Biologı́a Molecular BioMol

Ejercicios sobre la estructura del ADN

1. Escribir la secuencia complementaria (en la anotación estándar 5’-3’) de:
a) 5’—GATCATGCTCGAT—3’,
b) 5’—TCAGCTAGTCTGA—3’,
c) 5’—AATGCCGAGCATT—3’.
Solución. Obrando por complementariedad de bases nitrogenadas (A–T y G–C),
se tiene:
a) 5’—ATCGAGCATGATC—3’,
b) 5’—TCAGACTAGCTGA—3’,
c) 5’—AATGCTCGGCATT—3’.

A tener en cuenta...
La adenina (A) se una a la timina (T) mediante dos puentes de hidrógeno
y la guanina (G), a la citosina (C) mediante tres puentes de hidrógeno.

2. En condiciones fisiológicas el ADN se encuentra en forma de ADN-B. Sin embargo,

los heterodúplex ADN-ARN adoptan la estructura en forma de hélice-A. En este
sentido, se pide deducir, en base a sus diferencias estructurales, la razón de este
fenómeno.
Solución. La hélice-A es una espiral que gira hacia la derecha, más amplia que
la B, con una hendidura menor superficial y más amplia, y una hendidura ma-
yor más estrecha y profunda. La hélice-A ocurre en condiciones no fisiológicas en
formas deshidratadas de ADN, mientras que en la célula puede producirse en apa-
reamientos hı́bridos de hebras ADN-ARN, además de en complejos enzima-ADN.
La geometrı́a del apareamiento es, en definitiva, la razón de este fenómeno: los
ribonucleótidos que forman parte del ARN presentan un grupo hidroxilo (—OH)
unido al segundo carbono de la β-D-ribofuranosa, mientras que los desoxirribonu-
cleótidos que forman parte del ADN carecen de oxı́geno unido al segundo carbono
de la β-D-2’-desoxirribofuranosa; hay diferencias entre los pares A–T y A–U.
3. Una muestra de ADN de doble cadena contiene un 21 % de adenina. ¿Cuál es su
concentración porcentual de bases?
Solución. La ley de Chargaff, basada en la relación cuantitativa de los desoxi-
rribonucleótidos que forman la doble hélice del ácido desoxirribonucleico (ADN),
establece que la cantidad de adenina (guanina) es igual a la de timina (citosina),
es decir, el número total de bases púricas es igual al de bases pirimidı́nicas.
De esta manera, dicha muestra de ADN de doble cadena contendrá un 21 % de
guanina, y un 29 % de timina y citosina.
4. La composición (en porcentaje molar) de una de las hebras de un ADN de doble
hélice es A1 ≡ 20 y G1 ≡ 34.

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a) ¿Qué puede decirse de los nucleótidos de T y C de la misma hebra?

b) ¿Qué puede decirse de los nucleótidos de A, G, T y C de la hebra comple-
mentaria?

Solución:

a) Primeramente, se hace evidente que, de acuerdo con la notación empleada

en el enunciado, T1 + C1 ≡ 46 (o, lo que es lo mismo, C1 ≡ 46−T1 ), si bien
no se puede especificar cuál serı́a la composición, en porcentaje molar, de
timina y citosina de dicha hebra de ADN.
b) La ley de Chargaff, basada en la relación cuantitativa de los desoxirribonu-
cleótidos que forman la doble hélice del ácido desoxirribonucleico (ADN),
establece que la cantidad de adenina (guanina) es igual a la cantidad de
timina (citosina), es decir, el número total de bases púricas es igual al de
bases pirimı́dinas. Ası́ pues, se tendrá que T2 ≡ 20 y C2 ≡ 34, ası́ como que
A2 ≡T1 y G2 ≡ 46−T1 .

A tener en cuenta...
La ley de Chargaff se trata de una proposición que solo se puede aplicar en
el caso de que se tenga un ADN de cadena doble (estructura secundaria).

Hipótesis | Doble hélice de ácido desoxirribonucleico (ADN).

