Divulgación de la Ciencia Química

Número 1

El
propósito
de la
CIENCIA
QUÍMICA
•EL ENLACE
• SÍNTESIS ORGÁNICA
•QUÍMICA FARMACÉUTICA
•QUÍMICA VERDE
•BIOCATÁLISIS
QUÍMICA TEÓRICA Y COMPUTACIONAL MITO QUÍMICO
•QUÍMICA: PILAR DE LA ECONÓMICA Las microondas
y su mal
Alejandro Torres entendimiento
Gavilán Ciencia y negocios
El nuevo pensamiento
científico

REVISTA QUIMIOFILIA JULIO 02018. #1. 2a EDICIÓN. $50

•Asignación estructural •Transferencia de Tecnología •Biocatálisis •Diseño
de Síntesis •Desarrollo de Métodos Analíticos •Investigación de Hallazgos
•Interpretación de Resultados •Formulación Cosmética y Farmacéutica
•Cursos, Actualizaciones y Capacitaciones •Seguridad en Laboratorio

alkimiasesores@gmail.com
 EDITORIAL
Entre los años 750 y 815 de ésta era, el persa Abū Mūsā Ŷābir ibn Hayyān, conocido en latín como Geber,
introdujo a la alquimia una nueva forma de ejecución y entendimiento de sus actividades: la experimentación.

Mucho antes que las aportaciones de Antoine Lavoisier o Friedrich Wöhler cambiaran la forma en que la hu-
manidad percibía a la realidad e incluso a la Divinidad, el estilo y pensamiento de Geber sentó las bases de
la Química, la disciplina que más aportes ha hecho a las actividades humanas en todas sus manifestaciones.

Durante siglos, la química ha creado y perfeccionado su lenguaje, su simbología e incluso su objeto de tra-
bajo, influyendo por sí misma en otras disciplinas mucho más, o al menos a la par, de lo que otras disciplinas
influyen en ella.

La química es una ciencia que genera conocimiento para que otros entiendan, apliquen o justifiquen su pro-
pio conocimiento. Sus alcances son tales que hoy toda línea de conocimiento de la naturaleza o aplicación
tecnológica en algún momento tuvo que resolver un problema químico.

Con tal variedad de aplicaciones e intervenciones, la química se ha ganado opiniones y calificaciones tanto
diversas como cambiantes, desde ser percibida como una disciplina de élite académica hasta ser la respon-
sable del consumo y contaminación de recursos naturales.

La química es la única ciencia formal en la que el comercio y las finanzas han encontrado oportunidad de
negocios. De ella surgieron fármacos y sustancias que se consideran ilegales; de ella supimos que existen o
que se pueden crear materiales con casi cualquier requerimiento, que muchos de ellos ayudan a conservar
alimentos, que otros no se podrán recuperar o destruir o que se pueden usar como armas.

Con todo esto, cada vez más gente, especializada y no especializada en el área, se formula preguntas para
las que no es sencillo dar una respuesta, o al menos una única: ¿Cuál es el propósito final de la química?
¿Cuándo un problema se vuelve dominio de la química? ¿Qué tan responsable es la química del uso que se
le da a sus conocimientos y técnicas?

Este es el primer número de una revista en la que queremos hacer llegar a todos el conocimiento químico,
sus condicionantes y consecuencias. Deseamos que el contenido contribuya a un mejor ejercicio de
profesionales y especialistas y a un mejor entendimiento de la química para aquellos no químicos.

¡Bienvenidos a la Divulgación de la Ciencia Química!

JOSÉ DOMINGO RIVERA RAMÍREZ

DIRECTOR GENERAL Y EDITOR

REVISTA QUIMIOFILIA DIVULGACIÓN DE LA CIENCIA QUÍMICA. Año 1. Núm. 1 Revista bimestral Julio 2018. Editor responsable José Domingo Rivera Ramírez. El logotipo y el nombre con
sus variantes, colores, tonalidades, tamaños, formatos y versiones son propiedad intelectual en trámite. La difusión de este documento es en formato digital a través descarga en la página web
QUIMIOFILIA.COM. La comercialización del formato digital por otra vía o la impresión para fines comerciales sin la autorización por escrito de Quimiofilia incurre en una falta a las leyes sobre
derecho de autor, patentes, marcas, modelos y diseños industriales o secretos industriales. Los contenidos del presente documento tienen fines divulgativos y de información al público en
general, así como a especialistas, investigadores, estudiantes y profesionistas. El contenido y las opiniones expresadas por los autores son responsabilidad de cada uno de ellos y no reflejan
necesariamente la postura del editor de la publicación o la opinión de Quimiofilia. El contenido, promociones y material gráfico que se inserta en los espacios publicitarios son responsabilidad
de los anunciantes. Quimiofilia no promueve, incita, insinúa, sugiere o invita a que la información aquí presentada sea utilizada sin la asesoría de un experto y/o para fines que violen las leyes
y las buenas costumbres de cada país.
2
 EL PROPÓSITO DE LA CIENCIA QUÍMICA

CONTENIDO
Contexto

6  EL ENLACE. DOGMA CENTRAL DE LA QUÍMICA

10  SÍNTESIS. LA HEROÍNA DE LA HISTORIA

13  QUÍMICA, FARMACIA Y… ¿QUÍMICA FARMACÉUTICA?

17  QUÍMICA VERDE

21  BIOCATÁLISIS
Contribuir a la sustentabilidad de los procesos químicos

Entrevista

26  ALEJANDO TORRES GAVILÁN

Ciencia y negocios. El nuevo pensamiento científico

32  QUÍMICA TEÓRICA Y QUÍMICA COMPUTACIONAL

La Química en lenguaje numérico

36  QUÍMICA: PILAR DE LA ECONOMÍA

Mito químico

38  LAS MICROONDAS Y SU MAL ENTENDIMIENTO

41  BIBLIOGRAFÍA

3
 EL PROPÓSITO DE LA CIENCIA QUÍMICA

EQUIPO QUIMIOFILIA

DIRECTOR GENERAL
EDITOR EN JEFE
José Domingo Rivera
información@quimiofilia.com

COMITÉ EDITORIAL

Fabiola N. de la Cruz Juan Emanuel Ortega

Doctora en Química. Estudiante del 8vo semestre de QFB,
Profesora Investigadora de la Universidad Tecnológica de
Universidad Autónoma de Coahuila. Guadalajara. Sus intereses se centran
fcruz@uadec.edu.mx en el desarrollo farmacéutico.
e_manuel_19@live.com.mx

DISEÑADOR DISEÑO WEB

Kenji Minami Mi Empresa Online
Minami.kenji@gmail.com http://www.miempresaonline.com.mx/
Linkedin.com/in/kenji-minami-41395b59

