Clase 1 – Procariotas

Dominios.
 Eucarya (hongos, plantas, bacterias y unicelulares)
 Bacteria. En forma de cocos y bacilos. Por ser pequeñas, se incrementa el ratio S/V (mas superficie y
menos volumen necesario).
 Archaea. Evidencia de relación evolutiva con eucariotas: similar secuencia entre secuencia de la actina

Celulas procariontes.

 Membrana plasmática. Función: interacción con el ambiente, contiene citoplasma, permeabilidad selectiva.

Bacterias. Tienen bicapa lipídica como eucariotas. Con proteínas integrales insertadas en membrana o periféricas
que están de un lado de la membrana. Lípidos (glicolipidos) que sobresalen y oligosacáridos también. Se regula la
fluidez mediante la presencia de insaturaciones. Con mas enlaces insaturados (C=C), mas fluidez por ser menos
empaquetables. A bajas temperatura: mas insaturado (C=C), cadena corta y ramificados, mas fluido. A altas
temperaturas: mas saturado (C=C), cadena larga, sin ramificar, menos fluido. Algunas cambian los lípidos en la
membrana para protegerse de sistema inmune. Poseen hopanoides en vez de esteorides (colesterol).

Regulacion: AG saturados, largos y sin ramificar (- fluidez)

Archaea. Sus fosfolipidos son algo diferentes: tienen L-glicerol, enlace éter en vez de ester e isoprenoles, cadenas
hidrocarbonadas ramificadas en vez de acidos grasos. Tambien, forman tetra-eters además de di-eters. Los
isoprenoles se unen en los entre si de un lado y del otro formando tetra-eteres, pasando de bicapa a monocapa. A
más tetra-eteres, menor fluidez (mas empaquetado). Compensa el exceso de temperatura y les permite existir en
ambientes mas extremos. Bajas temperaturas: +di-eteres. Altas temperaturas: +tetra-eteres, ciclopentanos (se
incorporan en isoprenoles y se empaquetan más) y ramificaciones isoprenoles (las ramificaciones se unen entre sí y
forman tetra-eteres, se empaquetan más).

Regulacion: tetra-eteres, ciclopentanos, ramificaciones isoprenoles (- fluidez).

 Pared celular. Solo bacterias. Función: determina forma, protege de lisis osmótica y sustancias toxicas,
adhesión, virulencia.

Gram +. Ambas poseen MI. Pared de peptidoglicanos gruesa. Sin ME.

Gram -. Ambas poseen MI. Pared de peptidoglicanos fina ubicada en periplasma. Con ME, que tiene
lipopolisacáridos (LPS: lípido A + polisacárido core y antigeno O) y porinas.

Los peptidoglicanos le brindan elasticidad pero también resistencia, por ser entrecruzada. Tiene porinas para ser
permeables. Acidos teicoicos y lipoteicoicos (llegan hasta MI y se anclan a esta) que producen respuesta inmune y
carga negativa atrayendo cationes.

Peptidoglicano. N-acetil glucosamina + péptido + N-acetilmuramico. Los azucares se van uniendo entre sí. La
transpeptidasa genera un péptido puente por medio de los aa. Los beta lactanos se unen a esta enzima e impide la
formacion de estos puentes y asi de la pared.

También tienen estructuras externas a la ME que le da protección como la capsula o capa S.

 Cápsula o Capa S

Función: protección. La capsula es regular formada por polisacáridos o aa. La capa S formadas por proteínas que se
autoensamblan, regular, unida a ME o a pared gruesa. En arqueas funciona como pared al unirse a la MP.

 Flagelo. Puede haber 1/+. Función: permitir el nado por líquido muy rapido.

En bacterias tiene homología con SEC 3. Estructura: cuerpo basal atraviesa toda la envoltura (conjunto de MP)
formando anillos que se insertan en las MP (en G-), gancho que conecta las dos estructuras y filamento formado
por flagelina que se va polimerizando espontaneamente para formarlo, mientras la FliD va subiendo y ayuda con el
acomodamiento. El flagelo es hueco y tiene una tapa formada por proteína FliD. Tiene ATPasa para transporte de
proteínas que lo forman.

Energía química a mecánica. Tiene rotor móvil (FliN, FliG) y luego una parte estable (MotA y MotB) que
generan movimiento por medio de gradiente electroquímico. Cuando se acumula H+ (por cadena de transporte de
e-) en el periplasma se genera alta concentración de H+ en perisplama respecto al citoplasma y tienden a volver a
citoplasma, generando movimiento. Los H+ vuelven por MotA y MotB (canales de H+) hay cambio
conformacional que produce movimiento del rotor.

