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Cap 7
Cap 7
Preguntas clave:
Esquema:
7.1 DNA: el material genético
7.2 La estructura del DNA
7.3 La replicación semiconservativa
7.4 Visión general de la replicación del DNA
7.5 El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria
7.6 La replicación en los organismos eucariotas
7.7 Telómeros y telomerasa: terminación de la replicación.
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La estructura propuesta del material hereditario sugirió de manera inmediata su
función como conjunto de instrucciones y cómo éste podría ser transmitido a lo largo de las
generaciones. Primero, la información para hacer un organismo podría estar codificada en la
secuencia de bases nucleotídicas que componen las dos cadenas de la hélice. Segundo,
debido a las reglas de complementariedad de bases descubiertas por Watson y Crick, la
secuencia de una cadena determina la secuencia de la otra cadena. De esta forma, la
información genética en la secuencia del DNA podría trasmitirse de una generación a la
siguiente haciendo que cada una de las cadenas por separado sirviera como molde para
producir nuevas copias de la molécula.
En este capítulo, nos concentraremos en el DNA, en su estructura, y en la producción
de copias de DNA mediante el proceso denominado replicación. Cómo se replica
exactamente el DNA es todavía, después de 50 años del descubrimiento de la doble hélice,
un área activa de investigación. Nuestra comprensión actual del mecanismo de replicación
da un protagonismo central a una maquinaria de proteínas denominada replisoma. Este
complejo de proteínas coordina las numerosas reacciones que son necesarias para la
replicación rápida y exacta del DNA.
Antes de ver cómo hicieron Watson y Crick para resolver la estructura del DNA,
revisaremos los conocimientos acerca de los genes y el DNA en el momento en que
comenzaron su colaboración histórica:
1. Se sabía que los genes, descritos por Mendel como los “factores” hereditarios, están
asociados con características específicas, pero no se conocía su naturaleza física. De igual
forma, se sabía que las mutaciones alteraban la función génica, pero no se sabía exactamente
qué era una mutación.
2. La hipótesis de un gen – una proteína (descrita en el Capítulo 6) postulaba que los genes
controlan la estructura de las proteínas.
5. Los resultados de una serie de experimentos que comenzaron en 1920 revelaron que el
DNA era el material genético. Los experimentos, que describiremos a continuación,
demostraron que las células bacterianas que expresan un fenotipo, pueden ser transformadas
en células que expresan un fenotipo distinto y que el agente transformante es el DNA.
El descubrimiento de la transformación
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por la apariencia que presentan sus colonias al ser cultivadas en el laboratorio. Una cepa era
del tipo virulento normal que mata a la mayoría de los animales de laboratorio. Las células
de esta cepa están encerradas en una cápsula de polisacáridos, que confiere a las colonias un
aspecto liso; y por lo tanto se identifica a esta cepa como S (del inglés smooth). La otra cepa
que empleó Griffith era un tipo de mutante sin virulencia
(Fin de la segunda página del capítulo) 266
Los experimentos realizados por Avery y sus colaboradores fueron definitivos, pero
muchos investigadores eran muy reacios a aceptar al DNA como el material genético en
lugar de las proteínas. Después de todo, ¿cómo podría una molécula de tan poca
complejidad codificar para la diversidad de vida existente en el planeta? Alfred Hershey y
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Martha Chase en 1952 aportaron una evidencia adicional realizando un experimento que
emplea un virus que infecta a las bacterias, el fago T2. Su argumento residía en que para
infectar a la bacteria el fago debe inyectar la información específica que dicta la
reproducción de nuevas partículas virales. Si pudieran averiguar qué material es el que
inyecta el fago dentro de la bacteria hospedadora, habrían determinado el material genético
de los fagos.
El fago tiene una constitución molecular relativamente simple. La mayor parte de su
estructura es proteica, con el DNA contenido dentro de la cubierta proteica de su “cabeza”.
Hershey y Chase decidieron marcar diferencialmente el DNA y la proteína usando
radioisótopos, de manera que podían rastrear los dos materiales durante la infección. El
fósforo no forma parte de las proteínas pero si forma parte integral del DNA; mientras que el
azufre está presente en las proteínas pero nunca se encuentra en el DNA. Hershey y Chase
incorporaron el radioisótopo del fósforo (32P) al DNA de un cultivo de fagos y el
radioisótopo del sulfuro (35S) a las proteínas de otro cultivo. Como se puede observar en la
Figura 7-4, se infectaron dos cultivos de E. coli con muchas partículas virales por célula: un
cultivo de E. coli recibió el fago marcado con 32P y el otro recibió el fago marcado con 35S.
Después que tuviera lugar la infección, separaron las cabezas vacías de los fagos (llamadas
fantasmas) por agitación con una batidora de cocina. Separaron las células bacterianas de los
fantasmas de los fagos con una centrífuga y entonces midieron la radioactividad en las dos
fracciones. Cuando se emplearon los fagos marcados con 32P para infectar E. coli, la mayoría
de la radiactividad se encontró dentro de las células bacterianas, indicando que
(Fin de página 268)
Aún antes que se esclareciera la estructura del DNA, los estudios genéticos indicaron
que el material hereditario debe tener tres propiedades claves:
1. Debido a que cada célula del cuerpo de un organismo tiene esencialmente la misma
composición genética, es crucial la replicación fiel del material genético en cada
división celular. Así, las características estructurales del DNA deben permitir la
replicación fiel. Las características estructurales serán consideradas más adelante en
este capítulo.
2. Debido a que debe codificar para la constelación de proteínas expresadas por un
organismo, el material genético debe tener contenido informativo. Cómo se descifra
la información codificada en el DNA para producir proteínas será el tema de los
Capítulos 8 y 9.
3. Debido a que los cambios hereditarios, llamados mutaciones, proveen la materia
prima para la selección evolutiva, el material genético debe ser capaz de cambiar en
raras ocasiones. Sin embargo, la estructura del DNA debe ser lo suficientemente
estable como para que los organismos puedan contar con la información codificada.
Consideraremos los mecanismos de la mutación en el Capítulo 15.
(Fin de página 269)
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(Inicio de página 270)
Los bloques estructurales del DNA La primera pieza del rompecabezas fue el
conocimiento de los bloques estructurales básicos del DNA. Como sustancia química, el
DNA es bastante simple. Contiene tres tipos de componentes: (1) fosfato, (2) un azúcar
llamado desoxirribosa, y (3) cuatro bases nitrogenadas: adenina, guanina, citosina y timina.
Los átomos de carbono en las bases tienen números asignados para referirse a ellos
fácilmente. Los átomos de carbono en el azúcar también tienen asignados números, en este
caso, el número está seguido por una prima (1’, 2’, y así sucesivamente). El azúcar en el
DNA se denomina “desoxirribosa” debido a que tiene un solo átomo de hidrógeno (H) en el
átomo de carbono 2’, a diferencia de la ribosa (componente del RNA), que tiene un grupo
hidroxilo (OH) en esa posición. Dos de las bases, la adenina y la guanina, tienen una
estructura de doble anillo característico de un tipo de químico llamado purina. Las otras dos
bases, la citosina y la timina, tienen una estructura de anillo simple del tipo llamado
pirimidina. Los componentes químicos del DNA están ordenados en grupos llamados
nucleótidos, cada uno compuesto de un grupo fosfato, una molécula del azúcar
desoxirribosa y cualquiera de las cuatro bases (Figura 7-5). Es
(Fin de página 270)
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Análisis del DNA por difracción de Rayos X. La tercera y más controvertida pieza del
rompecabezas proviene de los datos de difracción de rayos X sobre la estructura del DNA,
obtenidos por Rosalind Franklin cuando trabajaba en el laboratorio de Maurice Wilkins
(Figura 7-6). En sus experimentos, los rayos X bombardean las fibras de DNA y la
dispersión que producen los rayos sobre las fibras se captura sobre una película fotográfica,
donde los rayos X producen puntos. El ángulo de dispersión representado por cada punto
sobre el film suministra información acerca de la posición del átomo o cierto grupo de
átomos en la molécula de DNA. Este procedimiento no es simple de realizar ni de explicar, y
la interpretación del patrón de puntos requiere un tratamiento matemático complejo que está
fuera del alcance de este libro. Los datos disponibles sugerían que el DNA es una molécula
larga y delgada y que tiene dos partes similares que discurren en paralelo a lo largo de la
molécula. Los datos de rayos X mostraron que la molécula era helicoidal (en forma de
espiral). Maurice Wilkin mostró la mejor fotografía de rayos X obtenida por Rosalind
Franklin a Watson y Crick sin que ella lo supiera, y esta fotografía fue la pieza clave del
rompecabezas que les permitió deducir la estructura tridimensional que podría explicar los
patrones de puntos de los rayos X.
