1.

Menciona 3 de los factores que definan a 3 niveles de regulación de expresión génica a

nivel transcripcional.
 Los factores transcripcionales pueden dividirse en dos grupos funcionales: TFIIA, TFIIB,
TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH y TFIIJ (TF, transcriptional factor, y II, por asociarse a la ARN
polimerasa II)
 El ensamblaje se inicia con la unión del factor transcripcional TFIID a la secuencia TATA en
el promotor (formada por dos proteínas diferentes: TBP (TATA binding protein) y TAF (TBP
associated factor).
 Después se incorporan los factores TFIIA y TFIIB, y sólo entonces la ARN polimerasa II,
formando complejo con TFIIF se une al promotor. TFIIE, TFIIH y TFIIJ se acoplan después a
este complejo. Una vez reunidos todos estos elementos, TFIIE, con su acción de helicasa,
desenrolla el ADN y TFIIH fosforila la ARN polimerasa II en su dominio CTD, lo que produce
su activación.
2. Describe la estructura de un gen de procariotas.
 Organización compacta (poco espacio entre genes)
 Información adicional en plásmidos
 DNA no codificante en pequeños segmentos dispersos en el genoma
 No hay intrones
 Organización en operones
3. ¿Qué es un operón? Describe su estructura.
Un solo promotor puede regular la transcripción de varios genes estructurales (consecutivos)
Formada por un grupo complejo de genes capaces de ejercer una regulación de su propia
expresión por medio de los sustratos con los que interactúan las proteínas codificadas por sus
genes. Este complejo está formado por genes estructurales que codifican para la síntesis de
proteínas (generalmente enzimas), que participan en vías metabólicas cuya expresión
generalmente está regulada por otros 3 factores de control, llamados: factor promotor,
operador, gen regulador
4. Define que es un regulón.
Es un tipo de operón, los genes que regula no necesariamente están en el mismo sitio, pueden
estar ubicados en diferentes sitios del genoma, pero tener el mismo promotor. (Un mismo factor
sigma los reconoce y se da la transcripción de diferentes genes, en diferentes puntos del
genoma)
5. ¿Qué es el promotor de un gen?
Son secuencias de DNA que tienen ciertas características, que los hacen ser reconocidos por
el factor sigma de la RNA polimerasa para que pueda identificar donde están ubicados los
genes que va a transcribir.
6. ¿Qué es un operador de un gen?
Zona de control que permite la activación/desactivación del promotor a modo de "interruptor
génico" por medio de su interacción con un compuesto inductor. Esto lo logra porque tiene
secuencias reconocibles por proteínas reguladoras.
7. Describe las características generales de los promotores de genes procarióticos.
El promotor típico contiene 2 secuencias de ADN importantes, los elementos -10 (caja tata) y
-35. Existen promotores fuertes y débiles. La región -10 es una región rica en timina y adenina
y la región -35 es la que generalmente reconoce al factor σ. También existen genes o grupos
de genes que tienen sitios reguladores adicionales, que son los elementos UP o elementos
Upstream que los hace ser más fuertes, y éstos son los genes que se transcriben más. La
 actividad del promotor es la que determina que tanto se va a transcribir un gen, pero también
depende de las proteínas activadoras o represoras (factores de transcripción).
8. Describe la estructura y función de la RNA polimerasa (transcriptasa) de procariotas.
Está formada por 5 subunidades:
 2 unidades α idénticas: regula la frecuencia de iniciación
 Un factor σ : Interacciona con las secuencias del promotor para determinar el sitio de inicio de
la transcripción
 La subunidad β: Función catalítica
 La subunidad β´ : Función catalítica
Todas las subunidades funcionan en conjunto para llevar a cabo la transcripción
Ésta enzima cataliza la síntesis de todos los tipos de ARN
9. Describe las etapas del proceso de transcripción en procariotas.
Iniciación: Para comenzar la transcripción de un gen, el ARN polimerasa se une al ADN del
gen en una región llamada el promotor. Básicamente, el promotor le dice a la polimerasa donde
ubicarse en el ADN y comenzar a transcribir.
10. Describe los eventos que se dan en la etapa I (iniciación) de la Transcripción en
procariotas.
 El primer nucleótido puede ser cualquier purina (normalmente es A)
 El inicio de la transcripción es una iniciación abortiva, la RNA polimerasa sintetiza un
oligonucleótido entre 2 y 9 bases
 Después de dejar ir a este nucleótido inicia la síntesis de nuevo, este proceso se repite unas
veces, momento en que se dice que la RNA polimerasa está en forma de iniciación.
 La subunidad σ sigue unida todavía al RNA en esta fase, hasta que consiga alcanzar la
siguiente fase. Es en esta fase cuando la RNA polimerasa puede ser inhibida por rifampicina
 La fase se conoce como promotor clearance o despeje del promotor. Esta fase implica una
limitación de velocidad
 Los promotores fuertes tardan menos tiempo. Pasando un cierto tiempo, se consigue superar
esta fase y se entra en la siguiente fase, mucho más estable.
11. ¿Qué es un terminador?
Es una región de ADN que incluye la secuencia que codifica para el sitio de unión de rho en el
ARNm, así como el verdadero punto de alto (que es una secuencia que causa que la
polimerasa se detenga para que rho la pueda alcanzar).
12. ¿Cuáles son las características de los terminadores en procariotas?
Secuencias terminadoras
 Son variables
 Se sitúan en posición 5’ respecto del sitio de terminación
 Dos tipos de terminadores en función de que requieran de proteínas accesorias o no.
Terminadores intrínsecos

