Universidad Autónoma de Nuevo León

Facultad de Ciencias Químicas

Químico Farmacéutico Biólogo
Información Biomédica
Ejercicio 4
MC. Felipe Natarén Rodríguez

Análisis de los portales NCBI, EMBL´s, Uniprot y Farmacogenómica

1. Acceda a la siguiente dirección: https://www.uniprot.org/

- Haga una revisión en la página de inicio para que tenga una idea de la información que
maneja el sitio.
- Ingrese el nombre de una proteína de interés farmacológico (en idioma inglés)
• El sitio arroja un listado de resultados, seleccione el indicado
Subunidad de hemoglobina gamma-2
• Revise la función de la proteína
Las cadenas gamma forman la hemoglobina F fetal, en combinación con las
cadenas alfa.
• Revise nombre y taxonomia para revisar formas de nombrar
Nombres alternativos: Gamma-2-globina / Hb F Ggamma / Cadena de
hemoglobina gamma-2 / Cadena de hemoglobina gamma-G

Taxonomía:

• Observe el apartado de estructura y el de localización sub-celular

• Revise el apartado Post-translational modifications (PTMs) and/or processing

events, indique las modificaciones post-traduccionales de su proteína de interés
“La acetilación de Gly-2 convierte la Hb F en la menor Hb F1”.
 • Revise el apartado de patología

• Haga una revisión de la información brindada y realice un reporte

Una página web bastante útil para la búsqueda de información sobre todo tipo
de proteínas, brinda datos sobre su función, estructura, nombres alternativos,
taxonomía, entre otros.

2. Acceda a la siguiente dirección: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

- Haga una revisión en la página de inicio para que tenga una idea de la información que
maneja el sitio.
- Buscar secuencias de genes de interés para clonación molecular o desarrollo de una
prueba de diagnóstico molecular

- Ingrese el nombre de un gen de interés (en idioma inglés)

• Aparecen los resultados de las diversas bases de datos
• En la lista de genomas, abrir Nucleotide aparecen una lista de resultados abrir el
que indique “mRNA, complete cds” asegúrese de abrir el que indique homo
sapiens
• Revisar la secuencia del gen y de la secuencia codificante que se indica como CDS
dar un click en ese link y automáticamente se marca en marrón la secuencia,
aparece una barra debajo de la página con varias opciones seleccionar FASTA
arroga la secuencia lista para copiar y llevar a otro programa para un análisis
posterior.
• Dar regresar a la página anterior y volver a seleccionar CDS, en la misma barra
debajo de la página otra opción en detalles es la traducción de la secuencia a
aminoácidos, abrir el link para observarlo.

• Reportar Nombre del gen, número de GENBANK, tamaño en pares de bases de la

secuencia CDS del mRNA, número de aminoácidos que conforman la proteína y su
número de GENBANK.
Nombre del gen: Receptor de dopamina D4 (DRD4)
Núm. GENBANK: EU432112.1
Tam. pares de bases CDS: 1260
Núm. Aminoácidos: 419
Núm. GENBANK: ABY87911.1
• Ingresar a https://www.ebi.ac.uk/ena
• Ingrese el mismo nombre del gen que inserto en NCBI, compare la información
presentada.
3. Acceda a la siguiente dirección: https://www.pharmgkb.org/

- Haga una revisión en la página de inicio para que tenga una idea de la información que
maneja el sitio.
- Ingrese el nombre de una molécula pequeña de uso farmacológico

• Revisar el apartado Variant Annotations

• Revisar las variantes polimórficas de genes relacionados con la farmacocinética y
farmacodinámica del fármaco y sus efectos.
• Elabore un reporte con al menos 5 variantes, indicando el gen, el polimorfismo y el efecto
producido.
• Revisar el apartado de Pathways, para observar el comportamiento de su farmacocinética.