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METABOLISMO DE LOS NUCLEÓTIDOS

CONCEPTO: Los ribonucleósidos y desoxirribonucleósidos son esenciales
para todas las células:

1. Crean ARN y ADN

2. Crean intermediarios metabólicos (UDP-glucosa y CDP-colina)
3. Son componentes de coenzimas (FAD y NAD)
4. Son reguladores de muchas vías metabólicas

ESTRUCTURA DE LOS NUCLEÓTIDOS

Formados por una base nitrogenada, azúcar pentosa y uno, dos o trs
grupos fosfato.

Estructura de las purinas y pirimidinas:

1. Las bases púricas son la adenina (A) y la guanina (G).

2. ADN y ARN contienen citosina (C)
3. El ADN contiene Timina (T)
4. El ARN contiene Uracilo (U)

NOTA: realmente la única diferencia entre la timina y el uracilo es que la

timina tiene un grupo metilo en el carbono 5. Químicamente es (5-
metiluracilo).

Contienen dos tipos de azúcar:

1. Ribosa para el ARN

2. Desoxirribosa para el ADN

Ambos se unen a la base nitrogenada por enlace N-glucosídico entre el

carbono 1 de la pentosa y el 9 de las bases purínicas o 1 de las
pirimidínicas.

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El grupo fosfato se une por enlace éster al carbono 5 de la pentosa.

En caso de no tener grupo fosfato se le llama nucleósido. Por lo tanto, los

nucleótidos químicamente son 5´-trifosfatos de los nucleósidos.

PURINAS Y PIRIMIDINAS:

Realmente las purinas son una pirimidina unida a un anillo imidazol.

Las pirimidinas son: Uracilo, timina y citosina.

Las purinas son: Adenina y guanina

Los grupos importantes que intervienen en la formación de enlaces de

hidrógeno son los grupos amino de la A, G y C

Las bases purínicas y pirimidínicas libres son relativamente insolubles en

agua. Son compuestos básicos débiles que con un cambio de pH pueden
crear 2 o más tautómeros (como la lactama y la lactima, tautómeros del
uracilo).

Existen bases raras o bases menores. Son importantes en distintas rutas

metabólicas, y abundan hasta en un 10% en el ARN de transferencia.

NUCLEÓSIDOS:

Existen dos tipos de nucleósidos: ribonucleoósidos y

desoxirribonucleósidos. Se encuentran libres en cantidades muy
pequeñas en la célula.

Son mucho más solubles que los nucleótidos

NUCLEÓTIDOS

Los nucleótidos tienen una conformación N – O – PO3-2 , en donde su

enlace fosfato es muy fuerte a pH fisiológico.

Pueden aparecer como nucleósido – 5 – monofostato, aunque también

pueden ser 5 – difosfato (NDPs), 5 – trifosfato (NTPs), es decir, como ésteres
de 5 – pirofosfóricos y 5 – trifosfóricos de los nucleósidos.

Ejemplo:

1. AMP : 5´-monofosfato de adenosina

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2. ADP: 5´-difosfato de adenosina

3. ATP: 5´-trifosfato de adenosina

En el caso de los NDPs y NTPs pueden formar complejos con el Mg+2 y el

Ca+2. Debido a la alta cantidad de Mg+2 los NDPs y NTPs se unen con
magnesio en el ambiente intracelular.

Es último fosfato de los NDPs y NTPs se puede hridolizar por enzimas, el

resto puede liberarse selectivamente para formar fósforo inorgánico.

El ATP es el más importante de los NTP y, al hidrolizarse a ADP, este se

refosforila a ATP en la respiración. Existen otros NTP que regulan la
energía de vías biosintéticas específicas como UTP, GTP y CTP.

También pueden funcionar como coenzimas transportadoras de energía:

UDP puede ser transportador específico de los restos de azúcar en la

síntesis de polisacáridos (uridin-difosfato-glucosa)

CDP funciona en modo de citidin.difosfato.colina, un dador de

fosfocolina en la biosíntesis de los fosfoglicéridos de colina.

