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Fundamentos de genética

bacteriana

Luis Alberto Acuña Amador

Fac. Microbiología - UCR


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Agenda

1. Introducción e Historia

2. Genes, genética y genómica

3. Principios de biología molecular

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Antes de empezar...

1. ¿Cuáles son las 4 principales biomoléculas?

2. ¿Cuáles son sus funciones y dónde podemos

encontrarlas?

3. ¿Qué entendemos por "información genética"?

Introducción Genómica Biología Molecular

Primeros descubrimientos...
1869: Miescher aisla del núcleo la "nucleina"

1889: Altman separa 2 componentes de la

nucleina: proteínas y un "ácido nucleico"

1896: Kossel describe las 4 bases nitrogenadas

1928: Levene & Lunn describen la desoxiribosa

del ácido nucleico


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¿Dónde está la información genética?

Experimento de Griffith (1928):


Cepa S Cepa R + Cepa
Cepa Cepa
inactivada S inactivada
"rugosa" R "lisa" S
por calor por calor

"agente
transformante"

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¿Dónde está la información genética?

Avery, MacLeold & McCarthy (1944):


fracción activa es ADN

Chargaff (1950):
2 purinas: Adenina (A) y Guanina (G)
2 pirimidinas: Citosina (C) y Timina (T)

Reglas de Chargaff: (1) Ủpurinas = Ủpirimidinas


(2) A/T = 1 y C/G = 1

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¿Dónde está la información genética?

Hershey & Chase (1952):

Es en el ADN

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Estructura del ADN

Wilkins & Franklin: Watson & Crick (1953):

Doble hélice y enlaces


entre bases

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Información genética en el ADN

Gen: secuencia de ADN que codifica por una

molécula con una función. Es la unidad básica de

la herencia.

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Componentes de los ácidos nucleicos

ADN: Desoxiribosa doble


ARN: Ribosa simple

5’ 3’

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Secuencia de bases en el ADN

5’-TTCAG-3’

TTCAG
Doble hélice
antiparalela unida por
enlaces de hidrógeno
entre sus bases

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El ADN, molécula central en biología

• Sabemos que el ADN mantiene la información

genética y es el medio de transmisión a la

descendencia

• ¿Cómo estudiamos la genética en biología?

Introducción Genómica Biología Molecular

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Genomas y Genómica

• 1920: Winkler propone el término "genoma"

para referirse al conjunto de genes presentes en

los cromosomas y específicos de cada especie.

• Actualmente, "Genoma" se define como el

conjunto del material genético de una

célula
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Genomas bacterianos: organización

Generalmente haploide y constituido de un único

cromosoma circular, compactado en nucleoide

Introducción Genómica Biología Molecular

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Genomas bacterianos: excepciones

Bacterias con cromosomas lineales (e.g. Borrelia,

Streptomyces)

Bacterias con 2-3 cromosomas (e.g. Prevotella,

Rhodobacter, Vibrio, Brucella, Paracoccus)

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Talla de los genomas

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Talla de los genomas bacterianos

160 kpb (Ca. Carsonella ruddii) a 13 Mpb


(Sorangium cellulosum)

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Genoma bacteriano: características

1. ca. 90% del genoma contiene genes

2. Organización génica característica

3. Superposición de genes

4. Empaquetamiento con proteinas NAP

5. Puede haber elementos extracromosomales

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Organización génica

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Operones

1. Agrupamiento de genes que cooperan para una

función dada

2. Expresión coordinada

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Conceptos importantes

1. Haploide/Diploide (Alelos)

2. Monocistrónico/Policistrónico

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Superposición de genes

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Nucleoid-associated proteins (NAP)

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Elementos extracromosomales

Plásmidos:
1. moléculas de ADN de menor tamaño

2. Circulares o lineales

3. Variabilidad numérica

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Otros elementos

Secuencias de inserción y transposones:


1. Elementos móviles

2. Capaces de cambiar de lugar en el genoma

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Evolución y plasticidad en el genoma

1. Sin intervención de ADN foráneo: mutaciones

2. Con intervención de ADN foráneo

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Mutaciones

Cambios en la secuencia de nt del ADN, suelen ser

puntuales (de 1 o pocas bases)

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Ediciones mayores en el genoma

Cambio en bloques, secuencias de mayor tamaño


pueden sufrir el mismo tipo de mutaciones
Deleción
Inversión

Pseudogenisación
Translocación
Adquisición
por LGT

Duplicación

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LGT: transferencia lateral de genes

Corresponde a una transferencia de genes de una


bacteria a otra y la posterior integración del ADN
foráneo en la bacteria receptora

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Transformación

Adquisición de ADN libre en el ambiente

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Transducción

Adquisición de ADN por infección de un fago

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Conjugación

Adquisición de ADN por contacto con otra célula, a


través de una estructura especializada: el pilus

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La genómica

Es el estudio de los genomas de manera integral

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Áreas de estudio de la genómica

1. Estructural

2. Funcional

3. Comparativa

4. Ambiental

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Los conocimientos genómicos…

permiten entender el dinamismo de los genomas


bacterianos… pero…
¿cómo sabemos cuál es la función
de los genes?