(Fin de página 7) 271
La doble hélice.
El trabajo de 1953 publicado por Watson y Crick en la revista Nature comenzaba con dos
frases que anunciaban una nueva era para la biología: “Deseamos sugerir una estructura para
la sal de ácido desoxirribonucleico (D.N.A.). Esta estructura tiene características novedosas
que son de interés biológico considerable”. La estructura del DNA había sido un tema de
gran debate desde los experimentos de Avery y sus colaboradores en 1944. Como ya se ha
visto, se conocía la composición general del DNA, pero no se sabía cómo concordaban las
partes en su conjunto. La estructura tenía que satisfacer los principales requerimientos para
una molécula hereditaria: la capacidad de almacenar información, la capacidad de replicarse
y la capacidad de mutar.
La estructura en tres dimensiones presentada por Watson y Crick está compuesta por dos
cadenas o “hebras” de nucleótidos que se tuerce formando una doble hélice (Figura 7-7).
Las dos cadenas de nucleótidos están unidas por puentes de hidrógeno entre las bases de
cada hebra, formando una estructura como de escalera en espiral (Figura 7-8b). El esqueleto
de cada espiral está formado por unidades alternantes de fosfato y de azúcar desoxirribosa
que están conectados por enlaces fosfodiéster. Podemos usar estos enlaces para describir
cómo se organiza una cadena de nucleótidos. Como ya se ha mencionado, los átomos de
carbono de los azúcares están numerados desde el 1’ hasta el 5’. Un enlace fosfodiéster
conecta el átomo de carbono 5’ de una desoxirribosa al átomo de carbono 3’ de la
desoxirribosa adyacente. Así, cada esqueleto de azúcar-fosfato tiene una polaridad o
dirección 5’ a 3’, y el conocimiento de esta polaridad es esencial para entender cómo
desempeña el DNA sus funciones. En la molécula de dos cadenas de DNA, los dos
esqueletos están en orientación opuesta, o antiparalela (véase Figura 7-8b).
Cada base está enlazada al átomo de carbono 1’ de una desoxirribosa en el esqueleto
de cada cadena y se encara hacia el interior con una base de la otra cadena. Los puentes de
hidrógeno entre pares de bases mantienen unidas a las dos cadenas de la molécula de DNA.
Los puentes de hidrógeno están indicados por líneas discontinuas en la Figura 7-8b.
(Fin de la página 272)
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Dos cadenas de nucleótidos emparejadas en dirección antiparalela automáticamente adoptan
una conformación de doble hélice (Figura 7-9), principalmente a través de la interacción
entre los pares de bases. Los pares de bases, que forman una estructura plana, se encuentran
apilados unos encima de otros en el centro de la doble hélice (véase Figura 7-9a). El
apilamiento de las bases añade estabilidad a la molécula de DNA debido a que excluye a las
moléculas de agua de los espacios entre los pares de bases. La forma más estable que surge
de la posición de las bases es una doble hélice con dos surcos de distinto tamaño distribuidos
a lo largo de la espiral: el surco mayor y el surco menor, como puede observarse tanto en
el modelo de cinta como en el modelo espacial compacto (véase Figura 7-9b) La mayor
parte de las asociaciones DNA-proteínas se realizan en el surco mayor. Una única cadena de
nucleótidos no adopta una estructura helicoidal; la forma helicoidal del DNA depende por
completo del emparejamiento de las bases apiladas en las cadenas antiparalelas. El DNA es
una hélice dextrógira; en otras palabras, tiene la misma estructura que la de un tornillo que
se atornillase en el mismo sentido de las agujas del reloj.
La doble hélice explica con éxito los resultados de los rayos X y los datos de
Chargaff. Watson y Crick estudiaron los modelos de la estructura, y comprobaron que el
radio observado de la doble hélice, obtenido a partir de los datos de rayos X, podría
explicarse si una purina siempre aparea con una pirimidina mediante puentes
(Fin de página 273)
Mensaje: El DNA es una doble hélice compuesta por dos cadenas de nucleótidos que se
mantienen unidas por complementariedad de los apareamientos de A con T y de G con C.
El descubrimiento de Watson y Crick de la estructura del DNA se considera uno de los más
importantes descubrimientos biológicos del siglo veinte y los por ello ganaron el Premio
Nobel junto con Maurice Wilkins en 1962 (Rosalind Franklin murió de cáncer en 1958 y no
se otorga póstumamente). La razón por la que este descubrimiento sea considerado tan
importante es que la doble hélice, además de ser consistente con los datos previos de la
estructura del DNA, cumple con los tres requisitos de una sustancia hereditaria.
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1. La estructura en doble hélice sugiere cómo el material genético podría determinar la
estructura de las proteínas. Quizá la secuencia de pares de nucleótidos en el DNA
dicte la secuencia de aminoácidos en la proteína especificada por el gen. En otras
palabras, alguna clase de código genético podría escribir la información en el DNA
como una secuencia de nucleótidos y luego traducirlo en el lenguaje diferente de la
secuencia de aminoácidos de la proteína. Cómo esto se hace es el tema del Capítulo
9.
2. Si la secuencia de bases del DNA especifica la secuencia de aminoácidos, entonces la
mutación es posible a través de la sustitución de un tipo de base por otra en una o
más posiciones. Las mutaciones se discutirán en el Capítulo 15.
3. Como Watson y Crick han señalado en las palabras finales de su trabajo en Nature de
1953, que comunicaba la estructura de doble hélice del DNA: “No se ha escapado a
nuestra atención de que el apareamiento específico que hemos postulado sugiere
inmediatamente un posible mecanismo de copia del material genético”. Para los
genetistas de la época, el significado de esta declaración fue claro, como se verá en la
siguiente sección.
El experimento de Meselson-Stahl
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Para comprender el proceso de la replicación del DNA, había que determinar si el
mecanismo era semiconservativo, conservativo o dispersivo. En 1958, dos jóvenes
científicos, Matthew Meselson y Franklin Stahl, se propusieron descubrir cuál de estas tres
posibilidades describe de manera correcta la replicación del DNA. Su idea era permitir que
las moléculas parentales que contienen nucleótidos de una densidad determinada se
repliquen en un medio que contenía nucleótidos de densidad diferente. Si el DNA se replica
de manera semiconservativa, las moléculas hijas deberán tener una cadena con la densidad
de la molécula original y una cadena con la densidad de los nuevos nucleótidos; en
consecuencia, las moléculas hijas presentarán una densidad intermedia. Para realizar este
experimento, crecieron células de E. coli en un medio que contenía el isótopo pesado del
Nitrógeno (15N) en vez de la forma normal más ligera (14N). El isótopo se insertó en las bases
nitrogenadas, y se incorporaron en la molécula de DNA sintetizada de nuevo. Después de
muchas divisiones celulares en un medio rico en 15N, el DNA de las células estuvo marcado
por completo con este isótopo pesado. Entonces, se cambiaron las células del medio con 15N
a un medio con 14N; y después de una y dos divisiones celulares, se retiraron muestras de las
que se aisló el DNA.