También pueden fungir como precursores de elevado contenido energético

en la biosíntesis enzimática de ADN y ARN. Como los NTPs y los dNTPs.

Hay nucleótidos que tienen sus grupos fosfato en otras posiciones.

2´-3´-fosfatos-cíclicos de ribonucleósidos que fungen como

intermediarios y los 3´-fosfato de ribonucleósidos son productos finales de
la hidrólisis de ciertos enlaces del ARN por la acción de algunas
ribonucleasas.

3´5´-fosfato cíclico de adenosina (AMPc) y el 3´5´-fosfato cíclico de

guanosina (GMPc) funcionan en la acción de cierto número de hormonas.

El AMPc surge de la hidrólisis de ATP por la adenilatociclasa, se le llama

segundo mensajero porque transmite y amplifica la señal en el interior de
la célula de los primeros mensajeros (hormonas).

ÁCIDOS NUCLEICOS

ADN y ARN. Ambos mantienen unidos sus nucleótidos por enlaces

fosfodiéster, establecidos entre el 5´-hidroxilo de un nucleótido y el 3´-
hidroxilo del siguiente.

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PENTOSA – FOSFATO – PENTOSA = estructura covalente

ARN: Los 3 tipos de ARN son ribosomal, mensajero y transferencia

El ARN ribosomal aparece en 3 tipos diferentes en la mayoría de las

especies biológicas

El ARN transferencia presenta hasta 60 formas diferentes

El ARN mensajero tiene centenares o incluso millares de formas diferentes.

11% de ARN se encuentra en el núcleo, 15% en las mitocondrias, 50% en

los ribosomas, y un 24% en el citosol.

ARN MENSAJERO: Se sintetiza en el núcleo durante el proceso de

transcripción, también puede sintetizarse en la mitocondria. Después,
pasa al citoplasma para iniciar la síntesis de proteínas. En eucariotas
pueden tener cerca de 200 restos sucesivos de adenilato en el extremo 3´,
la cual según parece desempeñar algún papel en el tratamiento o
transporte de ARNm del núcleo a los ribosomas.

ARN DE TRANSFERENCIA: Son transportadoras de aminoácidos

durante la síntesis de proteínas. PM: 23,000 y 28,000. Contienen cerca de
75 a 90 unidades nucleótidas.

En un extremo terminal tienen ácido gianílico y en otro tienen

citidílico-citidílico-adenílico (C-C-A), que es el que se une a los a.a.

ARN RIBOSÓMICO: Constituye hasta el 65% de los ribosomas.

Existen 4 tipos de ARNr: 5S, 7S, 18S y 28S.

Hidrólisis de ácidos nucleicos por ácidos y por bases:

La hidrólisis de ADN con ácido a pH=3 separa las purinas, sin que
resulten dañados los enlaces de pirimidinas ni los enlaces fosfodiéster.
Resulta un ácido apurínico. La eliminación selectiva de las bases de
pirimidina, produce un ácido apirimidínico.

El ADN no se disuelve por álcalis, pero el ARN sí. El primer producto

de su hidrólisis es el AMPc.

Hidrólisis enzimática de los ácidos nucleicos

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Los ácidos nucleicos ingeridos se hidrolizan en el intestino delgado por

acción de las nucleasas secretadas por el páncreas. Los puentes de
fosfodiéster son metabolizados por dos clases de enzimas a y b (3´y 5´).

El veneno de serpiente tiene fosfodiesterasa, que hidroliza los enlaces 3´en

el ARN o en el ADN, liberando casi todos los nucleótidos en forma de 5´-
fosfato de nucleósido.

Cualquier enzima que ataca desde los extremos de la cadena de

nucleótidos se les llama exonucleasas.

La endonucleasas pueden atacar cualquier enlace 3´o 5´en cualquier

parte de la cadena de nucleótidos.