 Estructura secundaria en forma de horquilla

 Sucesión de 6 U al final de la horquilla
 Generalmente región rica en G+C en la base del tallo

Terminadores dependientes de Rho

 Además de una secuencia terminadora similar a la habitual, requieren del factor proteico
Rho.
 Rho: proteína de aprox. 46 kDa que actúa como hexámero
 Actividad helicasa dependiente de ATP
 Se une al RNA en secuencias específicas
 Longitud= 50-90 bases
 Posición 5’ al sitio de terminador
 Ricas en C y pobres en G

13. ¿Cuántos tipos de terminadores hay en procariotas? Descríbelos

La terminación de la transcripción se da gracias a secuencias ya transcritas de RNA (regiones
ricas en G y C, las bases se colocan de manera que al transcribirse formen bucles); y existen
2 tipos de terminadores:
Independientes o intrínsecos:

1. Son independientes de la proteina rho

2. Depende solo de la secuencia.
3. Regiones ricas en G y C.
4. Se forman bucles cerca del final del gen (a unos 20 nucleótidos); provocan una
disminución de la polimerasa.
5. Hay una tira de A en la cadena molde (después de la formación de los bucles).
6. La cadena de A provoca que la polimerasa se pueda liberar, ya que es un fragmento
muy débil.
7. La función es señalar la disociación del complejo de elongación ternario (TEC)
Dependientes o (extrínsecos):
1. Dependientes de rho
2. Con regiones para la formación de los bucles
3. Aquí no existe la tira de A al final.
4. Rho es una proteína con función ATPasa la cual se debe unir al RNA (relación 1 a
1).
5. Rho no se podrá unir hasta que se haya sobrepasado el codón de terminación.
6. En E.coli existe un factor que se puede unir a la polimerasa cuando no este σ.
Conocido como NusA podría provocar que la polimerasa se frene al llegar al bucle del
final.

Ambos afectan a la polimerasa una vez que han sido transcritos (funcionan en el ARN
y no en el ADN).

14. Describe el modelo procariótico de regulación transcripcional del operón de lactosa

(operón lac). Su estructura y su regulación.

 El operón lac contiene tres genes:

1. lacZ: codifica para la b-galactosidasa que cataliza la hidrolisis de la lactosa en glucosa
más galactosa.
2. lacY :codifica para la galactósido permeasa que transporta b-galactósidos al interior
de la célula bacteriana.
3. lacA: codifica para la tiogalactósido transacetilasa que cataliza la transferencia del
grupo acetil del acetil Coenzima A al 6-OH de un aceptor tiogalatósido.
 Sin inductor no hay transcripción
  El inductor es la lactosa y cuando la glucosa está ausente.
 Hay dos reguladores "encienden" y "apagan” depende los niveles de lactosa y glucosa
1. Represor lac: sensor de la lactosa, bloquea la transcripción del operón y deja de
actuar como represor cuando hay lactosa (la detecta indirectamente por su isómero
llamado alolactosa).
2. Proteína activadora por catabolito (CAP): es un sensor de la glucosa, activa la
transcripción del operón solamente cuando los niveles de glucosa son bajos (la
detecta indirectamente por su molécula de señal de hambre llamada AMPc).

