Cálculo del Valor Predictivo Positivo

para las Diferentes Pruebas de

Detección de Covid-19 en Ecuador
MAT-2003 Introducción a las Probabilidades

Junio, 2021

Resumen
El presente documento es un análisis de la probabilidad de que un individuo tomado al azar de la
población ecuatoriana esté contagiado con Covid-19 dado que el resultado de su test es positivo. Se
analiza este caso para las diferentes pruebas RT-PCR y la prueba rápida. Se realizan algunas consi-
deraciones con respecto al número de casos activos.

1. Consideraciones
En este análisis se realizan las siguientes consideraciones:
Los casos activos (en un período de tiempo especificado) son aquellos que han
sido reportados como positivos en [1], independientemente de la prueba rea-
lizada para verificarlo.
Una persona que da positivo en un test, no se realiza otro.
El período de tiempo en el que se considera a una persona como caso activo es
entre 14 días y 2 meses.
Sólo se han considerado pruebas que se realicen en Ecuador cuya especificidad
y sensibilidad ha sido verificada.

2. Procedimiento
A lo largo de este análisis se consideran los siguientes eventos:
E: describe el evento en el que una persona está contagiada.

1
 TX : describe el evento en el que una persona da positivo en la prueba X.
TXc : describe el evento en el que una persona da negativo en la prueba X.
Para calcular la probabilidad de que un individuo aleatorio ecuatoriano esté conta-
giado con Covid-19 dado que su test es positivo, se consideran dos factores.
Sensibilidad del test.
Especificidad del test.
Prevalencia de la enfermedad.

2.1. Sensibilidad & Especificidad

Por definición, la sensibilidad es la capacidad de la prueba para detectar la enfermedad
en sujetos enfermos. Es decir, dado el evento E, es la probabilidad de que ocurra TX .
Sensibilidad = P (TX | E) (1)
La especificidad es la capacidad de la prueba para clasificar correctamente a un indi-
viduo sano. Es decir, dado que alguien no posee la enfermedad, la probabilidad de
que no ocurra TX .
Especificidad = P (TXc | E c )
Se presenta un listado de algunas pruebas que se realizan en el Ecuador, con sus
respectivos datos, obtenidos de [4], [2] y [3].

Prueba Sensibilidad Especificidad

RT-PCR Naso-faringe
Isopollo®Covid-19 detection kit 86 % 94.9 %
Otros 73 % 97 %
RT-PCR Esputo
General 89 % 97 %
RT-PCR Oro-faringe
General 60 % 97 %
Pruebas rápidas
Pruebas combinadas IgG/IgM 88.66 % 90.63 %
Cuadro 1: Sensibilidad y especificidad de las diferentes pruebas realizadas en
Ecuador.

2.2. Prevalencia
La prevalencia de la enfermedad a analizar es la proporción de individuos del total
de la población ecuatoriana que son considerados casos activos de Covid-19.

2
En el presente análisis, se consideran dos maneras de medir la prevalencia, las cuales
serán denominadas P (E1 ) y P (E2 ).
P (E1 ) se refiere al porcentaje de la población ecuatoriana con un diagnóstico
confirmado de Covid-19 en los últimos 14 días1 .
P (E2 ) se refiere al porcentaje de la población ecuatoriana con un diagnóstico
confirmado de Covid-19 en los últimos 2 meses.
Según datos de (N. Robalino, 2021) [1] el número de personas con un diagnóstico de
coronavirus confirmado entre el 11 y el 25 de Junio de 2021 es 15 113.
Por tanto:
15113
P (E1 ) = ≈ 0,00087 (2)
17,37 × 106
De manera similar se encontró que el número de personas con un diagnóstico de
coronavirus confirmado entre el 11 y el 25 de Junio de 2021 es 78 872.
78872
P (E2 ) = ≈ 0,00454 (3)
17,37 × 106

2.3. Cálculo de Probabilidades

Para calcular el Valor Predictivo Positivo de cada prueba, se usa la Regla de Bayes y
la Ley de Probabilidad Total:

P (T | E)P (E)
P (E | T ) = . (4)
P (T | E)P (E) + P (T | E c )P (E c )

Donde,
P (T | E c )P (E c ) = [1 − P (T c | E c )](1 − P (E)). (5)

3. Resultados
Se realizaron los cálculos con cada uno de los valores presentados y se obtuvo lo
siguiente:
1
En esta forma se considera caso activo a toda persona diagnosticada con Covid-19 en los últimos
14 días.

3
 Prueba VPP
RT-PCR Naso-faringe
Isopollo®Covid-19 detection kit 1.45 %
Otros 2.07 %
RT-PCR Esputo
General 2.51 %
RT-PCR Oro-faringe
General 1.71 %
Pruebas rápidas
Pruebas combinadas IgG/IgM 0.817 %
Cuadro 2: Valor Predictivo Positivo considerando los casos activos en los últi-
mos 14 días (E1 ).

Prueba VPP
RT-PCR Naso-faringe
Isopollo®Covid-19 detection kit 7.141 %
Otros 9.989 %
RT-PCR Esputo
General 11.918 %
RT-PCR Oro-faringe
General 8.359 %
Pruebas rápidas
Pruebas combinadas IgG/IgM 4.137 %
Cuadro 3: Valor Predictivo Positivo considerando los casos activos en los últi-
mos 2 meses (E2 ).

4. Observaciones & Conclusiones

Pese a que el VPP puede ser contradictorio con la intuición, es una medida efectiva
para enfermedades con mayor prevalencia. En este caso, al tener una prevalencia
menor a 0.1, es muy bajo.

4
Referencias
[1] Andrés N. Robalino. Ecuacovid. https://github.com/andrab/ecuacovid.
2021.
[2] NUS Saw Swee Hock School of Public Health". COVID-19 science report: Diag-
nostics. Inf. téc. Mar. de 2020. doi: 10.25540/e3y2-aqye. url: https://cpb-
ap-se2.wpmucdn.com/blogs.auckland.ac.nz/dist/f/688/files/2020/
03/COVID-19-Testing-Landscape-Appendices.pdf.
[3] SYNLAB". Verificación RT-LAMP COVID-19 Isopollo. Inf. téc. Jul. de 2020.
url: https://www.quito.gob.ec/pruebas/Informe_SynLab.pdf.
[4] Unidad de Epidemiología Clínica y Biblioteca Hospital Universitario Donos-
tia". Diagnóstico de laboratorio del coronavirus. Inf. téc. Mar. de 2020. url: https:
//es.cochrane.org/sites/es.cochrane.org/files/public/uploads/
COVID-19/hudonostia_diagnostico_de_laboratorio_del_coronavirus.
pdf.