4
 EL PROPÓSITO DE LA CIENCIA QUÍMICA
COLABORADORES EN ESTE NÚMERO
ARTÍCULOS
Marco V. Mijangos
Candidato a Doctor por la UNAM
Su trabajo de tesis se centra en la síntesis
total de alcaloides.
viniciomili@gmail.com
Jaime Escalante
Profesor Investigador en la Universidad
Autónoma del Estado de Morelos, México.
Sus intereses son estrategias de síntesis con
microondas, mecanoquímica, enzimas y
ultrasonido. Ha dirigido más de 10 tesis
doctorales y publicado más de 60 artículos
en revistas internacionales.
jaime@uaem.mx
Cristina Gonzáles
Candidato a Doctor en Química en McMaster
University, Hamilton, Ontario, Canadá. Su
trabajo se centra en el desarrollo de métodos
teóricos con modelos de separación de
intervalos.
Regino Castro Grela
Maestro en administración químico-industrial.
Es experto en cotización, gestión y diseño de
servicios en instalaciones químicas a nivel
industrial y de laboratorios de investigación.
ingrcg@yahoo.com.mx
Telaraña Farmacéutica
Es un proyecto de divulgación de las ciencias
farmacéuticas de origen colombiano. Cuentan
con una app interactiva.
Edmundo Castillo
Profesor investigador en el Instituto de
Biotecnología de la UNAM, Nivel II del Sistema
Nacional de Investigadores. Ha publicado más
de 40 artículos en revistas internacionales. Ha
dirigido 3 tesis doctorales, 11 de maestría y 5 de
licenciatura.
edmundo@ibt.unam.mx
Filiberto Gutiérrez
Candidato a Doctor en Química por la
Universidad de Guadalajara, México. Su trabajo
se centra en la predicción de la actividad
biológica, síntesis y pruebas biológicas de
lignanos y sus análogos.
gutierrez@hotmail.com
5
EL ENLACE
DOGMA
CENTRAL DE
LA QUÍMICA
Contexto
 EL ENLACE. DOGMA CENTRAL DE LA QUÍMICA
P ara las personas no especializadas en el
mundo y el lenguaje de la química, pero in-
cluso para las que tienen una instrucción avan-
zada en ella, la percepción de ésta disciplina es
muy amplia y diversa. Y es que la definición de
ésta ciencia es muy sencilla: el conocimiento
necesario para transformar materia; sin embar-
go, el concepto que abarcan estas palabras es
amplio y complejo.
Siendo así, debe haber una idea fundamental
de la que surjan todas las construcciones de la
química y hacia dónde se pueda remitir cual-
quier manifestación científica que pretenda inte-
grarse a ella. Dicha idea es la Existencia del
Enlace, y es tan importante que muchos filóso-
fos de la Química la han llamado El Dogma
Central de la Química.
No pocos especialistas e incluso autoridades
del área considerarían que la química tiene co-
mo dogma la existencia del átomo como unidad
fundamental y mínima de la materia; sin embar-
go, cada vez mayor cantidad de estudiosos
consideran que este concepto, su definición y
estudio son competencia de la física. Si bien el
concepto de átomo y materia también son de
vital importancia para la química, pretender ex-
plicar un problema químico estudiando única-
mente la composición de una sustancia, resul-
taría para muchos químicos de la actualidad en
una absurda pérdida de tiempo.
La química en cambio, basa su desarrollo en
establecer cómo manipular las fuerzas que
mantienen a dos o más átomos unidos y la con-
secuencia de dicha interacción o manipulación:
la transformación de la materia.
El problema es que aún con lo claro que resulta
la distinción entre átomo y enlace, la definición
de éste último es una de las mayores dificulta-
des de la química y a lo largo de la historia, quí-
micos de toda clase de motivaciones y posibili-
dades lo han estado estudiando directa o
indirectamente.
El problema estriba en que hasta el momento
no existe un método con el que se pueda ob-
servar a un enlace directamente. Lo que se tie-
ne hasta ahora es un acervo de técnicas e ins-
trumentos para medir los fenómenos que deri-
van cuando dos átomos están a cierta distan-
cia, la variación en dichos fenómenos cuando
se quiere acortar o alargar esa distancia o
cuando se acerca o se aleja un tercer átomo de
ellos. Técnicas como Resonancia Magnética
Nuclear (RMN) permiten verificar si un átomo
de carbono tiene cerca a tres átomos de hidró-
geno, dos átomos de hidrogeno y uno de carbo-
no; un átomo de hidrogeno y dos átomos de
carbono o a tres átomos de carbono; a través
de miles de experimentos y la aportación de
miles de científicos se ha observado que cuan-
do se mide cada una de esas combinaciones
por RMN se tienen el mismo tipo de respuestas,
es así que ha sido posible proponer que lo que
se está midiendo son diferentes tipos de enla-
ce carbono-hidrógeno o carbono-carbono: es
por eso que la RMN es una técnica útil en el
descubrimiento de la conectividad estructural
de una sustancia orgánica.
Otros fenómenos que es posible asociar con el
cambio en un patrón de enlace entre átomos
pueden ser: cambios de color de la sustancias,
cambios de estado, generación o pérdida de
calor, cambio en una señal eléctrica –por ejem-
plo, el cambio en el valor de pH en un potenció-
metro significa que dos átomos que tienen aso-
ciaciones iónicas las están modificando cuando
entran en solución o cuando una tercera espe-
cie interacciona con ellos– o cambio en una
función biológica. Al observar que las medicio-
7
 EL ENLACE. DOGMA CENTRAL DE LA QUÍMICA
nes de dichos fenómenos son constantes, se
puede sugerir que se deben a la interacción
entre los átomos que componen a la sustancia
y que dichas interacciones son enlaces.
Actualmente el estudio, la comprensión y la uti-
lidad del concepto de enlace se han diversifica-
do a tal grado, que es posible entender, expli-
car y manipular todos los fenómenos del mun-
do natural y responder a las preguntas: ¿cómo
formarlo o romperlo? ¿qué tan fácil es hacerlo?
y ¿cuánto tardará el proceso?
La primera pregunta la responde la Teoría
Ácido-Base, la cual estudia la forma de romper
y formar enlaces y las condiciones para que
esto suceda. La segunda pregunta la responde
la Termodinámica Química al establecer qué
tanta energía se necesita para romper o formar
un enlace y que tan estable será la sustancia
que se obtendrá; además de que establece el
grado de avance de una reacción y cómo
manipularlo. En la práctica cotidiana es difícil
advertir cual de estas dos disciplinas se está
aprovechando más al resolver un problema, ya
que están estrechamente relacionadas.
La limitante de la teoría ácido-base y de la ter-
modinámica es que no establecen qué tan rápi-
do se llevarán a cabo los fenómenos que estu-
dian y exactamente con qué mecanismo, ahí
donde interviene la Cinética Química, la cual
estudia qué tantos enlaces se rompen o se for-
man por unidad de tiempo y si son de diferente
tipo, en qué orden.
