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PROYECTO DE INVESTIGACION
Resumen
Problema: Pirazinamida (PZA) es una de las drogas antituberculosas más importantes. Pero
su mecanismo de acción y resistencia aún no está completamente entendido. PZA es una pro
droga que necesita ser convertida en ácido pirazinoico (POA) por la pirazinamidasa (PZasa)
dentro del bacilo para ser efectiva. Mediante un mecanismo de eflujo, el POA es transportado
fuera del bacilo donde es protonado en un medio ácido (pH 5.5 aproximadamente) y regresa
al interior liberando el protón y repitiendo el ciclo. La perdida de actividad de PZasa,
usualmente causadas por mutaciones en el gen pncA, que codifica a la PZasa, está asociada
altamente con la resistencia a PZA. Se ha demostrado que la simple presencia de mutaciones
en la PZasa (presencia vs. ausencia de mutación) está asociada con una clasificación
dicotómica de resistencia a PZA (resistente vs. susceptible).
Si el malfuncionamiento de la PZasa es el principal mecanismo de resistencia a PZA, la
asociación entre mutaciones de PZasa y la resistencia a PZA debería mostrar un efecto de
dosis-respuesta entre la eficiencia enzimática de la PZasa (el cual es un parámetro
cuantitativo), y el nivel de resistencia a PZA, medido igualmente por un parámetro
cuantitativo.
Datos preliminares: En estudios previos exploratorios se analizaron 12 muestras de
Mycobacterium tuberculosis resistentes a PZA y la cepa susceptible H37RV, obtenidas de
aislados clínicos. Se clonó, expresó y purificó la enzima PZasa y se encontró que la eficiencia
enzimática (Kcat/Km) esta significativamente asociada con el nivel de resistencia a PZA
estimada por el MIC en cultivo en medio 7H9. Sin embargo se ha encontrado que la
variabilidad de los niveles de resistencia a PZA explicada por la eficiencia de PZasa fue
escasamente 27%. Interesantemente se han encontrado 2 cepas que fueron resistentes a PZA y
cuyas PZasas recombinantes mostraron actividad.
Especulamos que la variabilidad de la resistencia a PZA no estaría principalmente explicada
por la falla funcional de la PZasa de manera exclusiva, por lo cual existiría un mecanismo
alternativo de resistencia. El mecanismo alternativo de resistencia a PZA más probable, sería
una alteración del mecanismo eflujo de POA. Una cepa de M. tuberculosis con un mecanismo
alterado de eflujo de POA sería resistente a PZA a pesar de su habilidad de convertir PZA en
POA por su enzima PZasa activa. Para contrastar esta hipótesis se propone determinar las
tasas de flujo y eflujo de POA y PZA y evaluar la relación múltiple con la eficiencia
enzimática de la PZasa, y los niveles de resistencia microbiológica a PZA en muestras
clínicas de M. tuberculosis.
Hipótesis M. tuberculosis presentaría un mecanismo de resistencia a PZA alternativo y
distinto a la falla funcional de la enzima PZasa. Una alteración de la tasa de translocación de
POA por medio de la bomba de eflujo explicaría parte de la resistencia a PZA.
Objetivo: En el presente estudio deseamos estimar la tasa de flujo y eflujo de PZA y POA y
buscar su relación con la resistencia a PZA en muestras aisladas de Mycobacterium
tuberculosis.
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Resultados esperados e importancia: La medición de las tasas de translocación de PZA y
POA en diversas cepas para las cuales tenemos conocimiento previo de la resistencia
microbiológica y la eficiencia enzimática de la PZasa, permitirá obtener un mejor
entendimiento del mecanismo de resistencia a PZA. Esta información nos brindará
información sobre la real importancia de la PZasa y de la bomba de eflujo de POA en la
resistencia a PZA, lo cual daría un potencial impacto en el desarrollo de nuevas drogas
antituberculosas análogas a la PZA, mejorando los tratamientos contra tuberculosis latente.
Objetivo General
Objetivo Específico
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secundarios y presentan un costo elevado. La alta tasa de transmisión de TB sumado a la
emergencia de TB-MDR son actualmente los mayores obstáculos para el control de la
tuberculosis. El 30% de personas sanas pueden infectarse después de haber tenido contacto
con un paciente con TB, el 5% de estos desarrollan la enfermedad en los dos primeros años
mientras que el 40% de personas co-infectadas con VIH lo hacen [3].