Meselson y Stahl fueron capaces de distinguir el DNA de diferentes densidades
debido a que las moléculas se separan unas de otras por un proceso llamado centrifugación
en gradiente de cloruro de cesio. Si el cloruro de cesio (CsCl) se centrifuga a velocidades
tremendamente altas (50.000 rpm) durante muchas horas, los iones de cesio y de cloruro son
empujados por la fuerza centrífuga hacia la parte inferior del tubo. Finalmente, se establece
un gradiente de iones en el tubo, de manera que los iones de mayor densidad se depositan en
el fondo. El DNA centrifugado con cloruro de cesio forma una banda en la posición
correspondiente a su densidad en el gradiente (Figura 7-13). El DNA de diferentes
densidades formará bandas en distintas posiciones. Las células crecidas en el medio con el
isótopo pesado 15N mostraron un DNA de alta densidad. Este DNA se muestra en azul en el
lado
(Fin de página 276)
La horquilla de replicación
Otra predicción del modelo de Watson y Crick es que durante el proceso de la
replicación del DNA, se forma una cremallera u horquilla en la molécula. Esta horquilla se
encuentra en el lugar donde la doble hélice se desenrolla para exponer las dos cadenas
simples que servirán de molde para el proceso de duplicación. En 1963, John Cairns puso a
prueba esta predicción permitiendo que el DNA de las células bacterianas se replique
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incorporando timidina tritiada ([3H]-timidina); el nucleótido timina marcado con un isótopo
radioactivo llamado tritio. En teoría, cada molécula hija recién sintetizada debería contener
una cadena radiactiva (“caliente”) con 3H y otra cadena no radioactiva (“fría”). Después de
varios intervalos y varios ciclos de replicación en un medio “caliente”, Cairns produjo la
lisis bacteriana y permitió que el contenido celular se depositase sobre una pieza de papel de
filtro, que colocó luego en un portaobjetos de microscopio. Por último, Cairns cubrió el
filtro con emulsión fotográfica y la expuso en la oscuridad durante dos meses. Este
procedimiento, llamado autorradiografía, le permitió a Cairns revelar una foto de la
localización del 3H en el material celular. A medida que el 3H decae, emite partículas beta, un
tipo de electrón energético. La emulsión fotográfica detecta una reacción química que tiene
lugar donde sea que la partícula beta golpee la emulsión. Al revelar la emulsión como una
fotografía, se pueden observar las partículas beta como puntos negros o granos.
Luego de un ciclo de replicación en [3H]-timidina, aparece en la fotografía un anillo
de puntos. Cairns interpretó este
(Fin de la página 277)
DNA polimerasas
El siguiente problema que se les planteó a los científicos, era comprender cómo
hacen las bases para unirse al molde de la doble hélice. Aunque los investigadores
sospechaban que las enzimas jugaban algún papel, tal posibilidad no se demostró hasta
1959, cuando Arthur Kornberg aisló la DNA polimerasa de E. coli y demostró su actividad
enzimática in vitro. Esta enzima añade desoxirribonucleótidos al extremo 3’ de una cadena
de nucleótidos, y emplea como molde una cadena sencilla de DNA que se expone tras
desenrollarse la doble hélice (Figura 7-15). El sustrato para la DNA polimerasa son las
formas trifosfato de los desoxirribonucleótidos, dATP, dGTP, dCTP y dTTP.
Ahora se conocen cinco DNA polimerasas en E. coli; la primera enzima que purificó
Kornberg se denomina DNA polimerasa I, o pol I. Estas enzimas tienen tres actividades, que
parecen estar localizadas en partes diferentes de la molécula:
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moléculas/célula) y se disocia del DNA después de la incorporación de 20 a 50 nucleótidos.
En 1969, John Cairns y Paula DeLucia resolvieron este asunto
(Fin de página 278)
A medida que la DNA pol III se mueve, la doble hélice se desenrolla continuamente
por delante de la enzima para exponer fragmentos adicionales de DNA de simple cadena que
actuarán como molde (Figura 7-16). La DNA pol III actúa en la horquilla de replicación, la
zona donde la doble hélice se encuentra desenrollada. Sin embargo, debido a que la DNA
polimerasa siempre añade nucleótidos al extremo 3’en crecimiento, sólo una de las dos
cadenas antiparalelas puede servir como molde para la replicación en la dirección de la
(Fin de página 15)
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del DNA de relleno al extremo 5’ del fragmento de Okazaki que se encuentra río abajo. La
cadena formada de esta manera se llama la cadena retrasada. La DNA ligasa une las piezas
sueltas de DNA
(Fin de página 279)
Mensaje: La replicación del DNA tiene lugar en la horquilla de replicación, donde la doble
cadena se desenrolla y las dos cadenas se separan. La replicación progresa continuamente en
dirección hacia la horquilla sobre la cadena líder. El DNA se sintetiza en pequeños
fragmentos en dirección contraria a la horquilla sobre la cadena retrasada. La DNA
polimerasa requiere un cebador, una cadena corta de nucleótidos que se encuentra en el sitio
para poder iniciar la síntesis.
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Algunos de los componentes que interactúan en el replisoma de E. coli se muestran
en la Figura 7-18. En la horquilla de replicación, el núcleo catalítico de la DNA pol III forma
parte de un complejo mucho mayor, llamado holoenzima pol III, que consiste de dos
núcleos catalíticos y muchas proteínas accesorias. Uno de los núcleos catalíticos dirige la
síntesis en la cadena líder mientras que el otro núcleo conduce la síntesis en la cadena
retrasada. Algunas proteínas accesorias (no se observan en la Figura 7-18) forman una
conexión que
(Fin de página 282)
Cuando se propuso el modelo de la doble hélice en 1953, una objeción mayor fue
que la replicación de este tipo de estructura necesitaría desenrollar la doble hélice en la
horquilla de replicación y romper los puentes de hidrógeno que mantienen unidas a las
cadenas. ¿Cómo podría desenrollarse tan rápidamente el DNA? Y si lo hiciera, ¿cómo hace
para no enrollar en exceso el DNA por detrás de la horquilla y provocar un nudo? Ahora se
conoce que el replisoma contiene dos clases de proteínas que abren la doble hélice y
previenen el superenrollamiento: estas enzimas son las helicasas y las topoisomerasas,
respectivamente. Las helicasas son enzimas que rompen los puentes de hidrógeno que
mantienen unidas a las dos cadenas de la doble hélice. Como la proteína abrazadera, la
helicasa se ajusta como un dónut alrededor del DNA; desde esta posición, desenrolla
rápidamente la doble hélice para permitir la síntesis. Las proteínas de unión a cadena
sencilla (SSB, del inglés single-strand binding), estabilizan el DNA desenrollado al unirse a
la cadena sencilla y prevenir la formación del dúplex.
El DNA circular puede doblarse y enrollarse como lo hace una goma elástica. El
desenrollamiento de la horquilla de replicación por la helicasa causa un superenrollamiento
compensatorio en otras regiones, formándose espirales denominadas “superenrolladas” que
liberan a la cadena de la torción extra. Las torsiones y los “superenrollamientos” deben
eliminarse para permitir que continúe la replicación. Las enzimas llamadas topoisomerasas
pueden crear o relajar estos enrollamientos, tal como lo hace la DNA girasa (Figura 7-19).
Las topoisomerasas relajan el DNA superenrollado produciendo roturas en la cadena sencilla
o doble de DNA, lo que permite rotar al DNA hacia una molécula más relajada. La acción de
las topoisomerasas finaliza reuniendo las cadenas de la molécula, ahora relajada, de DNA.
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Mensaje: Una maquinaria molecular denominada replisoma lleva a cabo la síntesis de DNA.
La maquinaria incluye dos unidades de DNA polimerasa que realizan la síntesis en cada
cadena y coordinan la actividad de las proteínas accesorias requeridas para formar el
cebador, desenrollar la doble hélice y estabilizar las cadenas simples.
(Fin de página 19) 283
El montaje del replisoma es un proceso ordenado que comienza en sitios precisos del
cromosoma, llamados orígenes, y tiene lugar sólo en determinados momentos del ciclo
celular. La replicación en E. coli se inicia en un sitio fijo (llamado oriC) y desde allí procede
en ambas direcciones (formando una horquilla en los dos extremos, como se muestra en la
Figura 7-14), que prosigue hasta que las horquillas se fusionan. La Figura 7-20 muestra el
proceso en detalle. El primer paso en el montaje del replisoma es la unión de una proteína
denominada DnaA a una secuencia específica de 13 pares de bases (pb), que se repite cinco
veces en el oriC, llamada “caja de DnaA”. Como respuesta a la unión de la DnaA, el origen
se desenrolla a partir de una región rica en nucleótidos A y T. Recuerde que los pares de
bases A-T se mantienen unidos por dos puentes de hidrógeno, mientras que los G-C se
mantienen unidos por tres. De esta forma, es más fácil separar la doble hélice en regiones
del DNA ricas en bases A y T.