Asimismo, durante el abordaje de algún
cuestionamiento básico o tecnológico de la
química, siempre se vuelve necesario recurrir a
estas tres disciplinas para formarse una idea
clara del problema y obtener resultados
apropiados para su resolución.
8
Derivado de estas tres disciplinas fundamenta-
les en la química y de sus colaboraciones
mutuas, es que se han construido teorías, des-
cubrimientos y desarrollos tecnológicos que
brindan beneficios y comodidades a la socie-
dad y sobretodo han aportado grandes co-
nocimientos a nuestro entendimiento de la na-
turaleza. También, derivado de ellas tres es que
se ha estructurado la enseñanza y academiza-
ción de la química en lenguajes, simbologías y
líneas de entendimiento.
En la actualidad no hay problema científico que
no tenga que recurrir al lenguaje de la química
o que no se haya beneficiado de su legado y
mejor aún, la química cada vez interactúa más
y mejor con otras áreas del conocimiento.
Es importante reconocer que las tres disciplinas
fundamentales tienen como base de desarrollo
y entendimiento a la Mecánica Cuántica. Es a
este nivel dónde la distinción entre la química y
la física se vuelve muy difuso y pretender incli-
narse por una en particular no pasa de ser un
infructífero ejercicio intelectual.
La definición del concepto de enlace sigue
siendo un problema central en la química en el
que aún quedan más preguntas confusas que
respuestas satisfactoria, es nuestra responsa-
bilidad como usuarios de la química, emplear
apropiadamente cada descubrimiento y término
nuevo para aportar evidencia de su utilidad en
el Dogma Central de la Química
 EL ENLACE. DOGMA CENTRAL DE LA QUÍMICA

EL DOGMA CENTRAL DE LA QUÍMICA

TECNOLOGÍA

ELUCIDACIÓN DE
FÁRMACOS MATERIALES CELDAS
PROCESOS
CIENCIA
BIOLÓGICOS
APLICADA

BIOQUÍMICA
SÍNTESIS BIOLOGÍA MOLECULAR
SÍNTESIS BIOFARMACIA ELECTROQUÍMICA
ASIMÉTRICA ÁREAS DE
FARMACOCINÉTICA
LA QUÍMICA

QUIMICA ANALÍTICA

VELOCIDAD DE REACCIÓN
ESTEREOQUÍMICA EQUILIBRIO QUÍMICO CINÉTICA ENZIMÁTICA

CIENCIA ENERGÍA DE ENLACE MECANISMOS

ENERGÍA DE ACTIVACIÓN DE REACCIÓN FISICO-
BÁSICA QUÍMICA

TEORÍA ÁCIDO-BASE TERMODINÁMICA CINÉTICA

ENLACE • QUÍMICA CUÁNTICA

• QUÍMICA TEÓRICA
TEORÍA ATÓMICA TEORÍA ESTRUCTURAL

MECÁNICA CUÁNTICA

Visión desde la Visión desde la

investigación academia

9
SÍNTESIS
ORGÁNICA
La heroína de la historia
Por Marco V. Mijangos
A finales de los años 80’s, los químicos del
Instituto Nacional del Cáncer (National
Cancer Institute) en Estados Unidos tomaron 14
toneladas – el peso de dos elefantes africanos–
de una planta marina conocida como Bugula
neritina y aislaron 18 gramos –el peso de dos
monedas– de Briostatina 1, un compuesto que
se perfiló como un prometedor agente de prime-
ra clase para el tratamiento de enfermedades
como el VIH/SIDA, el cáncer y la enfermedad
de Alzheimer.
El problema surgió cuando se exploró la posibi-
lidad de llevar a cabo estudios con esa cantidad
de compuesto, ya que para fines prácticos re-
sultaba ser muy poco y obtenerlo a gran escala
a partir de sus fuentes naturales causaría daños
significativos al ecosistema y expondría a la
extinción al organismo que lo produce. Así, la
Briostatina 1 se incorporó a la larga lista de sus-
tancias de alto interés para la humanidad, pero
que su aplicación se ha visto obstruida por su
baja disponibilidad en la naturaleza.
 SÍNTESIS ORGÁNICA
Pensando en la resolución de este dilema fue
que a finales del siglo XIX toda una generación
de científicos ideó una premisa: Construir a las
sustancias en lugar de obtenerlas de fuentes
naturales. Esto dio paso a la actividad química
por excelencia: La Síntesis Química.
La Síntesis Química –o Síntesis– es la discipli-
na química que se dedica al estudio sistemático
de la construcción de sustancias complejas,
mediante la transformación de moléculas más
simples y de fácil obtención, económica o am-
biental. En otras palabras, es el sueño hecho
realidad de los antiguos alquimistas, la obtén-
ción de una sustancia de alto valor, a partir de
otras muy baratas.
Hoy en día, los científicos practicantes de la
síntesis buscan la obtención de sustancias quí-
micas complejas con estructura tridimensional y
funcionalidades precisas, utilizando –y descu-
briendo– principios fundamentales de reactivi-
dad para diseñar reacciones que generen el
producto deseado de manera rápida, eficiente y
con el mínimo impacto ambiental.
En 2017 fue posible obtener Briostatina 1 vía
síntesis química, dando una alternativa para su
abastecimiento sin necesidad de aventurarse al
fondo del mar y facilitando su futura aplicación
en la medicina.
Es grato decir que no solamente la medicina ha
sido beneficiada por esta ciencia. La síntesis ha
generado desde productos agroquímicos y de
control de plagas, plásticos y gomas, pigmentos
para ropa, pinturas, perfumes y aditivos en ali-
mentos, hasta las moléculas que iluminan las
pantallas de nuestros teléfonos celulares.
Esta gama de beneficios hace parecer que la
síntesis es una ciencia madura, sin embargo,
aun en estos días sintetizar una molécula com-
pleja requiere muchos recursos y de un gran
esfuerzo. Los químicos sintéticos siguen bus-
cando nuevas formas de armar moléculas que
permitan proveer cualquier sustancia útil para la
humanidad y que esto sea tan fácil como pre-
parar unos huevos revueltos. Con trabajo duro
y creatividad este ideal algún día será posible.
HOY EN DÍA ES DIFÍCIL MIRAR
ALGO DONDE LA SÍNTESIS NO
HAYA TENIDO UN IMPACTO
MUY AMPLIO, NO POR NADA
ES LA ACTIVIDAD QUÍMICA
POR EXCELENCIA
Algunos datos de la síntesis orgánica
Se ha calculado que en el mundo existen al-
rededor de 30 millones de sustancias recono-
cidas en el Registro CAS y 50 millones regis-
tradas en el buscador SciFinder, las cuales han
sido identificadas, proporcionadas o fabricadas
por 500 compañías y 2200 universidades.
Jonathan Goodman de la Universidad de
Cambridge contabilizó que para Octubre de
2017 existían 279 revistas especializadas en
síntesis orgánica.
Para 2017 las búsquedas especializadas en el
portal de la American Chemical Society ronda-
ron los 27 millones de visitantes. Esta pres-
tigiosa revista publicó alrededor de 40 mil
artículos ese año. Únicamente en esta asocia-
ción se hacen hasta 181 millones de revisiones
de resúmenes de artículos por año.
11
Fabricante de vidriería
para laboratorios e
industrial Detlix
Belisario Domínguez No. 1202, Colonia Independencia, Guadalajara, Jalisco, México
Telefono: 36 37 24 97, 36 99 62 03 . Móvil: 3314084890 ventasdetlix@gmail.com
Cotizaciones y envíos a México, Centro y Sudamérica
QUÍMICA, FARMACIA Y
¿QUÍMICA
FARMACÉUTICA?

