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BIOQUÍMICA DE NITRÓGENO.
MANUAL DE LABORATORIO.
Profesor:
Alumno:
Grupo:
5G
N. DE CONTROL:
19040109
Introducción
Levadura es un nombre genérico que agrupa a una variedad de hongos, incluyendo
tanto especies patógenas para plantas y animales, como especies no solamente
inocuas sino de gran utilidad. De hecho, las levaduras constituyen el grupo de
microorganismos más íntimamente asociado al progreso y bienestar de la
humanidad. Algunas especies de levaduras del género Saccharomyces son
capaces de llevar a cabo el proceso de fermentación, propiedad que se ha
explotado desde hace muchos años en la producción de pan y de bebidas
alcohólicas.
El ADN fue aislado por primera vez en 1869 por Friedrich Miescher. La sustancia
obtenida se encontró únicamente en el núcleo, razón por la que fue originalmente
llamada nucleína y posteriormente este término ya sido modifcado hasta llegar a su
denominación de ácido desoxirribonucleico (ADN).
La levadura es un hongo unicelular que se alimenta de azúcares y compuestos
hidrogenados a través de las enzimas que produce. Estas enzimas fermentan los
azúcares transformándolos en gas carbónico y alcohol. La levadura, como parte del
reino fungi, pertenece al grupo de los descomponedores ascomicetos unicelulares.
Llamada también como fermento, se usa en la cocina, ya que sus enzimas ayudan a
aumentar el tamaño de las masas y fermentar cereales y uvas para la creación de
bebidas alcohólicas como la cerveza.
El ADN mitocondrial también puede considerarse parte del genoma de la levadura.
Este ADN codifica para los componentes de la maquinaria traduccional de la
mitocondria y aproximadamente el 15 % de las proteínas mitocondriales. Existen
mutantes que carecen de ADN mitocondrial, estas se denominan ro y carecen de los
polipéptidos que se sintetizan en los ribosomas mitocondriales. Estas mutantes son
incapaces de llevar a cabo el metabolismo respiratorio, pero son viables y capaces
de fermentar sustratos como la glucosa. Uno de los paradigmas más importantes de
la biología es el que establece que el ADN se transcribe a ARN, el cual se traduce,
generando todas las proteínas que están presentes en los diferentes momentos del
ciclo celular. Son las proteínas las responsables de mantener el funcionamiento de
la célula, y es por ello que el estudio simultáneo de todo el juego de proteínas
presentes en los diferentes momentos de la célula ha resultado de gran interés; la
disciplina que se ocupa de este estudio se denomina proteómica.
Objetivo
Aislar ADN de levadura de panadería.
Metodología
En un vaso precipitado de 250 mL, se agregaron 40g (levadura en pasta), también
se agregaron 30 mL de hidróxido de sodio al 30%. Se agito con una varilla de vidrio
durante 20 minutos hasta formar una suspensión. Luego de transcurrir el tiempo se
adiciono 40 mL de agua destilada y hasta homogenizar. Se añadieron 20 Ml de
cloruro férrico al 10% y se mezcló muy bien. Enseguida se filtró la suspensión con
ayuda de un embudo de filtración rápida implementando una capa de manta de
cielo. Se exprimió la pasta usando guantes de hule, se recogió el filtrado en un vaso
de precipitado de 250Ml.
Se lavó la pasta con 30 ml de agua destilada y un papel filtro, se realizó los mismos
procedimientos dos veces hasta tener un residuo más limpio. El residuo que quedo
en el papel filtro retirarlo y eliminarlo.
A la mezcla se le adicionaron 100 Ml de etanol al 95% agitándolo continuamente
durante la adición. Enseguida se le añadió suficiente ácido clorhídrico concentrado
hasta que se acidificar la solución, se utilizó papel indicador para verificar el pH. Se
consiguió la precipitación del ácido nucleico. Por último, se filtró la suspensión a
través del papel filtro y se lavó el residuo con agua destilada y el filtrado se desechó.
Resultados:
Los resultados obtenidos fueron a partir de la levadura en pasta, lo primero que
hicimos fue colocar la levadura en pasta en un vaso de precipitado, según se nos
indica en la práctica, nosotros colocamos 40 gr de la levadura con 30 ml de
hidróxido de sodio, mezclamos muy bien hasta que la pasta empezó a tomar una
coloración rojiza, estuvimos mezclando por 20 minutos.
Después que colocamos el agua destilada en la mezcla no pudimos observar ningún
cambio en específico hasta que empezamos a agregar el cloruro férrico al 10%, en
este punto fue cuando empezamos a notar cambios ya que la mezcla que en un
inicio era líquida empezó a tomar una densidad mayor, haciéndose mas espesa y a
formar grumos, la práctica nos indica que tenemos que filtrar la mezcla a través de
una gasa o una manta, nosotros lo hicimos mediante una gasa y de esa manera
retiramos los sólidos de los líquidos.
