única
identidad del 100% con los genes dsz correspondientes (dsz A, dszB, dszC) de R. fuente de azufre. Sin embargo, la tasa de consumo de DBT alcanzó el 33,9%
erythropolis IGTS8. Esto está de acuerdo con la naturaleza conservada del en presencia de DMSO en comparación con el 98% solo con DBT. La
genotipo dsz de bacterias desulfurantes. Se ha descubierto que los genes degradación de DBT parecía estar inhibida por la presencia de DMSO. Se
implicados en el metabolismo de DBT están presentes en casi todas las obtuvo un resultado similar en presencia de BTH. El crecimiento bacteriano
bacterias degradantes de DBT y se ha demostrado que tienen casi el 70% de fue mejorado por la presencia del compuesto organosulfurado aromático BTH
la homología de secuencia [1]. (Figura 6). Sin embargo, el consumo de DBT fue de alrededor del 68% en
presencia de BTH.
Bioconversión de DBT en presencia de diversas fuentes de azufre
La cepa S27 que tiene la tasa de bioconversión DBT más alta se identificó como Serratia
marcescens presion. La detección de los genes de desulfuración, es decir, el operón ABC de
dsz, nos lleva a concluir que la vía 4S está implicada principalmente en la degradación de
DBT. Según investigaciones anteriores, la vía 4S es una vía específica para la
biodesulfuración de DBT y su conversión en 2-hidroxibifenilo. En este caso, la estructura
carbonada de DBT se libera intacta [2]. Además, las vías de bioconversión de DBT por
bacterias, han sido ampliamente estudiadas, como: Arthrobacter [ 37], Brevibacterium [ 38], Mycobacter
y
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de estas moléculas, conocidas por ser recalcitrantes a la hidrodesulfuración. 11. Oshiro T, Izumi Y (1999) Desulfuración microbiana de compuestos orgánicos
En este estudio se tuvieron en cuenta dos OSC: DMSO (OSC alifático) y BTH de azufre en el petróleo. Biosc Biotech Biochem 63: 1-9.
(OSC aromático). La presencia de BTH y DMSO obviamente ha mejorado el 12. Kayser KJ, Cleveland L, Park H, Kwak J, Kolhatkar A, et al. (2002)
crecimiento bacteriano relacionado con la abundancia del elemento azufre. La Aislamiento y caracterización de un termófilo moderado,
Mycobacterium fleos GTIS10, capaz de dibenzotiofeno
absorción de DMSO y BTH por la cepa Serratia marscens S27 fue
desulfuración. App Microb Biotech 59: 737-746.
considerablemente más alta que la captación de DBT. En consecuencia, la
bioconversión de DBT disminuyó considerablemente. Esto sugirió que la
13. Li FL, Xu P, Ma CQ, Luo LL, Wang XS (2003) Desulfuración profunda de aceite
diesel tratado con hidrodesulfuración por una bacteria termófila facultativa
actividad de degradación de DBT en esta cepa parecía estar inhibida por estos Mycobacterium sp. X7B. FEMS Microbiol Lett 223: 301-307.
compuestos y la cepa utilizó predominantemente estos compuestos como
14. Lu J, Nakajima-Kambe T, Shigeno T, Ohbo A, Nomura N, et al. (1999)
fuente de azufre en lugar de DBT. Este comportamiento podría ser una Biodegradación de dibenzotiofeno y 4,6-dimetil dibenzotiofeno por la
limitación cuando se aplica en una escala práctica que contiene una mezcla de cepa TZS-7 de Sphingomonas paucimobilis. J Biosc Bioeng 88: 293-299.
compuestos orgánicos de azufre. 15. Kirimura K, Furuya T, Nishii Y, Ishii Y, Kino K, et al. (2001) Biodesulfuración de
dibenzotiofeno y sus derivados a través de la escisión selectiva de enlaces
carbono-azufre por una bacteria moderadamente termófila Bacillus subtilis WUS2B.
Conclusión
J Biosc Bioeng 91: 262-266.
Se aislaron cinco aislamientos capaces de desulfurar DBT en estado de El-Bassi
dieciséis. L, Shinzato N, Namihira T, Oku H, Matsui T (2009)
crecimiento y reposo de las aguas residuales industriales. La tasa de Biodegradación de tiodiglicol, un hidrolizado del arma química yperita,
biotransformación fue considerablemente más alta en el estado de las células en por bacterias desulfuradoras de benzotiofeno. Revista de materiales
peligrosos 167: 124-127.
reposo que en el estado de las células en crecimiento, lo que significaba que la tasa
de biodegradación de DBT pertenecía al metabolismo secundario de estas cepas. La 17. Rhee SK, Chang JH, Chang YK, Chang HN (1998) Desulfuración de
dibenzotiofeno y aceite diesel por una cepa de Gordona recientemente
cepa con alta tasa de degradación se identificó como Serratia marcescens presion.
aislada, CYKS1. App Environ Microbiol 64: 2327-2331.
Sin embargo, la bioconversión de DBT usando esta cepa está muy influenciada por
los compuestos orgánicos de azufre que existen en el medio. Junto con el hecho de
18. Chang JH, Chang YK, Ryu HW, Chang HN (2000) Desulfuración de gasóleo
ligero en sistemas de células inmovilizadas de Gordonia sp. CYKS1 y Nocardia
que la cepa expresó actividad desulfurante en un estado celular en crecimiento y en sp. CYKS2. FEMS Microbiol Lett 182: 309-312.
reposo, como se mostró anteriormente, esta bacteria podría contribuir al
19. Setti L, Farinelli P, Martino SD, Frassinetti S, Lanzarini G, et al. (1999)
tratamiento de aguas residuales que contiene DBT. Aunque parece que el S. Desarrollos en vías destructivas y no destructivas para la desulfuración
marcescens es capaz de desulfurar DBT, la bioconversión de este compuesto selectiva en procesos de biorrefinación de petróleo. App Microbiol Biotech 52:
todavía requirió mucha investigación para descubrir el mecanismo real de la vía 111-117.
metabólica de desulfuración de DBT. 20. Labana S, Pandey G, Jain RK (2005) Desulfuración de
dibenzotiofeno y aceites diesel por bacterias. Lett Appl Microbiol
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