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La pirazinamida (PZA), junto con la isoniacida (INH) y rifampicina (RIF) forman los
pilares de la terapia antituberculosa [4]. Mientras INH y RIF eliminan a los bacilos en estado
de crecimiento activo, la PZA elimina a los bacilos en estado latente. Debido a esta
importante característica la PZA ha permitido reducir el tratamiento de 9 a 6 meses [5].
Pirazinamida (PZA) es además una de las drogas antituberculosis más importantes, por
que es la única droga con alta efectividad conocida frente a M. tuberculosis en estado latente
[6]. Considerando que 2 de cada 3 personas en el mundo en promedio están infectados con M.
tuberculosis en estado latente[7], es muy importante incrementar el conocimiento sobre esta
droga, a nivel del mecanismo de acción y resistencia, el cual potencialmente permitirá
desarrollar estrategias para la generación de nuevos fármacos alternativos.
4. Marco teórico
La PZA es una droga importante de primera línea para tuberculosis y parece ser las
más importante matando bacilos latentes. La inclusión de PZA con Isoniasida y Rifampicina
ha permitido acortar el periodo de tratamiento de 9 meses a 6 meses [12]. Las cepas
resistentes a PZA emergentes representan un importante problema de salud pública ya que
ambas etapas del tratamiento incluyen PZA. Casi el 30% de las cepas peruanas MDR TB son
también resistentes a PZA[13] . En Perú también como en muchos países en desarrollo, la
PZA es parte del tratamiento de segunda línea anti tuberculosis en pacientes donde falla el
tratamiento de primera línea[14].
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Los mecanismos de acción y resistencia a PZA en M. tuberculosis son
incompletamente entendidos debido a sus propiedades inusuales. Aislados susceptibles a PZA
de M. tuberculosis poseen una enzima nicotinamidasa / pirazinamidasa que hidroliza PZA en
ácido pirazinoico (POA) [15] . El POA es transportado fuera del bacilo por un mecanismo de
eflujo deficiente y bajo condiciones ácidas extracelulares del medio es protonado y convertido
en HPOA, el cual posteriormente reingresa al bacilo liberando el protón en el citoplasma. Este
ciclo es repetitivo y el resultado es la reducción letal del pH intracelular y la acumulación de
POAH el cual altera la permeabilidad de membrana celular (figura 1), [16] .
Los residuos catalíticos parecen afectar un sitio activo y un sitio de unión metálica. Se
piensa que los residuos de aminoácidos del sitio activo son D8, A134, C138 y K96 y los del
sitio de unión metálica son D49, H51 y H71. Esto sugiere que las mutaciones que causan una
gran pérdida de actividad de PZasa son las que producen una alteración en el sitio activo y de
unión metálica. Mutaciones localizadas lejos de estos sitios tienen un menor efecto en la
actividad PZasa [17].
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Lemaitre [18] y Zhang [19] clonaron y expresaron PZasas mutantes obtenidas de
aislados clínicos de M. tuberculosis así como también generadas por muta-génesis dirigida,
respectivamente. Estos estudios mostraron que la actividad específica de las enzimas varían
dependiendo del sitio de la mutación. Los que tuvieron mutaciones en el sitio catalítico
estuvieron asociados con la menor actividad enzimática.
Es claro que la resistencia a la PZA puede deberse entonces a varios posibles factores,
desde el mal funcionamiento de la enzima pirazinamidasa debido a mutaciones en el gen
pncA, hasta defectos en cualquiera de los canales o bombas mencionadas. Se presume que un
80% de los casos de resistencia a PZA se deben a fallas en la enzima PZasa, mientras que un
20% de cepas resistentes muestran una actividad completa de de la enzima, en cuyo caso
habría problemas asociados a las bombas. Estos canales o bombas responsables del tránsito
intra-extra-intra celular del ácido pirazinoico son hasta el momento desconocidos, y son un
tema de especial interés actualmente.
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5. Estudios preliminares:
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Tabla 1. Resistencia microbiológica de aislados clínicos de M. tuberculosis, y parámetros cinéticos de la enzima PZasa recombinante.
