Metabolismo de

compuestos
nitrogenados – Parte 2:
Metabolismo de
nucleótidos
Sesión 25
Semana 13
Sergio Barahona Padilla, MSc.
Logro de sesión:
Al término de la sesión, el estudiante reconoce la importancia del metabolismo de ácidos
nucleicos y nucleótidos para el funcionamiento de la vida.
DESARROLLO DEL TEMA
Contenido

Nucleótidos

Degradación de los nucleótidos

Metabolismo de nucleótidos

Rutas de salvamento

Rutas de novo

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Nucleótidos
Introducción
Nucleótidos
• Los nucleótidos son compuestos formados por un grupo fosfato, un azúcar pentosa y una
base nitrogenada.
• La azúcar pentosa puede ser desoxirribosa o ribosa, por lo que hay dos tipos de
nucleótidos: desoxirribonucleótidos y ribonucleótidos
• Las bases nitrogenadas pueden ser púricas o pirimidínicas, por lo que hay dos tipos
de nucleótidos: nucleótidos púricos y nucleótidos pirimidínicos.
• Los nucleótidos son los monómeros de los ácidos nucleicos (ADN y ARN), biopolímeros
que se encargan de almacenar, transmitir y expresar información genética.
• Pero los nucleótidos también desempeñan otros papeles vitales para las células tales
como: ser segundos mensajeros celulares (AMPc), transportadores de energía (ATP,
GTP), transportadores de ácidos grasos (coenzima A) y coenzimas (NAD, FAD).

7
Un nucleótido es un nucleósido fosfatado en la
posición 5’ (nucleósido-5’-monofosfato)

NH2
Enlace
fosfoéster

5’ Base
CH2 nitrogenada

Enlace β-N-
glucosídico
Grupo
fosfato
Pentosa
8
Bases nitrogenadas

BASES
PÚRICAS:
derivadas de
la purina

Purina Adenina Guanina

BASES
PIRIMIDINICAS:
derivadas de la
pirimidina

Pirimidina Citosina Uracilo Timina

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Nomenclatura de nucleósidos y
nucleótidos
Base nitrogenada Nucleósido Nucleótido Ácido nucleico
P

Purinas Adenosina Adenilato (AMP) ARN

Adenina (A)
Desoxiadenosina Desoxiadenilato (dAMP) ADN
A Guanosina Guanilato (GMP) ARN
Guanina (G)
Desoxiguanosina Desoxiguanilato (dGMP) ADN

Pirimidinas Citidina Citidilato (CMP) ARN

Citosina (C)
Desoxicitidina Desoxicitidilato (dCMP) ADN
-- -- --
Timina (T)
Desoxitimidina Desoxitimidilato (dTMP) ADN
Uridina Uridilato ó Uridinilato (UMP) ARN
Uracilo (U)
-- -- --
10
Ejemplo: nucleósidos y nucleótidos
de adenina
NH2 NH2

5’ Adenina 5’ Adenina
CH2 CH2

Grupo Grupo
fosfato fosfato
H
Ribosa Desoxirribosa

Adenosina Desoxiadenosina
Adenosin-5’-monofosfato (AMP) ó adenilato Desoxiadenosin-5’-monofosfato (dAMP) ó desoxiadenilato
11
El AMP es usado para formar el ATP
Adenina

Enlace fosfoanhidro

Enlace fosfoéster
Ribosa
Ribosa Adenina

AMP
ADP

ATP

12
Los desoxinucleósidos trifosfatados (dNTPs) son los
desoxinucleótidos usados por la ADN polimerasa
La energía
del enlace
fosfoanhidro
del dNTP se
utiliza para
formar un
nuevo enlace
fosfodiéster
liberándose
pirofosfato
(PPi).

Gif
Los dTNPs
dNTPs son cuatro:
dATP, dGTP,
dTTP y dCTP.

Desoxiadenosina trifosfato Desoxiaguanosina trifosfato Desoxitimidina trifosfato Desoxicitidina trifosfato

(dATP) (dGTP) (dTTP) (dCTP) 13
Varios nucleótidos forman parte de
importantes coenzimas

Nicotinamida
(Vit B3)
Riboflavina
(Vit B2)
β-Mercaptoetilamina Ácido pantoténico
(Vit B5)

Coenzima A 3-fosfoadenosina difosfato

Coenzima A
(coA)

Nicotinamida Adenina Dinucleótido Flavín Adenín Dinucleótido

(NAD+) (FAD)