Por Telaraña Farmacéutica

 QUÍMICA, FARMACIA Y ¿QUÍMICA FARMACÉUTICA?

L a química está en todo y en todos. Nuestro

entorno y nuestro interior se encuentran en
un proceso constante de transformación a base
de reacciones químicas que a veces no
percibimos y muchas de las cuales aún no
conocemos. Existen sin embargo algunas
transformaciones que si percibimos, ya sean
porque algún agente externo las ocasionó o
porque las funciones normales dejaron de serlo,
esas transformaciones cambian las funciones
normales de nuestro organismo y las
conocemos como enfermedades.
Una de las primeras manifestaciones de la quí-
mica desde hace decenas de siglos, se encargó
de estudiar y entender dichos procesos anóma-
los con el afán de revertirlos o prevenirlos –la
segunda manifestación inicial de la química fue
la de intentar obtener oro a partir de cualquier
sustancia o cosa–.
Una de las anécdotas más reconocidas acerca
del raciocinio de las funciones anómalas de un
ser vivo, la protagonizaron los gemelos Cosme
y Damián, nacidos en Arabia alrededor del si-
glo III d.C. Estos hermanos, después de apren-
der medicina en Siria se trasladaron a Roma
para curar cualquier enfermedad en el nombre
de Dios, tanto en hombres como animales.

En poco tiempo el éxito y efectividad de los mé-

todos de los gemelos fue tal que cientos de per-
sonas ocupaban de sus servicios, por lo que
repartieron sus labores, siendo Cosme el que
se dedicaba a diagnosticar las enfermedades y
Damián el que realizaba los preparados medi-
camentosos para administrarlos como trata-
miento preventivo o correctivo.
La importancia y distinción de estas dos activi-
dades generó en los años siguientes tal grado
de especialización y diferenciación entre ambas
actividades, que en el siglo XII el Emperador
Federico II aprobó El Edicto de Palermo,

14
QUÍMICA, FARMACIA Y ¿QUÍMICA FARMACÉUTICA?

un documento escrito por el boticario Pier Delle

Vigne en donde se distingue la independencia
de la actividad farmacéutica de la médica. A
partir de entonces nació la actividad científica
más influyente de y para la humanidad y hacia
la que todos los esfuerzos de la química de-
sean ser de utilidad –La Farmacia –.

En el campo farmacéutico se estudian las en-

fermedades y los procesos químicos que las
caracterizan para así elegir o diseñar los acti-
vos químicos que ayudarán a eliminar o reorde-
nar dichos procesos. El farmacéutico ha adap-
tado y contribuido a enriquecer las disciplinas
fundamentales de la química en su quehacer
diario. Desde conocer qué tanto activo necesita
y con qué frecuencia administrarlo (posología),
hasta las condiciones y sustancias que ayuda-
rán a que cumpla su objetivo (biofarmacia). De-
rivadas de fundamentos químicos y físico-
químicos es que han nacido disciplinas como la
Farmacocinética, la Biofarmacia o conocimien-
tos como el metabolismo de fármacos.
La Química Farmacéutica es uno –o quizá el
único– de los ejemplos de actividad científica
que se ha industrializado a niveles que influyen
directamente en la sociedad en el sentido eco-
nómico, laboral, sanitario y académico.
Ya sea como Farmacéuticos, Químicos Farma-
céuticos, Químicos Farmacéuticos Biólogos,
Químicos Farmacéuticos Industriales, Químicos
Farmacéuticos Biotecnólogos, Químicos Far-
macéuticos Parasitólogos, Farmacéuticos In-
dustriales o Bioquímicos Farmacéuticos, los
profesionales de la farmacia han hecho un
aporte mayúsculo a las actividades de la quími-
ca y a la humanidad en general, y hoy en día si-
guen colaborando con otros especialistas de
diversas disciplinas para generar más y mejo-
res conocimientos y tratamientos que contribu-
yan al estado de salud de las personas.

15
 QUÍMICA, FARMACIA Y ¿QUÍMICA FARMACÉUTICA?
8 DISCIPLINAS FARMACÉUTICAS
Biofarmacia
El estudio de cómo
diseñar los preparados
farmacéuticos para ser
administrados
Farmacología
El estudio de cómo los
fármacos afectan a los
sistemas biológicos
Farmacognosia
La forma de extraer
fármacos de fuentes
naturales
Farmacodinámia
La interacción entre
los fármacos y los
receptores biológicos
Tecnología
Farmacéutica
Principios fisicoquímicos e
ingenieriles de la fabricación
de medicamentos
16
Farmacogenómica
Las bases genéticas de la
actividad farmacológica
Farmacocinética
Qué tan rápido pasa un
fármaco por el cuerpo y
qué cambios sufre
Farmacia Clínica
Investigación y diseño de cómo
responde la población a los
tratamientos
Química Farmacéutica
La forma químico-sintética
de diseñar y obtener un
fármaco
Farmacoeconomía
Investigación y estudio del uso
en masa del conocimiento y
productos farmacéuticos
QUÍMICA VERDE
Por Jaime Escalante

17
 QUÍMICA VERDE
E n la literatura existen muchas definiciones para
Química Verde –Green Chemistry, por sus siglas en
inglés, Química Sostenible o Sustentable–. Una de las
mas apropiadas sería: Es el diseño, desarrollo e imple-
mentación racional de sustancias o productos y procesos
químicos que reduzcan o eliminen el uso y generación de
compuestos peligrosos para el medio ambiente y por tanto
para la sociedad en general.
El objetivo de la Química Verde es la prevención de con-
taminantes desde su origen, es decir desde el diseño de
un producto comercial o de una sustancia y su fabricación
a nivel de laboratorio o industrial. Dicho proceso debe ser
seguro para las personas y generar un mínimo de subpro-
ductos dañinos para la salud y el ambiente. Cumpliendo
estas premisas es que se pueden reducir además los cos-
tos económicos del proceso.
La filosofía de la Química Verde fue propuesta en 1998
por Anastas y Warner y desde entonces sus doce princi-
pios han revolucionado drásticamente la forma en que se
trabajan y planean las reacciones tanto a nivel de labora-
torio de ciencia básica como en la industria química a
nivel comercial.
Las áreas en las que se aplican estos principios incluyen
el uso de nanomateriales, especialmente en la industria
medicinal y farmacéutica. En procesos de síntesis orgá-
nica que buscan reducir el impacto ambiental reempla-
zando reactivos que se emplean en cantidades estequio-
métricas por catalizadores. También en combustibles
automotrices que usan catalizadores para una buena
combustión y una baja emisión de contaminantes gaseo-
sos a la atmósfera.
18
Un campo con un uso notable de los doce
principios es la Biocatálisis. Con el uso de
enzimas en lo que se hace llamar la quími-
ca fina, se encuentran ventajas como
quimio-, enantio- y regioselectividad y con-
diciones de reacción suaves. Se evitan eta-
pas de protección y desprotección de gru-
pos funcionales en síntesis, logrando rutas
de transformación más cortas y por lo tanto
la generación de menos subproductos.
Otro ejemplo es la Ingeniería de Disolven-
tes. Ésta busca el diseño de estrategias que
racionalicen el uso de disolventes conven-
cionales, además del desarrollo de di-
solventes verdes que reduzcan o eliminen
el uso de los empleados tradicionalmente
en síntesis orgánica y organometálica.
Aunado a lo anterior, el uso de tecnologías
limpias y más amigables con el medio
ambiente está siendo bien recibida por
muchos laboratorios, con el fin de reducir el
consumo de energía. Ejemplo de esto es el
uso de las microondas, la mecanoquímica,
la sonoquímica y la irradiación ultrasónica.
Así, los doce principios y desarrollos tecno-
lógicos de la Química Verde actualmente se
empiezan a implementar en la investiga-
ción para tener efectos de prevención am-
biental en el planeta y de cambio de prin-
cipios éticos y de ejercicio profesional en
nuestras futuras generaciones.
 QUÍMICA VERDE

Los 12 Principios de
la Química Verde

Prevención. En un proceso químico es Materias primas renovables. Las

1 mejor evitar la generación de un subproducto
–residuo– que tratar de limpiarlo una vez que
7 materias primas deben ser renovables así co-
mo los productos y subproductos de los pro-
se haya generado. cesos químicos deberán de ser reutilizados
siempre que sea económicamente viable.