En arquea tiene homología con pilus 4. Similar al de bacteria en superficie y movimiento al rotar. Pero es
impulsado por hidrolisis de ATP y crece por polimerización en la base y no en la punta.

Regulación del movimiento.

o Run and Tumble. Avanzan en línea recta durante un tiempo y luego cambian de dirección al azar y
vuelven a avanzar un tiempo en su línea recta ahora, etc. Run avanza en línea recta y flagelo gira en anti
horario. Tumble es cuando cambia de dirección al azar y el flagelo gira en horario.

o Quimiotaxis. Proceso por el que las bacterias se dirigen hacia o en contra a un componente químico
determinado. Censan la presencia de componentes. En presencia de un gradiente el camino aleatorio se ve
sesgado. Son más cortos los movimientos cuando se va en contra del gradiente (de la zona de interés) y más
largos cuando se va a favor. El cambio de dirección (tumble), sigue siendo aleatoria.

La señalización para indicar la rotación del flagelo se da por receptores de membrana en el lado opuesto al flagelo
por cadena de señalización. Hay más cantidad de tumble mientras haya menos componentes de interés en el medio.
La bacteria cambia más de dirección para poder llegar a componentes de interés.
1. Receptor quimiotácticos en MI censa componente. Específicos para 1/+ moléculas.
2. CheA. Autofosforilación = activa cuando no está unido a nada/ no interesa el componente.
Desfosforilación = inactiva cuando interesa el componente.
3. CheY. La fosforilan.
4. FliN. Cambio de rotación del rotor, hace tumble.

Regulación a la sensibilidad de sustrato.

1. CheR es una metiltransferasa que transfiere CH3 y lo hace normalmente.
2. CheA activada fosforila a CheB (metilesterasa que remueve grupos CH3 de aa de receptores).
3. + CH3 en receptor, - sensible al sustrato.

Más interés por esa zona, CheA y CheB inactivada, más CH3 en receptor, - sensible al sustrato. Se fomenta el run.
Necesita de más sustrato en el medio para hacer tumble y cambiar de dirección.

 Pili. Función: twitching motility, adhesión, patogenia, conjugacion.

Tipo 4. Estructura. Atraviesa la envoltura. Transporta proteínas y ADN (conjugación). Se ensambla y desensambla
en la base por PilA que produce la twitching motility (movimiento por superficies).

Mecanismo. Las proteínas de la base son ATPasas (PilC, B y T). Al unirse PilD permite la incorporación de PilA,
monómeros que permiten crecimiento del pili. El desensamblaje dado por PilT desde la base arrastra la bacteria.

 Ribosomas

 Nucleoide.

El cromosoma se condensa de forma ordenada, teniendo el Ori en un polo y el Ter en el opuesto. La posición de
cada gen es definida y determina donde se ubica la proteina. La replicación y segregación de ADN ocurre en
simultaneo.

 Citoplasma.
 Citoesqueleto. Funcion: polaridad (zona apical y basolateral).

La FtsZ es ~tubulina. Tienen homología estructural y funcional. Polimeriza con GTP produciendo túbulos. Se
ubica en forma de anillo en donde la bacteria se divide, reclutando otras proteínas que forman complejo para actuar
en la división celular. Bacterias largas.

La MreB es ~actina. Con ATP, polimeriza y forma túbulos que se curvan. Se ubica en el borde de la célula
formando una hélice y se asocia a proteínas involucradas en la síntesis de pared y elongación de la bacteria.
Bacterias como cocos, sin división.

La crescentina es ~filamentos intermedios. Polimeriza y forma filamentos sin cofactor. Se ubica en el lateral
cóncavo, dándole forma curva. Permite la adhesión cuando hay flujo permitiendo que el pili toque la superficie.
Bacterias rectas.

Para saber si una proteína es esencial, se deleta el gen y se evalúa. Se observa su ubicación. También se puede usar
un inhibidor de la proteína (ventaja: se puede usar cuando uno quiere, en especial cuando es esencial. Desventaja:
difícil conseguir inhibidores tan específicos).

Las bacterias tienen polaridad dada a nivel molecular (citoesqueleto, receptores, de Quimiotaxis, flagelos, pili,
cromosoma).

Sistemas de transporte y secreción. Canales de proteínas para alcanzar ubicación final.

Algunos atraviesan solo MI, otros pared y ME, otros la membrana del hospedador.