Al comenzar la apertura de la doble hélice, más proteínas DnaA se unen a la región de
cadena sencilla recién abierta. Mientras las proteínas DnaA cubren el origen, dos helicasas
(las proteínas DnaB) se unen y se deslizan en dirección 5’ a 3’ para mantener la apertura de
la doble hélice en la horquilla de replicación. La primasa y la holoenzima DNA pol III se
incorporan a la helicasa a través de una interacción proteína-proteína, y comienza así la
síntesis de DNA. ¿Por qué la DnaA no está presente en la Figura 7-18 (la maquinaria del
replisoma)?. La respuesta es que no forma parte de la maquinaria del replisoma. Su trabajo
es más bien conducir al replisoma al sitio correcto del cromosoma circular para iniciar la
replicación.
El replisoma eucariótico
El replisoma de E. coli contiene 13 componentes conocidos y al menos se conocen
27 componentes en los replisomas de las levaduras y los mamíferos. Una razón para la
complejidad adicional del replisoma eucariótico es la mayor complejidad del molde
eucariótico. Cabe recordar que a diferencia del cromosoma bacteriano, los cromosomas
eucarióticos se encuentran en el núcleo formando la cromatina. Como se describe en el
Capítulo 2, la unidad básica de la cromatina es el nucleosoma, que es el DNA enrollado
alrededor de proteínas de histonas. Así, el replisoma no sólo tiene que copiar la cadena
parental sino que también debe desensamblar el nucleosoma y volver a ensamblarlo en las
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moléculas hijas. Esta maniobra la realiza mediante la distribución aleatoria de las histonas
viejas (de los nucleosomas existentes) a las moléculas hijas y
(Fin de página 284)
Mensaje: El replisoma eucariótico realiza todas las funciones del replisoma procariótico; y
además, desensambla y vuelve a ensamblar los complejos DNA-proteínas llamados
nucleosomas.
Mensaje: Cuándo y dónde tiene lugar la replicación está cuidadosamente controlado por el
ensamblaje ordenado del replisoma en un sitio específico llamado origen. La replicación
tiene lugar en ambas direcciones desde un único origen en el cromosoma procariótico
circular. La replicación tiene lugar en ambas direcciones desde cientos o miles de orígenes
en cada uno de los cromosomas lineales eucarióticos.
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La replicación del DNA y el ciclo celular de las levaduras
La síntesis del DNA tiene lugar en la fase S (síntesis) del ciclo celular eucariótico (Figura 7-
23). ¿Cómo se limita el inicio de la síntesis a esta única etapa? En las levaduras, el método
de control es asociar el ensamblaje del replisoma al ciclo celular. La Figura 7-24 muestra el
proceso. En las levaduras, se requieren tres proteínas para comenzar el montaje del
replisoma. El complejo de reconocimiento del origen (ORC, del inglés, origin recognition
complex) se une primero a las secuencias de origen de la levadura, como lo hace la proteína
DnaA en E. coli.
(Fin de página 286)
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condensada y unirse primero a estos orígenes, y entonces podría unirse a los sitios de
cromatina condensada sólo después de que se hayan replicado las regiones ricas en genes.
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Es interesante remarcar que la proteína telomerasa lleva una pequeña molécula de RNA, que
actúa como molde para la polimerización de la unidad repetida telomérica. En todos los
vertebrados, incluyendo los humanos, la secuencia de RNA 3’-AAUCCC-5’ actúa como
molde para la unidad repetida 5’-TTAGGG-3’ por un mecanismo como el que se muestra en
la Figura 7-26. Brevemente, primero la telomerasa se alinea al extremo 3’ saliente del DNA,
que se extiende por acción de los dos componentes de la telomerasa: el pequeño RNA (como
molde) y la proteína (con actividad polimerasa). Después de añadir unos pocos nucleótidos
al extremo 3’ saliente, la telomerasa mueve el RNA sobre el DNA de manera que el extremo
3’ puede extenderse por su actividad polimerasa. Movimientos repetidos de la telomerasa
continúan extendiendo el extremo 3’. La primasa y la DNA polimerasa emplean este
extremo saliente y muy largo como molde para rellenar el extremo de la otra cadena de
DNA.
Mensaje: Los telómeros son estructuras especializadas de los extremos de los cromosomas,
que contienen repeticiones en tándem de una secuencia corta de DNA que se añade al
extremo 3’ por la enzima telomerasa. Los telómeros estabilizan los cromosomas previniendo
la pérdida de información genómica después de cada ronda de replicación y se asocian con
proteínas para formar un tapón que “oculta” los extremos cromosómicos de la maquinaria
celular de reparación del DNA.
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de arrugas en la piel, cataratas, osteoporosis, canas en el cabello y enfermedades
cardiovasculares (Figura 7-28). Los estudios genéticos y bioquímicos descubrieron que las
personas afectadas tienen los telómeros más cortos que las personas sanas debido a una
mutación en el gen denominado WRN, que codifica para una proteína (una helicasa) que
forma parte de la estructura del tapón del telómero (véase la Figura 7-27). Se cree que esta
mutación altera la formación del telómero normal que lleva a la inestabilidad cromosómica y
al fenotipo de envejecimiento prematuro. Los pacientes con otro síndrome de
envejecimiento llamado disqueratosis congénita (DC) también tienen los telómeros más
cortos que la gente no afectada de su misma edad, y también portan mutaciones en los genes
necesarios para la actividad de la telomerasa.
Los genetistas están interesados también en las conexiones que existen entre los
telómeros y el cáncer. A diferencia de las células somáticas normales, la mayoría de las
células cancerígenas tienen actividad telomerasa.
(Fin de página 290
Resumen
El trabajo experimental sobre la naturaleza molecular del material hereditario demostró sin
lugar a dudas que el DNA es el material genético (y no las proteínas, los lípidos o los
carbohidratos). Utilizando los datos obtenidos por otros, Watson y Crick dedujeron el
modelo de la doble hélice con dos cadenas de DNA enrolladas una alrededor de la otra, en
sentido antiparalelo. La unión de las dos cadenas se mantiene por el encaje entre adenina (A)
y timina (T) y entre guanina (G) y citosina (C). El primer par se mantiene por dos puentes de
hidrógeno y el último par se mantiene por tres puentes de hidrógeno.
El modelo de Watson y Crick muestra cómo el material genético puede replicarse de
una forma ordenada, una condición primordial del material genético. La replicación se
realiza de forma semiconservativa tanto en procariotas como en eucariotas. Una doble hélice
se replica para formar dos hélices hijas idénticas, cada una de las cuales contiene una cadena
vieja y una cadena recién polimerizada de DNA.
La doble hélice se desenrolla en la horquilla de replicación, y las dos cadenas simples
sirven como molde para la polimerización de nucleótidos libres. La enzima encargada de
este proceso es la DNA polimerasa, que añade nuevos nucleótidos sólo al extremo 3’ libre de
la cadena creciente. Debido a que la adición se produce sólo en el extremo 3’, la
polimerización en un molde es continua, constituyendo la cadena líder; mientras que en el
otro molde, se debe realizar en fragmentos cortos y discontinuos (los fragmentos de
Okasaki), produciendo la cadena retrasada. La síntesis de la cadena líder y de los fragmentos
de Okasaki se inicia por un cebador corto de RNA (sintetizado por la primasa) que
suministra el extremo 3’ libre necesario para la adición de los desoxirribonucleótidos.
Los múltiples sucesos que tienen lugar de una forma rápida y exacta en la horquilla
de replicación los realiza el replisoma, una máquina biológica. Este complejo de proteínas
incluye dos unidades de DNA polimerasa, una que actúa en la cadena líder y la otra que
actúa en la cadena retrasada. De esta forma, el proceso que más tiempo consume, que es la
síntesis y reunión de los fragmentos de Okasaki en una cadena continua, se coordina en el
19
tiempo con la síntesis menos complicada de la cadena líder. El momento y el lugar en que
ocurre la replicación están controlados cuidadosamente por el ensamblaje ordenado del
replisoma en ciertos lugares del cromosoma llamados orígenes. En los genomas eucarióticos
puede haber decenas de miles de orígenes. El montaje del replisoma en los orígenes tiene
lugar sólo en un momento específico del ciclo celular.