Economía atómica. Los métodos de Reducción de intermediarios de

2 síntesis deben diseñarse de manera que in-
corporen al máximo, en el producto final, to-
8 reacción. Muchas rutas sintéticas son muy
largas, pero si se hace un diseño apropiado,
dos los materiales usados durante el proceso, se evitarán derivados como los grupos de
minimizando la formación de subproductos protección/desprotección.

Potenciación de la catálisis. Se
3 Productos menos tóxicos. Siempre
que sea posible, las rutas sintéticas deberán
diseñarse utilizando sustancias que tengan
9 preferirá el uso de procesos catalíticos ya que
estas condiciones casi siempre son mejores
que los procesos estequiométricos.
poca o ninguna toxicidad, tanto para el hom-
bre como para ambiente.

Compuestos seguros. Los productos

4 químicos deberán diseñarse para lograr
mantener su eficiencia y reducir su toxicidad.
10
Productos biodegradables. El di-
seño y producción de sustancias preferen-
temente deberá ser biodegradable, es de-
cir, aptos para ser consumidos en un tiem-
po corto por microorganismos o plantas.

5 Menos disolventes y auxiliares

químicos. Se evitará, en lo posible, el uso
de sustancias que no sean necesarias como
11
disolventes, reactivos para llevar a cabo se-
paraciones, etc., y en el caso de que se utili-
cen que sean lo más inocuos posible.
Métodos analíticos de monito-
reo inmediato. Las metodologías ana-
líticas serán desarrolladas para permitir un
monitoreo y control del proceso en tiempo
real, con la finalidad de controlar la forma-
ción de sustancias peligrosas.

Eficiencia energética. El uso de fuen- Minimizar los accidentes quí-

6 tes energéticas deberá evaluar su impacto
ambiental y económico, y deberán minimizar-
12
se. Se prefieren procesos que se puedan lle-
var a cabo a temperatura y presión ambiente.
micos. Desarrollar una cultura de ejer-
cicio de la química más segura respecto a
la emisión de contaminantes, incendios,
derrames y explosiones.

19
 Posgrado en
Ciencias Químicas
Universidad Autónoma del Estado de Morelos
Centro de Investigaciones Químicas

jaime@uaem.mx
BIOCATÁLISIS
Contribuir a la sustentabilidad de
los procesos químicos existentes
Por Edmundo Castillo
F ue Jöns Jakob Berzelius, uno de los pilares
de la química moderna –junto con Dalton,
Lavoisier y Boyle– quién introdujo en 1836 el
término fuerza catalítica o catálisis. El término
sirvió para describir reacciones que aumenta-
ban su velocidad por efecto de sustancias pre-
sentes en el medio y que al final del proceso
permanecían inalteradas, los catalizadores.
 BIOCATÁLISIS
Debido probablemente a sus estudios en medi-
cina, Berzelius relacionó a la catálisis con pro-
cesos biológicos, pensando que debería haber
sustancias que sostuvieran las funciones vi-
tales sin tomar parte en ellas. ¡No estaba equi-
vocado!; en 1876 Khüne reforzó esa idea al
estudiar los componentes funcionales de una
levadura y emplear el término enzima para re-
ferirse a algunos de ellos. Dos años más tarde
Traube reconoció a estos componentes como
sustancias químicas formales –responsables
de la catálisis, al menos en sistemas vivos–.
Es así que a partir de estos trabajos inicia una
fructífera producción de información y datos
que colocaron a las enzimas en la mira de la
ciencia. Se destacan en 1894 los trabajos de
Emile Fischer y sus Reglas Estereoquímicas
descubiertas en enzimas o los descubrimientos
de Eduard Buchner en 1897 en donde propone
que las fermentaciones pueden suceder fuera
de una célula, contradiciendo completamente a
la vigente Teoría Vitalista.
Es importante subrayar que la catálisis en sis-
temas vivos se respaldó siempre en elementos
fundamentales de la química para poder expli-
car dichos descubrimientos. Pronto se supo
que una enzima contiene funciones alcalinas y
ácidas y que sus transformaciones correspon-
den en muchos casos a mecanismos de
reacción clásicos de sistemas no biológicos. De
hecho, los mismos Michaelis y Menten, conoci-
dos por su descripción matemática del compor-
tamiento cinético de las enzimas, se basaron
en la Cinética Química para proponer un mode-
lo matemático de la hidrólisis de sacarosa
catalizada por la enzima invertasa.
Únicamente entendiendo sus propios procesos
y dándole una categoría científica a sus aporta-
ciones, durante mucho tiempo la enzimología
22
no brindó un beneficio palpable y confiable a
las actividades de la química tradicional. Sin
embargo, esta idea cambiaria cuando en 1977,
los descubrimientos del grupo del Alexander
Klibanov en el Instituto Tecnológico de
Massachusetts (MIT) estableció la posibilidad
de utilizar a las enzimas en medios no acuosos,
inaugurando lo que para muchos es la nueva
área de la química, La Biocatálisis aplicada a la
síntesis orgánica.
Pese al escepticismo con el que muchos ven a
la biocatálisis, ésta ha dado una nueva visión a
las actividades y objetivos de la química. Si
bien, en la actualidad su impacto se ha orienta-
do mas a refinar los métodos ya existentes en
la química y menos a la obtención de compues-
tos novedosos, el uso de biocatalizadores en
síntesis muestra aún un terreno muy fértil de
aplicación. Uno de los aspectos donde la bio-
catálisis ha sido determinante, es en el contri-
buir a la sustentabilidad de los procesos quími-
cos existentes; la biocatálisis brinda procesos
más limpios, rápidos y eficientes, lo cual de
forma clásica es difícil de alcanzar o resolver.
Ya no es desconocido que una síntesis enzimá-
tica se puede planear y manipular como cual-
quier síntesis química clásica. Actualmente,
buena parte de los métodos y productos de sín-
tesis se pueden obtener con una enzima y más
aún, así es como muchos productos que antes
no existían ahora son posibles.
Una característica de las enzimas es que cuan-
do se emplean fuera de un organismo vivo pue-
den catalizar reacciones para las que no fueron
diseñadas. Esta propiedad, conocida como pro-
miscuidad catalítica ha permitido utilizar enzi-
mas para reacciones muy costosas, muy lentas
o prácticamente imposibles de realizar.
 BIOCATÁLISIS

60% Desde el punto de vista económico, la biocatá-

Fármacos, esencias, saborizantes lisis es uno de los mercados más crecientes de
15% los últimos 60 años. Interviniendo en la pro-
Especialidades químicas: Precursores ducción de combustibles, fármacos, textiles,
de fármacos, estándares, monómeros pieles, alimentos, papel, energía, metales y
procesando desechos, para 2010 la industria
15% química generó 20% de sus ingresos con enzi-
Detergentes y sanitizantes, enzimas mas. Uno de los mejores ejemplos es la gluco-
para procesar productos como piel sa isomerasa, cuya demanda en 1975 era de
500 kilogramos anuales y aumentó hasta 10
millones de toneladas anuales para 2007. Otro
6% ejemplo de éxito es Novozymes Inc., el actual
Polímeros líder en comercialización de enzimas en el
mundo. Fundada en 1950, en sus primeros
4% cuatro años cotizaba sus ingresos en $50 MDD
Otros anuales y para 2003 ya había alcanzado la
suma de $1000 MDD; para el 2008 su mercado
se estimaba ya en los $2000 millones de euros.
Estos avances han sido posibles gracias a la
producción de proteínas recombinantes y a la
ingeniería de proteínas, disciplinas de bio-
tecnología desarrolladas en los últimos 30
años. Estas disciplinas se encargan del aisla-
miento, caracterización, producción y mejora-
miento catalítico de las enzimas. De esta forma
en los últimos años los biocatalizadores se han
vuelto menos costosos y han ampliado sus
aplicaciones. Se estima que en la naturaleza
existen 25 mil enzimas, de las cuales 3700 ya
han sido estudiadas y caracterizadas, por lo
que la era de la enzimología apenas asoma su
potencial.
El avance de la biocatálisis y la importancia de
la bioquímica son tales que no existe actual-
mente ningún problema de síntesis química
€ 1000 millones que no considere, al menos en el papel, a las
Enzimas con propósitos industriales enzimas para ser resuelto. Más aún, no existe
área de la química que no se vea cuestionada
€ 600 millones si sus aportaciones o afirmaciones teóricas o
Enzimas para preparar alimentos experimentales no coinciden o contribuyen con
el comportamiento de los sistemas biológicos.
€ 200 millones
Enzimas para enriquecer alimentos