Tesis | La cantidad de adenina (guanina) es igual a la de timina

(citosina), es decir, el número total de bases púricas es igual al de
bases pirimidı́nicas.

5. El ADN de un mutante delecionado del bacteriófago T4 tiene una longitud de 30

µm en lugar de 34 µm. ¿Cuántos pares de bases se han perdido por esta deleción?
Solución. Sabiendo que la distancia entre dos pares de bases consecutivos en el
ADN-B es de 0,34 nm, es fácil llegar a la conclusión de que el número de pares
de bases en cuestión es, aproximadamente, igual a 1,2 · 104 , que es, a su vez, el
resultado del cociente de la longitud del fragmento de ADN que se ha perdido
(4 · 10−6 m) y la distancia entre dos pares de bases consecutivos en el ADN-B
(3,4 · 10−10 m).

A tener en cuenta...
Es necesario conocer que la distancia entre dos pares de bases consecutivos
en el ADN-B es de 0,34 nm.

6. Existe 1 pb cada 0,34 nm de ADN y la longitud total del ADN de una célula
humana es de 2 m.
Se pide:

a) calcular el número de pb de una célula;

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b) calcular la longitud total del ADN humano, habiendo de ser esta comparada
con la distancia entre la Tierra y el Sol (1,5 · 108 km), suponiendo que en
humanos hay 1014 células.

Solución:

a) Es evidente que el número de pb de una célula vendrá dado por el cociente

entre la longitud total del ADN de una célula humana (2 m) y la distancia
entre dos pares de bases consecutivos en el ADN-B (3,4 · 10−10 m), es decir,
será, aproximadamente, igual a 5,9 · 109 (5,9 miles de millones).
b) Por su parte, la longitud total del ADN humano se obtiene multiplicando la
longitud total del ADN de cada célula humana (2 m) por el número total de
células que existen (1014 ), esto es, es de 2 · 1014 m o, equivalentemente, de
2 · 1011 km —con lo que es superior a la distancia existente entre la Tierra y
el Sol (de hecho, es, concretamente, 1333 veces más)—.

A tener en cuenta...
Es necesario conocer que la distancia entre dos pares de bases consecutivos
en el ADN-B es de 0,34 nm.

7. ¿Qué interacciones no covalentes contribuyen a la estabilidad de la estructura

helicoidal del ADN?
Solución. La estructura helicoidal del ADN se mantiene gracias a interaccio-
nes no covalentes. Por un lado, el apilamiento entre las bases adyacentes de una
misma hebra favorece interacciones hidrofóbicas entre estas; por otro, cada base
está unida a su pareja mediante enlaces de hidrógeno (la adenina [guanina] a la
timina [citosina] mediante dos [tres]). A ello hay que sumar las fuerzas de Van
der Waals entre las bases apiladas, la solvatación de los fosfatos, las interacciones
electrostáticas con Mg2+ , las histonas, etc.

A tener en cuenta...
La estructura helicoidal del ADN se mantiene gracias a interacciones no
covalentes:

Interacciones hidrofóbicas entre las caras de las bases.

Puentes de hidrógeno entre bases complementarias.

Fuerzas de Van der Waals entre las bases apiladas.

Solvatación de los fosfatos, interacciones electrostáticas con Mg2+ ,

histonas, etc.

8. Razonar si es mayor o menor la estabilidad del ADN que la del ARN.

Solución. Se tiene que:

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la β-D-2’-desoxirribofuranosa, que forma parte del ADN, tiene un grupo

hidroxilo (–OH) menos que la β-D-ribofuranosa, que forma parte del ARN,
haciendo a la molécula de ADN menos reactiva y más estable;
el ADN, a diferencia del ARN, es estable en condiciones alcalinas;
el ADN goza de una mejor defensa contra ataques externos (virus), mientras
que el ARN es más vulnerable a virus y enzimas.
En suma, el ADN es más estable que el ARN.
(Nótese que la comparación que se ha hecho es entre el ADN de cadena doble y
el ARN de cadena sencilla).
9. ¿Cuál de las dos moléculas de ADN que se muestran se desnaturalizará primero al
aumentar la temperatura? Razonar la respuesta, aportando un dato cuantitativo.