Los extremos de los cromosomas lineales, los telómeros, presentan un problema para
el sistema de replicación porque siempre queda un trecho corto en una cadena en el que no
puede colocarse un cebador. La enzima telomerasa añade un cierto número de secuencias
repetitivas cortas para mantener la longitud. La telomerasa lleva un RNA corto que actúa
como molde para la síntesis de las repeticiones teloméricas. Estas repeticiones no
codificadoras se asocian a proteínas para formar un tapón telomérico. En las células
somáticas, los telómeros se van acortando progresivamente con la edad debido a que la
telomerasa no se produce en estas células. Los individuos que tienen los telómeros
defectuosos experimentan un envejecimiento prematuro.
Términos clave
-abrazadera
antígeno nuclear de proliferación celular (PCNA)
base
base complementaria
cadena líder
cadena rezagretrasada
cebador
código genético
desoxirribosa
DNA ligasa
doble hélice
enzima distributiva
enzima procesiva
estructura Theta
fosfato
fragmento de Okasaki
helicasa
holoenzima polimerasa III (pol III)
molécula hija
nucleosoma
nucleótido
orientación antiparalela
orígen de replicación
primasa
primosoma
proteínas accesorias
replicación conservativa
replicación dispersiva
surco mayor
surco menor
telomerasa
telómero
topoisomerasa
20
Problemas resueltos
Problema 1
La mitosis y la meiosis se estudiaron en el Capítulo 2. Considerando que en este capítulo se
han visto los conceptos relacionados con la replicación del DNA, represente gráficamente el
contenido de DNA en la célula en función del tiempo que sufre mitosis y meiosis. Suponga
que se trata de una célula diploide.
Solución
(Gráfico)
Problema 2
Si el contenido de CG de una molécula de DNA es del 56 %, ¿cuáles son los porcentajes de
las cuatro bases en ésta molécula? (A, T, G, C)
Solución
Si el contenido de GC es del 56 %, entonces G = C, el contenido de G es del 28% y el
contenido de C es del 28% también. El contenido de AT es 100 – 56 = 44%. Como A = T, el
contenido de A es 22% y el contenido de T es del 22%.
Problema 3
Describa el patrón de bandas esperado en un gradiente de CsCl para la replicación
conservativa del experimento de Meselson y Stahl. Dibuje un diagrama.
Solución
Consulte la Figura 7-13 para una explicación adicional. En la replicación conservativa, si la
bacteria crece en presencia de 15N y luego se la cambia a 14N, una molécula de DNA será 15N
después de la primera generación y la otra molécula 14N, que se verá en el gradiente como
una banda pesada y una banda ligera. Después de la segunda generación, el DNA con 15N
producirá una molécula con 15N y una molécula con 14N, mientras que la molécula con 14N
sólo producirá moléculas con 14N. De esta manera, se producen moléculas que sólo llevan
14
N y moléculas que sólo llevan 15N, que generaran una banda liviana y una banda pesada
nuevamente:
Problemas
PROBLEMAS BÁSICOS
1. Describa los tipos de enlaces químicos que existen en la doble hélice de DNA.
3. ¿Qué entiende por cebador, y por qué los cebadores son necesarios para la replicación del
DNA?
21
4. ¿Qué son las helicasas y las topoisomerasas?
5. Por qué la síntesis del DNA es continua en una cadena y discontinua en la cadena opuesta.
9. ¿Qué ocurriría si, durante la replicación, las topisomerasas fueran incapaces de reunir los
fragmentos de DNA de cada cadena después que se desenrollara (relajara) la molécula de
DNA?
10. Cuál de las siguientes afirmaciones sería verdadera si la síntesis de DNA fuera
discontinua en cada cadena:
a. Los fragmentos de DNA de las dos nuevas cadenas se mezclarían, produciendo posibles
mutaciones.
b. La síntesis de DNA no tendría lugar, porque las enzimas apropiadas para la replicación
discontinua no estarían presentes en las dos cadenas.
c. La síntesis de DNA llevaría mucho tiempo, pero no habría otra diferencia.
d. La síntesis de DNA no tendría lugar, debido a que el cromosoma no podría estar
desenrollado en toda su longitud antes de que las dos cadenas estuvieran replicadas en una
forma discontinua.
12. ¿Por qué es esencial que los cebadores de RNA de los extremos de los fragmentos de
Okasaki se eliminen y se reemplacen por DNA? De no producirse, ¿cuál de los siguientes
sucesos ocurriría?
a. El RNA puede que no fuera leído exactamente durante la transcripción, e interferiría en la
síntesis de proteínas.
b. El RNA tendría una mayor probabilidad de contener errores debido a que la primasa
carece de función de corrección de pruebas.
c. Los fragmentos de RNA podrían desestabilizarse y comenzar a romperse en
ribonucleótidos, creando huecos en la secuencia.
d. Los cebadores de RNA podrían formar puentes de hidrógeno entre sí, formando
estructuras complejas que podrían interferir con la formación de la doble hélice de DNA.
22
13. Las polimerasas generalmente sólo añaden 10 nucleótidos a una cadena de DNA antes de
disociarse. Sin embrago, durante la replicación, la DNA pol III puede añadir decenas de
miles de nucleótidos en una horquilla en movimiento. ¿Cómo se lleva a cabo esta adición?
14. En cada origen de replicación hay dos horquillas de replicación. ¿Cuál de los siguientes
supuestos podría ocurrir si surge un mutante que tenga sólo una horquilla funcional por
burbuja de replicación? (Véase el diagrama).
Normal Mutante
a. No cambia nada en la replicación.
b. La replicación sólo podría ocurrir en la mitad del cromosoma.
c. La replicación sólo podría completarse en la cadena líder.
d. La replicación tardaría el doble de tiempo.
15. En una célula diploide con 2n = 14, ¿cuántos telómeros hay en cada una de las siguientes
fases del ciclo celular: (a) G1; (b) G2; (c) profase mitótica; (d) telofase mitótica?
16. Si la timina representa al 15 % de las bases de una molécula específica de DNA. ¿Qué
porcentaje representa la citosina?
18. Suponiendo que un cierto cromosoma bacteriano tiene un origen de replicación. Bajo
condiciones de rápida división celular, la replicación podría comenzar desde el origen antes
de que la replicación precedente finalizara el ciclo completo. ¿Cuántas horquillas de
replicación podrían estar presentes bajo esas condiciones?
21. Considere el siguiente fragmento de DNA, que es parte de una molécula mucho mayor
que constituye un cromosoma:
5’ ….ATTCGTACGATCGACTGACTGACAGTC…..3’
3’ ….TAAGCATGCTAGCTGACTGACTGTCAG…..5’
Si la DNA polimerasa comienza la replicación en este fragmento desde la derecha,
a. ¿cuál será el molde de la cadena líder?
(Fin de página 293
23
c. Esquematice las dos moléculas hijas completas.
d. Su diagrama de la parte b ¿es compatible con la replicación bidireccional desde un origen
simple, o sea, con el modo normal de replicación?
22. Las DNAs polimerasas están posicionadas sobre el siguiente fragmento de DNA (que
forma parte de una molécula mucho mayor) y se están moviendo desde la derecha hacia la
izquierda. Si suponemos que se forma un fragmento de Okazaki a partir de este fragmento,
¿cuál sería la secuencia del fragmento? Marque los extremos 5’ y 3’.