Después de haber exprimido la pasta la volvimos a pasar por el vaso que la
teníamos inicialmente y la lavamos con otros 30 ml de agua destilada.
Conclusión
A través del procedimiento de extracción utilizado fue posible aislar el ADN de
levadura de panificación, cabe resaltar que gracias a los reactivos usados fue
posible de separar y la mayoría de los contaminantes de la muestra, por ejemplo
las proteínas.
Es evidente que es más fácil la obtención del ADN que la del ARN, debido a que la
molécula de ARN es ciertamente menos estable que la molécula de ADN, esto a
causa de su estructura
La muestra final de ADN tuvo que dejarse secar debido a que aún se encontraba
húmeda por los lavados con los distintos disolventes, los cuales podían
evaporarse a temperatura ambiente.
Práctica 2.
Título.
Introducción
Los ácidos nucleicos son compuestos nitrogenados de elevado peso molecular que
se pueden encontrar en las células asociadas a proteínas formando complejos
llamados núcleo-proteína. Estas proteínas tienen carácter básico mientras que los
ácidos nucleicos son ácidos. Se conocen dos grupos de ácidos nucleicos: ARN
(ácido ribonucleico) y el ADN (ácido desoxirribonucleico). La hidrólisis controlada de
ARN y ADN produce nucleótidos. Si la hidrólisis continúa se producen nucleósidos y
finalmente fosfatos, azúcares y bases púricas y pirimidínicas.
El producto básico de extracción de ARN consiste en el tratamiento del
homogeneizado con disolvente orgánico como el fenol, cloroformo o ambos. La
solución concentrada de fenol rompe los enlaces de hidrógeno de las
macromoléculas, causando la desnaturalización de las proteínas.
Para evidenciar la presencia de ácidos nucleicos en extractos celulares vegetales se
requiere células en cantidad suficiente y en medio libre de interferencias que puedan
causar lisis celular o hidrólisis de los ácidos nucleicos por nucleasas. Una completa
extracción de ácidos nucleicos es fundamental para la determinación indirecta.
El método elegido para aislar el ARN varía con arreglo al tipo de tejido y a la especie
particular de ARN que se desea aislar. Probablemente, el método más utilizado en
la preparación de ARN no degradado, con suficiente rendimiento, está basado en el
tratamiento a temperaturas elevadas (63°C) con un detergente para liberar y
desnaturalizar la proteína, junto con un disolvente, como el fenol para la proteína
desnaturalizada. La capa acuosa obtenida después de centrifugar contiene ARN y
polisacáridos. Ambos se precipitaron con etanol, pero el ARN puede extraerse del
precipitado con 2-metoxietanol en tampón fosfato. Tras diálisis, el ARN se vuelve a
precipitar con etanol. Hay varias modificaciones del método del etanol.
Objetivo
Extraer el ARN de levadura de un homogeneizado de células con fenol.
Fundamento:
El ARN de levadura se obtiene extrayendo un homogeneizado de células con fenol.
La solución concentrada de fenol rompe los enlaces de hidrógeno en las
macromoléculas, causando la desnaturalización de la proteína. La suspensión turbia
se centrifuga y aparecen dos fases: la fase inferior de fenol contiene ADN y la parte
superior acuosa contiene carbohidratos y ARN. La proteína desnaturalizada se halla
presente en ambas fases y puede removerse por centrifugación. El ARN se precipitó
luego con etanol. El producto obtenido no contiene ADN pero generalmente está
contaminado con polisacárido. Se puede obtener mayor purificación tratando esta
preparación con amilasa.
RESULTADOS Y OBSERVACIONES
Peso de ARN seco: 0.0315g
(0.0315g)(100%/5g)= 0.63%
(4%)(5g/100%)=0.2g
0.2g-0.0315g= 0.1685g
4%-0.63%= 3.37%
CONCLUSIONES
A través del procedimiento de extracción con fenol fue posible aislar el ARN de
levadura de panificación, cabe resaltar que gracias a los reactivos usados fue
posible separar el ADN y la mayoría de los contaminantes de la muestra, por
ejemplo las proteínas.
Es evidente que la obtención de ARN fue un poco más complicada que la de ADN,
debido a que la primera molécula es ciertamente menos estable que la segunda,
esto a causa de su estructura.
La muestra final de ARN tuvo que dejarse secar debido a que aún se encontraba
húmeda por los lavados con los distintos disolventes, los cuales podían
evaporarse a temperatura ambiente.
El peso de la muestra seca fue de 0.0315g, el cual representa un 0.63% de la
muestra inicial, claramente se obtuvo una cantidad de ARN menor a la esperada.
Esta diferencia de 0.1685g, o bien, 3.37% se atribuye a que durante
los trasvasados pudo perderse cierta cantidad de muestra, además de que es
posible que debido a la inestabilidad de la molécula se evaporara también parte de
la muestra junto con el disolvente
Práctica 3.