5’—GCCATTTCGGCGCGCACA—3’
3’—CGGTAAAGCCGCGCGTGT—5’

5’—ATGCTGCTTATACTAGCTA—3’
3’—TACGACGAATATGATCGAT—5’

Solución. Se desnaturalizará primero aquella molécula de ADN que contenga un

menor número de pares G–C, puesto que, como se ha indicado, entre la guanina
y la citosina se establecen tres enlaces de hidrógeno frente a los dos enlaces de
hidrógeno que se forman entre la adenina (A) y la timina (T). Ası́ pues, será la
segunda molécula mostrada la que se desnaturalice primero, pues se precisa una
energı́a calorı́fica menor para romper los enlaces de hidrógeno que se establecen
entre la adenina y la timina que los que se forman entre la guanina y la citosina
—en la primera molécula la mayor parte de los enlaces de hidrógeno existentes se
hallan entre la guanina y la citosina, mientras que en la segunda lo hacen entre
la adenina y la timina—.
De hecho, se tiene que:
Tm = (4 · 12 + 2 · 6) ◦ C = 60 ◦ C, para la primera molécula de ADN;
Tm = (4 · 7 + 2 · 12) ◦ C = 52 ◦ C, para la segunda molécula de ADN.

A tener en cuenta...
La adenina se une a la timina mediante dos enlaces de hidrógeno y la
guanina, a la citosina mediante tres enlaces de hidrógeno.

La temperatura de fusión, Tm , es la temperatura en la cual el 50 %

del ADN tiene sus hebras separadas (desnaturalización del ADN).

10. La absorbancia a 260 nm observada en un ARN de cadena sencilla se incremen-

ta conforme se acrecienta la temperatura. ¿Cómo se podrı́a explicar este efecto
hipercrómico?

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Solución. Puede ser debido a que el ARN en cuestión contenga, pese a ser de
cadena sencilla, regiones con bases apareadas (estructuras parciales en doble héli-
ce, como, por ejemplo, horquillas), con lo que un aumento de la temperatura
propiciarı́a la pérdida del apilamiento de dichas bases y, consecuentemente, el
incremento de la absorción de la luz UV por parte de estas.

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Ejercicios sobre la replicación del ADN

1. ¿Qué resultado hubiera obtenido Meselson y Stahl si la replicación del ADN fuese
conservativa? Dar la distribución esperada de moléculas de DNA después de las
generaciones 1 y 2 para una replicación conservativa.
Solución. En el caso de que la replicación del ADN fuera conservativa —lo cual
supondrı́a que cada hebra original servirı́a de molde para la sı́ntesis de una he-
bra hija complementaria, pero las dos hebras hijas se unirı́an después entre sı́ y,
consecuentemente, se recuperarı́a el ADN original—, Meselson y Stahl habrı́an ob-
servado iguales cantidades de ADN de mayor y menor densidad, pero sin producir
ADN de densidad intermedia: de hecho, para la primera generación se esperarı́a
que la mitad del ADN serı́a de mayor densidad (15 N) y la otra mitad de me-
nor densidad (14 N); para la segunda generación, el 75 % del ADN serı́a de menor
densidad (14 N) y el 25 % de mayor densidad (15 N).

A tener en cuenta...
Según la hipótesis conservativa, cada hebra de la molécula de ADN origi-
nal sirve de molde para sintetizar una hebra hija complementaria. Las dos
hebras hijas se unen entre sı́ y forman una molécula de ADN, y se guarda
el original.

2. En Escherichia coli, la horquilla de replicación avanza en direcciones opuestas a

una velocidad de 1400 pb/s. Teniendo en cuenta que el cromosoma bacteriano
contiene 4,2 · 106 pares de bases, ¿cuánto tiempo se requiere para que se replique
completamente?
Solución. El tiempo que se requiere para que se replique completamente viene
dado por la mitad del cociente entre el número de pares de bases que contiene
el cromosoma bacteriano (4,2 · 106 pb) y la velocidad a la que la horquilla de
replicación avanza (1400 pb/s), es decir, es de mil quinientos segundos o, lo que
es lo mismo, de veinticinco minutos.