5’ … CCTTAAGACTAACTACTTACTGGGATC…3’
3’ … GGAATTCTGATTGATGAATGACCCTAG…5’
23. Los cromosomas de E. coli en los que el átomo de N está marcado (es decir, cada átomo
de nitrógeno es el isótopo pesado 15N en vez del isótopo normal 14N), se replica en un
ambiente en el que todo el nitrógeno es 14N. Usando una línea sólida para representar una
cadena de oligonucleótidos pesada y una línea de puntos para una cadena ligera,
esquematice cada una de las siguientes descripciones:
a. El cromosoma parental y el producto de la primera replicación después de transferir las
células a un medio con 14N, suponiendo que el cromosoma es una doble hélice de DNA y
que la replicación es semiconservativa.
b. Repita la parte a, pero ahora suponga que la replicación es conservativa.
c. Repita la parte a, pero suponiendo que el cromosoma son dos doble hélice lado a lado, y
cada una de ellas se replica semiconservativamente.
d. Repita la parte c, pero suponiendo que cada doble hélice se replica conservativamente y
que la replicación conjunta del cromosoma es semiconservativa.
e. Si el cromosoma hijo de la primera división en 14N es centrifugado en un gradiente de
densidad de CsCl y se obtiene una sola banda, ¿cuáles de las posibilidades de los apartados
de a hasta d podrían ser descartadas? Reconsidere el experimento de Meselson y Stahl: ¿qué
es lo que demuestra?
24. Una estudiante del laboratorio del profesor Griffith encontró tres muestras celulares
marcadas con “A”, “B”, y “C”. No conocía lo que contenía cada muestra, y decidió intentar
inyectarlas en sus ratones, tanto por separado como en combinación, para ver si podía
determinar lo que contenía cada muestra. Observó las respuestas de los ratones inyectados
después de un período de incubación y extrajo sangre de cada grupo para observar la
presencia de células infectadas. Anotó sus observaciones en la siguiente tabla. Suponiendo
que cada muestra contenía una sola cosa en estado puro, ¿qué es lo que piensa que había en
las muestras “A”, “B”, y “C”?
Muestra inyectada
A
B
C
A+B
A+C
B+C
A+B+C
Respuesta del ratón
Muerto
Ninguna
Ninguna
Muerto
24
Muerto
Muerto
Muerto
Tipos de células recuperadas del ratón
Células vivas S
Ninguna
Células vivas R
Células vivas S
Células vivas R y S
Células vivas S
Células vivas S
25. Si en el experimento del problema 24 la capa de proteínas de las células fuera el factor
transformante, ¿qué resultados esperaría? Complete la siguiente tabla y recuerde que las
muestras son las mismas que en el problema 24.
Muestra inyectada
A
B
C
A+B
A+C
B+C
A+B+C
Respuesta del ratón
27. En el planeta Rama, el DNA tiene seis tipos de nucleótidos: A, B, C, D, E y F. Los tipos
A y B se denominan marzinas, los tipos C y D se denominan orsinas, y el E y F son pirinas.
Las siguientes reglas son válidas para el DNA de Rama
A=C=E
B=D=F
b. En Rama, la mitosis produce tres células hijas. Teniendo en cuenta esto, proponga un
patrón de replicación para su modelo de DNA.
28. Si extrae el DNA del colifago X174, encontrará que su composición es del 25 % de A,
el 33 % de T, el 24 % de G y el 18% de C. ¿Tiene sentido esta composición basándose en las
25
reglas de Chargaff? ¿Cómo podría interpretar estos resultados? ¿Cómo hará el colifago para
replicar su DNA?
26
FIGURAS
Modelo por ordenador del DNA. (J. Newdol, Computer Graphics Laboratory,
University of California, San Francisco. Copyright by Regents, University of
California)
FIGURA 7-1 Modelo de Watson y Crick de la molécula de DNA del Museo de las
Ciencias, Valencia, España (Arco Images/Alarmy)
FIGURA 7-2
Título: Transformación de células R en células S
La presencia de células S muertas por calor transforma a células vivas R en células
S.
a) Ratón que muere después de una inyección con la cepa virulenta S.
b) Ratón que sobrevive después de una inyección con la cepa R.
c) Ratón que sobrevive después de una inyección con la cepa S muerta por calor.
d) Ratón que muere después de una inyección con una mezcla de la cepa S muerta
por calor y la cepa R viva. La cepa S muerta por calor transforma de alguna manera
a la cepa R en virulenta. (De G.S. Stent y R. Calendar. Molecular Genetics, 2nd ed.
Copyright 1978 by W. H. Freeman and Company. De R. Sager y F. J. Ryan. Cell
Hereduty. Wiley 1961)
FIGURA 7-3
Título: El DNA es el agente transformador.
El DNA es el agente transformador de la cepa R hacia la virulencia. Si se destruye el
DNA en un extracto de células de la cepa S muertas por calor, entonces el ratón
inyectado con una mezcla de células muertas por calor y células de la cepa no
virulenta R ya no moriría.
FIGURA 7-4
Título: El material genético del fago es el DNA
El experimento de Hershey-Chase demostró que el material genético del fago es el
DNA, no las proteínas. El experimento empleó dos grupos de bacteriófagos T2. En
un grupo, la capa de proteína está marcada con azufre radioactivo (35S), que no se
encuentra en el DNA. En el otro grupo, el DNA está marcado con fósforo
radioactivo (32P), que no se encuentra en las proteínas. Sólo el 32P es inyectado en E.
coli, indicando que el DNA es el agente necesario para la producción de nuevos
fagos.
FIGURA 7-5
Título: Estructuras de los cuatro nucleótidos del DNA
Estos nucleótidos, dos con bases púricas y dos con bases pirimidínicas, son los
bloques constructivos fundamentales del DNA. El azúcar se llama desoxirribosa
porque es una variación del azúcar común ribosa, que tiene un átomo más de
oxígeno (la posición se indica con una flecha roja)
FIGURA 7-6
Título: Resultado crucial del experimento de Rosalind Franklin
27
Rosalind Franklin (izquierda) y su patrón de difracción de rayos X del DNA
(derecha).
(Izquierda) Cortesía de la Galería Nacional Portrait, Londres; (derecha) Rosalind
Franklin/Science Source/Photo Researchers)
FIGURA 7-7
Título: El primer modelo del DNA
James Watson y Francis Crick con su modelo del DNA (Camera Press)
FIGURA 7-8
Título: La estructura del DNA
a) Modelo simplificado que muestra la estructura helicoidal del DNA. Las barras
representan los pares de bases y las cintas representan los esqueletos de azúcar-
fosfato de las dos cadenas antiparalelas.
b) Un diagrama exacto de la estructura química de la doble hélice, desenrollado
para mostrar los esqueletos de azúcar-fosfato (en azul) y los peldaños de los pares
de bases (en rojo). Los esqueletos corren en direcciones opuestas: los extremos 5’ y
3’ se nombran por la orientación de los átomos de carbono 5’ y 3’ del anillo del
azúcar. Cada par de bases tiene una base púrica, (A) adenina o (G) guanina, y una
base pirimidínica, timina (T) o citosina (C), conectadas por puentes de hidrógeno
(líneas discontinuas). (De R.E. Dickerson, “The DNA Helix and How it is Read”.
Copyright 1983 por Scientific American, Inc. Todos los derechos reservados.
FIGURA 7-9
Título: Dos representaciones de la doble hélice de DNA
Diagrama en cintas (a) destacando el apilamiento de los pares de bases, mientras
que el modelo espacial (b) muestra los surcos mayor y menor. ((b) De C. Yanofsky,
“Gene Structure and Protein Structure”. Copyright 1967 by Scientific American, Inc.
Todos los derechos reservados).
FIGURA 7-10
Título: Apareamiento de bases en el DNA
El apareamiento de las purinas y las pirimidinas explica exactamente el diámetro de
la doble hélice determinado por los datos de rayos X. El diámetro está indicado por
las líneas discontinuas verticales. (De R.E. Dickerson, “The DNA Helix and How it
is Read”. Copyright 1983 por Scientific American, Inc. Todos los derechos
reservados).
FIGURA 7-11
Título: Replicación semiconservativa del DNA
El modelo semiconservativo de la replicación del DNA propuesto por Watson y
Crick se fundamenta en la especificidad de puentes de hidrógeno de los pares de
bases. Las cadenas parentales, mostradas en azul, sirven de molde para la
polimerización. Las cadenas recién sintetizadas, mostradas en dorado, tienen
secuencias de bases que son complementarias a sus respectivos moldes.
FIGURA 7-12
Título: Tres modelos alternativos para la replicación de DNA
28
De los tres modelos alternativos para la replicación del DNA, el modelo de Watson
y Crick de la estructura del DNA produciría el primero (semiconservativo). Las
líneas amarillas representan las cadenas recién sintetizadas.
