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En 1808 fue elegido miembro de la Real Academia Sueca de Ciencias, que por entonces se
había estancado durante varios años debido al menor interés por las ciencias en Suecia
desde la época del romanticismo. En 1818 fue elegido secretario de la misma, y ocupó el
cargo hasta 1848. A Berzelius se le atribuye la revitalización de la Academia que vivió una
segunda época dorada, siendo la primera la que estuvo bajo la secretaría del
astrónomo Pehr Wilhelm Wargentin (1749 a 1783). En 1837, fue elegido también miembro
de la Academia Sueca, con el sillón número 5.
Por sus enormes logros en el campo de la química Berzelius es considerado como el "padre
de la química en Suecia"
Estudió las combinaciones de azufre con fósforo, el flúor y los fluoruros, determinó un gran
número de equivalentes químicos. Fue prácticamente el creador de la química orgánica.
Introdujo las nociones y las palabras alotropía, catálisis, isomería, halógeno, radical
orgánico y proteína. Tan filósofo como experimentador, consolidó la teoría atomística así
como la de las proporciones químicas; inventó e hizo aceptar universalmente fórmulas
químicas análogas a las fórmulas algebraicas con el objetivo de expresar la composición de
los cuerpos. Para explicar los fenómenos adoptó la célebre teoría del dualismo electro-
químico, y con esta teoría llevó a cabo muchas reformas en la nomenclatura y en la
clasificación. Desarrolló una teoría electroquímica acerca de los radicales. También fue uno
de los primeros que basó la mineralogía en el conocimiento de los elementos químicos de
los cuerpos. El actual sistema de notación química se adoptó gracias a Berzelius, que fue
quien lo propuso en 1813. Berzelius fue uno de los primeros que publicó una tabla de
las masas moleculares y masas atómicas con exactitud aceptable. A Berzelius también se
le atribuyen nuevos términos empleados en química
como catálisis, polímeros, isómero y alótropo, aunque sus definiciones originales difieren
drásticamente de su uso moderno. Con el fin de sistematizar sus experimentos, desarrolló
un sistema de notación química en la que a los elementos se les denotaba con símbolos
simples. Codificó los elementos según la primera letra de su nombre latino, agregando una
segunda letra cuando había necesidad de diferenciar dos elementos cuyo nombre
comenzaba con la misma letra inicial