3. Una disolución acuosa contiene ADN-polimerasa I, ası́ como dATP, dGTP, dCTP
y dTTP. Se separa en diferentes alı́cuotas a las que se les añaden las moléculas
de ADN que se indican a continuación. ¿Cuáles de ellas conducirán a la sı́ntesis
de ADN?

a) Un ADN circular de cadena sencilla de dos mil nucleótidos.

b) Un ADN circular de doble hebra de dos mil pares de nucleótidos.
c) Un cı́rculo cerrado de una hebra de dos mil nucleótidos emparejados con una
hebra lineal de mil nucleótidos con el grupo hidroxilo (–OH) del extremo 3’
libre.
d ) Un ADN lineal de doble hebra de dos mil pares de nucleótidos con el grupo
hidroxilo (–OH) del extremo 3’ libre en los extremos de cada una de las
cadenas.

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Solución:
a) Las ADN-polimerasas catalizan la unión de desoxirribonucleótidos por la
formación de enlaces fosfodiéster en sentido 5’→ 3’. Al contrario que la
primasa, no son capaces de iniciar un fragmento nuevo, sino que solo pueden
añadir nucleótidos a una cadena preexistente. Es por eso que no serı́a posible
la sı́ntesis del ADN (bajo las condiciones dadas en el enunciado).
b) Por la misma razón dada en el apartado anterior, no se sintetizarı́a ADN.
c) Es evidente, recurriendo, de nuevo, a la explicación aportada en el primer
apartado, que, como la ADN-polimerasa I puede añadir nucleótidos a una
cadena preexistente cuyo grupo hidroxilo (–OH) del extremo 3’ está libre,
sı́ habrı́a sı́ntesis de ADN (a partir del extremo 3’ libre), ya que, además,
existe una cadena molde.
d ) Basándose en el apartado anterior, no habrı́a sı́ntesis de ADN (a pesar de
los dos extremos 3’ libres), debido a que no hay cadena molde.

A tener en cuenta...
Para que haya sı́ntesis de ADN, es menester que:

exista una cadena de ADN preexistente cuyo grupo hidroxilo (–OH)

del extremo 3’ esté libre,

exista cadena molde.

4. Teniendo en cuenta que durante la replicación del ADN la sı́ntesis se produce a

una tasa de nucleótidos añadidos de 1000 nt por segundo, se pide determinar:
a) la velocidad, expresada en revoluciones/segundo, a la que gira el ADN molde
en una horquilla de replicación;
b) la velocidad, expresada en micrómetros por segundo, del holoenzima ADN-
polimerasa III con respecto al ADN molde.
Solución:
a) El ADN-B posee 10,4 desoxirribonucleótidos por cada vuelta de hélice, de
forma que la velocidad a la que gira el ADN molde en una horquilla de
replicación es, aproximadamente, igual a 96 revoluciones/segundo (o vuel-
tas/segundo).
b) La holoenzima ADN-polimerasa III añade mil nucleótidos (3,4 · 104 µm) por
segundo, sabiendo que la distancia entre dos pares de bases consecutivos es
de 0,34 nm.
5. Supongamos que iniciamos la replicación en un medio que contiene timidina mode-
radamente radiactiva. Al cabo de unos pocos minutos de incubación, se transfieren
las células a un medio con timidina altamente radiactiva. Dibujar el esquema del
patrón autorradiográfico que se obtendrı́a:

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a) si la replicación fuese unidireccional desde el origen,

b) si la replicación fuese bidireccional a partir de un único origen.

Solución:

a) Si la replicación fuese unidireccional desde el origen (O1 ), entonces solo

habrı́a una horquilla de replicación (en la cual se apreciarı́a la radiación).
b) Si la replicación fuese bidireccional desde el origen (O2 ), entonces habrı́a dos
horquillas de replicación (en las cuales se apreciarı́a la radiación).

O2

O1

O2