FIGURA 7-13
Título: El DNA se copia mediante replicación semiconservativa
El experimento de Meselson y Stahl demuestra que el DNA se copia por replicación
semiconservativa. El DNA centrifugado en gradiente de cloruro de cesio (CsCl)
formará bandas de acuerdo a su densidad.
a) Cuando las células crecen en 15N y se transfieren a un medio con 14N, la primera
generación produce dos bandas: una intermedia y una liviana. Este resultado está
de acuerdo con las predicciones del modelo semiconservativo de la replicación del
DNA. (b y c) El resultado predicho por el modelo conservativo y dispersivo.
FIGURA 7-14
Título: Replicación de un cromosoma bacteriano
Un cromosoma bacteriano que se replica tiene dos horquillas de replicación. a)
Izquierda: Autorradiografía de un cromosoma bacteriano después de una replicación
en timidina tritiada. De acuerdo al modelo semiconservativo de replicación, una de
las dos cadenas debe ser radioactiva. Derecha: Interpretación de la autorradiografía.
La hélice en amarillo representa la cadena tritiada.
b) Izquierda: Autorradiografía de un cromosoma bacteriano en la segunda ronda de
replicación en timidina tritiada (3H). En esta estructura theta (), la doble hélice
recién replicada que atraviesa el círculo podría consistir de dos cadenas radioactivas
(si la cadena parental fuera la radiactiva). Derecha: El doble grosor de la
radioactividad calcado de la autorradiografía parece confirmar la interpretación
mostrada aquí.
FIGURA 7-15
Título: Reacción catalizada por la DNA polimerasa
La DNA polimerasa cataliza la reacción de elongación de la cadena. La energía para
la reacción proviene de la rotura de los enlaces fosfato de la alta energía del sustrato
trifosfato.
FIGURA 7-16
Título: Replicación del DNA en la horquilla creciente
La horquilla de replicación se desplaza durante la síntesis del DNA a medida que la
doble hélice se va desenrollando. La síntesis de la cadena líder puede proceder
lisamente sin interrupción en la dirección de la horquilla de replicación, pero la
síntesis de la cadena retrasada debe proceder en la dirección opuesta, fuera de la
horquilla de replicación.
FIGURA 7-17
Título: Síntesis de la cadena retrasada
Pasos en la síntesis de la cadena retrasada. La síntesis del DNA procede por la
síntesis continua en la cadena líder y la síntesis discontinua en la cadena retrasada.
FIGURA 7-18
29
Título: Proteínas que operan en la horquilla de replicación
El replisoma y las proteínas accesorias llevan a cabo numerosos pasos en la
horquilla de replicación. Las topoisomerasas y las helicasas desenrollan y abren la
doble hélice preparándola para la replicación. Cuando la doble hélice se abre, las
proteínas que se unen a las cadenas simples evitan que se vuelva a cerrar. La
ilustración es una representación del modelo llamado trombón (denominado así
por su semejanza con el instrumento debido al bucle que se forma en la cadena
retrasada) que muestra cómo los dos núcleos catalíticos del replisoma interactúan
para coordinar los numerosos sucesos de la replicación de la cadena líder y la
retrasada. (De Geoffrey Cooper, The Cell. Sinauer Associates, 200)
FIGURA 7-19
Título: La DNA girasa elimina las torsiones extras
La DNA girasa, que es una topoisomerasa, elimina las torsiones extras durante la
replicación. a) La región con torsiones extras (superenrollada positivamente) se
concentra delante de la horquilla de replicación a medida que las cadenas
parentales se separan para su replicación. b) Una topoisomerasa como la DNA
girasa elimina estas regiones, cortando las cadenas de DNA, permitiéndoles rotar, y
reuniéndolas. ((a) De A. Kornberg y T.A. baker, DNA replication, 2nd ed. Copyright
1992 by W.H. Freeman and Company)
FIGURA 7-20
Título: Iniciación de la replicación en procariotas
La síntesis del DNA de procariotas se inicia en el origen de replicación. Las
proteínas se unen al origen (oriC), donde separan las dos cadenas de la doble hélice
y reclutan los componentes del replisoma a la horquilla de replicación.
FIGURA 7-21
Título: Ensamblaje de los nucleosomas durante la replicación del DNA
La proteína CAF-1 (factor de ensamblaje de la cromatina 1) se une a las histonas de
la horquilla de replicación donde se ensambla para formar los nucleosomas. PCNA,
antígeno nuclear de proliferación celular. Por simplicidad, el ensamblaje del
nucleosoma se muestra en una sola de las cadenas replicadas.
FIGURA 7-22
Título: La replicación del DNA avanza en dos direcciones
La replicación del DNA procede en ambas direcciones desde un origen de
replicación. Las flechas negras señalan la dirección del crecimiento de las moléculas
hijas de DNA. a) Inicio en el origen. La DNA polimerasa se mueve en ambas
direcciones desde el origen. Las flechas largas representan las cadenas líderes y las
cortas representan las cadenas retrasadas. b) Proceso de la replicación a nivel
cromosómico. En este ejemplo se muestran tres orígenes de la replicación.
FIGURA 7-23
Título: Etapas del ciclo celular
30
El DNA se replica durante la fase S del ciclo celular.
FIGURA 7-24
Título: Iniciación de la replicación en eucariotas
Este ejemplo de levaduras muestra la iniciación de la síntesis de DNA en un origen
de replicación eucariótico. Como ya se ha visto en la iniciación procariótica (véase
Figura 7-20), las proteínas del complejo de reconocimiento del origen (ORC) se
unen al origen, donde separan las dos cadenas de la doble hélice y reclutan a los
componentes del replisoma en las dos horquillas de replicación. La replicación está
ligada al ciclo celular a través de la disponibilidad de dos proteínas: Cdc6 y Cdt1.
FIGURA 7-25
Título: El problema de la replicación de los extremos cromosómicos
(Superior) La replicación de cada fragmento de Okazaki sobre la cadena retrasada
comienza con la inserción de un cebador.
(Inferior) El destino de la cadena inferior en la burbuja de trascripción. Cuando se
elimina el cebador del último fragmento de Okazaki de la cadena retrasada, no hay
forma de rellenar el hueco mediante la replicación convencional. Cuando el
cromosoma que contiene el hueco se replica se obtiene un cromosoma acortado.
FIGURA 7-26
Título: Prolongación de los telómeros
La telomerasa lleva una molécula de RNA corta (letras rojas) que actúa como molde
para el añadido de secuencia de DNA complementaria, que se añade al extremo 3’
saliente (letras azules). Para añadir otra repetición, la telomerasa se transloca al final
de la repetición que ha añadido. El extremo 3’ saliente puede entonces servir como
molde para la replicación convencional. (De Lin Kah Wai, “Telomeres, Telomerase
and Tumorigenesis: A review”. Medscape Gen, Med. 2004, 6(3): 19 ©Medscape)
FIGURA 7-27
Título: La estructura del tapón telomérico
Un “tapón” protege al telómero al final de un cromosoma. El extremo 3’ saliente se
“oculta” cuando se sustituye una cadena de DNA en una región donde las
repeticiones teloméricas son de doble cadena. Las proteínas TRF1 y TRF2 se unen a
las repeticiones teloméricas, y otras proteínas, incluyendo la WRN, se unen a TRF1
y TRF2, para formar el tapón protector del telómero.
