EGPL - Tutorial Gephi

Curso: Gestión Logística Humanitaria
228011A
Tutorial Modelamiento Redes

Gephi
Especialización en Gerencia de Procesos Logísticos
en Redes de Valor.
ZCBC- JAG- ECBTI Noviembre de 2020
Curso Gestión Logística Humanitaria
Modelamiento de Redes Gephi
1- Preparación de Software.
Descarga de Java versión 8 o versión 7
Descarga de Gephi versión 0.9.2

2 - Tabulación Encuestas
Digitar Nodos - Actores
Digitar Enlaces ( aristas – links)

3 - Preparación de Datos
Archivo Nodos – Actores
Guardar como CVS (delimitado por comas)

3 - Preparación de Datos
Archivo Enlaces -
Relaciones Aristas
Guardar como CVS (delimitado por comas)
1- Copiar datos en otro archivo y pegar como valores

2- Mantener las etiquetas con los mismos nombres
3- Eliminar filas en donde no hay valores de enlaces
4- Ordenar en ascendente la columna Weight.
5- Reemplazar comas por puntos para poder subir a
Gephi
6- Guardar como CVS ( delimitado por comas)
4- Cargue Datos en Gephi
Nuevo Proyecto
Cargue archivo de Nodos:
Click 1- Pestaña Nodos
Click 2 - Importar hoja de calculo

Click 1- seleccionar archivo
Click 2 - siguiente
Click 3 - terminar
Verificar que no hayan avisos de

alertas
Click 4- aceptar
Click 4 – seleccionar grafo no

dirigido
Click 5- aceptar
Se visualiza cargue exitoso

Cargue archivo de enlaces:
Click 1. pestaña “ aristas”
Click 2. Importar hoja de cálculo

Click 3. seleccionar archivo
Click 4. seleccionar “tabla de

aristas”
Verificar que estén cargando los

datos como el archivo original
Click 5. siguiente
Click 5. terminar
Verificar que no hayan avisos de

alertas
Verificar que hayan sido

Cargados el mismo numero de
aristas de la tabla original
Click 6. aceptar
Se visualiza cargue exitoso

5- Distribución o Layout de la Red
Click 1 – Vista General

Da una primera visualización del
Grafo.
Debe hacerse mas legible los

Nodos y conexiones para poder
Intepretar.
Grafo inicial –
Click 2 Distribución poco legible
Click 3 – Escoger alguna de las

opciones de algoritmos para
mejorar la visualización.
Sugerencia 1.
Escoger “Expansión”
Mejora la
Ejecutar 3 veces apariencia

mejorar la visualización.
Sugerencia 2.
Escoger “Force Atlas”

Nodos mas
Fuerza de repulsión Alta separados.
200.000 o mas
Esperar 10 segundos y parar


Se busca con este refinamiento
mejorar la visualización. que los nodos no se superpongan,
que se suavicen los clústeres
Sugerencia 3.
Parar Force Atlas y Escoger

“Force Atlas 2”
Para refinar la visualización Esperar 10 segundos y parar
Click 6- disuadir hubs

Click 7- Modo Linlog
Click 8-Evitar solapamiento
Curso Gestión Logística Humanitaria - Fase 4
Fases de la Estrategia de Aprendizaje

ANÁLISIS DE LA RED Diámetro
6- MODELADO DE
Densidad RED
RED
H F Agrupamiento ACTORES
Basado en Encuestas
A B
C G
D E
4 Diámetro: Distancia entre los dos nodos más alejados
4 Densidad: Nivel de conexión de la red. - conexiones existentes/ conexiones posibles
4 Agrupamiento: Grado de cohesión entre vecinos. - clustering - coeficiente de Agrupamiento


4
Diámetro: Distancia entre los dos nodos más alejados ANÁLISIS DE LA RED
Click 1 – Ejecutar diámetro de la red.
Click 2- normalizar entre 0 y 1
Click 3 - aceptar