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Transmisión de la información

1. Conociendo la estructura, ¿se puede

determinar cómo sirve el código?

2. ¿Cómo fluye la información genética para

generar rasgos característicos en los

organismos?

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El « Dogma Central »

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El « Dogma Central »

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Replicación del ADN

Copia del ADN

¿Cuando es necesario este proceso?

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Modo de replicación del ADN

Experimento de Meselson-Stahl (1958):


semiconservativo

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Proceso de replicación del ADN

Base

H
Base Base

OH H

Cadena crece al agregar nt


al extremo 3’
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Etapa 1: Iniciación 1/3

ADN helicasa separa las cadenas del ADN:

horquilla de
replicación

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Etapa 1: Iniciación 2/3

Proteínas de unión a cadena sencilla evitan que la

cadena se cierre y ADN girasa alivia la tensión:


ADN girasa o
ADN
topoisomerasa
helicasa

proteína de unión a
cadena sencilla (SSB)

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Etapa 1: Iniciación 3/3

Primasa sintetiza un cebador (11-12nt) de ARN:

Primer o ADN
cebador de ARN primasa

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Etapa 2: Elongación

ADN polimerasa añade nt al extremo 3’, las dos

cadenas sirven de molde:

Cadena avanzada

3
2 Cadena retrasada
1

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Síntesis continua y discontinua

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Etapa 3: Terminación

ADN exonucleasa 5’→3’ elimina el primer de ARN y

la ADN ligasa cierra la cadena:

Introducción Genómica Biología Molecular

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Actores principales de la replicación

Introducción Genómica Biología Molecular

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Vista global de la replicación

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Replicación del genoma bacteriano


Cadena avanzada Cadena retrasada
« Leading strand » « Lagging strand »
oriC

ter

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El « Dogma Central »

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Transcripción

Síntesis de ARN usando ADN como molde

¿Cuáles son 3 diferencias con el ADN?

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Etapa 1: Iniciación 1/2

ARN polimerasa se une a un promotor « corriente

arriba » del gen que va a ser transcrito

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Etapa 1: Iniciación 2/2

Se separan las dos cadenas

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Etapa 2: Elongación

ARN polimerasa añade directamente el primer nt

y luego los demás al extremo 3’

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Etapa 2: Elongación

Solo una cadena del ADN es transcrita: cadena

molde; la otra se llama cadena de codificación

Introducción Genómica Biología Molecular

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Etapa 3: Terminación

Dos formas principales de terminación


Estructura brazo-bucle Rho dependiente

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Vista global de la transcripción

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El « Dogma Central »

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Traducción

Síntesis de proteínas: cambio de lenguaje (nt a aa)

Papel central de los 3 tipos principales de ARN

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Tipos de ARN

ARN mensajero (ARNm)

ARN de transferencia (ARNt)

ARN ribosómico (ARNr)

ARN pequeños (sRNA)

Interruptores de ARN (riboswitch)

Ribozimas
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Traducción: los ARN importantes

ARN mensajero (ARNm)

ARN de transferencia (ARNt)

ARN ribosómico (ARNr)

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El ARN ribosómico y el ribosoma

El ARNr compone los ribosomas, fábricas de


proteínas

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El ribosoma

Sitio A: « aminoacyl »

Sitio P: « peptidyl »

Sitio E: « exit »
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El ARN mensajero

El ARNm es el transcrito del ADN que debe ser


interpretado para producir la proteína

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El ARN de transferencia

El ARNt es el « adaptador » que permite interpretar


el ARNm y pasar de una secuencia de nt a aa

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El ARNt y aminoácidos

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67

¿Por qué se llama traducción?

Introducción Genómica Biología Molecular

68
Proteínas: polímeros de aminoácidos

hélice a

aminoácidos
láminas ß

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Los aminoácidos

Introducción Genómica Biología Molecular

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El código genético

El ARNm se lee por tripletes, c/u llamando


« codón ». Existe 43 = 64 codones para 20 aa

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Etapa 1: Iniciación

El ARNm se une a la unidad pequeña del ribosoma


Inicia con el codón AUG → Met (fMet)

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Etapa 2: Elongación

El sitio A se carga con el siguiente ARNt-aa


Se forma el enlace peptídico
Se da la translocación

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Etapa 3: Terminación

Cuando se llega a un condón de parada, un factor


de liberación se une y libera el polipéptido

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Acople de los procesos

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Vista global de la traducción

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Temas vistos en clase

1. ADN como molécula de la información genética

2. Genomas bacterianos: organización/plasticidad

3. Dogma central y las 3 etapas de cada proceso

Introducción Genómica Biología Molecular

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Fundamentos de genética
bacteriana

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