Bioquímica II

Segundo cuatrimestre de 2019

Segundo Parcial – Segunda Fecha
27 de noviembre de 2019

Parte A

NOMBRE y APELLIDO:_____________________________________ Cantidad de hojas parte A:__________

PROBLEMA UNO [6 puntos]

El largazol es un depsipéptido cíclico producido por una cianobacteria marina del género Symploca con notables
propiedades antitumorales (Figura 1). Esta molécula es sintetizada ante la presencia de levaduras.
Recientemente, un colega de su laboratorio ha encontrado un derivado del largazol con propiedades antitumorales
más potentes. Esta molécula se encuentra unida a una base púrica y su colega la ha llamado puril largazol (Figura
2). El Director del laboratorio le indica a su colega y a usted que propongan para mañana una hipótesis acerca de
la vía de síntesis bioquímica de esta molécula. Aunque se tiene poca información sobre su síntesis, usted sabe que
la misma se ve aumentada cuando el medio mínimo es suplementado con SH2, sin embargo, una suplementación
de un medio mínimo con cisteína o metionina no conlleva a un incremento de la síntesis de esta molécula. Por otro
lado, la síntesis de Puril largazol necesita de la activación de la vía de las pentosas fosfato de la cual aparentemente
obtiene un azúcar de 7 carbonos que luego es modificado. También, mediante transcriptómica comparativa se pudo
observar la expresión diferencial de algunas enzimas que estarían involucradas en la síntesis de aminoácidos
ramificados. En cuanto a los anillos de tiazolina (anillo de 5 miembros que contiene átomos de nitrógeno y azufre),
hay evidencias de que éstos se generan a partir de la unión de 3 aminoácidos derivados de la serina. Ambos anillos
se unen inicialmente por un enlace amida, y se ciclan mediante una reacción intramolecular. Por otro lado, en cuanto
a la síntesis de la base nitrogenada no se ha detectado aspartato como dador de nitrógeno.

HS S

N
N NH
N

N O
H N
N S
O O O

S N
H

Figura 1: Largazol Figura 2. Puril largazol

Con estos datos:

a) Reescriba la estructura de la Puril largazol y marque sobre ella, los precursores que dan origen a cada uno
de sus átomos. Escríbalos además en una lista.
b) Describa la vía de síntesis de la Puril largazol a partir de sus precursores. Dibuje las fórmulas estructurales
de los intermediarios, incluya cofactores, cosustratos y coproductos de las reacciones y marque los enlaces
de alta energía.
c) Describa la vía de síntesis de cada uno de los precursores de la Puril largazol. Asuma que los sustratos
iniciales son glucosa, amonio y azufre. Dibuje las fórmulas estructurales de los intermediarios, incluya
cofactores, cosustratos y coproductos de las reacciones y marque los enlaces de alta energía.
d) Dibuje un esquema sin fórmulas en el cual se muestre cómo se conectan las vías centrales del metabolismo
con la vía de síntesis de la Puril largazol.
e) ¿En qué condiciones metabólicas considera usted que Symploca sintetiza la Puril largazol?
f) Marque sobre el esquema del punto d) las enzimas que regulan la síntesis de la Puril largazol, indique
además qué metabolitos podrían actuar como reguladores y cuál sería el signo de la regulación en cada
caso.
 Bioquímica II
Segundo cuatrimestre de 2019
Segundo Parcial – Segunda Fecha
27 de noviembre de 2019

Parte B

NOMBRE y APELLIDO:______________________________________ Cantidad de hojas parte B:__________

Problema 2 [1,5 puntos]

a) Proponga un mecanismo de degradación de la arginina a un intermediario del Ciclo de Krebs. Incluya
fórmulas desarrolladas, actividades enzimáticas y cofactores. Recuerde que las transaminaciones son
reacciones reversibles.
b) Explique, sin fórmulas y con el mayor grado de detalle, cuál es el destino metabólico final del esqueleto
carbonado de la arginina durante el ayuno prolongado.

Problema 3 [1 punto]
Grafique el perfil hormonal (insulina y glucagón) y de concentración de glucosa, glucógeno y cuerpos cetónicos
durante las fases absortiva y post-absortiva en mamíferos.

Problema 4 [1,5 puntos]

Las estatinas son un grupo de fármacos utilizados para disminuir los niveles de colesterol y triglicéridos en pacientes
que, por tenerlos elevados, presentan un mayor riesgo de sufrir episodios de patología cardiovascular. Durante sus
estudios de posdoctorado usted intenta determinar el mecanismo de acción de una novedosa droga (ANP) cuya
estructura es similar a la de varias estatinas conocidas. Utilizando el modelo de rata adulta comprueba que al
aumentar la dosis del fármaco logra inhibir la producción de mevalonato y, por lo tanto, de colesterol. De manera
complementaria a este resultado, en un grupo control que se encuentra en ayuno intermedio observa que la
producción de cuerpos cetónicos se mantiene constante aun en presencia de la droga. A partir de estos datos:

a) Indique la vía de síntesis de los derivados de isopreno desde Acetil-CoA hasta el escualeno (30 C),
incluyendo sus intermediarios, actividades enzimáticas, cosustratos y coenzimas.
b) Indique la cantidad de enlaces de alta energía consumidos por cada molécula de escualeno generada.
c) Proponga sobre qué enzima de la vía de síntesis del colesterol se ejerce el mayor control regulatorio.
Justifique su respuesta.