15. Describe y explica en qué consiste el modelo procariótico transcripcional de regulación

de represión mediada por catabolito.
 Cuando una bacteria crece en una fuente de carbono usa preferentemente glucosa como
fuente de energía. La lactosa es una fuente de energía alternativa que se puede usar en
ausencia de glucosa.
 Cuando la concentración de glucosa baja, se eleva la de AMPc y se estimula la transcripción
con el operón lac.
 Cuando se eleva la concentración de glucosa, cae la de AMPc y deja de activarse la síntesis
del mRNA a partir del operón lac.
En este mecanismo regulador, la elevada concentración de glucosa puede reprimir la expresión de
operones necesarios para el catabolismo de fuentes alternativas de energía.
 Está mediada por la proteína reguladora del catabolito y por AMP cíclico.
16. Describe el modelo procariótico de regulación transcripcional de Sistema de Dos
componentes.
 Tiene un regulador (factor transcripcional, en el citoplasma).
 Y una proteína (sensora de estímulos para la bacteria).
La proteína de membrana externa recibe un estímulo externo que causa un cambio conformacional,
activando la autofosforilación del dominio citoplasmático del receptor y la transferencia del grupo
fosfato al dominio de respuesta de la proteína reguladora, promoviendo su unión a las regiones
operadoras de los genes regulados.
 En un sistema de regulación por fosforilación, se da una cadena de reacciones de fosforilación
que conducen a la activación de la proteína reguladora.

17. Describe el modelo procariótico de regulación transcripcional de Sistema de D

liberación de fosfatos.
18. Explica en qué consiste la regulación de la transcripción de un operón mediada por
atenuación:
La atenuación es un mecanismo para reducir la expresión del operón trp cuando los niveles de
triptófano son altos. Sin embargo, en lugar de bloquear la iniciación de la transcripción, la
atenuación impide la terminación de la transcripción. Al haber grandes concentraciones de
triptófano, la RNA polimerasa cesa la transcripción poco después de haber comenzado en una
región llamada la secuencia líder. En caso de que la concentración de dicho aminoácido sea
baja, la transcripción no termina hasta que todo el operón se haya transcrito. El mecanismo de
atenuación vincula estructuras de RNA secundarias alternativas (lazo u horquilla) al proceso
de terminación de la transcripción. Una vez finalizada esta última, el RNA de la región líder se
pliega en una de dos estructuras secundarias alternativas. Una de ellas es una señal de
terminación de la transcripción que impide que la RNA polimerasa continúe hasta el final del
operón.
 19. Explica en qué consiste el sistema de regulación global mediada por Quorum (Quorum
sensing). Tanto en Gramnegativas como en gran positivas.

Regulación de la expresión génica en respuesta a las fluctuaciones en la densidad de la población

celular. Las bacterias que detectan el quorum producen y liberan moléculas de señal llamadas
autoinductores (AIs) que aumentan su concentración en función de la densidad celular.
 Las bacterias grampositivas y gramnegativas utilizan circuitos de comunicación de detección
de quórum para regular una amplia gama de actividades fisiológicas. Estos procesos incluyen
simbiosis, virulencia, competencia, conjugación, producción de antibióticos, motilidad,
esporulación y formación de biopelículas. En general, las bacterias gramnegativas utilizan
lactonas de homoserina aciladas como autoinductores, y las bacterias grampositivas utilizan
oligopéptidos procesados para comunicarse.
20. Investiga dos Procesos celulares que estén mediados por Quorum.
Quimiotaxis, bioluminiscencia, virulencia, esporulación, conjugación, swarming, auto
agregación
21. Menciona y explica uno de los mecanismos de regulación transcripcional que involucre
la acción de un RNA regulador.
 A nivel transcripcional sobre el ARNm, ocurre al inicio de la transcripción y se realiza una
sustitución del factor s de la ARN-polimerasa y por interacción de proteínas regulatorias sobre
secuencias de ADN cercanas al promotor.
 A su vez estos fenómenos pueden realizarse por mecanismos de control positivo y mecanismo
de control negativo.
 La terminación prematura de la transcripción: fenómenos de atenuación de la transcripción.
22. ¿En qué consiste la regulación transcripcional mediada por pequeños RNAs
reguladores?
 Su estructura básica consiste en dos dominios: un aptámero que se une al ligando y una
plataforma de expresión que cambia su estructura en respuesta a esta unión.
 Los “riboswitches”, localizados en regiones sin traducir 5´ de los RNAs mensajeros se
encargan de regular la expresión de un gen
 Estos RNAs forman estructuras que al interactuar con un ligando (metabolito o algún ión) es
inducido un cambio conformacional en su estructura, lo que ocasiona la activación o inhibición
de la traducción del gen.
 Detectan purinas, y son capaces de detectar adenina, guanina, di-GMP cíclico (di-guanilato
cíclico), son el único grupo de “riboswitches” que pueden afectar positiva y negativamente la
expresión de genes.