14
El inosin monofosfato o inosinato (IMP) es un
nucleótido intermediario en el metabolismo de
nucleótidos

Ribosa hipoxantina

Inosina
Inosin monofosfato (IMP) o inosinato 15
 Metabolismo
de nucleótidos
Introducción
El concepto de “pool de nucleótidos”
• Los nucleótidos son incapaces de atravesar las membranas celulares, pero los
nucleósidos y las bases nitrogenadas sí pueden hacerlo. Entonces, como no existen
nucleótidos fuera de la célula, el pool de nucleótidos es, en esencia, intracelular.
• La cantidad y concentración de los diferentes nucleótidos es constante y esto es el reflejo
de los proceso que aportan nucleótidos al pool y los sustraen de él.
• Los procesos que aportan nucleótidos al pool son:
• La absorción intestinal
• El catabolismo de polinucleótidos (ADN y ARN)
• La síntesis de nucleótidos
• Los procesos que sustraen nucleótidos del pool son:
• La síntesis de polinucleótidos (replicación de ADN y transcripción)
• La formación de compuestos que contienen nucleótidos
• El catabolismo de nucleótidos

17
El concepto de “pool de nucleótidos”

18
Metabolismo de las bases
nitrogenadas
Nucleótidos de la dieta

Digestión

Absorción Biosíntesis
intestinal de novo

Degradación de Endonucleasas y
nucleótidos y
ácidos nucleicos exonucleasas
PURINAS Y PURINAS Y
PIRIMIDINAS PIRIMIDINAS
EXÓGENAS ENDÓGENAS
Síntesis de
nucleótidos y
ácidos nucleicos

Catabolismo Reciclaje o
recuperación

Excreción

Ácido úrico
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 Degradación
de nucleótidos
Digestión y absorción de nucleótidos
• La mayoría de los ácidos nucleicos (ADN y ARN) de los alimentos se
degradan en el duodeno dando nucleótidos por acción de las nucleasas
pancreáticas y fosfodiesterasas intestinales.
• Luego, por acción de nucleosidasas y fosforilasas, los nucleótidos se
degradan a bases nitrogenadas (purinas y pirimidinas) y ribosas.
• Gran parte de las purinas es metabolizado por la flora intestinal. El resto
es absorbida y pasa a la circulación portal.
• Una de estas bases nitrogenadas ingeridas, muy pocas serán
incorporadas a los nucleótidos pues mayoría será degradada a ácido
úrico y excretada a la orina.
• NOTA: El organismo puede prescindir totalmente del aporte exógeno de
nucleótidos, pues todas las bases nitrogenadas son producidas por la
propia célula con eficacia. Las bases nitrogenadas son normalmente
sintetizadas de novo.

21
Digestión y absorción de nucleótidos

22
Degradación metabólica de
nucleótidos
• En la célula, las endonucleasas y exonucleasas generan nucleótidos.
• Luego los nucleótidos de purina (AMP y GMP) sufren una eliminación secuencial que
produce ácido úrico como producto final.
• La AMP por ejemplo presenta dos vías distintas de degradación dependiendo del tejido:
• En los tejidos, la nucleotidasa libera adenosina la cual sufre desaminación y se transforma en
inosina. En el tejido muscular, primera se desamina pasando a inosina monofosfato (IMP) y
luego una desfosforilación para obtener inosina.
• En ambos casos, la inosina perderá la ribosa pasando a hipoxantina que pasará a xantina y
luego a ácido úrico.
• La GMP se desfosforila pasando a guanosina, ésta pierde la ribosa dando guanina y
luego se desamina originando xantina. La xantina dará ácido úrico.
• En muchos animales, el ácido úrico es el compuesto final de la degradación de purinas
(e.g. hombre y primates). En otros animales, el ácido úrico pasa a alantoína, luego a
alantoico y finalmente urea o amoniaco.

23
Degradación de nucleótidos de
purina (AMP y GMP)

24
Degradación de
nucleótidos de purina
(AMP y GMP)

25
Síntesis de
nucleótidos
Síntesis de nucleótidos de purina
• Para la biosíntesis de nucleótidos de purina (AMP y GMP) existen dos vías:
• Biosíntesis de novo: las bases nitrogenadas A, T, C,G y U no son intermediarios y
no se les une la ribosa como podría esperarse. El anillo de purina se construye
añadiendo uno a uno los átomos a partir de aminoácidos (aspartato, glicina y
glutamina), el CO2 y el formiato a la ribosa. Costo energético alto
• Las rutas de salvamento (rutas de rescate, reciclaje o recuperación): se reciclan las
bases libres y nucleósidos. Costo energético bajo.
• Ambas vías utilizan un precursor común: el fosforribosil pirofosfato (PRPP), el cual
es una “ribosa activada” formada de la reacción de una ribosa-5-fosfato y ATP por
acción de la PRPP sintetasa.
• Al ser ribosa el azúcar del PRPP, los productos finales de esta vía son ribonucleótidos de
purina (AMP y GMP). Es recién al final cuando se formarán los desoxirribonucleótidos por
otra enzima.