23
 Instituto de El grupo de
Biotecnología Biocatalisis del
IBT-UNAM
UNAM Convoca a estudiantes de
licenciatura, maestría y
Doctorado a integrarse
como tesistas
edmundo@ibt.unam.mx

Líneas de Investigación
• Síntesis orgánica con enzimas
• Ingeniería de disolventes
• Fisicoquímica de sistemas enzimáticos
• Diseño y caracterización enzimática
• Mecanismos de reacción enzimática

El grupo cuenta con

- Promedio de 6 publicaciones al año
- Respaldo de líneas de investigación con
cálculos computacionales
- Equipo analítico y de caracterización
experimental
- Técnicos especialistas en el manejo de técnicas y equipos
- Colaboraciones con grupos de síntesis orgánica, fisicoquímica,
química computacional y desarrollo industrial
- Programas inscritos al Padrón Nacional de Posgrados Conacyt
 CAPSAICINOIDES

Hot spicy molecules for food, medical and

self-defense industry

Design • Development • Production

alejandro.atg@appiedbiotec.com
 LA HISTORIA ALREDEDOR DE LA QUÍMICA

ALEJANDRO CIENCIA Y
TORRES NEGOCIOS,
EL NUEVO
PENSAMIENTO
GAVILÁN CIENTÍFICO
Entrevista
 ALEJANDRO TORRES GAVILÁN
Con una personalidad alegre y jovial,
es difícil imaginar que Alex es un cien-
tífico escrupuloso y metódico cuando
se trata del trabajo experimental y la
elección de datos; más aún cuando los
traslada a una aplicación tecnológica.
Su interesante pensamiento y forma
de trabajo representan un nuevo estilo
de ejecución científica, la de sacar el
conocimiento de los laboratorios lo an-
tes posible y aplicarlo para lo que fue
diseñado originalmente.
Estamos seguros que esta entrevista
más que una anécdota interesante se
va a convertir en una enriquecedora
lección para científicos y no científicos.
EL PROYECTO
Applied Biotec S.A. de C.V. es una empresa de reciente crea-
ción que integramos Omar Piña Barraza, Cinthia Ávila
Domínguez y Alejandro Torres Gavilán. Esta empresa se gene-
ró como un spin-off del Instituto de Biotecnología de la UNAM.
En Applied Biotec contamos con una plataforma enzimática
perteneciente al concepto de biotecnología verde. Producimos
una amplia variedad de capsaicinoides, los compuestos
responsables del efecto pungente o sensación picante de los
chiles. Estos compuestos tienen aplicaciones tecnológicas y
comerciales como el gas pimienta y cremas analgésicas, pero
nosotros buscamos expandir el potencial de estos compuestos
en repelentes orgánicos para plagas del campo, la conserva-
ción de granos para cosecha, recubrimiento de cables para
evitar las mordeduras de roedores y como aditivos en pinturas
marinas antivegetativas.
27
 ALEJANDRO TORRES GAVILÁN
¿En qué consiste una jornada de un
científico empresario?
Nuestra atención se centra en buscar aliados
para el desarrollo de las tecnologías y aplica-
ción de los capsaicinoides. Buscamos empre-
sas interesadas en darle un valor agregado a
sus productos (cables, pinturas marinas o re-
pelentes del campo). Así, nuestro día a día se
compone de entrevistas con empresarios o
gerentes de investigación y desarrollo de esas
empresas, para explorar negocios rentables
con una orientación sustentable.
En Applied Biotec, concientizamos sobre los
daños generados por los compuestos tóxicos
recalcitrantes empleados en el campo o el uso
de metales y biocidas en las pinturas ma-
rinas. Nuestro esfuerzo se dirige a convencer
sobre los beneficios de la biotecnología como
herramienta para solucionar problemas de
salud y en los ecosistemas.
28
Las empresas del ramo son gigantescas y
están altamente equipadas. Es raro, al
menos en México, ver a un emprendedor
científico del área química ¿Cómo
decidiste iniciar este proyecto?
Una de las razones por las que emprendí es
el convencimiento de que los desarrollos ge-
nerado en los centros e institutos de investiga-
ción tienen un gran potencial para contribuir
con el desarrollo económico de México. Es
triste y lamentable que grandes avances en la
ciencia se queden almacenados en las bitá-
coras, artículos o publicaciones, cuando pue-
den generar riqueza mediante la aplicación de
ese conocimiento, particularmente en la solu-
ción de problemas que atañen a la industria.
El trayecto del conocimiento desde la in-
vestigación hasta un producto comercial
inicia en una universidad y culmina en una
empresa transnacional ¿Crees que repre-
sentas una segunda modalidad de flujo de
conocimiento?
La modalidad en la que Applied Biotec se ha
aventurado tiene implícito un alto riesgo. Es
decir, es una tecnología en una etapa tempra-
na de desarrollo y su aplicación en ambientes
reales se encuentra en pruebas de validación.
Es difícil que una transnacional o una empre-
sa consolidada apueste por este tipo de desa-
rrollos y los casos en los que lo hacen son
escuetos –hasta ahora no conozco uno–.
Normalmente, esas empresas buscan desa-
rrollos maduros, probados y con patente licen-
ciable o transferible para así explotar su co-
mercialización. He de decir que en este
esquema, el mayor beneficio económico se lo
lleva la empresa y poco permea o se derrama
a la universidad, centro o instituto donde se
concibió la tecnología.
 ALEJANDRO TORRES GAVILÁN
Dicen que es más difícil mantenerse que empezar.
¿Cómo se sostiene tú proyecto?
Existe algo conocido como el Valle de la Muerte en
donde muchos proyectos decaen o quedan abando-
nados por diferentes causas. El proyecto ha tenido
distintas fuentes de financiamiento en las que hemos
encontrado satisfacciones y beneficios, así como sa-
crificios y decepciones. Actualmente Applied Biotec
opera con el mínimo indispensable –nadando de
muertito– en la búsqueda de aliados interesados en la
explotación comercial de la tecnología. Los fondos
públicos nos han servido para la maduración de la
tecnología y ahora estamos en la búsqueda de capital
privado para la comercialización.
EL VALOR DEL
TRABAJO
DEPENDE DEL
PROBLEMA QUE
SE RESUELVE O LA
CONTRIBUCIÓN
QUE SE HACE
¿Cómo sabes cuánto cuesta tú trabajo?
Aún no le sé. Creo que la mejor forma de
responder a esta pregunta es que el valor
del trabajo depende del problema que se
va a resolver o de la contribución que uno
hace. Como emprendedor, aunque uno
sabe que el trabajo que estás realizando
debería tener una mayor remuneración, es
uno de los sacrificios o inversiones que
nos toca hacer. Es decir, uno tiene que in-
vertir su propio sueldo por el bien del em-
prendimiento con el objetivo de que el ne-
gocio o la empresa empiece a funcionar.
Estamos convencidos de que el
crecimiento económico del país,
solo se verá acelerado al basar la
generación de riqueza en una
economía del conocimiento.
29
 ALEJANDRO TORRES GAVILÁN
Cuando buscas que alguien invierta o
consuma tus servicios ¿qué le dices? ¿Cómo
le vendes ciencia a alguien que no la conoce?
Por un lado, a los inversionistas poco les interesa
conocer los aspectos técnicos; en cambio, los
académicos somos muy dados a presumir nues-
tra tecnología y por lo tanto existe una brecha
que se tiene que acotar. Por otro lado, los inver-
sionistas o empresarios tradicionales esperan un
retorno monetario al siguiente día de haber rea-
lizado la inversión, cosa que normalmente o defi-
nitivamente no sucede con emprendimientos de
base tecnológica como el nuestro. En este senti-
do, es importante aprender a hablar en el idioma
de los negocios y sobre todo, concientizar a los
inversionistas o consumidores sobre los hitos en
el desarrollo del negocio o emprendimiento.
Supongo que no tienes muchos competidores
comerciales, ¿a qué te enfrentas entonces o
qué te motiva a mejorar?
¡Lo que más me motiva es demostrar que se
puede! Que la ciencia que se genera en el país
puede contribuir al desarrollo de México y que no
es necesario importar tecnología. Para mi es im-
portante conocer el camino completo, desde el
laboratorio hasta la industria.
Con el conocimiento adquirido sobre cómo gene-
rar una empresa creo que puede abrir el camino
para empezar a “sacar” a otras tecnologías gene-
radas en México, que ahora están estacionadas
en las bitácoras, artículos y publicaciones acadé-
micas y que sin embargo tienen mucho potencial.
30
¿Cuáles son las cosas que ya no harías?
Confiar demasiado en la tecnología. Los aca-
démicos tendemos a creer que nuestra tecno-
logía es la mejor, que el mercado está espe-
rándonos y que es la solución que desde años
se ha buscado. Sin embargo, cuando salimos
del laboratorio nos damos cuenta que no es
así y que las prioridades del mercado son otras
o bien que cuesta mucho trabajo insertar una
tecnología nueva en el mercado.
Como desarrolladores de tecnología no enten-
demos o no conocemos muchos aspectos de
la comercialización por lo que el valle de la
muerte a veces resulta insuperable.
Otro error es malbaratar la tecnología y entre-
garla al primer inversionista dispuesto a capi-
talizar el desarrollo. Cuando inicié mi proyecto
no busqué diferentes socios inversionistas y
me fui con el primero que me presentaron, al
cual no logré concientizar sobre los hitos del
proyecto y la inversión necesaria para supe-
rarlos. Supongo que él sintió que yo lo veía co-
mo alcancía infinita y yo me sentí sin el apoyo
empresarial que requería para el desarrollo
exitoso del negocio.
El tercer error que no cometería es considerar
a los apoyos federales como a fondo perdido.
Somos dados a desvalorizar lo que no nos
cuesta y los apoyos federales no son la excep-
ción. Es importante internalizar que los apo-
yos federales provienen de nuestros impuestos
y que debemos retribuir al país el capital
invertido.
 ALEJANDRO TORRES GAVILÁN
¿Qué hubieras hecho antes o mejor?
Una de las cosas que hubiera hecho antes es iniciar
el emprendimiento en cuanto desarrollé la tecnolo-
gía ya que me tardé un tiempo en explorar la posi-
bilidad de generar un negocio con lo que había en-
contrado durante el desarrollo.
Aunque en ese entonces el ecosistema de empren-
dimiento estaba aún en gestación o bien, no había,
creo que me tardé en interiorizar la idea de que los
desarrollos científicos deben buscar la manera de
transformarse en ciencia aplicada y contribuir con el
crecimiento económico del país.
Otro aspecto que también hubiera hecho antes y
que también me llevó tiempo es la apropiación de la
tecnología. En ello me refiero a sentir como propia la
tecnología que estaba desarrollando. Como es-
tudiantes de maestría o doctorado creemos que la
tecnología es del investigador principal o tutor cuan-
do en realidad es de ambos. En este sentido, yo
esperaba que mi tutor fuera el que buscara la apli-
cación de la tecnología cuando en realidad, debí ser
yo desde el inicio.
La tercera es haber explorado mejor el mercado
potencial de la tecnología y centrarme a conocer
otros aspectos del negocio que no están relaciona-
dos con la tecnología.
ALEJANDRO TORRES
Doctor en ciencias por la UNAM
Es especialista en enzimología,
biocatálisis e ingeniería de
disolventes.
Con Applied Biotech ganó en 2017 el
cuarto lugar en Cleantech Challenge
México, otorgado por
Greenmomentum
¿Crees que tú formación científica ha
beneficiado al proyecto?
La formación que he recibido me ha enseñado
una cosa fundamental en mi vida profesional y
eso es a estructurar el pensamiento. En la vida
como investigador siempre planteamos una
hipótesis, las actividades para demostrarla y los
resultados que esperamos validan o rechazan
esas suposiciones. Así, en cualquier ejecución
trato de hacer el mismo proceso.
Muy relacionado con la pregunta anterior, en
términos prácticos el conocimiento científico que
he adquirido me ha servido bastante, sobre todo
en sentido de siempre estar buscando mejoras al
proceso o nuevas tecnologías o alternativas
dentro de la biotecnología.
¿Cómo cambiaste tú mentalidad para
progresar en tú proyecto?
El cambio de mentalidad es progresiva y más
que un cambio creo que es una adaptación de la
manera de pensar. Los lapsos de tiempo que tie-
ne la academia son muy distintos a los negocios
y adaptarme a ello me ha costado trabajo. Como
investigador buscas un resultado casi perfecto,
en donde las dudas no tengan mucha cabida y se
demuestre que la hipótesis es válida. En cambio,
en los negocios es importante responder a las
demandas de mercado con prontitud a pesar de
que la respuesta (producto o solución) pueda ser
perfectible. Otro cambio que he tenido que rea-
lizar es migrar del altruismo de investigador que
tengo para solucionar algún problema hacia la
rentabilidad económica que debe haber en esa
solución para que el negocio persista.
31
QUÍMICA TEÓRICA Y
QUÍMICA
COMPUTACIONAL
La química en lenguaje numérico