4
Reportes.
Diámetro de la Red - Longitud Media de Camino
En el ejemplo, la red tiene una distancia corta entre actores.


4
Reportes.
Grado intermediación
( Betweennes)
En el ejemplo, 3 nodos tienen el mayor valor

De Grado de intermediación

4
Densidad: Nivel de conexión de la red ANÁLISIS DE LA RED
Click 1 – Ejecutar Densidad del grafo.
Click 2- No dirigido
Click 3 - aceptar

4
Click 1 – Ejecutar Densidad del grafo.
Click 3 - aceptar

4
Reportes
En el ejemplo, la red tiene una baja densidad.


4
Agrupamiento: Grado de cohesión entre vecinos. – ANÁLISIS DE LA RED
clustering
Click 1- Ejecutar Coeficiente medio de clustering
Click 2 – No dirigido
Click 3 - aceptar

4
Agrupamiento: Grado de cohesión entre vecinos. – ANÁLISIS DE LA RED
clustering
Reportes
En el ejemplo, la red tiene un alto nivel de clustering, es decir vecindades entre los nodos para conformar
comunidades locales.
PERFIL DEL ACTOR

ANÁLISIS DE ACTORES
H
Grado
6- MODELADO DE F
RED
Intermediación ACTORES = Nodos
Basado en Encuestas
A B Centralidad
C G
D E
4 Grado: Número de conexiones que tiene el nodo. Degree
4 Intermediación: Grado en el que un nodo conecta otros nodos . - Betweenness
4 Centralidad: prestigio de cada nodo basado en la importancia de los nodos con los que se conecta.
Eigenvector centrality

4
Grado: Número de conexiones que tiene el nodo - Degree ANÁLISIS DE ACTORES
Click 1 – Ejecutar grado medio
Reportes
En el ejemplo, un nodo tiene

en promedio 13 conexiones
con otros nodos.

4 Intermediación : Grado
en el que un nodo ANÁLISIS DE ACTORES
conecta otros nodos. Betweenness
Ya calculado previamente

4 Centralidad: prestigio de cada nodo basado en la importancia de los nodos con
los que se conecta. Eigenvector centrality
Click 1 – Ejecutar centralidad del vector propio.
Click 3 - aceptar

4 Centralidad: prestigio de cada nodo basado en la importancia de
los nodos con los que se conecta. Eigenvector centrality
Reportes
En el ejemplo, se muestra la distribución del nivel de

Importancia de nodos, destacándose 3 nodos del
Extremo superior derecho con puntaje de 1

4 Análisis por actores ANÁLISIS DE ACTORES
Click 1- Laboratorio de datos
Click 2 – Nodos

4 Análisis por actores ANÁLISIS DE ACTORES
Se visualiza el detalle de indicadores por nodos .
En el ejemplo, los tres nodos con mayor nivel

de importancia Eigenvector centrality
Son:
Nodo 1 – UGR - Unidad Gestión Riesgo

Nodo 8- Secretaria Vivienda
Nodo 14 – Cruz Roja
7- Identificación de Comunidades
Click 1 – Vista general
Click 2 – Ejecutar Modularidad
Click 3 – Aleatorio
Click 4 - Utilizar pesos
Click 5 - Aceptar
Puede ejecutar 3 veces la
modularidad para identificar las
comunidades
Reporte de Modularidad
En el ejemplo se visualizan 4
comunidades
Visualización de Comunidades
Apariencia de Nodos por comunidad
Click 1- paleta colores

Click 2- partición
Click 3- Escoger atributo
Click 4- modularity class
Permite segmentar por colores las

comunidades
Click 1- paleta colores

Click 2- partición
Click 3- Escoger atributo
Click 4- modularity class
Click 5 – aplicar
Permite segmentar por colores las

comunidades
En el ejemplo la comunidad 2 y 3 son las que tienen

mayor participación de enlaces en la red
Mejorar tamaño de nodos
Click 1- Tamaño
Click 2- Puede ser Único o por ranking
Click 3 - Elegir tamaño
Click 4 - Ejecutar
Mejorar tamaño de nodos