BIOSÍNTESIS DE LOS NUCLEÓTIDOS

En las purinas, los átomos de nitrógeno 3 y 9 proceden del grupo amida de

la glutamina, el N1 del aspartato, el N7 de la glicina. Los átomos de
carbono 4 y 5 también son de la glicina. Los carbonos 2 y 8 son del
formiato y el carbono 6 del CO2.

El primer material de partida es la azúcar pentosa de forma activada de la

ribosa – 5 – fosfato, sobre la que se va formando, paso a paso, el anillo
purínico.

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La ruta biosintética para formar ácidos adenílico y guanílico comienza por

la activación de robosa-5-fosfato por pirofosforilación enzimática a
expensas del ATP, para formar 5-fosfo-ribosa-1-pirofosfato (PRPP).

Para la regulación de la biosíntesis nucleotídica es significativo, el hecho

de que la formación del PRPP esté catalizada por una enzima alostérica
que es inhibida tanto por ADP como GDP.

Ribosa-5-fosfato + ATP → 5-fosfo-ribosa-1-pirofosfato + AMP

En la etapa siguiente, el PRPP reacciona con glutamina, de suerte que el

grupo amino de la amida de la glutamina desplaza por sustitución doble al
grupo pirofosfato del carbono 1. El átomo de Nitrógeno en el carbono 1 va
a corresponder al de la posición 9 en el producto final. (FASE
REGULADORA)

5-fosfo-ribosa-1-pirofosfato + glutamina + H2O → 5- fosfo-ribosilamina

La enzima de esta etapa es una transferasa que contiene hierro. Dicha

reacción constituye el segundo punto de control de biosíntesis purínica y
es inhibido por los nucleótidos purínicos. También puede ser inhibido por
el antibiótico azaserina.

En la tercera etapa, el grupo carboxilo de glicina reacciona con el grupo

amino de 5-fosfo-ribosilamina formando un enlace amida (peptídico). Esta
reacción necesita ATP y su producto es 5-fosfo-ribosil-1-glicinamida

5-fosfo.ribosilamina + Glicina + ATP → 5-fosfo.ribosil-1-glicinamida + ADP +

Pi

En este momento en núcleo purínico se está construyendo alrededor de la

porción de glicinamida, que ya posee los átomos 4, 5, 7 y 9. Los átomos
faltantes se van agregando uno a uno.

Se agrega el grupo formilo, formando el que será el carbono 8 del anilo de

purina. Dicho formilo es donado por el portador de grupos formino N5,N10-
metenil-tetrahidrofolato. La fuente biológica original de este átomo es del
átomo beta de la serina.

5´-fosforribosil-glicinamida + N5,N10- metenil-FH4 → 5-fosforribosil-N-formil-

glicinamida + FH4

La siguiente etapa es agregar el Nitrógeno en la posición tres, que proviene

del grupo amida de la glutamina.

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5-fosforribosil-N-formil-glicinamida + glutamina + ATP + H2O →

5-fosforribosil-N-formil-glicinamida + ADP + Pi

La azaserina también puede bloquear este paso.

En este momento ya se posee los 5 átomos del anillo imidazólico, por lo

que se procede a cerrarse eliminando una molécula de agua, proceso que
también necesita ATP.

5-fosforribosil-N-formil-glicinamida + ATP → 5-fosforribosil-5-aminoimidazol

+ ADP + H2O

El átomo del carbono 6 procede del CO2, por lo tanto se introduce en una
reacción de carboxilación.

5-fosforribosil-5-aminoimidazol + CO2 → Ácido 5-fosforribosil-5-

aminoimidazol 4- carboxílico

En este momento solo falta introducir un átomo de nitrógeno y uno de

carbono. El primero en introducirse es el nitrógeno en la posición 1 que
viene del aspartato:

Ácido 5-fosforribosil-5-aminoimidazol 4- carboxílico → 5-fosforribosil-4-

succinocarboxinado-5- aminoimidazol

Después se le eliminará fumarato. El carbono que falta en la posición 2 se

introduce por un donador de formilo al grupo 5-amino formando

5-fosforribosil-4-carbozamida-5-formamidoimidazol.