Por Cristina González – Filiberto Gutiérrez

 QUÍMICA TEÓRICA Y QUÍMICA COMPUTACIONAL
E l objeto de estudio de la química es la
transformación de la materia, el cómo se
forma una sustancia a partir de otra. Esta
transformación, que puede ser natural o sinté-
tica, la conocemos como reacción química y se
lleva a cabo por la formación o rompimiento de
enlaces químicos. Es decir que, para entender
el por qué sucede una reacción química es ne-
cesario primero entender cómo se forman los
enlaces químicos. De nuestras clases básicas
de química general podemos recordar que los
enlaces se deben a la interacción entre los
electrones de los átomos, y dependiendo de
cómo se forma la interacción existen diferentes
tipos de enlaces: iónico, covalente, de coor-
dinación, entre otros.
Las áreas de la química emplean modelos para
describir enlaces y explicar sus mecanismos de
formación. Sin embargo, para obtener una des-
cripción cuantitativa de dichas propiedades es
necesario recurrir a la química teórica.
La química teórica hace uso de herramientas
matemáticas para describir las propiedades
estructurales y dinámicas de las moléculas. La
química computacional, una variante de la quí-
mica teórica, tiene como interés primario el re-
solver problemas químicos a través de cálculos.
Esta alternativa se usa cuando un método ma-
temático es suficientemente robusto como para
automatizarse en una computadora.
Dependiendo de la propiedad y del tamaño del
sistema a estudiar, existen distintos métodos
que emplean aproximaciones para representar
la interacción entre los átomos. Los métodos
más precisos son los métodos ab initio, que
quiere decir “desde el inicio”, en los cuales los
electrones son descritos explícitamente por
medio de la mecánica cuántica. El sistema es
representado por medio de una función de onda
y las propiedades son evaluadas a través de
operadores matemáticos. Si la propiedad de
interés es la energía electrónica del sistema, el
operador correspondiente es el operador
Hamiltoniano y la ecuación a resolver es la
ecuación de Schrödinger.
Los métodos que utilizan funciones de onda, en
particular los que incluyen la correlación elec-
trónica, por ejemplo los métodos de interacción
de configuraciones (CI) y de clusters acoplados
(CC), son costosos computacionalmente y sólo
se pueden emplear en ciertas moléculas. La
teoría de los funcionales de la densidad (DFT)
reemplaza la complicada función de onda y usa
como variable la densidad electrónica. Las pro-
piedades son definidas como funciones de la
densidad electrónica, que a su vez es una fun-
ción que depende de la posición en el espacio.
La función de una función es llamada funcional,
por lo tanto, las propiedades son funcionales
de la densidad electrónica. A pesar de la ele-
gancia con la que derivó esta teoría, no se co-
noce la forma exacta del funcional para repre-
sentar a la energía y sólo se cuenta con aproxi-
maciones, tales como la aproximación de den-
sidad local (LDA), con correcciones de gradien-
te (GGA), funcionales híbridos, entre otras. Los
métodos basados en la teoría de los funciona-
les de la densidad tienen buen equilibrio entre
costo y precisión, por lo que han sido populares
para respaldar resultados experimentales, co-
mo estructuras moleculares y mecanismos de
reacción. Sin embargo, esta popularidad ha lle-
vado a que se utilicen de manera indiscrimina-
da, sin considerar sus limitaciones. En la reali-
zación de un estudio teórico, es imperativo
contar con la asesoría de un químico teórico
especializado que pueda advertir y evitar la
mala interpretación de un resultado, por prome-
tedor y útil –o incluso equivoco– que pudiera
parecer para el químico experimental.
33
 QUÍMICA TEÓRICA Y QUÍMICA COMPUTACIONAL
Los métodos de DFT, están limitados a un pe-
queño número de moléculas debido a que el
costo de los cálculos crece exponencialmente
con el número de electrones. Para reducir el
tiempo de cómputo se pueden reemplazar al-
gunos términos, generalmente integrales com-
plicadas, por parámetros. Los métodos Semi-
empíricos usan esta estrategia utilizando térmi-
nos constantes que aseguran que los resulta-
dos reproduzcan valores experimentales, como
calores de formación de enlace y constantes
espectroscópicas.
En el caso de sistemas más complejos, como
polímeros, sistemas bioquímicos o moléculas
en disolución, las fuerzas electrostáticas son
determinantes para describir la estructura y la
reactividad. En este caso no es posible trabajar
con mecánica cuántica por lo que se utilizan
potenciales clásicos y campos de fuerza. Estos
métodos representan a los átomos en forma de
cargas puntuales y sus interacciones, pura-
mente electrostáticas, dependen de la magni-
tud de sus cargas y de su posición relativa en
el espacio.
Jugando un papel fundamental en la fisicoquí-
mica, las químicas teórica y computacional
ayudan a predecir estructuras moleculares, di-
námicas, asociaciones sustrato-proteína, ener-
gías de reacción, constantes de velocidad, pro-
piedades físicas, parámetros termodinámicos y
respuestas espectroscópicas. También ayuda
a comprender el comportamiento de micro-
emulsiones, líquidos iónicos, fluidos supercrí-
ticos y soluciones de polímeros. Las investiga-
ciones de flujo de energía en moléculas exci-
tadas vibracionalmente contribuyen al entendí-
miento microscópico de la reactividad química.
34
LA QUÍMICA
COMPUTACIONAL EN EL
DESARROLLO DE FÁRMACOS
Desde siempre las personas buscan encontrar
remedio a padecimientos y enfermedades. El
descubrimiento de sustancias de origen natural
con actividad terapéutica fue una de las activi-
dades que demandaron especialistas en el
área y el registro de sus descubrimientos. Los
métodos de esa época eran pruebas de “ensa-
yo y error” de compuestos naturales, lo que
provocó que el desarrollo de medicamentos
fuera lento, inseguro y poco eficiente.
A finales del siglo XVIII el desarrollo de la quí-
mica ayudó a optimizar el descubrimiento de
fármacos incorporando los compuestos sintéti-
cos y semisintéticos al acervo farmacéutico.
Los primeros prototipos o cabezas de serie ob-
tenidos fueron consecuencia del estudio de la
actividad biológica de productos del metabolis-
mo secundario de organismos vivos, del des-
cubrimiento accidental o de efectos inespera-
dos en ensayos biológicos. Sin embargo, este
método de desarrollo resultó en una limitada
diversidad de compuestos ya que muchos pro-
blemas se abordaban desde perspectivas es-
trictamente médicas o químicas, lo que hacia
lento el entendimiento de los fenómenos farma-
cológicos. Fue hasta el primer cuarto del siglo
XX cuando se optó por un abordaje multidisci-
plinario, donde la colaboración entre químicos,
médicos, farmacéuticos, físicos y biólogos fo-
mentó el inicio de la industria farmacéutica.
Consecuencia de esto, fue que a principios de
los años 60 aparecieron las técnicas computa-
cionales aplicadas al desarrollo de fármacos, lo
que contribuyó aún más, en el desarrollo ra-
cional de fármacos, surgiendo así, el diseño de
fármacos asistido por computadora (DiFAC).
 QUÍMICA TEÓRICA Y QUÍMICA COMPUTACIONAL
Simulación de tres moléculas
acoplándose al mismo sitio de
acción en el péptido RMSD.
Tomado de Antes, I. 2010
El DiFAC es un conjunto de técnicas computa-
cionales cuyo fin es el desarrollo de una nueva
molécula con actividad biológica. Se divide en
dos: el diseño basado en el receptor y el dise-
ño de fármacos basado en el ligando.
En el diseño de fármacos basado en el recep-
tor se debe conocer la diana biológica con la
cual interactuará el ligando (fármaco) a dise-
ñar. Un modelo del receptor se obtiene experi-
mentalmente por cristalografía de rayos X,
RMN, Criomicroscopía Electrónica, o computa-
cionalmente mediante modelado de novo o
modelado por homología. Usando dicho recep-
tor, el nuevo ligante se diseña basándose en la
estructura del sitio activo o en una molécula
que interaccione sobre residuos importantes en
dicho sitio –lo que se conoce como diseño de
novo–. Otro método es el acoplamiento mole-
cular o docking, el cual consiste en encontrar el
modo de unión más favorable de un ligando a
un receptor: primero se realiza la exploración
de espacios accesibles en el receptor para el
ligando, posteriormente, se calcula la confor-
mación del ligando con la menor energía de
unión, esto permite evaluar millones de molé-
culas teóricas o existentes sobre un mismo re-
ceptor en poco tiempo y los que tienen mejor
afinidad se pueden evaluar experimentalmente.
En el diseño de fármacos basado en el ligando
no es necesario conocer el blanco biológico del
nuevo fármaco. Los estudios de relación
estructura-propiedad son los más conocidos y
de fácil implementación. Dentro de este grupo,
los más representativos son los estudios de re-
lación de estructura-actividad (SAR) y los estu-
dios de panorama de actividad. Los estudios
SAR, buscan correlaciones entre la actividad de
la diana con alguna característica fisicoquímica
del ligando, estos estudios parten del principio
de qué compuestos con estructura semejante
tienen propiedades semejantes. Una desventa-
ja en este método es que dicha relación se pier-
de en algunas moléculas, a las cuales se les
conoce como acantilados de actividad.
Recientemente, se usan bases de datos de
compuestos (características químicas y fisico-
químicas y actividad biológica), donde a través
de la minería de datos y usando métodos infor-
máticos (quimoinformática) se pueden identifi-
car patrones de relación actividad-propiedad,
como núcleos farmacológicos base, propieda-
des farmacocinéticas o farmacodinámicas.
Uno de los errores más comunes al usar herra-
mientas teóricas o computacionales, es creer
que sus resultados son infalibles o irrefutables.
Si bien están basados en la experiencia y la
información miles de observaciones y datos, no
dejan de ser un modelo de un fenómeno y por
lo tanto siguen siendo perfectibles.
El uso de herramientas de Química Teórica y
Computacional contribuyen a pasos gigantes-
cos a reducir los tiempos y costos en el desa-
rrollo de fármacos, generando protocolos de
trabajo y experimentación más selectivos, afi-
nes y seguros. Con todo esto es que se han
ampliado los grupos de moléculas que se pue-
den usador como medicamento.
35
 QUÍMICA PILAR DE LA ECONOMÍA
QUÍMICA
PILAR DE LA
ECONOMÍA
Por Regino Castro
De niño me gustaba tomar leche con hielo y
chocolate, lo amaba, era mi mezcla química
favorita. Fue probablemente la primera vez que
vino a mi cabeza la pregunta de por qué tres
cosas tan distintas –para mi– podían combinar-
se para mejorar el sabor una de la otra. Otra
pregunta que venía a mi cabeza era saber có-
mo, quiénes y en cuánto tiempo las prepara-
ban. A pesar de que yo ya la practicaba, mi
primer contacto con la química como ciencia –
aunque no sabía qué era o qué significaba– fue
cuando tenía 6 años. Mi primo tenía un juego
de química –de los que brindan alegría– y yo
veía como realizaba mezclas, las calentaba, las
enfriaba y cambios de color y aspecto
maravillosos pasaban ante mi entendimiento,
eran reacciones químicas.
En la primaria, secundaria y preparatoria se ve
a la química como una más de las demás ma-
terias de ciencias exactas; como cuestiones
inentendibles, dónde solo aquellos que tienen
un entendimiento especial, curiosidad o ge-
nialidad, tenían la capacidad de ver más allá de
lo que los profesores explicaban y poder
trasladarlo al disfrute de la vida diaria. Muy
pocos tienen ese privilegio a esa edad.
36
Aún en la universidad, e incluso en las carreras
de ciencias e ingenierías, mucha gente piensa
que los químicos sólo hacen experimentos y
conjeturas poco entendibles y que su vida
transcurre en las bibliotecas y laboratorios –yo
mismo lo llegué a pensar–.
Una grata sorpresa para mi fue cuando me gra-
dué e ingresé al mundo laboral –mi pregunta
infantil halló respuesta– me di cuenta que los
químicos no solo están en un laboratorio, biblio-
teca o dando clases. Antes mis ojos se mostró
la poderosa herramienta –más que ciencia de
eternas y complejas filosofías– que es la quími-
ca y el incontable beneficio que ha traído a la
humanidad. Desde el transporte que da movi-
lidad a productos, servicios y personas; esos
mismos productos y servicios y personas; los
insumos y métodos para producir esos produc-
tos y brindar esos servicios, alimentar y man-
tener saludables a esas personas: todo es quí-
mica. Materiales, conservadores, fármacos,
combustibles, alimentos, cosméticos, deco-
raciones, todos y cada uno son consecuencia
de nuestro entendimiento de la química.
Existen profesionistas químicos que colocan
acciones en la bolsa de valores, que trabajan
tomando decisiones financieras o definiendo el
futuro de la sociedad.
Así que, en lo venidero, cuando pensemos en
química, no lo hagamos a nivel de laboratorios,
bibliotecas y sesiones académicas. La química
es vida, ciencia, industria, finanzas, bienestar
social, amor, filosofía y un pilar fundamental de
la economía.
 LA INDUSTRIA QUÍMICA
Productos químicos más vendidos
• Estamos en la era de los
materiales. QUIMICOS DE PETROQUÍMICOS
• 20 millones de empleados en el CONSUMO DIRECTO 13.6%
25.9%
mundo, 811000 en EUA.
• Ganancias de 5 trillones de ESPECIALIDADES
dólares anuales. QUIMICAS 21.6 %
INORGÁNICOS BÁSICOS 11.7 %
• Todos los productos se originaron Auxiliares para la industria 15.1%
4.5% Varios
o trataron con sustancias Tintas y pinturas 7.7%
2.6% Gases Industriales
provenientes del petróleo y el gas Protección de cultivos 2.1% 4.6% Fertilizantes
natural.
Tintes y pigmentos 2.3%
• La industrias agrícola, automotriz, POLIMEROS 21.6%
farmacéutica y de la construcción 1.5% Fibras sintéticas 19.2% Plásticos
son clientes directos de la 0.9% Caucho sintético
industria química.