Mostrar etiquetas de nodos:
Click 1 – tamaño de letra

Click 2- atributos
Tamaño letra Atributos

Mostrar etiquetas de nodos:
Click 3- Nodos
Click 4- escoger la variable
que quiero aparezca en la
etiqueta
Click 5- aceptar
Puedo visualizar las conexiones de cada
nodo.
Posicionando el click en el nodo de interés
En el ejemplo, el nodo 1: La Unidad Nacional de

Riesgos tiene alto numero de enlaces, coherente
con el indicador de centralidad previamente
analizado y los indicadores de grado e
intermediación
Puedo visualizar las conexiones de cada
nodo.
Posicionando el click en el nodo de interés
En el ejemplo, el nodo 11: DNP – Dirección Nacional de

Planeación tiene bajo numero de enlaces, coherente con lo
indicadores de: Grado, intermediación y centralidad
8- Exportación de la Red
Click 1 – previsualización
Click 2– configurar parámetros de lo que
quiero que se visualice. Ej, etiquetas de nodos y
tamaño. Aristas, curvas
Click 3- Exportar . Archivo pdf
Click 4- Definir ruta para guardar y nombre
de archivo
Material de apoyo complementario

Jorge Vivares (2020). Diseñador de curso
Conceptos fundamentales para modelar la logística humanitaria en red https://youtu.be/aGcfk0JHEg0
Caja de Herramientas https://javivaresv.wixsite.com/logisticahumanitaria
Ejercicio práctico para modelar la logística humanitaria en red https://youtu.be/9s1aE6KSTuw

utilizando el software Gephi
https://www.youtube.com/watch?v=
9s1aE6KSTuw&feature=youtu.be
¡GRACIAS POR SU ATENCIÓN!

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Digitar Nodos - Actores

Digitar Enlaces ( aristas – links)

Archivo Nodos – Actores

Guardar como CVS (delimitado por comas)

1- Copiar datos en otro archivo y pegar como valores

4- Cargue Datos en Gephi

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de Nodos:

Click 1- Pestaña Nodos

Click 2 - Importar hoja de calculo

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de Nodos:

Click 1- seleccionar archivo

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de Nodos:

Verificar que no hayan avisos de

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de Nodos:

Click 4 – seleccionar grafo no

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de Nodos:

Se visualiza cargue exitoso

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de enlaces:

Click 1. pestaña “ aristas”

Click 2. Importar hoja de cálculo

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de enlaces:

Click 3. seleccionar archivo

Click 4. seleccionar “tabla de

Verificar que estén cargando los

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de enlaces:

Verificar que no hayan avisos de

Verificar que hayan sido

4- Cargue Datos en Gephi

Cargue archivo de enlaces:

Se visualiza cargue exitoso

5- Distribución o Layout de la Red

Click 1 – Vista General

Debe hacerse mas legible los

5- Distribución o Layout de la Red

Click 3 – Escoger alguna de las

5- Distribución o Layout de la Red

Escoger “Force Atlas”

Esperar 10 segundos y parar

5- Distribución o Layout de la Red

Parar Force Atlas y Escoger

Click 6- disuadir hubs

Fases de la Estrategia de Aprendizaje

4 Diámetro: Distancia entre los dos nodos más alejados

4 Densidad: Nivel de conexión de la red. - conexiones existentes/ conexiones posibles

4 Agrupamiento: Grado de cohesión entre vecinos. - clustering - coeficiente de Agrupamiento

Fases de la Estrategia de Aprendizaje

Click 1 – Ejecutar diámetro de la red.

Click 2- normalizar entre 0 y 1

Fases de la Estrategia de Aprendizaje

Diámetro de la Red - Longitud Media de Camino

En el ejemplo, la red tiene una distancia corta entre actores.