Título.
Introducción
Casi todas las células humanas contienen nucleoproteínas en las que los ácidos
nucleicos están unidos a diferentes proteínas. Los ácidos nucleicos, que son los
grupos prostéticos de las nucleoproteínas, están formados de bases púricas y
pirimídicas, una pentosa y ácido fosfórico combinados para dar un polímero.
Objetivo
● Balanza analítica
● Tiras indicadoras de pH
● Gotero
● Mechero Bunsen
● Pinzas para tubo de ensaye
● Pipeta graduada de 1mL
● Pipetas graduadas de 5mL
● Pipeta graduada de 2mL
● Tripie
● Tela de asbesto
● Tubos de ensaye de 15X150
● Vaso de precipitado de 250mL
REACTIVOS:
4. Ácido sulfúrico 3N (H2SO4 3N): Añada 8.3mL de ácido sulfúrico concentrado por
las paredes del recipiente a un volumen de 50mL de agua destilada, mezcle
cuidadosamente a medida que se añade el ácido. Completar con agua hasta un
volumen de 100 mL.
5. Ácido sulfúrico 10N (H2SO4 10N): Repita el procedimiento anterior, pero utilice
27.7mL de ácido sulfúrico concentrado.
MÉTODO:
Práctica 4.
Título.
Introducción
Una hidrólisis ácida remueve todas las bases púricas (hidrólisis de uniones
N-glicosídicas entre pentosa y las bases púricas) sin afectar las uniones
fosfodiéster del esqueleto nucleotídico, por lo tanto obtenemos como producto
ácidos nucleicos sin bases púricas.
FUNDAMENTO:
Método
Práctica 5.
Título.
Introducción
Objetivo
FUNDAMENTO:
MÉTODO
Introducción
La pentosa del ADN y ARN puede evidenciarse por la reacción con orcinol. El ácido
sulfúrico hidroliza las uniones fosfodiéster y N-glucosídicas, liberando ribosa, bases
púricas, pirimidínicas y ácido fosfórico.
El grupo fosfato se identifica por la reacción para fósforo inorgánico, en medio ácido,
con el molibdato da fosfomolibdato, color amarillo, que es reducido luego por el
ácido ascórbico a azul de molibdeno, color azul verdoso. El arsenito/citrato, se
combina con el exceso de molibdato impidiendo su reacción posterior con otros
fosfatos.
Objetivo
FUNDAMENTO:
Esta es una reacción general para las pentosas y se debe a la formación de furfural
cuando se calienta la pentosa con HCL concentrado. El orcinol reacciona con
furfural en presencia de cloruro férrico como catalizador, dando una coloración
verde. Solamente los nucleótidos de purina dan una reacción considerable.
MÉTODO
Discusión de resultados:
Varios factores pueden incidir en la concentración del ARN que se obtiene tras el
proceso de extracción y purificación. Entre ellos: la cantidad de células, el volumen
de muestra que se extrae y la conservación óptima de la muestra.
CONCLUSIONES:
No es nuestro objetivo discutir todos los factores que pueden afectar el rendimiento
y la preservación del ARN. Comentamos algunos de ellos para ilustrar la manera en
que la concentración final del material puede estar afectada y destacar la
importancia de realizar su medición.
REFERENCIAS
● González, T. Martínez, G. Ocampo, M.. (2010). El ARN en las Levaduras. 15
de Mayo del 2017, de Facultad de Ciencias Naturales y Exactas,
Cali, Colombia. Sitio web:
http://documents.mx/documents/to-del-arn-de-levadura.html
● Walker K.. (2016).¿Qué es el ADN?. 15 de Mayo del 2017, de
BioTech Sitio web: http://www.gpc-biotech.com/que-es-arn/
● Tejero, F.. (2015). La levadura en la Panadería. 15 de Mayo del 2017, de
Asersoría técnica en panificación, Madrid Sitio web:
http://www.franciscotejero.com/tecnicas/la-levadura-en-la-panaderia/
● Facultad de Ciencias Naturales. (2010). Extracción, caracterización y
reconocimiento de ARN. 15 de Mayo del 2017, de UNP Sitio web:
http://www.fcn.unp.edu.ar/sitio/quimicabiologica1/wp-content/uploads/2010/08
/TP-Extracci%C3%B3n-y-caracterizaci%C3%B3n-de-DNA-y-RNA.pdf
● Anónimo. (2010). Organización del ADN. 15 de Mayo del 2017, de Portal
Educativo Sitio web:
https://www.portaleducativo.net/segundo-medio/10/organizacion-de-adn
● Anónimo. (2011). Metabolismo de nucleótidos, purinas y pirimidinas. 15 de
Mayo del 2017, de Facultad de Ciencias, Enzimología Sitio web:
http://enzimologia.fcien.edu.uy/BQII%202011/Metabolismo%20de%20Purinas
%20y%20Pirimidinas%20(14-09-11).pdf