FIGURA 7-28
Una mujer con el síndrome de Werner a la edad de 15 y 48 años. (International
Registry of Werner Syndrome, www.wernersyndrome.org)
PARCHEADO
FIGURA 7-2
Parcheado:
1. Células vivas de la cepa S
31
2. Ratón muerto
3. Cepa R
4. Ratón vive
5. Cepa S muerta por calor
6. Ratón vive
7. Cepa R
8. Cepa S muerta por calor
9. Ratón muere
10. Células vivas de la cepa S.
FIGURA 7-3
Parcheado:
1. El DNA es el agente transformante
2. Extracto de la cepa S
3. No se destruye ningún componente
4. Se destruyen los polisacáridos
5. Se destruyen los lípidos
6. Se destruye el RNA
7. Se destruyen las proteínas
8. Se destruye el DNA
9. Cepa R
10. Ratón muerto
11. Ratón muerto
12. Ratón muerto
13. Ratón muerto
14. Ratón muerto
15. Ratón sobrevive
16. Cepa S recuperada viva
17. No se recupera cepa S viva.
FIGURA 7-4
Parcheado:
1. El material genético del fago es el DNA
2. Fago T2 35S
3. E. coli
4. Batidora y centrífuga
5. Fantasmas de fagos
6. La mayor parte de la radioactividad se recupera en los fantasmas de los fagos
7. 32P
8. Batidora y centrífuga
9. Fantasmas de fagos
10. La mayor parte de la radioactividad se recupera en las bacterias.
FIGURA 7-5
Parcheado
1. Estructuras de los cuatro nucleótidos del DNA
2. Nucleótidos púricos
3. Fosfato
32
4. Base nitrogenada (Adenina, A)
5. Azúcar desoxirribosa
6. Desoxiadenosina 5’-monofosfato (dAMP)
7. Desoxiguanosina 5’-monofosfato (dGMP)
8. Guanina (G)
9. Nucleótidos pirimidínicos
10. Citosina (C)
11. Desoxicitidina 5’-monofosfato (dCMP)
12. Timina (T)
13. Desoxitimidina 5’-monofosfato (dTMP)
FIGURA 7-6
1. Resultado crucial del experimento de Rosalind Franklin
FIGURA 7-7
1. El primer modelo del DNA
FIGURA 7-8
Parcheado:
1. La estructura del DNA
2. Esqueleto de azúcar-fosfato
3. Par de bases
4. Unidad de nucleósido monofosfato
5. Enlace fosfodiéster.
FIGURA 7-9
Parcheado:
1. Dos representaciones de la doble hélice de DNA
2. Surco mayor
3. Surco menor
4. Pares de bases
5. Esqueleto de azúcar-fosfato
6. H
7. O
8. C in la cadena éster fosfato
9. P
10. C y N en las bases.
FIGURA 7-10
Parcheado:
1. Apareamiento de bases en el DNA
2. Pirimidina + pirimidina: DNA demasiado fino
3. Purina + Purina: DNA demasiado grueso
4: Purina + Pirimidina: grosor compatible con los datos de rayos X
FIGURA 7-11
Parcheado:
1. Replicación semiconservativa del DNA
33
2. Las dos cadenas de la doble hélice parental se desenrollan, y cada una especifica
una nueva cadena hija por las reglas del apareamiento de bases.
3. Vieja
4. Nueva
FIGURA 7-12
Parcheado:
1. Tres modelos alternativos para la replicación de DNA
2. Replicación semiconservativa
3. Replicación conservativa
4. replicación dispersiva
FIGURA 7-13
Parcheado:
1. El DNA se copia mediante replicación semiconservativa
2. a) Predicción del modelo semiconservativo
3. Parental
4. 1º generación
5. 2º generación
6. 15N/15N DNA (pesado)
7. 14N/15N DNA (híbrido)
8. 14N/14N DNA (liviano)
9. b) Predicción del modelo conservativo
10. Parental
11. 1º generación
12. 2º generación
13. 15N/15N DNA (pesado)
14. 14N/14N DNA (liviano)
15. c) Predicción del modelo dispersivo
16. Parental
17. 1º generación
18. 2º generación
19. 15N/15N DNA (pesado)
20. 14N/15N DNA (híbrido)
21. 14N/15N DNA (híbrido)
FIGURA 7-14
1. Replicación de un cromosoma bacteriano
2. (a) Cromosoma después de una ronda de replicación
3. Autorradiografía
4. Interpretación
5. (b) Cromosoma durante la segunda ronda de replicación
6. Autorradiografía
7. Horquillas de replicación
8. Interpretación.
FIGURA 7-15
Parcheado:
34
1. Reacción catalizada por la DNA polimerasa
2. Cadena molde de DNA
3. Cadena molde de DNA
FIGURA 7-16
Parcheado:
1. Replicación del DNA en la horquilla creciente
2. Cadenas molde
3. movimiento de la horquilla
4. Dirección de la síntesis
5. Cadena retrasada
6. Cadena líder
7. Dirección de la síntesis
FIGURA 7-17
Parcheado:
1. Síntesis de la cadena retrasada
2. 1. La primasa sintetiza oligonucleótidos cortos de RNA (cebador) que copia del
DNA.
3. Cebador de RNA
4. 2. La DNA polimerasa III elonga los cebadores de RNA con nuevo DNA
5. DNA nuevo
6. Fragmento de Okazaki
7. 3. La DNA polimerasa I elimina el RNA en el extremo 5’ del fragmento contiguo
y rellena los huecos
8. 4. La DNA ligasa conecta los fragmentos adyacentes.
FIGURA 7-18
Parcheado:
1. Proteínas que operan en la horquilla de replicación
2. Topoisomerasa
3. Movimiento de la horquilla de replicación
4. Helicasa
5. El siguiente fragmento de Okazaki comienza aquí
6. Cebador de RNA
7. Primasa
8. abrazadera β
9. Cadena líder
10. Dímero de la DNA pol III
11. Cebador de RNA
12. Fragmento de Okazaki
13. Proteínas de unión a cadena sencilla
14. DNA polimerasa I
15. Cadena retrasada
16. Ligasa
35
FIGURA 7-19
Parcheado:
1. la DNA girasa elimina los torsiones extras
2. Dúplex parental desenrollado
3. Región de superenrollamiento
4. 1. La DNA girasa corta las cadenas de DNA
5. 2. El DNA rota para eliminar las torsiones
6. 3. La DNA girasa reúne las cadenas de DNA
7. Horquilla de replicación.
FIGURA 7-20
Parcheado:
1. Iniciación de la replicación en los procariotas
2. Región rica en AT
3. Cajas de DnaA
4. Reconocimiento del origen (oriC) y desenrollamiento
5. Múltiples proteínas DnaA
6. Carga de la helicasa
7. Movimiento de la helicasa
8. Reclutamiento del replisoma
FIGURA 7-21
Parcheado:
1. Ensamblaje de los nucleosomas durante la replicación del DNA
2. Histonas sintetizadas recientemente
3. CAF-1
4. DNA que se replica
5. PCNA
6. Ensamblaje intermedio
7. Nucleosoma ensamblado de nuevo
8. Distribución de nucleosomas espaciados.
FIGURA 7-22
Parcheado:
1. La replicación del DNA avanza en dos direcciones
2. Origen de la replicación
3. Crecimiento
4. Crecimiento
5. Comienzo de la replicación en tres orígenes
6. Cromosoma
DNA
7. Cromátidas hermanas.
Réplicas de DNA (moléculas hijas)
FIGURA 7-23
Parcheado:
1. Etapas del ciclo celular
36
2. Célula original
3. Células hijas
4. Etapas del ciclo celular
M: mitosis
S: síntesis del DNA
G1: etapa de crecimiento 1
G2: etapa de crecimiento 2
FIGURA 7-24
Parcheado:
1. Iniciación de la replicación en eucariotas
2. Secuencia consenso II-pb
3. Región rica en AT
4. Reconocimiento del origen
5. Carga de la helicasa, Cdc6 y Cdt1
6. Apertura de la hélice y desplazamiento de la helicasa
7. Reclutamiento de la DNA polimerasa
FIGURA 7-25
Parcheado:
1. El problema de la replicación de los extremos cromosómicos
2. Origen de la replicación
3. Horquilla de replicación
4. Cadena retrasada
5. Cadena líder
6. Cadena líder
7. Cadena retrasada
8. Cadena líder
9. Cadena retrasada
10. Cebador
11. Cebador degradado
12. Hueco interno
13. Hueco terminal
14. Todos los huecos internos se rellenan, el hueco terminal no se rellena
15. Extremo saliente
FIGURA 7-26
Parcheado:
1. Prolongación de los telómeros
2. a) Prolongación del extremo 3’ saliente
3. La telomerasa alinea al extremo 3’ saliente
4. Telomerasa
5. Elongación
6. Translocación
7. Elongación
8. b) Replicación de la cadena complementaria
9. Se sintetiza un cebador
10. Primasa
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11. La polimerasa rellena el hueco
12. DNA polimerasa
13. Se elimina el cebador y la ligasa sella el hueco
FIGURA 7-27
1. La estructura de la cápsula telomérica
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