Países con mayor venta de productos químicos (billones de euros)

1 empleo en la USA Francia Alemania China Corea del sur

industria química 71 145 1331 113
476
Japón
140
6.3 empleos en
la economía

6 millones de empleos
Taiwán
en sociedad 63

• 2006 - 2016 China triplicó sus ventas de 13 a 39 b€

• 2006 - 2016 América Latina disminuyó de 5.1 a 3.8 b€ Brasil Italia India
• 2006 - 2016 EUA disminuyó de 28 a 15 b€ 59 50 76

Compañías con Premios Ingresos de compañías químicas durante 2018

Nobel de Química (billones de dólares)

DUPONT DowDuPont 70.76 Eastman Chemical 9.85

Alan Heeger, 2000. Polímeros conductivos LyondellBasel 35.82 Huntsman Chemical 8.72
Charles Pedersen.1987. Éteres corona
PPG Industries 15.05 Air and Chemicals 8.7
GENERAL ELECTRIC COMPANY Ecolab 14.15 Unival 8.41
Irving Langmuir,1932. Química de superficies
Praxair 11.71 Westlake Chemical 8.25
37
LAS MICROONDAS
Y SU MAL
ENTENDIMIENTO
Mito químico

Por Mongonye

La idea de que las microondas de

aparatos caseros propician la
aparición de cáncer, o eliminan las
propiedades de los alimentos ha
crecido tanto que muchos médicos
e incluso investigadores la han
aceptado como verdadera
 LAS MICROONDAS Y SU MAL ENTENDIMIENTO
E n el verano de 2013 tuve la oportunidad
–más bien casualidad– de asistir a una plá-
tica en Cuernavaca, México. El evento, bastan-
te concurrido por cierto, tenía como tema cen-
tral el exponer los daños que los hornos de mi-
croondas y en especial las microondas gene-
ran en las personas que preparan ahí sus ali-
mentos. La plática era presidida por un muy
prestigioso cancerólogo mexicano y patrocina-
da por una aún más prestigiada asociación de
médicos cancerólogos. En ella se ilustraba y di-
fundía la larga y contundente evidencia acerca
del origen de muchos tipos de cáncer en perso-
nas, cuyas causas se debían a que habían con-
sumido alimentos calentados con hornos de mi-
croondas o porque se habían expuesto a ellas.
Las imágenes y los datos mostrados por el
especialista –y sobretodo la respuesta de los
asistentes, la mayoría gente no especializada
en medicina o ciencias– era impactante y el
mensaje aún más: ¡Las microondas provocan
cáncer!
Algo que llamó mi atención, era que curiosa-
mente, el ponente no citaba alguna fuente bi-
bliográfica o evidencia numérica o experimental
confiables que respaldara aquellos casos.
Como digno e impetuoso estudiante del primer
año del posgrado en química, estaba yo ansio-
so de echar abajo aquellas afirmaciones, pero
entre los asistentes estaba otro más ansioso
que yo y formuló una buena pregunta:
¿cómo pueden las microondas generar
cambios en una célula a ese nivel si la energía
que proveen ni siquiera rompe un enlace débil?
La cara de desaprobación del médico que
presidia la sesión y su evidente ignorancia de
la muy profunda cátedra de química impartida
en esa pregunta, dieron por terminada la
sesión y la plática y dejaron más preguntas que
respuestas en la concurrencia.
Y es que, toda la información mostrada en la
exposición de ese día era falsa –probablemen-
te el mismo ponente no lo sabía–. Las microon-
das no provocan cáncer por irradiación, no se
quedan atrapadas en los alimentos, ni se dis-
persan y causan daño cuando llegan al orga-
nismo, entre otras afirmaciones que han pro-
liferado y han sido aceptadas por muchos. La
razón por la que podemos calentar alimentos
con microondas es porque su efecto en ciertas
moléculas polares –como el agua de los
alimentos– es aumentar su temperatura por
fricción, y nada más.
Este es un ejemplo de como información mal
entendida se difunde y se da por cierta por un
sector importante de la población e incluso del
ámbito profesional sin haber sido demostrada
eficientemente. Si de todas formas alguien
tiene dudas sobre el uso de microondas bien
estudiadas y documentadas, consulte las
interesantes publicaciones de Oliver Kappe o
del Dr. Jaime Escalante.
39
!Anúnciate
en
QuimioFilia!
Si eres un proveedor especializado
en el ramo químico, éste espacio es
para tu producto o servicio

ALCANCES

20 mil lectores en México,

Centro y Sudamérica

15 mil usuarios activos en la

academia, la industria o la
investigación

DISEÑO ASESORÍA
Diseñamos Sabemos lo que
tu logotipo y nuestros lectores
publicidad requieren

contacto@quimiofilia.com FACEBOOK/QUIMIOFILIA
BIBLIOGRAFÍA
U na de las prácticas más útiles de la ciencia y de los científicos es la rastreabilidad que
es posible hacer de prácticamente cualquier afirmación, información y dato que se
llegue a documentar y exponer. La forma específica en que se logra esto es la cita biblio-
gráfica de dónde se han tomado algunos de los tópicos antes señalados.
No es frecuente que de las revistas de divulgación de la ciencia utilicen este recurso, qui-
zá porque la información que muestran tiene un carácter más informativo que de concien-
tización, como es nuestro caso, y es probable que los lectores no siempre deseen verifi-
car la fuente primaria de la información que consultan. En la Revista QuimioFilia sin em-
bargo, hemos notado con agrado que nuestros lectores son exigentes con la calidad de la
información que reciben y es por eso que hemos decidido incluir nuestras fuentes biblio-
gráficas. Con esto deseamos que quién esté interesado, pueda verificar la interpretación
que hemos dado a la información y pueda generar una opinión propia de un tema que a
todos nos interesa: La Química.
 BIBLIOGRAFÍA

1. Labarca, M. Redes, 2005, 11, 155-171.

2. Chamizo J. A. Educación Química, 2009, 6-11.
3. Labarca, M.; Lombardi, O. Principia, 2010, 14, 309-333.
4. Weisberg M. Challenges to the structural conception of chemical
bonding, University of Pennsylvania, forthcoming in Philosophy of
Science.
5. American Chemical Society portal web
6. www.rsc.org/Membership/Networking/InterestGroups/OrganicDivi
sion/organic-chemistry-case-studies/
7. http://www-jmg.ch.cam.ac.uk/
8. Rabasco-Álvares, A. De la farmacia galénica a la farmacia
clínicay atención farmacéutica con el horizonte del “medication
therapy management” Academia Iberoamericana De Farmacia,
Granada-Sevilla, 2010
9. Warner, J. Green Chemistry: Theory and Practice. T., Oxford
University Press, 1998.
10. Bolm, C. J. Org. Chem. 2017, 82, 4007–4019.
11. Bolm, C. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 6924–6926.
12. Pérez-Venegas, M.; Reyes-Rangel, G.; Neri, A.; Escalante, J.;
Juaristi, E.; Beilstein J. Org. Chem. 2017, 13, 1728–1734.
13. Suslick, K. Faraday Discuss. 2014, 170, 411–422.
14. Crawford, D. Beilstein J. Org. Chem. 2017, 13, 1850–1856.
15. Notley, S. Langmuir 2012, 28, 14110–14113.
16. Suslick, K. Adv. Organomet. Chem. 1986, 25, 73–119.
17. Li, J. Curr. Org. Synth. 2005, 2, 415–436.
18. Memon, J. Agron. Crop Sci. 2007, 193, 218–228.
19. Faber, K. Biotransformations in Organic Chemistry. 6th Edition.
Springer-Verlag. Berlin, 2011.
20. Afagh, N.; Yudin, A. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 262-310.
21. Drauz, K.; Waldmann, H. Enzyme Catalysis in Organic Synthesis
2nd Edition WILEY-VCH 2002.
22. Illanes, A. Enzyme Biocatalysis Principles and Applications,
Springer, 2008
23. Brown, J. Adv. Synth. Catal. 2001, 343, 755-756.

42
 BIBLIOGRAFÍA

24. Christmann, M.; Stefan Bräse, S. Asymmetric Synthesis – The

Essentials. WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. 2007.
25. The economic benefits of chemistry research to the UK 2010
26. Chemical industry braces for downturn en
www.chemistryworld.com/news/chemical-industry-braces-for-
downturn/ 3000840. article.
27. Kappe, O., Stadler, A. Microwaves in Organic and Medicinal
Chemistry. Wiley VCH, Weinheim, Germany. 2005.
28. Chemical Industry in the Age of Big Data Analytics
29. Big Data Latest News by Sowmya Krishnan December 20, 2017
30. https://www.statista.com/markets/410/topic/445/chemical-
industry/
31. http://www.cefic.org/Facts-and-Figures/Chemicals-Industry-
Profile/
32. http://stats.areppim.com/listes/list_nobelxprize.htm
33. Young, D. "Computational Chemistry: A Practical Guide for
Applying Techniques to Real World Problems", John Wiley &
Sons , 2001.
34. https://www.nature.com/subjects/theoretical-chemistry
35. http://chemistry.cornell.edu/theoretical
36. https://www.tau.ac.il/~ephraim/intro2comp.pdf
37. http://www.chemistryexplained.com/Te-Va/Theoretical-
Chemistry.html
38. Antes, I. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2010,
78(5), 1084–1104.

43
 HUBO UN

ORIGEN …mas bien varios

REVISTA QUIMIOFILIA  NÚMERO 2  JULIO 2018

¿QUÉ QUIERES SABER?

QuimioFilia

AÑO
I
 El primer número de la Revista Quimiofilia es un reto y un premio a la vez. El presente
trabajo representa muchos meses de planeación y esfuerzo. Sabemos que con esto
estamos aceptando un gran compromiso social, educativo y profesional y que de aquí en
delante seremos un foco de orientación ante muchas personas y es un reto que estamos
dispuestos a asumir con entusiasmo y responsabilidad.

A nombre de todos los autores, el equipo de edición y de diseño deseamos agradecer a

todos lo que están leyendo en este momento este párrafo, suponemos que es porque ya
leyeron todos los anteriores y eso nos alegra aún más. Tengan por seguro que en cada
número encontraran más y mejor información y nuevas secciones.

¡Seguimos creciendo y no nos vamos a detener!