En este momento la porción purimidínica del núcleo purínico se cierra y,

eliminando agua, se forma el ribonucleótido ácido inosínico (IMP)

El cierre del anillo imidazólico requiere ATP pero el del anillo purimidínico
no.

Las sulfonamidas impiden la formación de ácido fólico y así impiden la

formilación.

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RUTAS DESDE EL ÁCIDO INOSÍNICO A LOS ÁCIDOS ADENÍLICO Y

GUANÍLICO

El IMP es el precursor del AMP y GMP.

Para convertir IMP a AMP se necesita solo la sustitución del grupo

hidroxilo en la posición 6 por un grupo amino. Sin embargo, el IMP debe
reaccionar primero con el ácido aspártico para rendir ácido
adenilosuccinico y que escinde un enlace fosfato de GTP a GDP.

IMP + Aspartato + GTP → ácido adenilosuccínico + GDP + Pi

Después, se eliminará el fumarato y se produce el adenilato ´pr acco+pm

de la adenilato-siccinato-liasa (misma enzima que se utilizó en la última
reacción de la síntesis del ácido inosínico).

Ácido adenilossínico → adenilato + fumarato

Para formar GMP a partir de IMP el ácido es primero deshidrogenado a

ácido xantílico, un nucleótido a base de xantina en una reacción ligada a
NAD.

IMP + NAD + H2O → Ácido xantílico + NADH

Después, el ácido xantílico es aminado para formar guanilato. El donador

es glutamina y requeire ATP

Ácido xantílico + H2O + ATP + glutamina → Guanilato +AMP + PPi + glutamat

Para formar desde ribosa-5-fosfato hasta GMP se requieren 8 grupos

fosfato de alta energía

La conversión de AMP a ATP y de GMP a GTP se lleva a cabo por

transferencias de grupos fosfato gracias a la nucleósido-monofosfato-
cinasa y nucleósido-difosfato-cinasa.

REGULACIÓN DE LA BIOSÍNTESIS DE LOS NUCLEÓTIDOS PURÍNICOS

Existen dos rutas de regulación:

La primera implica la regulación del camino conducente al ácido

inosínico, lo que proporciona una regulación de biosíntesis de purinas

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La segunda es una regulación de las rutas ramificadas que van

desde el ácido inosínico a los adenilato y guanilato, y sirve para controlar
la abundancia relativa de AMP y GMP.

La primera etapa es regulada por la segunda reacción. La

aminotransferasa que cataliza la reacción (aminofosforribosil transferasa)
es inhibida por ATP, ADP o AMP, por el GTP, GDP o GMP. Se inhibe por
acumulación.

La regulación de las sendas ramificadas que van al AMP y GMP son

dos.

La primera. Cuando se produce GMP se requiere ATP como

reactivo, mientras que para formar AMP se requiere GTP. Por tanto, un
exceso de ATP acelera la producción de GMP, de modo semejante todo
exceso de GTP incrementa la síntesis de AMP.

El segundo se provoca por retroinhibiciones. Las primera

reacción tanto para formar GMP como AMP. El AMP y acelera la
producción del GMP en la primera reacción y visceversa. Pero el propio
excedente de AMP o GMP retrasa su propia síntesis.

BIOSÍNTESIS DE LOS NUCLEÓTIDOS PIRIMIDÍNICOS

Difiere a la ruta de las purinas en que el resto de ribosa-5-fosfato (derivado

del PRPP) se une al núcleo de la purina después de la previa formación de
éste a partir de sus precursores en cadena abierta.

El ácido orótico, abundante en el suero de leche, es un precursor

inmediato de las pirimidinas.

La ruta del ácido orótico conduce primero al ácido uridílico (UMP) del cual
derivan tanto el ácido citidílico (CMP) como el desoxitimidilíco (dTMP).