Sistema Sec. Genérico. Solo MI. Transporta proteínas desplegadas.

 Translocación post-traduccional. Proteina sintetizada reconocida por SecB (chaperona) que transporta hasta
Sec. SecA hidroliza ATP para que se trasloque al sistema. Cunando llega al periplasma, la peptidasa escinde el
péptido señal. Allí la chaperona ayuda a que se pliegue o se queda en la MP.
 Translocación co-traduccional. La proteina va a Sec mientras se transcribe en el ribosoma por SRP.

Sistema Tat. Transporta proteínas plegadas. Para proteínas unidas a factores (grupos hemo, Mg+, etc) que lo
toman del citoplasma.

Sistema 3. Funcion: patogénesis, simbiosis. Solo G-. Inyecta proteínas (efectores) en citoplasma del hospedador
para manipular sus funciones. Tiene cuerpo basal, aguja y complejo del poro. Deriva del flagelo. ATPasa para
transporte de efectores. La transcripción esta regulada por factores que indican la presencia de la celula
hospedadora. Ensamblaje jerarquico.
1. Adhesion a MP de hospedadora.
2. Sintetis de Sistema III.
3. Ingreso de efectores que favorece polimerización local de actina. Los efectores emulan a los reguladores de
Rac. Los primeros que entran son: GEPs (guanine nucleotide exchange factors) que transforman GDP a
GTP y activan Arp2/3 (ramifica y nucleación de actina).
4. Formacion de ruffles (extensiones de MP) para engullir la bacteria por macro-pinocitosis.
5. Ingreso de bacteria a vacuola da comienzo a secreción de efectores GAPs (proteínas activadoras de
GTPasa) que hidrolizan el GTP a GDP que termina el proceso de macropinocitosis.
6. En vacuola sintetiza sistema que permite pasaje de efectores por esa MP.

Efectores de SST3. Regulan citoesqueleto, rtas inflamatorias, uniones estrechas en barrera epitelial, ciclo celular,
apoptosis.

Sistema 6. Funcion: competir con otras bacterias. Solo G-. Transloca efectores dentro de célula target (otras
bacterias o eucariotas). Se ensambla, eyecta y luego se contrae para desensamblarse. Tiene forma filosa en punta
para que atraviese MP. Para protegerse, producen proteínas de inmunidad. Se les inyecta el sistema pero los
efectores son neutralizados.
Endotoxinas. Ventaja: mas chances de afectarla. Desventaja: mas gasto de energía, se necesita estar cerca, se hace
de a uno. Con las exotoxinas es al revés.

Efectores de SST6. En procariontes: toxinas que hidrolizan péptido glicano, disruptores de MP, nucleasas. En
eucariontes: disrupción de actina, actividad fosfolipasa.

Quorum sensing. Mecanismo por el que se comunican las bacterias con señales químicas para coordinar
actividades grupales. Hay mecanismos que ocurren cuando las bacterias censan que hay mucha población de ellas.
Lo notan porque producen una proteina de forma habitual y a mayor numero de bacterias mayor concentración de
esta proteina. Un umbral de esta proteina permite la expresión de determinados genes, promoviendo algunos
mecanismos. Permite coordinar como si fueran multicelulares.

Swarming motility. Bacterias asociadas a superficie se desplazan coordinadamente. Movimiento por superficies
con flagelo. Las bacterias cambian de dirección cuando se chocan con otras. Las bacterias que tienen varios
flagelos, no solo coordinan sus propios flagelos, sino con las otras. Secretan surfactantes que disminuyen la tension
entre el sustrato y las bacterias, favoreciendo el deslizamiento.

Formacion de biofilms. Funcion: protección y mas acceso a nutrientes. Canales para agua y nutrientes que se
mantienen abiertos por sufractantes que se pegan a las bacterias hidrofóbicas, dando apertura del poro para que
pase lo hidrofílico.
1. Bacterias nadando
2. Adhesión a superficie.
3. Secrecion de compuestos
4. Formacion de matriz
5. Se despegan de biofilm (erosion, naturalmente) y vuelven a 1.

Cianobacterias. Menos gasto de energía. Generan estructuras multicelulares (hacen división celular pero quedan
unidas formando filamentos). Fijan N2 (nitrogenasa se desactiva por O2) y hacen fotosíntesis (genera O2). Como
son varias bacterias unidas, algunas son heterocistos que solo fijan N2 y no hacen fotosíntesis y otras si son
fotosintéticas.