27
Biosíntesis
de novo
Nucleótidos de purina
Biosíntesis de novo
• Para la síntesis de novo, es decir, de nuevos nucleótidos de purina (AMP y GMP),
existen dos etapas:
1. A partir del PRPP, formar el IMP:
• En presencia de la ribosa-5-fosfato, se forma el PRPP y luego intervienen los aminoácidos glicina,
glutamina y aspartato, el CO2 y el formato para construir la base nitrogenada, dando origen al
nucleótido IMP (inosinato)
2. A partir del IMP, obtener AMP y GMP:
• Al sintetizarse el IMP, la ruta se bifurca para acabar en los dos nucleótidos de purina AMP y GMP. A
partir de estos ya se puede sintetizar los desoxirribonucleótidos dAMP, dGMP por acción de la
ribonucleótido reductasa (rNDP reductasa).
• La síntesis de nucleótidos de purina, a diferencia de loa síntesis de nucleótidos de
pirimidina, consiste en la construcción de cero de la base nitrogenada sobre el ribosil-5-
fosfato ya unido. En la síntesis de nucleótidos de pirimidina, la base nitrogenada se forma
primero y luego se une el azúcar ribosa.

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Fosforribosilpirofosfato (PRPP)

PRPP
sintetasa

Ribosa-5-fosfato 5-fosforribosil-1-
pirofosfato
(PRPP)

30
Formación del IMP a
partir del PRPP
• Una vez formado el PRPP, será necesario
construir la base nitrogenada “hipoxantina”
para formar el nucleótido de purina
progenitor, el IMP (monofosfato de
inosina).
• Esta vía consta de nueve reacciones
donde se van incorporando los átomos de
carbono y nitrógeno para formar el anillo
purina.
• Se requiere ATP como fuente de energía.

31
Resumen de la síntesis de nucleótidos de purina:
formación de AMP y GMP a partir de IMP

PRPP IMP
PRPP
sintetasa

La síntesis de AMP utiliza

GTP, mientras que la síntesis
de GMP utiliza ATP.

Biosíntesis de
desoxirribonucleótidos

32
Síntesis de nucleótidos de pirimidina
• En la síntesis de los nucleótidos de pirimidina primero se forma la base nitrogenada (el
ácido orótico) y después se le une el ribosil-fosfato (al revés que la síntesis de
nucleótidos de purina). Esto originará el nucleótido llamado OMP (orotidina-
5’monofosfato u orotidilato), el cual por descarboxilación se forma el primer nucleótido
de pirimidina, el uridin-5’-monofosfato (UMP).
• A partir del UMP, se obtienen el citosin-5’-monofosfato (CMP) y el dCMP y dTMP.

33
Formación de los demás nucleótidos de
pirimidina a partir del UMP

34
Procedencia de los carbonos y nitrógenos de las
bases nitrogenadas púricas y pirimidínicas
Las bases nitrogenadas púricas
son adenina (A) y guanina (G).
Glicina Las purinas se forman en una
secuencia de 11 reacciones
enzimáticas para formar el ácido
inosínico (IMP), del cual se
obtienen luego el AMP y el GMP.
El anillo de purina se comienza a
construir sobre el P-ribosil-PP.

Purinas

Las bases nitrogenadas

pirimidínicas son timina (T),
citosina (C) y uracilo (U).

Pirimidinas
35
 Rutas de
salvamento
Rutas de salvamento
• A una parte de las bases nitrogenadas púricas generadas por la degradación metabólica
y que tenían como destino ser degradas, se les añade un grupo fosfato para generar
nucleósidos trifosfato para la síntesis de ácidos nucleicos.
• A partir de ribosa-5’-fosfato se formará el fosforribosilpirofosfato (PRPP).
• Luego actúa por ejemplo la hipoxantina fosforribosiltransferasa que transfiere la
hipoxantina o la guanina a la fosforribosa originando la inosina monofosfato (IMP) o
guanosina monofosfato (GMP)

37
38
Síntesis de nucleótidos de purinas
vs nucleótidos de pirimidinas

39
APLIQUEMOS LO
APRENDIDO
SECCIÓN DE REFERENCIA

APLIQUEMOS LO APRENDIDO
MUCHAS GRACIAS