El anillo de pirimidina se forma por la condensación del ácido arpártico

que aporta 3 carbonos y el nitrógeno restante. La enzima que cataliza la
reacción es la aspartato-carbamil-transferasa (aspartato transcarbamilasa)

Después, el grupo carbamilo del carbamil-fosfato es transferido al

aspartato formando N-carbamil-aspartato. Etapa determinante de la
síntesis de pirimidinas.

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El carbamil fosfato proviene de

2 ATP + glutamina + CO2 + H2O → 2 ADP + Pi + glutamina + carbamil fosfato

Dicha reacción es catalizada por carbamil-fosfato-sintasa (glutamina). Si se

recuerda, esta enzima es homóloga a la carbamil-fosfato-sintasa
(amoniaco) en la mitocondria para el ciclo de la urea.

Una vez completado la síntesis, el anillo de pirimidina se cierra por pérdida

de agua del N-carbamil-asparato, gracias a la dihidro orotasa, rindiendo
ácido dihidro orótico. Este compuesto se oxida a ácido orótico.

Llegando a esta reacción el ácido orótico se une a la Ribosa-5-fosfato por la

orotato-fosforribosil-transferasa produciento orotato-5-fosfórico o ácido
orotidílico.

Por últomo el ácido orotidílico se descarboxila para formar ácido uridíluico.

El UMP es precursor del CMP

La aciduria orótica es una enfermedad genética de la biosíntesis

pirimidínica en el hombre, en el que se acumula ácido orótico en la sangre
y se excreta en la orina. Se les de uridina y citidina en vía oral.

REGULACIÓN DE LA BIOSÍNTESIS DE NUCLEÓTIDOS PIRIMIDÍNICOS

La aspartato transcabamilasa cataliza la priemra reacción y resulta

inhibida por el CTP, el producto final de esta secuencia. Esta inhibición la
evita el ATP.

Hay que recordar que el centro de regulación reside en la reacción de la

ribosafosafato-pirofosfato-cinasa, precursora tanto de purinas como de
pirimidinas.

BIOLSÍNTESIS DE DESOXIRRIBONUCLEÓTIDOS

La síntesis de desoxirribonucleótidos viene de una reducción del carbono 2

de los correspondientes ribonucleótidos en su azúcar pentosa.

Los 4 ribonucleósido-difosfato (ADP, GDP, UDP y CDP) son directamente

reducidos a los correspondientes desoxi-análogos.

La reducción a 2-desoxirribosa requiere un par de átomos de hidrógeno

que son donadas finalmente por el NADPH y el H+. Sin embargo, el
donador primordial electrónico no es NADPH sino una proteína llamada
tiorredoxina que tiene dos grupos –SH provenientes de dos cisteínas.

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Tiene capacidad oxidorreducción reversible. Su forma oxidada que

contiene cistina, puede ser reducida a ditiol de la siguiente manera:

Tioredoxina ( – S – S – ) + NADPH + H → Tiorredoxina ( -SH)2 + NADP+

Reacción catalizada por la tiorredoxina reductasa, siendo una

flavoproteína con dos moléculas FAD ligadas.

La tiorredoxina transfiere al aceptor los equivalentes de la reducción

Tiorredoxina (-SH)2 + NDP → Tiorredoxina (-S-S-) + dNPD + H2O

Con ayuda de dos subunidades proteicas y Mg se puede reducir cualquier

ribonucleósido.

FORMACIÓN DEL ÁCIDO DESOXITIMIDÍLICO

El ADN contiene timina (5-metiluracilo) en vez del uracilo del ARN. El ácido
desoxitimidílico (dTMP) se forma a partir del (dUMP) por la acción de la
timidilato-sintetasa que cataliza la metilación del uracilo a través de
N5,N10, metil-TH4.

La aminopterina y ametoprterina retrasan esta reacción. Se les llaman

medicamentos antifólicos, se utilizan contra cáncer y leucemias. Y son
inhibidores competitivos de la dihidrofolato reductasa.