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6. Metodología:
Explicación Teórica
La dinámica del mecanismo de acción de PZA podría ser simplificado como tres
procesos de translocación de moléculas con tasas características constantes: (1) La entrada de
PZA en el ambiente intracelular de mycobacterium con una tasa constante I, en donde la PZA
es convertida a POA a una tasa no limitante, (2) la salida de POA a través de un mecanismo
de eflujo al medio extracelular a una tasa constante E, donde es protonado (POAH) a una tasa
no limitante y (3) la reentrada del POAH protonado al medio intracelular a una tasa constante
F donde el protón es liberado a una tasa no limitante.
Se ha demostrado que cepas con altos valores de tasa de eflujo E son naturalmente
resistentes a PZA, como M. smegmatis. También se espera que las cepas con tasas E menores
que las correspondientes a cepas susceptibles H37RV sean resistentes a PZA dado que el
POA no es bombeado fuera de la bacteria. En principio, cualquier alteración del delicado
balance de las tasas de translocación mencionadas, podría comprometer la susceptibilidad a
PZA en la micobacteria.
Z0 – Ze = - dt ( I Ze)
Zi + Pi = dt ( I Ze + E Pe – F Pi )
Pe = dt ( F Pi – E Pe )
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Procedimientos
Pruebas de absorbancia
Se determinará el espectro de absorbancia y el coeficiente de extinción molar de PZA
y POA en buffer citrato a pH 5.5 por espectrofotometría UV
(2) Una alicuota de sobrenadante será incubada con PZasa activa, fresca y purificada
durante toda la noche, con lo cual toda la PZA será totalmente convertida a POA. Se añadirá
SO4NH3 al 20% y luego de 5 minutos se mediará la abosorbancia a 450 nm, de manera
similar a la prueba de Wayne. Esto determinará nuevamente la concentración total de Ze + Pe.
(3) Para determinar la concentración solamente del POA externo, una alícuota del
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sobrenadante será incubada directamente con SO4NH3 (el cual reacciona únicamente con
POA y no con PZA), 20% por 5 minutos y luego se medirá la absorbancia a 450 nm. Con esta
absorbancia podremos determinar la concentración del POA externo (Pe), debido a que el
SO4NH3 solamente reacciona con el POA.
7. Análisis
La medición de las tasas de translocación de PZA y POA en diversas cepas para las
cuales tenemos conocimiento previo de la resistencia microbiológica y la eficiencia
enzimática de la PZasa, permitirá obtener un mejor entendimiento del mecanismo de
resistencia a PZA. Estos datos nos brindarán información sobre la real importancia de la
PZasa y de la bomba de eflujo de POA en la resistencia a PZA, lo cual daría un potencial
impacto en el desarrollo de nuevas drogas antituberculosas análogas a la PZA, mejorando los
tratamientos contra tuberculosis latente.
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9. Infraestructura y medios físicos a utilizar (Laboratorios, talleres experimentales,
equipos sofisticados, etc.)
También se cuenta con tres maquinas MB-BAC-T (el equivalente no radioactivo del la
máquina bien conocida como BACTEC) las cuales son usadas diariamente para un cultivo
automatizado y rápido de TB y pruebas de sensibilidad.
Laboratorio de Bioinformática
Este laboratorio participa en los análisis bioinformáticos, estadísticos y teóricos de los
proyectos y tiene un equipamiento de última generación con acceso a software especializado
de bioinformática y estadística.
MESES
1-2 3-4 5-6 7-8 9-10 11-12
Determinación del espectro de
absorbancia de PZA y POA y
X
calibración de la prueba de
detección
Determinación del coeficiente
de extinción molar de PZA y
X
POA y calibración de la
prueba de detección
Cultivo de las cepas
seleccionadas de M. XX XX XX
tuberculosis.
Determinación de las tasas de
XX XX XX
translocación de PZA y POA
Análisis estadísticos de datos X XX
Preparación del informe final X
X= 30 días
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11. Presupuesto (en Soles S/.)
Materiales de escritorio
Papeles, marcadores y otros 700
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12. Bibliografía (estrictamente relacionada al proyecto)
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