REGULACIÓN DE LA BIOSÍNTESIS DE LOS

DESOXIRRIBONUCLEÓTIDOS

La reducción de CDP a dCDP y la de UDP a dUDP resulta muy acelerada

por el ATP, mientras que la reducción de ADP a dADP y del GDP a dGDP es
estimulada por el dGTP y el dTTP. Por otra parte, el dATP actúa como
retroinhibidor de la reducción de todos los ribonucleósidos 5 fosfatos.

DEGRADACIÓN DE PURINAS

Son degradados por nucleasas, en hidrólisis hasta rendir purinas y

pirimidinas. Si no se recuperan o se utilizan se excretan.

En algunos animales como los simios, aves y el dálmata se excretan en

forma de ácido úrico.

En algunos mamíferos, reptiles y moluscos, se excreta en forma de

alantoína.

En vertebrados acuáticos se excreta en forma de amoniaco

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En el cerdo y arañas se excretan en forma de guanina.

Xantina + H2O + O2 → ácido úrico + O2-

El superóxido se vielve peróxido de hidrógeno por la superóxido dismutasa.

En un día se forman 5g de purinas libres y se excretan 0.5gde ácido úrico.

El ácido úrico libre así como sus sales, son insolubles en agua, lo que hace
que en la orina se cristalice y pueda formar cálculos renales. En cartílagos
forma la gota. El alopurinol se utiliza para tratamiento contra gota
(disminuye la producción de ácido úrico)

RECUPERACIONES DE PURINAS

La adenina-fosforribosil-transferasa y la guanina (hipozantina)-

fosforribosil- transferasa llevan a cabo las siguientes reacciones:

Adenina + 5-fosforribosa-1-pirofosfato → AMP + PPi

Guanina + 5-fosforribosa-1-pirofosfato →GMP + PPi

Estas importantes enzimas convierten a las purinas libres en sus

correspondientes purino-nucleósido-5-fosfato que son reutilizables.

Otra ruta la lleva a cabo la purino-nucleósido-fosforilasa

Purina + ribosa -1-pirofosfato → purino-nucleósido + Pi

Y la nucléosido cinasa como la adenosina cinasa

Adenosina + ATP → AMP + ADP

El 90% de las purinas son recuperadas. Síndrome de Lesch-Nyhan es un

fallo en la recuperación de purinas, especialmente en la de guanina

DEGRADACIÓN DE PIRIMIDINAS

Son degradadas principalmente a amoniaco y urea. Pueden también ser

utilizadas como biosíntesis de B-alanina. Y por tanto de coenzima A.

CICLO DE LOS NUCLEÓTIDOS PURÍNICOS.

Dos reacciones de la biosíntesis de AMP funcionan para la desaminación

del aspartato y consiste en lo siguiente

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AMP + H2O → IMP + NH3

Reacción en la que interviene la adenilato desaminasa

IMP + aspartato + GTP → adenilo-succinato + GDP + Pi

Reacción catalizada por la adenilosuccinato sintetasa

Adenilo-succinato → AMP + fumarato

En total, la suma es:

Aspartato + GTP + H2O → Fumarato + NH3 + GDP + Pi

Consiste en la desaminación del aspartato en el músculo esquelético, el

cuál no contiene mucha glutamato deshidrogenasa. También este ciclo
sirve para producir fumarato para introducirlo a Krebs.

BIOSÍNTESIS DE COENZIMAS NUCLEOTÍDICOS

El FMN (riboflavin fosfato), los nucleótidos piridínicos y el coenzima A son

derivados del ADENILATO.

Riboflavina (B2) + ATP → Riboflavina-5-fosfato +ADP

La enzima que realiza esta reacción es la riboflavina quinasa

Después, la FMN-adenilil-transferasa cataboliza la siguiente reacción:

Riboflavina-5-fosfato + ATP → Flavin-adenin-dinucléotido + PPi

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